3ZL5A

Crystal structure of schistosoma mansoni peroxiredoxin i c48s mutant with one decamer in the asu
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
b'LLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVSPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITINDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Switching between the Alternative Structures and Functions of a 2-Cys Peroxiredoxin, by Site-Directed Mutagenesis
pubmed doi rcsb
molecule keywords PEROXIREDOXIN I
source organism Schistosoma mansoni
molecule tags Oxidoreductase
total genus 54
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zl5A00
3PR8A 4OD7A 3DVXA 2YOIA 6GSUA 2GZPA 4K6XA 1QXHA 1NHOA 2CAIA 5B7CA 5FHIA 3VPTA 3F0IA 4AJ7A 3VWXA 1JZDA 1ZL9A 4HS1A 2J23A 2ZCTA 2TRXA 3IA1A 1F37A 3LORA 4WETA 4NHWA 2G2QA 1J08A 1GULA 2FWEA 2IWTA 2V6OA 3DKSA 2CZ2A 2L5OA 1A8LA 1YDKA 3SWLA 1EZKA 4EUYA 3H8QA 5IMAA 5D9XA 1XZOA 1TTZA 3DRNA 1XFLA 5LNKe 4X0XA 1XXUA 1KEBA 4TN8A 1XWAA 3QAWA 1EP7A 3TKSA 3Q18A 5ECHB 3C71A 3FKFA 1EWXA 1GH2A 1MDJA 4PXOA 3O3TA 1GP1A 3DIEA 1PRXA 3LYKA 3D4TA 2H74A 5DVBA 5B6MA 5DDLA 1EOHA 3D21A 1YEXA 3QR6A 1AXDA 2R5GA 1I9DA 4I2TA 4YQMA 3CTGA 4EKZA 4HU7A 2OBIA 1WPIA 1THXA 4IBPA 2VD1A 2XHFA 5JWQB 4JU5A 5JWRB 4KNDA 4FYUA 2A2SA 5GAND 3TJFA 1T7PB 1U3AA 2QC7A 1GSQA 3EMPA 3CXGA 1S3AA 4CDOA 2YN1A 1ZCPA 5KN3A 5CREA 2VCWA 5ID2B 1M2DA 1ZMAA 3QD9A 4ML1A 1Z7PA 5D8IA 3QCPA 2HRNA 4TR3A 5GSSA 1R7HA 2R37A 1XWCA 4HDEA 4AGSA 1SJIA 3M3MA 3IXRA 4GQFA 1W89A 5IOWA 5CRHA 2VM1A 2GGTA 5HR2A 3HZ4A 1MDKA 4XS4B 4N0VA 1K3LA 2H1BA 2CX3A 1V58A 1OYJA 1J9BA 3IPZA 4ILFA 1NSWA 5IM9A 2P0GA 2H1AA 4HU9A 1OC8A 5ELAA 3GSSA 1RQMA 4ECBA 3AY8A 3MSZA 2P31A 2WULA 4K7IA 1A2JA 2LUSA 3GL5A 2FNOA 4F0BA 1PMTA 1WOUA 3ZFLA 2HYXA 1FOVA 1GTBA 4YAVA 4J57E 8GSSA 3APSA 1GNEA 2A4VA 4V2NA 2DBCA 3C73A 5KN2A 5AGYA 2DJ3A 4RUVA 4MK3A 2QSIA 5EPFA 1USBA 1Z5YE 5E59A 2LRNA 1FHEA 2O7KA 2VO4A 3HVVA 3LYPA 2WB9A 5DALA 3DYRA 4L0UA 4RI6A 1V98A 5A4VA 4HJ2A 4IQ1A 4NMUA 1OC3A 5LD0A 2YZUA 