2JSZ | Genus

Total Genus 47

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	47
sequence length	167
structure length	167
Chain Sequence	MAEITFKGGPVTLVGQEVKVGDQAPDFTVLTNSLEEKSLADMKGKVTIISVIPSIDTGVCDAQTRRFNEEAAKLGDVNVYTISADLPFAQARWCGANGIDKVETLSDHRDMSFGEAFGVYIKELRLLARSVFVLDENGKVVYAEYVSEATNHPNYEKPIEAAKALVK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	Probable thiol peroxidase
publication title	Reversible conformational switch revealed by the redox structures of Bacillus subtilis thiol peroxidase pubmed doi rcsb
source organism	Bacillus subtilis
molecule tags	Oxidoreductase
total genus	47
structure length	167
sequence length	167
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2007-07-17

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF08534	Redoxin	Redoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	2jszA00

1ERTA 2N5AA 1Z7PA 1FVJA 3FEUA 4EDZA 4IN0A 3E3EA 4L0UA 2F8AA 2KOKA 4IJIA 3D21A 2R6KA 1X0RA 3VK9A 1FAAA 1O6JA 3IV4A 4EDYA 3D5JA 2HFDA 1YF1A 4POBA 2IMIA 2JZSA 4TKYA 1JZRA 1QFNA 4MPGA 1GSSA 2MYGA 4YAVA 3C1SA 4RUVA 5JCGA 2YWMA 4OMVA 5IMFA 1AQVA 3Q6OA 3TRPA 1XWKA 1V58A 3QAVA 4DSRA 4TR4A 5HR2A 3BOAA 4J56E 3TB2A 1VRSD 3TKRA 4O5RA 4TOPA 1WJKA 5CP1A 5CO3A 2B7JA 5D9XA 2VCVA 4POLA 2DJJA 2I9HA 3FHKA 2O89A 4IHUA 1YZXA 3M9JA 1X9MB 4BWSA 2VIMA 2H30A 3G9BA 4YQMA 2VUPA 4GTUA 2NBSA 3CSHA 4K7OA 2GSSA 2JZRA 1PA3A 1XW6A 5IM9A 3EINA 1AAZA 3DIEA 4IP6A 2XBIA 2AAWA 2GQKA 4NMUA 4N0VA 3NZNA 1TI3A 18GSA 3UBKA 3A3TA 3DKSA 1QK8A 2E7PA 4QQ7A 3I69A 1HD2A 1H75A 3L0HA 1ZZYA 5ECPB 3QD9A 4HQSA 3L9VA 3ZLPA 5FT3A 1W89A 5G5FA 1DE2A 3QAGA 1TK5B 3TUEA 5CRHA 5ECKB 3GX8A 1SJ6A 4OFNA 2PERA 5JCUA 3FYGA 4V1Ag 13GSA 3EC3A 2IMEA 2GS3A 3DRNA 1A0FA 2I4AA 