4TW5A

Structure of the first two thioredoxin domains of saccharomyces cerevisiae eps1p
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
PPEGFPEPLNPTNFKEELSKGLHIIDFYSPYCPHCKHLAPVWMETWEEFKEESKTLNITFSQVNCIESADLCGDENIEYFPEIRLYNPSGYIKSFTETPRTKESLIAFARRESMDPNNLDTDLDSAKSESQYLEGFDFLELIAGKATRPHLVSFWPTKDMKNSDDSLEFKNCDKCHEFQRTWKIISRQLAVDDINTGHVNCESNPTICEELGFGDLVKITNHRADREPKVALVLPNKTSNNLFDYPNGYSAKSDGYVDFARRTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Eps1p
publication title The eps1p protein disulfide isomerase conserves classic thioredoxin superfamily amino Acid motifs but not their functional geometries.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Isomerase
total genus 81
structure length 264
sequence length 264
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.4.3.1: Deleted entry.
pdb deposition date 2014-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tw5A01
4XRAA 4ZL8A 1XW6A 1YQ1A 3CRTA 2PGTA 3GTUA 1EZKA 3LGCA 4NAXA 3BCKA 4TVEA 2QKEA 5D8IA 2L5OA 1TRUA 2WCIA 3E3EA 7GSSA 3TDGA 1V98A 4PQIA 2X99A 3WD6A 1ZGNA 2YWMA 4HUAA 4OCEA 3C1SA 4WF5A 1MDIA 4KB3A 11GSA 5CAXA 5FHIA 5E59A 1PN9A 2OA7A 3L9SA 3HDCA 2H0GA 1O8XA 1OE8A 1SKRB 3KMOA 1YKCA 1HNCA 4WXTA 2C80A 5DAKB 5LD0A 2XPDA 5A4VA 3TUEA 4ID0A 5DAKA 3WGXA 1X9SB 2E0QA 6GSSA 2GQMA 3FR9A 2GQKA 2OBIA 2MMZA 3F4TA 1GUMA 1UC7A 2VCXA 5AIXA 1U88A 3GSTA 4LMVA 4HS1A 4F0BA 1IYIA 5HFKA 4JU5A 4FIWA 1ACVA 4GWRA 1GSQA 1TTZA 3ERWA 1O81A 1W4VA 4AJ8A 5DBQA 2VL2C 5INYA 4EDZA 1DUGA 4XCSA 1M0UA 4LL4B 4EDYA 2C0GA 4MK3A 5CO3A 3D5JA 3TRPA 4OFNA 3GX0A 3Q18A 2HXKA 2P31A 4YAVA 2MBTA 4CHSA 3F4RA 1O85A 1GSUA 1O73A 4AGSA 3DXBA 1NHYA 1SL1B 3U5RE 1M9AA 2CZ2A 5DCGA 2H75A 1G7EA 3GYKA 1K0OA 4J57E 4K0GA 