3GKXA

Crystal structure of putative arsc family related protein from bacteroides fragilis
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
117
structure length
117
Chain Sequence
MKTLFLQYPACSTCQKAKKWLIENNIEYTNRLIVDDNPTVEELKAWIPLSGLPVKKFFNTSGVVYKELKLSSKLPTMTEEEQIALLATNGKLVKRPLVVTERFVLVGFKPEEWEKLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of putative ArsC family related protein from Bacteroides fragilis
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Bacteroides fragilis
molecule keywords Putative ArsC family related protein
total genus 31
structure length 117
sequence length 117
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03960 ArsC ArsC family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gkxA00
1JLWA 2C0DA 4HOJA 5IQYA 5B8AA 2NVLA 2DBCA 3HVXA 4MMMA 1T8EB 3CXGA 1FG4A 3ERWA 3ZLPA 4RUVA 5IMVA 1G7EA 4KCEA 4ECIA 5J9BA 1MEKA 1AXDA 1XVWA 1M99A 2HT9A 2O7KA 1MTCA 4KE3A 5KN1A 5CP1A 4YH2A 1O81A 4PNFA 4NHWA 3PINA 10GSA 3F63A 1TU7A 1SYXA 2R2JA 3JCML 1SJZA 1GSFA 3QAWA 2GZPA 4K7OA 1BEDA 3C7MA 5J9CA 4OCFA 2H1AA 4X0XA 4L5OA 1PQNA 4IJ3A 3RAZA 1E2YA 3UEMA 1NSWA 3NZNA 3PH9A 2DIYA 2X64A 4PURA 4ZL7A 2VCVA 3DVWA 1Y25A 4BWQA 2GGTA 5FHIA 4L5LA 1F6MC 4TR0A 1A0RP 2DLXA 2P5QA 3P7XA 3KTLA 2I1UA 2KP2A 3Q74A 4F9ZA 3M9JA 3O3TA 1BYEA 2TRCP 1XZOA 2OACA 4D73A 2GT6A 4TRXA 5LD0A 2J9HA 2H6YA 3FRCA 3I9V2 1QMVA 4ZIJA 1A8YA 3ME8A 3OR5A 3EU3A 2F3MA 3GKXA 5AGYA 2FHEA 2G2QA 5F07A 4MH2A 4POKA 1A2MA 1PX7A 5ECIB 5CRWA 3F0IA 3ZVJD 4EL1A 4K8MA 5E4WA 1ILOA 3BOAA 1WPIA 2NTOA 3TUEA 1U3IA 3QMXA 5COHA 1ZZYA 3HDCA 4X43A 1OAZA 2DSAA 3DRNA 3KP8A 1UC7A 6GSSA 4HU9A 3HD5A 2WRTA 3IC4A 2QKEA 1O8XA 2H1GA 2B5YA 4N0ZA 5DAKA 3GTUA 1TOFA 2KUCA 2P5RA 4HQZA 3KM6A 1V58A 4KUNA 4IVFA 5GZZB 4ISDA 1AQWA 2H0IA 4RI6A 4IW9A 4EDYA 2BMXA 3VK9A 3L4NA 3WYWA 4I2TA 1F3AA 2B1KA 2OE3A 3GKNA 2WFCA 5ECOB 3IBHA 2L59A 2VL2A 3FZ9A 5CREA 3ZL5A 2H70A 1XXUA 3IR4A 3E0UA 4MLYA 3QDNA 1SYRA 2E0QA 1VRSD 1Z9HA 5LCZA 1KEBA 5FWGA 1HNBA 3RPNA 1G7OA 2PGTA 5JWRB 4K0GA 2JADA 1JHBA 2OE1A 2IWTA 3TRQA 