4TW5A

Structure of the first two thioredoxin domains of saccharomyces cerevisiae eps1p
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
PPEGFPEPLNPTNFKEELSKGLHIIDFYSPYCPHCKHLAPVWMETWEEFKEESKTLNITFSQVNCIESADLCGDENIEYFPEIRLYNPSGYIKSFTETPRTKESLIAFARRESMDPNNLDTDLDSAKSESQYLEGFDFLELIAGKATRPHLVSFWPTKDMKNSDDSLEFKNCDKCHEFQRTWKIISRQLAVDDINTGHVNCESNPTICEELGFGDLVKITNHRADREPKVALVLPNKTSNNLFDYPNGYSAKSDGYVDFARRTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Eps1p
publication title The eps1p protein disulfide isomerase conserves classic thioredoxin superfamily amino Acid motifs but not their functional geometries.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 81
structure length 264
sequence length 264
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.4.3.1: Deleted entry.
pdb deposition date 2014-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tw5A01
1SJZA 4F03A 2GGTA 4V1Ag 1Y6EA 1OKDA 3UVTA 1O73A 5G5EA 2K8SA 1RW1A 2K18A 2WJUA 3FEUA 1YF0A 3M9JA 2R4VA 3CXGA 1NHOA 4JE1A 4MPFA 2LEGA 2CA8A 3UAPA 4IW9A 1GTBA 1YKCA 4X0XA 1SYRA 4NMUA 2H75A 3QAGA 1XOAA 2OKAA 3C1SA 4EDZA 4F9ZA 1MEKA 4MH2A 5E59A 4MF7A 4CHSA 2C3NA 5HFKA 1K0OA 2CZ3A 1ILOA 4ZBAA 3F6DA 1JHBA 5ECHB 2L59A 3UBKA 2A2SA 3MAKA 3GRXA 5HR1A 2JADA 2L6CA 2FCHA 1FOVA 4LL4B 3BD2A 2HXKA 5F0GA 1K0BA 3TKSA 4NPBA 2OE0A 4AJ6A 1G6YA 3LG6A 4XS4A 2WS2A 1M2DA 2OJLA 3TGZA 1XPVA 2L4QA 3F4RA 2GT6A 1F6MC 4GRFA 4ZB9A 2F9SA 3UEMA 4Z7XA 2HRFA 2H6XA 2VM2A 1ZCPA 1SYXA 4NAXA 1T1VA 4PNFA 4XHMA 1TTZA 3CRTA 3IC4A 4OFTA 2B5XA 3KEBA 5B6NA 1U3AA 2WDUA 3GL5A 2XBQA 1U87A 2L4CA 2M80A 2OADA 2IMDA 4IP6A 3ZRDA 2B5EA 5A4UA 4KSMA 2AB6A 2HSHA 4ZIJA 4NV5A 2YZHA 2JSYA 2A4VA 2WGRA 5JCWA 5CRHA 3HJPA 1G7OA 3N9JA 