4TW5A

Structure of the first two thioredoxin domains of saccharomyces cerevisiae eps1p
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
PPEGFPEPLNPTNFKEELSKGLHIIDFYSPYCPHCKHLAPVWMETWEEFKEESKTLNITFSQVNCIESADLCGDENIEYFPEIRLYNPSGYIKSFTETPRTKESLIAFARRESMDPNNLDTDLDSAKSESQYLEGFDFLELIAGKATRPHLVSFWPTKDMKNSDDSLEFKNCDKCHEFQRTWKIISRQLAVDDINTGHVNCESNPTICEELGFGDLVKITNHRADREPKVALVLPNKTSNNLFDYPNGYSAKSDGYVDFARRTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The eps1p protein disulfide isomerase conserves classic thioredoxin superfamily amino Acid motifs but not their functional geometries.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Eps1p
molecule tags Isomerase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 81
structure length 264
sequence length 264
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.4.3.1: Deleted entry.
pdb deposition date 2014-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tw5A01
2GZYA 4GRFA 2PN8A 1V57A 1GSEA 5ECQB 2XPDA 5DQYA 2H74A 3M3MA 22GSA 4KX4A 3DVWA 2B1LA 1WIKA 4HZ2A 4V2NA 1ZGNA 4XS4B 1T3BA 3PINA 1YZXA 3ZZXA 4IP6A 3ZTLA 3M8NA 3IAM2 5KN2A 2REMA 4KGIA 4EL1A 3RPPA 5DJLA 5DQSA 16GSA 4KSMA 2I9HA 3TRPA 2BMXA 1XZOA 3GURA 4LL4B 3O6TA 4Z7XA 3VWXA 1M99A 1O85A 2HZFA 2JL4A 3UBKA 5GAPD 1TRVA 5B7CA 1BEDA 3GV1A 2FLSA 3G7JA 4TXVA 3EC3A 1SJIA 1WJKA 2C0EA 3KH7A 1RW1A 5DALB 3FR9A 2K9FA 4NHZA 3GTUB 4PNFA 3KP9A 19GSA 5IMZA 1JZWA 4PNGA 4ULXA 3CRTA 2GLRA 4HU9A 4KDYA 1VF1A 4OCEA 5KEJA 3IA1A 3LG6A 2JSZA 5AIXA 4MZCA 2YN1A 2KLXA 4KB3A 5IMCA 3IK9A 1ERVA 2C3NA 5IMVA 2O8VB 3EMXA 5IQYA 2JU5A 3F3RA 2HT9A 3D4TA 1G7EA 1RQMA 1ML6A 4MPFA 4NV5A 3TRQA 4WBRD 2MMOA 4GQCA 3CSHA 1A2JA 2HZEB 4XRAA 3ZIVA 4KW6A 1K0MA 2H73A 3PR8A 