2LV3A

Structure-functional characterization of grx domain of mus musculus tgr
Total Genus 21
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
21
sequence length
102
structure length
102
Chain Sequence
AREELRRRLRDLIEGNRVMIFSKSYCPHSTRVKELFSSLGVVYNILELDQVDDGASVQEVLTEISNQKTVPNIFVNKVHVGGCDRTFQAHQNGLLQKLLQDD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural analysis of glutaredoxin domain of Mus musculus thioredoxin glutathione reductase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin reductase 3
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mus musculus
total genus 21
structure length 102
sequence length 102
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2012-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2lv3A00
1YF1A 2VCZA 2NBSA 3E0UA 4TN8A 2YWMA 5HFKA 2HSYA 1X9SB 2LRCA 1ZL9A 2CX4A 3IE3A 1XXUA 5EVOA 3TGZA 1N2AA 3QDNA 4NXIA 3IV4A 19GSA 1PKWA 4PUFC 3F3QA 5LNKe 2C0GA 2GT6A 2MMNA 2H73A 4RI7A 3ZVJD 4QL9A 1SJ6A 4AJ6A 1R5AA 1GLQA 5IOWA 3TRXA 2MBSA 3CRTA 1TU8A 1F6MC 5C04A 4HZ2A 3WGXA 2H6YA 4HDEA 3HHVA 4WR5A 1B4QA 2GTUA 3IK7A 1F3BA 3UL3A 1F9MA 4PNGA 2VL2C 5ECKB 3I6AA 1ZGNA 1ST9A 2TIRA 4ZBAA 2XC2A 4J2FA 12GSA 1FW1A 1GRXA 3Q74A 4YQVA 2OE3A 3M8NA 1A24A 3O3TA 2H76A 4J56E 5B6NA 1F2EA 3EMXA 3LFLA 1GSDA 1OC9A 3F6FA 3HKRA 2JZTA 1HNBA 3TB2A 2L6CA 1BYEA 3VK9A 1EP7A 1SYRA 5A4UA 4L8EA 5G1KA 2R5GA 4JE1A 5ECLB 3RDWA 3ERFA 2RUEA 2WFCA 4LLRA 4TR0A 5CRWA 4EL1A 3VWUA 1A2MA 5AIXA 5ECOB 13GSA 3LYPA 1BX9A 4MH3A 4N0VA 4ZXGA 3K8NA 2GLRA 3I9V2 4BPYA 4F82A 1EWXA 1HNAA 3ZTLA 4POMA 4IN0A 2C3NA 2XBQA 3KCMA 3IR4A 4NAXA 4ZL9A 4MF7A 3A2XA 4V1Ap 2JL4A 2GQKA 4J57E 2YN1A 2IPAA 2C3QA 1BEDA 3I43A 3ZRDA 1NSWA 3KH7A 2IMEA 3FYGA 1TRVA 3BD2A 20GSA 5DVBA 4MLYA 1QFNA 3L0HA 3NIVA 3PGTA 2CA8A 1IYHA 3CTGA 3F63A 2I3YA 5GSTA 3L9VA 2NTOA 4KX4A 1Q4JA 1EOGA 2ON7A 3RHCA 3EWLA 4JR4A 3FZAA 3KGKA 3I69A 2CT6A 2CQ9A 3W8JA 3HCZA 2VCTA 3GTUA 4IQAA 8GSSA 4FYCA 4PNFA 4HUAA 4H86A 2YZUA 5GAPD 2B6MA 2H1DA 2O85A 4KCEA 3GKNA 3DEXA 5IO0A 5HR3A 2NVLA 2NPBA 1ZYEA 4N30A 