3EYTA

Crystal structure of thioredoxin-like superfamily protein spoa0173
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
156
structure length
156
Chain Sequence
SNAMKAPELQIQQWFNSATDLTLADLRGKVIVIEAFQMLCPGCVMHGIPLAQKVRAAFPEDKVAVLGLHTVFEHHEAMTPISLKAFLHEYRIKFPVGVDQPGDGAMPRTMAAYQMRGTPSLLLIDKAGDLRAHHFGDVSELLLGAEIATLLGEAAP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords uncharacterized protein SPOA0173
publication title Crystal structure of Thioredoxin-like superfamily protein SPOA0173
rcsb
source organism Silicibacter pomeroyi
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 42
structure length 156
sequence length 156
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eytA00
3MSZA 3TJGA 2LJAA 2KOKA 2OBKA 3CTFA 3D4TA 1URMA 4MMMA 3VFIA 3F4RA 2QC7A 4WR5A 4K2DA 2HE3A 5HR2A 5COHA 1GSDA 3GIXA 4MJAA 1GSFA 5IPHA 2H66A 2O8VB 1OKDA 5IO2A 3KMOA 1ZCPA 3M3MA 2FGXA 4NXIA 1DBYA 3M0FA 2RM6A 4EVMA 2DBCA 2X8HA 2VLVA 3UMAA 1TKDB 3KMNA 2ZUPA 4PUAA 3UBLA 5A4VA 4ZL8A 1R5PA 4EDYA 3CBUA 3G7JA 1AUCA 1A2JA 3GURA 2GZPA 3EC3A 3FK8A 5CP1A 4MF6A 2K8SA 3RHBA 2F51A 1WWJA 4HU9A 2R6KA 1M2AA 1F6MC 4ZB8A 3WGEA 3TB2A 2GT5A 1OC8A 3A5WA 4DEJA 1TW9A 4XTSA 3L0HA 3FZ9A 3I69A 3GKNA 3SBCA 1GSUA 2LRNA 3M1GA 2QKEA 2V1MA 3J7Yk 1Z7PA 1SL2B 2E2GA 3F6DA 3ME7A 1N8JA 4V1Ag 1SL0B 2PBJA 4OCFA 4BL7A 5G31A 1XPVA 2L5LA 2VD1A 5B6NA 4IW9A 3RBTA 2IMKA 2CVKA 1GTBA 1AW9A 3IRAA 5IO0A 5GSSA 5C00A 1J0FA 1GLQA 4OO5A 5F06A 2H75A 3MNGA 2CX3A 2M72A 3KEBA 4CDOA 2YJHA 5ID2B 1X5DA 3LXTA 2IFQA 2YV9A 2OE1A 1WMJA 1MD3A 3RPNA 2R2JA 2PGTA 3HZ4A 5IQYA 4JZQA 4MH2A 4E8EA 4KGIA 1BX9A 1KNGA 2YWMA 4YAPA 3HY2A 1B4QA 2C8UA 1GLPA 3K8NA 1XWKA 5ECHB 3MAKA 2C80A 5JCGA 1GL8A 4WF5A 4ISDA 3E3EA 3HYPA 2OKAA 1A2LA 2DIYA 1FVJA 4HQSA 2M80A 3GTUB 1XWAA 3I43A 1PA3A 5D93A 1SKWB 3Q6OA 1AC1A 3CRUA 5B8AA 1O73A 3BOAA 2YNXA 1EWXA 4RUVA 2IMIA 4HZ2A 3IC4A 3QFBC 4LMWA 3UJ1A 3VWUA 2DLXA 5ENUA 2MMAA 1FOVA 3C71A 3U5RE 3UBKA 3UARA 1RK4A 3EYTA 4KCAA 1O8WA 1WRYA 1RQMA 2H1AA 1ZMAA 1JFUA 3HCZA 4KE3A 1QFNA 5IMVA 2IPAA 