1LU4A 2CAIA 3GKKA 4ZL9A 2AHEA 3P90A 1K3LA 3H4KA 2LJRA 2F8AA 4HJMA 2PN8A 2VLVA 2JZTA 1JZOA 3EINA 5D96A 5INYA 4ULXA 1WP0A 2EIOA 3D6IA 1GUMA 2LRCA 5JWQB 2XPEA 3GX0A 1GSQA 3DMLA 3VWWA 3QFAC 3TRPA 3F8UA 1GRXA 4PUFC 3P2AA 2O87A 4FIWA 3QR6A 3D21A 2NBSA 1R5PA 1K0DA 5ID2A 4ZB6A 2FY6A 3N9JA 5A4WA 4HZ4A 5C00A 3TDGA 5H5RA 2IMFA 2MMNA 2LRNA 3KJYA 4Q5FA 4KAEA 3MDKA 3GNJA 19GSA 1SD8A 1AIUA 1ZMAA 4BVXA 5G30A 2ES7A 4HJ2A 5DCGA 4IJIA 2REMA 5GSTA 5JWOB 4XTSA 5G1LA 3VFIA 1M2AA 2I3YA 5GAPD 1VF1A 2IMEA 1ERWA 1YKCA 3D22A 2GT5A 2YWMA 5ECNB 1FAAA 4JR6A 4PQ1A 2JZSA 2DIZA 1PGTA 1AC1A 3TOUA 2HNLA 2DJ1A 5ELGA 3F4TA 1B4PA 4I6XA 1Y6EA 1RW1A 2IMDA 1TJDA 1TXXA 4WF4A 4F82A 3TJBA 1AQXA 2GZZA 4XS6A 1ON4A 2FWEA 5DVBA 2L6CA 1PKWA 5A4VA 3BCKA 4AJ6A 2ALBA 3A2WA 16GSA 2YOIA 3GN3A 1M2DA 1Z7PA 4TR1B 1JFUA 4ZL8A 4JBBA 1XOAA 2KOKA 4DSSB 3LG6A 3N5OA 1WJKA 1WWJA 3ZMLA 4WR4A 5L71A 4KGIA 5D8IA 3DKSA 3HHVA 1FW1A 4EVMA 5KN2A 1DUGA 5B7CA 1J08A 1SK1A 1HNCA 2YWOA 3QAGA 3KD0A 3FKFA 4MPFA 2H75A 4WKWA 3GSTA 5HFGA 2CVKA 4KDYA 1YEPA 4K1FA 3DWVA 1A0FA 5HR1A 1YY7A 2M72A 2B7JA 1XW5A 4FO5A 1Q98A 12GSA 1SD9A 1PSQA 4EO3A 2WZ9A 3TKSC 1GSEA 3WGXA 1H4OA 1ERUA 2K8VA 2X8CA 1FOVA 4O92A 1TK5B 1VF3A 4LL4B 3M8NA 3CTFA 4G10A 2VM1A 4PXOA 5F0GA 4MJCA 3ED3A 14GSA 3DXBA 3APQA 2HSHA 5D9WA 1B4QA 5EVOA 1Z6NA 5HFKA 2OBIA 3R2QA 3UMAA 5E59A 3DIEA 4XIHA 1GUKA 3TKQA 1BG5A 5KEJA 2PMTA 4OCEA 2WULA 2LQQA 3Q18A 1V57A 2I4AA 4KCAA 3H79A 3TKRA 2LRTA 4J56E 4X1UA 2GTUA 1TRUA 2MBTA 5DCHA 3G7IA 2EC4A 2PPTA 3I6AA 4YQVA 3WGEA 1YKAA 4G2EA 4GWRA 5F05A 1HYUA 2PUKC 1WMJA 1EOHA 3UOMA 3A2VA 1Z7RA 2P31A 2WDUA 5HQPA 3HZ8A 4LLRA 2GSTA 1TRVA 3VI7A 3C1SA 3QFBC 2N5FA 2P0GA 1OVNA 5HR3A 4ZBBA 2N5BA 3CBUA 1R4WA 2FWHA 1PKZA 1K0OA 2M80A 4YQUA 3G7YA 1XWBA 2FUG2 6GSYA 3VWXA 1FO5A 1HQOA 2YJ7A 4E8EA 3KEBA 2YNXA 3HY2A 6GSXA 1A24A 4FYUA 2K18A 4KDUA 1JZWA 1ZGNA 2HYXA 3J7Yk 1WRYA 1SENA 1FHEA 3O76A 1Z5YE 2LQOA 4KX4A 4MF5A 4TKYA 4IELA 2B5EA 1V2AA 3FY7A 1RK4A 3E9JB 2F9SA 4ML1A 4MJAA 4OFNA 1YDKA 2H0HA 3ZFBA 2V6OA 1CQGA 4FYCA 4I2UA 4EF0A 3FZ5A 3H8QA 3DD3A 