4L8EA 5B6NA 3C7MA 1TU8A 3LXTA 3LSZA 4NV2A 2YWIA 1R7HA 1PN9A 3APOA 5ECOB 3QFBC 5JCWA 4ZL7A 1SYRA 3CXGA 1UVZA 3DMLA 2VCVA 2FWHA 2FHEA 2LRNA 3KM6A 3O3TA 3VURA 3VWWA 4DSSB 4EDYA 5HFIA 3E9JB 4TR1A 2L5OA 2H6YA 5AIVA 4MLYA 4XHMA 3KP8A 4K2DA 2CT6A 4MPGA 2XPEA 4IW9A 2AB6A 4NWYA 1F3BA 1GUHA 4YAVA 2H1AA 1OE7A 5G31A 3Q74A 3ZRDA 2KOKA 1THXA 4AGSA 3I43A 2RM5A 2V2GA 2OACA 2LKUA 2PVQA 4ZB6A 4YH2A 1SD8A 3PH9A 3UIWA 4HZ4A 1O81A 4I6XA 2X99A 2R3XA 2LNSA 2H0HA 5ECSA 1M2DA 2YWOA 4GXZA 2AV4A 3DRNA 1GULA 1U3IA 5IIZA 4MF7A 2GQLA 1HD2A 2MMZA 5HFGA 5JWRB 2HE3A 3D4MA 3GSTA 3FEUA 2FNOA 1FHEA 4POMA 2GZZA 3ZFBA 2VCQA 2KP2A 2MBTA 4ZL8A 1JZDA 2C4JA 5DDLA 1SL0B 2GT6A 3GKMA 4EXJA 3ISOA 2DSAA 1OVNA 3FRCA 4QL7A 4K0GA 1B48A 3UARA 3ZMKA 4HEA2 2GDRA 1V9WA 1THOA 1VF4A 4XCSA 3BBYA 2M46A 3DD3A 5GZZB 2O89A 2MZCA 2BTOT 4MJBA 5ECLB 1AIUA 3US3A 3TRXA 2LTKA 2VM1A 4L0UA 4WXTA 5B8BA 4TKYA 2C3TA 1OKTA 2LRTA 1MDKA 1N2AA 3FK8A 1VGLA 1TK8B 1V40A 4H86A 5KN1A 3D22A 5E59A 3IK7A 3RHCA 4BVXA 3GA4A 2FA8A 4ZL9A 2WFCA 3LYPA 1T8EB 5CREA 3D0ZA 4P3YB 4MF6A 5ID2A 5G1KA 2V32A 1F37A 4QQ7A 1LU4A 2JADA 1QUWA 1V98A 3CBUA 3GFKA 5B8AA 4K8MA 1PGTA 2ON7A 1Z7RA 5J9BA 5D96A 3JCML 4IS0A 2VLVA 10GSA 3EYTA 2CX4A 3F6FA 4K9ZA 3KMOA 5G2ZA 3F4TA 11GSA 2B1KA 4GSTA 1A8YA 2FWGA 4I5QA 1A0RP 1DE2A 3CSJA 3H8QA 1F6MC 2VM2A 5GSSA 5E4WA 1K0DA 2GQMA 2XBQA 4WKWA 1WRYA 4JRRA 2H6XA 1FB0A 4ECCA 13GSA 2I3YA 1GUKA 4XIHA 2A2SA 2IFQA 3GL3A 4LL1B 1B9XC 3HJMA 2PMTA 3SBCA 1NM3A 1TXXA 3HYPA 5HR3A 2ZNMA 1MD4A 3RDWA 4KNDA 5DCHA 4IJ3A 3Q18A 2MYGA 5LCZA 3GX0A 3WGEA 4XTSA 2GS3A 2IPAA 3F4RA 3FZ9A 3FZ5A 2FA4A 1K0NA 3VLNA 6GSTA 1GNWA 3HDCA 4HOJA 1ILOA 5IMFA 1SKRB 6GSUA 3C1SA 2LSTA 2X8CA 2XBIA 5HR1A 2B7JA 3TKSE 4ECJA 3TJGA 1CQGA 3QR6A 2V6OA 