3GKXA

Crystal structure of putative arsc family related protein from bacteroides fragilis
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
117
structure length
117
Chain Sequence
MKTLFLQYPACSTCQKAKKWLIENNIEYTNRLIVDDNPTVEELKAWIPLSGLPVKKFFNTSGVVYKELKLSSKLPTMTEEEQIALLATNGKLVKRPLVVTERFVLVGFKPEEWEKLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Putative ArsC family related protein
publication title Crystal structure of putative ArsC family related protein from Bacteroides fragilis
rcsb
source organism Bacteroides fragilis
total genus 31
structure length 117
sequence length 117
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03960 ArsC ArsC family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gkxA00
3HA9A 3FW2A 3ZVJA 1XW6A 4OWYA 1S3DA 1JFUA 3I6AA 2H1DA 3WD6A 3F9UA 3KM6A 3DIEA 5CNWA 5H5RA 2CVBA 5ECOB 4TXVA 3G9BA 3GHAA 1SJIA 3GN3A 1OVNA 4XS4B 4V2LA 2F8FA 3GV1A 2YZUA 1GSQA 4J56E 2YPMA 4GWRA 3LORA 3TKPA 5CO3A 1YJ6A 5ABRA 3DKSA 2F3MA 4DSSB 1XWBA 3TRQA 1EV4A 3CSHA 2KUCA 4J2FA 3VPTA 2WZ9A 4L8EA 4TVEA 3TOTA 4JU5A 3TRPA 2CA8A 4KE3A 3VPQA 4OCEA 4BVYA 12GSA 4IJ3A 5D9XA 3PH9A 4OD7A 4XHMA 2R37A 6GSSA 3KMOA 3TJKA 4MP4A 4PURA 3G7IA 3ZFBA 5ECLB 1UC7A 2LV3A 4PQIA 4GRFA 3VWUA 1JZDA 2ZNMA 1J0FA 4MF5A 1BAYA 4KAEA 2OADA 2PPTA 1PMTA 2N5BA 4MZBA 5DALA 2G0FA 1HNCA 4K2DA 3ZZXA 1T8EB 1WWJA 5B8BA 5B8AA 1A23A 1EWXA 5B6NA 3N5OA 1ZL9A 1RW1A 1CQGA 1BEDA 1A0RP 1GNEA 2LJRA 3ME7A 3UVHA 5KN3A 1SKRB 1SD9A 3IK9A 4JEDA 1WRYA 1MDIA 5IM9A 1OC8A 4L0WA 5G5EA 1WE0A 1FOVA 2GTUA 1PL1A 1XIYA 5A5KA 2CV4A 1ERVA 3HXSA 5LNKe 4Q5FA 1M9AA 3HVVA 2JZRA 1QXHA 3HHVA 3GIXA 1T4ZA 1OYJA 6GSTA 4AGSA 4KH7A 3WGDA 2A4VA 2X64A 19GSA 2MZCA 5IMVA 2K18A 1M99A 1MD4A 1B48A 3QMXA 2V1MA 2IPAA 5F06A 1OC3A 2WB9A 2GLRA 1B8XA 3GYKA 5J3RA 1AQVA 1ILOA 3TB2A 2H1BA 2K9FA 3RPNA 4TR1A 5GSSA 1KTEA 4TKYA 2X8HA 4TRXA 4NXIA 5B7CA 2OA7A 2F51A 4HU9A 2JZTA 3PR8A 3VWVA 2V6KA 3MSZA 3W8SA 2GS3A 4MH3A 4IGJA 2HE3A 1BQ7A 4JR6A 3EURA 1JZRA 2VL3A 4MJCA 3ERGA 1SL0B 1V9WA 1N8JA 1EOGA 1SK2A 3ZLPA 5G5FA 