2VCWA 1FB6A 4LL4B 1HQOA 4ZIJA 3C71A 4TXOA 1EV9A 5IMCA 2H66A 1O85A 1W4VA 5ID2A 1X9WB 2I9HA 3Q18A 4O5RA 4GSSA 5KN0A 3GV1A 16GSA 4WKWA 3TKPA 5D9TA 6GSXA 5HR2A 3IPZA 2HE3A 2H1GA 1ERUA 4N0ZA 1GNEA 3TKSE 1U88A 3G7YA 4O7HA 1PX6A 2F8AA 4WBJA 4X1UA 3MAKA 3MNGA 4ECIA 5E4WA 4O32A 2HRNA 2GDRA 1A0RP 1DE1A 4TXOB 4HQSA 3JCML 3HXSA 2IMDA 2C80A 4D73B 4HU9A 1AUCA 4RQRA 5ECRB 1GUHA 2GSRA 1ILOA 3GL3A 4MJBA 3IXRA 2RM6A 1H75A 3PR8A 1U3AA 2YCDA 3TJFA 1EZKA 1T4YA 2YJ7A 1XWBA 5DCGA 3HVXA 1K0NA 1UC7A 4EVMA 5LCZA 1JLWA 1BG5A 3TKSC 5A5KA 4NHZA 1XFLA 3TJJA 4ECBA 5JWRB 4RUVA 5AN1A 2HZEA 4KDYA 2H0HA 2XPDA 2KP1A 4ULXA 2HRFA 2X8GA 1DSBA 4MJAA 5ECNB 3LYKA 4POKA 1I9DA 4KE3A 1TP9A 5IMDA 1RQMA 1LU4A 2H74A 3DD3A 1GTBA 6GSTA 2HLSA 3D4MA 5B7CA 3ZVJA 1XVWA 1YEPA 4BL7A 2GSQA 4EO3A 4GSTA 2G2QA 2I81A 1ZMAA 3LORA 3ZMKA 4NMUA 3ZL5A 3D5JA 3KMOA 1ML6A 1T00A 5AISA 1VF1A 3M0FA 3DYRA 4I8BA 2OACA 2CX3A 5F0GA 4ECJA 4I5QA 5IMZA 3ME7A 2PERA 1AQVA 2H0IA 4ZB9A 2X99A 2ZNMA 2L59A 5CO3A 1SD9A 1AAZA 1Z9HA 2KLXA 2XHFA 3M3MA 2PPTA 1OYJA 4V2MA 3F4RA 3VURA 1BAYA 2MZCA 1B9YC 4MPFA 4L0WA 3FR6A 2CVKA 2KUCA 3UBLA 1SKSB 4RI6A 1N8JA 3Q6OA 5CRHA 3GSTA 3UBKA 5F05A 1MDKA 2YWNA 3TKQA 1EGRA 4ML1A 3GA4A 5ECMB 2LTKA 3F3RA 3GL5A 4GLTA 2E2MA 4LMWA 3WGEA 4GXZA 3BCKA 3KEBA 1X5EA 3LG6A 4F0BA 1T8EB 2H71A 2QGVA 3F9UA 2DJ1A 3VWVA 6GSYA 5B6MA 2LV3A 2WB9A 2B3SA 1GTAA 4MABA 3EU4A 4PX1A 3VI7A 3H1NA 4GQFA 2XPEA 2DIZA 4JZQA 1AXDA 5G5FA 4G19A 2IFQB 2KOKA 1QMVA 2V41A 3VPQA 5G30A 2AB6A 3W8SA 3C7MA 5ABRA 2B5XA 3A5WA 1O7UA 3FR3A 1R4WA 2OKAA 3FEUA 4Q5NA 2H1AA 6GSUA 4BVYA 3GSSA 3HDCA 1PKZA 2V6OA 4L5OA 4HI7A 5F8BA 2DJ0A 3CSHA 2GZZA 2P5RA 2L4CA 3CSIA 2B7JA 1A23A 2V2GA 1GSUA 1XWAA 4HS1A 1V9WA 1SYXA 4EKZA 2VD1A 3Q19A 5L71A 4FYBA 4KA0A 1YKAA 2L4QA 1EV4A 1F37A 4MZCA 1WIKA 1ERTA 3UVHA 2JADA 1A8LA 4BVXA 2AYTA 4KDUA 1QK8A 4ZB8A 4EXJA 1K0BA 1V2AA 3M1GA 3ZYWA 2FCHA 1HNCA 2LRTA 5IMFA 3ZZXA 2A2SA 1IYIA 1V40A 3TJBA 1FVKA 3TOTA 1G6WA 1SKWB 3ZMLA 1ABAA 5HR1A 4OO5A 2H01A 4K0NA 9GSSA 2KP2A 2GQLA 3F4TA 2CAQA 5LD0A 1V57A 3IC4A 3EU3A 5B8AA 4GWRA 1AC1A 