2LV3A

Structure-functional characterization of grx domain of mus musculus tgr
Total Genus 21
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
21
sequence length
102
structure length
102
Chain Sequence
AREELRRRLRDLIEGNRVMIFSKSYCPHSTRVKELFSSLGVVYNILELDQVDDGASVQEVLTEISNQKTVPNIFVNKVHVGGCDRTFQAHQNGLLQKLLQDD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural analysis of glutaredoxin domain of Mus musculus thioredoxin glutathione reductase
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mus musculus
molecule keywords Thioredoxin reductase 3
total genus 21
structure length 102
sequence length 102
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2012-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2lv3A00
1PD21 3F0IA 3D0ZA 1XWCA 2FGXA 3P7XA 1A0FA 1AW9A 4ML1A 1TU8A 4LL1B 2FWHA 2L5OA 3IBHA 2MZCA 4MZWA 4ML6A 4NHZA 5IM9A 1O85A 3DVWA 3VWVA 1EGRA 4YH2A 5KN0A 4OCEA 2LNTA 1FW1A 2C8UA 2NPBA 3EINA 5ECSA 3CSJA 3TKSC 2MBTA 5J5NA 3F3RA 1V40A 3GIXA 2LV3A 3UIWA 1N8JA 1EV4A 2VM1A 4V1Ag 1GULA 5DDLA 3DWVA 5B8AA 4IP6A 2VLVA 2J23A 2H1AA 1FB6A 4MMMA 3CRUA 4L5LA 1EOGA 3KD0A 2C3TA 4TR0A 3D22A 5ECKB 1QMVA 4IELA 4IS0A 3IRAA 2VCZA 4POMA 3ERWA 4ECIA 3F4RA 3Q6OA 1GLQA 2QGVA 4O5RA 1ON4A 1HNAA 2IPAA 2VD0A 5D9TA 4ULXA 1CQGA 1SL0B 3A2XA 4ISDA 1F6MC 3FZ5A 4KDXA 5D9WA 3FZ9A 5G2ZA 2JU5A 2M80A 1B8XA 2KP2A 4PQHA 4HJ2A 5D8IA 3TJKA 4AF2A 1G7EA 2O85A 2ALBA 3TKQA 2DJ2A 4YQUA 3CBUA 3TB2A 4JR6A 4IGJA 5ENUA 4TXVA 2VLUA 5AGYA 1BJXA 1EGOA 1ACVA 2BJXA 4EDZA 2C0FA 3WGEA 1XOBA 1XWBA 4HEA2 2GTUA 3RPNA 2XPDA 2OBIA 1QXHA 1SYRA 1TRWA 2C0EA 1S3DA 4MF5A 5IMCA 10GSA 2L4CA 2GSSA 2H0GA 3F3QA 2HSYA 3KZQA 3WT2A 2XBIA 1TOFA 3ZIJA 2LNSA 4TXOB 5IMVA 5IO0A 1DE1A 2CX4A 3N9JA 1NHOA 1ZCPA 1FVJA 4TOPA 1HD2A 4J56E 4L0UA 1X5DA 2IIYA 2DJKA 2WDUA 4FYUA 3APSA 1SJZA 3HYPA 1V2AA 22GSA 2IMDA 5H5QA 4TW5A 1ILOA 3GSSA 2LTKA 3VWUA 4MP4A 5A5KA 2FCHA 1DUGA 5CRHA 2E2MA 2F51A 1T00A 4TXOA 5C00A 3QD9A 2QSIA 3CXGA 4Q5QA 16GSA 2VO4A 4WETA 3ZFLA 3LSZA 3H8QA 1PKZA 1EZKA 1M2BA 5LNKe 3KH9A 4V2LA 3K8NA 