2K8SA 3HJPA 1AUCA 4POLA 4GF0A 4TN8A 1GSUA 3P8WA 2IFQA 5EPFA 4K6XA 1SD8A 4EE0A 2C4JA 4N0VA 3VFIA 1Q4JA 1VF2A 3KGKA 4HS1A 2VLVA 2KOKA 1M0UA 4E8EA 2JL4A 3RBTA 3FK8A 2HNLA 4IHUA 4IKHA 1SL2B 5CRDA 3LXTA 3ERFA 4QL9A 4AJ8A 2FCHA 2E2GA 4IS0A 3IAS2 3IK7A 4F82A 2LRCA 2X99A 2TIRA 4D73A 3VWXA 3H4KA 2B6MA 1OC9A 1OE8A 4GQCA 1T7PB 1TI1A 3DWVA 3LGCA 1YZXA 1V58A 4BVXA 2CT6A 1T1VA 2C8UA 4N0ZA 4GTUA 1SYRA 1GRXA 4K7NA 3CSIA 2YP6A 2IJYA 5DQSA 2VCZA 1ON4A 1B9XC 4JZQA 1BG5A 5LCZA 3RDWA 3E9JB 3C7MA 1J08A 3A2XA 1RQMA 4I5QA 2LRTA 4WR4A 4FH8A 1FB0A 4ZXGA 2WGRA 5DBQA 1O6JA 2NTOA 2HZEA 2LQQA 1FG4A 2LS5A 3GSTA 4LL4B 1YKAA 3A2WA 1K3OA 5KN1A 2VM2A 1YQ1A 4GLTA 2HLSA 4MF7A 3IE3A 5KEJA 4Z7XA 4XS4A 3ISOA 2C1YA 5ECNB 1Z7PA 2LQOA 4K7IA 1XOBA 1FW1A 4WKWA 1HNBA 3EYTA 1GL8A 2YV7A 1EGOA 4POKA 1OE7A 3E3EA 2JU5A 1MEKA 4ZBDA 2H74A 5ECPB 4RQXA 4FYBA 2VLUA 1F2EA 1EEJA 3APQA 2IMKA 4DSSA 2L59A 2DJ0A 2Z9SA 4YAVA 1GSDA 4LA1A 5F0GA 4E8HA 2VL2A 5D93A 3DEXA 5IMDA 2EIRA 5ELGA 1YKCA 3H79A 4NAXA 2PVOC 18GSA 4HJMA 1RK4A 2PGTA 3ZITA 4IP1A 4O5RA 2NBSA 2H72A 5ECIB 3UL3A 1TK0B 2PN8A 4J57E 5HR2A 4CDOA 5D9WA 3IXRA 5D73A 3O6TA 2GQMA 1TRSA 1K3YA 4KDYA 2YWIA 3O76A 3ZREA 1G7OA 1O73A 3BCKA 3KH7A 2VCXA 3ZYWA 2B5XA 5ECMB 2P0GA 4V2NA 2C3TA 22GSA 2CX4A 2AYTA 4YQMA 4POBA 1XPVA 2MMAA 1M9BA 3P90A 2B1KA 4GXZA 2EC4A 2C80A 1O81A 3Q19A 3Q6OA 1NW2A 1ZGNA 5JCGA 4AJ6A 1G6WA 7GSSA 3BCIA 3FR3A 2F9SA 4F0BA 3ZL5A 5DCGA 1QUWA 5FT3A 4HOJA 1Z7RA 5G1LA 4WR5A 1EZKA 2FWFA 3D4MA 3LYPA 2O8VB 1QGVA 1LU4A 2OKAA 2QSIA 2LTKA 2GT6A 2H1AA 3FZAA 4NMUA 2IMEA 4ZL9A 2H6ZA 1SENA 2OE1A 5ID2B 1NSWA 1A2MA 3TKQA 1AQWA 5C00A 4MMMA 2IL3A 2LJKA 5G1KA 3ZIJA 3DMLA 3U6VA 2HT9A 4GSTA 3UEMA 3H1NA 2B7JA 5GZZB 4TW5A 3M9JA 1T4YA 5HR1A 2OJLA 1FVJA 1Z5YE 1Z6MA 1M2AA 3D6IA 3F3RA 2FLSA 1G6YA 3OR5A 2CAQA 4XRAA 2LJAA 2VOCA 3C1SA 1ACVA 4EDZA 1EOHA 4ECJA 3HJOA 2J23A 1NHOA 1PA3A 1B9YC 3GX0A 3VI7A 1SJ6A 1GTUA 4MJBA 2BMXA 2MMOA 4ZIJA 1X5DA 5AGYA 1WPIA 3S9FA 1PGTA 1LJRA 2IIYA 4MK3A 1XWKA 3PINA 5COHA 3FZ4A 1QK8A 3CYNA 4BWQA 3IPZA 4IP6A 1ZYQB 4MA9A 4EF0A 2IMDA 