1A24A

Solution nmr structure of reduced dsba from escherichia coli, family of 20 structures
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
189
structure length
189
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of reduced DsbA from Escherichia coli in solution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DSBA
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 44
structure length 189
sequence length 189
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1a24A00
3D4TA 1YF0A 3E0UA 3HHVA 4WEYA 3I9V2 1PRXA 2WB9A 4MABA 3A2XA 2LQOA 2FNOA 4FYUA 1AQWA 3FHKA 2L59A 3UBKA 3RHCA 8GSSA 2C0EA 1WRYA 2VLUA 3KP9A 2TIRA 4I6XA 1TDIA 4TXVA 4IKHA 4HI7A 4RQXA 3IC4A 5IMAA 5CAXA 4JBBA 4N0VA 1ERTA 4FO5A 3HA9A 5ELAA 4ISDA 2IFQA 5CRWA 3VK9A 5G2ZA 3GTUA 1O81A 5HQPA 3IHQA 3QFAC 2MMZA 1O7UA 2VCVA 4OO4A 2GSSA 4K9ZA 3KGKA 2VL2C 2VLVA 5HR0A 1B9YC 2CAQA 1XWGA 3FY7A 1BEDA 3LORA 5B6NA 4EVMA 4J56E 2MZCA 4OD7A 1O8WA 1IYHA 4EUYA 2BTOT 3HZ4A 1Z5YE 2FWEA 4WETA 4TVEA 1U3IA 2C3QA 2HZFA 2OJLA 1M0UA 1GTUA 1SL0B 4MA9A 1EWXA 2L57A 1ON4A 1T4YA 2G2QA 1Z3EA 3M9KA 2AB6A 1EZKA 3VWVA 2IMDA 1ST9A 3HJMA 1QQ2A 2ZNMA 4MK3A 2VCXA 2XPDA 2YNXA 2OE1A 4G19A 1DSBA 4O7HA 2VO4A 1SL2B 3ME8A 1VF1A 2PMTA 3FKFA 2OACA 4OMVA 2IMEA 3FR9A 1PL1A 5DJMA 1XW5A 4G9HA 5FHIA 3G7IA 1SJIA 1R26A 1M2BA 4GCIA 4MPGA 4XRDA 2V2GA 2MMOA 3V1WA 2ON5A 2C0DA 2GVPA 3LWAA 1WE0A 2L4QA 5ECIB 4PNFA 2H0GA 4NXIA 1HQOA 5A4VA 1ML6A 2RLIA 5A4UA 4MF7A 3ZITA 2V32A 9GSSA 4GWRA 1YKCA 3DD3A 3DWVA 1GH2A 1TI1A 4PURA 4ZBAA 3LG6A 3CMIA 2X8HA 3DXBA 2RUFA 3UARA 1A23A 1MDKA 4IHUA 2CVKA 5IOWA 2DJ1A 2DLXA 1BAYA 3APOA 1X5DA 1ERWA 2C0GA 2LQQA 3OR5A 1GSQA 1UN2A 4HZ4A 2IJYA 1MEKA 2M46A 6GSWA 3GKMA 4ECIA 3ZTLA 3EE2A 2Z9SA 3GX0A 1TK0B 3VLNA 4NV2A 1K0MA 3FR6A 3Q18A 4ECCA 1W4VA 2VLTA 3F6FA 3UBLA 