3LQ7A 4KNDA 2B7JA 3TJFA 1SK2A 3FKFA 1GSSA 3DYRA 3CMIA 2WDUA 3IDVA 4O5RA 4MA9A 1XWBA 4HU9A 3CSJA 4FYCA 1BG5A 3PH9A 2A2RA 5IPGA 5IQYA 2OE0A 3TB2A 2O85A 3EMXA 2RLIA 4DVCA 2LV3A 3KCMA 1XWCA 2DJ1A 4L8EA 6GSTA 3KJYA 1ZMAA 4MABA 5HR3A 3L78A 1AQXA 4WETA 1AW9A 1GNWA 2EIQA 2IN3A 2I4AA 2MBSA 2ON7A 3O3TA 4GCIA 4GSNA 1JLVA 4TR4A 1EWXA 3IE3A 1DE1A 3HZ4A 3FW2A 1ERWA 3VFIA 2TRXA 3ZLPA 2DMLA 1JFUA 2LRNA 3QOUA 4J56E 4EF0A 2VD1A 1EGRA 4TXVA 3EWLA 4EUYA 1VF3A 3KM6A 1ST9A 1Z7PA 2LJAA 2H76A 4PX1A 5A4WA 3EVIA 1G0TA 1YDKA 2FWEA 4GXZA 1B4PA 3ISOA 3IK9A 2FGXA 1MD4A 3M9JA 3FZ9A 3HVSA 1GSFA 3TJGA 2B5YA 4POLA 3HVXA 1PKZA 4MJEA 1MD3A 4O92A 4NXIA 3ZFLA 2C8UA 5IMDA 3I6AA 3VI7A 2HNLA 2N5AA 1R7HA 1TU8A 1THXA 5J41A 4Q5RA 1NHOA 3HYPA 2H6ZA 4I2UA 3UIWA 1ABAA 2C0EA 3GH6A 6GSVA 1FOVA 3M1GA 4ZL9A 1GRXA 1VF1A 4RQXA 2JZRA 1DSBA 3WT1A 4K7IA 3GA4A 1X0RA 2H1DA 4KDXA 3LSZA 2NTOA 2V41A 4POKA 2R37A 4HI7A 1GNEA 4KCAA 3GL5A 3G7IA 2H74A 2RUFA 2LEGA 1SENA 1XIYA 2DJKA 5IMCA 1ILOA 4K6XA 3M0FA 1OAZA 2HYXA 2ES7A 4ULXA 2I3YA 3TOTA 4OFTA 1F9MA 3WT2A 2VLVA 2YZHA 2VIMA 2AYTA 2GSQA 1GSDA 4OMVA 3BCIA 5IPHA 3KP9A 1PRXA 1TW9A 2IL3A 3IHQA 5IM9A 1E2YA 2J9HA 4F0CA 2I9HA 1OC9B 2YN1A 4TRXA 3A3TA 2GTUA 3NZNA 1TK5B 22GSA 5EL8A 6GSXA 5IOXA 1OC9A 3GUSA 2HSHA 5L71A 3HZ8A 1YJ6A 3ZFBA 3GFKA 2P5RA 4IBPA 2M80A 1K0BA 3GL3A 5CP1A 3F6FA 1SKSB 1XVWA 2JZSA 4ZXGA 3L9VA 5LCZA 2B5XA 2L4QA 2O8VB 2FD3A 1U3AA 2FY6A 1MDKA 2YJ7A 1T3BA 6GSYA 4JEDA 3V1WA 2H66A 3WGEA 3F8UA 3HJPA 2XHFA 3SBCA 2PPTA 3DGQA 2L4CA 1Y25A 4KE3A 4RI6A 5KN3A 5EPFA 1V58A 3LYKA 4DSRA 4IQ1A 2H72A 3FR6A 4EC0A 2PU9C 4TR1B 4MZBA 2JADA 4G9HA 1EP8A 5IIZA 4N0VA 4TR1A 2E2MA 1Z3EA 3D21A 12GSA 3QAWA 3EYTA 4GF0A 1THOA 2H01A 5G2ZA 1QUWA 1OC3A 19GSA 4ZBAA 1GLPA 9GSSA 