2FLSA 3ZIVA 2OA7A 2PWJA 4F0CA 2DLXA 2F9SA 2YJHA 2VCVA 2X8HA 3KH9A 3QAVA 1WRYA 1O73A 2JSZA 1XW5A 4I97A 4IJ3A 5CAXA 2H1BA 1TRUA 4NPBA 3F8UA 3FY7A 2O87A 3IA1A 3NOFA 1LJRA 3UJ1A 3QFAC 3RBTA 4OMVA 1USBA 2V1MA 3KTBA 3KM6A 3FZ9A 1OVNA 3DRNA 2OE0A 4KUNA 1G7OA 3GKXA 3APQA 5DAKA 1RK4A 1U87A 2I1UA 4K2DA 4PXOA 3IOSA 1XWCA 3VWWA 2REMA 2ZCTA 1FO5A 3HY2A 3WT2A 4AJ7A 1TW9A 1FVJA 4ZILA 4OO4A 4Q5QA 3HZ8A 2OE1A 2PBJA 2VOCA 5D9WA 4DVCA 1GUMA 1XWKA 3S9FA 1OC9B 4NV2A 1B4PA 1A8YA 2PU9C 2HSHA 4MH2A 2E7PA 3LXZA 1A0FA 3VI5A 5F06A 4P3YB 3ZREA 1PL2A 2FA8A 2VM1A 3KTLA 4F2IA 5GSSA 10GSA 4XRDA 5IO2A 2FWHA 1M99A 2A2RA 3QAWA 2LSTA 4IVFA 4POLA 2B7KA 1Z7PA 3HA9A 5D9VA 1WE0A 1KTEA 3BBYA 5IM9A 1NM3A 1TI1A 1J08A 1C72A 1QQ2A 3GH9A 4N11A 3HVVA 4DSSA 4IW9A 3RHBA 1PQNA 4TKYA 3J7Yb 3LSZA 4I2UA 2VL3A 5DDLA 1HD2A 4YQMA 3ERWA 2MMOA 4NWYA 3GKMA 2G0FA 4L0UA 2FGXA 1A2JA 2B1KA 2AV4A 1GULA 5FHIA 4OCEA 2QKEA 1O8WA 3HJMA 4ZL8A 4OFMA 2VL9A 3R2QA 2F3MA 2HNLA 5DCHA 3P8WA 2R3XA 1GNWA 1PA3A 2R6KA 2ZUPA 2WGRA 4K0GA 4EE0A 1JLVA 4LMVA 4XS6A 1J0FA 1B8XA 4HQZA 4K8MA 1T1VA 1XIYA 4Q5RA 4E8EA 3HZ4A 5JCGA 5D8IA 2WULA 2CVBA 4KSOA 1VRSD 5KN3A 4DSSB 1MEKA 1XW6A 2JSYA 3UEMA 6GSSA 2DMLA 2R2JA 2LNSA 3TOUA 4KGIA 3CYNA 4IQ1A 3HJOA 1ACVA 3FK8A 4OFNA 1GH2A 2DJJA 2LQOA 1JZWA 1EP8A 2XBIA 4YAVA 2LQQA 4F9ZA 3GTUB 4JR6A 4K1FA 3ZFLA 1TK5B 5C00A 4KDXA 3UMAA 4IGJA 3QOUA 3MDKA 1EGOA 5AIVA 4HJMA 2YWOA 2C8UA 4N10A 3FZ5A 4NV5A 2NDOA 5D9XA 5JCWA 3UAPA 4I6XA 3D22A 2F8FA 1O8XA 2LEGA 22GSA 4WETA 3TRPA 2HXKA 1QUWA 4ZBDA 5ID2B 1XZOA 3VPTA 2CZ2A 1XOBA 2J23A 2H30A 2MBTA 3A3TA 5DJLA 4K9ZA 5CP1A 2DJKA 2P5QA 2OJLA 3NZNA 1AIUA 2P0GA 1J9BA 4XS4A 3RPNA 3GFKA 5H5SA 1V98A 2ALBA 4MF5A 2JACA 4K7IA 3C1SA 3FRCA 2CAIA 4OWYA 4MCUA 2MYGA 2O8VB 1JZDA 3LWAA 4PGTA 1SKRB 2YNXA 1TTZA 2GS3A 4IJIA 2HZFA 2VAFA 2VLVA 1TU7A 4MZBA 5E59A 5KEJA 2KHPA 2BTOT 4ZBBA 5GAND 3CSJA 1PMTA 5HQPA 1SK0A 4F03A 2N5BA 4FYUA 2VLTA 3IRAA 1TRWA 4XS4B 1TOFA 2C0EA 2WJUA 1Z5YE 5HR0A 1ZZYA 4DSQA 2CZ3A 2AJQB 3TDGA 3V1WA 2HZEB 4KB3A 4BA7A 4IKHA 2H70A 3ED3A 4G10A 4WF4A 1Y6EA 