5JCUA 4GTUA 4ID0A 2J9HA 2CX4A 2A2SA 2FLSA 3TJKA 3BBYA 1R7HA 3I43A 1QXHA 3KEBA 2X99A 3GTUB 1U88A 4L0WA 3RAZA 2RUEA 4X0XA 4RI7A 2O87A 2H75A 1EV9A 3FEUA 5KN0A 2IMFA 3FW2A 2F9SA 3TKQA 2AAWA 2IWTA 2K8VA 3FZAA 3FZ5A 3BOAA 4JU5A 3KXOA 4PNGA 2P5QA 5DAKA 1XXUA 2C4JA 2B5YA 3KTLA 3MAKA 3WYWA 2H6ZA 1F6MC 1EGRA 3GIXA 3GH9A 1T4ZA 4GF0A 2JACA 4K6XA 4HS1A 5J41A 2LRNA 4HU9A 3VWUA 2N5FA 1N8JA 1JZDA 2QGVA 2C0FA 1Z6NA 5HFKA 4HDEA 2H73A 5GAPD 4EC0A 5H5RA 3C7MA 3RPPA 4CW9A 4AJ6A 3MSZA 4BWQA 1PX6A 1R5PA 3H4KA 2B1LA 2DJ0A 2H8LA 3UJ1A 2V41A 1EOGA 3D21A 1XOBA 5KN1A 4F0CA 1FB6A 2RM5A 5CREA 4CHSA 5ID2A 2DMMA 1GP1A 1JZWA 2I3YA 4FH8A 3ZFBA 2HYXA 4MH2A 3RPNA 1UVZA 2KUCA 2LEGA 3GX8A 1PN9A 2CA8A 2BJXA 1OC9B 1O85A 2A4VA 2R37A 5D9VA 4KUNA 1BQ7A 2CVDA 3N5OA 2XC2A 3L9SA 1ZGNA 3TKRA 1SKWB 3HJOA 2KHPA 2WULA 4KNDA 3HZ8A 4ZB6A 2BMXA 4TXOA 1EP7A 4V2MA 1E2YA 2MMNA 3P90A 1OVNA 4KA0A 4DEJA 3APSA 3EURA 2E7PA 4MZCA 1HNBA 4OFMA 1AIUA 4WBJA 4RI6A 1A2JA 4IVFA 3NOFA 2FA4A 1K3YA 2CX3A 1WIKA 6GSXA 1T7PB 2H6YA 5F05A 2K9FA 5EL8A 3G7YA 5EVOA 2X8CA 3PR8A 5CYYA 1TP9A 5GSSA 1U6TA 3BCIA 4F0BA 5LD0A 2PERA 2E2MA 4KX4A 4WR4A 3KH9A 3F4SA 2LS5A 2PPTA 2OBIA 5EPFA 2C8UA 5D9TA 5DAKB 2DJ3A 3LQ7A 4IP1A 5ECMB 6GSYA 2EIQA 3GH6A 5DBQA 4ZILA 2V1MA 2FWGA 3NIVA 5DJLA 2HRFA 6GSTA 2V6OA 4POMA 1AW9A 1WWJA 2VOCA 1SKRB 4F2IA 1FVKA 4G10A 4PGTA 2YJHA 2RM6A 4MH3A 4PQ1A 2H1BA 2XBIA 2N5AA 1T8EB 4BVXA 4WR5A 4TR1A 1GUKA 4ULXA 4ZXGA 3GMFA 1QK8A 1S3AA 4GXZA 4ZBDA 2ES7A 1VGLA 3SWLA 3TJJA 1GSSA 3J7Yk 19GSA 3DYRA 3TRPA 3ZVJD 3RDWA 1GL8A 1T00A 1BX9A 1ABAA 3H8QA 2JL4A 3I69A 3U5RE 1PX7A 3UIWA 3FR3A 1ZCPA 2VIMA 3VURA 3VPQA 1W89A 4DVCA 1SJZA 2YV7A 1G6WA 3W8SA 1BYEA 3D6IA 4ZL9A 5B7CA 1HD2A 2IMKA 1TKDB 1DE2A 2VCTA 2CT6A 3P2AA 3CSIA 3L9UA 4TXOB 3F63A 3KH7A 2VD1A 1K0DA 2WS2A 2GGTA 4MJCA 3CTFA 2H72A 