1TOFA

Thioredoxin h (oxidized form), nmr, 23 structures
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
112
structure length
112
Chain Sequence
GGSVIVIDSKAAWDAQLAKGKEEHKPIVVDFTATWCGPCKMIAPLFETLSNDYAGKVIFLKVDVDAVAAVAEAAGITAMPTFHVYKDGVKADDLVGASQDKLKALVAKHAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title NMR solution structure of an oxidised thioredoxin h from the eukaryotic green alga Chlamydomonas reinhardtii.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Chlamydomonas reinhardtii
molecule keywords THIOREDOXIN H
total genus 38
structure length 112
sequence length 112
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1tofA00
3UEMA 1T4YA 2IWTA 1WMJA 4IGJA 4GSSA 4XS6A 2O8VB 2A2SA 2X8CA 3KP8A 1H75A 1NM3A 5J4UA 4J56E 2FA4A 1THOA 3M0FA 4MF6A 2RLIA 3FW2A 5DALA 3O3TA 2D2ZA 2H6ZA 3FZAA 5JCWA 4E8EA 5G31A 4GWRA 2GZPA 1G7OA 1M2AA 1O81A 3MNGA 5JCGA 1WWJA 3ZITA 20GSA 1NHYA 3TJFA 1PRXA 1XWGA 9GSSA 4RI7A 4AJ6A 2VAFA 2RIIA 1JHBA 1GP1A 1OKDA 4MCUA 2HZEB 5D9VA 5AIXA 3IXRA 4G19A 3Q6OA 3VK9A 3F4SA 2H6YA 4HEA2 4BL7A 1JFUA 2O89A 3DGQA 2PUKC 4NWYA 2FA8A 3VWWA 1FB6A 1HD2A 1MDKA 4OD7A 1ON4A 1TP9A 3TRPA 1SJZA 5IO0A 1PX6A 1KTEA 1V2AA 2YV7A 5J9CA 3MDKA 1AC1A 1VRSD 1B4PA 3EWLA 4F82A 2EC4A 3HA9A 2MYGA 3GURA 4I8BA 3C1RA 2B7JA 2KOKA 1K0OA 3TKSC 3KD0A 3GA4A 4JRRA 4K7NA 4NV5A 3RHCA 4HJMA 1K3LA 1Z3EA 4K6XA 2IL3A 2E2MA 3D21A 4BWSA 2NVLA 3QAWA 2GQKA 5JWRB 4JBBA 3EU3A 5KN1A 3LJRA 4ZXGA 3VWVA 5IOXA 3U6VA 2IMIA 1MDIA 1A0RP 3O76A 1BJXA 1G6WA 3HZ4A 4L8EA 5AN1A 2LJRA 3GX8A 2L4CA 5IM9A 2VIMA 3LGCA 4HI7A 1YJ6A 5HQPA 3PH9A 3ED3A 2H0HA 5D8IA 1X5CA 4MZCA 3I9V2 4TRXA 2E0QA 2XPDA 2P0GA 2DJ3A 2VL9A 1SK2A 4TR0A 4ECIA 1M9BA 3D4MA 1GTBA 1X9WB 4ILFA 4TN8A 2GTUA 4NHWA 5G1LA 3O6TA 4FO5A 2O85A 5ECRB 1M9AA 3BBYA 3CRUA 3QFAC 3VFIA 3UVTA 3CBUA 4KB3A 2MZCA 1RQMA 1S3AA 1V58A 1R5AA 1K3YA 2R37A 3F0IA 2LV3A 3IOSA 4FYCA 4GQFA 5ECLB 3CSIA 3ZYWA 4BA7A 2IFQB 1TXXA 2B3SA 2DJ1A 4K7OA 1O7UA 3GRXA 4OFMA 1XWBA 3A2WA 3L9VA 3K8NA 4LLRA 1OE7A 2B5YA 3IAM2 1FHEA 1W89A 