3ZL5A

Crystal structure of schistosoma mansoni peroxiredoxin i c48s mutant with one decamer in the asu
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
LLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVSPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITINDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
publication title Switching between the Alternative Structures and Functions of a 2-Cys Peroxiredoxin, by Site-Directed Mutagenesis
pubmed doi rcsb
molecule keywords PEROXIREDOXIN I
total genus 54
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zl5A00
5IOXA 4N11A 1FB6A 4EVMA 4F0BA 3ZMLA 2E2MA 2OADA 4GSTA 4TR1A 3D5JA 4YAVA 3BCKA 4L5LA 4J56E 1PKZA 2F51A 5KN1A 1CQGA 3KEBA 5IMZA 1Z7PA 2PU9C 1T7PB 4XS4B 1GTAA 1DE2A 1R26A 3UAPA 2OE1A 3RPNA 2VOCA 1M9AA 1XIYA 1F37A 4YQUA 3LWAA 4MZWA 2KP2A 2AAWA 1V58A 1Y25A 2I4AA 1QK8A 5EY6A 4EUYA 2LV3A 3HVSA 5DDLA 1M2DA 1F2EA 4XIHA 2PERA 2WS2A 4ZB6A 5JCWA 3DVWA 2FLSA 3H1NA 1U3AA 3LYPA 4MH3A 1J0FA 5D9TA 3CSHA 3APOA 1GLQA 4KNDA 1TKDB 5B8BA 5CO3A 4IHUA 1AQWA 5FT3A 2PVQA 4POMA 2DJKA 2H0HA 2OE3A 1GLPA 3RAZA 3BJ5A 4P3YB 4RQXA 1KTEA 2HSHA 2VCZA 4GSSA 3M9JA 5JCUA 2DJJA 2LQQA 3LQ7A 5L71A 2H6ZA 1F3AA 3IHQA 3W8JA 3EU3A 3TKPA 3IK9A 3TJJA 3IE3A 2JZTA 4ML6A 4OO4A 2V6OA 5IMCA 4FO5A 4IP6A 3GFKA 3L9SA 4TXOA 3VI5A 1XXUA 3OR5A 2LJKA 5G30A 5CRGA 4AGSA 4IKHA 4L8EA 1J08A 3IXRA 3QR6A 4PURA 1U3IA 4ACSA 3HCZA 4KUNA 2NTOA 2VCTA 4MF5A 4WXTA 3TDGA 2ZUPA 4KDUA 3FR6A 2YNXA 1FVJA 1H75A 2DIYA 4ECBA 1VF1A 9GSSA 4KX4A 3DVXA 1OE8A 4WR5A 2YJHA 3KTBA 1SK1A 1A8LA 1AAZA 1PMTA 4ID0A 4BA7A 4JBBA 3GKXA 5J9BA 4ZB9A 3G7JA 3TRQA 1X9SB 5IMAA 3CBUA 2KHPA 2HFDA 5A4VA 4HJMA 1UVZA 4NAXA 3KZQA 1FB0A 5AN1A 1X5DA 1MD3A 1UA5A 2YCDA 2MMZA 1XW9A 3VLNA 2H72A 3L4NA 2JZRA 3MDKA 1LJRA 3F0IA 3TJFA 3DIEA 4KCEA 1B4QA 1Z9HA 1ERWA 5CRHA 3TGZA 1W89A 1VF2A 4Q5FA 1M0UA 5G5EA 2CQ9A 3H79A 1QXHA 2H75A 4DEJA 2R5GA 2K18A 1EGOA 3IDVA 12GSA 3ZYWA 2R6KA 2YZUA 1NM3A 8GSSA 1FHEA 4JRRA 4I2UA 2X8CA 1OAZA 16GSA 2VIMA 2GLRA 