2C1YA 3WGDA 3ERFA 5DJMA 3IK7A 5J41A 2E2GA 1M9AA 3GMFA 1AUCA 3EMXA 5A4UA 2DJJA 4MF7A 3DGQA 5DJLA 4GQFA 4G19A 4YAVA 2OE0A 1K3OA 3KTBA 4ECBA 3SBCA 3VPTA 2H74A 1M9BA 1XW6A 2PERA 1AW9A 4F03A 1T7PB 3CMIA 2FA4A 3TKSE 2DMMA 2PBJA 3FZAA 4QQ7A 4XS4B 3EWLA 3HZ4A 4KNDA 4E8HA 3ZREA 4KSOA 4GF0A 1K3YA 2CT6A 3BD2A 2K9FA 2H19A 4IP1A 4HDEA 1SKRB 4MJBA 4V1Ap 2HFDA 5CAXA 5IPHA 1A2JA 1GUHA 2IL3A 4EXJA 2AJQB 4CW9A 1Z6MA 1V98A 2XBIA 5DBQA 1GTUA 2MMZA 3IE3A 1W89A 6GSWA 1X9MB 1H75A 3FEUA 2H76A 4PQIA 4XCSA 2QGVA 1FVKA 2HLSA 1SJ6A 2K6VA 1GTIA 1GSYA 3HVSA 4IS0A 5G31A 1A23A 1XVQA 4TVEA 3BCIA 1LBKA 5ECKB 8GSSA 2CZ2A 5LNKe 4OMVA 5G2ZA 2RUFA 4MA9A 5AIVA 3HCZA 2H1BA 3L9UA 1T1VA 2HZEB 5D73A 1G6YA 2VO4A 1TK0B 4GLTA 3L9SA 2OA7A 1ZCPA 2IN3A 1GSDA 4GQCA 2FNOA 2GSRA 1WE0A 2MZCA 5B8BA 1YF0A 1O7UA 4HEA2 4F0BA 4NV5A 4EUYA 4TR3A 3F9UA 5JCGA 4NV2A 4TR1A 4TR4A 2XBQA 3LXTA 3V1WA 1XOBA 1QXHA 2C4JA 5ECQB 2LUSA 4WEYA 4MZBA 4BL7A 2DJKA 4DSSA 1Q4JA 3D0ZA 2ON7A 3IRAA 4POLA 2R3XA 3P8WA 3WT2A 2VD1A 4XS1A 1AQVA 1VF2A 1XPVA 4O5RA 3FHKA 4AJ7A 3QPMA 3U6VA 3ZVJA 3CYNA 3CSHA 1ZOFA 5ABRA 1W4VA 1OKTA 1EOGA 1F37A 1K0AA 1BJXA 1K0MA 3VPQA 4GSNA 2YZUA 2GSSA 2H8LA 3TJFA 1N8JA 3TGZA 5DQYA 1F9MA 2DC5A 3RBTA 2CAQA 4L8EA 5DALB 2GSQA 3I43A 5ECMB 1K0CA 2YP6A 1EP8A 1GLQA 2RLIA 1VGLA 2ZUPA 3IDVA 2VLTA 3C8EA 4NWYA 4IN0A 4GXZA 6GSVA 5D9XA 2AAWA 1MD3A 3WD6A 2GLRA 1VF4A 2C0FA 3EU4A 2EIRA 3M3MA 4Q5QA 1IYHA 2V41A 2YANA 3FR3A 1ZL9A 1PL2A 5GSSA 3HJPA 3GURA 3H93A 1GP1A 1B8XA 3UJ1A 1TTZA 1XBSA 3KP9A 3KH7A 1ZYEA 2R4VA 3RHCA 1QUWA 5IMAA 1GWCA 4HUAA 1PRXA 2GQLA 2XC2A 3G9BA 3TB2A 20GSA 2WJUA 5IO0A 2FGXA 5IOXA 2DJ3A 4KSMA 2VUPA 1T4YA 4OO4A 3LEFA 3APSA 2R37A 3EYTA 3LJRA 3HYPA 5CYYA 1T00A 2I9HA 2H0GA 2OJLA 5B6MA 2R5GA 4OD7A 3UVHA 5D9VA 5G5EA 4FH8A 3GX8A 3FK8A 4PX1A 4ZBAA 3TJKA 1SL1B 1XIYA 3VLNA 1THXA 1XWKA 18GSA 2GDRA 4O32A 1EP7A 4OFMA 2DJ2A 2NPBA 4HZ2A 3ZTLA 2AB6A 1GSUA 3ZMKA 5HFIA 1EZKA 1I9DA 2PVQA 1TRWA 2FWGA 4I8BA 5ECLB 2HZFA 1TP9A 3BJ5A 4POMA 2B5XA 4JZQA 3PR8A 4KH7A 3ZIVA 2YN1A 2HE3A 3EURA 4KA0A 4Q5RA 3ME7A 