2WULA 4TR4A 5D93A 1RK4A 1F6MC 2DIYA 2DMMA 3BD2A 4KDXA 3QAGA 4TXOA 2VL2C 1PKZA 5F05A 4PQ1A 2E7PA 4HU9A 1NSWA 1ERWA 4PUAA 3RAZA 3TJKA 4LMWA 1EV9A 1GSQA 2JZTA 2YZUA 2WCIA 6GSWA 3D5JA 1PGTA 6GSVA 4CHSA 1GLPA 2HFDA 5G1KA 3H8QA 1SL2B 2ON5A 3G9BA 1RW1A 1I5GA 4F2IA 2H73A 2A2RA 3UBLA 4QL9A 2Z9SA 2L5LA 6GSYA 3KZQA 5G30A 1FG4A 2VCTA 3BCIA 1Z6MA 5B8AA 2B5XA 5ECKB 1G0TA 4HJ2A 1QMVA 3CTFA 4MDCA 4EUYA 4WBJA 2HNLA 1ACVA 3EVIA 1GWCA 3TGZA 3G7JA 2QSIA 3TKPA 4KCAA 4NPBA 1VF4A 4MZBA 5AGYA 2R6KA 2DBCA 1EEJA 1R5PA 4IP1A 2N5AA 1V9WA 2FWHA 3EE2A 8GSSA 1EP8A 1OAZA 18GSA 5FT3A 3BOAA 1YF0A 2LKUA 5CO3A 2JSZA 1X0RA 2VLUA 5GAPD 4XRDA 3KMNA 6GSSA 4XTSA 4MF7A 2VO4A 4KE3A 1FAAA 1WP0A 2CVBA 4RQXA 1TJDA 4MABA 1LBKA 2VOCA 1GNWA 1EOGA 2H1DA 3RBTA 3AY8A 1M2DA 2L6CA 2GLRA 2MMOA 4OFTA 2C8UA 1K0DA 3I6AA 1F3AA 1Q98A 2OE1A 2H19A 1K0AA 4AF2A 3JCML 4YAPA 2C3TA 4JZQA 2PWJA 5HFKA 1EGRA 5E4WA 2H01A 1XVWA 5DAKB 3TJBA 4PQIA 3IR4A 1O73A 1T00A 4YAVA 3UL3A 1OC3A 2LRCA 1XW5A 2BTOT 4F9ZA 5J41A 4XRAA 4MJAA 5ABRA 4FH8A 4MP4A 2HRFA 2NTOA 3ZRDA 3ZMKA 5ECNB 3IE3A 5GSSA 4IJ3A 5IMCA 4MK3A 4N0ZA 2PERA 3TJJA 1GUMA 2HE3A 1MDJA 1E2YA 4LL4B 3C7MA 1F37A 1TU8A 2GT5A 2OBIA 4RUVA 3FK8A 1TRUA 4KSOA 5INYA 2YOIA 3TB2A 2F8FA 3F4TA 4LMVA 2LEGA 3GTUB 2HZFA 3GKXA 3HKRA 1U87A 2CAQA 2XBIA 4LL1B 2FNOA 1TK8B 3PR8A 4NXIA 3GMFA 4POKA 2PBJA 2H66A 2YN1A 5IQYA 2EIOA 1A8LA 1DSBA 5ELGA 1M0UA 2IPAA 1TOFA 1DBYA 1U88A 3IA1A 4EVMA 2H1GA 3Q74A 2IMDA 5CAXA 2O87A 2HI7A 1YEPA 4GCIA 3F6DA 1Y6EA 3L9SA 2AAWA 3L4NA 4MLYA 3LXZA 3DMLA 2GDRA 4CW9A 4KAEA 2CV4A 3G7YA 1ZZYA 3VWXA 4I5QA 1AQXA 1CQHA 2CZ3A 1HNAA 2H1BA 2YNXA 4OCEA 3J7Yb 2CQ9A 1C72A 1BX9A 3DKSA 4K0NA 4XS4B 2LSTA 1FVJA 5H5RA 1I9DA 1TI1A 2DJKA 1XCCA 2LNSA 4J57E 3GSSA 1ZYQB 2X99A 4ZB8A 5ECQB 7GSSA 1SU9A 3KH9A 4EXJA 1WOUA 2WJUA 1XBSA 3ME8A 3QR6A 4GTUA 1ML6A 3UMAA 5EPFA 4MPGA 1B4QA 4OO4A 2GVPA 3F4RA 2V32A 4O7HA 1GTIA 4L0UA 3FHKA 3LORA 1TRSA 4P3YB 2C0DA 2JADA 3KJYA 2B6MA 3US3A 2GSQA 1BG5A 2PU9C 5ECIB 19GSA 3GH6A 3EU4A 1SYRA 3GUSA 3VI7A 5COHA 4D73A 3KTLA 1FB0A 