3P90A 1GWCA 3L78A 2N5BA 2G2QA 2CZ2A 3DD3A 1URMA 2GQKA 1U3IA 1S3DA 2YPMA 2GSTA 4LL1B 2C80A 1J9BA 3LFLA 5CP1A 5ECRB 4I2TA 4EDYA 3WGDA 3G9BA 4BVXA 1TK5B 4K0GA 2C0GA 4MP4A 3TJFA 1YEPA 1K0NA 3VWVA 3ZYWA 5DBQA 1V57A 4MZWA 2H1GA 5E4WA 4OCEA 5F07A 2I1UA 3IA1A 4IS0A 3I6AA 3EC3A 4GSSA 4N0ZA 3FY7A 5ECIB 1F3AA 2L5OA 2LQOA 2ZUPA 3F6FA 3AY8A 4XS1A 5LNKe 2GQMA 3BBYA 4XS4B 1Z7RA 3GH6A 2OBKA 3CSIA 2VCVA 4OD7A 4ECBA 3EYTA 4PQHA 5CRWA 2QSIA 1SKRB 5IMZA 3IRAA 4WF5A 1ZYEA 3IAM2 1HNCA 3C73A 3UBLA 3QAWA 4POLA 1OC9A 3GSTA 1VF2A 4KCAA 5ELGA 4KDYA 4HZ2A 1M7TA 2VL2A 1F2EA 2O89A 3PINA 5ECPB 5DAKA 1EGOA 4MK3A 4LLRA 4KAEA 3ERWA 1SD8A 3UARA 5DVBA 5HR0A 2NDOA 3IDVA 3TJBA 3LEFA 3UOMA 4V2MA 4L5LA 3KP9A 4KNDA 4OCFA 5B6MA 2HZEB 2RM5A 5IMVA 3H8QA 1N2AA 1A23A 1VF4A 2GZYA 1USBA 1R26A 3JCML 1Z7PA 2H72A 2GSSA 4MDCA 3TUEA 1EOHA 4WR4A 3APQA 4IJ3A 5EY6A 2WRTA 3ZIVA 1X5EA 4N0VA 4NWYA 4PXOA 1F9MA 2VAFA 1BQ7A 3KP8A 4MA9A 3TOTA 2VL9A 1GSSA 4KSOA 5IO0A 3VI7A 2KUCA 1ZOFA 2K6VA 2AAWA 5GSSA 3QMXA 3F8UA 2YWOA 2C0FA 2LS5A 2AJQB 5GZZB 3F63A 4EE0A 1XFLA 1KNGA 2HRNA 2FHEA 1ERUA 3DYRA 3E3EA 1SU9A 3LXTA 1AUCA 4LMWA 2H0HA 1TU7A 2MZCA 3GX8A 3ZTLA 1TRWA 2KHPA 4JZQA 3OR5A 1SKSB 3SWLA 1QK8A 1OC9B 3TKQA 1PKWA 1QGVA 2I9HA 4DEJA 2DIYA 1M9BA 2YOIA 1M9AA 1SK1A 2VLVA 4J57E 4Q5FA 3FR3A 4L5OA 4ZB6A 5GAPD 5DDLA 1X0RA 5CO3A 2GQLA 14GSA 4GF0A 3FW2A 2CAIA 5DAKB 3C71A 3Q6OA 2CVDA 3TKSE 5G1LA 4L0UA 2Z9SA 1TK8B 4KE3A 2YCDA 3TOUA 4WF4A 2E2MA 2HE3A 2L57A 3FZAA 3F3RA 4N10A 1TU8A 4I8BA 4K0NA 2KP2A 1LJRA 1Q4JA 2F51A 1THOA 4EC0A 3NIVA 4HDEA 2I81A 3ERFA 1ACVA 2DC5A 1QMVA 3WT1A 3TRXA 3DGQA 3LJRA 1UA5A 1AIUA 6GSSA 4WR5A 1DUGA 3US3A 3TDGA 4TR1A 5ELAA 3APOA 3D6IA 3FKFA 3QD9A 1A0RP 4I2UA 4KX4A 3LORA 3GKMA 4MZCA 3UJ1A 2B7JA 