2RM5A 4YAPA 2LQOA 2VLUA 3U6VA 4Z7XA 5DJMA 4XS4B 3RDWA 2VD0A 1SD9A 1VRSD 2V32A 2I1UA 3KEBA 4XS4A 5F06A 1SJ6A 4PUFC 2Z9SA 4HDEA 2CA8A 1QQ2A 1MEKA 2C3QA 3GHAA 3VWUA 2VCTA 4N11A 2OE3A 3G7YA 1B8XA 4MPFA 4FYBA 2MMAA 1GL8A 4IJ3A 4WR5A 5HR1A 1O7UA 3ZVJA 3JCML 3RBTA 3UEMA 5ABRA 4K9ZA 1HNBA 1UVZA 3CTGA 1EOGA 1Q98A 1S3DA 1AQWA 2VM1A 3F4SA 2EIRA 1JZDA 1EP7A 4FH8A 2VLTA 1OC8A 3QD9A 4I2TA 3KTBA 2K18A 2H1BA 5JWQB 3FZAA 1XOAA 5CNWA 4GQCA 2WZ9A 2CT6A 1R26A 1GTBA 4POMA 2NBSA 1A2MA 1SJIA 4V1Ag 1DBYA 2DLXA 1SK0A 3TJJA 2GZZA 5ECQB 1GP1A 2A4VA 2PBJA 5A5KA 1LBKA 3LORA 4MJAA 3SWLA 2O87A 1DE2A 2G2QA 3FK8A 5D9VA 2GZPA 3CBUA 1IYHA 2K8VA 4PNFA 5CRGA 3TRXA 4BWSA 1C72A 1GLQA 2YP6A 4TKYA 4TN8A 3ERFA 1J0FA 5AISA 2H6YA 20GSA 1TXXA 4OO4A 3M9KA 3I9V2 5E4WA 1M2DA 3IBHA 4MH2A 4EKZA 1PX7A 3EU4A 1B48A 1XZOA 1WE0A 2JZTA 1F3AA 4KW6A 5G1LA 3FZ5A 3NOFA 2RUEA 2RM6A 1PKWA 1NM3A 3G9BA 3ZL5A 3D22A 5JCGA 3GRXA 2JACA 3Q19A 4KSOA 3I69A 2PN8A 1Y6EA 1JLWA 1BYEA 3CTFA 1B9YC 4J2FA 1K3LA 3J7Yk 2XBIA 2ZUPA 2H30A 1X5CA 2HRNA 5ECKB 5ECOB 3FRCA 2DJJA 3QMXA 3NIVA 2FHEA 3P7XA 5ECRB 3LXTA 4OD7A 4MLYA 5HR0A 5FT3A 1FG4A 3M3MA 1GUKA 5IO2A 5CREA 1PGTA 1A24A 2KP2A 2H1AA 5IMZA 5AGYA 3UVTA 5F05A 4X1UA 4ZL7A 5ECPB 2C3NA 3GKMA 3IAM2 4GSTA 4JZQA 2YWOA 1PL1A 4NHZA 1FB0A 4KGIA 5DALB 1HNAA 3UL3A 2V6KA 3C8EA 2QSIA 1Z7RA 1S3CA 2KOKA 3IAS2 2PMTA 5DALA 4IELA 4QL9A 2E7PA 3O6TA 1PD21 3C7MA 5IMAA 2KUCA 2LJKA 3D4MA 4JR4A 1XWGA 3DKSA 4KDYA 4G2EA 3L0HA 4XTSA 3IA1A 6GSUA 1FB6A 2PWJA 3QAVA 4LA1A 4ZB6A 2DIYA 2JL4A 2ZCTA 1MDJA 1ML6A 3ZMKA 4G19A 3GNJA 5AN1A 3TGZA 3QPMA 4MMMA 1O6JA 3ED3A 4YQUA 1PMTA 4KX4A 2MZCA 4KA0A 2GS3A 1KEBA 2CX3A 1F2EA 1BEDA 3GKXA 3H4KA 1B4QA 3BJ5A 1AAZA 1X5DA 1TRVA 1G6WA 1TK8B 1GSYA 2C3TA 2GGTA 4L0WA 