2GSRA 4MZWA 3I69A 4IS0A 3W8JA 2WFCA 4KDYA 3KMOA 5C00A 2V6OA 4PURA 12GSA 1BAYA 4JR6A 4N10A 1GTUA 3DD3A 4AJ8A 2B7KA 3IC4A 1M99A 4PNGA 3ZIVA 1OC9B 4WETA 4ECCA 2HYXA 2F51A 3LEFA 5AISA 4YQVA 4MJCA 3ISOA 4IP6A 1X9SB 2C0GA 2KUCA 2H74A 2FCHA 1GULA 3QD9A 16GSA 1GNEA 3A2VA 1B9YC 2FY6A 4TR1A 2K8VA 2PPTA 3GH9A 4N11A 3QOUA 5HR3A 3CTGA 2DJJA 4FIWA 1A0FA 2B1KA 4I2TA 4ZILA 1HYUA 4XS4A 2FLSA 1XPVA 3FR9A 4ML1A 3HCZA 1A2LA 5E59A 4KX4A 1DUGA 4ZBBA 2ALBA 3ME7A 13GSA 3G7IA 1X5EA 3P8WA 1A23A 5H5QA 4EC0A 1PN9A 3UBKA 2DIZA 2AHEA 4ZL9A 1Q4JA 4ID0A 3IAS2 2MBTA 1PQNA 4Q5FA 2YWOA 4J2FA 2FUG2 4OCFA 3M8NA 1TRWA 3F63A 3GKKA 4MH3A 3MSZA 3GN3A 4MMMA 1ZCPA 4DSRA 5LNKe 2R2JA 3ERFA 3HVXA 3RPNA 2FWEA 2I4AA 4PUFC 5IMVA 3H1NA 5B6MA 3L9UA 3GYKA 1G7EA 5GZZB 4ACSA 1XWAA 1SD9A 3HHVA 3DVXA 5IO2A 2WDUA 2HZEA 1SJIA 4BPYA 4FYUA 2L59A 4WBRD 2CZ2A 2I3YA 4MH2A 1O8WA 4EL1A 3PINA 2BMXA 2VM2A 4WR4A 3CSHA 1EV4A 5CRDA 1GSSA 2XHFA 3WYWA 1SD8A 2ON7A 2AYTA 2I1UA 1HNCA 3UARA 2RM5A 2J9HA 2YJ7A 2JZRA 4PXOA 3H93A 4GSTA 2ZNMA 1PKWA 3IPZA 4WKWA 2OBKA 4F03A 2DLXA 3GL5A 1WRYA 1BEDA 2G2QA 3IK9A 3EMXA 3E0UA 1CQGA 1K0MA 2VUPA 5A4UA 4KSMA 4POMA 1KNGA 3ZTLA 1YF1A 1A2MA 2CVDA 2QKEA 5IMZA 3DXBA 2VM1A 2IN3A 4I2UA 1SKWB 2PN8A 2LJKA 2V41A 5G5FA 3P90A 5ENUA 1BQ7A 2MMZA 4WEYA 1KBNA 3D0ZA 1IYHA 1XFLA 1GRXA 2WS2A 5KN2A 1H4OA 5FHIA 3KH7A 5HFIA 3VI5A 1GSUA 4IVFA 2R5GA 3IHQA 2KP1A 3LYKA 1A24A 4GRFA 1UA5A 3C71A 4KCEA 2P5QA 2I9HA 4GQCA 4V1Ap 2FWGA 3KEBA 1SK0A 3HVVA 2LRNA 4JEDA 1ERTA 2MMNA 4TW5A 1WJKA 3W8SA 3EURA 3GNJA 2C4JA 10GSA 2N5BA 4N30A 1XZOA 3DIEA 3KIJA 3MAKA 5IIZA 4MF5A 4IN0A 1SJ6A 2YWIA 2IFQA 3CXGA 5D96A 2IMKA 1TDIA 5F0GA 1WIKA 2LS5A 4XS1A 3ZLPA 3HJPA 2IMEA 3A5WA 3ERWA 3P2AA 2H72A 2H30A 1OE8A 4IJIA 1GSYA 1YDKA 3TOTA 1WPIA 4NAXA 3UVHA 1XWCA 5DBQA 3FYGA 2AB6A 3C73A 4OWYA 2L5OA 4KGIA 3QFBC 5GSTA 3H4KA 1YKAA 3Q18A 2EIRA 1QXHA 1WE0A 4JE1A 1KEBA 2C1YA 5F07A 4DVCA 4X0XA 2A4VA 4G2EA 1EP7A 4MA9A 4JR4A 1SL1B 3H79A 2REMA 3VWUA 3KTBA 5L71A 3F3QA 2XBQA 3M9KA 3LSZA 1NW2A 2PVOC 4WR5A 5ID2B 4TXVA 4MPFA 