3EURA 4HEA2 1V2AA 1V40A 3O76A 3HXSA 3HDCA 1XIYA 2PU9C 4NHWA 2YWIA 4HQSA 1XWGA 4HUAA 5AISA 2CVBA 2E7PA 3QDNA 1ZYQB 1FO5A 1WRYA 4HZ4A 5IIZA 1AQVA 3HCZA 4KDUA 2DIZA 1YEXA 3F4TA 2YJHA 3VI5A 2OACA 1TI3A 4IQAA 2VD0A 4IJIA 4QL9A 5ABRA 2XBIA 1T4YA 5J41A 1I9DA 1GULA 4G2EA 3HY2A 2GSQA 5DCGA 2VUPA 3MWHA 3GKNA 4BA7A 1FB0A 2N5AA 2YV9A 2F8FA 1A2MA 2TIRA 1O7UA 4ECCA 3APSA 3IPZA 2DJ0A 2YN1A 3GKXA 4J56E 4CDOA 4YAPA 1ZL9A 4MF6A 2FD3A 4RQXA 3IBHA 1OE7A 1GSUA 1C72A 1XWBA 4FYBA 3P2AA 3BCKA 4ZILA 1TKDB 5IMCA 4Q5QA 2WULA 1WWJA 4POBA 2IMFA 4OMVA 1IYHA 1VF1A 2V32A 2IJYA 1YDKA 1O8WA 4O92A 4FIWA 3GIXA 1U88A 5CRGA 4TR1B 1FG4A 3ERGA 3HJOA 1ERTA 2GS3A 4EF0A 1GSFA 3RPPA 3IK9A 1LU4A 5F06A 4WBRD 2DSAA 3LQ7A 2V2GA 3DWVA 1G6WA 6GSVA 3QCPA 3J7Yk 1GTAA 2LUSA 2C3QA 5D73A 3ZMKA 19GSA 2PN8A 1TI1A 1FVJA 3P7XA 4MABA 4YQMA 1SJIA 3H4KA 1NM3A 3MSZA 2H71A 3TJKA 1XOBA 4FO5A 5D9XA 2OBIA 3A5WA 1M99A 2GSRA 4JU5A 3ZVJA 1N8JA 2NTOA 1ZZYA 4RQRA 1GL8A 2WB9A 2LNSA 1EV4A 4HJMA 2H30A 1A2LA 1GLPA 2KOKA 4IQ1A 3W8SA 2HLSA 3W6GA 5F05A 3UVHA 3M1GA 3UL3A 3DKSA 4ID0A 4I97A 3TRPA 4HS1A 2LRTA 5CNWA 13GSA 4IELA 5HQPA 4PNGA 4G19A 4POMA 5A4WA 1X9WB 2MBTA 1YY7A 3EU4A 5KN0A 5IPGA 2CV4A 5G2ZA 3S9FA 3EU3A 2CVKA 6GSUA 2OE1A 4G10A 2VL3A 1V58A 4Q5RA 11GSA 1EP7A 5KN3A 4LA1A 5LCZA 5L71A 4ZL8A 1AAZA 3VLNA 1FB6A 4K6XA 2QGVA 5ECQB 1R5PA 2PVQA 3EMXA 4TW5A 3VFIA 5ID2B 3W8JA 1JZWA 1XVQA 6GSYA 1I5GA 4XRAA 5JWQB 4ML1A 1UC7A 6GSWA 4ECIA 3DEXA 2B5YA 4WKWA 2R6KA 4WEYA 2XPDA 4IGJA 1CQGA 2CT6A 1JZDA 4ILFA 1EP8A 2HZEA 5IQYA 2V1MA 3D4TA 3GYKA 3GMFA 3L9UA 2PERA 5HFGA 4YQUA 4AJ8A 4BL7A 2IFQA 1CQHA 1B9XC 1PSQA 5DJMA 4H86A 4E8EA 1EEMA 3TB2A 2P5QA 2MBSA 3ED3A 2YWMA 3EE2A 5ECLB 4BWSA 1ERWA 1B9YC 4TR3A 1GTUA 3E9JB 1THXA 1PL1A 