3FZAA 2NBSA 1TDIA 3E0UA 2IL3A 5J5NA 1XOBA 1SD9A 2WJUA 2DLXA 3UAPA 2VD0A 5D9XA 5C04A 2WULA 1VRSD 4POBA 5JWQB 3V1WA 3TUEA 2IMKA 1A2LA 4BWSA 1GH2A 4GSSA 2TIRA 3HJOA 1X0RA 1XWCA 2MBSA 5ECMB 4XS4A 5INYA 3A3TA 2YZUA 4F0CA 5FT3A 1SENA 1EEMA 3TJJA 1USBA 3LGCA 5JCGA 3L78A 4F82A 1TTZA 2P0GA 4ILFA 1GUMA 3MDKA 2DMMA 3LJRA 5G5FA 3LORA 5AISA 4HUAA 2P5QA 3IAS2 2C1YA 5EY6A 3HXSA 1JZRA 5A5KA 4MCUA 2H66A 3K8NA 1TK5B 2I1UA 1M2AA 1TI1A 1Z6MA 3OR5A 3VI7A 5GAND 2QKEA 5CNWA 4DSQA 1FO5A 2PU9C 2LJRA 3QOUA 2V41A 3DXBA 2C0GA 6GSYA 5A4UA 1SKWB 4TOPA 2H19A 1GSUA 2DJKA 1SU9A 5DALA 3HD5A 1W89A 3ZMLA 2WS2A 2DJ3A 3GTUA 2HXKA 3VPQA 3ZIJA 3G7YA 3EMPA 3KMNA 4POKA 2IMIA 1QFNA 3TJBA 1TK0B 4OFNA 2H75A 1YF1A 2PGTA 3ED3A 2L59A 4F0BA 1WMJA 4EUYA 4WF5A 4MABA 1GTUA 4LMVA 5F07A 1X5CA 2HNLA 5AGYA 4MJCA 1T1VA 5AN1A 3J7Yb 1E6BA 1ABAA 4O92A 2VLTA 4JE1A 2IMDA 4MJEA 3QAVA 2RIIA 4ECBA 4FYUA 1A8LA 2FUG2 1HNAA 3HHVA 1XW5A 1GLQA 1Y25A 2H0IA 2QC7A 18GSA 1M9AA 1H75A 4IELA 2GSTA 5CP1A 1T00A 2HZEA 4N30A 5D9WA 2ZCTA 1ST9A 2OJLA 3EU3A 3RBTA 2OBKA 4K6XA 1K3LA 2CVKA 1EWXA 3KTBA 2B3SA 3EWLA 4X1UA 3A2WA 4O7HA 2AYTA 4WBJA 1E2YA 3FR3A 2H1BA 2VD1A 3D6IA 4NPBA 4E8EA 3N9JA 1J9BA 3FW2A 3UVTA 4TR0A 4EO3A 3GKNA 1BG5A 4DSSA 3I9V2 4YQMA 1SK1A 3ERFA 1GTIA 1FOVA 4G19A 5A4WA 4BWQA 1GWCA 4RQXA 4RI6A 1BAYA 3IC4A 1GLPA 2YPMA 6GSWA 3IPZA 3F6DA 3TKQA 3L0HA 3QAWA 2R5GA 1X9SB 2HLSA 2NTOA 1XVWA 5H5SA 2CAIA 2LJAA 2DJ1A 4MH3A 1PKWA 8GSSA 1NW2A 1OC3A 1B8XA 4MP4A 4L0WA 2O85A 4IN0A 2PERA 1DUGA 3GRXA 2YP6A 5ECHB 2HFDA 1O73A 4FYBA 3S9FA 5H5QA 1MTCA 4PQHA 5HR0A 5EPFA 3ZLPA 2EIRA 3LYKA 3KJYA 4WEYA 4KDXA 3ME7A 1Y6EA 1V58A 2L57A 5KN3A 5FWGA 1FW1A 2JZTA 2I81A 4KH7A 3RAZA 4TVEA 1ZYEA 1F3AA 2OA7A 1EOHA 1AUCA 4LA1A 3TCOA 3ERWA 4IVFA 