4HU7A 1XWGA 2VD0A 4MZCA 3GKKA 3KM6A 3BBYA 1X0RA 4RI6A 4GF0A 5DAKA 3LXTA 2CT6A 3ZZXA 2YWNA 2B7JA 3DGQA 1TJDA 3KGKA 4ZL9A 4DSSB 3KD0A 4HI7A 1XWCA 4KGIA 1TXXA 3H93A 1NHOA 1VF3A 1XOBA 3QFAC 2GQKA 4JR6A 5IMVA 1PL2A 2VLVA 5HFGA 5ECLB 1XWAA 3LEFA 4WR4A 5DQSA 3L9UA 3LG6A 4TR0A 2REMA 1TTZA 1G7OA 3FR3A 1SK0A 2IFQA 1FAAA 2C80A 4AF2A 5F0GA 3VWUA 1MDJA 1TRSA 3EMPA 1OE7A 5CRDA 2V2GA 1M2AA 3F3RA 4FIWA 3C1SA 1QQ2A 2OBIA 1SJZA 5D8IA 2H6YA 1PN9A 3ZMKA 3RPPA 4OWYA 3GSSA 2VM2A 4IP1A 4N0VA 1S3CA 1V2AA 2JACA 2VCVA 1PD21 1YKAA 4MMMA 5ELAA 1BEDA 3HJMA 1V57A 3L9VA 1TK0B 2E0QA 2WULA 1X5CA 1SL1B 1ZMAA 2YWMA 3ZFLA 4Q5RA 4V1Ag 5JWRB 3Q74A 6GSSA 3VFIA 1GSUA 2A4VA 2HZEB 4OFNA 2GS3A 3IAM2 2LRCA 3V1WA 4EKZA 3TKSA 5ECMB 2E2GA 1K3YA 3FKFA 2CA8A 4K7IA 4MABA 2VCWA 1M2BA 5D9WA 1ZGNA 4YQMA 3UIWA 2KUCA 1CQHA 1A0RP 5G31A 1PRXA 1USBA 4AJ6A 3APSA 5EPFA 3GRXA 1EV4A 2XPDA 2ZCTA 1A2JA 1S3AA 1B4PA 2H1AA 1WPIA 4WBRD 3HXSA 1GUKA 4POLA 2LRNA 3TKSE 1QUWA 3GX8A 3VI7A 1BQ7A 2DLXA 4OFMA 1A2MA 2YV7A 2L6DA 3IA1A 1TRVA 1IYIA 1LU4A 1BAYA 2VL9A 5J4UA 3EE2A 3FEUA 1B8XA 3QFBC 1OKDA 2FD3A 4IJ3A 4EDYA 1ERVA 2L5LA 2MZCA 4E8EA 2H74A 3KH9A 3O3TA 2LKUA 3I6AA 1X9WB 2OACA 4GRFA 2F8AA 3QCPA 2LS5A 2VLUA 1AQXA 4WEYA 1ZOFA 4TKYA 2I1UA 2B7KA 3K8NA 4OCFA 3PGTA 2K8SA 3F6DA 1JZWA 4I8BA 5IPGA 4N0ZA 1MDKA 4XS1A 1R7HA 5DQYA 4HJ2A 2D2ZA 1TOFA 1K0DA 1UN2A 5F05A 3LORA 2TRCP 4K2DA 2V32A 2IN3A 4LL1B 4CHSA 4POKA 6GSXA 1K3OA 5ID2A 3KMOA 3LXZA 3MAKA 2E7PA 1F9MA 4GQFA 4MCUA 1Y6EA 2PUKC 2CX3A 4I5QA 1GNEA 3KJYA 1XBSA 4QQ7A 3UBKA 1RW1A 1S3DA 1TDIA 2H0GA 2JSYA 2O89A 2H1BA 1NSWA 3IPZA 2L4QA 5DJMA 2CVBA 1GWCA 1PX6A 3UBLA 2BJXA 1OKTA 5ECKB 2ZNMA 4KAEA 3HY2A 22GSA 2H19A 1WRYA 2IMKA 2J9HA 1HNBA 3P8WA 1ST9A 1EZKA 1X9MB 3ISOA 4TR4A 2DC5A 2R4VA 3HJOA 1O6JA 1T00A 3VK9A 2WZ9A 2XBQA 4V2MA 2N5AA 2HZFA 5KN0A 3QAGA 3FK8A 1TU8A 4XS6A 2DJ3A 2WB9A 1ERUA 2O87A 4Z7XA 5AISA 4H86A 1AXDA 2QKEA 1GUHA 2BTOT 3EMXA 2GVPA 10GSA 1A8YA 1V98A 4TR3A 6GSYA 2JSZA 5GAPD 1A2LA 1SL2B 5B6MA 4GLTA 2HE3A 4X1UA 3QOUA 4K0NA 4AJ8A 