2YN1A 4LMWA 3GX8A 3JCML 2A2RA 5F05A 2CX3A 2E7PA 3BBYA 4V1Ap 1F37A 3GKKA 1XOAA 4N10A 4Q5NA 2P31A 5IPGA 2I3YA 2KLXA 2YWNA 10GSA 4Q5RA 3EWLA 4O32A 1TP9A 1BJXA 2M72A 4PUFC 1TW9A 3TJJA 2I1UA 5ECKB 1X0RA 4G19A 4FO5A 4WBJA 4V1Ag 2CAIA 2IMIA 3GTUB 2CVKA 20GSA 2O87A 4IN0A 2I9HA 2XPDA 5FWGA 2DIZA 1A2JA 1THOA 1G7EA 3QAGA 4HZ4A 4I97A 1SYXA 3QAVA 4IQAA 4XCSA 1TK8B 1XW5A 2VAFA 3MDKA 3QOUA 3QR6A 5HFIA 3CSJA 2XBQA 5CRWA 3F0IA 4HI7A 3D5JA 1DE1A 3G7YA 2G2QA 5FHIA 4EVMA 4MCUA 4HEA2 1BYEA 3TCOA 3FR9A 3EINA 3KEBA 4KSOA 3ED3A 3IDVA 3US3A 1TOFA 5IOXA 3IBHA 2IN3A 3CBUA 2FY6A 2GDRA 3DGQA 4FYCA 5JWQB 4MLYA 4KX4A 5ECSA 2DC5A 3BD2A 1Y25A 1GLQA 3TKSE 4ML6A 2BJXA 2ZUPA 1O8XA 1MTCA 3HVSA 3F4RA 4O7HA 4NHZA 3GNJA 3L9SA 5E59A 4NV5A 2BTOT 3KD0A 2VCTA 3UBLA 1ERWA 4ULXA 4EL1A 1R4WA 2R2JA 5B6MA 1HD2A 3RAZA 2GZPA 5L71A 3KP9A 5G30A 1V2AA 4K9ZA 5IPHA 4POMA 4G10A 4OO4A 2FWGA 3QFBC 14GSA 3HJMA 3UOMA 1A8LA 3PGTA 1TI3A 4MH2A 1N2AA 3HZ8A 1NM3A 5G2ZA 3J7Yk 4PX1A 3TKSA 3UAPA 4F03A 1Q98A 3UJ1A 3UIWA 1R26A 3FZ5A 1BX9A 2GQLA 5GAPD 2C3NA 1U3AA 4WBRD 6GSXA 4NWYA 2ZCTA 3FR6A 5GSTA 4OMVA 2H0HA 3CRTA 1EV9A 1SU9A 3UMAA 2FWEA 1S3AA 3ZTLA 1B4QA 2JSYA 5H5QA 2RM6A 2YZHA 1MDJA 1O7UA 4PXOA 2K6VA 5D96A 3CMIA 1UA5A 2PU9C 3M8NA 1TRUA 2LKUA 5HR3A 3EC3A 3WT2A 4TXOB 2HZFA 1LBKA 5IOWA 4YQUA 5CRHA 2WRTA 2VUPA 3ZMLA 1GTIA 4DSQA 4CW9A 4FYUA 2L5OA 3RPPA 1YY7A 4L0UA 3GA4A 2VIMA 1UVZA 4K1FA 5CRGA 2GQKA 3ZMKA 2DIYA 1ERTA 1G0TA 4IQ1A 1HYUA 3ZVJD 3TJBA 3C71A 5C04A 5IMZA 3CXGA 4RI7A 2H76A 3E0UA 6GSYA 5J9CA 3VI5A 4HJ2A 3KIJA 5J4UA 3F6DA 4AF2A 1TXXA 1GULA 1TRVA 4ZBBA 2R3XA 3FY7A 3L78A 2RIIA 1PN9A 2A2SA 2O89A 3EMXA 2AJQB 3GL5A 1U6TA 3F6FA 2DLXA 2H01A 3WGEA 2E0QA 2DJ2A 5AIXA 1K0BA 5IMAA 2FHEA 4MDCA 4RQRA 4HZ2A 4KDXA 1XBSA 4XIHA 1OKTA 3LWAA 1UN2A 4ZL8A 2L5LA 1A24A 4P3YB 17GSA 2FNOA 1H4OA 4X43A 3ZRDA 5CAXA 3W8JA 3GMFA 2RM5A 5A4VA 1TKDB 1AC1A 3LEFA 3MAKA 4Q5QA 4NPBA 3LQ7A 2X8CA 2HSYA 1GNWA 1X5CA 3ZFLA 2CZ3A 2H6XA 5DDLA 5KN2A 4EXJA 3GKNA 2GSSA 3WYWA 5DJLA 3H93A 6GSUA 2V32A 2M46A 5HQPA 2DMMA 4WETA 1K0MA 4KSMA 