3TJGA

Crystal structure of human peroxiredoxin iv c51a mutant in oxidized form
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
SKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
total genus 57
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjgA00
3RHBA 3KMOA 2I1UA 3LSZA 3N5OA 4JR6A 5ECHB 1B48A 3TRXA 2DMLA 2C3TA 1U6TA 3DEXA 3FHKA 2YPMA 4L8EA 3EURA 2HNLA 4NHZA 5B6MA 3W8SA 3ZIVA 5DBQA 4OFMA 5J9BA 2JL4A 4OCEA 3LXTA 4GCIA 2XPDA 2LUSA 1OVNA 2HE3A 3GKMA 3GHAA 3KTLA 3M0FA 4MJBA 3VPQA 20GSA 3BD2A 4V1Ag 2OE0A 2DJ2A 3MSZA 1JZWA 4G9HA 1MDKA 3C8EA 2LKUA 1K0OA 3UVHA 4KW6A 4POKA 1JZDA 3GNJA 5HR1A 1O6JA 3KMNA 4JZQA 5FT3A 3GKKA 2EC4A 4TVEA 2LRCA 4ACSA 1BEDA 2CZ2A 5IPHA 3F6FA 1VGLA 2VD0A 3HCZA 2LNTA 3US3A 3BOAA 3D6IA 1ZYQB 3G9BA 2I9HA 1ZL9A 3UARA 3Q74A 4PUAA 3GSTA 2HRFA 3TKQA 3K8NA 1ZMAA 3GV1A 4EC0A 3E3EA 5HFGA 5EPFA 3TCOA 5D9XA 4XRAA 2K9FA 4MZBA 3IBHA 2WCIA 1SU9A 2BMXA 4WF5A 2IFQB 1QQ2A 1QFNA 5IQYA 3BCIA 1R26A 4F0CA 5G1LA 3EE2A 5L71A 5IM9A 1F6MC 2C0EA 1R7HA 1SJIA 2L4CA 2R3XA 1XOBA 5COHA 5D96A 5ABRA 2KHPA 2CA8A 1SKWB 1XOAA 2JACA 1YDKA 3GFKA 4IGJA 3FZ9A 3GX0A 1PD21 5J41A 5FWGA 3GSSA 1WIKA 1T1VA 18GSA 4F03A 1XCCA 4ECJA 1SK1A 5LD0A 2X64A 5LCZA 3NOFA 1VRSD 3HKRA 1OYJA 1PKZA 1K3YA 1BJXA 2P31A 1Z9HA 1Q4JA 5GAND 2E2GA 3FKFA 4IVFA 3TUEA 1G7OA 2JZRA 5D9VA 2GVPA 1DE1A 2LEGA 2OACA 4YQMA 4K0GA 2C3QA 1SL1B 2YWOA 1QK8A 3HZ4A 2HZEA 3EU3A 4KH7A 1F3BA 2V41A 4KCEA 5H5RA 3P7XA 5G31A 2HI7A 2X8GA 2QSIA 4Q5FA 1WE0A 2H74A 2DBCA 2B7JA 4CW9A 5CO3A 3PINA 4ZBBA 2N5FA 4PQHA 5A4WA 2A2RA 3VWWA 14GSA 22GSA 1PX6A 4FYBA 4KA0A 3DYRA 4K2DA 5G5EA 1FO5A 2HRNA 4I2TA 1GTUA 1V9WA 3HD5A 1URMA 2O89A 2B6MA 1U3IA 3KXOA 2H19A 1THOA 1GL8A 1T8EB 2YOIA 3I69A 4MPFA 2C3NA 5KN3A 4BVYA 3N9JA 2LQQA 1U87A 1JZRA 1X5EA 3FYGA 4K8MA 4MZCA 1N8JA 4BL7A 3ME7A 3DXBA 2VM1A 2EIOA 4KX4A 4AJ8A 5KN2A 1GSUA 3TJJA 6GSXA 4F9ZA 4GQFA 2H71A 3WD6A 4L5OA 5GSSA 4GXZA 2F8FA 1SL2B 5D73A 1GSFA 3CBUA 3LFLA 1YKAA 