5LD0A 1LBKA 3HHVA 2I3YA 3G7IA 4IQAA 2O7KA 2AV4A 3FR9A 4D73A 3KXOA 4LL4B 3GSTA 3HD5A 4BVYA 5ECRB 3U5RE 2PN8A 3QAVA 4K1FA 1M9BA 2O85A 3D4MA 1O81A 1GUMA 2CVKA 3D21A 4PGTA 1GTUA 2XBIA 1WE0A 4GSNA 4OO5A 4KCAA 2A2SA 3IV4A 5D96A 2JZSA 4TR1B 4TXVA 3PR8A 5J5NA 4DSQA 1K0OA 3BD2A 4PQHA 3C8EA 4F03A 5KEJA 2RM6A 1VGLA 3CMIA 1JFUA 1MD4A 3EINA 2C3NA 2OBKA 2FGXA 2JADA 4K7NA 1EOGA 3TOUA 3TJKA 3N5OA 6GSWA 5ABRA 3ME8A 3PH9A 1K0MA 1O7UA 4E8HA 4D73B 1A24A 2L5OA 2V41A 2P5RA 5H5QA 4IELA 2PWJA 1DSBA 4ILFA 4QL7A 1TRUA 1KBNA 1SYXA 2HT9A 2R37A 2O8VB 4XHMA 2IWTA 3GX0A 3TJBA 5DALA 2FY6A 2L4CA 5B7CA 2VAFA 3FZ9A 2PPTA 5HR2A 4MJBA 2M72A 1EV9A 3HJPA 1OVNA 4YAPA 4POBA 3F63A 5EL8A 4ML1A 4G19A 4G10A 1O85A 1XVWA 4JZQA 6GSVA 1EP8A 5DBQA 5CNWA 4GWRA 4TXOB 5A4UA 2CVDA 4PX1A 3ZTLA 2HRFA 2DJ0A 1PKWA 2YOIA 2FWFA 3ZVJA 1XWBA 2VO4A 1GSSA 4KSMA 3A2WA 4I6XA 5F8BA 2VL2C 3HYPA 3EYTA 3TUEA 4IQ1A 4HQZA 3ZLPA 4EC0A 3P7XA 1T8EB 5H5SA 5G5FA 5DCHA 4TN8A 3KP8A 3M0FA 4DSRA 2C3TA 4ZBBA 3W6GA 20GSA 3ED3A 5ECIB 5D9VA 5LNKe 1ON4A 4K0GA 4PNFA 2ALBA 4F2IA 4HQSA 4G2EA 2QGVA 2KLXA 3KIJA 3FY7A 5CP1A 4BWQA 3NIVA 2HNLA 3KMNA 3US3A 4JEDA 2GSRA 3GTUA 5CRWA 2IMEA 2AHEA 1BG5A 2LTKA 2HLSA 3IOSA 4KH7A 4N10A 2J23A 2GZZA 3GIXA 4K8MA 2K8VA 1GL8A 4RQRA 4HZ2A 2GT5A 1URMA 1DBYA 1E6BA 1YEXA 3BOAA 3E9JB 1T4YA 5IIZA 1QFNA 2AJQB 4WETA 2R3XA 3F4SA 3GV1A 3MWHA 1ZYQB 4TRXA 2NBSA 4FYBA 4MLYA 4G9HA 5C04A 2XPEA 1KEBA 2CX4A 1B48A 1WIKA 2DJ1A 1GH2A 2ES7A 2YZHA 5DAKB 1YJ6A 5B8AA 2GSSA 2HRNA 1FVKA 1XW5A 4V2NA 2M80A 5DCGA 1BX9A 1U6TA 3TJGA 1XPVA 2VL3A 3GTUB 2GGTA 3GUSA 2FCHA 3VWXA 1HD2A 1DUGA 4NPBA 4J57E 2X8HA 5ECNB 1JLWA 4LMVA 3TCOA 5KN2A 2KP1A 2B5YA 2JU5A 2LJRA 5HR1A 3IC4A 1WMJA 4TW5A 4IJIA 1Q98A 1TI3A 1T1VA 4KA0A 2LUSA 2IFQB 1OC9A 3NZNA 4K7OA 3O76A 5ECHB 3C7MA 3TKRA 2EIRA 5G2ZA 4WKWA 3HKRA 2VLTA 5FWGA 2IIYA 5AIXA 1PSQA 2C4JA 3R2QA 1I9DA 4ULXA 3EU4A 4YQVA 4NV5A 2WCIA 3ZFBA 2MBSA 4ZILA 2OA7A 3GN3A 1NHYA 3M3MA 3QD9A 4EXJA 1GTIA 1Z6MA 4MF7A 1R5PA 4TOPA 4EE0A 4L0WA 1V9WA 3BCIA 3GMFA 3ZITA 3RDWA 