1EWXA

Crystal structure of native tryparedoxin i from crithidia fasciculata
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
144
structure length
144
Chain Sequence
SGLDKYLPGIEKLRRGDGEVEVKSLAGKLVFFYFSASWCPPCRGFTPQLIEFYDKFHESKNFEVVFCTWDEEEDGFAGYFAKMPWLAVPFAQSEAVQKLSKHFNVESIPTLIGVDADSGDVVTTRARATLVKDPEGEQFPWKDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structures of tryparedoxins revealing interaction with trypanothione.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
molecule keywords TRYPAREDOXIN I
total genus 43
structure length 144
sequence length 144
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ewxA00
1ZOFA 4OWYA 3VWUA 1EP7A 3GKMA 2FUG2 2M46A 3GKKA 2LEGA 1EV9A 1ZGNA 1XWBA 4NV2A 5DALB 3QPMA 1JLWA 2JZTA 1UN2A 2WJUA 4KA0A 1BYEA 2I3YA 4V1Ag 2X99A 3L9VA 4POKA 4OO4A 2YPMA 3FYGA 1KTEA 3FZAA 4KCEA 2QSIA 2HSHA 1QGVA 5L71A 1S3CA 3DYRA 3A2VA 4ZIJA 1A23A 2VCWA 5G5EA 1SJ6A 4ZBAA 4L5OA 1PGTA 4EF0A 4MJCA 2REMA 2H6XA 2VLUA 1OYJA 2VOCA 3FY7A 1R26A 1YJ6A 1YF0A 2HI7A 5GSTA 2HXKA 4ZILA 4ACSA 1SL2B 2AV4A 2JADA 4KDXA 5IPHA 1V40A 1ON4A 2YWIA 5JWOB 2CVKA 5J9CA 2C0FA 4DSSB 1TJDA 1GTIA 1O7UA 4HU7A 1PQNA 2LRCA 5B7CA 3GURA 3UAPA 2DJKA 3TRPA 4GLTA 1I5GA 3GN3A 3H4KA 1PRXA 4L8EA 3IPZA 1ABAA 4TKYA 1JFUA 1Y6EA 5DCHA 5HR2A 2H6ZA 5D96A 1T1VA 5IQYA 2FGXA 4IKHA 20GSA 5EVOA 2IJYA 3IAM2 3HVSA 1V2AA 3PR8A 3VURA 2FY6A 3C71A 1S3DA 4BVXA 5DQSA 1K0AA 2C1YA 2KP2A 2OACA 2HSYA 4ULXA 1GTBA 3KGKA 4KDUA 3CRTA 1VF3A 3M9KA 1K0BA 1V98A 5ECPB 2P31A 4KAEA 3EVIA 2L5LA 3M9JA 4EDZA 18GSA 2IMKA 2JU5A 6GSYA 1M99A 2LQOA 1JZWA 1AXDA 2V32A 5JCUA 5IPGA 4MK3A 2XBQA 3G7YA 5HR0A 5DJLA 2QGVA 3U6VA 7GSSA 4K0GA 5J3RA 4J57E 2C0DA 1R5PA 1THXA 1NHYA 3VK9A 1GTAA 3KMNA 5CO3A 4WR5A 2GT5A 2DIYA 4WBJA 3DKSA 1YY7A 4LA1A 4PURA 4FYUA 1RK4A 4DEJA 3AY8A 3TKPA 4X1UA 5A4WA 5CNWA 3RBTA 5F05A 1H75A 2MYGA 3ZVJA 1U6TA 2LQQA 3J7Yb 1B9YC 1K3OA 3P7XA 1X5DA 3LWAA 3UIWA 3QOUA 5F8BA 2GSTA 3KD0A 1CQGA 4DSQA 3HA9A 4K6XA 2IMDA 3W8SA 3HVXA 2K6VA 4G10A 3UBLA 4YQUA 1XPVA 2D2ZA 