1ZCPA 1MD3A 4TRXA 2JZSA 3DIEA 3UVTA 3WD6A 4FIWA 3M9KA 5ECQB 3D0ZA 2H6XA 1R5PA 2DIYA 2GZYA 2YV7A 1GSFA 4XCSA 1XCCA 4GCIA 4JBBA 1SK1A 5ECHB 4HEA2 1M9BA 2MMZA 4K7NA 4OCFA 4PUAA 2VCQA 2ES7A 5DALA 4WEYA 2VCXA 3BJ5A 2R37A 3BOAA 4KSMA 2PMTA 1FHEA 2H6ZA 3RPPA 1E2YA 3N5OA 3C8EA 3ZLPA 2J9HA 5DQYA 1T7PB 1TRSA 1SD8A 2WS2A 4CW9A 1PD21 1Z6NA 4MJCA 1PN9A 3PH9A 3IDVA 4ECCA 2HFDA 3FHKA 4ACSA 1THXA 3MSZA 4AGSA 2B5YA 4MF6A 4X0XA 4HU7A 4V2LA 2K8SA 4RQXA 3KJYA 1ERVA 3TJGA 5KN1A 3CRUA 4GF0A 4HJ2A 2GZPA 4WF5A 5CNWA 2GSSA 3IK9A 4QL7A 1K0AA 2CVDA 3IBHA 1YZXA 1GSYA 1NW2A 5HFGA 4TR4A 2IL3A 1WMJA 3UIWA 3MWHA 3GYKA 5A4VA 4PQHA 3EYTA 4G9HA 2AAWA 5AGYA 2VIMA 1YY7A 11GSA 3EURA 2H19A 2PVQA 2YZHA 2LS5A 4CDOA 2EIOA 5DQSA 5ELGA 2HYXA 4XHMA 5CYYA 1YF0A 4JEDA 3WGDA 1MD4A 4ZB6A 5ECIB 4K6XA 3C73A 4KW6A 4IP1A 2M46A 2WDUA 2LUSA 4GTUA 2FD3A 3DKSA 5F07A 1UVZA 3CBUA 3DMLA 2WCIA 3D6IA 3KP8A 1XWGA 1PX7A 3HVSA 2O7KA 2EIQA 3W6GA 2LJRA 1G0TA 3ZIJA 1GTIA 3U5RE 3KD0A 1K3LA 3A2VA 1E6BA 3TKRA 3VFIA 7GSSA 1YJ6A 1R26A 1WOUA 2IIYA 2ON5A 2EC4A 3LGCA 3EE2A 5ELAA 2OADA 1ZOFA 1XOAA 2MMAA 1PGTA 2I4AA 2RIIA 1X0RA 3E3EA 2FNOA 1I5GA 1FG4A 4DEJA 2BJXA 2H8LA 6GSWA 3GURA 1TJDA 4G2EA 4MMMA 4NHWA 4JU5A 4MDCA 5IMAA 2IWTA 2FY6A 3GIXA 1GSEA 2WRTA 4WBRD 2B1LA 1M2BA 1K0OA 1WPIA 1MDIA 5J9CA 3LQ7A 1CQGA 3C1RA 4HZ4A 1S3AA 1THOA 5ECSA 3ERGA 2D2ZA 2VUPA 3QD9A 2B5EA 1GWCA 5DBQA 3CXGA 3OR5A 2VL2A 1OC3A 4Z7XA 1WWJA 3DVXA 3CMIA 1K3OA 2GVPA 1KNGA 3BCIA 2GSTA 2FWGA 3WT1A 1AW9A 2LJAA 2C0DA 3P2AA 1O81A 4AF2A 1G7EA 5CREA 1XBSA 1OAZA 1GSSA 1UA5A 2L5LA 4E8HA 1GL8A 3ME8A 5EY6A 5EL8A 3VLNA 5GZZB 3G9BA 2C0FA 2AHEA 4MZWA 3H4KA 3J7Yk 5G5EA 4XS1A 1Z7RA 3TUEA 5G2ZA 1ZYQB 1AQXA 3G7JA 4MP4A 1SL1B 3APSA 5ECPB 3WYWA 1JZRA 1JHBA 4TXVA 3QFBC 4GRFA 3EVIA 3IAM2 1PSQA 1URMA 5D73A 3EINA 2K8VA 3P7XA 2L57A 2JU5A 4BWSA 5DAKB 3DXBA 3LJRA 1YDKA 4KAEA 3GN3A 3KMNA 1M2DA 3UOMA 1EEJA 3ZFBA 1R7HA 4QQ7A 3DWVA 1SJIA 1BQ7A 2VD0A 14GSA 3EC3A 1DUGA 2FWEA 5J41A 5A4WA 3HJPA 1VF4A 3F4SA 1MDJA 1X5CA 5CRDA 2LKUA 3QCPA 4ILFA 3AY8A 1X9MB 2QC7A 3LXTA 2X64A 2LNTA 