3ERFA 4FYUA 2L6CA 2MMAA 3MNGA 1R5AA 3IRAA 3GHAA 5HR0A 18GSA 2C0FA 2CZ2A 3WGDA 4HS1A 1O73A 3ZREA 6GSUA 1SKSB 3GL5A 3O6TA 4I2TA 5IMDA 4I97A 3ZL5A 2WGRA 4HU9A 3CRTA 1YQ1A 1M99A 4ZXGA 2RM5A 1B9YC 1NW2A 4MJCA 1TW9A 1YF0A 4O92A 2DIZA 1AUCA 2GSQA 5DVBA 2X99A 5CREA 4O7HA 1GTBA 3F3QA 2NDOA 3QDNA 1G0TA 2PVOC 3D0ZA 2KOKA 4CW9A 2X64A 2WFCA 3DEXA 1SD8A 1TRWA 4WBJA 3WYWA 2RUFA 3FHKA 3DYRA 13GSA 1EP7A 1ABAA 4RUVA 2GTUA 4KW6A 4BPYA 2H6XA 2RIIA 5ENUA 2I81A 2GQLA 1UC7A 3G9BA 1WJKA 4IGJA 1RQMA 3PINA 1YKCA 4L5OA 4HOJA 1Q4JA 4IW9A 3H8QA 4KDXA 4JE1A 1SL0B 4TVEA 1SJ6A 5DJLA 2B5EA 3Q6OA 4ZIJA 2FA4A 4PUFC 1TI1A 2V1MA 2TIRA 5C00A 1F3BA 3U6VA 3FW2A 1HNAA 4XS4A 1B9XC 4LMWA 2XC2A 6GSTA 3HVXA 3ERGA 3FRCA 1XWKA 4JR4A 4WF4A 1XW6A 1QMVA 4MPGA 1K0BA 2V6KA 2LNSA 5J3RA 4OCEA 4MJEA 3SBCA 2VCQA 2P5QA 4MP4A 2C0DA 3APQA 5ID2B 4XCSA 3A2XA 3SWLA 1WWJA 4NHZA 3WD6A 2VCXA 2YP6A 5INYA 3C73A 2OKAA 2DMMA 17GSA 1SD9A 2YWOA 2GQMA 4KSOA 1XCCA 2H30A 1KNGA 5ECSA 1SYRA 1J9BA 3J7Yb 1ACVA 3W8SA 1TP9A 2H66A 3HZ8A 1FOVA 2AB6A 2CZ3A 3DXBA 5A5KA 4J2FA 5HFKA 3RHBA 1E2YA 2JL4A 3E3EA 2PMTA 3GKNA 4F82A 3F6FA 2N5BA 4BVXA 1AC1A 3A3TA 1ILOA 1G6YA 2G0FA 2C0GA 1AQVA 5IPHA 4IVFA 2H76A 1EEMA 1PQNA 3GKMA 2DBCA 2MBTA 2PGTA 2X8GA 3TKSC 4MZBA 3UL3A 2HI7A 4MA9A 4L0UA 5H5RA 2TRXA 3EC3A 1EOHA 3IR4A 2YN1A 3EURA 4ZL7A 1T4ZA 4K6XA 1MEKA 2VM1A 3J7Yk 1GSFA 3H4KA 2FHEA 1A0FA 2LNTA 2IJYA 2L59A 4XRDA 2WDUA 2H01A 4FYCA 1TU7A 1FG4A 4X0XA 5ECPB 1G6WA 3D6IA 2VD1A 4RI7A 3C71A 3UOMA 4GXZA 2IL3A 1YEPA 2LSTA 4MDCA 3A2VA 3GYKA 4F0CA 1F6MC 2FA8A 1JZDA 2XHFA 1THXA 4JU5A 3VPQA 5HQPA 4Q5NA 5F06A 5F07A 2IMDA 1XVQA 3FZAA 2YV9A 2YPMA 4QL9A 1SJIA 3TKQA 4HZ4A 2P31A 3UJ1A 1HQOA 2B5XA 2DJ2A 3TOTA 3DWVA 3E0UA 4NWYA 2QC7A 1N8JA 2CV4A 3TRPA 3IAS2 5JWQB 4NV2A 1GSYA 4MJAA 5KN3A 1K0AA 1MTCA 5D9XA 1C72A 1JLVA 4KDYA 1FW1A 4OFTA 1GSQA 1YZXA 2B1LA 3GNJA 3QMXA 1BYEA 1TK5B 2VUPA 3TRXA 3F4TA 1OYJA 5CYYA 3F8UA 1GSDA 1SKRB 2ON5A 1I5GA 5CAXA 4ZBAA 3KP9A 3GL3A 3KTLA 2FWHA 2I9HA 1HNCA 4LA1A 1T3BA 4O5RA 5DALB 2R2JA 1YDKA 