1SU9A 2HI7A 1TRUA 1FVKA 3I9V2 1BYEA 1XCCA 1QUWA 5HQPA 4RI7A 2PERA 1TU7A 1KEBA 3NOFA 2NBSA 5G30A 2MYGA 3NIVA 3S9FA 3IK7A 1Y25A 1USBA 1FAAA 5J9BA 4PUAA 1SK0A 3GV1A 5F06A 2GSTA 4TRXA 3ZVJA 4DSSB 2B3SA 1J9BA 4JR4A 1PKWA 1PSQA 1TK5B 2P5QA 4XTSA 2YN1A 3JCML 1I9DA 3RDWA 3A5WA 5COHA 4EE0A 2DMLA 2M46A 3E3EA 3F8UA 3APQA 4MDCA 4WBRD 4Q5RA 1K0AA 3HA9A 4DSSA 5CRDA 2RM5A 1K0BA 2HRFA 4MH3A 4E8HA 2O87A 1SKSB 4XRDA 2F8AA 6GSXA 4KNDA 2M72A 5ECHB 2WJUA 3P2AA 3KMNA 3ZFBA 3LYKA 5H5SA 1O7UA 5GAND 3IPZA 1OKDA 3VFIA 4ACSA 1BQ7A 2C4JA 2H0HA 4MH2A 3EURA 3LFLA 5HR0A 1EOHA 2GQKA 1U88A 2B1KA 7GSSA 2A2RA 3HZ8A 2GDRA 3E0UA 1WMJA 4KX4A 4KAEA 1A8LA 3KP9A 3HD5A 1K0MA 5H5RA 4NMUA 2CAIA 4ECCA 1VRSD 3L0HA 2E2GA 3PINA 4XHMA 4IW9A 4J57E 1I5GA 1AQXA 4KW6A 1EEMA 4KDUA 1A2LA 4WBJA 1XIYA 4YAVA 4DEJA 2CZ3A 3LORA 4KSOA 1XOAA 4BL7A 4IHUA 5FWGA 3GKMA 4V2MA 1MTCA 1URMA 4ZXGA 1DBYA 2B7KA 2LRCA 2HNLA 3F6FA 5G31A 3A2WA 2E7PA 2IMIA 2YP6A 1GSSA 2CT6A 3BCKA 4WF4A 5C04A 3FZAA 3G7JA 5HR2A 4D73B 4MZCA 5AISA 3UBKA 3IHQA 4IKHA 2TIRA 3W8JA 2OA7A 3O6TA 2H8LA 4G9HA 4OCFA 1MD4A 1GSEA 3KP8A 2H71A 4MF7A 1IYHA 3D4MA 2V32A 4I97A 1WPIA 2IWTA 2OJLA 1R5PA 1WP0A 5ECRB 4FIWA 4LLRA 1TW9A 5CREA 1RK4A 1Z9HA 2KUCA 4D73A 2K8VA 3IA1A 4GCIA 4KH7A 4XCSA 4RQXA 5ECPB 3UMAA 4XS1A 2OKAA 2OE1A 5DQYA 3L78A 1GTIA 1XBSA 1VF4A 1GNWA 5B7CA 1G0TA 1M2DA 2FUG2 3VWWA 4QQ7A 3HY2A 4TKYA 1ZYQB 4NAXA 4H86A 5DQSA 1KTEA 2BMXA 2C0DA 3VPQA 1XWKA 5E59A 2NTOA 1EWXA 2H1BA 1NHYA 1LU4A 3KIJA 2HLSA 2E0QA 2P5RA 4HS1A 5DVBA 5JCGA 2X8GA 4RQRA 1K0NA 5L71A 3GURA 1HNCA 4EVMA 2C3QA 3GMFA 2C80A 6GSSA 1R26A 5ECIB 4MZBA 1Q4JA 5CAXA 2RM6A 3LGCA 3H93A 2V1MA 3ZITA 1XVWA 4YQMA 5KN1A 4XIHA 1MEKA 4ZL9A 3KJYA 3CTFA 3VI5A 4PQ1A 4P3YB 1M0UA 2R3XA 3WT1A 4EDYA 1N2AA 4RI6A 4OFMA 3M9KA 3RPPA 4X1UA 2FHEA 3LEFA 4K7OA 1GRXA 2CVBA 4O7HA 2KLXA 1QGVA 2VLTA 3PH9A 2YCDA 5DAKA 3ZTLA 1WE0A 3TKPA 2GT5A 3ZVJD 2DLXA 2H75A 4LL4B 1PQNA 3GKKA 2DJ3A 4EL1A 1MDJA 4POKA 4GWRA 2HRNA 1SJ6A 14GSA 1PL1A 3FHKA 4IJIA 3IAS2 4V1Ap 4FH8A 1TJDA 2AUVA 2VL3A 3CRTA 1MDKA 5G1KA 3R2QA 