1B9XC 1F3AA 1QGVA 4BWQA 2GT5A 4HOJA 4LL1B 5COHA 1M9AA 5CRGA 4TW5A 5J3RA 1A2LA 5J5NA 2IMKA 1PRXA 2L6DA 1VF2A 3GKKA 5B8BA 2PN8A 3M9JA 4ZL7A 3E9JB 3CTFA 3HD5A 3H93A 3F0IA 1OE7A 2K18A 3PINA 2O89A 2DJ2A 1SK2A 2L5OA 5H5RA 3APOA 4PQ1A 1DE2A 1U6TA 3L9UA 4AJ8A 4EF0A 3F6DA 3L9SA 2FHEA 2IN3A 4EDYA 1V58A 1ERWA 4POBA 4JRRA 2K9FA 1K0CA 2V6KA 1GSQA 5IOXA 1TKDB 3DVWA 4I2TA 4PQIA 1S3DA 2VO4A 4MJEA 4DSRA 5FWGA 4MA9A 2FA4A 2LJKA 5FT3A 1B48A 2P31A 2LRNA 4KNDA 4D73A 3GHAA 4OD7A 2OBKA 1T3BA 2VM2A 1ON4A 3TJKA 2OBIA 3O76A 1U3IA 4IHUA 3US3A 4FH8A 4ISDA 1G6YA 4IS0A 3GH6A 3QAGA 4XIHA 1WP0A 5KN2A 4TVEA 5H5QA 2DC5A 1OKTA 3P90A 1Y25A 4X43A 5D93A 1Z6MA 2E2GA 3H79A 5D96A 4LA1A 2JZRA 1M7TA 1DBYA 2E0QA 1H4OA 3ISOA 3FKFA 5JCUA 1K0DA 2N5AA 1K0MA 3U6VA 4L5LA 2F51A 2FWFA 3UARA 5G1LA 4CHSA 2C1YA 3DGQA 1VGLA 3GNJA 2HI7A 3TKSA 3QMXA 3IAS2 2M80A 3G7IA 3O6TA 1JFUA 3LEFA 1Z3EA 4IBPA 1PL1A 1W89A 4V2NA 4EUYA 4O92A 2GQMA 4YAPA 5DJMA 1TXXA 3KIJA 4YH2A 4EC0A 5IQYA 3RAZA 2DMMA 1NHOA 2IMFA 2RLIA 2EIRA 3FZ4A 1SL0B 1OKDA 5J4UA 2CV4A 2AUVA 2DBCA 3KZQA 4ID0A 1OC8A 1EEMA 1YEXA 17GSA 1XPVA 2X8CA 2RM5A 1M0UA 2TRXA 2YP6A 4GQCA 4V1Ag 2Z9SA 3GRXA 3D4TA 4XRAA 3KP9A 2GGTA 3TCOA 2IJYA 2N5FA 1GTUA 3SBCA 2BMXA 4KH7A 5G31A 2VLUA 1JZOA 2C4JA 4WXTA 5ENUA 1XW9A 1SENA 5EPFA 3VWXA 1HYUA 3HYPA 4IP6A 1Q98A 4MPGA 5J9BA 5JWQB 2YPMA 1TI3A 1GLPA 6GSVA 3L78A 2YV9A 3FR9A 3SWLA 4FO5A 1BJXA 3D21A 4OFTA 1TK8B 4MK3A 1LBKA 1RW1A 1K3YA 1X5DA 4GSNA 3N9JA 2PVOC 2HT9A 1UN2A 2DSAA 3GX0A 3L4NA 2IFQA 4EDZA 3QPMA 3FW2A 3GX8A 3QR6A 1YQ1A 1O6JA 1SJZA 4TR1A 2H72A 5IPGA 2IMIA 5HFIA 2H0GA 1T4ZA 2H75A 1XVQA 2YANA 5DALB 2V32A 2WZ9A 4ML6A 1KBNA 2YWIA 3KXOA 1EOHA 1MTCA 1GP1A 3H8QA 18GSA 1SL2B 5IIZA 1CQHA 3A2WA 1NHYA 3ZITA 3GUSA 2FUG2 2R4VA 5IPHA 1QXHA 4K7OA 1M2AA 2M72A 1SU9A 4KCAA 5INYA 2DJ3A 1KEBA 4XTSA 2QSIA 2PGTA 3TRQA 2PUKC 2RUFA 2C3TA 3EMPA 1GUKA 4TR1B 1FB0A 1OE8A 1TK0B 1YKCA 2K6VA 2TRCP 2YOIA 4TR3A 3GMFA 4WR4A 1FAAA 1VF3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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