1M2DA 2H76A 2F9SA 2QC7A 4IQAA 2KUCA 3H93A 3SBCA 5F07A 4HOJA 2OE3A 1T1VA 1G7EA 1VF2A 1U3AA 2QGVA 3MAKA 2DMLA 4BVXA 3CYNA 2RM5A 3US3A 2OE0A 1K3LA 1V40A 3C7MA 5COHA 2GDRA 2RM6A 4HI7A 3DYRA 4HU9A 2H1DA 4N10A 4KGIA 4K0NA 1XPVA 2ES7A 3BBYA 2JZTA 2OACA 3VWWA 2GSTA 1MTCA 4NWYA 1M2AA 1K0OA 2YV7A 2IMKA 1TU8A 6GSWA 4CDOA 2YJHA 3GNJA 4KSMA 3HY2A 5ECOB 1SL2B 1HYUA 3EU4A 4K0GA 2EIOA 2C3NA 3EE2A 2K9FA 1B4QA 2VLVA 4I2UA 2V6KA 2VO4A 2DJ1A 3TRQA 2V1MA 4JEDA 3L9SA 2B3SA 4JE1A 3IBHA 3ERFA 3C71A 1YF0A 4KH7A 4MH2A 3GURA 1XCCA 1URMA 2FHEA 1OYJA 4I8BA 5C00A 3G7JA 3LYPA 1O8WA 4KB3A 2YZUA 1O73A 2TIRA 1EV9A 1I5GA 1PQNA 5F8BA 2K6VA 4KDUA 2REMA 1PMTA 1XWGA 2X64A 1S3AA 1WWJA 1TDIA 4ML1A 3C73A 3APOA 3FZ4A 1MDIA 5E4WA 6GSTA 4KDXA 3M3MA 3U5RE 4FIWA 1TRUA 3ZYWA 3FKFA 2HNLA 3FW2A 5J9CA 2FWGA 2A2SA 2P5RA 4LMVA 2LNSA 1YEXA 3Q18A 5LD0A 1F6MC 3M1GA 1XVWA 3TJFA 2JU5A 1F3AA 1OE8A 1JZWA 1VF4A 2WRTA 4BL7A 5DALA 4IELA 4HDEA 3A2WA 4EVMA 5DAKA 2VCWA 2X99A 3Q74A 1ZCPA 1EGRA 2L4CA 4EC0A 2AUVA 5KEJA 1X5DA 2AHEA 5LNKe 2GQLA 2K8SA 4NPBA 3LJRA 4TXOB 2IFQA 3I9V2 1WRYA 2FA4A 3TJBA 1SYXA 1X5EA 1XWBA 2G2QA 5KN3A 2IIYA 5CNWA 5GSTA 1UVZA 2XPEA 2Z9SA 3K8NA 5IPGA 4PURA 1MD4A 1QQ2A 2C1YA 1GNWA 5DJMA 1OC9A 4XS4B 2CAIA 3IHQA 2M46A 5IOXA 4V2MA 2E2MA 2H74A 1CQGA 2WS2A 4IKHA 3FR6A 2F3MA 5ECLB 4EE0A 3E0UA 3ZREA 6GSVA 1EGOA 2C3QA 4NV5A 3BCIA 3TJGA 3NIVA 3C8EA 1VGLA 3GH9A 1FB0A 1DUGA 1EEMA 3TJKA 3QFAC 2J9HA 2FCHA 1SK0A 1FVKA 4ZB9A 5EVOA 2O87A 4KA0A 2C0DA 4RQRA 4MF7A 3FR9A 2H73A 3QPMA 4TRXA 3IK7A 2LEGA 2DIYA 4RQXA 1U88A 5ECIB 4WEYA 5JWQB 2H72A 3GA4A 1SENA 3RPNA 8GSSA 2FNOA 4BPYA 5D93A 2I3YA 3W8JA 2QKEA 5ECNB 4CW9A 1XWCA 2PVOC 4ECCA 1GUHA 3IRAA 5IQYA 3KZQA 1XBSA 2R5GA 2JSYA 3QFBC 3UBLA 4HS1A 4ZB8A 1FHEA 