3MNGA 1Z6NA 2G2QA 4HZ2A 4WXTA 1M9BA 2AYTA 3O3TA 3QFAC 4NPBA 1OAZA 1HYUA 1H4OA 1K3YA 4K9ZA 2GLRA 5LCZA 4K6XA 5HFIA 2HZEB 1V58A 1SENA 3UARA 5CRGA 2F3MA 5DBQA 1TRVA 1EP8A 2HSHA 4ZL7A 5D73A 1A0RP 4MPGA 1VGLA 1S3CA 5B6NA 4MJCA 2EIOA 2F8FA 9GSSA 3ZREA 3HJOA 3U5RE 1FB0A 2HZEA 2K8SA 4G10A 5F0GA 1NSWA 1U3IA 4FYCA 3GA4A 4TR1B 1MD3A 1WRYA 2C1YA 2XHFA 4DSRA 3HHVA 2JZSA 4EC0A 1GP1A 5B6MA 1GUHA 1G6YA 2ZCTA 1QFNA 1ZGNA 4HQSA 2WCIA 2Z9SA 1XW6A 6GSWA 2YNXA 2WZ9A 1F37A 3M3MA 3F9UA 3H1NA 2CX3A 3QOUA 2RLIA 4TR1A 2F9SA 5KN2A 1GSYA 1PRXA 4KSMA 1T3BA 3V1WA 3VK9A 1OE7A 1HQOA 2H01A 1M99A 5IMFA 2PPTA 1SKRB 3QAGA 1AC1A 3MSZA 5D96A 2H6ZA 1DE2A 3LJRA 2P31A 4GQCA 1UVZA 1THXA 4MJAA 1A8YA 3H79A 3IAM2 4TVEA 3C71A 3FR6A 2ON5A 1FO5A 5DCHA 1TK8B 1SK2A 4ZL8A 1WOUA 2DJJA 2C0GA 5CO3A 2MMNA 2O89A 3IE3A 2JSYA 3FYGA 3FR3A 6GSVA 3QMXA 3GL5A 4F82A 1GUKA 1ZL9A 3GH6A 2VM2A 4ILFA 1OC3A 3GTUB 3Q74A 5IPHA 3QCPA 2JL4A 2XBQA 4GLTA 3ZMLA 3LYPA 5GZZB 3CTGA 3M9JA 1THOA 1B9XC 1O6JA 3ZLPA 4EKZA 3I6AA 2D2ZA 4OMVA 17GSA 2A4VA 2PN8A 2YANA 5HFGA 1QK8A 3ZMKA 1J0FA 1E6BA 1TK0B 2YZUA 5CYYA 3GTUA 4I8BA 1XWGA 4GSNA 1T4YA 4K0GA 4I2TA 4K0NA 3P8WA 4DVCA 3EVIA 5DALB 2CV4A 2VAFA 5DJMA 5LD0A 4ZBDA 3M0FA 4MA9A 1EP7A 3GH9A 5AIXA 1ML6A 1K0CA 3C1RA 1EEJA 1YEPA 2PMTA 4KE3A 2QC7A 3TOTA 2X99A 2I9HA 2H30A 1X5CA 5IOXA 1PX7A 1SJIA 5JWQB 2IN3A 3ERFA 3GN3A 1JHBA 1RQMA 2JADA 3IOSA 3QAWA 5FHIA 1OYJA 2VL9A 4DSQA 3KMOA 5DALA 4PGTA 2CQ9A 3DEXA 3ME8A 2GVPA 1SKWB 1GTUA 2FD3A 2IFQB 3QDNA 2VUPA 2H74A 1E2YA 1ST9A 5IOWA 2VCTA 4PXOA 3N5OA 1GSDA 4OD7A 1TXXA 4ZB9A 2A2SA 2FA8A 3I43A 4PX1A 4GSTA 4AJ7A 3WYWA 4IP1A 2IMFA 3DRNA 1Q98A 5DCGA 4NV2A 2PUKC 3TKSA 4ZIJA 3HVSA 4XRAA 1ZZYA 3RAZA 1SL1B 2IFQA 3HVVA 4F0BA 3M1GA 3HKRA 4CW9A 4K1FA 1PX6A 4FYBA 2LUSA 2WULA 3HXSA 5J41A 3UBLA 2B1LA 2P0GA 2DBCA 3ZIVA 2DIYA 1UN2A 2OADA 1OE8A 1HNBA 2YOIA 1V98A 1VF1A 4K2DA 2IMEA 2XPEA 3TCOA 1OVNA 2RUFA 1W89A 4IVFA 4AJ6A 1Z6MA 4X0XA 3FY7A 2H70A 2L4QA 2FWGA 1LBKA 4QL7A 3E9JB 3LXZA 4MJEA 2K18A 4EXJA 1A23A 1A2MA 2X8HA 2HZFA 1SD9A 4E8EA 3G7YA 1SD8A 3LQ7A 