2H73A 1TXXA 3GV1A 3U6VA 4I6XA 2VD1A 2C3TA 4PGTA 1OVNA 2RUFA 1H75A 4XS6A 1S3AA 3HD5A 2YJ7A 4D73B 2KP1A 1RQMA 1PA3A 3RDWA 1DE2A 4TRXA 2IMIA 4YH2A 1JFUA 3DRNA 3P8WA 1T7PB 4YQVA 2H0IA 3LYPA 4IP1A 1EEJA 4KGIA 3EINA 3H79A 1WP0A 4EL1A 2VL2C 4YAVA 3FK8A 3ME7A 1GP1A 5IMAA 4HOJA 1SKWB 5D96A 2AUVA 2LQQA 4WETA 3HVSA 2VLTA 2MMOA 2FWEA 3FRCA 4ULXA 3TJGA 1GH2A 3BJ5A 1KTEA 3F9UA 3O3TA 3ZFLA 5CAXA 2I3YA 4N30A 3VWWA 2LJKA 4LMVA 1PX6A 3KTLA 2DJ3A 1XWKA 4MZBA 1AC1A 2N5FA 3BCIA 1A8YA 3O6TA 1AXDA 5G31A 2P0GA 2CAQA 2IFQB 4TN8A 4EVMA 3VPQA 4ZL9A 1TRUA 4GLTA 5IPHA 3LXZA 1BJXA 1AQXA 1OKTA 5G1KA 1W89A 4HU9A 2L5LA 1XW9A 2H74A 5ECOB 2X8HA 2B6MA 4XRDA 3FR6A 1XWAA 4K7IA 2DJJA 1SENA 4WBJA 3HZ4A 2CQ9A 3ZZXA 2M46A 3GHAA 3VWXA 1W4VA 2O7KA 1OC8A 1XXUA 3KMNA 5ECSA 2LNTA 5IOWA 1JLWA 2DLXA 2F3MA 2P5RA 1B4QA 9GSSA 1BX9A 5J5NA 3HHVA 2GZPA 4NV2A 2E2GA 2DJ1A 2ON5A 4ZB8A 1FAAA 5AGYA 5JWOB 1BAYA 4RUVA 5C04A 2RIIA 5IO2A 3KCMA 1SD9A 4PQIA 4JR6A 4EUYA 2C0EA 2JZRA 2B1KA 2ZCTA 3VURA 3MNGA 4F2IA 2J23A 3KD0A 2ON7A 2BTOT 5LD0A 2PPTA 5D93A 3IXRA 2PGTA 3TKRA 3H93A 4EO3A 4AJ7A 2R3XA 5KN1A 1SL2B 2NPBA 3ZITA 1PL2A 3IOSA 4AF2A 1MDJA 2IIYA 2MMZA 5B8AA 2G0FA 2QC7A 4IVFA 2LJAA 2P31A 4ACSA 2PMTA 4HQZA 4CW9A 4ZXGA 2H66A 22GSA 1U6TA 7GSSA 1PKZA 2EIRA 5J9CA 1TDIA 2MMNA 4IBPA 1WOUA 4L8EA 4K1FA 2B7KA 3WT2A 2H8LA 4P3YB 1A2JA 4IHUA 2EIQA 18GSA 2B1LA 3FZ4A 2JU5A 1PGTA 1BG5A 2JSZA 2RM6A 5ENUA 20GSA 1AQWA 2HFDA 1E2YA 1ON4A 4DSSB 3E0UA 2FWHA 4KW6A 3RHBA 3CBUA 2IMKA 3G7JA 1GNWA 1GUHA 4TXOB 2QKEA 2X8GA 1T00A 1NW2A 3LWAA 1GSDA 3LGCA 1KBNA 2DMLA 1YJ6A 4F0BA 3GX0A 2ZNMA 2PWJA 4F82A 1PMTA 3ZL5A 3TKPA 4K7OA 3NZNA 2YWNA 2WFCA 2O8VB 4TXVA 1ZGNA 5D9WA 2LJRA 1G0TA 4KH7A 3WGEA 3IV4A 1M2BA 2FA8A 3D21A 1J0FA 3M3MA 2LV3A 5C00A 4DSRA 5COHA 1K0MA 4BWQA 2VOCA 2GT5A 5A4VA 1X9MB 5FT3A 1SK0A 1XW6A 4GWRA 4O7HA 1MDKA 1GUKA 1GUMA 3Q19A 1HYUA 5D9VA 2F8AA 2A2RA 3QPMA 5G5FA 3QR6A 3C8EA 1XW5A 3KH9A 2VLUA 3SBCA 3QFBC 1Z9HA 1R5AA 4K7NA 4GTUA 3D4MA 5ID2A 5CREA 2VO4A 5AIVA 3U5RE 2VIMA 1HNBA 2H6YA 2VM1A 2V6OA 1XZOA 1EGRA 3C1RA 5ECKB 4ML6A 2H19A 1GLQA 4OO5A 4JEDA 3WGXA 2LTKA 5CRDA 5J4UA 5HFIA 4DSQA 4MLYA 2X64A 1R7HA 4BVYA 1SK2A 2EC4A 3CTGA 2OE3A 1HNAA 2PUKC 1QQ2A 1GTIA 2NVLA 1TRSA 3ZFBA 4XIHA 4GQFA 3I9V2 3FYGA 1B48A 2BMXA 2HSYA 1SL1B 1YF1A 4IN0A 1SL0B 2XHFA 3D0ZA 2FWGA 1X5CA 5FWGA 4ECJA 3Q74A 3GKKA 4MJBA 2MYGA 3TKSC 5JCUA 2JL4A 1YKAA 3KXOA 4TVEA 4POKA 3J7Yb 4PQ1A 3N5OA 1M2AA 5D8IA 4NXIA 3QAVA 4D73A 1QFNA 4JBBA 2GVPA 4GSNA 1GRXA 2IL3A 3FR9A 10GSA 1F3BA 3M0FA 4OWYA 2RLIA 3DVWA 3WD6A 4RI7A 4ISDA 1ML6A 1EOGA 3KJYA 3C7MA 1GSQA 4F0CA 4GCIA 1B4PA 2C8UA 2LKUA 5EL8A 1T3BA 2FWFA 3LSZA 2DJKA 12GSA 4PX1A 5JWRB 2IWTA 4RI6A 3F4SA 3HVVA 2X8CA 1EV9A 1HD2A 4JR4A 2ALBA 2O85A 5DALA 3KZQA 1Z5YE 1T4ZA 3FZ9A 2WZ9A 4MJAA 4G9HA 4PUAA 2REMA 1XCCA 1R4WA 3M8NA 5G30A 5INYA 5IMDA 2R37A 2GZZA 3EWLA 3A2WA 3ZREA 1K3OA 1E6BA 3V1WA 5IMFA 4JRRA 3IHQA 3A2VA 1WJKA 3TCOA 3NOFA 2M72A 2NBSA 2V41A 3PH9A 2OA7A 3K8NA 4FYCA 1A24A 4ZBDA 3ZVJD 4KA0A 4HU7A 3ISOA 3RHCA 5IM9A 3RAZA 3KM6A 1VF3A 4ZBBA 2AV4A 5H5SA 2B3SA 1IYIA 4Q5NA 5B7CA 5KN2A 4ZL7A 1TRVA 6GSXA 3BOAA 4K2DA 4V2NA 3KGKA 3MDKA 2H76A 2GDRA 3DXBA 3CMIA 1TOFA 4J2FA 1ABAA 2FNOA 3GFKA 4AGSA 1OC3A 3H1NA 2H6ZA 3TRQA 5CYYA 1GSYA 1Z6MA 3CTFA 1XBSA 1K3YA 2BJXA 3CSJA 4QL7A 2H1BA 1K0CA 1JLVA 1Z3EA 1OE8A 3KIJA 4KDXA 4V2LA 1K0DA 4GXZA 1PRXA 3HYPA 2H1DA 4PUFC 5DALB 17GSA 4FH8A 1MD4A 3M9KA 1OYJA 5ECMB 1NHYA 1RK4A 5B8BA 1G7EA 2GLRA 4XTSA 2H70A 5FHIA 3GL3A 1WPIA 2VCQA 3Q18A 3L9VA 5J9BA 2E0QA 2YV7A 2PVOC 5JCGA 3UIWA 4TKYA 1EZKA 1QUWA 3L9SA 4MMMA 3R2QA 1X9SB 1BEDA 2HZFA 3IE3A 4MF5A 3LYKA 2O87A 3F3QA 5D9TA 1JZOA 2FY6A 1FW1A 2I4AA 3IK7A 4MH3A 2TRXA 1X5DA 1K0AA 3ZMLA 2C1YA 4GSTA 1V98A 3GNJA 5DCHA 1MDIA 1TW9A 1SJ6A 2AHEA 4DSSA 4DVCA 2YZUA 3QFAC 4MJCA 1KEBA 3GN3A 3A2XA 1PD21 1H4OA 3UMAA 2YANA 2H0GA 5AIXA 3PR8A 4TXOA 1XWCA 1ZMAA 4OFNA 3CRUA 8GSSA 2K9FA 3DVXA 3GA4A 1DSBA 5F8BA 2MMAA 2PBJA 1O85A 2JACA 4HJ2A 2HT9A 2FLSA 1PX7A 3DMLA 2ES7A 3I43A 3TJJA 1K3LA 1FHEA 3RBTA 4V1Ap 2C4JA 4KUNA 4X1UA 2C0DA 2VCXA 2FGXA 1JZRA 1ERVA 1MD3A 3PGTA 3G7YA 4WXTA 4BPYA 1OAZA 3IAS2 2TRCP 3EMPA 5DQSA 3FHKA 1GNEA 3DIEA 3VK9A 1DE1A 4O32A 2VCTA 2X99A 4OO4A 1TJDA 4K9ZA 4K8MA 4GQCA 2DBCA 2FUG2 16GSA 2RUEA 3ZIJA 3FZ5A 3HA9A 4TR0A 2AYTA 2R5GA 3F0IA 3GUSA 3D22A 2D2ZA 4KCEA 3GTUA 2J9HA 1PQNA 3A3TA 5GAND 2K8VA 1VGLA 5J3RA 2FA4A 3HVXA 2H01A 3IR4A 3QOUA 2CX4A 4EKZA 3L4NA 1Q98A 2EIOA 1ST9A 4HI7A 1Z6NA 1PN9A 1QXHA 1HQOA 3GURA 3ME8A 2HI7A 2V6KA 5HR2A 5HR3A 3EVIA 4TOPA 3VPTA 4IKHA 5AN1A 1GSEA 2HNLA 5ECNB 2YNXA 5GSTA 1WE0A 3CYNA 4X43A 1AW9A 1O8XA 1J08A 1T8EB 1UVZA 4NHZA 1F37A 3ZLPA 2DMMA 2WCIA 5H5QA 4KB3A 3D5JA 2CX3A 1YQ1A 1TP9A 4E8HA 1WMJA 3I69A 3GSSA 1NSWA 3HKRA 2L6DA 1YZXA 1LBKA 3VWUA 4O5RA 2LRNA 5EPFA 1WIKA 2VCZA 4XCSA 3RPNA 1VRSD 3CSHA 1UN2A 3L0HA 4FYUA 1B8XA 4TR4A 2R2JA 3WYWA 1Y25A 1BYEA 1V9WA 2XPEA 3G7IA 1A0FA 1XVWA 6GSTA 1M0UA 2LSTA 3HZ8A 3KMOA 2JZSA 2IN3A 1O6JA 1DBYA 1A8LA 5DQYA 5H5RA 4MCUA 3HJMA 4EXJA 4QQ7A 2JZTA 4I5QA 4MJEA 3GTUB 2IMEA 3GH9A 4OFMA 2XC2A 5A5KA 2KLXA 1O81A 2IPAA 1FVKA 3KH7A 2H1AA 4N11A 1EWXA 2LRCA 5EVOA 2DJ2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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