2P0GA 3DMLA 5GAND 1JHBA 1YKAA 4DVCA 3MDKA 5B7CA 3TOTA 1NW2A 1K3YA 4PQIA 1ERWA 3HVVA 1ZMAA 1EV4A 4GSSA 4RI6A 4ILFA 4GRFA 1JLWA 1BQ7A 2H1GA 2LRTA 2AB6A 1GSYA 4GQFA 1TRSA 3TKQA 1G0TA 5CREA 1T00A 4XS6A 2OBIA 3IK9A 2NVLA 1ERVA 1SYRA 6GSUA 2FWHA 1XOBA 2WDUA 1SU9A 2GZPA 1BYEA 1Z9HA 2HLSA 1UN2A 5G2ZA 1GRXA 1HNBA 4NV2A 4IBPA 4RI7A 3ZFBA 2IN3A 4GQCA 3IE3A 4GSTA 2HI7A 2C8UA 2GT5A 4I5QA 4HJMA 3HJOA 3ZMLA 5FHIA 1T4ZA 4MK3A 3VI7A 3PH9A 1T3BA 20GSA 4KE3A 4LA1A 3HXSA 5KN0A 3F3RA 3GIXA 1SKWB 1BG5A 1ACVA 4POMA 2FWEA 5EPFA 5JWOB 5IMVA 2H71A 4WR4A 2M80A 2F51A 1B4PA 3HDCA 2RUFA 3EURA 1PKWA 1PL1A 5IMZA 3I43A 5AISA 2GSQA 3QAWA 2OJLA 1TXXA 2CVDA 5IIZA 2CZ2A 1ML6A 1A23A 2CVBA 3UJ1A 5CRGA 1F37A 4MJEA 3APSA 2PPTA 3UEMA 2OA7A 2BMXA 5EL8A 3GKMA 4HEA2 4TVEA 3D22A 4GWRA 1AIUA 2TRCP 4DSSB 1T4YA 2LUSA 4O7HA 2LQQA 4HUAA 5CRDA 1T8EB 3GMFA 4GLTA 4GXZA 3HZ8A 4DSQA 3CTGA 5ECMB 1T7PB 1USBA 3F4SA 3ZFLA 2WULA 3TKPA 3HA9A 1KNGA 3QOUA 2R2JA 1QMVA 3CXGA 4XTSA 4ZILA 4V2LA 3ZL5A 1TKDB 3KH9A 5A4WA 1AC1A 4EXJA 1NHOA 4MZCA 2EIRA 2V6OA 2VL9A 4GCIA 5CRWA 4BWQA 2O7KA 3QR6A 3GRXA 3UIWA 3VLNA 4Q5NA 2PMTA 2R37A 1DE1A 1J0FA 3GH6A 2D2ZA 5ECQB 1FB6A 2LS5A 3DGQA 3GKNA 1ZGNA 2XPDA 4Q5QA 1WOUA 3F6DA 1TK0B 9GSSA 2ZUPA 4JR6A 1FG4A 2V32A 3TCOA 2F8FA 1TJDA 3FZ9A 1SKSB 1U6TA 2LQOA 2H1AA 3D0ZA 2DIZA 4X1UA 4ZBAA 3A2XA 5D9WA 3GL5A 4TW5A 2GSRA 1V57A 2CQ9A 4WETA 2MBTA 2YPMA 2FGXA 3DEXA 4PUAA 2VCXA 3FY7A 1K0DA 4MJBA 5ELGA 2DJ2A 4TXOA 4YQUA 17GSA 3TOUA 2VCQA 3GX0A 1YEPA 2MMOA 3QMXA 4HZ4A 2HRFA 1M9BA 3MSZA 3FR3A 3H4KA 1KEBA 1RW1A 4OWYA 4ZBBA 1VF3A 2PWJA 3VWXA 4XS4A 1TW9A 5F06A 3UARA 1U3IA 4LL1B 4E8EA 5DBQA 1NSWA 1O85A 2AV4A 2L59A 5DCHA 3GYKA 2PBJA 3QCPA 4I2TA 4ZL7A 4MH3A 6GSYA 1GL8A 5GSSA 2PN8A 3RBTA 1BJXA 