2YCDA 2CVBA 4CDOA 4L0UA 2JL4A 4MJEA 2GQMA 2TIRA 3GL5A 4ECCA 2CQ9A 1PD21 4MH3A 5AN1A 3GYKA 2H6XA 3QAVA 2QSIA 1BX9A 4GSSA 3HXSA 5DDLA 2V6KA 4MK3A 2HXKA 2HRFA 2M46A 1K0NA 13GSA 3CRUA 4MPGA 1MDKA 5ID2B 1C72A 2FLSA 1AAZA 4EE0A 3KCMA 1NHYA 2MMAA 2O8VB 4XS4A 3UARA 2G0FA 4EDZA 4LA1A 4K7IA 1XCCA 5IPGA 3IK9A 1OE7A 1UVZA 1YF1A 4K7NA 3CRTA 1U88A 2FWFA 4NHZA 3TKSA 3GV1A 1GLPA 3KH9A 1N2AA 2IPAA 2GS3A 3CSJA 3CSIA 4L0WA 1HD2A 2RIIA 2VM2A 5IMCA 4MABA 3L9VA 2A2SA 5AISA 4KW6A 4IQ1A 2JSYA 2HRNA 2BJXA 4LMWA 2V1MA 3W8JA 5IOWA 3AY8A 1OKDA 4ECJA 4J2FA 5ECHB 1YZXA 5IIZA 1GULA 1THOA 1U6TA 1EWXA 2J23A 2C0EA 3Q19A 4MF6A 2CVDA 5ECSA 2A4VA 1EEJA 3ZZXA 1OYJA 2HI7A 2VD0A 4WBJA 1SL0B 2RM6A 2H66A 3M1GA 1OE8A 11GSA 3UVTA 4WR5A 4IKHA 2JU5A 5KN0A 5EPFA 2VOCA 1TW9A 1GSSA 3UBLA 2H72A 4NAXA 4V2MA 2HZEA 4TN8A 1CQHA 1TU8A 2KHPA 1SJIA 2H01A 1U3AA 2VCQA 2E2MA 3GIXA 4HI7A 1GTBA 2VL9A 1E6BA 2C3TA 3WT1A 2PU9C 3LSZA 1TKDB 3MNGA 2IIYA 3F4RA 3LWAA 2MYGA 2H73A 3RPPA 1WOUA 1B48A 1MDJA 1DE1A 1O6JA 1U87A 1YQ1A 1X9SB 4GTUA 6GSTA 1O8WA 2H1DA 1QK8A 2LNTA 4PQHA 4HS1A 4ZB9A 1BAYA 4BVYA 3HKRA 17GSA 1BQ7A 2L4CA 3L78A 1R5AA 3HA9A 1FVJA 4FYBA 2FCHA 1NM3A 3US3A 1XFLA 4YQMA 3IAS2 3M0FA 3S9FA 1X9WB 2WCIA 3EMPA 2LEGA 4POBA 3KMNA 2N5AA 2A2RA 3KIJA 2OKAA 2IFQB 3GRXA 3LGCA 1X5DA 1EGOA 1NW2A 4K0NA 4TXOB 2L57A 4EC0A 2H71A 3IOSA 5IMZA 1SKSB 2VCXA 3KZQA 4MZCA 4P3YB 2VCWA 2JZRA 2CZ3A 5DALA 3D5JA 2PVOC 4MDCA 1PX6A 3GH6A 3MAKA 4JEDA 4OO5A 4YAPA 3D4TA 4N0VA 3ZIJA 5HR0A 1A2LA 4TOPA 2L6DA 5JCWA 3HVVA 1F3BA 1ACVA 4BWSA 5J4UA 3TJGA 1R7HA 1OC9B 3EVIA 2C8UA 2K8SA 4IGJA 3GUSA 4AF2A 1A8LA 3L0HA 2LJKA 5ECRB 3VWVA 5IMDA 4IHUA 2TRXA 4AJ8A 3VI5A 3HJOA 1FB0A 2MBSA 3IXRA 1KNGA 2H6ZA 2ON5A 3O6TA 1DSBA 2B6MA 4GSTA 3RDWA 1X5CA 3Q6OA 1ABAA 4RQRA 1M0UA 1DE2A 1T4ZA 3GFKA 3VURA 2VL2C 4HQSA 1Z3EA 1XWAA 5G1KA 4Z7XA 5CNWA 5H5SA 2LTKA 1V40A 3F6FA 4IBPA 1B9XC 3KMOA 2YPMA 3GKMA 2B7KA 2AUVA 3LXZA 2ZNMA 5CRGA 1RQMA 2QC7A 3DYRA 3LYKA 5IMFA 1ML6A 2JSZA 2DJ0A 2YWIA 4BPYA 4N30A 4V2LA 1PA3A 1G0TA 1JZRA 3F4SA 1PL1A 1HNAA 2C3QA 1USBA 2LKUA 