3IV4A 4TVEA 2IMIA 4MZWA 4FH8A 2JU5A 3BOAA 4RQXA 1GWCA 4MABA 5A4UA 4IELA 1K0AA 1FAAA 3DGQA 1SENA 4MF7A 2X99A 3HVSA 4O32A 3TKQA 16GSA 2HSYA 1VF3A 4J2FA 3TRQA 5ECOB 5E4WA 2FA8A 4PQIA 3KTBA 1JZOA 1BJXA 2C3QA 1GTUA 3O76A 5J3RA 5EVOA 2CAQA 3FYGA 2PGTA 3TKSE 2LRTA 5HFIA 1TU8A 1DSBA 3C7MA 1SKSB 1B4PA 4KCAA 3VWWA 1JFUA 5G30A 1Z6MA 5FT3A 3GYKA 4EE0A 1XW9A 3RPPA 1RW1A 5IPGA 2VAFA 1GSEA 3CBUA 2RUFA 1XW5A 4QL7A 2JZRA 1M2AA 5DAKB 1ABAA 3LG6A 2VCVA 1X5EA 2XBQA 3ZMLA 4ZIJA 4MH2A 1VGLA 3TOTA 3HZ8A 2H0GA 1S3DA 2WS2A 2XPEA 2O87A 1QUWA 4ZB8A 3RDWA 4D73A 4BA7A 1M7TA 19GSA 4GSNA 1EV4A 2GT5A 3L78A 5JCGA 1T3BA 1AAZA 4K0NA 4XHMA 2LQOA 4KCEA 2PERA 3GNJA 2X64A 1G7EA 2B3SA 3TB2A 1TKDB 2VLUA 6GSYA 5ENUA 5H5RA 3GSTA 4JR4A 3WT2A 3H4KA 5IMVA 22GSA 4MPFA 1WIKA 3N9JA 2OBKA 3GX0A 2FCHA 1DE2A 3KMNA 4TKYA 1B9XC 2PVQA 4HEA2 2XPDA 4IHUA 2M46A 3M1GA 1O6JA 1SD8A 4DSSA 2I81A 4RQRA 1AW9A 3IR4A 3Q6OA 5JWOB 4ZBBA 5GSTA 5ABRA 1SYXA 1A0RP 3KCMA 2JACA 2DJ2A 3ED3A 5D93A 1ZZYA 3ZVJA 2I4AA 2HFDA 1Y25A 3L9UA 3VURA 3HYPA 3TJKA 3TUEA 1KBNA 2IJYA 6GSTA 4HQSA 1EV9A 4O92A 4QQ7A 5FWGA 3TJJA 6GSWA 4NXIA 1E2YA 1M0UA 4H86A 4L5OA 1GLPA 2C1YA 3HCZA 1IYHA 1Z6NA 2AAWA 2C0GA 3A2VA 4HOJA 3E9JB 1TRSA 5EL8A 2AHEA 4BPYA 2IMKA 3WT1A 3EWLA 3WGEA 3A3TA 1TOFA 4I6XA 3D0ZA 2IFQB 2TIRA 1R5AA 1SU9A 3TKRA 3QAGA 3A2XA 3TDGA 4HZ2A 1F3AA 3GIXA 3GUSA 1QQ2A 3UEMA 1HNCA 4LMWA 2PMTA 1TK8B 2LJKA 1EOGA 2ON7A 2C3NA 1NHYA 2N5AA 3DEXA 2CT6A 4YAPA 2LJRA 3G7IA 2PBJA 3ZVJD 3GN3A 2YPMA 4ECIA 4G19A 3GTUA 3GMFA 4XTSA 4MA9A 3ZFBA 2GZYA 5F06A 2PPTA 2VOCA 1THOA 2JZTA 1NM3A 2LRCA 2AV4A 3APQA 5H5QA 3GRXA 3MDKA 3HD5A 1M9BA 4FIWA 5IMZA 4AF2A 3IC4A 2OE1A 6GSSA 1YQ1A 5J5NA 1ACVA 2KHPA 4TXOB 1OVNA 5J41A 2VLVA 4Q5FA 3EYTA 4ZILA 2VL2C 3FY7A 4IQAA 3US3A 3F6DA 4K7OA 3RBTA 3GFKA 3I6AA 5H5SA 5IPHA 2HLSA 2BMXA 18GSA 4KSOA 5J9CA 1EGRA 3L4NA 3ZZXA 1A2LA 2OE0A 2DMMA 5F8BA 2L4CA 1GSUA 1ILOA 4HUAA 2IMDA 1IYIA 5ECRB 4HQZA 3M9JA 2HXKA 2NVLA 3TRPA 5AIXA 2GQLA 2EIQA 1T8EB 4AJ6A 1SKWB 3UBLA 3I69A 2PN8A 4FYCA 3WGXA 2MBTA 