4K6XA 5IO2A 2IMFA 1G7OA 2WGRA 3CSIA 1E2YA 3CMIA 3RHBA 1PSQA 1M0UA 2NDOA 3A2VA 4PXOA 4F0BA 4MJAA 4L5LA 1IYHA 1GWCA 4MF6A 1E6BA 4YH2A 5EY6A 2HYXA 2LRCA 4Q5RA 3DXBA 1TK8B 2LNTA 2VL2A 2X8GA 1THXA 2DLXA 3L78A 4BA7A 1G6WA 4EUYA 1O7UA 1GSQA 3KM6A 3GSTA 3F6FA 2IPAA 3N5OA 3WYWA 1GUMA 1H4OA 3DVXA 2YP6A 1YY7A 4BVYA 4K2DA 3APQA 5J41A 2A4VA 4OFMA 5L71A 1GTAA 1OE7A 1TRVA 3C1RA 5DJLA 1N8JA 3GTUB 3UAPA 1EP7A 4MLYA 3D4TA 4J57E 5G5EA 1TTZA 2MMAA 1SJZA 2B6MA 2C0FA 2RUEA 4KX4A 5G30A 3LG6A 5D73A 5GAPD 1A2MA 3U6VA 3ZIJA 2GT6A 1U87A 1EOGA 3R2QA 3FK8A 2V2GA 5HFGA 4AF2A 3ME7A 5D96A 4K7NA 5JWRB 4J2FA 1SD8A 1Y25A 2FA8A 2KP2A 4F9ZA 4TR0A 3IAM2 2K8VA 1GTIA 3L4NA 1PD21 1TI1A 2RLIA 4HZ2A 3P90A 4LMWA 2ON5A 2HSYA 3GN3A 2C80A 3KIJA 3FZ5A 1J9BA 3H8QA 1S3CA 4N11A 1PX7A 3KGKA 2OE1A 5HFKA 3M0FA 4F82A 2H0GA 2C3TA 1Z3EA 4KNDA 1PGTA 3ZVJD 1XIYA 3O6TA 2B5XA 2FLSA 1O8XA 1XW5A 3BCKA 2RIIA 2MBSA 4G19A 4XRDA 2NTOA 2O85A 1Y6EA 4K7IA 2NPBA 1QUWA 2OADA 3FZAA 5B8BA 3HYPA 5AIVA 4ZL8A 1RK4A 3J7Yb 4LLRA 1GSUA 4F2IA 2P31A 2CAQA 3ZITA 4JU5A 4DEJA 2FY6A 5D9TA 3LFLA 4FYCA 2R4VA 1NHYA 2EIQA 4ML6A 3WT2A 2GVPA 4DSSA 5LCZA 1ABAA 1EZKA 4MABA 4XIHA 1C72A 1GNEA 2VM2A 3CRTA 4WR5A 4OO4A 2LJAA 2KP1A 2C4JA 3ZMKA 2VOCA 5ECHB 2YWOA 2YV9A 3FRCA 1CQHA 3MNGA 4KCEA 4AJ7A 3KCMA 5DCGA 1MDKA 1JZOA 2VD1A 3LXZA 2ZNMA 4ZIJA 1BAYA 3P2AA 2LKUA 1K0CA 3HCZA 1OVNA 4MPFA 1DSBA 1NM3A 3F0IA 2DBCA 1UA5A 1AXDA 4KSOA 1GTUA 4N30A 2YJ7A 1B9XC 2E0QA 4FYUA 3RDWA 2FUG2 3BD2A 19GSA 4JRRA 2HZEB 1M9AA 3HVXA 4QL7A 3D6IA 1UC7A 3KJYA 2CX4A 4G10A 5KN1A 1Q4JA 1X5CA 3UMAA 5J4UA 2H1BA 1K3OA 1JLVA 1WE0A 2KHPA 3VPTA 2YWIA 1THOA 3LEFA 4I97A 5AGYA 2IMDA 1SD9A 3ISOA 3M8NA 5GZZB 4IW9A 1SK2A 3GV1A 3E9JB 5G31A 2HRNA 4PGTA 5IPHA 3UVTA 3IPZA 2E2GA 