2HT9A 4JR4A 3GKNA 4L0UA 4WR4A 2FHEA 4AJ6A 1AAZA 1YF1A 3ZVJA 4ZL9A 3GL3A 2R5GA 3BCKA 1ERWA 3QAVA 3Q6OA 3GN3A 4GSTA 5B6NA 2R2JA 3APSA 3APOA 2IPAA 2VCXA 1XW5A 1S3CA 2D2ZA 2P5QA 3ZMLA 1GUMA 1V57A 4NAXA 2TRXA 1SYXA 3CYNA 3ERGA 3DGQA 2OA7A 3KH9A 2OE1A 3IE3A 2EIQA 1YF0A 4MDCA 2QGVA 4MP4A 5A4VA 2JADA 2KP2A 2K8VA 3GTUB 1O8WA 4QQ7A 3C7MA 1EP8A 4HOJA 3F3QA 1M0UA 3KZQA 3F63A 3HHVA 3FW2A 2LJKA 1GSDA 3EINA 3F4TA 4HEA2 1K0AA 1MEKA 3CTGA 3UBKA 5IO2A 1EWXA 5CNWA 4RI6A 4BWQA 3JCML 3GMFA 2RIIA 2H01A 4TRXA 1GLPA 3E9JB 1VF1A 3F8UA 1DE2A 2WB9A 2O85A 4TR0A 3LGCA 2H0GA 2VL9A 1ERTA 2MMZA 3HVXA 1AIUA 1SKSB 4IKHA 1EV4A 2CVBA 1WMJA 2GSQA 2YV7A 1EV9A 1YEPA 2IMEA 4TXOA 1EEMA 3ED3A 1EGOA 3ERWA 5HR2A 1JZOA 4XHMA 5GAPD 4YAPA 3L0HA 5IMFA 1Z3EA 4HQZA 1TXXA 2AV4A 1OKDA 5ECRB 2ZNMA 5H5SA 5ID2A 1ERUA 4DVCA 4TOPA 2PWJA 3W8JA 1ILOA 3KCMA 2XC2A 4KSMA 4I6XA 4MF7A 1B9YC 1TW9A 2F8AA 5F07A 1Z6MA 4O92A 3G7IA 1GSQA 1R5AA 2CX4A 2C1YA 1ST9A 3QR6A 4ILFA 3H1NA 5GZZB 2GQMA 4WF4A 1GWCA 4ZXGA 3O6TA 3H8QA 2LRNA 3LORA 4WEYA 2M80A 1A2JA 2VO4A 2QKEA 1EEJA 2P5RA 3IV4A 3SBCA 2C80A 1W89A 3U6VA 1J0FA 4OFNA 3RPPA 1K0MA 4Q5QA 2E0QA 4NV5A 2H72A 3G7JA 2LRTA 3ISOA 1Z5YE 4GRFA 4ZL8A 4ZBAA 4EO3A 2IWTA 2O87A 5EY6A 3DWVA 3VK9A 2DMMA 2E2MA 2BJXA 3LXZA 1FOVA 2VCVA 9GSSA 3FZ4A 3HVSA 2L59A 1B8XA 3RHCA 1X9WB 5ECPB 3L9SA 1BAYA 1AW9A 4DSSB 4PXOA 1XBSA 2WZ9A 3KJYA 5ELAA 2H70A 5B8AA 2X8HA 1JFUA 2GZYA 4P3YB 4OWYA 3LG6A 1B9XC 1SENA 5AGYA 3ZZXA 5H5QA 3H93A 2YANA 3KH7A 4PUFC 3KIJA 1K0NA 3IA1A 5CRWA 2PU9C 2GQLA 1MTCA 4ZILA 2GZZA 4IW9A 3IDVA 4PQIA 4KNDA 1K3LA 2WJUA 3TKSA 1VF4A 5DCHA 1YY7A 4LMWA 4OMVA 1BX9A 4RI7A 2WS2A 3CSJA 2OBKA 1A8YA 3DMLA 1PMTA 4TR1A 2B5XA 1UC7A 2GZPA 2GS3A 2AAWA 2X99A 1TK8B 3FEUA 2FD3A 3KD0A 10GSA 1TRVA 3P90A 5DJMA 1WOUA 3L9VA 4IELA 1ZCPA 2O7KA 2FA4A 1J9BA 4PGTA 3M9KA 1JLVA 2NDOA 2XBIA 3KEBA 4XS4A 1UA5A 2IJYA 5ECQB 3HJOA 3HA9A 5D93A 16GSA 3WGDA 4G10A 2FLSA 1TRWA 3M1GA 1F9MA 2VAFA 2B1LA 1S3AA 3APQA 1EOGA 2FY6A 1ZGNA 2DSAA 3I6AA 3WT1A 1Y25A 3IRAA 2G0FA 4TW5A 2VCWA 3IPZA 4N11A 2H6XA 1DSBA 2L57A 2L5LA 2MMAA 4EKZA 3ZTLA 2GTUA 1UVZA 1NSWA 5JWRB 2H76A 4GSSA 2JZSA 2LV3A 4OO4A 3ZLPA 5DALA 4J2FA 1QGVA 1G7EA 3GYKA 5DJLA 2RM6A 3UL3A 1FVJA 4MPGA 3TRPA 4N0ZA 3EC3A 1AC1A 1TK5B 4QL7A 3CRTA 3QD9A 1PRXA 3KP9A 2X8CA 1GSEA 4HQSA 2VOCA 5ID2B 2AB6A 4MJAA 3RBTA 1S3DA 1R5PA 1YJ6A 1XVWA 4AJ7A 3IK9A 2RLIA 6GSSA 2LS5A 1GULA 1TDIA 2L4QA 2GSTA 3ZRDA 4TR4A 2PPTA 4KCAA 4OFTA 3HXSA 2PUKC 3VPTA 2FUG2 5DCGA 2YZUA 4RQXA 2OBIA 2O8VB 4FYUA 4D73A 1OKTA 2MZCA 4ULXA 3TKSC 3L4NA 4CHSA 4WBRD 3EYTA 4CDOA 2KLXA 1M9BA 1Q98A 4I8BA 4KE3A 1GLQA 3L78A 1O7UA 4LLRA 4RUVA 2GSRA 5ECNB 1FB6A 4ECCA 2C0GA 4KUNA 1JHBA 5G2ZA 1N2AA 3UBLA 1V98A 2LJAA 3DVXA 1HQOA 5KEJA 1OC9A 3A5WA 1A24A 1XWGA 2TRCP 1YKCA 3BJ5A 3ZMKA 5KN0A 1PSQA 4J56E 2KUCA 2YWIA 1GNEA 4FH8A 1V58A 3UMAA 1OAZA 4EUYA 2REMA 4MMMA 3H4KA 2OKAA 5CRGA 3H79A 5C04A 2G2QA 4K6XA 5F06A 1GTBA 3MAKA 1GSYA 2BTOT 4MJEA 3DRNA 3ZREA 2JU5A 3MWHA 1HYUA 1O81A 2IMKA 2YWMA 1PQNA 1NHYA 3DKSA 4O32A 2C8UA 1FB0A 5IOXA 1IYHA 2DIYA 3G7YA 5ECLB 1G6WA 2RUEA 5G5FA 3KM6A 4ZB8A 3TRQA 2YWNA 1QUWA 1RK4A 2LSTA 2B7KA 5IOWA 1M2BA 5DAKA 3C73A 2NTOA 1QXHA 2MBTA 3RPNA 4I5QA 4EXJA 2PVOC 2DJJA 3GH9A 1GUKA 4ML6A 1M2DA 3LYKA 1MDJA 4EL1A 1Z7PA 4V2NA 2VLUA 3M8NA 3O76A 4RQRA 5CRHA 4OD7A 4OCFA 5EL8A 3QAWA 4DSQA 2HZFA 4GLTA 3TKRA 2V6OA 3RDWA 4HZ2A 2HYXA 1XZOA 1EOHA 2XPEA 3HJPA 3I43A 1SK0A 2L5OA 2K8SA 1LJRA 5CP1A 2GSSA 2V32A 4NPBA 2AUVA 3S9FA 1ACVA 2NVLA 1H4OA 2FWGA 4MCUA 3CRUA 3A2XA 2WULA 1TRUA 5HR3A 1MDIA 1Y6EA 1GSSA 3ERFA 2CX3A 3IAM2 4ZB9A 4NV2A 5D9TA 4I2UA 4LA1A 3QOUA 2CQ9A 2HXKA 1DBYA 4MABA 3NZNA 2VD1A 2LTKA 5G1KA 4LL1B 4GF0A 5IPGA 1QMVA 1PN9A 1SJZA 5J4UA 3LQ7A 1PA3A 1AQXA 3EU4A 3TKSE 4PNGA 2N5BA 1ZZYA 5CAXA 3IHQA 1J08A 2V1MA 1PKWA 2CAIA 3QAGA 2IFQA 3EMXA 2CV4A 3QDNA 4EDYA 3P2AA 4ZIJA 1GP1A 4V1Ap 1ZOFA 5DQYA 5IIZA 3VWVA 1H75A 1O8XA 3HZ8A 3QFBC 2AJQB 2L6DA 6GSWA 4JU5A 4HU7A 1XIYA 4MZWA 5HFKA 3UVTA 1FW1A 3R2QA 1X9SB 5HQPA 4HJMA 3VWXA 3WGXA 4MH3A 4F2IA 2DLXA 2OE3A 4HDEA 4ID0A 5B7CA 5IMVA 2FWEA 5E4WA 4MLYA 1USBA 4JRRA 2HZEB 4N10A 2HFDA 4H86A 2YNXA 4LL4B 3GA4A 2DJ1A 2R37A 4V2MA 2H75A 2F51A 1M99A 1ABAA 1YQ1A 1W4VA 3L9UA 1PX7A 3GIXA 2VCZA 2M72A 2EIRA 4F82A 2GT6A 3TKPA 2V2GA 1OC9B 4TKYA 3DIEA 1MD3A 4XS6A 1YEXA 3EWLA 5ENUA 3PH9A 4ZBDA 2YN1A 2L6CA 3D4TA 5LNKe 3TB2A 3TOUA 1XWKA 5IMZA 3GKXA 4MF5A 3D22A 2ON7A 3FRCA 1X5DA 5HFIA 3TJGA 2VLTA 3VI5A 3HDCA 4POBA 2H73A 2KP1A 1G0TA 12GSA 3F6DA 2VCQA 1KBNA 3LYPA 5HR0A 3FR9A 2PMTA 2CZ3A 1PL2A 1IYIA 4V2LA 4PURA 4Q5NA 4MF6A 1WRYA 4KGIA 3GRXA 2YV9A 1WPIA 1DUGA 4IBPA 1VF3A 5EVOA 3QCPA 4ECBA 3TOTA 19GSA 1I5GA 1AQVA 4ML1A 4G19A 3GH6A 3IOSA 5C00A 1WP0A 4FYCA 4FIWA 5DVBA 2ZCTA 1ZYEA 1A2MA 5CYYA 4GTUA 5JCWA 1A2LA 1RQMA 3EVIA 3HY2A 3CXGA 4POMA 3QMXA 4MK3A 5JWOB 1BQ7A 4K9ZA 2AHEA 2ON5A 3RAZA 4EF0A 2RM5A 1TK0B 1FAAA 3I9V2 5IO0A 2Z9SA 3GUSA 2GT5A 4NXIA 2H66A 1I9DA 2WFCA 17GSA 5DDLA 3WGEA 5E59A 3OR5A 4IP6A 3Q19A 1M7TA 1GUHA 2LJRA 3ZL5A 2YJ7A 5ECMB 4AGSA 4Z7XA 3E0UA 1HNCA 4XRDA 3FR3A 3J7Yk 1CQHA 1K0BA 1XWBA 3FR6A 1SD8A 5IMDA 1TU8A 2WDUA 3GX8A 3GTUA 5G30A 3F3RA 1M9AA 3TJBA 4EE0A 2VL3A 1Z7RA 1O73A 1O85A 1TKDB 1ML6A 3F9UA 3PGTA 2IMDA 1A0RP 3O3TA 1JLWA 4TXVA 5AISA 3GURA 2IMIA 4TXOB 2CT6A 1T7PB 5JWQB 4IS0A 3C1SA 1TRSA 4HUAA 4K7NA 2VM2A 2TIRA 2WRTA 5IMCA 1OC8A 3QFAC 1SK2A 4POLA 2DJ0A 2NPBA 4GWRA 3C71A 2GDRA 2IN3A 1LU4A 2FA8A 3NIVA 2IMFA 3UAPA 2CAQA 3TJFA 1SL0B 1K3OA 2B5EA 2HLSA 2JSZA 2H6ZA 1TU7A 2FNOA 3FK8A 3LJRA 2VLVA 2B1KA 4QL9A 3SWLA 3ZVJD 3UOMA 1FVKA 6GSVA 3J7Yb 2XBQA 2N5AA 2DJ3A 4ISDA 2C0FA 1M2AA 1HNBA 5AN1A 4YQVA 1G6YA 1HD2A 3UJ1A 5AIVA 2PN8A 1GNWA 1X5CA 1OC3A 3UEMA 1WWJA 2FWHA 2YCDA 2ES7A 4HJ2A 1WJKA 3D21A 1TTZA 3MDKA 5GSTA 4MA9A 2YP6A 3F4RA 1KEBA 2H0HA 2JZTA 3IC4A 3IAS2 5IMAA 3FY7A 1VF2A 5D9WA 3VURA 5JCUA 3VFIA 1T3BA 4KDXA 5J3RA 3KTBA 4PNFA 1XVQA 1PL1A 2V6KA 1KNGA 2DC5A 4JE1A 1T4ZA 1TOFA 1XW9A 4DEJA 1CQGA 5INYA 5A5KA 4NHWA 2M46A 4TN8A 3AY8A 3TJKA 4JEDA 2H8LA 3CTFA 4DSSA 4XCSA 5AIXA 4LMVA 1XXUA 1F37A 3TGZA 4IQ1A 1OE7A 5F8BA 3IXRA 1UN2A 3D4MA 1THXA 5KN1A 4G2EA 4WXTA 2E7PA 5ECIB 4BWSA 2H0IA 2B5YA 2H1BA 4NMUA 2ZUPA 3PR8A 2I81A 3IR4A 3ME8A 4F0BA 1NHOA 2H1GA 6GSTA 4GSNA 2I3YA 2PGTA 4TR1B 2F3MA 2IIYA 2B3SA 6GSYA 5F0GA 2OADA 1SYRA 1K0CA 1U3AA 1GRXA 3ZIJA 2FWFA 4JBBA 2KOKA 1SKRB 1FHEA 3EMPA 3TDGA 1YZXA 3C1RA 1V40A 1R4WA 2C0DA 1B4QA 1T00A 1PGTA 1U88A 2J23A 2YZHA 3F4SA 3BBYA 3ZFBA 1V2AA 5FHIA 4XS4B 1TI3A 3M3MA 3DD3A 2F9SA 4IJIA 1X9MB 3CMIA 3QPMA 4FO5A 4WKWA 3ZYWA 5J5NA 5ECOB 5CREA 5ECSA 2LNSA 2AYTA 4IN0A 4E8EA 3U5RE 3P8WA 1HNAA 2PERA 4WETA 1NM3A 4XTSA 4IJ3A 2R4VA 3CSHA 3HVVA 4K7OA 3D5JA 3A2VA 2C4JA 4YQUA 3A3TA 2K18A 4YH2A 2VL2A 4PQ1A 1GTIA 3DVWA 1ON4A 3LEFA 4IQAA 1K0DA 3F0IA 3M9JA 4E8HA 5A4UA 11GSA 1XFLA 4J57E 2DIZA 2CVDA 4XIHA 1RW1A 5F05A 1TI1A 3IK7A 4N30A 1KTEA 3HJMA 4IP1A 4I97A 5DALB 2H1DA 2XHFA 2FCHA 4L0WA 1XWCA 4BPYA 4BA7A 3HYPA 2CVKA 2JSYA 4KSOA 2ALBA 4HZ4A 2A4VA 3CSIA 1F3AA 3VLNA 2K6VA 1F2EA 2RUFA 1NW2A 4N0VA 1TP9A 4O5RA 1EGRA 2NBSA 1XW6A 4EDZA 3Q18A 4KDYA 1A8LA 4NWYA 4WR5A 7GSSA 2MMOA 5ECKB 1AUCA 1GH2A 4L5LA 1EP7A 3FZ5A 5J9CA 1AXDA 2H6YA 2DJKA 4PX1A 3ZITA 1OE8A 2P0GA 4MH2A 4ECIA 4HS1A 1C72A 4D73B 3V1WA 2GGTA 2WGRA 6GSUA 2LQOA 4KB3A 1XWAA 4XS1A 1A23A 2VIMA 2YJHA 3UIWA 4AF2A 1Z6NA 4HU9A 3WT2A 1GTAA 2MYGA 2A2SA 2HSHA 1MD4A 1EZKA 2IL3A 2H30A 4O7HA 4X43A 4ZL7A 1XPVA 4YAVA 3D0ZA 4GQCA 2H1AA 4OO5A 4DSRA 2VCTA 2GLRA 3LWAA 5JCGA 4KAEA 3W6GA 1ERVA 5D8IA 4K0NA 5DQSA 1TJDA 4TR3A 1A0FA 4K7IA 2FGXA 8GSSA 4BVXA 1SJ6A 1SD9A 4WBJA 3KGKA 2GQKA 4X1UA 1AQWA 1E6BA 1T4YA 1FG4A 4K1FA 1LBKA 4Q5RA 4MJCA 4HI7A 3A2WA 3FZAA 1BYEA 2HSYA 2I4AA 3VI7A 3VWUA 1BG5A 2MMNA 3WYWA 5ELGA 2PBJA 2VL2C 2PVQA 5B8BA 3ZFLA 2OJLA 4EVMA 3KP8A 13GSA 2QC7A 2VUPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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