3A5WA 3QFBC 1A2MA 2GT5A 1OE7A 1R5AA 1CQGA 2WJUA 3LEFA 3K8NA 2GDRA 2F8AA 3CSHA 1B4PA 2I9HA 6GSUA 1XZOA 2B7JA 1TI3A 4WXTA 1WMJA 4N10A 4IQ1A 1K0AA 4TR3A 1XBSA 4JEDA 1M2DA 3IRAA 4NAXA 2HSYA 2FWHA 1GULA 2H66A 3IXRA 6GSVA 3NZNA 2JU5A 1TU8A 4IQAA 4BL7A 4KB3A 4EL1A 3FZ4A 2TRXA 2LRCA 3WT1A 1PL2A 2IPAA 16GSA 1K0BA 4KDXA 3DRNA 5D9WA 1Z9HA 2PWJA 4K7NA 1I9DA 5ELGA 5L71A 5IPGA 4KSOA 2AUVA 4Q5FA 10GSA 1TRUA 1QUWA 1ACVA 1EP8A 3QDNA 4L5OA 1C72A 2OKAA 2YP6A 4TRXA 1XW9A 5IPHA 1LJRA 3HCZA 2DC5A 1KEBA 3PH9A 5E59A 4MCUA 3R2QA 3TKSA 1SU9A 2AV4A 2H30A 1R4WA 2YWIA 3IAM2 2O8VB 1XW6A 5ECNB 2OA7A 1XIYA 3GRXA 2E0QA 3A2VA 2EIRA 3HXSA 1Q4JA 1GRXA 2PBJA 4ZIJA 5IIZA 4NHZA 4TR1B 4JRRA 2E2GA 3EINA 1X9MB 1DE1A 3BD2A 2LNTA 2LJKA 1GTBA 1NHOA 4FYCA 1MDIA 1S3CA 3C1RA 4XS6A 4J2FA 1F9MA 1KTEA 4EDYA 4K0GA 2P0GA 4HUAA 3MDKA 2HT9A 1V40A 5D73A 4CDOA 3UVTA 4PQIA 5DALB 2GZPA 1H75A 4TR0A 4GSTA 3KTBA 4PX1A 1SD8A 1OC9A 3DMLA 3US3A 3TCOA 5J3RA 2H74A 1DUGA 5AN1A 1PGTA 4KW6A 2GSRA 1Z7PA 2WRTA 4K8MA 2IN3A 4MF5A 3QAWA 3S9FA 4KH7A 1Y25A 2WFCA 4MDCA 5F06A 1MD3A 3GL3A 4YH2A 3DKSA 1GLPA 2B6MA 2NPBA 2DJ2A 5J9CA 5J9BA 4QL9A 4YAPA 5CP1A 2TRCP 3TOUA 2J23A 2YANA 4NWYA 1PSQA 3Q74A 4DSRA 1G7OA 2AYTA 3KD0A 2PN8A 1F37A 3TGZA 2FY6A 4I8BA 2HNLA 2K6VA 4KGIA 1XVQA 4K1FA 4K0NA 1Z7RA 11GSA 1TK8B 5IO2A 3W6GA 3H79A 2VUPA 2R6KA 1JHBA 3F3QA 1THOA 4K7IA 1U87A 3CRUA 2C1YA 4GQCA 4EE0A 3F3RA 1GUMA 2HE3A 3H93A 2VD0A 1JZRA 3EMXA 1NHYA 3E9JB 3D5JA 4DSQA 2VAFA 4IW9A 14GSA 4MF6A 2H0IA 4EKZA 4ECBA 2I81A 4NHWA 3QAGA 4TKYA 3WT2A 1TXXA 1WP0A 5ECQB 1ZZYA 3HJPA 5AIVA 5H5QA 2H71A 1TJDA 4KCEA 2R4VA 1GSUA 4NPBA 4IBPA 3ME7A 3VPTA 4I2UA 4LMVA 2AHEA 1PQNA 4K7OA 3GKNA 2LNSA 2FA8A 2LRTA 3MWHA 2YV9A 1SENA 4XRAA 1NSWA 1NW2A 3G7JA 3LXTA 1CQHA 4TN8A 1SD9A 2H76A 4OCFA 4N30A 3J7Yb 4IP6A 1MDJA 2QKEA 2OADA 