1YY7A 1TDIA 4TOPA 5DCHA 1R5AA 2WS2A 2QGVA 5D93A 3UARA 1RK4A 3H79A 2BJXA 2GLRA 1M7TA 1ZCPA 2OBKA 2JSZA 2VOCA 3DWVA 2AHEA 3S9FA 1GSEA 1LJRA 3GURA 1GTAA 2RIIA 3QR6A 1A2LA 2F9SA 3ZRDA 5DJLA 2LTKA 2REMA 2AJQB 2CQ9A 3HXSA 4ZILA 2LJRA 3UMAA 4EL1A 2LNTA 4H86A 2IMDA 4WBRD 2WB9A 4V1Ap 3OR5A 2VCZA 3DVXA 2OE1A 1PX6A 1W89A 3AY8A 2MMNA 3APQA 4TXOB 3ZYWA 1F6MC 4YH2A 1E6BA 2B3SA 3ZIJA 1ON4A 4TXOA 3TJBA 3A2XA 3KH9A 1ZL9A 2PUKC 5C04A 1JHBA 5G31A 5A4UA 4BPYA 3KIJA 4I5QA 2B1LA 2B1KA 2H0IA 2CVDA 2VM2A 4EVMA 4MJCA 2L5LA 2YV7A 3FR3A 1Q4JA 1AUCA 4IHUA 2B5EA 1Z6NA 2H6XA 1O8WA 2MMOA 4V2NA 5ENUA 3UOMA 1H75A 5AIVA 2ALBA 1YZXA 4GTUA 4ACSA 1ERTA 5CRHA 1X9MB 1SKWB 4NWYA 3W6GA 5J5NA 3K8NA 4MZCA 2R2JA 5B8BA 5IMFA 3EINA 1G6YA 4K1FA 4TR3A 3LYPA 3P8WA 2GT6A 2YJHA 3W8SA 1FVKA 3KP8A 2VUPA 2WJUA 4L5LA 1QK8A 1WMJA 1JZWA 3QDNA 1USBA 4POBA 1JZOA 2M46A 3APOA 2OACA 4PGTA 3IPZA 3VWWA 2FA8A 4TW5A 1Z9HA 1FO5A 4F2IA 1YF0A 4EO3A 1XW9A 1G7OA 1GH2A 3O76A 1SL2B 3DIEA 2FA4A 4YQVA 2NPBA 1OKTA 2F8AA 4XRDA 2KP1A 3CSHA 1A2JA 4KDUA 5ECMB 1SD8A 5DVBA 4HZ4A 4PUAA 5D96A 1BX9A 4NPBA 2OKAA 4KSMA 1VF2A 5JWOB 5ELGA 1T4YA 3TKSC 1PQNA 4IKHA 5F8BA 2VCVA 1TKDB 3ERGA 1M2BA 3IOSA 1SYRA 2OJLA 5FWGA 2JU5A 1U87A 4IJIA 2LKUA 3GIXA 1KBNA 4ZB8A 2YCDA 8GSSA 3ME7A 2NVLA 3RPNA 3VLNA 4MF5A 2M72A 2FWGA 3CXGA 3C73A 1URMA 1GUHA 2AV4A 4IN0A 1XW5A 3BBYA 1SYXA 3VK9A 3M8NA 3Q74A 3GX8A 2YPMA 4K7OA 1MTCA 3Q6OA 4L5OA 2K8SA 2LNSA 4IP6A 3L4NA 3F3QA 3P2AA 2CZ3A 3A2VA 3KTLA 2X8CA 5G1KA 1QXHA 2N5BA 4LMWA 3IR4A 2IFQB 2H8LA 3TOUA 4WR4A 4GSSA 4JRRA 4ECCA 3HKRA 5J3RA 2IFQA 2HLSA 3EU3A 2IPAA 3PGTA 2IWTA 3ZVJD 1I5GA 4AJ6A 1K0MA 2LQQA 4XIHA 1OE7A 5H5QA 4KAEA 1YF1A 1TJDA 2HFDA 5EVOA 2KLXA 2L57A 1HYUA 3W8JA 3FHKA 2YOIA 1VGLA 2DMMA 3GKNA 