3FY7A 2MMNA 1FB0A 5DDLA 1NSWA 4KW6A 4AJ6A 4MJBA 2N5AA 1VF2A 1K0NA 4HQZA 2P0GA 2OBIA 1SK0A 5KN1A 1QUWA 3IR4A 2B1KA 3UAPA 4KAEA 3ZVJD 2IMDA 4AJ8A 7GSSA 1W89A 19GSA 2HXKA 3H1NA 4BVYA 5J4UA 2GSSA 2VCZA 2B5XA 4Q5QA 4OCEA 2AV4A 4X0XA 3ZL5A 4NMUA 1XW5A 22GSA 2L57A 3H93A 4V2MA 4ZL9A 3V1WA 4E8HA 3C1SA 4K0NA 5HFGA 1YKAA 3ZRDA 2XPDA 4F9ZA 3D21A 1M9AA 4N10A 1NHYA 5ELGA 5IPGA 4K0GA 5B7CA 1U87A 3DYRA 1GUKA 4BA7A 2LJKA 3ZMLA 4POBA 2CVDA 3GA4A 4V2NA 1XIYA 4KUNA 5CRDA 2H19A 1O7UA 3DVWA 4ZIJA 5LD0A 3S9FA 6GSSA 1UVZA 4IBPA 3TRXA 1GSYA 5DAKB 2CZ2A 2PERA 2GLRA 5DCGA 2YCDA 4MF5A 4XRAA 3GMFA 4K7NA 2RUEA 1K3OA 2O85A 2H0HA 3IHQA 3ZYWA 3JCML 3ZIJA 1TRWA 2O89A 2I4AA 1CQGA 5ABRA 3FYGA 4MZWA 2L4CA 2JU5A 2AJQB 1M7TA 17GSA 1HYUA 5JWRB 3GFKA 3GKXA 2LRCA 2WZ9A 3GHAA 6GSTA 5DJLA 1NM3A 2CAQA 3HVXA 5J3RA 5ECRB 3EU3A 3NOFA 5FT3A 5DJMA 3IPZA 2JZTA 1M2DA 4JBBA 2PWJA 1YF1A 2H1DA 14GSA 2MBSA 3TDGA 3FEUA 1WJKA 3EMXA 1QMVA 1V57A 3M9KA 4O32A 4TXOA 4EO3A 3OR5A 5DQSA 1USBA 5C04A 1QK8A 3FR6A 1AQXA 4XS4A 2IN3A 3UOMA 2P31A 4IQ1A 4L5LA 2B7JA 2AHEA 1A8YA 1PD21 3ME8A 2PPTA 2N5FA 2ZNMA 1ABAA 4QL9A 1JZOA 5E59A 2GDRA 5DALB 4K7OA 1KTEA 4NV2A 2FWFA 2R37A 4ULXA 1R7HA 4GLTA 1ST9A 4IELA 3GX8A 1TK0B 1DE1A 1K3YA 3D6IA 4EF0A 3LORA 3GH6A 3TOUA 4TXOB 3LG6A 4GSSA 2LEGA 3CSHA 4FIWA 2IJYA 4DSSB 2FA4A 1TRSA 1SJIA 4MJCA 2XBIA 1EOHA 1THOA 2FWGA 3FRCA 4XRDA 5H5RA 2VL2C 1A23A 1GNWA 1V2AA 3HKRA 3ZFLA 2C4JA 1VF3A 1O8XA 3UEMA 1OE7A 1TI3A 4OO4A 2H0IA 3MDKA 2P5RA 4HJMA 4KB3A 2VM1A 4K7IA 3LJRA 1S3AA 3FZ4A 3I6AA 3DEXA 4EDZA 3LWAA 4Q5NA 4JEDA 2BTOT 5ECOB 4N30A 1Q4JA 2P5QA 1PKWA 4WXTA 3WT2A 3TGZA 3KXOA 1K0AA 1M9BA 4N11A 2TRXA 5KEJA 3QAVA 4NPBA 1ERWA 2L6CA 2MMOA 2VLTA 3GN3A 1K0CA 4IJ3A 5DQYA 2K9FA 1N2AA 3GL5A 1I9DA 3WYWA 1NHOA 3F3QA 2NBSA 4MPGA 5G5FA 3P7XA 2VL3A 5AIVA 3BCKA 2BMXA 1OC9B 16GSA 2C3NA 3F6FA 2RLIA 3D0ZA 1AQVA 4TR0A 4OWYA 3P90A 1YY7A 1VF4A 3M8NA 3IA1A 4IN0A 4ML6A 2H70A 20GSA 3CSJA 3C1RA 5EL8A 3F8UA 5J9BA 4LMVA 2F3MA 3UL3A 1ILOA 1MDIA 1DE2A 4JE1A 4IJIA 3WGXA 1VRSD 3LQ7A 4O5RA 1X5CA 1JZRA 