2GDRA 3D22A 2M72A 1M7TA 2H1AA 1KBNA 3ISOA 1OC8A 1N2AA 2NVLA 4PGTA 5ECHB 2RIIA 1SYRA 3FZ4A 2J9HA 4DVCA 1TRVA 2AUVA 4KW6A 2E0QA 2DJ0A 4O5RA 4D73A 3C1SA 2ON7A 3TOTA 1LBKA 4ZB9A 4OD7A 1AQWA 3OR5A 3LXZA 1R4WA 3IHQA 1C72A 1YEXA 4MZCA 2YJHA 3EWLA 4N0VA 1OC9B 1ZYEA 3F3RA 2WCIA 2CV4A 2H1GA 1WMJA 3TJFA 3NOFA 1U88A 5GSSA 5AIXA 2VAFA 3VWWA 4NHZA 4PNFA 1MDJA 2RM6A 3NIVA 4ML6A 4POBA 5EY6A 5IMCA 3TJGA 1TXXA 2PERA 3EU3A 3IK9A 2CT6A 4EL1A 1B8XA 3MAKA 5CP1A 1GSYA 5CAXA 2FD3A 5A4VA 4HI7A 2IL3A 6GSWA 3O6TA 3IDVA 1OAZA 1MEKA 2FLSA 2WS2A 3ME8A 3QCPA 3KH7A 3IOSA 4EE0A 4EVMA 3HJOA 2B5XA 3EE2A 1DE1A 2DLXA 3PH9A 3ZMKA 2F8AA 1XXUA 3WGXA 1XWCA 4WF5A 4MCUA 3GKXA 1SJZA 2F51A 4G2EA 1GSUA 4EC0A 4YH2A 1EZKA 4I2TA 4AGSA 1TK8B 2MMOA 1MDKA 3ZYWA 2LNTA 4POMA 3QAGA 2EIOA 4KDYA 12GSA 2I1UA 1T7PB 1SK0A 4MH3A 4O92A 1K0OA 1TP9A 4OFNA 1K0CA 4ML1A 2VCZA 3HD5A 3VI7A 5GAND 1BJXA 3FRCA 5CRDA 2YWOA 1PMTA 5D9VA 3FW2A 2O89A 3L4NA 4YQVA 3KTLA 4L5LA 1WPIA 1M2BA 1PL2A 1OC3A 3N9JA 4WR4A 6GSTA 4TXOA 2H66A 4F03A 5DBQA 1HNCA 4NV5A 1TKDB 3Q18A 3GV1A 2CAQA 4EKZA 4RQRA 4P3YB 1GH2A 5E59A 3KIJA 3F3QA 4IS0A 4K1FA 1B9XC 2GTUA 4I2UA 3HZ4A 3F4RA 2LUSA 3F0IA 3UMAA 3W8JA 5DAKA 5H5RA 1A0FA 3F8UA 1THOA 4NAXA 2BTOT 1XWKA 1GL8A 4LMWA 5HR1A 1MD3A 3CRUA 1Z9HA 2VD0A 4ZB8A 1Z5YE 4TR3A 5H5SA 1HD2A 1FB0A 2B5YA 2DJJA 4XRDA 2GZYA 1FO5A 3TUEA 4CW9A 2X8HA 4K8MA 4KX4A 2CA8A 3GX8A 2R3XA 4RI7A 3ME7A 2IFQB 4HQZA 4Q5NA 3A5WA 1JLVA 1O85A 4YAVA 5D8IA 1A2JA 4N30A 17GSA 4MJBA 2TRXA 1SKWB 1HNAA 1W89A 4L0WA 1X5CA 1A0RP 3CMIA 3GHAA 1GNEA 2KHPA 4EUYA 3IA1A 3GNJA 1UVZA 5DCGA 4MABA 1SENA 2H1DA 2R2JA 3IBHA 4XRAA 3GUSA 4WKWA 4BWQA 2ZNMA 1HYUA 3E9JB 2BMXA 2LTKA 1NW2A 3TKQA 3DXBA 4QQ7A 4TR1A 1AAZA 1WOUA 3EU4A 2C80A 4EXJA 4JR4A 3GFKA 3Q19A 5AISA 5EPFA 4TXVA 4AJ8A 5LD0A 4F0BA 2XC2A 1J9BA 2WFCA 3HDCA 4XS4A 4V1Ap 4FIWA 3MDKA 1PSQA 2DJ1A 4BVYA 2HZEA 3VI5A 1N8JA 3ZZXA 4V2MA 2LKUA 9GSSA 3CSIA 3RPPA 3GYKA 4WEYA 2FA4A 5DVBA 3HYPA 3F6FA 4OCEA 1T3BA 4MJEA 5IM9A 1DSBA 1TK5B 1T4YA 1AIUA 1OKTA 3DVXA 2RM5A 1PA3A 3UVHA 2WDUA 