1EZKA 2YWMA 3IE3A 1GSSA 4KSOA 2KP1A 1SL1B 1ACVA 3QMXA 3W8JA 3KTLA 9GSSA 1Z7PA 2K8VA 4NMUA 5DBQA 2LV3A 4NAXA 4DEJA 4BA7A 1R5AA 2LQQA 2VCZA 2GSRA 3N5OA 1HYUA 5F8BA 2IWTA 2DJJA 3GMFA 1G0TA 2DMLA 4ECIA 4BPYA 1Z6NA 5IO0A 4GSNA 5G30A 5IOWA 4KAEA 1Z3EA 4JEDA 5IO2A 1PMTA 4IQAA 3FHKA 5LD0A 4ZBBA 5LNKe 2LUSA 1U87A 5ABRA 2HRNA 4IQ1A 1EP7A 4J2FA 4K7NA 5IPGA 3TB2A 2AJQB 4OCFA 1XVQA 12GSA 1BQ7A 4MH2A 2L4CA 3QPMA 5HQPA 1GSQA 3EINA 3TGZA 4N0VA 5J41A 2FWEA 2X8GA 1JHBA 2VAFA 4ZB8A 1ZMAA 4PXOA 1K0OA 2G2QA 1EOGA 4MZBA 5FHIA 1XFLA 2IJYA 4HJMA 2K18A 5F05A 3GUSA 5EVOA 5ELAA 1XWAA 4OFMA 2XC2A 3WGXA 4TR3A 2VLUA 3U5RE 3F3QA 1SK0A 1PSQA 2L6DA 2R37A 3EURA 4AJ7A 1XBSA 3NZNA 1AC1A 3O76A 1ZYQB 5CRDA 3QDNA 5ELGA 2CA8A 2PUKC 4RUVA 1MDIA 1Q4JA 4I2TA 1R26A 2VCWA 4WR5A 2TRXA 1XW9A 3I69A 1MDJA 1F2EA 1TRUA 1O8XA 4KCEA 1Q98A 3G9BA 3HVSA 1YY7A 4MA9A 3ME8A 3IHQA 4IJIA 1SK2A 4OMVA 1PRXA 4KUNA 1OC8A 2V6KA 4CDOA 4EDZA 1Z5YE 4OO4A 3IDVA 4TW5A 2H0GA 1WE0A 3IOSA 1YEPA 4O32A 3H1NA 2TRCP 4G10A 1TW9A 3HVXA 3UOMA 1RK4A 3HA9A 5HR2A 3WT2A 3AY8A 3GN3A 4FYCA 3H4KA 1PX6A 3L9UA 20GSA 2HYXA 1HNCA 2YJ7A 1G6WA 3IV4A 1A2MA 1FVKA 1A0FA 1AQWA 2C80A 3GX8A 3SWLA 3NIVA 2VL2C 5DCGA 3ZYWA 3GNJA 3R2QA 1GTAA 2K8SA 1KNGA 1MEKA 1OKDA 3U6VA 1JFUA 2ZUPA 4MZWA 2YOIA 1GSFA 1PL2A 1AXDA 3TJKA 2WGRA 4RQRA 5CYYA 1M2BA 2LQOA 2V1MA 4HS1A 2P5RA 5J3RA 2GVPA 4KDUA 2F8AA 4MDCA 1TRWA 5JCUA 1EV4A 4E8HA 1HNBA 2PVOC 3BCIA 2MMAA 5CAXA 3ERGA 1XPVA 3BOAA 1K0AA 3EVIA 1O6JA 4PURA 2HI7A 5IPHA 1QXHA 5J4UA 2K6VA 3FKFA 2B5EA 2ON5A 2VCTA 3E3EA 3HVVA 1JZOA 3QD9A 3HY2A 3DIEA 2VCXA 4WF4A 2F51A 2DJ0A 2Z9SA 2D2ZA 1O7UA 3H93A 3GIXA 4WR4A 3CTFA 1EGOA 3LQ7A 1EGRA 2FCHA 3DEXA 2AUVA 3Q6OA 1DBYA 2NDOA 3IXRA 1JLWA 2N5BA 2M80A 2RLIA 3HZ4A 