4GSSA 5EL8A 3UAPA 1XWAA 3D4TA 3KTLA 3ZL5A 3AY8A 1OC9B 1S3AA 4NV5A 4GTUA 2KOKA 4Q5FA 3GKXA 3ZYWA 5G5EA 2KP1A 2YWMA 3F4TA 1R5AA 1T8EB 5IMDA 3TDGA 4Q5NA 1ERVA 5KN3A 3U6VA 4CDOA 1Z3EA 2H72A 3RHBA 2OACA 5IO2A 3WGXA 1WIKA 1AQWA 3MWHA 2EIRA 4NWYA 1O8WA 2IMKA 3DKSA 1OC9A 3RHCA 3EMPA 2C3NA 4I2UA 4TR4A 1PMTA 2WB9A 5A4UA 4N30A 4O32A 2FWEA 13GSA 5D93A 5ELGA 4MJBA 3CSHA 1ZOFA 5B8BA 3CMIA 3DGQA 2O8VB 2HFDA 1R7HA 2GQMA 2HXKA 2I81A 4KGIA 1EV9A 4OO4A 5EVOA 4GXZA 4ECJA 4HUAA 5JCWA 1X9SB 2CAQA 3UL3A 2H73A 6GSTA 2RUEA 1O73A 2H66A 3OR5A 1AIUA 3GRXA 1V57A 1JZDA 2OE3A 4JEDA 2YWOA 2FNOA 1B48A 3GFKA 5A4VA 2V41A 1RW1A 3FW2A 2GS3A 4LMVA 3UEMA 1TTZA 3TKSE 3FKFA 4F9ZA 5DAKB 2LQOA 1M9AA 2VCVA 2L59A 3UJ1A 1ERUA 2B7JA 1IYIA 2EC4A 1LJRA 1ERTA 2CZ2A 2L6DA 2YZHA 2LS5A 2PU9C 3Q19A 1BAYA 5F05A 1PL2A 2VL2A 2YJHA 1FHEA 3GKNA 4TR3A 2FWFA 2PBJA 4LA1A 4ZB8A 3C73A 4ZBBA 3GUSA 3DD3A 1GSUA 4ZBAA 5IMZA 3QAVA 2VD1A 3A2VA 3W8SA 2KHPA 4EO3A 4HDEA 3C7MA 2B5EA 1JZWA 3FRCA 2GGTA 1XVQA 2LSTA 12GSA 1K3OA 3L9UA 1CQHA 1XW9A 2YPMA 3DIEA 1F3BA 3HDCA 4XS6A 5G1LA 2H1DA 3L9VA 1T1VA 2DC5A 1X9WB 5ECNB 1TI3A 1GLPA 2VCXA 5AN1A 3F63A 1KNGA 3PGTA 1GWCA 4OO5A 1J08A 2YWIA 4Z7XA 2WFCA 2YV9A 4BPYA 3FR9A 2K6VA 3EU3A 1YZXA 5JCUA 3BJ5A 1F3AA 2ON7A 3ZZXA 1JZOA 2B6MA 3KTBA 4KUNA 1C72A 2LJRA 1AUCA 1BEDA 1OKTA 5CRWA 4HJMA 4WR5A 4ZB6A 3O76A 3D6IA 8GSSA 2N5FA 1ZMAA 1QQ2A 3ISOA 1TDIA 4K7IA 2R4VA 2H76A 4I6XA 6GSUA 1GUMA 4ZILA 4K8MA 5ID2B 1K0OA 1PGTA 5F07A 4NXIA 2IJYA 3TJFA 1UC7A 2AB6A 3IR4A 3TRQA 2DJ1A 2X64A 1BG5A 3HZ4A 1T7PB 4JU5A 3TJGA 5D9XA 3TJBA 4PNFA 2FLSA 2GSQA 1K0DA 4L8EA 1T4ZA 2XC2A 4QL9A 4BWSA 3BBYA 4MABA 11GSA 4JRRA 1Z5YE 1JFUA 2CVDA 5G5FA 2OBKA 1O81A 5ECQB 3UVHA 1B4QA 4HI7A 5ID2A 3IC4A 4MF6A 2AAWA 5ECOB 5IQYA 4HU9A 5JWOB 4GRFA 4YQVA 3KXOA 4J2FA 2R2JA 1WJKA 4IJ3A 4ECBA 3US3A 1W4VA 1V9WA 3APOA 2H0IA 3IXRA 3WD6A 3MDKA 2DIZA 4EUYA 4ID0A 4KCEA 5GSTA 2DMMA 1A24A 1F9MA 4G2EA 4RUVA 3I69A 4IN0A 2B5YA 5CNWA 2TRXA 1TRSA 3TUEA 2NDOA 4IQAA 3IK9A 1JZRA 3ZRDA 2V6KA 1TP9A 2CA8A 2AJQB 4F2IA 4OFNA 5AIVA 4JE1A 3IV4A 