5J5NA 2DIZA 1OVNA 4YAPA 3U5RE 8GSSA 1WP0A 3TJBA 3EINA 4K9ZA 1BAYA 2H76A 3D4TA 5CYYA 2A2RA 5FWGA 1XW5A 2FCHA 4HDEA 1G0TA 4KCAA 2H0GA 2JZRA 3GH9A 1XIYA 1QFNA 2VL2A 4JRRA 4V2LA 1AUCA 1Z6NA 4XIHA 4JBBA 2LS5A 3GTUB 1PX6A 3KCMA 4IJ3A 4GRFA 2PVOC 3TKSA 5CRWA 1USBA 2G2QA 3HJPA 4LLRA 3TJKA 1O81A 2H6YA 3LYKA 5IMZA 5ECMB 4WXTA 4GSTA 3QFAC 4RQXA 4FO5A 3CYNA 2GQLA 2RUEA 1T4ZA 3FK8A 1U87A 1Q4JA 5ELGA 3ZTLA 1QQ2A 2PU9C 2BJXA 2V1MA 2KOKA 1T00A 3LJRA 1XVQA 4QL9A 5F0GA 2ALBA 2JSZA 1VGLA 3KZQA 5D9WA 3DGQA 3GH6A 2NDOA 2GVPA 4MH2A 2H71A 3QFBC 5AN1A 5DQYA 4MP4A 4OFTA 1ERUA 2MMNA 1A8LA 4K0NA 3FEUA 2L59A 1F2EA 2A4VA 2VCQA 1HQOA 2E2MA 1QXHA 3DRNA 3ZLPA 4HJMA 4J2FA 2JZSA 3TGZA 3WGDA 2CX4A 3HCZA 4TVEA 4MPFA 2PN8A 5ECIB 4DSRA 4NXIA 1TRWA 5IO0A 2GGTA 4IN0A 3IRAA 2OADA 3O3TA 2EC4A 4ECCA 5FT3A 2VL2C 3QMXA 3FR6A 4G19A 4MLYA 2HYXA 4BL7A 3TKSC 4MF7A 3W6GA 1TDIA 4NWYA 3F63A 4MZWA 2HFDA 2HLSA 4ISDA 4PX1A 2B1LA 2C0GA 3ED3A 4ILFA 5ENUA 4K7IA 2KUCA 1J08A 1MD4A 2OKAA 3H93A 1AQVA 2M80A 3BBYA 4MZBA 2C3QA 1IYIA 4I8BA 3HY2A 4KE3A 3H1NA 2OA7A 1W4VA 2XPDA 3LQ7A 4GSNA 3C1RA 2IN3A 4HZ4A 4IQ1A 1FVJA 2C8UA 2R6KA 3WT2A 5INYA 4HEA2 2E2GA 3L0HA 1EOGA 3DVWA 3DEXA 1XFLA 2DJ3A 2GQMA 5CRHA 3BOAA 3F6DA 3PINA 5E4WA 2H01A 1YQ1A 3TRQA 1SJIA 2EIQA 2YZHA 1FOVA 3A3TA 4K7OA 14GSA 3GRXA 1XOAA 3BJ5A 5HR3A 3FHKA 4ZL7A 1G6WA 2B1KA 4FH8A 4MJAA 5JCWA 1EEJA 1XW9A 2EIRA 5F06A 1PN9A 2N5AA 3EMXA 4GSSA 3GKNA 4GQCA 2AJQB 3TB2A 1AW9A 1ZZYA 3ZIVA 1XVWA 3I69A 1X9SB 2ES7A 3MWHA 3APSA 3P8WA 3SBCA 1K0MA 2VM1A 2FWGA 2L5OA 5KEJA 2VO4A 1GUKA 2VCVA 6GSXA 1LJRA 3US3A 2GSRA 5ECKB 3UJ1A 3Q74A 4JU5A 5JWQB 3E0UA 2H1BA 1GNWA 4ZL9A 5AGYA 5DALA 1VF1A 2LJKA 2C4JA 2X8CA 5IIZA 13GSA 1AQXA 16GSA 5IO2A 4PQIA 3GSTA 1WE0A 4MF6A 5A5KA 2R4VA 5DDLA 1DUGA 4N11A 4IW9A 3KP9A 2H72A 3CBUA 4RUVA 3JCML 4Z7XA 1ACVA 2XBIA 2CX3A 1S3AA 4TR0A 3UBKA 1URMA 4XHMA 1U3IA 1YDKA 2YV9A 2OBKA 3ZRDA 3QDNA 4MDCA 4BPYA 3UARA 2WULA 4HOJA 5D73A 3E3EA 2CZ2A 1ZL9A 2A2SA 3UEMA 3BD2A 3DWVA 1BQ7A 1F3AA 2ZCTA 3KEBA 3FZ5A 3D6IA 4V2NA 4DSSA 1TRUA 1ML6A 3EMPA 1Y25A 5LCZA 1SD8A 1CQHA 2H0IA 5HFGA 4ZBDA 1F9MA 4PUFC 4NPBA 2YZUA 2H19A 1G7EA 1SU9A 1IYHA 4HU9A 3RDWA 4Q5RA 4TRXA 3I9V2 4HS1A 2DBCA 2OBIA 2O7KA 4OCFA 1YZXA 1GULA 1PX7A 3F4TA 1F3BA 1G7OA 3HVVA 3VWXA 3M3MA 1EV4A 3L9SA 5HFIA 1TI1A 4I6XA 3ZMLA 3KTBA 3TKSE 2WB9A 4ZXGA 4F9ZA 1GUHA 4KSOA 2OE1A 4ECBA 1B4QA 3GX0A 4K7NA 2Z9SA 3K8NA 2DMMA 3G7IA 2L6CA 2MBTA 3IC4A 3RHCA 2YANA 4ZL8A 1O8XA 1DE2A 2FWHA 2YWMA 4KNDA 3SWLA 3H8QA 5G30A 2VCXA 4L0UA 4ID0A 3VPQA 1VRSD 2O8VB 4KSMA 3G7JA 5G31A 2L4QA 1GLQA 2PGTA 1OKDA 2KLXA 4HZ2A 5KN3A 1GSQA 4GF0A 4ZB6A 2DMLA 2VL9A 3QR6A 5F07A 1YKCA 4BWSA 3ERWA 5ECLB 3LXTA 3DD3A 3KH9A 5CREA 3UL3A 4X43A 2DSAA 2P5RA 1GUMA 3LG6A 2FWFA 4KH7A 2LRNA 3QAWA 1X9MB 1SYXA 1EGOA 1O73A 2C3NA 2GS3A 2CVDA 3FR9A 3QAVA 1F6MC 2IIYA 4GWRA 1JHBA 2MMZA 1E2YA 4LMVA 1PD21 4YQMA 4D73B 2K8VA 5FHIA 2DC5A 2E7PA 2PPTA 4RI6A 2I9HA 4JE1A 1UA5A 2ON5A 2FHEA 4CDOA 5ECOB 2YOIA 2C3TA 4IELA 2MMAA 3RHBA 2K8SA 3KMOA 2GSSA 3ZREA 1RQMA 4OO5A 2GQKA 2NTOA 1Z7PA 2YN1A 1T8EB 1GLPA 5G2ZA 2HZFA 2IWTA 4F2IA 1EGRA 1V9WA 2JSYA 3EC3A 3TJJA 3D0ZA 2JL4A 2B5EA 2VM2A 1TTZA 4NHWA 1OE7A 2QKEA 3ERGA 4IP6A 2H73A 3L78A 4GQFA 1FVKA 3NZNA 2AAWA 3H79A 2KP1A 4F0CA 1GSEA 3BCKA 1XOBA 1MTCA 2WZ9A 3VLNA 4POLA 1ZMAA 5IOWA 2VLTA 2VIMA 3O76A 2H30A 2TIRA 2X64A 1A2LA 1EEMA 2VD1A 1OC9A 2LNSA 1NHOA 1YEPA 5D9TA 3D21A 4FYCA 2VL3A 5ECSA 22GSA 1EP8A 1M9BA 5KN2A 3F9UA 4IHUA 4F82A 4O7HA 3RPNA 3UVTA 4XCSA 1M0UA 1YF1A 5EL8A 3FKFA 5ID2B 6GSUA 2YJ7A 3PGTA 2GZZA 2CAIA 4TR4A 1K0DA 1BX9A 3TOUA 3I6AA 4PQHA 3QD9A 4ECIA 1M2AA 3GSSA 2H74A 4IBPA 4JZQA 4HQSA 3GMFA 2HNLA 3C8EA 1PKWA 4HUAA 5D9XA 1WRYA 2AYTA 2RLIA 4TW5A 3WYWA 3LGCA 3TRXA 4TXOB 1A2MA 1U3AA 3ZFLA 5ECNB 1B48A 2CVBA 1JZDA 2HRNA 4GTUA 5GZZB 5DAKB 1ZYQB 2O87A 1H4OA 1Z3EA 5ECQB 1A24A 4AJ6A 1FAAA 2K18A 1I9DA 1SD9A 1VF4A 1SL0B 2F3MA 10GSA 3KXOA 2H0HA 1V58A 3Q6OA 1GP1A 3EURA 1AC1A 4PXOA 1X0RA 5GAPD 2GT6A 3F4SA 1JZRA 1YKAA 1OE8A 4NMUA 2H8LA 2RUFA 2OE0A 4G9HA 5IMVA 4GCIA 5HFKA 1TW9A 3LYPA 2CZ3A 4PQ1A 2MZCA 4WETA 2L57A 1SK1A 1Z7RA 4BA7A 3L9UA 2B7KA 1XWAA 3GL5A 5COHA 5A4UA 3N5OA 2AB6A 3GIXA 4Q5FA 1VF2A 1GWCA 2ZUPA 4J56E 1QK8A 2IPAA 3FR3A 3IV4A 2IMFA 3J7Yk 4TN8A 5IMAA 5H5QA 2K9FA 2N5FA 2V41A 1WWJA 3TCOA 2PUKC 2MBSA 3GL3A 1QUWA 5DJMA 3C7MA 4XS1A 3HHVA 5J4UA 3LSZA 1XW6A 4TR1B 4MA9A 1EOHA 2PVQA 11GSA 4I97A 2YNXA 1A8YA 5C04A 2IFQA 4EO3A 5IOXA 3VFIA 5D93A 3P90A 2R5GA 1EWXA 1NM3A 1TOFA 3EYTA 5LNKe 1QMVA 1Z6MA 4KUNA 1XBSA 1X5EA 5ABRA 1G6YA 4IVFA 5J9BA 3WT1A 5G5FA 2HRFA 4XS4B 2XHFA 1LU4A 3MSZA 2NBSA 1FG4A 3I43A 2HZEB 1J0FA 2L6DA 3D5JA 1BG5A 5ELAA 4N0ZA 2B3SA 1GRXA 3LORA 2VLVA 2L4CA 1GSFA 6GSVA 2CQ9A 3G9BA 4WF4A 2O85A 2P0GA 3APOA 1E6BA 1R5AA 1ILOA 2TRCP 2FNOA 3CXGA 3CTFA 3KJYA 1K3LA 2I81A 5B8BA 1K0NA 2VCTA 5KN1A 3A2WA 1TRSA 4OFMA 4IP1A 3APQA 3ZFBA 1GSSA 1HNBA 2B6MA 2I4AA 3IAS2 4AJ7A 2G0FA 3WD6A 1SKSB 1SL1B 2LRTA 2YWNA 1K3YA 2LSTA 4Q5QA 3M1GA 1ERVA 2P5QA 4E8EA 4E8HA 3CSJA 2YCDA 1O8WA 1MDIA 3D4MA 2HE3A 3DMLA 3UOMA 2QC7A 4N10A 3ERFA 4LL4B 3DIEA 3VWVA 2LV3A 1R7HA 3HKRA 2OJLA 4PNGA 4I5QA 4XS6A 4GXZA 2IMIA 1FW1A 4K2DA 3IE3A 3CSHA 3ZITA 2FWEA 3BCIA 4CHSA 2IMEA 4QL7A 6GSSA 1GSDA 3HZ8A 4HJ2A 3M0FA 4MPGA 3GTUA 3KP8A 1ZCPA 2YP6A 5G1LA 1XZOA 3S9FA 1KEBA 3ZVJD 4TOPA 1KNGA 1UC7A 2PMTA 1TI3A 1ERWA 2LJRA 4MF5A 5ID2A 2PWJA 5B6NA 2R37A 3FZ9A 2V2GA 1SK2A 4EDYA 2X8GA 2GSQA 4MMMA 4H86A 5IMFA 2H75A 5AIVA 1X9WB 5ECRB 3WGEA 1M9AA 2WRTA 5JWRB 5JCGA 4ZBBA 3LEFA 1FHEA 3R2QA 1PL1A 5J41A 1WJKA 2LJAA 1TK0B 5HQPA 2B7JA 5KN0A 1XWGA 3P2AA 4LL1B 4X0XA 5IMDA 2PBJA 4O32A 2DJ2A 3IK7A 2J23A 4WBRD 2NPBA 4XTSA 2C0EA 3TDGA 1TU7A 3TKRA 2AHEA 3ZL5A 2HT9A 3HJMA 2F9SA 1RW1A 4KGIA 1V57A 4JR6A 3RAZA 1SKRB 4FYBA 3IXRA 1JZOA 3LFLA 1FB6A 1XCCA 5G1KA 2XPEA 3CTGA 2V6OA 5CRGA 2N5BA 3HXSA 2WGRA 1WIKA 2GLRA 2VUPA 3VPTA 3GA4A 3V1WA 3ZIJA 2V6KA 3KM6A 2OE3A 4OMVA 1TU8A 4JEDA 1PKZA 1Q98A 1M2DA 4IJIA 4IGJA 1NSWA 1ERTA 3MNGA 4KB3A 3IR4A 1GTUA 1DBYA 3A2XA 2YV7A 4PUAA 5B8AA 2GZPA 4IQAA 2JACA 2F8FA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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