3P7XA 4Q5NA 3IBHA 2VCVA 1VF1A 1Y25A 3CRTA 1X5DA 4IW9A 4AGSA 4Z7XA 1XW9A 2JACA 1OYJA 1QFNA 4V1Ag 1S3CA 4AJ7A 2CVKA 1X9MB 1R7HA 4PQHA 2K6VA 3ZMLA 3KCMA 2LNTA 4JU5A 4K7IA 4HOJA 3CMIA 3TKRA 4ECJA 1DE2A 5HR2A 1ST9A 5ECMB 4ECBA 4PNFA 2V2GA 1IYIA 3QPMA 2CT6A 1O8XA 5C04A 4X43A 2ES7A 5JWOB 3CSJA 5DALB 1J9BA 2EIQA 3UOMA 5IMAA 3HVSA 1EZKA 1AUCA 2P31A 1USBA 4IBPA 3W6GA 2H76A 4BVYA 1MEKA 4OFNA 3C8EA 2YCDA 3EYTA 4E8HA 1J0FA 3VLNA 3ZVJA 4GF0A 1YEXA 5CREA 1SL0B 3VURA 2HSHA 3TDGA 2VL3A 1EWXA 2YV9A 3U5RE 2FWFA 4IQ1A 3QDNA 5CP1A 1VGLA 5J3RA 3ERGA 1G6YA 5AIVA 3UAPA 3WGEA 5DAKA 3APQA 3RDWA 1TRVA 3NIVA 4O5RA 3ZFLA 4K1FA 2FD3A 3M9JA 5DJMA 2K8SA 1F3BA 1VF3A 3GV1A 3A3TA 3GKMA 3HXSA 1BYEA 5IPHA 3DEXA 2XPEA 2X8GA 1JZOA 1OVNA 1R26A 3BCKA 3HYPA 2ZUPA 1MTCA 2WRTA 2H71A 4N0VA 1B48A 1XXUA 2HSYA 2TRXA 2OE0A 2L4QA 3TRXA 4KW6A 4MJBA 5H5SA 3E3EA 3WT1A 2TIRA 1XIYA 2C0FA 3D6IA 4IELA 1U3AA 3KM6A 4Q5QA 3DYRA 4V2MA 5CNWA 2GZZA 2IJYA 1FO5A 1XWKA 1URMA 2VCWA 3GL3A 2GT6A 1SKRB 5B6NA 4ZIJA 3GTUA 3F3RA 1AIUA 1O85A 2CAIA 5HR0A 2IMFA 2HRNA 4WF4A 2MMAA 3HD5A 4EE0A 4L0WA 1THXA 3M1GA 3GSTA 3C1SA 5KEJA 5DCGA 4LA1A 1JZRA 4GSNA 1U3IA 1QGVA 1PX7A 3VPTA 2VLVA 3HY2A 2VD0A 3CYNA 3L78A 4DSQA 5D9WA 3N9JA 2JZSA 2LQOA 1K3OA 22GSA 4K8MA 4GLTA 3D4TA 5ELAA 2E2GA 1PMTA 3IRAA 2YPMA 3TKQA 1XW6A 1TI3A 1E6BA 4CDOA 3FEUA 3ZIJA 2RUEA 2VLTA 2KLXA 3WT2A 2YZHA 3GX0A 2YWMA 6GSXA 2QC7A 5HFGA 2VCQA 2KHPA 5CYYA 1LJRA 4RQRA 2GSTA 4O32A 1A8YA 1SYXA 5ECHB 2C3QA 1TKDB 4Q5RA 1PL2A 2OA7A 1O6JA 2F9SA 1FVKA 4L5OA 1AW9A 5DVBA 2YJHA 1XOAA 1SK1A 14GSA 1B9XC 1GH2A 5EL8A 2PMTA 4TXOB 2FGXA 4G10A 3ZFBA 4BVXA 2R4VA 4EDZA 3ZZXA 3KXOA 5F06A 5LCZA 3LYPA 2VCXA 5GAND 4KNDA 2K18A 2LTKA 2JSYA 4K2DA 2DC5A 2OACA 2GZYA 4V2LA 1TW9A 4QL7A 2M46A 2LJAA 4NHZA 3KP9A 4OMVA 3FR3A 1YZXA 2MBSA 4K9ZA 3TUEA 2LUSA 5EY6A 2HLSA 1VF2A 4POBA 4V2NA 1PD21 3TOUA 3HJOA 2H6XA 1Z5YE 1OC8A 4IHUA 1JZDA 2C80A 3TJGA 5B7CA 5JCUA 2NPBA 1S3DA 4ZBAA 1A2JA 5ECOB 1ERUA 5F8BA 2M80A 4NV2A 3A2XA 1MD4A 5DJLA 1TK5B 5IMFA 2C3NA 2HT9A 1OC9A 4TVEA 3WGDA 