4XRAA 2CQ9A 2C80A 4OCFA 2OA7A 1JLVA 2GS3A 4KDUA 4FYBA 3KEBA 3GURA 2IMEA 4ZL8A 4POKA 2NDOA 4OFTA 1CQGA 2WFCA 3M8NA 1PL2A 4POLA 2GSSA 4BVYA 3CSIA 4KW6A 1ZYEA 3P2AA 5F05A 4DSQA 1EEJA 2B1KA 4G9HA 1M99A 3HY2A 4IP6A 2L4QA 3FRCA 5HQPA 4K2DA 4MJBA 2MMZA 1ST9A 1GSDA 3PH9A 4O7HA 4K8MA 2NTOA 3F9UA 2B5YA 2RLIA 3LGCA 2YP6A 4Q5RA 3GL3A 3IE3A 4N30A 1LBKA 4JR6A 2A2RA 4WBJA 4GLTA 6GSXA 1QK8A 3RPNA 3UMAA 5IQYA 5IMCA 4KA0A 1SL0B 3UIWA 12GSA 3UVTA 2HI7A 4MLYA 2XBIA 4MMMA 1FVKA 1GSSA 2FUG2 2DIYA 5DCGA 3PGTA 3GKMA 1N8JA 3UARA 1XOAA 3KH9A 4HZ4A 5B6NA 1U88A 1YY7A 3EVIA 2DJ1A 3KP8A 4MJAA 14GSA 2P5RA 2AB6A 1Z9HA 20GSA 4PQ1A 5IIZA 5D9VA 1V40A 3ZL5A 10GSA 5G1KA 2R6KA 5ECIB 3F3QA 4EDYA 2C8UA 2LKUA 1WJKA 1A23A 3CRTA 1PKWA 3A5WA 2VL3A 2F8AA 2RIIA 4G2EA 3VLNA 4PGTA 3O6TA 3ZYWA 2H1DA 4LA1A 3GV1A 5F0GA 5DBQA 3LJRA 3GHAA 1MD4A 1TU7A 3K8NA 4TR0A 5COHA 4I5QA 4OFMA 4K1FA 4PUFC 2EC4A 2JADA 1YF1A 2E2MA 5IMFA 1ZOFA 2B7JA 1BQ7A 3LXTA 3A2WA 3IK7A 3PINA 4WR4A 5ECLB 3EU4A 4WBRD 4NWYA 2WRTA 1AQXA 2B5XA 3CTFA 4MF5A 2HZEA 2ALBA 2F3MA 3H1NA 2Z9SA 4TR4A 4KB3A 4QL9A 3M0FA 4IN0A 3VI5A 2FWFA 1XVWA 3MWHA 3QPMA 3CSHA 5INYA 1O85A 1S3CA 1X9SB 3L9VA 1YEPA 1K3OA 4IVFA 2YJ7A 3RHBA 4GSTA 1R5PA 3HKRA 2L57A 4N0ZA 5DJLA 2PVOC 3P8WA 1B9YC 3R2QA 1XWGA 3S9FA 4YH2A 3HJOA 3KD0A 3CSJA 2CVDA 2ON5A 2I1UA 4GSSA 3GH6A 3FZ4A 1FO5A 5L71A 1EEMA 1V9WA 4TR1A 4K9ZA 4WXTA 1A2MA 3W8SA 1PQNA 2RM5A 2V32A 3QFBC 5DALB 1SL1B 1EGOA 4PNGA 1TI3A 4WR5A 1DUGA 3J7Yk 3FZ5A 4NHZA 1N2AA 5A5KA 2H66A 5KEJA 3VK9A 2L6DA 4JRRA 3F8UA 1BAYA 1TRVA 4WEYA 3FK8A 1GLQA 1FB6A 1QGVA 2XC2A 3FHKA 2C4JA 5J9BA 1XOBA 2H6YA 7GSSA 2ES7A 2HT9A 4F0CA 1URMA 3EC3A 2FA4A 2O89A 1TI1A 3ZIVA 2NPBA 3FZ9A 3JCML 1OE8A 3Q19A 2X8GA 1QMVA 2OACA 2B5EA 4MDCA 1J0FA 1B4QA 2KP1A 5DQYA 4OCEA 4EC0A 5D96A 2FD3A 1PX6A 3LEFA 4I97A 5HFKA 1FG4A 2YCDA 4PQHA 1WMJA 2DJ0A 3IDVA 3VWVA 1NW2A 2PU9C 2MBSA 3KTLA 4KH7A 4ZXGA 1K0NA 2C0DA 4X1UA 2NBSA 4V2LA 3UBKA 3V1WA 4IJ3A 2YWMA 4EDZA 1BEDA 5CYYA 4POBA 3D5JA 2JSYA 4D73B 1O73A 3DD3A 1I5GA 3VWUA 4ULXA 