3GKKA 1FAAA 5D8IA 1U6TA 3KCMA 2H71A 2LNTA 1NSWA 3A5WA 2IIYA 4KA0A 1X5EA 2ALBA 1KTEA 2GT5A 4V2MA 3TKSC 4DSRA 1I9DA 4JU5A 1O8WA 3KIJA 4K0NA 4FH8A 4K1FA 1EV9A 2JZRA 2YV7A 2KHPA 1OC9B 1C72A 2B5XA 4TXOB 4JZQA 4ISDA 3PGTA 2J23A 5IM9A 3P7XA 1ON4A 2VIMA 3LWAA 1TOFA 4PUFC 3VPTA 4MK3A 3CMIA 2QSIA 1QK8A 4GCIA 2H72A 3VWUA 4GF0A 3G7IA 3F0IA 3KGKA 1X9MB 3RPNA 3ZITA 3L9VA 4L5LA 5ECNB 2VL3A 2CQ9A 4ZB9A 1PX7A 4NXIA 1T4YA 2A4VA 3M9KA 1ZL9A 5J9CA 2MMNA 1GRXA 1IYHA 4V2LA 2N5FA 3MAKA 3UBLA 17GSA 4N11A 4EF0A 2JZSA 5G1LA 4PQ1A 3VWVA 4MF5A 1URMA 3CSIA 2CVDA 3LXZA 2KUCA 2F8FA 1K3YA 2CX3A 2H1GA 4OD7A 4GWRA 3HCZA 2J9HA 1YKAA 2OKAA 1PL1A 2H1DA 1BJXA 3HZ8A 3FYGA 1PQNA 3C71A 1M7TA 1XWBA 4BL7A 3M1GA 1I5GA 2QGVA 3LEFA 5ECIB 1BYEA 2WZ9A 2NVLA 1ZCPA 2H70A 2B5YA 2O87A 2H01A 3MWHA 3UEMA 3C8EA 5CO3A 3QFAC 2PWJA 5ECKB 4D73B 5D9VA 2YJHA 1TP9A 1SJZA 3W8SA 1TU7A 2GTUA 4MMMA 1FVJA 5KN0A 2X8HA 3WT1A 4ZXGA 4TR4A 5JWOB 5DVBA 2L4QA 4ZILA 2YANA 4IBPA 4HU7A 2GGTA 2VOCA 3UMAA 3A2XA 4IGJA 3F9UA 3GKXA 1LJRA 4EKZA 5D73A 1YDKA 4V1Ag 1TJDA 3NOFA 3RHBA 1K0BA 3WD6A 3CTGA 1GSDA 2F3MA 3UJ1A 4N10A 2P31A 3Q19A 4AJ8A 1NHYA 1PD21 2B7KA 1UA5A 4ZBAA 1FB6A 2VUPA 2YV9A 1UC7A 5F0GA 3ZVJD 2R4VA 3DYRA 2X64A 3TKRA 2DC5A 1WWJA 4TRXA 2RM6A 1YF0A 3KH9A 4J56E 1BX9A 4K7IA 2OE0A 2OADA 5HFKA 1U3AA 1IYIA 1XW6A 3TOUA 1U88A 1YQ1A 1DSBA 2VO4A 1H4OA 1S3AA 1T4ZA 1KBNA 2H8LA 4POLA 1TKDB 6GSVA 4XRDA 2CZ2A 5ECPB 5ENUA 1SJ6A 1S3DA 1A24A 3UVHA 4AF2A 5ECRB 4EE0A 2HSHA 1WPIA 2M72A 2R6KA 4FO5A 5DJMA 1K0CA 3GHAA 5A4VA 3LFLA 3F8UA 1B9YC 3VI5A 5COHA 4KE3A 4TN8A 1J0FA 1LBKA 1QMVA 1XCCA 1ZZYA 3HJPA 4FIWA 3ZREA 1Z9HA 4GLTA 4XS6A 3GSSA 3IBHA 2CV4A 4OO5A 4O5RA 4V1Ap 2VL2A 4G9HA 3APSA 4KCAA 2YZHA 1M9BA 2RUFA 2E7PA 4ML6A 5C00A 2HRFA 