1SKSB 1J08A 3LWAA 1GSFA 1F9MA 4YH2A 3OR5A 1M2BA 1QQ2A 2QGVA 4ZBDA 2F8AA 2H0GA 1UVZA 3HZ8A 3QCPA 2OE3A 3WD6A 2J23A 2LQQA 1XOBA 1AAZA 1B8XA 3HDCA 1N8JA 1T4ZA 3FKFA 1ZYEA 5D9TA 5J5NA 1EGOA 4O92A 1XVQA 3KGKA 2TRCP 4ZL7A 4KUNA 2KP2A 2ZCTA 3GIXA 3M3MA 5G2ZA 3F6FA 3IDVA 4HQSA 1T8EB 1PSQA 2YP6A 4HQZA 4WXTA 4HZ2A 4TKYA 2X8HA 3SWLA 3LQ7A 1N2AA 1T7PB 3TKSA 3DVWA 6GSUA 1ABAA 3RPPA 3TCOA 2G0FA 4KH7A 1ERVA 2GQLA 1ILOA 1GUHA 1GSEA 2P5RA 2L57A 1ZOFA 2AUVA 1TK0B 4DEJA 2CA8A 3I43A 1GLQA 3LG6A 2CX4A 1Z6NA 4ISDA 1TTZA 2OKAA 2DSAA 3FZ9A 1MD3A 5LD0A 4DSSB 2H0IA 1JZWA 2FHEA 1QUWA 3QAVA 1GL8A 3Q19A 5ECPB 1Z9HA 3TRQA 2GSSA 5A5KA 1YQ1A 3BJ5A 5ECSA 4I6XA 1K0CA 4BWQA 3R2QA 4TR3A 5DDLA 3EINA 2XC2A 1FOVA 3FZ5A 1W4VA 5IPGA 3APSA 5J9BA 1HQOA 1GUKA 4G9HA 1K0NA 4XHMA 4EDYA 1UC7A 3NOFA 1EEMA 3E9JB 11GSA 2VD1A 1Z7RA 3D22A 3SBCA 5EVOA 2I81A 1F2EA 3VPQA 1V57A 4KDUA 3LXTA 3TKSE 4WF5A 2BJXA 4HZ4A 1ZGNA 3GKNA 2DJ0A 3N5OA 2N5FA 5IMDA 2O7KA 4K0GA 2H75A 4HUAA 1HNBA 4POLA 3RHBA 5A4WA 4YQMA 3UIWA 5DQSA 2F3MA 2JL4A 2V1MA 4L5LA 4I97A 1DE1A 2DMLA 3F8UA 5KN0A 2JU5A 2B5EA 2PVQA 4HU7A 4ZB6A 4MJEA 2IIYA 3IV4A 2GGTA 4ML6A 4GXZA 5CRWA 2H8LA 5CRHA 5G5EA 2VL2A 5DCHA 2CX3A 5B8BA 2K9FA 1LU4A 1SENA 4XCSA 4NMUA 2AV4A 3FR6A 2RUFA 5IOWA 3APOA 2R3XA 3F9UA 1EOHA 2AJQB 3EMPA 5HR1A 3L0HA 4DSSA 4PX1A 1PA3A 3GHAA 4EO3A 4ZL8A 5FWGA 1GSDA 2HXKA 2NBSA 3FY7A 1T1VA 1YY7A 3IK7A 2L6DA 1Z7PA 4X1UA 4EKZA 4F0CA 1R4WA 3HJMA 2V6KA 6GSTA 4IKHA 3DRNA 4TOPA 1NHOA 5CRGA 1T3BA 2H70A 2LRTA 1V98A 3PGTA 1JLVA 5KN3A 3UJ1A 3S9FA 2YANA 3DWVA 2WB9A 1V40A 2OJLA 4D73B 2B1LA 1UN2A 4F0BA 2M72A 2NDOA 17GSA 3GFKA 4YQUA 2OADA 4HS1A 2VCZA 5A4VA 3MWHA 2RM6A 4PGTA 1OKTA 2DJ2A 3ZREA 2PGTA 3ZL5A 1GTAA 1QK8A 2C0EA 1FW1A 3V1WA 1JLWA 4H86A 5D9XA 1AQWA 2X64A 1ZL9A 5ID2A 2GS3A 2GQMA 4TR1B 4HDEA 2YWNA 4XIHA 1PL1A 4EF0A 1TU7A 4ULXA 5JWQB 3FZ4A 4IQAA 4ZB9A 1M7TA 3WGXA 3FRCA 2WGRA 2WZ9A 5D73A 5DQYA 3QMXA 1U6TA 4OO5A 2H1AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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