3TJGA 2VCTA 3I43A 2AYTA 2GSRA 1SJZA 1XPVA 3GA4A 4V1Ap 2CVKA 1G6YA 1OC9A 3ZLPA 4K7NA 3IAS2 3HA9A 4MZCA 4E8EA 4XS1A 1PKZA 1A0FA 1O7UA 2L6CA 4ACSA 1HQOA 4GXZA 1LU4A 3N5OA 5G1LA 5JCUA 1SD9A 1ML6A 3LXZA 1SL2B 1TJDA 3KMOA 3U5RE 4JBBA 2H72A 4OWYA 5G5EA 3HJMA 1AQVA 1DE1A 5IO0A 1WE0A 3D4MA 2F51A 2K18A 3C1RA 4BWQA 2DC5A 3I9V2 3G7YA 2YWIA 4JZQA 2GQMA 2LSTA 1SKRB 1T00A 3TRXA 1UC7A 4KGIA 2C0EA 1QFNA 2H70A 4RI7A 1YKAA 1WP0A 5EY6A 2MYGA 2FLSA 5CNWA 2KP2A 5G2ZA 2RUEA 4Q5NA 4CW9A 2FY6A 3WD6A 5CRDA 4MCUA 2YANA 4ECCA 1W4VA 4ZL9A 2K8SA 2B6MA 6GSVA 2HZFA 4LL4B 5KN1A 2EIOA 2GTUA 1YZXA 2YWNA 4OO4A 5D9WA 2BTOT 2P5QA 2MMAA 3QAVA 2H0IA 1G0TA 2GT6A 1PGTA 4WF5A 5B8AA 4I8BA 5ECKB 1AIUA 1R4WA 5GZZB 3ZTLA 3ZRDA 2N5BA 1MDIA 17GSA 2VIMA 3IAM2 3W8JA 3UVHA 4MJCA 1LJRA 4ML6A 2H19A 5AN1A 2L5LA 2CZ3A 2RM6A 3GTUB 3KIJA 2KLXA 4EL1A 1V2AA 5HR0A 3BCIA 1K0BA 3GH9A 1AUCA 1K0CA 2E2GA 2DSAA 5C04A 1G7OA 1T4YA 2VCXA 2YJHA 2YZHA 2FWGA 2H0HA 4GRFA 2OKAA 2VCZA 1Q4JA 1XIYA 3D6IA 1EP8A 4P3YB 4OMVA 2X8CA 2H76A 3EMXA 4K0GA 4GQCA 2HSHA 1MD3A 1Y6EA 1OAZA 3HDCA 4PNFA 3KXOA 1ZGNA 1JZWA 2F8FA 2ZUPA 1K0MA 2YV7A 2VM2A 2YNXA 3EE2A 1R26A 3EURA 1FB0A 1F9MA 2TRCP 1PA3A 4EVMA 3EU3A 1YJ6A 2YV9A 11GSA 3ME8A 3ZMKA 2K6VA 1UVZA 2QGVA 1HYUA 2OE3A 4ECJA 2WGRA 4ZBAA 4NV2A 4MP4A 2G0FA 3BD2A 4IS0A 2H71A 3GKKA 4GWRA 4KE3A 1H4OA 3ISOA 4OO5A 3ZIJA 4LL1B 1O81A 2AJQB 3NOFA 1F6MC 1CQHA 1KTEA 4F2IA 1RK4A 3QMXA 3J7Yb 1BYEA 1XWBA 2F9SA 2MZCA 2K9FA 2KUCA 3F4RA 1ERWA 3TGZA 2H6XA 3TKSC 1U6TA 4TXVA 5ID2A 2J9HA 4DSRA 3RAZA 3IK9A 1SK0A 1SK1A 2VUPA 1M9AA 1MTCA 4IGJA 2CV4A 1K0DA 3DXBA 4ISDA 4MF6A 4AJ8A 5G31A 1T4ZA 4FO5A 2H75A 2O8VB 2LQQA 1TXXA 3GX8A 2N5FA 4XS4A 4KDXA 1VF4A 2PWJA 1XCCA 4BL7A 2MMNA 2GQKA 5HR1A 4V1Ag 2H30A 1K0OA 5ELGA 3FR6A 2DJKA 4Z7XA 1X5DA 4BWSA 2DMLA 5IOXA 1PX7A 1H75A 1XW6A 4ZB9A 2DJJA 2V1MA 2GSQA 1TK5B 4G10A 4J56E 3QFAC 2WJUA 3TCOA 3DVWA 4HI7A 1TDIA 3TJBA 3IRAA 2GLRA 3L9SA 1BX9A 4L5LA 1M2BA 1MEKA 3UL3A 4IJIA 3F6FA 3W6GA 2VL9A 2LNSA 2FWHA 5CP1A 1X5CA 4IKHA 2K8VA 5ECPB 