6GSSA 3TUEA 3PGTA 2G0FA 4F9ZA 1OYJA 2H70A 3QR6A 1VF3A 4HQZA 4O32A 5ECRB 4IJIA 2LJAA 3HY2A 3VI5A 1IYIA 3WGDA 2NVLA 5DVBA 3DVWA 3LYPA 3C8EA 2WDUA 3DGQA 2PVQA 2F8FA 1JLWA 1YZXA 3Q6OA 5E4WA 3GKXA 3GNJA 4XCSA 4ZL7A 1GTAA 4HJMA 2OE3A 2GS3A 4QQ7A 4KDYA 5IMDA 1YDKA 1Q98A 3GHAA 2WCIA 2MYGA 4L8EA 5D96A 2LSTA 1GSYA 5INYA 4OO5A 4XTSA 4ZB8A 4WF4A 1FW1A 5ECPB 2B7KA 5F07A 3ZL5A 1ZMAA 3TJFA 1JLVA 1SJ6A 1TRWA 1YEXA 1YQ1A 4XHMA 4HOJA 1A0RP 4YQVA 1MTCA 2FD3A 3UOMA 1PKWA 4JR6A 3ISOA 3ZRDA 2KP1A 4AF2A 1JFUA 3ZIVA 2XHFA 5GSTA 3F8UA 1TRVA 1OKDA 1A2LA 4DSSB 4F82A 3D4MA 4MZWA 2PUKC 2P31A 2H19A 3EVIA 3N9JA 3RHBA 4HJ2A 2HI7A 2R5GA 4KDUA 4MJAA 4V1Ag 1X5EA 1A24A 4WBRD 2B3SA 3FRCA 4PQHA 1GSFA 3M9JA 4Z7XA 4MP4A 4BPYA 12GSA 1ERVA 1H4OA 5COHA 3IK7A 3GL5A 2L5LA 1FHEA 3I6AA 4EF0A 3ZFLA 1XFLA 2IMIA 1M7TA 2H01A 1X0RA 3M1GA 5LCZA 3QD9A 2YZUA 2FWFA 3SBCA 2QSIA 3G9BA 2ALBA 1M9BA 2EC4A 4JE1A 2YWMA 1PKZA 3TKSE 5ECHB 4GQFA 4ZL8A 4V1Ap 1M2AA 2GSTA 3CBUA 3FYGA 3QMXA 1EEJA 3IE3A 3O3TA 5GAND 5G5EA 2H0HA 3GN3A 3WD6A 2VM2A 1O73A 4MJBA 1RW1A 3IV4A 5C04A 3QCPA 1QGVA 4D73B 5C00A 2EIOA 2DJJA 3TKPA 1EOHA 2QC7A 2FUG2 1AC1A 4JR4A 2OBKA 3GSSA 3ZMKA 1K3OA 1WOUA 5AGYA 5DALA 1UA5A 2K18A 1F2EA 1GSEA 3LSZA 3KCMA 4IJ3A 4ECJA 1GSDA 2YOIA 5DQSA 1YKAA 2B1KA 3A3TA 5D93A 3ERFA 3D0ZA 1OAZA 5IMVA 3F4RA 3LJRA 3KJYA 1KNGA 1TTZA 4E8EA 3GYKA 4FYBA 3ERWA 2VL2A 3GUSA 4TR4A 1OC3A 3GA4A 4K2DA 5A4WA 2PVOC 5DQYA 2NTOA 1PA3A 13GSA 1TRSA 3H1NA 4GLTA 2DIYA 1RQMA 3HKRA 1GNWA 1JZOA 1URMA 4LA1A 1ZL9A 1OE8A 4V2LA 4L0UA 4BA7A 3P7XA 5CO3A 1G7EA 1EEMA 3IOSA 3VI7A 2YPMA 1EV4A 2F3MA 3HD5A 3L9VA 5B8AA 2C3NA 2HRNA 5AISA 1GWCA 5B6MA 4L5LA 2NBSA 2HXKA 4XS1A 4TOPA 3VWWA 1O6JA 4O92A 3EYTA 2O89A 3GFKA 7GSSA 3VFIA 3IA1A 2DSAA 4EO3A 1V57A 2I4AA 1SYXA 5A5KA 1ZOFA 2ZCTA 1V58A 2VL9A 4QL7A 4N0ZA 2H6XA 