2RLIA 1M7TA 4PUAA 1XFLA 2OJLA 3ME7A 3C1RA 4ZBDA 2GZYA 4DSSA 1WP0A 4ISDA 5IO0A 3CRUA 1IYHA 2ON7A 5LCZA 3I69A 4OMVA 1Z7RA 5HFIA 1A23A 1PL1A 1AIUA 2C0EA 2H70A 5GSSA 1Z5YE 1GSEA 5HR3A 2OE0A 4MH2A 1MDIA 1JZOA 1FO5A 2B6MA 3WT2A 1ZCPA 14GSA 3CSIA 1QGVA 5ELGA 5D93A 2WRTA 5GSTA 3IK7A 1GP1A 3VPTA 4O32A 1BJXA 1PGTA 2GT6A 3CTGA 2FNOA 2N5FA 1XOAA 2GSTA 3FZ5A 4V2LA 2BMXA 3DMLA 5JCGA 2GZPA 1RK4A 4WF5A 2C1YA 4LLRA 2HSYA 3RHCA 3I9V2 3GURA 2FUG2 4IN0A 1U88A 5FHIA 3EWLA 3DD3A 1HYUA 3MSZA 1AW9A 4BWSA 1H4OA 4MK3A 3QPMA 1GNWA 4ECJA 3ZIVA 2DMLA 3EVIA 4FH8A 4PXOA 3P90A 3NOFA 3CTFA 2IMIA 4NXIA 3M9KA 2RUEA 3QAWA 2HZEA 4Q5QA 2AUVA 2Z9SA 4PQ1A 4GCIA 1JZRA 3UARA 3D22A 3TB2A 1SU9A 2PBJA 1ZL9A 3LGCA 2F3MA 2YWIA 3DRNA 1G7EA 2H1DA 3L0HA 3ERWA 2CAQA 3UVTA 3VWWA 3CSJA 3WGEA 1WOUA 3UEMA 3F9UA 3KCMA 5J9CA 2G2QA 2YJ7A 2FWGA 2C8UA 1GULA 4XRAA 1W4VA 11GSA 3GH6A 5IOWA 1V40A 5G1LA 4PQIA 4DVCA 3F4RA 1TK8B 1SK2A 4EF0A 3HDCA 3I43A 3LYKA 4EDZA 3D4TA 4HDEA 3UMAA 4AJ7A 1THOA 3DKSA 4NHWA 2B1KA 2YANA 2H0IA 2MMOA 3GA4A 1U87A 2LEGA 4CDOA 2IMFA 3JCML 2MYGA 2H1GA 2H73A 5IMFA 3RBTA 1YY7A 4ECCA 1EEJA 1Z3EA 2HXKA 2LJAA 2F9SA 3FYGA 3M8NA 4PNGA 1K3LA 4YH2A 5IM9A 5JWOB 4GQCA 3VWVA 1EWXA 3A5WA 2F8FA 1ML6A 4XTSA 1VRSD 2K9FA 5E4WA 7GSSA 2LRTA 4ZB8A 5G1KA 4HEA2 4IBPA 5EVOA 3Q18A 4N30A 3M1GA 1OC9B 2M46A 3N9JA 1X5EA 4OD7A 3S9FA 1OC3A 2CAIA 1DE1A 1O8WA 3LJRA 4V1Ap 4EL1A 4EO3A 1VF4A 3LFLA 2AYTA 2FWEA 3AY8A 1PA3A 1ZYEA 2C3QA 3LSZA 5B6NA 5AIVA 1PX7A 4ZL8A 2H8LA 3ZRDA 2QSIA 5D73A 2H71A 4K9ZA 5GAND 1EGRA 3WT1A 2NPBA 5GZZB 4IS0A 3ZVJD 4F9ZA 2A2RA 3L78A 5E59A 2IPAA 1ERTA 3WGXA 4MF6A 3IBHA 2LQOA 1N2AA 2P0GA 1XZOA 2MMNA 3G7YA 3CYNA 4NMUA 3KH7A 3HZ4A 5ECOB 1SKWB 5IQYA 4GTUA 5J41A 3UVHA 3P2AA 1OC8A 3GH9A 2WJUA 1JHBA 1K0NA 2DSAA 3Q19A 5ECQB 2GDRA 2VL2A 1O8XA 1SENA 3FZ4A 2HYXA 1YF1A 2EIOA 4KB3A 4HUAA 2NVLA 1Z6NA 5COHA 3ZIJA 5A4WA 4KE3A 3HVVA 2L57A 19GSA 2K6VA 2EC4A 2B3SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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