1K0BA 1ZL9A 3G7IA 2YN1A 5DDLA 1ILOA 4PQHA 1YJ6A 2V41A 6GSSA 4EL1A 2L6CA 2DC5A 1HQOA 3GUSA 5AIXA 2L6DA 4QL9A 1GSEA 2MMZA 2AYTA 3CTFA 3F8UA 2L5LA 4IS0A 3KXOA 1QXHA 2GZYA 2JSZA 4KUNA 2XHFA 1EWXA 1JFUA 2M72A 4NXIA 2ALBA 4OCEA 3S9FA 4MP4A 1ST9A 1VF1A 4F03A 4GF0A 5IMDA 2H01A 1GLQA 3VWUA 4JBBA 2VD0A 1PL2A 1WPIA 2EC4A 2H75A 1Q98A 3TRXA 2HE3A 4I6XA 3ERWA 2JADA 1AQXA 2ON7A 5D9VA 1B9YC 1XW9A 4FYBA 4WXTA 2B5YA 1X9WB 3GHAA 3TDGA 1XWAA 1F3BA 2P5QA 3J7Yk 2MMNA 5A5KA 1OKDA 2WCIA 2GQMA 5CYYA 1SJIA 2I81A 4POKA 1DBYA 2H6XA 3HKRA 3WD6A 1MD3A 2PUKC 1TRWA 1R26A 1GTBA 4TR1B 3NOFA 2YANA 2LJRA 4K9ZA 5IO0A 1GP1A 2B5EA 5C04A 3HD5A 1ZYEA 3N9JA 5B8AA 4K8MA 2XC2A 3ZZXA 3KTBA 4LL4B 2IJYA 5HR0A 2PVQA 1FW1A 3F3QA 4MDCA 1XFLA 3GKKA 5H5RA 3VWVA 3L9UA 4AJ6A 3LGCA 3LWAA 2GGTA 1SL1B 4MZBA 1TOFA 1R5AA 4Q5FA 4D73B 4MMMA 2L57A 4KCAA 2GTUA 5F0GA 4EO3A 4WKWA 3GTUA 4OD7A 3TKSE 5ID2B 5ABRA 14GSA 2TRXA 1OC3A 3WT1A 2GLRA 2HSHA 4MCUA 1M2BA 3TGZA 1XXUA 3H1NA 1PKZA 1GH2A 4HU7A 2HXKA 3CSJA 2YOIA 4WBJA 2H6ZA 4O32A 4FH8A 2VCZA 2VL3A 3TKSC 5J9BA 4PNFA 2I1UA 5E59A 3KTLA 3CBUA 3EMXA 3GL3A 4ISDA 4ZBDA 1SK1A 7GSSA 4H86A 3VFIA 5H5QA 1YQ1A 4K1FA 3DVWA 2VLTA 1ON4A 1A24A 1R5PA 3UOMA 3MWHA 3UVHA 3QDNA 2WFCA 3GFKA 2YNXA 3LYKA 3WGEA 5ECRB 3GKXA 2J23A 4ZL9A 3ZRDA 4F0CA 3ED3A 2AJQB 4PQ1A 1YDKA 2H66A 4YAPA 5ECSA 5IMAA 4ECJA 5HR3A 3RHCA 3OR5A 1RQMA 3PR8A 2YWNA 3F4TA 3LQ7A 2QSIA 1FOVA 2PGTA 3F63A 4ZB6A 2X8HA 2DMMA 4ID0A 1Z5YE 3EU3A 1ERUA 2K18A 4MA9A 1MEKA 1PX6A 5ELAA 1G6YA 4XS1A 4TN8A 5HR1A 5FWGA 3G7YA 4WBRD 1GUKA 2MZCA 1Z6MA 1PRXA 1I9DA 4N0ZA 4PNGA 5F05A 1S3DA 1A8LA 1LU4A 3AY8A 4Z7XA 4JR4A 2LTKA 1ZYQB 4JZQA 1SL0B 3D4MA 2H8LA 3EMPA 1LJRA 1KTEA 1ZOFA 2WB9A 1J08A 2FD3A 3V1WA 4L5OA 3LORA 5CAXA 3IC4A 4IP1A 