3TUEA 3APOA 5IO2A 2V2GA 3IR4A 4PQHA 4F9ZA 2YWOA 3F8UA 1FB6A 2AHEA 1Z9HA 4EDYA 3APSA 4I6XA 2NVLA 8GSSA 4KDUA 2VCVA 4KUNA 4HQSA 1E2YA 1O8WA 2YJHA 4V2MA 1PX6A 2PMTA 3WT1A 4ZB6A 5JCUA 4XRDA 3Q74A 2HFDA 3H8QA 3SBCA 3M0FA 2LNTA 3GTUA 1XXUA 1U87A 1E6BA 3QFAC 5GAND 1XCCA 2DSAA 4I8BA 4GCIA 5AIVA 1DUGA 2H73A 11GSA 2FA8A 1QFNA 4WXTA 1O85A 3KMNA 2H66A 3K8NA 1EEMA 1AAZA 2JACA 1J9BA 3ERWA 3KJYA 2I4AA 2WULA 2C0GA 3TJGA 1TRWA 2RUFA 3NZNA 4OFNA 4IELA 3U5RE 4MPFA 2REMA 5ECRB 1FHEA 2DBCA 2H70A 1KEBA 3ME8A 1ZCPA 4ZILA 5J9BA 3TKRA 5E4WA 3C1RA 1X9MB 3LG6A 2H0GA 1PQNA 3O3TA 1TTZA 1GTBA 4PUAA 3TDGA 1HQOA 5IMFA 1MDKA 1F3BA 1SK1A 3FZ9A 2VM1A 2XHFA 1W89A 3LJRA 3NIVA 2L4CA 5ECHB 3MNGA 4BL7A 4JBBA 1ZMAA 4IJIA 4IW9A 4PQ1A 4ILFA 2XC2A 1XWGA 1WOUA 2C0DA 1YF0A 4ZL7A 2GSQA 4KA0A 3HKRA 2DMLA 3GKMA 2WS2A 4X1UA 2CZ2A 3TJFA 3D0ZA 4MZCA 2VD1A 2CVDA 3IV4A 3I43A 1GH2A 4IVFA 2D2ZA 2M80A 5HR0A 2H71A 1X5EA 13GSA 1YDKA 4HUAA 3KCMA 1JZWA 5F07A 2ON5A 3RHBA 2LRNA 2AUVA 5DQYA 3ZIVA 3A3TA 1F6MC 5DAKB 3EMPA 1YEPA 1ST9A 3EU3A 1XW9A 2L4QA 2MMNA 2AB6A 2FA4A 3KXOA 4NV2A 2HZEB 4HDEA 2J9HA 2V6OA 1GUKA 1OKDA 1DE2A 2K8VA 2OACA 3KZQA 1TU8A 5IIZA 1DBYA 2VD0A 4X0XA 2FGXA 4TR4A 1VRSD 1V57A 4LL1B 2MYGA 2PBJA 4PGTA 3FRCA 1GSSA 2GT5A 1XWCA 4JR4A 4DSRA 1R5AA 4ACSA 4YH2A 2QC7A 2NPBA 3C8EA 5CP1A 1A0FA 1WP0A 1V98A 4ML1A 4TXOA 1VF4A 2DJ1A 4QL7A 1SKSB 3DRNA 5G31A 2DJJA 1F3AA 3TGZA 5A4UA 1B4PA 1I9DA 1SK0A 3EU4A 3DD3A 2AAWA 5JWOB 1GLPA 2XBIA 3GURA 4G9HA 1YEXA 2H75A 5HFGA 1VF3A 4WF5A 2KP1A 4ZB9A 1K0CA 3KTLA 3GUSA 5DJMA 1FAAA 2B5YA 2AV4A 1ERUA 3LSZA 3F3QA 3CRUA 3VK9A 2RUEA 4TR3A 1W4VA 3EVIA 4KNDA 3F63A 1M2DA 2P5RA 4RI6A 2KP2A 2GZZA 3DXBA 1A8YA 1K0DA 1U3IA 1R5PA 6GSWA 1SL1B 2R4VA 1SKWB 6GSVA 2LNSA 1URMA 4ID0A 1VGLA 3L0HA 2YNXA 2HI7A 4PNGA 1K0NA 4EKZA 2EIQA 4YQVA 4MZWA 4AJ7A 3F4TA 2FD3A 5J41A 3DYRA 3I69A 4EUYA 1XVQA 2VO4A 2FUG2 2L6CA 3FHKA 2WFCA 4TR0A 2HYXA 5CREA 1K0OA 1CQHA 4K0NA 2R6KA 4NHWA 3QD9A 4BPYA 3LFLA 5DCHA 2PERA 1XFLA 4TOPA 5D8IA 4XS6A 1I5GA 2MBSA 2VLTA 4GSSA 3BJ5A 5AISA 4BA7A 2ALBA 1KNGA 5D9TA 