3TJGA

Crystal structure of human peroxiredoxin iv c51a mutant in oxidized form
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
SKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 57
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjgA00
1B4PA 4LLRA 4HQZA 4PUAA 1N8JA 4IN0A 1YKCA 1WRYA 2LJRA 1SD8A 2HRFA 5B6MA 3L0HA 1AW9A 1B9YC 1PD21 1HD2A 4WBRD 2R6KA 1TRUA 3L9UA 1Z6NA 2O8VB 4OO4A 4RUVA 1VGLA 1W4VA 3ZREA 5IIZA 6GSSA 3HVSA 4WBJA 3P2AA 1MDJA 3GKNA 4WF5A 2B1LA 1PRXA 2FY6A 3ME8A 4TR1A 4LMVA 2HRNA 3KGKA 4ZBAA 3TGZA 4JEDA 17GSA 2DSAA 3TJGA 1A2LA 3Q19A 4O32A 1SENA 5KN0A 5L71A 1SJZA 3TKSE 4IP6A 2IFQB 3GHAA 2TIRA 5DVBA 3UL3A 1OKDA 2P0GA 4EC0A 1F3BA 2C0DA 2LUSA 2OA7A 5D9WA 3KTBA 3ZITA 3K8NA 3FKFA 1VF1A 4F2IA 3RAZA 3QCPA 5CNWA 2LQOA 3ZMLA 5EY6A 2WS2A 1GSQA 1GUHA 5F06A 2YCDA 1A8YA 2C8UA 2H8LA 3EE2A 2FWHA 2E7PA 1OE7A 4HZ4A 1PSQA 1GSYA 4F82A 1GSUA 3ZIVA 2GZZA 2FLSA 4FH8A 3GNJA 2TRCP 2WFCA 5ECNB 4AJ8A 1AQVA 4V1Ag 3HCZA 3DVWA 2YANA 3BCKA 4TVEA 3WYWA 2O89A 1FVKA 3HHVA 3H79A 1YJ6A 3QDNA 3P8WA 1RK4A 1USBA 5JWRB 3VLNA 1U6TA 3LORA 3GL3A 4G9HA 6GSVA 3UVHA 1VF2A 4PGTA 1YF1A 3F6DA 1U3AA 3UOMA 2XPDA 3GTUA 5ECOB 3O6TA 1TRWA 4H86A 3F4SA 2CZ2A 4WR4A 4WF4A 1ILOA 4EE0A 3G7YA 2HXKA 3CSJA 5ECKB 3C7MA 1FW1A 2C3QA 2A2RA 4V2LA 1XOAA 3GV1A 1SYXA 2JSYA 1K3YA 4LL1B 2F8FA 1LJRA 2YJHA 3I43A 1QK8A 1EEMA 2FWEA 2PPTA 1ZYQB 1DE2A 2O85A 1F37A 1K0BA 1GLPA 3MAKA 1U88A 3VWVA 3KP9A 2EIOA 5ECLB 2I3YA 2RM5A 4DVCA 1AAZA 4KSOA 3G9BA 4MDCA 3KD0A 3ZTLA 1PX6A 2HZEA 1Z7PA 1CQHA 1Y25A 2GSRA 4PNGA 4IW9A 2OKAA 3L4NA 4ILFA 4HQSA 3HZ8A 3TRXA 1UA5A 3NZNA 2DMMA 5G31A 1B48A 1RW1A 3A2WA 4I2TA 1Q98A 3IK7A 2K6VA 4XHMA 3KH9A 3LYKA 2LRTA 1X5DA 3WT2A 4TW5A 4IQ1A 1V98A 5COHA 3GH9A 2JZTA 3GSSA 2VD1A 4TXVA 1FVJA 3CRUA 3C1SA 2JSZA 3EYTA 2C3TA 1SKSB 2R2JA 1MTCA 1PA3A 2L4QA 2JZSA 4JE1A 3QAVA 3UMAA 1GP1A 1NM3A 4MZWA 4HU9A 5G1KA 1T1VA 4ZL8A 4Q5RA 1F2EA 2YWMA 5KEJA 2CQ9A 1MDKA 3GN3A 3LGCA 2IL3A 1GL8A 