4DSRA 2LJAA 5CO3A 1EEMA 2CA8A 1GNEA 3C73A 3QD9A 4KDXA 3IAM2 3APOA 2WB9A 5EL8A 5HR2A 3GL3A 3IPZA 2R6KA 1ZYQB 4H86A 2C80A 2JACA 3NOFA 1S3DA 1SK0A 4XHMA 3A5WA 3TJJA 2VL3A 3LYPA 2CX4A 1MDIA 1TDIA 3F3QA 3UIWA 5D93A 1ST9A 1PN9A 4JE1A 4D73B 4TXVA 2LS5A 4ILFA 1QGVA 3UBKA 4G9HA 1XWCA 1WIKA 1KBNA 2I81A 1G6WA 4OWYA 3TOTA 2X8HA 3F6DA 2O89A 1ERVA 5G5FA 5AIXA 3KXOA 2L5LA 5CRDA 4N11A 4Q5NA 2BTOT 2KLXA 1KTEA 3A3TA 1S3CA 3LQ7A 3NIVA 3W8SA 3FZ4A 1TRSA 4XRDA 4MCUA 2OBKA 4WXTA 2EIQA 2WGRA 3H1NA 4NMUA 1GL8A 3GA4A 2OADA 2VIMA 3G7JA 3MSZA 1SL2B 3CTGA 4ZXGA 2Z9SA 2B3SA 3K8NA 1TK8B 5DQSA 4K9ZA 2LV3A 2FD3A 5CRHA 1JZDA 2DMLA 4ACSA 4KB3A 2PWJA 3HJMA 3FR9A 1JLVA 2KP1A 1FB6A 2HSYA 3F3RA 2H30A 2ZCTA 2YJHA 4WBRD 4K6XA 3PGTA 5DAKB 3GTUB 4F2IA 5F8BA 7GSSA 3UAPA 1NHOA 2VLUA 2YZHA 1LJRA 1GH2A 2FA8A 1URMA 2VCTA 1M2BA 4ID0A 3C1RA 4J57E 5IM9A 5C04A 1SK2A 1UN2A 2RUEA 1J9BA 2XHFA 2WS2A 3RHBA 1V9WA 2X8GA 4O7HA 4MP4A 1IYIA 3GSSA 3DVXA 4JU5A 2YV9A 5H5QA 4ZB8A 4K2DA 3BBYA 3IHQA 1TI3A 3UL3A 1F2EA 1QFNA 3MWHA 3ZRDA 3TRXA 2X99A 1O73A 1GTAA 1PMTA 4NXIA 4CHSA 5ENUA 4ML6A 9GSSA 5EY6A 4GRFA 2LNSA 3FYGA 3E3EA 3I69A 4HU7A 1XW9A 2C3NA 4ZBDA 5GAND 4F0CA 1MD4A 4IQAA 4PUAA 3QCPA 5JCUA 6GSUA 2IMIA 4JRRA 1X0RA 2XPDA 4LL1B 4V1Ag 1OC3A 4RI7A 1J0FA 2MMOA 5J3RA 1S3AA 4DSQA 22GSA 2E7PA 2F8FA 3SWLA 3VWUA 4QL7A 1K0BA 2AYTA 3ERGA 4N10A 4PNGA 1UA5A 3QOUA 4I97A 3A2XA 3TKPA 5KN3A 3EE2A 5D9TA 1TI1A 2IFQA 2V2GA 4MZWA 4PGTA 2IJYA 4V2NA 2YWNA 4TXOA 1GNWA 1SKWB 4LMVA 3GHAA 4WETA 2LSTA 1DBYA 3IV4A 2RM5A 3C71A 2V32A 1XWGA 5FT3A 3LFLA 4BA7A 1QQ2A 3J7Yb 2GQKA 4DEJA 1I5GA 3LORA 4TW5A 1T3BA 2IMKA 2O85A 2AV4A 2VAFA 4NPBA 3FW2A 4AGSA 2NDOA 2GVPA 2L5OA 4EKZA 4XRAA 2B1LA 1YJ6A 3ISOA 1ERTA 3D4MA 3GH9A 1OC9A 1EV4A 4JR4A 3TCOA 3EC3A 3KGKA 3IA1A 4OFTA 3M9KA 4GCIA 2F51A 3ZITA 5ELAA 4QL9A 2D2ZA 1YEXA 2CV4A 1EGRA 5J5NA 4WF5A 4IP6A 2CX3A 5F06A 4I5QA 2L4QA 3ZFLA 3DEXA 5IO2A 4DVCA 2YV7A 1B9YC 2C0GA 1O85A 1M7TA 1OC8A 4RQXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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