1K3LA 1DSBA 1YEXA 2WRTA 2L57A 1F2EA 3PR8A 4PURA 4PUFC 1XW5A 5FT3A 3D21A 3KEBA 2X8CA 1YJ6A 3A3TA 4MPFA 5IIZA 3LXTA 1AXDA 3EC3A 4PQIA 18GSA 2O7KA 5J4UA 2J9HA 2YWNA 4K7NA 5J3RA 2ES7A 4N0VA 1MDIA 1ERWA 1XXUA 3EU4A 4HZ4A 5GSSA 1YQ1A 3UVTA 1B4PA 3VLNA 3HVXA 3HCZA 3ERGA 4AJ8A 3KM6A 1WWJA 2ZUPA 2R6KA 1FOVA 1GTAA 4I5QA 3FEUA 3GHAA 2HYXA 1G7OA 1H75A 3C8EA 1X9MB 1SL2B 4MK3A 2VL2C 3GX0A 2ZNMA 5J9CA 3GNJA 2BTOT 1ZYEA 1PN9A 3CSIA 2REMA 4N10A 1A2JA 2TRCP 2JACA 1Z7RA 3L9SA 1Y6EA 5INYA 4IBPA 3LG6A 5IPGA 4AGSA 4BA7A 2N5AA 5DJLA 4F0CA 2GQLA 4G19A 2G0FA 2L6CA 3F4SA 5A4WA 3TRPA 4CHSA 3TRXA 4N11A 1KBNA 1NW2A 4XS4B 4POLA 2VOCA 4V2NA 2MMAA 4KCAA 1AAZA 4GF0A 5ECLB 1U3AA 1X0RA 3DYRA 1YY7A 2OE0A 1VF2A 2K9FA 2YJ7A 1VF3A 4X43A 3UOMA 4KA0A 3VURA 3NZNA 2R37A 2GZZA 2I4AA 4HOJA 4KDYA 3BOAA 2QKEA 2PVQA 4TN8A 2I3YA 2MBSA 4XS4A 2FA4A 4F03A 5JWRB 1GH2A 2L5LA 2WGRA 1XZOA 4LMWA 3G7IA 4MCUA 3VPTA 1YKCA 3RBTA 5GAPD 3IDVA 2GT6A 3DVXA 3G9BA 4WKWA 3D5JA 3ED3A 2V2GA 5EY6A 6GSYA 2H19A 1NM3A 19GSA 4MLYA 3QR6A 1GL8A 3BD2A 1BX9A 3QFBC 1SK1A 5D9VA 2FY6A 2GSRA 4HQZA 1JLVA 2MMZA 2PWJA 3TOUA 2JSZA 3KH7A 2PGTA 1YKAA 4O92A 5IMAA 3KCMA 4GQFA 2V6OA 3MAKA 3W6GA 3TJJA 2LJAA 2NVLA 3C1SA 1OC8A 3GL3A 3SBCA 3J7Yk 3H4KA 3M8NA 1U6TA 1XPVA 3TKRA 5KEJA 1R4WA 2CVKA 3VWXA 1U87A 3BCIA 1AQVA 2LQQA 1XFLA 2GZYA 2GZPA 1O8XA 5ABRA 4FO5A 2DJ0A 1G6WA 1PA3A 2VCQA 1B9YC 5HR3A 3GX8A 2I1UA 3HJMA 2N5BA 3DXBA 2DSAA 3F6DA 2EIQA 4JZQA 3LWAA 4OFTA 4WEYA 4YAPA 3DMLA 1TI1A 5HR1A 2H6YA 3KGKA 2LJKA 1TKDB 3GYKA 1JLWA 3WGDA 3GSTA 2RIIA 4HU7A 1Z7PA 1X5EA 4PNGA 3FZ4A 2R5GA 2JZTA 3EMXA 5F8BA 3CYNA 5ELAA 4OWYA 5CP1A 2LEGA 2LRTA 5HFKA 4POBA 2MMOA 1GTBA 2JZRA 4L0WA 2LRNA 3ME7A 1YF0A 3EWLA 2B5XA 2YV7A 2VCWA 3Q18A 3J7Yb 1UA5A 1YF1A 2LKUA 3EE2A 5EPFA 2AHEA 2HT9A 1YDKA 3VI7A 4IQ1A 3EYTA 2IL3A 20GSA 1M2AA 4WF5A 1M7TA 2WS2A 2H1GA 1ABAA 4N0ZA 4KB3A 2AV4A 3SWLA 1SYXA 3QPMA 4NHWA 3L4NA 4WR4A 2H6XA 1GSQA 1GSFA 4EF0A 4BWQA 3HJPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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