4PNFA 1X9WB 1PL2A 1K0AA 1F9MA 3WGXA 1SJZA 3LXZA 1PD21 3EE2A 5KN0A 3L4NA 1PKZA 4JE1A 2XPEA 4KB3A 2GGTA 1WMJA 1TK5B 1DSBA 2OE0A 3C73A 3UARA 4OFMA 3QAWA 5AN1A 4K0GA 3NOFA 2H30A 1S3CA 1X9SB 1T00A 3HD5A 2L57A 2LEGA 3QPMA 1U88A 3M9KA 3HZ4A 2YJ7A 1H75A 3GSSA 4ECCA 1GSYA 4WEYA 2WJUA 4LMVA 2C0EA 4I2UA 2H0IA 4I2TA 4BWSA 1Z6NA 1R7HA 1MD3A 2OBIA 4GSNA 5JCWA 4L5OA 2RLIA 2TRCP 1XVWA 1T3BA 4HU7A 5DVBA 1AW9A 3KH9A 1M2BA 4JRRA 3GH6A 3HVXA 2N5FA 2R5GA 2YANA 1ABAA 3UBKA 2MMZA 5ENUA 1WJKA 2GVPA 2HSHA 5EY6A 3SWLA 4MABA 4ECIA 5LD0A 1Z3EA 3IA1A 2DJ3A 2H1GA 2VL9A 3VURA 5D9VA 1ZZYA 1IYHA 1ZYEA 2HXKA 5CYYA 4MPGA 1GP1A 4OFTA 1YF1A 1TJDA 1XZOA 3G7JA 2B5EA 1GSFA 5ID2A 5IQYA 4WF4A 3P7XA 1ML6A 1QMVA 3IHQA 1JLVA 3W6GA 3DVWA 3QDNA 4ISDA 2PVQA 2DJKA 3KP8A 1NHYA 1VF1A 2ON7A 5INYA 3RHCA 1JLWA 4N11A 1JHBA 3Q18A 1HNAA 1KBNA 1A2LA 3A2VA 4ZB8A 5DALB 2QGVA 4EC0A 5DAKA 4N30A 2C0FA 16GSA 1TDIA 3MWHA 2L6DA 4MJEA 2O85A 4F2IA 3L9VA 4KW6A 4LLRA 3BOAA 4ECBA 1GTAA 2MBTA 3TKSC 1AQXA 2WDUA 5J5NA 3GRXA 5H5SA 5A4WA 3GFKA 3IOSA 3V1WA 2FWHA 3KTBA 2CQ9A 4FIWA 1IYIA 4ZBAA 2H6YA 4CHSA 1GUMA 4EO3A 2IWTA 2C3QA 2VCQA 2N5AA 2PUKC 3GKXA 4GQFA 3CTGA 3TOUA 1WIKA 3IRAA 3TRXA 4F0CA 1FO5A 1QQ2A 2YOIA 1XWAA 3QCPA 1M7TA 3FEUA 2I81A 4H86A 2YV9A 2GSTA 2NDOA 4K8MA 2TRXA 4DEJA 2B1LA 2YWMA 2JADA 1C72A 3LYKA 2H8LA 2OE3A 4KGIA 3HCZA 4YAPA 3VWWA 2GSRA 4MJAA 4TR1B 5ECQB 1PKWA 3M3MA 2HRNA 3A5WA 3FKFA 2H19A 3D21A 3GH9A 4MF6A 1USBA 1PRXA 3DVXA 3HDCA 1AXDA 5EL8A 2F8AA 2GZYA 2YCDA 3I9V2 1TU7A 2QKEA 3N9JA 2ES7A 4QQ7A 1THXA 2LSTA 1ZOFA 2IMFA 1GUHA 3IC4A 2HRFA 2IFQB 1FVKA 3J7Yb 1PSQA 4XTSA 1V40A 2E2MA 5ELAA 3HY2A 1PX7A 2V41A 3UVTA 2O7KA 9GSSA 5F8BA 3GL3A 3F4SA 1JZOA 2JSZA 2WCIA 4K7OA 3HYPA 3IAM2 4D73B 4OO5A 1OC9B 1GWCA 2X8GA 1OAZA 3L9UA 3M1GA 3FYGA 4O92A 1EP8A 4HQZA 2B3SA 1EGRA 4KCAA 3R2QA 3CTFA 3VLNA 2PWJA 1GSEA 3P2AA 4KCEA 5JWRB 2B7KA 2KHPA 5IMCA 2EIOA 2LUSA 4DVCA 4L5LA 4G2EA 2VL2C 1AIUA 2VCWA 1K3LA 2JZSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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