2CA8A 4XHMA 1AQWA 2JL4A 1HNAA 3F9UA 3DD3A 3IXRA 4V2NA 5A4UA 3W6GA 3BJ5A 1PN9A 11GSA 1X9SB 3JCML 4P3YB 4ZXGA 1EOHA 5G1LA 1TP9A 1B48A 1R4WA 2PU9C 3IR4A 1A2JA 4EKZA 2HZFA 2HZEA 3CRUA 2H19A 3SWLA 4V1Ap 1A8YA 2OBKA 4O92A 3WGXA 4IGJA 4G2EA 4G9HA 1AUCA 4AJ8A 1V9WA 2WJUA 3EWLA 6GSXA 4NAXA 5HQPA 3O3TA 3VPQA 4XRAA 3KD0A 1A2LA 3HJPA 2BJXA 2CV4A 5HFIA 2CVKA 4HJ2A 3KP9A 4L0WA 4MF5A 2VLUA 1A0RP 2N5BA 2H0IA 5A4VA 1M7TA 3ZTLA 3PINA 4NHZA 3A5WA 3ZIVA 1R7HA 1YKCA 1Z7RA 5H5SA 2CZ3A 3P7XA 3TJJA 2B7KA 1SKRB 2BTOT 3KP8A 4YQVA 3VURA 2VCTA 4IJ3A 1K0AA 5G1KA 5IOWA 16GSA 1TU7A 2XBQA 2LV3A 1LBKA 4ULXA 2DJ3A 3LXTA 2YCDA 2LSTA 2L4QA 5DQYA 1KBNA 1EP8A 1OKTA 2A2RA 5DVBA 1N2AA 4KDYA 3ZVJA 3HJMA 2OKAA 2C0EA 4FO5A 4AGSA 2FWFA 2GZZA 1HNCA 1EEJA 2H6YA 1F2EA 1K0MA 5DQSA 4HQZA 3W8SA 4IQ1A 4MZWA 1BX9A 2LJKA 3DWVA 1OC8A 3RPPA 5B6MA 2CT6A 5J5NA 3KH7A 3TKSA 2ZCTA 2DSAA 3VI5A 5B6NA 10GSA 3PGTA 1Z6NA 12GSA 2IL3A 4PX1A 4WF4A 3P8WA 5INYA 1JZDA 2N5FA 3KMOA 4TR1A 3GSSA 1XVQA 4KAEA 3IAS2 3RAZA 4L8EA 3IOSA 1WMJA 3ERGA 3IDVA 3Q19A 4OO5A 2IWTA 3M9KA 1AW9A 3KEBA 4KW6A 2H70A 3F4RA 1WIKA 1GSFA 1V98A 2WZ9A 4ACSA 3WGDA 5AN1A 2B1KA 1W4VA 1V2AA 4WF5A 1F9MA 1B8XA 3KMNA 4XCSA 1MDJA 22GSA 1O81A 3H79A 4TXVA 1XZOA 3LSZA 5JCWA 1OAZA 4TR3A 4D73A 3I6AA 3EYTA 5ID2A 2H0HA 1GSDA 3HHVA 2C0GA 1FO5A 2HT9A 5DALB 3IA1A 3O76A 4NHWA 3HVSA 4IVFA 5DAKB 3ME8A 4E8HA 2G0FA 4ECBA 4GSNA 1GLPA 2DJ0A 2O8VB 1XOAA 2YZHA 2CX3A 1BEDA 1IYIA 1QGVA 4OCFA 4PUFC 2X8CA 2KLXA 2IFQB 2VL2C 2JACA 2VM1A 4ECIA 5D8IA 3EVIA 4X0XA 2LRNA 1GULA 4CHSA 2L5OA 2VAFA 1OC9B 5J3RA 1M99A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2JSZA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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