4DSSB 5DCGA 3EINA 3VWXA 4GSNA 4XS6A 1V58A 1A2JA 2FGXA 3LWAA 4YQVA 1PL1A 1THOA 4NHZA 3F0IA 2CT6A 3D0ZA 1GTBA 1OC9A 2F8AA 4GSSA 5GSSA 3I6AA 1Z9HA 1V9WA 6GSXA 1ERUA 1YKAA 1M99A 1SL1B 3HJOA 2OBKA 3QAWA 4GLTA 4EL1A 2AAWA 2EIRA 3LEFA 3PR8A 2V1MA 5GSTA 2PVOC 2XHFA 2LRCA 3KP8A 4NXIA 2CAQA 3QAGA 3A5WA 2H1GA 4XS1A 1TTZA 4IELA 2I1UA 3TRQA 2ON5A 2H0IA 2YJ7A 3KIJA 1GTIA 3HXSA 4JRRA 11GSA 2O87A 16GSA 4V2MA 1BAYA 2GSQA 4PUFC 4MJCA 3QMXA 2H1BA 2QC7A 1ERVA 2WB9A 1R5AA 4OFMA 1JZRA 3F4TA 5IM9A 4ZL7A 3RBTA 4MZCA 2DIYA 4MH3A 3F9UA 3ZVJA 4MF5A 4K7IA 1EOGA 1PGTA 3EU4A 1SJIA 2XC2A 3J7Yb 4I2UA 1AC1A 2REMA 4V1Ap 2KLXA 2OJLA 1A0RP 1GSDA 3FEUA 3FR3A 4L0UA 22GSA 1R5PA 1WPIA 4ZB9A 1XZOA 3VK9A 3QFBC 2LSTA 3C1RA 3IE3A 3WD6A 1I9DA 2HNLA 5AN1A 1TKDB 2C4JA 2X99A 2B7KA 1GTUA 1F6MC 3FZ9A 19GSA 4GCIA 3N5OA 4KUNA 4HOJA 1GUKA 2VL2C 1GUMA 4XTSA 2JU5A 3R2QA 2CVKA 1EEJA 4KDUA 2H30A 4ECBA 3D6IA 2IIYA 2CA8A 4K8MA 3ZFLA 1XWKA 4MJEA 4G2EA 1E2YA 1PKZA 2ZCTA 4YQUA 5JWQB 4DEJA 2P5QA 3C8EA 4L8EA 4IBPA 2FCHA 4NWYA 2DJKA 1BQ7A 1K0AA 1T7PB 18GSA 3KTLA 2FWGA 2MMZA 3I9V2 4IQAA 1XW5A 4K9ZA 4DSRA 3TKSA 1J0FA 1PQNA 3ERGA 5FWGA 2V2GA 3DXBA 2H74A 3HD5A 5G30A 2PGTA 2C0EA 5DAKB 5CAXA 2RUEA 5D93A 2P5RA 3DWVA 3M0FA 1X9MB 4MK3A 1EOHA 1T8EB 1JFUA 4ZXGA 10GSA 5DCHA 4MMMA 4KA0A 1KNGA 4KCAA 2K8SA 1YEPA 3L78A 4ISDA 1M9AA 4L0WA 3ZIJA 2GGTA 2X8HA 1NW2A 4NHWA 4F03A 3U6VA 2L4CA 2B6MA 1OVNA 4MABA 2L6CA 2GLRA 3APOA 3TOTA 4MP4A 3P90A 2H0GA 1R4WA 3DRNA 2H6ZA 2H72A 4OMVA 4X43A 5AIXA 3HDCA 4AJ6A 6GSUA 1QXHA 2VLVA 1ZMAA 4TR3A 1Z7RA 1ZOFA 5IOWA 3US3A 2CVBA 1AXDA 2VD0A 2LTKA 1G6WA 2N5BA 5FT3A 3TKPA 4FO5A 4LL4B 4KX4A 2HSHA 5ELAA 3GX8A 4KAEA 5IMDA 4AF2A 2F9SA 4OD7A 8GSSA 3PGTA 5D96A 5CREA 3JCML 2GVPA 1EP7A 1WIKA 3UVTA 3CTFA 3KMNA 4XCSA 5DBQA 1T4ZA 4NV5A 1YF0A 2B5XA 5JCWA 4KSMA 3A3TA 4BVXA 1MD3A 3FY7A 1JZDA 1VF4A 2NDOA 4TXOB 1GNEA 4HUAA 2H1DA 2ZUPA 2AB6A 2EC4A 5D9TA 2H73A 3ZVJD 2GZYA 4MF6A 2N5FA 4HJMA 4WEYA 2OADA 