2HZEA 3VK9A 2GS3A 5AISA 1XWBA 4FYBA 5EY6A 3KTBA 1KEBA 2H30A 3L9UA 5LNKe 2HSHA 2LS5A 1H4OA 4GF0A 2AUVA 3E9JB 3GKMA 3A2WA 3APOA 2H6YA 3KP8A 1X0RA 5ECSA 1V98A 5G1LA 4Z7XA 1OAZA 2LTKA 1G6WA 2K8VA 1C72A 3I9V2 3CRTA 4ZILA 1G7EA 4K6XA 3GUSA 5D9VA 2YWNA 4ZL7A 5DVBA 2B3SA 2X64A 1GRXA 4J56E 1YDKA 3ED3A 3A3TA 2H0GA 2JZSA 1GWCA 1XOAA 2YOIA 3FW2A 5CNWA 2O87A 1VGLA 4GCIA 4RQXA 4YQVA 4OFNA 5ECQB 1B9XC 1OC3A 3TJFA 1GSSA 4EKZA 3GSTA 3L9SA 2H01A 5D9WA 5IM9A 4YQMA 3ZIVA 3EWLA 2RUFA 4KDUA 1H75A 4ACSA 5JCWA 4G2EA 4TR4A 1EGOA 5CRHA 5AIXA 5ECIB 12GSA 3ZZXA 4GSNA 2H73A 5HQPA 5CRWA 4I2UA 3ZTLA 2J9HA 4HZ4A 4HI7A 2MBTA 1GH2A 1PGTA 2CT6A 4J57E 3TCOA 3WT1A 2WGRA 5FHIA 3IAS2 3KIJA 3ZITA 4MZBA 1F37A 3L9VA 3TKSC 2GVPA 4RI7A 4TXVA 2H1BA 5J41A 4I6XA 4LA1A 1CQHA 1XFLA 2JACA 4FYCA 4KH7A 2VCTA 4F03A 3APQA 4BWSA 1OKTA 2KHPA 2C1YA 1ERUA 4GSTA 4OFMA 3TJJA 2DJ3A 3KD0A 5GAPD 2IFQB 3EVIA 4RQRA 5JWOB 4K1FA 3GL3A 1UC7A 2E2MA 2C0GA 1XBSA 8GSSA 1BJXA 2L5OA 4IKHA 1Z6MA 2GQLA 1YEXA 2GZYA 2GSRA 3GKKA 2A2RA 4HEA2 3IK9A 1U88A 4GQCA 4MA9A 2EC4A 2JL4A 1J9BA 4IHUA 4L0UA 3VPTA 4L8EA 3QD9A 5A4WA 2PVOC 2GQMA 1JZWA 2WCIA 4JRRA 1ZZYA 4X1UA 4EE0A 5IOWA 1BYEA 3G7YA 1K0BA 4XS6A 1G6YA 5ECLB 1XCCA 4KDXA 1T3BA 1EP8A 1EV4A 3EMPA 1E6BA 4AJ7A 1JZDA 4I8BA 2MMZA 2L4QA 1HQOA 4WF4A 3UVTA 1S3DA 4PUFC 4X43A 2H74A 2HFDA 4HOJA 4NWYA 3A2VA 2NDOA 1SJZA 4ZXGA 1PX6A 3HXSA 1PRXA 2Z9SA 4F0BA 1F3AA 2OE0A 4OFTA 5IIZA 1JHBA 1ACVA 1F9MA 4D73A 4GTUA 5JCUA 1HNAA 1PL2A 1Q98A 2V2GA 2LNTA 3VWVA 1Y6EA 2H6XA 4PQIA 1LU4A 4MLYA 3HJOA 1K0OA 3BJ5A 3IXRA 5IMZA 2H8LA 9GSSA 2YANA 1XWCA 3P2AA 2K6VA 3IOSA 4L0WA 3VWWA 1HD2A 5ECMB 3WGDA 4N0VA 2OA7A 1XW9A 5ELAA 4KDYA 1Z7RA 1S3CA 4EXJA 2WRTA 3UIWA 1YF0A 1M99A 2X99A 2YWOA 5E4WA 4TW5A 2HLSA 2WS2A 2IL3A 3HD5A 1T7PB 2DJJA 5ECPB 4I2TA 6GSXA 5KN2A 2KLXA 1AQWA 2V6OA 1YQ1A 2KP2A 3F9UA 4OD7A 1EP7A 3GSSA 4WR4A 3EINA 1SK1A 2HZFA 5LCZA 4P3YB 2NVLA 4F0CA 1DSBA 1Z3EA 1EOGA 4OMVA 2WB9A 2MYGA 4N0ZA 5J9CA 5HFKA 3PINA 4ZBAA 1I5GA 3NIVA 3HDCA 2OACA 1ZOFA 3FZ5A 4O92A 1TI1A 5JWQB 1WP0A 1K3LA 2N5BA 2LNSA 2V41A 3RPPA 1QXHA 1ZGNA 1R5AA 4TN8A 1DUGA 3TJKA 3DXBA 3EURA 2EIQA 2GZZA 1A8LA 1IYHA 2DMMA 4ZB9A 4MDCA 1FG4A 4HJ2A 6GSWA 3R2QA 1TU7A 1V40A 2KP1A 4TKYA 2I9HA 5J5NA 4TR3A 3HJMA 2DJ1A 3CSIA 2LJRA 1Z9HA 4TRXA 4PGTA 1GTUA 1WPIA 4MZCA 2AYTA 2JADA 2O7KA 4J2FA 1XZOA 2EIOA 2XC2A 5EVOA 2EIRA 1AIUA 3F0IA 5F07A 2GSQA 2ES7A 3FR3A 1PN9A 1BQ7A 5H5SA 4PNGA 2PVQA 1AXDA 1THXA 4XS4B 3VURA 3D5JA 1SD8A 2YWIA 2C0FA 2YZUA 4ML1A 3CTGA 1SU9A 3QR6A 2B5EA 13GSA 1IYIA 1MD4A 3PH9A 3CXGA 1B8XA 3O3TA 2I81A 4GWRA 4HU7A 4IS0A 2YV7A 1RW1A 2HRFA 5CREA 4AGSA 2HT9A 4KSOA 1FHEA 1SKRB 4TR1A 2X8GA 5IMAA 4PX1A 3C7MA 4BWQA 4NHWA 3ISOA 3KH7A 4L5OA 4MPFA 2GTUA 2AAWA 3HVSA 4F82A 4HUAA 2VCXA 3E0UA 5CO3A 2F8FA 2DMLA 11GSA 2FY6A 5B8BA 5GZZB 2MZCA 5KN3A 1QQ2A 3F63A 1A24A 2VCVA 3FZAA 2JSYA 5ECNB 4XHMA 1LJRA 2HNLA 3FKFA 2PN8A 4JR6A 4YQUA 2M46A 2JZRA 1BEDA 3TKRA 1O6JA 2QSIA 1TRVA 2H72A 5A5KA 1TK8B 5DBQA 3Q18A 2VOCA 5B6MA 2I3YA 3LSZA 2VD0A 3DGQA 1SYRA 4ZBDA 2LQQA 3GRXA 2WJUA 2C0DA 1SK2A 1TRUA 2B5YA 3MWHA 1J08A 5A4UA 3RAZA 3EU4A 1BG5A 1T4YA 3KZQA 2KUCA 1UA5A 1Y25A 2ALBA 2VUPA 2B1LA 5CAXA 3BD2A 3FHKA 2LV3A 1HNCA 2CV4A 3G7IA 2OADA 2PMTA 3KH9A 2D2ZA 2WULA 1VF1A 1UN2A 1K0MA 1A2MA 1B48A 3L4NA 4PQ1A 1AAZA 1U3AA 2G0FA 4Q5FA 3AY8A 4POKA 1U6TA 1T8EB 5F0GA 3PR8A 1X9WB 4MK3A 4Q5RA 2FUG2 1WIKA 1PX7A 2HYXA 5G1KA 3QFAC 1R4WA 1ERVA 4XS1A 2RIIA 5INYA 2R5GA 1TP9A 3TRPA 4NAXA 2DJ0A 2DJ2A 1MDKA 3A2XA 1ZYEA 2FA8A 2CVBA 2PUKC 2CZ3A 3Q19A 3LGCA 2LRTA 18GSA 1O85A 5HR3A 2OE3A 3HVVA 3W6GA 3Q74A 2H1GA 2C0EA 3VPQA 3O6TA 2H76A 5D8IA 2FNOA 4AF2A 4QQ7A 2VL2A 3D22A 2E7PA 2HZEB 1ZYQB 1F3BA 4POMA 1SYXA 2DC5A 4WEYA 1LBKA 1GNEA 3QAWA 3PGTA 3VI7A 2VM2A 1XVQA 2XBQA 3M9JA 5ID2A 1B4PA 1G0TA 4F2IA 4TOPA 4MP4A 4DVCA 2BJXA 2FD3A 4MABA 2L59A 3DRNA 3F4TA 1MEKA 2QGVA 1JLVA 3IV4A 3ZMKA 3ERFA 4PQHA 2VL9A 2FCHA 4MF7A 1HNBA 3TRQA 4H86A 2GGTA 2XPEA 3C8EA 1YJ6A 5ECKB 5GSTA 3U6VA 1TJDA 2VIMA 3FR9A 4WKWA 2REMA 1XWGA 3KM6A 4ECCA 1Z6NA 3F4SA 5DCHA 4K9ZA 3GTUA 4POLA 1U3IA 4NHZA 3VI5A 3VWXA 3DD3A 3GYKA 2PU9C 2CA8A 1A0RP 2OJLA 2LQOA 5IOXA 4MH3A 3UVHA 2VLUA 3TKQA 4KSMA 1FO5A 4BPYA 3CMIA 5IMDA 2CQ9A 2VCWA 3LEFA 4IGJA 3QPMA 6GSYA 1SL1B 1T00A 3ERGA 3KGKA 2TRCP 1B9YC 4HDEA 3US3A 2H71A 4IP6A 3APSA 3RHCA 4EC0A 2IWTA 2NTOA 4BVXA 4JR4A 1GTAA 2IIYA 2C3QA 4I97A 1OYJA 2HRNA 3HHVA 1XXUA 1O81A 2AB6A 1OE8A 2LSTA 3N9JA 3ZLPA 3LFLA 2HI7A 4NV5A 4PNFA 3L78A 4CHSA 2B6MA 3ERWA 1X5EA 4QL7A 1WE0A 1ERTA 3C73A 4V1Ap 4EUYA 1TXXA 3KCMA 5HR1A 3NZNA 4JU5A 1PQNA 3DMLA 1EEMA 5F05A 1X9SB 4ECJA 5F8BA 2YP6A 1PSQA 1FB6A 1PMTA 3QMXA 1WOUA 4FYUA 4LLRA 1GTIA 4K8MA 4KA0A 4WBJA 2ON5A 1QGVA 1SKSB 3GNJA 3KTLA 5DAKA 1V9WA 2C3TA 1KBNA 2WDUA 3KJYA 5L71A 3ZFBA 3WD6A 3IBHA 1V58A 5HFIA 3HJPA 3TKSE 4HS1A 5D9TA 1T4ZA 1JLWA 1W4VA 4LL4B 2G2QA 3TUEA 5GAND 4ZBBA 4LL1B 4GXZA 4WBRD 5D73A 4YAVA 1Z5YE 2FLSA 3TKPA 3TKSA 1YKCA 3TJBA 3CYNA 4TVEA 5D96A 2A2SA 2DJKA 3J7Yb 3LYKA 2FWHA 1M2BA 4KCEA 1TU8A 4I5QA 3SWLA 1ZL9A 1K0DA 4IVFA 1EGRA 1GSQA 4V2LA 4G10A 3P8WA 4D73B 2IMFA 1TK5B 2GQKA 5FWGA 4PXOA 2DIZA 1XVWA 3QCPA 1E2YA 1GSEA 3VLNA 1OVNA 2CX4A 4CW9A 1T1VA 1FW1A 3F3RA 2XHFA 2ZCTA 4G19A 3O76A 4ECBA 5HR0A 1MDJA 1TTZA 4ILFA 1ON4A 4O7HA 3D4MA 3DKSA 1M0UA 1XOBA 5DALA 4ECIA 5G2ZA 2IMEA 1EZKA 5IMCA 3LXZA 4FO5A 5EPFA 5CRGA 3LYPA 1SJ6A 3QDNA 3BCIA 4IP1A 4ZB6A 5KN0A 2I1UA 1X9MB 2H6ZA 2VO4A 4DSRA 4DSSA 4RI6A 2J23A 5IMFA 6GSVA 1YZXA 1PKZA 2LKUA 4ID0A 1SENA 1XW6A 1BAYA 3W8JA 1ML6A 5D9XA 3N5OA 1R26A 1PL1A 1GUMA 4IQAA 3IE3A 1GUHA 1SD9A 3EE2A 3QAGA 1EEJA 2R3XA 5CYYA 2LUSA 2V32A 1FVKA 4FH8A 2V6KA 2R4VA 4XIHA 2X8CA 3IAM2 3KP9A 4G9HA 2F8AA 4GQFA 2B7KA 2ON7A 4GRFA 2HSYA 3RDWA 2TIRA 3DVXA 1G7OA 2CAIA 2GSTA 2E0QA 2VCQA 2GT6A 2FHEA 3GV1A 1F2EA 3DWVA 5AGYA 3ZVJA 2K18A 3QOUA 3HZ8A 3W8SA 2A4VA 4KX4A 4WETA 2NPBA 1YEPA 2YZHA 3H8QA 5G5EA 3GH9A 1GP1A 4MCUA 1GULA 1MTCA 2F9SA 3IDVA 10GSA 1TOFA 1TDIA 4XCSA 1OC9A 3ZREA 3G9BA 2YJ7A 4TR1B 6GSUA 2FWEA 2WFCA 2YPMA 3TOTA 5G30A 1NW2A 5AN1A 4KNDA 3IK7A 3DIEA 2JSZA 3HA9A 3H79A 2VAFA 3GX0A 2DSAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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