4E8HA 1OVNA 14GSA 3N9JA 2X64A 3LJRA 1YKAA 2EIOA 2HI7A 1QFNA 16GSA 4MJBA 1GWCA 2IMFA 2PVQA 1XOBA 1V40A 3RHBA 3TKPA 3UAPA 4IGJA 5B6MA 6GSWA 3J7Yb 4OCFA 1UN2A 1QMVA 1T00A 2V1MA 1LU4A 4DSQA 3QCPA 3LXZA 4ZIJA 1TP9A 2GT5A 3UBKA 2F8FA 3HVVA 2XPEA 2YWIA 5H5SA 2F51A 1BJXA 4WKWA 3A2WA 3UBLA 4ZBDA 3DVWA 2CVBA 4LLRA 5B7CA 3HD5A 2GDRA 1F3BA 2R3XA 4AJ7A 1F37A 4JBBA 18GSA 4JE1A 5B8AA 2B7KA 2V6OA 2HSYA 4LL1B 1J9BA 1HD2A 3IC4A 4MF6A 2H71A 3H8QA 3MNGA 5ECSA 1XXUA 4FYUA 4ML6A 2VCQA 4ZB9A 4K7NA 3D6IA 5ECHB 2VL3A 2AB6A 3E9JB 2WFCA 17GSA 3KH7A 2LUSA 4X43A 1CQGA 2YNXA 3H93A 2C1YA 5B6NA 3QFAC 1R4WA 3IXRA 4IW9A 5G5EA 2P5QA 5CRDA 3CSIA 1TI3A 5D9TA 4I6XA 3ZTLA 5GAPD 4ECIA 1KNGA 2FNOA 4I8BA 1YEXA 5F07A 2V2GA 2H70A 4WF4A 4Q5FA 5KEJA 5C00A 4OO5A 1BAYA 3UVHA 4HJ2A 1K3OA 2DC5A 4X0XA 1R5PA 4Q5NA 2GSTA 3QFBC 1TRWA 5D9XA 3KGKA 3E0UA 1TU7A 2MYGA 5J9CA 3ZMLA 4WBJA 2XC2A 4GLTA 4HU7A 3GSSA 4HQSA 2WRTA 4O32A 2YV9A 2HZFA 3ZZXA 2DIZA 4V2MA 4FO5A 3LEFA 4PQ1A 4ILFA 1SL0B 2X8HA 2BMXA 3US3A 3LWAA 13GSA 3RAZA 4IQAA 2J23A 3VPQA 2GSRA 1FW1A 2LRCA 3KMNA 3D0ZA 3HA9A 2CAQA 2IIYA 2IMKA 2VCWA 5JCUA 1K0AA 1A0FA 1WOUA 4BA7A 2ZNMA 3GH9A 1XFLA 1EOHA 5G30A 2VAFA 5JWRB 4JR6A 3LG6A 1XBSA 2CV4A 4HEA2 5ELAA 2TRCP 1V2AA 1GTUA 2H19A 1K3YA 1NSWA 2K9FA 5EY6A 1AIUA 3KZQA 2DBCA 4RI7A 4ISDA 5GSTA 1J08A 5KN1A 3TKQA 2A2SA 3F9UA 1EEJA 2IMEA 2JSYA 3R2QA 4NV5A 4ECJA 4O7HA 2X8GA 4CW9A 3HY2A 5ID2B 1N2AA 2P0GA 1N8JA 2C0FA 3H1NA 3G7JA 2NDOA 5ID2A 3F3RA 4V2LA 2K6VA 1Z5YE 5ECLB 2CX4A 4I97A 4NV2A 4PNGA 5H5RA 3F63A 2IJYA 2WULA 3CYNA 1A23A 1AXDA 4ML1A 4XS6A 2VO4A 2XBQA 2GSSA 3DEXA 3I43A 1NW2A 5ECNB 2R5GA 2BTOT 1WJKA 1HQOA 3GMFA 2PERA 3TRQA 2IMIA 4YQMA 4HJMA 3GKKA 5HR2A 4XS1A 1H4OA 5D9WA 1PL2A 1ZZYA 3MSZA 3PINA 3ME8A 