3CRUA 4NAXA 3BBYA 1OE7A 2MMOA 1U3IA 2OJLA 5G5FA 3BJ5A 3G9BA 3KH7A 5B8BA 1T1VA 2DLXA 2ZNMA 3EINA 3UJ1A 4I2UA 2VD0A 1TK0B 2CA8A 5ECSA 2WDUA 4F9ZA 4ZBDA 3CYNA 4TW5A 1PD21 2VCQA 3F3RA 2B7KA 2DIZA 4KX4A 2CX4A 2HZEB 1B48A 4KDYA 4POMA 4V2MA 2GSTA 1KNGA 4F03A 1VF2A 4IW9A 2OADA 1E6BA 1BG5A 1TP9A 2GVPA 3GKXA 5LCZA 2V2GA 2LEGA 1C72A 2X8HA 4TRXA 5JCWA 1SJ6A 4ID0A 2JSZA 1ERTA 4EO3A 2KOKA 2H1GA 4CHSA 5AIVA 3HXSA 3MNGA 1A24A 4Q5QA 1Z7RA 4PX1A 5DAKA 1WRYA 3IBHA 3FW2A 3G7JA 1YF0A 4KSMA 2YWOA 2IIYA 3E0UA 1GUKA 3F63A 4O5RA 4L8EA 3UOMA 2C3TA 3H79A 1PL1A 3HJPA 3DWVA 3VFIA 4YQUA 4N11A 4TR1B 4JE1A 5AISA 1X9MB 4YQVA 3F4TA 4GTUA 3P90A 3VI7A 1B8XA 1K3YA 4MPGA 1UA5A 3FR3A 4XRDA 3DMLA 4WF4A 4GF0A 5ECQB 4XCSA 4GCIA 5IMDA 4WKWA 1DBYA 1Q98A 3RHCA 3KGKA 1ZYQB 5HR3A 4DVCA 3NIVA 1XVQA 2HRFA 2REMA 1TRWA 1AC1A 2H01A 5F07A 4EXJA 2VLTA 3F4SA 5J4UA 2JZSA 3ERWA 3KJYA 4MZBA 3KM6A 3UAPA 2V6KA 1JZRA 3QOUA 4JEDA 13GSA 5DJMA 3IOSA 3LSZA 2R3XA 3D22A 1F2EA 4MH3A 2E0QA 3GKNA 4OFNA 2I3YA 3FZAA 3KP9A 1VF1A 5ECNB 3FEUA 2H6ZA 1A8YA 3QDNA 3ZREA 2CVBA 2LS5A 1U87A 3WYWA 4LMVA 3C1SA 1XBSA 4XS6A 5D73A 3FR9A 1WWJA 2IFQA 1HD2A 5IO2A 1PN9A 1JHBA 3VPQA 2O85A 4KUNA 2C0FA 4X43A 2IL3A 4DSSB 2WCIA 4PURA 2AUVA 1GUHA 3APOA 4XIHA 1OC9B 2LTKA 4NV5A 5CO3A 9GSSA 1ERVA 1UN2A 3LWAA 4HJMA 3IHQA 3C8EA 4TOPA 2R4VA 2QKEA 2GDRA 3H93A 3HVXA 3P7XA 4L0WA 1G6WA 2M72A 5KN0A 1F3BA 2L59A 2LNTA 3ME7A 2H8LA 3ERFA 1ON4A 4E8HA 1GRXA 1OKDA 3U6VA 3OR5A 5DCHA 4TXOA 4NPBA 3TKPA 3BCKA 1Z3EA 1AQWA 4LLRA 3L0HA 5A4WA 2D2ZA 5D9TA 4ZB6A 2WZ9A 2EIRA 1JLWA 1GTIA 2IMFA 2LV3A 2VL2A 1HNBA 1GNWA 2E7PA 1PSQA 4N10A 4F82A 4ZL7A 1SK2A 1ERUA 4DEJA 1SYRA 3NZNA 3SBCA 3TOUA 2I9HA 2H73A 3M9KA 5CAXA 1GTAA 1X9WB 5GAPD 2IPAA 2FHEA 4MJEA 1GSFA 1XWKA 2R2JA 4PUAA 2M80A 2HE3A 2V41A 3CMIA 3LQ7A 3Q74A 1OKTA 3ERGA 1GL8A 4IP1A 5CRGA 5CRWA 1TW9A 2BJXA 1FVJA 5HFGA 1GSYA 3ZITA 4BVXA 4KAEA 3KZQA 2GZZA 2LJAA 1GUMA 5DQSA 2JL4A 3HHVA 3WGDA 1VRSD 1YKCA 3LFLA 1O8WA 2IN3A 2FGXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite