3EYTA

Crystal structure of thioredoxin-like superfamily protein spoa0173
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
156
structure length
156
Chain Sequence
SNAMKAPELQIQQWFNSATDLTLADLRGKVIVIEAFQMLCPGCVMHGIPLAQKVRAAFPEDKVAVLGLHTVFEHHEAMTPISLKAFLHEYRIKFPVGVDQPGDGAMPRTMAAYQMRGTPSLLLIDKAGDLRAHHFGDVSELLLGAEIATLLGEAAP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Silicibacter pomeroyi
publication title Crystal structure of Thioredoxin-like superfamily protein SPOA0173
rcsb
molecule keywords uncharacterized protein SPOA0173
total genus 42
structure length 156
sequence length 156
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eytA00
2YZHA 4ID0A 2CVKA 4PX1A 2IMEA 5EY6A 5B7CA 1I9DA 3EU3A 4FO5A 3WD6A 5IMZA 3TRPA 3D6IA 1FB6A 4AJ7A 5J4UA 2I9HA 4NV5A 2CT6A 2DJ2A 5G31A 1M0UA 3CSHA 1XFLA 2ZUPA 4HUAA 3D21A 4AF2A 1XWBA 4I2UA 1PX6A 3LYKA 2F3MA 2VL2A 2VCZA 2IPAA 2IMDA 4J2FA 1HNBA 4AJ8A 4TR1A 3IBHA 2VCTA 4EO3A 2WZ9A 1SK1A 1PQNA 5DBQA 1WWJA 5B8AA 3ZITA 5G5FA 5JWRB 2H71A 4ZBDA 2H6XA 4MJBA 1DSBA 3P90A 1NSWA 2IN3A 4ZXGA 3IC4A 2OE1A 3APOA 4OCFA 1TK0B 1SKWB 1FHEA 3GKNA 3GMFA 1BAYA 4BL7A 3FZAA 3H4KA 1MD4A 5F07A 3TKQA 3UL3A 1MDJA 3VWUA 1O7UA 5A4VA 2H30A 4OO5A 1Z6NA 3W8SA 2OA7A 1T4ZA 1K3OA 4ZL8A 3F8UA 2C3NA 2H0HA 2LQQA 6GSSA 1A23A 3A2VA 4Q5QA 3LXZA 3FZ9A 3FEUA 1NW2A 4ECBA 1A8YA 1PRXA 2B6MA 2JACA 2IWTA 1K0DA 2WFCA 2CV4A 2NBSA 3KZQA 5KN2A 4FIWA 3HJPA 4MDCA 2FHEA 3C73A 5D9XA 3NOFA 2F8FA 4KW6A 3HHVA 3KIJA 2GS3A 1OAZA 3FW2A 2VIMA 4WR4A 1YKCA 1F3AA 1UA5A 1WMJA 4EE0A 1SJZA 3IE3A 5DALA 5AN1A 4E8HA 1EZKA 3GSTA 3C1SA 1F6MC 5LNKe 5DQSA 1XW9A 4NV2A 3PINA 4LMVA 5C04A 2XPDA 1KBNA 1OE8A 2RIIA 4ZBAA 3F0IA 2GT6A 2VLUA 2VCXA 2H70A 3H79A 3TJJA 3UIWA 2I3YA 5F05A 1E6BA 14GSA 2FNOA 2FGXA 2FUG2 2H01A 4IVFA 3E3EA 3HKRA 3DD3A 5AGYA 4WF5A 3MNGA 3Q18A 4MPGA 2JZSA 3C8EA 4KDXA 2DC5A 4JZQA 5D9WA 2VD1A 5IMVA 1XPVA 17GSA 4NAXA 5HR3A 4XS4A 3LEFA 2CX3A 3TKRA 5CO3A 3RHBA 4MP4A 5GSSA 2X99A 1VF2A 3HDCA 1GTUA 2LV3A 1PL2A 2V1MA 1SD8A 1TU8A 5DJLA 2WRTA 3A5WA 3RDWA 2IFQA 4POKA 1ABAA 2YWNA 3ZIJA 1F3BA 2WGRA 5ECNB 5A4UA 3VWXA 4E8EA 1T7PB 2V32A 2BTOT 5IMAA 2H0GA 5ECLB 1ACVA 4YQMA 5H5SA 3HCZA 2GQMA 1RW1A 4WR5A 5IPGA 5DQYA 3QFAC 5KN0A 2I81A 1TK5B 5J41A 4IQAA 4ML1A 1FG4A 5ECIB 2O7KA 5ENUA 4K7IA 3ZL5A 3H93A 5AISA 3IOSA 5AIXA 1VGLA 1YEXA 2ON5A 3VWWA 1VF3A 4HQSA 5E4WA 4F2IA 3L0HA 3DVWA 1O73A 2LRNA 2B7JA 3IK9A 2KP1A 1XVWA 3HY2A 1USBA 5G1LA 2M72A 2L4QA 5H5QA 3ZZXA 4ISDA 1FVJA 2L5OA 1K0BA 2C8UA 1XZOA 1Y25A 1M2DA 1QFNA 4G9HA 18GSA 3U5RE 3DVXA 1DE2A 1O6JA 2A2RA 1TXXA 2IIYA 4HI7A 1W89A 3CSJA 1NHYA 4QQ7A 2YZUA 1EEMA 1M9BA 5ECHB 3QD9A 2LNSA 3IHQA 2B1KA 4WEYA 3K8NA 4OO4A 3M9JA 5JCUA 4GSTA 1TW9A 2DJ3A 3CXGA 2YWOA 5D93A 5INYA 2F9SA 5FHIA 1E2YA 4NPBA 5J9BA 2VM1A 3EU4A 3TUEA 1GH2A 2VCVA 2IMKA 3PGTA 4KH7A 3LXTA 2DJ0A 5IOWA 4RQXA 1Z6MA 3CSIA 4N0VA 1OKDA 2B5YA 5ECKB 4OFNA 2FCHA 2C0DA 5ECQB 2H19A 2L6CA 2JZTA 3EMPA 2HE3A 2OKAA 3LWAA 3C1RA 1G0TA 4V2NA 7GSSA 3KTLA 4MCUA 3UBLA 1NM3A 1XWKA 1TRWA 4ZBBA 2H8LA 4JBBA 2DJKA 3P7XA 1H4OA 4JRRA 3TOTA 4FYCA 3QCPA 3GH9A 3ZFLA 1U3AA 5C00A 1G7OA 2IJYA 4KCAA 8GSSA 5HR2A 4LLRA 2FWHA 2FY6A 4F82A 3CMIA 2VLVA 3D5JA 2HRFA 1X5DA 3VPTA 4KGIA 3GKXA 2HI7A 1ZYQB 2LJRA 4TR3A 1TP9A 5D9VA 2GZYA 1X9SB 3Q19A 1J08A 1AC1A 4TVEA 2P5QA 2FA4A 3DIEA 2JSZA 2HZEA 5IQYA 2J9HA 3E9JB 5B8BA 2F8AA 4V2LA 1ZZYA 3FYGA 1SL2B 3HVXA 2R6KA 1ML6A 1BEDA 3ZMLA 4GQCA 3HA9A 2BMXA 2HXKA 1EGOA 1GL8A 3N9JA 2LKUA 4QL9A 2I4AA 3G7JA 1FO5A 22GSA 1SYXA 4K9ZA 3HVVA 4QL7A 3TKPA 2WJUA 4PQ1A 3GL3A 4JU5A 4P3YB 3IAM2 2HFDA 4TXOA 4GF0A 4DSQA 1QXHA 2B7KA 1SKRB 3QDNA 3D4MA 1X9WB 1SL1B 2LJAA 3KCMA 3F4SA 2ZNMA 1U88A 2M80A 4NWYA 3UOMA 3OR5A 2OE3A 2ON7A 1ZGNA 2YPMA 2QSIA 3TRXA 5CRHA 1UVZA 2NVLA 4ZILA 1GP1A 1KTEA 3MDKA 2CZ3A 4TRXA 4MJCA 4WXTA 2VL2C 1B9XC 2H66A 4V1Ap 2B5XA 3RBTA 2F51A 4DSSB 1M7TA 3I69A 1Y6EA 2Z9SA 2YJ7A 2CX4A 2WULA 3J7Yb 1S3AA 5GAPD 1GULA 3WYWA 4JR4A 4HZ4A 1XVQA 4Q5FA 5A4WA 1QQ2A 4EL1A 3KEBA 2L4CA 2JSYA 3EE2A 2K9FA 2K8VA 3KH9A 5ECMB 1LJRA 3NIVA 1JLVA 1YKAA 3P2AA 5DAKB 2NPBA 6GSWA 1AQWA 3FR9A 2VCQA 3HZ4A 4KB3A 19GSA 5DJMA 1SENA 4ECIA 2WDUA 3VK9A 4PXOA 4XCSA 1A0FA 3C71A 5F06A 2P0GA 4NHZA 4DEJA 3N5OA 1K0MA 3IK7A 5D96A 1EWXA 1FW1A 3HVSA 2C3TA 3IRAA 2EIOA 4HQZA 3KMNA 2X8CA 2N5AA 2GLRA 1JZRA 2K8SA 2DSAA 4HU9A 3EWLA 4XIHA 2ES7A 3QAGA 3CYNA 5ELAA 1J0FA 2AB6A 4KDYA 2GTUA 3BBYA 2YWMA 4L5OA 3TGZA 3DXBA 4MH3A 5F8BA 4HJMA 3RPPA 1R5PA 11GSA 4D73A 2WS2A 4EC0A 5HQPA 1TOFA 4I6XA 3MWHA 4ACSA 3M1GA 4L0WA 3UARA 1T1VA 1FVKA 1V98A 3L9UA 4K2DA 1U3IA 3G7YA 1YQ1A 3GKMA 1PL1A 3AY8A 1BX9A 4HOJA 3ZVJA 4WKWA 2KP2A 2VCWA 4JEDA 4IBPA 4OMVA 2C3QA 4I2TA 4MMMA 4POLA 4POBA 3MSZA 2XC2A 3UEMA 4O7HA 5COHA 4TR4A 1Z3EA 1GTBA 3VLNA 4PUFC 1THOA 3DKSA 4G10A 1DUGA 2IMFA 13GSA 2VL9A 2R4VA 2GSSA 3EVIA 4N30A 2LEGA 1ZL9A 3IDVA 4DVCA 2MMOA 1X5CA 1QGVA 4K6XA 3L9SA 4OFTA 1TDIA 2QGVA 3TCOA 2OJLA 3ZIVA 3CRUA 4IJ3A 1K3LA 2QC7A 3V1WA 3GKKA 1YJ6A 1AIUA 4LA1A 1B8XA 1IYIA 1K3YA 2OBIA 5J3RA 4K1FA 2B3SA 1C72A 3QMXA 5CRDA 3QFBC 4X1UA 3EYTA 2L59A 3G7IA 2CVBA 4ECJA 2JZRA 1ERUA 1K0OA 2V41A 3M3MA 5CRGA 3BOAA 2H6YA 5F0GA 3VI7A 3EC3A 4MH2A 20GSA 2MYGA 5ABRA 2AYTA 2H0IA 4TR0A 1PGTA 2YNXA 4GXZA 2B5EA 3UJ1A 3WGDA 4WETA 5ID2A 4MJAA 1V40A 3GH6A 3I9V2 4TN8A 2C0FA 4CHSA 4PUAA 1F2EA 5AIVA 1OVNA 3ME7A 2L57A 4TR1B 4AGSA 1DE1A 4GLTA 2E2GA 3KP9A 5H5RA 4KAEA 4WBJA 1WOUA 3GRXA 5CREA 2XHFA 4HJ2A 1A8LA 2VD0A 2LRTA 4BA7A 5JCWA 4O32A 4WBRD 4GWRA 3HZ8A 3PH9A 2OADA 3FZ5A 3F6DA 4KUNA 2O85A 1BJXA 3H8QA 3KXOA 1Z7RA 1O81A 3W8JA 2DIYA 3LJRA 4IJIA 3KGKA 1XCCA 2RM5A 1GUHA 1XW6A 2KLXA 3F4RA 3FR6A 1QUWA 2VAFA 4H86A 9GSSA 1X5EA 3ED3A 2FA8A 4KX4A 4FYUA 3TOUA 1THXA 1U87A 2P31A 4KDUA 2LSTA 4MJEA 2GZZA 2RLIA 2ZCTA 4LL1B 1A2LA 4XRDA 3ISOA 4DSRA 2NTOA 4BVYA 1FOVA 1WPIA 3DWVA 3HYPA 4RQRA 1ERVA 1MDKA 5G5EA 3ZTLA 1AXDA 2YWIA 2PUKC 1OC9A 3EINA 1GNEA 4PQIA 1O8XA 2MMAA 2E0QA 4GSSA 1N8JA 3BD2A 5GSTA 3VURA 3UVTA 3VPQA 4HZ2A 1JFUA 1MD3A 1JZOA 4MLYA 2WCIA 2R5GA 3KM6A 2YP6A 3G9BA 3M8NA 4F03A 1LBKA 2XPEA 3GURA 3QR6A 5DALB 4ZL9A 2LTKA 4L5LA 3VWVA 4GCIA 4K0NA 5IOXA 1GLQA 4ZB6A 1EOGA 4MF6A 3R2QA 2TIRA 3ZMKA 1PD21 5G1KA 2DLXA 1ERWA 4RUVA 1YY7A 1WE0A 3BCKA 2KOKA 2H1GA 3S9FA 1Q4JA 1JLWA 1OYJA 4XS1A 5KN1A 4IELA 2HSYA 3TRQA 2H6ZA 3LG6A 4KSOA 3EMXA 3BJ5A 3TJBA 2HLSA 2MBTA 2LRCA 5DCHA 4PURA 4XS4B 1SD9A 2ALBA 1RQMA 1GTIA 1OC8A 1TKDB 3TB2A 4GSNA 2CAIA 5HR0A 2H74A 2CZ2A 3LQ7A 2IFQB 1XBSA 3L4NA 3L9VA 1B48A 1OC3A 4N11A 5IMCA 3I6AA 2DMLA 2CVDA 4PGTA 4MZWA 3O3TA 3DGQA 2YANA 1BG5A 1V9WA 2H72A 3C7MA 3GYKA 3DRNA 1GLPA 4BWSA 2C80A 3ERGA 1M2BA 4HDEA 3SBCA 2DJJA 5CAXA 4MA9A 2YV7A 3M9KA 4NHWA 2EIRA 3RPNA 3UAPA 5B6NA 4YAPA 2G0FA 5KEJA 1B4QA 3D4TA 1Z5YE 2FLSA 2GSRA 4EKZA 1BYEA 1M9AA 2H73A 3FRCA 4K0GA 3GV1A 1TRVA 1GSFA 2X8GA 1GRXA 4TOPA 1HD2A 2HZFA 1ZCPA 1R26A 2AJQB 2FWGA 3QOUA 1KEBA 2JL4A 2FWFA 3FR3A 4ULXA 3LORA 2RUFA 1Q98A 4MABA 4JE1A 1B4PA 3D22A 1EP7A 5D8IA 4HEA2 1PA3A 3IR4A 2MBSA 5ECOB 3LYPA 2EC4A 5CRWA 3GHAA 3TJGA 4FH8A 4KE3A 3BCIA 4TW5A 3TKSA 5JWOB 4J56E 4ZL7A 2H76A 4N0ZA 12GSA 4GRFA 3F6FA 4HS1A 4F0BA 3APSA 4KCEA 1GWCA 2PN8A 5IMFA 1R5AA 3VFIA 1TJDA 3L78A 1V57A 2C0EA 2GGTA 1VRSD 4EDYA 4N10A 4IHUA 2FD3A 5EPFA 1WRYA 4J57E 4MZBA 3D0ZA 4L8EA 2N5FA 5DDLA 2V2GA 1GTAA 3VI5A 4MF5A 3F3QA 1CQGA 1XWCA 3F63A 1HNCA 1S3DA 2BJXA 1K0AA 3Q6OA 5HFIA 3GNJA 2GSTA 1X0RA 3CRTA 1A2MA 3W6GA 3UMAA 3ME8A 4G19A 2VUPA 2E7PA 4G2EA 2MMZA 3GA4A 3WGEA 3LSZA 5CYYA 1TRSA 1SK0A 1N2AA 2G2QA 2VO4A 4JR6A 2VOCA 2C1YA 4ZIJA 2PGTA 5G2ZA 4FYBA 1W4VA 1URMA 2A2SA 3US3A 4I5QA 1CQHA 1F9MA 3RAZA 4AJ6A 5J5NA 2IL3A 1ZYEA 3Q74A 3KJYA 2B1LA 1V2AA 3KD0A 2GVPA 2PBJA 1GSEA 3FK8A 2O87A 3ZYWA 1YEPA 2OBKA 4K8MA 4F0CA 2L6DA 5ECSA 2V6OA 2AV4A 3TDGA 2YN1A 2HZEB 1ST9A 3KTBA 1XOAA 3IXRA 2PVQA 2VLTA 2DBCA 4MPFA 5KN3A 3GSSA 1EGRA 4IW9A 2FWEA 3KMOA 1XWGA 2GQLA 16GSA 4O5RA 3ERFA 1AAZA 4OWYA 1YZXA 3TJKA 1MTCA 3F9UA 5JWQB 3O76A 1I5GA 2R2JA 4EUYA 5FWGA 1FAAA 2OACA 2YCDA 1K0NA 3GUSA 1Z9HA 4TXOB 1JZDA 5E59A 2NDOA 3IV4A 1A0RP 3DYRA 1RK4A 4HU7A 2P5RA 1UN2A 1J9BA 2GZPA 3FY7A 5HFKA 3H1NA 4PNFA 4ML6A 5D73A 2H1BA 2CQ9A 2LUSA 3HD5A 5LCZA 3ZLPA 4EVMA 4EF0A 2GQKA 2RUEA 2JADA 4RI6A 1T3BA 2LS5A 1TK8B 4YQUA 1NHOA 3U6VA 2HNLA 2PWJA 4IN0A 1GUMA 2PVOC 1T8EB 5FT3A 6GSUA 1OE7A 3GIXA 4MF7A 2MMNA 2D2ZA 3DMLA 1T4YA 3WGXA 4XRAA 5DVBA 4IKHA 3IA1A 1B9YC 2TRCP 3JCML 1PN9A 4LMWA 3CTFA 2VL3A 1GSYA 1G6WA 6GSXA 5CNWA 2LJKA 4EXJA 2PMTA 1GSDA 5IMDA 3GTUA 1GSQA 4CDOA 1R7HA 4XTSA 4POMA 2RM6A 2L5LA 1HYUA 1XWAA 2J23A 4F9ZA 3GL5A 2GDRA 4IQ1A 3FZ4A 3NZNA 1AQVA 4Q5NA 5IM9A 4X43A 3RHCA 3IAS2 1A24A 5IPHA 2YOIA 1SKSB 4K7NA 4OD7A 3A2XA 1GSSA 1AW9A 3WT2A 5ECRB 2XBIA 2MZCA 3HJMA 2K18A 1M99A 5A5KA 3O6TA 1V58A 1MDIA 4Q5RA 2H75A 1T00A 2K6VA 4L0UA 1SK2A 4D73B 2LQOA 3ZFBA 1UC7A 4KSMA 3A2WA 4RI7A 1JHBA 2HYXA 2O89A 3A3TA 4IS0A 1A2JA 1SJ6A 4OCEA 1TI3A 5ELGA 5EL8A 4MZCA 2PU9C 4XS6A 4EDZA 4LL4B 2JU5A 2KHPA 5IO2A 1AQXA 2IMIA 2OE0A 1PKZA 4OFMA 4X0XA 2REMA 1VF4A 1WP0A 1PKWA 4DSSA 4PQHA 1SJIA 5ECPB 3SWLA 2AUVA 1S3CA 2LNTA 5IO0A 4BVXA 1X9MB 1TTZA 3QAVA 2DJ1A 1VF1A 1ON4A 1ZMAA 2WB9A 1QK8A 4CW9A 2V6KA 1O8WA 1EEJA 2GT5A 2H1AA 3ZREA 3J7Yk 2I1UA 1SYRA 3ERWA 2CAQA 10GSA 5DAKA 4BPYA 4ZB8A 4NMUA 5DCGA 3GFKA 5IIZA 1ERTA 2N5BA 5L71A 1TU7A 4YQVA 2R3XA 4PNGA 1WIKA 3APQA 3KP8A 3CTGA 1MEKA 2YV9A 1EV9A 1R4WA 3QAWA 2PERA 4TKYA 5G30A 5LD0A 1BQ7A 4IP1A 1ILOA 2HT9A 1TI1A 2AHEA 2X8HA 1GUKA 4V2MA 2C0GA 4MK3A 1OKTA 1EOHA 1Z7PA 4K7OA 2XBQA 1TRUA 1EV4A 2R37A 2HRNA 3E0UA 6GSTA 2KUCA 1XW5A 3UBKA 4ECCA 2TRXA 1O85A 1EP8A 1ZOFA 1IYHA 2O8VB 5GZZB 5ID2B 4ILFA 3EURA 5GAND 3IPZA 3F4TA 4KA0A 1G6YA 4IP6A 1XIYA 2X64A 5JCGA 5B6MA 2HSHA 3GTUB 1PX7A 2PPTA 1WJKA 3ZRDA 3CBUA 3LGCA 1F37A 2AAWA 1QMVA 2CA8A 2E2MA 3MAKA 4NXIA 3WT1A 6GSVA 2GSQA 3FKFA 1YF1A 3TKSE 1G7EA 3M0FA 2VM2A 1JZWA 2H1DA 4GQFA 5J9CA 1SU9A 3F3RA 2DMMA 4I97A 4XHMA 4BWQA 1GSUA 2DIZA 5D9TA 5HFGA 2A4VA 3HXSA 4V1Ag 3QPMA 3HJOA 1SL0B 3DEXA 4IGJA 3LFLA 2M46A 3TKSC 3UVHA 4YAVA 6GSYA 1U6TA 3ZVJD 3PR8A 1AUCA 1FB0A 1PMTA 5HR1A 3TJFA 1PSQA 2EIQA 4KNDA 4GTUA 4WF4A 5EVOA 1LU4A 2QKEA 1XXUA 5CP1A 2YJHA 4YH2A 3FHKA 1HQOA 1H75A 1KNGA 1YDKA 1HNAA 4ZB9A 1GNWA 3GX8A 4O92A 1M2AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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