3TKSA 1FAAA 3KD0A 4F9ZA 3MWHA 3L9UA 2L6CA 2GQLA 4GQFA 1KTEA 3P90A 2YANA 5G5FA 1K0DA 2PVOC 1VF4A 4E8EA 3UJ1A 4ECBA 2G0FA 4IVFA 3QAGA 1XVQA 2E2GA 5HFGA 2CVKA 1EV9A 4MDCA 4HZ2A 2C4JA 5JCWA 4BWQA 3VWVA 3FEUA 4EE0A 1QGVA 4PXOA 3TKRA 2H1GA 1T7PB 3GV1A 3EURA 2OADA 4K2DA 4QL7A 1CQHA 5IO0A 5COHA 4IP1A 1WIKA 1FHEA 2H0HA 3C1RA 1PA3A 1S3AA 5LNKe 3MAKA 4MCUA 2ON5A 1AQVA 2D2ZA 1SK1A 4DSSB 1OKDA 5DQYA 1SU9A 4MF7A 3N5OA 4QQ7A 5J9BA 4MH3A 2FWHA 4DSSA 4N0ZA 4N10A 4N30A 3HCZA 1TK0B 2FCHA 1XWKA 3VURA 2QC7A 1WP0A 5HFIA 1GULA 4P3YB 2AAWA 1GTIA 2EC4A 3FZ4A 1M2AA 5F0GA 4NHWA 1PSQA 3BD2A 1K0NA 2R4VA 4EXJA 2C0DA 2LS5A 4RUVA 1K0CA 1YEPA 5GSSA 4L0UA 1T8EB 3ZITA 4PURA 2O89A 4WEYA 3GN3A 3TJKA 1A8LA 5CRWA 2B6MA 2F3MA 3BOAA 1JZRA 2R6KA 4CDOA 4HQZA 3WYWA 4OWYA 2L6DA 2I81A 3RPPA 3HJMA 3PR8A 1B9XC 3EE2A 4AF2A 2YWNA 1X9WB 5KN0A 2L59A 4XHMA 1WRYA 3EMPA 1ZYQB 5ECIB 1AC1A 2AUVA 4D73B 4NMUA 1ERUA 1M9BA 4GRFA 1EEMA 4MZWA 4BVYA 5IOWA 4D73A 4G10A 4DEJA 3KXOA 1ERVA 2DJ3A 2DJ0A 2N5FA 1WWJA 2FUG2 5DQSA 1XCCA 2LSTA 1A0RP 1TRSA 2DSAA 1I9DA 1OYJA 2YZUA 1ZYEA 3F0IA 3MDKA 3TKSE 2O7KA 3APSA 4KCEA 1UA5A 1V57A 4MP4A 3ZIVA 1EGOA 2H73A 4IS0A 2HZEB 4KH7A 5HQPA 1V9WA 5J4UA 2HZEA 3ZREA 1XWAA 4RQRA 1T4ZA 3VWXA 3EC3A 3LFLA 3DD3A 5GAND 1XPVA 3VPTA 2TIRA 3A5WA 4F03A 2GZYA 1BQ7A 2VL9A 2FLSA 5KN2A 1TI1A 4KUNA 1A8YA 3WGDA 2WGRA 1M99A 4TR0A 2HE3A 3TCOA 5CYYA 3F6DA 5D73A 1SJZA 1WPIA 1RQMA 3CRUA 1EV4A 1U6TA 4F82A 4HOJA 5IMVA 2HT9A 3VI5A 1FVJA 1Z6MA 2FWFA 4K0NA 4PQHA 10GSA 3HHVA 4ZBBA 4BL7A 4Q5QA 3FY7A 3IV4A 3RHCA 1T1VA 1X5EA 2HRFA 1RW1A 3HJOA 5GZZB 4K8MA 2KHPA 3DRNA 1TOFA 2VL2A 4BVXA 4OFMA 3IRAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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