5HR1A 3F3QA 3IHQA 1K0CA 2YV7A 4QQ7A 5IMAA 1TI3A 3WT1A 1PX7A 5J9CA 3FYGA 3TJBA 1SK2A 3EMPA 4BPYA 5F0GA 5EVOA 1C72A 1BYEA 5FHIA 2XBQA 3E3EA 4ULXA 5GAND 1XOBA 3KM6A 2YWIA 2VM2A 3EURA 2OE3A 3IRAA 4ZBBA 1M0UA 3TDGA 4F9ZA 3UEMA 1SJ6A 4BVYA 4IVFA 3Q74A 3IBHA 4POLA 5JWOB 3IK9A 3C71A 1RQMA 3F6FA 3QD9A 4PNFA 5AIVA 2WZ9A 5DJLA 3LYPA 1K0OA 3IOSA 4O5RA 5DQSA 1XWGA 4GXZA 5CO3A 3OR5A 3L9SA 4I5QA 2VAFA 3CYNA 1LBKA 1GULA 1QUWA 1GSFA 3J7Yk 1KEBA 1ON4A 1TP9A 1MEKA 4FIWA 3RDWA 4TKYA 4X1UA 2IJYA 1ZCPA 2WJUA 2RIIA 3QR6A 1PKWA 2GTUA 1O7UA 3H93A 1SK1A 2VL9A 4GQCA 3QPMA 5HFIA 1EGOA 3IAM2 4MJAA 2DMLA 3EWLA 4D73A 2YPMA 3WGDA 4V2NA 2H76A 3EU3A 4ML1A 1DUGA 3F8UA 2PUKC 4TOPA 4ZL9A 2FUG2 3HZ4A 2V32A 2GT5A 1KBNA 4P3YB 5CRWA 3LG6A 3N9JA 2J9HA 1NHOA 3CMIA 4HDEA 3BD2A 1JZOA 3RPPA 4POKA 1QQ2A 3GKKA 3IDVA 3ISOA 5ECSA 1JLWA 1SL0B 2C3NA 2E2GA 3GSTA 2CX3A 2PN8A 5C04A 2L6DA 3FHKA 5IMVA 2B5YA 3IXRA 2M46A 1X0RA 1TK8B 3FK8A 3D21A 5IQYA 3W8SA 2PBJA 5G5FA 1GLQA 3GRXA 5JCUA 3PINA 4ZIJA 1SK0A 1SKRB 2DBCA 2DC5A 3GKMA 3M9KA 1IYIA 1ZL9A 1TU8A 4MA9A 3SBCA 3MSZA 1G6YA 2H6YA 4O7HA 5D9VA 1ST9A 1XIYA 5IPHA 1BEDA 5CRDA 5H5RA 1YQ1A 1NHYA 4MF7A 3CXGA 2FHEA 5KN2A 4MLYA 1TOFA 1K0MA 4IP1A 3M8NA 3VFIA 4E8EA 5G5EA 4IS0A 1PMTA 4N0ZA 5IOXA 1TJDA 2YZHA 1DE1A 1ERTA 1ZGNA 4YH2A 2YWOA 1TI1A 1OE8A 1W89A 2K9FA 5J4UA 1MD4A 2C80A 3G7JA 3TJFA 5IMCA 4CDOA 2GSSA 4JU5A 3IV4A 4HU7A 6GSWA 4GSTA 2C0GA 3E9JB 5LCZA 3FZ4A 4KH7A 3Q18A 1HNAA 1OC3A 3NIVA 1TK0B 1B4QA 5IMFA 4OCEA 5IPGA 5ID2B 5INYA 3CRTA 1A8LA 2HSYA 2A2SA 2WRTA 2VL2A 1SKWB 2B3SA 3BCIA 1TXXA 3KJYA 2CAIA 1FHEA 1EP8A 1FO5A 2FWFA 2QSIA 1VRSD 1GH2A 3GFKA 4PX1A 2OACA 1YDKA 2VM1A 2RUFA 1HYUA 4HI7A 1HNBA 4KE3A 2O7KA 1ACVA 3S9FA 2EIQA 3GTUB 5ABRA 1MDIA 4LA1A 5DALB 2CZ3A 4EDYA 3FRCA 1A24A 4CHSA 4N0VA 3HY2A 3ZLPA 5C00A 1OYJA 3ERWA 1T4YA 5H5QA 3PH9A 1AQXA 2G2QA 1G7EA 3ME7A 3BOAA 3GYKA 2OBIA 5ELGA 2BJXA 2L57A 1UC7A 3TKQA 2DJ0A 3QFAC 2IFQA 4ID0A 1SYRA 4ZBDA 1QMVA 2L59A 3DGQA 3G7IA 2IMKA 3MNGA 3UBLA 2HZEB 2GQKA 4OFTA 1TDIA 4OFNA 5LD0A 3IR4A 4RI6A 4I97A 4QL9A 3UBKA 2NPBA 4MZBA 5GAPD 1G0TA 2I81A 1S3DA 1OKTA 4OWYA 2HFDA 2D2ZA 3A2VA 4FYBA 3F3RA 5EPFA 4KDXA 2Z9SA 1V57A 3IA1A 4MH2A 2PVQA 1K3LA 2JZRA 4HZ2A 2P31A 2YOIA 2H75A 3DYRA 2G0FA 3SWLA 3TCOA 2E2MA 2OE0A 2WGRA 2GDRA 4RQRA 5ECHB 2J23A 4KW6A 5DJMA 1DSBA 2KP1A 1WJKA 4FYUA 3LSZA 2MBTA 4EO3A 2AYTA 4NV2A 4WR5A 3GUSA 1PN9A 1F3AA 2AJQB 4O92A 1XW6A 5DDLA 1O85A 3DKSA 4IGJA 3KH7A 3D4MA 3W8JA 4ECCA 1GSEA 3H1NA 2B5EA 1WP0A 4TN8A 2VCQA 1OC9B 1FB6A 4PXOA 1GTAA 2MMOA 2X8CA 4POBA 3CSIA 1XVWA 2DIZA 4KB3A 2GT6A 1SD9A 3GA4A 4EF0A 2QGVA 3TRPA 1XWBA 4QL7A 1T3BA 4DSQA 1JZWA 3O76A 3CBUA 1ABAA 4K0GA 1THXA 1M2AA 2LNTA 3VURA 4EDZA 3A2XA 4MPGA 3O3TA 1Z5YE 2H70A 1O81A 1T00A 5HR3A 4RQXA 3ZL5A 3D22A 5A4UA 4K7OA 5F8BA 3VI7A 1O8WA 5IO2A 4NMUA 3F63A 2AV4A 2BTOT 5HFKA 3BJ5A 5D8IA 6GSYA 2M80A 5ECPB 2V6KA 1U87A 1FB0A 1K0DA 3TJJA 2R37A 2X64A 4XIHA 2RM6A 2JACA 1WE0A 1YEXA 2DJ2A 3ERFA 3GMFA 1X9WB 1TW9A 3GH6A 4YAVA 2MZCA 2ZNMA 1YZXA 2KP2A 2N5AA 2V6OA 2HE3A 2KUCA 4Q5FA 2VOCA 2I9HA 3LJRA 1ERWA 2VCZA 4G19A 1Z3EA 2ES7A 3H4KA 2GQMA 3KMOA 3GURA 2VLUA 4GF0A 5HR2A 4KGIA 5KN1A 1XBSA 3U5RE 3HVXA 5H5SA 14GSA 5ENUA 3EC3A 5AGYA 5CRHA 1BG5A 1IYHA 5LNKe 4DSSA 1SL2B 4IHUA 3RHBA 3IPZA 1TU7A 2V41A 2TRXA 4EUYA 4YQMA 1PL2A 4PQHA 2HZFA 2AHEA 4RI7A 2IN3A 3HJMA 3NOFA 5HQPA 4TRXA 5B8BA 3V1WA 4XS4B 1O8XA 2MBSA 4BWQA 6GSTA 3TOUA 1V40A 3TUEA 4WKWA 4KCEA 4I6XA 2HI7A 1XCCA 2PU9C 7GSSA 1EGRA 5B6NA 5D73A 3ZMKA 5CYYA 3QOUA 2CX4A 5ECIB 5ID2A 2IWTA 2GSTA 5J41A 4HEA2 4MJBA 3MDKA 4PURA 2GZPA 4MCUA 13GSA 1J9BA 2F51A 1GNWA 5F07A 2HT9A 5JCGA 2JADA 1K0NA 5G2ZA 2NTOA 2YNXA 5F05A 4Q5NA 4F0CA 2MYGA 4OO5A 3VWWA 1XFLA 3GIXA 2IMDA 1URMA 2H66A 2LEGA 2WCIA 2YZUA 1EWXA 1R7HA 3EVIA 4N11A 1M7TA 4GQFA 1V2AA 5DALA 2DLXA 3HYPA 5J9BA 1G7OA 3LXZA 1H4OA 5HFGA 1H75A 1JLVA 3UIWA 4EXJA 1FAAA 1ZZYA 1VF3A 2C1YA 5A4WA 2H19A 3HA9A 3UARA 4GRFA 5IO0A 1FG4A 1K3OA 2RLIA 2JL4A 5A4VA 3I69A 2YP6A 3DEXA 3Q6OA 2WULA 2R3XA 1QFNA 4G10A 3ZYWA 5EL8A 2L5LA 2H71A 4JR6A 3RHCA 3RPNA 4TR1B 2LV3A 2DJJA 2PWJA 2GQLA 3MWHA 4BL7A 4TR4A 1X5EA 2XBIA 2H1AA 2E0QA 2R5GA 5ECMB 5J3RA 3KEBA 1M2BA 2H0HA 4JBBA 1ZYEA 3UJ1A 4ZB6A 4JR4A 4EVMA 4LMWA 2MMNA 2QKEA 2X8GA 5D9XA 1B9XC 4K2DA 3D4TA 2A4VA 4KNDA 1N2AA 2H6XA 2PERA 2VIMA 4J56E 4ECIA 1OC8A 2IPAA 5DAKA 3KCMA 5ECQB 3FR6A 2LS5A 2IMFA 1O6JA 5B8AA 4POMA 4J57E 5ECRB 1AQWA 5E4WA 1XW9A 3HJPA 1X9SB 2K8VA 1GSSA 2YV9A 1GRXA 1TK5B 1XVQA 3DIEA 2VUPA 3W6GA 2I4AA 1YY7A 5DQYA 2VCXA 1XWAA 2DJ1A 2CV4A 3APQA 2CVDA 1F9MA 5E59A 3EMXA 4CW9A 2BMXA 4GTUA 2NVLA 2IMEA 2VO4A 4WETA 1EV4A 1HQOA 1U3IA 2FD3A 4NAXA 2B7JA 3TKRA 3CSHA 3P7XA 3DMLA 4EKZA 2LKUA 4WXTA 5IMZA 3FZAA 3HVVA 4IKHA 1Z6MA 20GSA 1M9BA 2L5OA 3IC4A 4PQ1A 4BWSA 2WDUA 2LRNA 5AISA 1XPVA 1ML6A 4KDYA 2LJKA 5CRGA 1J08A 2LJAA 2FNOA 5CP1A 4ECJA 2LQQA 1R26A 4YAPA 2NBSA 3FZ5A 3VPTA 2VCVA 4ZB8A 4D73B 5G1LA 3KZQA 4IJIA 1FOVA 3DVXA 2KHPA 4TXOA 1UVZA 3D5JA 3VWUA 1XXUA 1BJXA 3GKXA 1EV9A 2DJ3A 2H01A 1KTEA 3TJKA 3KXOA 2K18A 1UN2A 2F3MA 3ED3A 1QGVA 4XRAA 3VPQA 2OE1A 3M9JA 1B8XA 4GWRA 1BX9A 4L5LA 1X5CA 4I8BA 4HS1A 3HKRA 2ALBA 3LXTA 3L9VA 4JZQA 4IJ3A 4NPBA 3WGEA 2PMTA 4J2FA 2B1KA 2VL3A 1LU4A 3DD3A 4N30A 2M72A 1TRVA 2HYXA 3ZFBA 4X0XA 4K6XA 1A0FA 2XPEA 4E8HA 2YN1A 4PQIA 2HLSA 2IMIA 3M1GA 4XS4A 1WWJA 4Z7XA 1HNCA 1XWCA 4Q5QA 4HJ2A 1M2DA 3F4RA 3GX0A 5GZZB 3TB2A 3M3MA 3ZRDA 4OCFA 3WGXA 1Q4JA 1DBYA 2FA4A 4ACSA 4L5OA 2FA8A 3BBYA 4BA7A 1S3AA 1I5GA 3ZZXA 3FR9A 2GS3A 3GL5A 3IAS2 3AY8A 2VLTA 3FW2A 3H8QA 2VCTA 1S3CA 5HR0A 1NSWA 1OAZA 3E0UA 4ZILA 5A5KA 4F0BA 4ML6A 3C73A 4XRDA 4AJ7A 3UAPA 1E6BA 2LNSA 1Y6EA 2KOKA 4K0NA 12GSA 3APSA 1AUCA 1TRSA 2R4VA 2ON7A 5KN3A 2YWNA 1JHBA 4K1FA 4FYCA 1SU9A 4TR0A 4K7NA 4AGSA 2C0FA 1O73A 5J5NA 1EZKA 2AUVA 9GSSA 4N10A 2VCWA 1GWCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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