4AJ6A 4NHWA 2OBIA 4CHSA 1VF3A 1W4VA 1OYJA 4F9ZA 2JACA 3BD2A 1YKCA 4HQSA 1XXUA 3ZVJA 1SKSB 4Q5RA 3BJ5A 2E2GA 3F63A 2GZPA 4G2EA 4X0XA 1ERTA 3KXOA 4HQZA 1SL2B 3QCPA 4IHUA 2OE3A 1UN2A 3L4NA 3W6GA 3KD0A 2LEGA 4I2UA 5D93A 3D5JA 3J7Yk 3ZL5A 2AHEA 4TR1B 1VF2A 3TOTA 1YEXA 3C1RA 4Q5QA 4HDEA 14GSA 2YNXA 4BVYA 4CW9A 2FD3A 2EIQA 2LJKA 4JBBA 2CZ3A 6GSXA 4IKHA 5CRWA 1WP0A 1R4WA 1GTBA 2PPTA 3EE2A 2IN3A 4F2IA 3EU4A 4N0ZA 1GSYA 3ZFLA 1CQHA 4QL9A 1S3CA 3H79A 4LLRA 2RUEA 1F9MA 1FG4A 2A2RA 2LS5A 2L6CA 2DIZA 5GSTA 2N5AA 1EEJA 4PGTA 4GQFA 1A23A 2O7KA 2NPBA 1V2AA 1X5DA 1ERUA 3TKSA 1XOAA 1M0UA 2WB9A 2DIYA 2CVBA 1AQVA 3TJFA 2JSYA 4YQVA 2DJ2A 6GSSA 3I6AA 3GL5A 1OAZA 1XWGA 2H6ZA 3GH9A 4ACSA 3GH6A 2ES7A 3FZ4A 7GSSA 3CYNA 5EL8A 1GNEA 3WYWA 1G6YA 2XHFA 4J57E 3M9JA 2IMFA 1G7OA 2WRTA 4XS1A 1N8JA 3P2AA 2WCIA 4Q5NA 1TRSA 3MSZA 3L9SA 2C3QA 2FGXA 2B6MA 2R2JA 4ZBDA 3CRUA 1AQXA 1QGVA 4WETA 5ID2B 4GTUA 1HQOA 5CRGA 2C0FA 3GYKA 5G5EA 1PKZA 1GP1A 1XWKA 2GSQA 3D21A 4PX1A 4DVCA 2YWNA 5CRHA 3VFIA 2DBCA 5D9TA 5DAKA 2GSSA 3IR4A 2PBJA 1B4PA 3P8WA 2EIOA 1K3OA 3TKPA 4HJ2A 1OC9A 3P90A 1B4QA 4RI7A 4LMWA 4TXOA 3APQA 4PUAA 1YJ6A 4YAPA 4HI7A 1J08A 2IMEA 1PA3A 1NHOA 2HSYA 4EC0A 1QQ2A 4I97A 1AAZA 4ZIJA 3IRAA 2VL9A 1X9WB 3C73A 2C0DA 2H76A 1T7PB 1MD3A 2GQKA 4I8BA 1R5PA 4Q5FA 3KZQA 3WGDA 1TI3A 2F9SA 1DE1A 2IFQB 3DWVA 3M0FA 3DGQA 3FY7A 3KEBA 4OWYA 2OE1A 4JR4A 3UL3A 1SYXA 3DKSA 3VK9A 4K7OA 2I4AA 4ID0A 1AW9A 5IMAA 1OE8A 1EP8A 3QAGA 5B6MA 3FR6A 4YQUA 5IMDA 1WOUA 1XIYA 2LRCA 5DAKB 5IOXA 5H5RA 5F06A 2FY6A 3DVXA 3TDGA 4EVMA 4X43A 2EC4A 1ZOFA 2AAWA 3MNGA 2WDUA 4MJAA 1GL8A 2L5LA 2FWFA 2H30A 2YCDA 2G0FA 1KEBA 5L71A 4PQIA 2CAQA 4OFTA 4F03A 2E2MA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite