1OC3A

Human peroxiredoxin 5
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
SAPIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a Dimeric Oxidized Form of Human Peroxiredoxin 5
pubmed doi rcsb
molecule keywords PEROXIREDOXIN 5
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 47
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2003-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1oc3A00
1TRVA 2RM6A 2L6CA 5LCZA 3F8UA 3Q6OA 2FGXA 2V6KA 1K0OA 2IFQB 3H79A 3C73A 5G31A 4ZL7A 2N5BA 22GSA 1B4QA 1E6BA 4OD7A 2B5XA 3IPZA 5FT3A 1Q98A 2EC4A 5JWQB 2H1DA 1W89A 2RLIA 4V2LA 5GAPD 4WR5A 2CZ3A 5DAKA 4I97A 2CQ9A 4GSSA 1A2MA 3VWXA 2DJKA 1T8EB 1PRXA 2I4AA 4ZBAA 2V2GA 5KN0A 3KMNA 4I8BA 3U5RE 3K8NA 2CX4A 2IMDA 2RUEA 2HZEA 4K0NA 1ZCPA 4LMVA 3DXBA 1ZGNA 2VUPA 2C3QA 3TB2A 1B9YC 3HJPA 2IWTA 3VI5A 1M99A 2CAIA 2HNLA 1Y25A 1GULA 4RI7A 2KP1A 4BWQA 1SU9A 2MMZA 3LORA 4HOJA 2L6DA 4FH8A 3DYRA 2VOCA 3D21A 5DALB 1YKCA 1PX7A 1FVJA 5IMFA 2XPDA 3UVHA 1YDKA 2M72A 3FW2A 2VL3A 3BD2A 3APSA 5HR0A 3F9UA 3E0UA 3F4RA 5DDLA 2A4VA 1U6TA 4GXZA 1USBA 1NHYA 3TRXA 4IELA 1F6MC 1C72A 3P8WA 2QKEA 4MCUA 1ERTA 5DCGA 2IN3A 4YQMA 1GLQA 1MD4A 4L0WA 3D6IA 1TTZA 2CZ2A 3E3EA 1QGVA 1XFLA 4EL1A 5JCUA 3MNGA 4I6XA 4HEA2 1JFUA 1LU4A 2FA8A 2K8VA 1XWBA 3HYPA 3M9JA 14GSA 3MDKA 3UL3A 4XS4B 1N2AA 4WF5A 2H0GA 1VRSD 1TI1A 5G1KA 4DSSA 2C0EA 4HJMA 1GNWA 2LNTA 1TOFA 4L0UA 2WRTA 2MYGA 3P2AA 2HRFA 3D4TA 7GSSA 3FEUA 1F3BA 1V40A 2NPBA 3F3QA 1Y6EA 3C1SA 3IK7A 4PNGA 4G19A 5IO2A 1B48A 1B4PA 1K0AA 4EDZA 4MA9A 1SL1B 3C1RA 3LJRA 1O8WA 1ML6A 5CRHA 1BJXA 1TKDB 2H70A 1PSQA 4CDOA 1SKRB 3TKPA 2NDOA 3N5OA 1ACVA 2OBKA 1AQVA 3N9JA 4O5RA 13GSA 1A23A 1TK8B 5ECNB 1QXHA 4NMUA 1OC9A 3CXGA 4GCIA 5D9WA 1K3OA 2IIYA 4GWRA 2YN1A 3KTBA 4XS1A 2JZSA 1S3AA 1FW1A 1X0RA 2EIRA 2WFCA 4GF0A 5JWRB 2WZ9A 5L71A 2H74A 4XIHA 3KH9A 3RHBA 4O92A 4MH2A 4HJ2A 19GSA 1HYUA 2FWEA 4L5OA 3ZMKA 3BCKA 5D8IA 2C80A 3GHAA 2AYTA 2PU9C 1JZRA 5FWGA 2PMTA 1SYRA 1TDIA 3ME7A 2ALBA 4KSMA 16GSA 1GSDA 4K7OA 1TRUA 2RIIA 4OO4A 3DVWA 1GSSA 3F63A 3QPMA 2CV4A 3L9UA 4IVFA 4NPBA 1FHEA 2H66A 2VLTA 4YAVA 2F51A 5INYA 1THOA 3ZTLA 3GKMA 3GL3A 5JWOB 5IPHA 2FNOA 2O87A 3NOFA 2H6YA 4V2NA 4J2FA 2VCTA 4TXVA 1M2DA 1QUWA 3QAVA 4KDUA 1TJDA 3G7YA 4K7NA 2L5OA 2FWFA 5D93A 2LJKA 2MZCA 4F82A 2HSYA 3VPQA 1ZMAA 4GTUA 3QCPA 1U87A 2R6KA 4JEDA 2GT6A 4GQCA 4I5QA 1SYXA 1XCCA 1TRWA 2YP6A 2JADA 4RI6A 4Q5RA 3ZFBA 2C3TA 1YJ6A 2TIRA 2DBCA 5IMVA 4Q5FA 3HVVA 2WB9A 2YWMA 2XHFA 1G6WA 4RQRA 2FWGA 4NHZA 2XBIA 2N5AA 2VL9A 2B5YA 1BAYA 2O8VB 4Z7XA 2CAQA 3M9KA 2I3YA 4ML6A 2VO4A 5ECPB 4KW6A 3VK9A 3JCML 4ECIA 3GTUB 4XHMA 4H86A 4GRFA 4MZCA 2CVBA 1WE0A 4ILFA 2VCWA 4ZB8A 5EVOA 4L5LA 1BQ7A 3NIVA 3TJJA 2JL4A 4FIWA 2N5FA 4MF7A 3L4NA 1OC8A 4FYUA 1Z3EA 3FR3A 2WCIA 2F8AA 3LEFA 2IFQA 4MJEA 1GRXA 5CAXA 3I43A 2VL2C 4ZL9A 1IYIA 1YEXA 4D73B 2X8HA 4EF0A 2CT6A 1V2AA 3M1GA 4ECJA 1JZDA 3TCOA 4IGJA 2YJHA 1EEMA 2FHEA 4TR1B 4XRDA 2PVQA 2MBSA 3FRCA 4MJAA 5ID2B 4O32A 4JU5A 3IC4A 5HR3A 3DGQA 1UVZA 4DEJA 3EE2A 3HY2A 3TJBA 1WWJA 2I81A 1T4ZA 1TRSA 3IDVA 1JLVA 3UJ1A 1GSQA 2JSZA 2GSSA 4BL7A 4AGSA 4EKZA 1HQOA 1AC1A 2H1AA 1GUKA 3FR6A 3A5WA 1UA5A 1QMVA 5B6NA 1CQGA 1SK2A 4FYBA 1A24A 1R5AA 4LMWA 1GTBA 3ZLPA 2BJXA 4IP6A 1BEDA 3Q74A 2LSTA 5DALA 1R5PA 3KCMA 3J7Yk 3EVIA 3IAM2 2FUG2 5DCHA 1GL8A 5HFIA 4N10A 2HZFA 4LL4B 2LV3A 1DE2A 1EWXA 1EGRA 2DLXA 1PX6A 2FCHA 4KNDA 3IHQA 3KD0A 1MEKA 1FVKA 1KNGA 1V58A 2WJUA 2X8CA 1Z7RA 3US3A 4JBBA 1K0MA 3ISOA 11GSA 3WGDA 4MABA 2DMLA 1V98A 3HVXA 2GLRA 4N0VA 4TXOB 1XW6A 1I5GA 5JCWA 5KN1A 1G0TA 4HI7A 2C3NA 1FG4A 4IN0A 2CX3A 4XS4A 4X1UA 5EPFA 2R37A 4QL9A 2V6OA 1AQXA 4JE1A 4HQZA 4N11A 3EMPA 1AAZA 2LRNA 2P5QA 2GQLA 3ZMLA 3H4KA 4WBRD 5G5EA 2HXKA 3Q19A 4XTSA 2LUSA 4IBPA 1SKWB 4IJ3A 5ELGA 5C04A 4MDCA 1VF4A 3BOAA 5CRDA 1SJ6A 3BCIA 3HKRA 4IKHA 4G9HA 3TUEA 3TJGA 2M80A 1GTIA 4KX4A 4WKWA 2JACA 3HJMA 3L78A 1DUGA 2OE1A 3HXSA 5A4WA 5ABRA 3GSSA 3SWLA 1THXA 3L9VA 4KDYA 5D9XA 3GL5A 3ZREA 1QQ2A 5J5NA 1EOHA 4GLTA 2LS5A 2K18A 1Q4JA 2F9SA 2FY6A 4JR6A 2C0FA 1FB6A 5KN3A 2B3SA 5H5SA 1WJKA 3GNJA 3DRNA 2AJQB 4CHSA 2VCXA 3TGZA 2ES7A 4DSRA 3QFBC 3S9FA 4MF5A 2B6MA 2FLSA 2LEGA 3CRTA 4IHUA 4ID0A 3D4MA 3L9SA 3DIEA 2GSTA 4POLA 3PINA 3IOSA 3LXZA 1QFNA 3F0IA 4GQFA 3CSIA 4HDEA 4IP1A 2QSIA 4V2MA 2AAWA 3GUSA 5CO3A 3C71A 4PURA 2RUFA 4OWYA 4QL7A 2BTOT 4OFTA 3KP8A 3ZRDA 4WBJA 3D5JA 2K6VA 2CA8A 1M2BA 3RDWA 5HQPA 3P90A 2JZRA 1ZYEA 2R4VA 3ZIVA 5LNKe 1PKWA 4P3YB 2XPEA 3CYNA 3HHVA 2A2RA 3TOTA 3ERWA 1K3YA 2AUVA 1A8LA 5CREA 2JZTA 2H1GA 4G2EA 4FO5A 4IW9A 4POKA 20GSA 5D73A 2P0GA 3PR8A 5HR1A 1M7TA 3PGTA 2GZZA 3GKNA 5HFKA 3LXTA 4OO5A 3FR9A 5EY6A 4OFMA 1ILOA 2PVOC 1K0CA 1SD8A 4X43A 2O89A 1RQMA 3QOUA 1F3AA 2H73A 3ZIJA 2B1LA 4BA7A 5J41A 4CW9A 4KSOA 3RBTA 5DQYA 4GSTA 1V9WA 2AB6A 1WMJA 4EVMA 2E2GA 1YEPA 4XCSA 2H76A 3HA9A 3I9V2 2F8FA 5E59A 4NHWA 5G5FA 1GUMA 1J08A 2YJ7A 2P5RA 4PNFA 5IMAA 3GTUA 5D96A 2E0QA 3F3RA 3QMXA 3TKSA 1O7UA 3LFLA 3GX8A 1WIKA 1O85A 3FK8A 2WS2A 6GSWA 1LJRA 4ULXA 2R5GA 1PN9A 2IL3A 1OVNA 3Q18A 2G0FA 3GA4A 1EGOA 1NM3A 4LLRA 3VWWA 4HQSA 2AV4A 3WD6A 3IV4A 4I2UA 1O73A 1XW5A 3ERGA 4MLYA 4K1FA 1NW2A 5KN2A 4D73A 1R4WA 2DSAA 1PA3A 2L57A 3TKQA 1F9MA 4ZB6A 1B8XA 1GSUA 3TJKA 5IOWA 3ME8A 5CP1A 3A2XA 2ZNMA 3IA1A 4WR4A 3F4TA 4MJBA 4TR1A 4WEYA 3FZAA 1Z6MA 3ZVJD 5IMZA 3LYPA 2QGVA 2NTOA 3GN3A 4EO3A 2JSYA 2GT5A 1M9AA 4K6XA 4MPFA 4K0GA 3BJ5A 3LWAA 3MWHA 3I6AA 5AIVA 1DBYA 5B8AA 12GSA 2B1KA 2LKUA 4V1Ap 5E4WA 3SBCA 2J23A 2HLSA 1YF0A 3O6TA 3O3TA 1A0RP 3EYTA 5AN1A 4KB3A 3QAWA 5B8BA 5F8BA 1JLWA 1Z5YE 5DJLA 4F2IA 2L59A 4Q5NA 5F0GA 1XIYA 2HE3A 2CVDA 3FHKA 4YQVA 3PH9A 1ERVA 3E9JB 2OACA 3WGXA 3UBKA 2VD1A 5GAND 3W8SA 2M46A 10GSA 1XOBA 4J57E 3UVTA 4TXOA 2EIQA 4EUYA 4ZL8A 5A5KA 3CSJA 2PN8A 5KEJA 2EIOA 4F9ZA 2V41A 2LNSA 4ISDA 1F37A 2MMOA 1FAAA 1V57A 4PQIA 1G7OA 1PL1A 1PD21 2OBIA 3KZQA 2DJ2A 2YPMA 2PBJA 4AJ7A 1VGLA 4HUAA 1BYEA 2VAFA 3DWVA 5B7CA 1ST9A 2TRCP 4PUAA 4GSNA 4ZIJA 4HS1A 3KTLA 2C4JA 1JZOA 1GLPA 1TW9A 2O7KA 4ML1A 2ZCTA 9GSSA 4TRXA 2H6XA 3ZYWA 1EV9A 1OAZA 1JHBA 1X5EA 5IOXA 4MPGA 3DVXA 2HFDA 2VIMA 1DSBA 5J4UA 3W8JA 3GKKA 2HRNA 1K0NA 1B9XC 2PGTA 3QD9A 4E8HA 4E8EA 3KEBA 1XW9A 2YCDA 4K7IA 1AQWA 2VCZA 3IRAA 5G1LA 3W6GA 4NV2A 3IXRA 2L5LA 5IMCA 2KLXA 2C0DA 3U6VA 4OCEA 2X8GA 3FYGA 3GIXA 3D22A 3H1NA 2K9FA 3UMAA 1RW1A 1MTCA 3IR4A 5FHIA 1NHOA 2GQKA 1U3IA 1E2YA 3EC3A 4DSQA 1OKTA 2LRCA 2P31A 3D0ZA 2WDUA 3KMOA 1A2LA 2ON5A 1M2AA 3VLNA 5J9CA 2WGRA 5IQYA 2DC5A 4X0XA 1SJIA 3GV1A 2IMKA 3UARA 2GSRA 2A2SA 3RPPA 18GSA 3TRPA 2HYXA 3WGEA 4ZB9A 1WRYA 2YV9A 3HVSA 4ACSA 2LQQA 3CRUA 2VM1A 1GSFA 3HZ8A 4IQAA 4KAEA 3UOMA 1U88A 1URMA 3TKSC 6GSVA 5EL8A 1I9DA 5J3RA 4YAPA 2PERA 1NSWA 2ON7A 4EC0A 2LTKA 3UAPA 1EV4A 4JZQA 2YZHA 2K8SA 2YNXA 5CRWA 2G2QA 4KUNA 3TOUA 5AIXA 4F0BA 3V1WA 1O8XA 4FYCA 1X5CA 3CTGA 1AUCA 3EMXA 3CSHA 3VWUA 3ZFLA 2D2ZA 1IYHA 1LBKA 3GSTA 1SL0B 1A8YA 3HD5A 1T1VA 1YKAA 1JZWA 5GSSA 3EWLA 1GSEA 3CMIA 3IBHA 4AF2A 3IK9A 3KH7A 3AY8A 1SL2B 2LJRA 5ELAA 1M0UA 1J9BA 4OFNA 1R26A 1XXUA 3TDGA 1EZKA 4ZBDA 3F6FA 1SKSB 1GH2A 1N8JA 3A2VA 4I2TA 5DQSA 4YQUA 4KH7A 4AJ8A 3CBUA 1X9WB 2DIYA 2X99A 1K0BA 3G9BA 5H5QA 1M9BA 2KOKA 2MBTA 3OR5A 3NZNA 4TR3A 4NV5A 3DMLA 4BWSA 4TW5A 2H0HA 2RM5A 2GSQA 3UEMA 4BVXA 1GTUA 2KHPA 1EP7A 4KCEA 1HD2A 2E7PA 2GZPA 4JRRA 5DVBA 2VL2A 2XBQA 3C7MA 2KP2A 2GGTA 3O76A 3KM6A 2PUKC 3MAKA 2REMA 5B6MA 4MMMA 1UC7A 1S3CA 5ECMB 4IS0A 3A2WA 1F2EA 4MK3A 2VLUA 1TK0B 2IMEA 2AHEA 4RQXA 3QAGA 4ZILA 1Z6NA 3EURA 2YZUA 1BX9A 2LRTA 5IMDA 1X9SB 2HSHA 1DE1A 2C8UA 5AGYA 3VFIA 2KUCA 1OC3A 17GSA 1PGTA 3GFKA 3GURA 2YWNA 1BG5A 3DEXA 3FKFA 2H0IA 1R7HA 2DJ0A 3UBLA 1T7PB 4TR0A 2VCQA 3UIWA 4KGIA 2PWJA 3DKSA 3LYKA 4N0ZA 1MDKA 4TOPA 2LQOA 4TN8A 4PUFC 2TRXA 1XWAA 4MH3A 1GNEA 1HNAA 2IPAA 4LA1A 2GZYA 1ERWA 1ZZYA 4LL1B 1O81A 1ZYQB 3GKXA 2GVPA 5IM9A 3TRQA 3GH9A 4EE0A 2YOIA 4OMVA 1PMTA 4IQ1A 2C0GA 2YWIA 1YZXA 4Q5QA 4TR4A 3M3MA 1XWKA 3VWVA 2DIZA 5ECLB 3IAS2 2O85A 2V32A 2OE0A 4ZXGA 3QDNA 4KE3A 1T3BA 1T00A 2B5EA 4V1Ag 4WF4A 1TU7A 5GZZB 5DAKB 5IPGA 1ON4A 5CYYA 3DD3A 3KGKA 1ZL9A 1OYJA 3F4SA 3CTFA 4PGTA 3MSZA 5H5RA 2OJLA 1OE8A 2I9HA 2HZEB 1EOGA 2DMMA 4MF6A 2MMAA 3GYKA 4PX1A 6GSSA 1AXDA 1YF1A 4N30A 1YY7A 3BBYA 2OKAA 3RHCA 3EINA 4TVEA 4JR4A 2FA4A 5ECIB 3APQA 2GTUA 3VPTA 4OCFA 1J0FA 1HNCA 3H93A 4ECCA 1PKZA 1ABAA 1T4YA 1FB0A 4XS6A 1GWCA 2VM2A 3FZ9A 2FD3A 2GDRA 2DJ1A 1SJZA 2H8LA 3LQ7A 4EXJA 5ID2A 4MP4A 4HU9A 3M8NA 3GH6A 2R2JA 4NAXA 2H72A 3P7XA 2H19A 5F05A 4YH2A 5ECKB 1AW9A 5ECHB 1XBSA 2GS3A 4KA0A 1A2JA 2H1BA 2GQMA 4K2DA 3LGCA 2NVLA 2VLVA 3HDCA 3WYWA 4DSSB 6GSXA 1TXXA 2OA7A 2X64A 3ERFA 4ECBA 4KCAA 1WP0A 2Z9SA 4DVCA 1A0FA 1MDJA 2HI7A 3GMFA 1X9MB 3FZ4A 3QFAC 4WXTA 1K3LA 3M0FA 4TKYA 2WULA 3G7JA 1SK1A 1SENA 1CQHA 4L8EA 5C00A 1GSYA 1XWCA 1XOAA 1SD9A 1VF1A 5G30A 2QC7A 2OADA 1Z9HA 4G10A 1RK4A 1OC9B 2L4CA 2E2MA 2YWOA 3A3TA 5LD0A 1XVQA 5IO0A 1ZOFA 4ZBBA 3ZZXA 3R2QA 3I69A 6GSUA 4NWYA 5ECOB 3GX0A 1OKDA 2PPTA 3TKRA 3HJOA 5ECQB 4F0CA 2HT9A 2V1MA 5DBQA 5HR2A 5A4VA 1XZOA 3F6DA 2CVKA 2VD0A 2JU5A 1FO5A 5J9BA 3LG6A 3FZ5A 1U3AA 3VURA 4RUVA 3KIJA 1MDIA 4F03A 4O7HA 4BVYA 6GSTA 1TU8A 2IMIA 5HFGA 1GTAA 2R3XA 4BPYA 3KJYA 2OE3A 4KDXA 5AISA 4K9ZA 3QR6A 5CRGA 3C8EA 5F07A 1S3DA 1Z7PA 2DJ3A 1SK0A 3HZ4A 4MZWA 3J7Yb 3ZL5A 1XPVA 1EEJA 1EP8A 5CNWA 1PL2A 2H71A 3TKSE 1G7EA 5ECRB 4MZBA 1UN2A 3EU3A 1TI3A 2FWHA 2LJAA 1H75A 1G6YA 3RAZA 3RPNA 2H01A 3LSZA 1KTEA 3L0HA 5D9VA 5G2ZA 4K8MA 1VF3A 2B7KA 1X5DA 1TP9A 1FOVA 1KBNA 5GSTA 6GSYA 5JCGA 2IMFA 2L4QA 1YQ1A 2F3MA 3WT2A 4PQ1A 2XC2A 3G7IA 3GRXA 1MD3A 3EU4A 4PXOA 4PQHA 1H4OA 1KEBA 4XRAA 3WT1A 4POMA 5IIZA 5DJMA 4MJCA 1OE7A 2MMNA 1GUHA 4J56E 3TJFA 4POBA 1WOUA 1O6JA 1W4VA 2NBSA 1XVWA 2YANA 3ZVJA 2YV7A 3IE3A 2H6ZA 2BMXA 4NXIA 2I1UA 5ECSA 8GSSA 2DJJA 4QQ7A 3KXOA 1TK5B 1WPIA 1ERUA 5F06A 1HNBA 3FY7A 3VI7A 4WETA 2J9HA 3HCZA 3H8QA 5ENUA 1XWGA 2H30A 2ZUPA 4IJIA 4AJ6A 3KP9A 4HZ4A 5D9TA 1PQNA 3APOA 2B7JA 1K0DA 5COHA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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