2M80A 3CTGA 3IDVA 5G1KA 4MLYA 1ILOA 1ERUA 4AGSA 4I97A 4MZBA 4O5RA 2VCZA 3DEXA 4IN0A 1FOVA 5CRDA 2B5XA 4N11A 2ZUPA 3TJGA 2CV4A 1HNAA 2GZYA 3KZQA 2RIIA 2L6DA 2VCQA 4OWYA 3A2WA 1TK5B 3WGXA 1USBA 3IAS2 4I5QA 3CXGA 3EWLA 2I1UA 4LL4B 4X1UA 5D9XA 1AAZA 3TRXA 4BVYA 2LJRA 4HQSA 4YAVA 1BG5A 1FO5A 5G30A 3GSTA 1N2AA 1UC7A 2IIYA 2YWNA 1BJXA 2HZEA 1TW9A 1M9AA 5JCWA 4MJEA 3ZIJA 2KLXA 3PINA 5H5SA 4IGJA 1XWKA 2REMA 3DIEA 5IMFA 2MBSA 2CZ2A 1V98A 1MD4A 2VCWA 4KE3A 2K8SA 4GSNA 3QOUA 4GSSA 2N5BA 1Z6MA 2R2JA 5DCGA 3UL3A 5GZZB 1A0FA 4ACSA 5AIXA 1XWBA 2H1GA 4WKWA 2AJQB 1SK0A 1GUHA 2L6CA 4V2NA 3E3EA 1F3BA 3TKSC 5J4UA 5HFIA 3L4NA 5ECKB 1T3BA 3ZREA 20GSA 5B8BA 3TRQA 1K0CA 1PMTA 5JWRB 3ZLPA 5HR2A 2H1AA 5ECLB 1SK1A 3O76A 5CRGA 2DJKA 1X5CA 1VF2A 1XWAA 2DMLA 5DCHA 3ZYWA 2D2ZA 3W8JA 2C80A 2R3XA 22GSA 3F0IA 4IS0A 3ZZXA 4I2TA 4LLRA 2IL3A 2A2RA 3M0FA 4H86A 5HFGA 1G6YA 4POBA 4XS4A 1F3AA 3JCML 4DSSA 2C3TA 2DBCA 2XPEA 4X43A 1AUCA 4LL1B 3CRTA 4E8HA 2HSHA 4RUVA 5IMZA 1XOAA 2ON7A 2IFQB 5IO0A 2L5OA 1GLQA 1YJ6A 5IOXA 1K3LA 3HVSA 1K0NA 2JZSA 3UEMA 3WGEA 4XIHA 3FZ9A 2CVBA 2JSZA 4G2EA 4OFTA 4Q5QA 1YF1A 5G5FA 3HYPA 1U3AA 3KM6A 2CQ9A 1M99A 3TB2A 2X64A 3CYNA 2LUSA 3TJBA 3LGCA 4EXJA 3MNGA 2YJ7A 3UAPA 3BJ5A 5DDLA 1X9SB 2MBTA 2GQLA 3EC3A 1NM3A 3D22A 1AQVA 1FVJA 4ZB9A 4ML1A 4NMUA 2WZ9A 2GLRA 1WPIA 5IMCA 1Y6EA 5ABRA 2GQMA 2OE0A 3BCKA 2V6KA 4OCEA 2B5EA 2VM1A 4D73A 2PGTA 2F51A 1LU4A 4GRFA 4Q5RA 5JWOB 4PUAA 3L78A 4ZBBA 5F8BA 3GV1A 1ZYQB 3O6TA 2HZEB 3GKKA 1ZYEA 1TU7A 3HDCA 2NDOA 3F4TA 4TW5A 1B48A 2FCHA 1J08A 3F9UA 5JCGA 3M8NA 5CNWA 1V9WA 3HVVA 5IM9A 1GTIA 1KBNA 1YY7A 4IELA 2GQKA 5FWGA 2CZ3A 3CSJA 3KIJA 1B4QA 4YQUA 4Q5NA 2GTUA 1RK4A 5KN2A 3HVXA 1OKTA 2LTKA 3C71A 3P8WA 3IPZA 2L4CA 4MMMA 5HR1A 3ZMLA 4YQMA 5HR3A 4HEA2 1GNEA 1X9WB 3IBHA 2YWOA 3TOTA 1TOFA 2YZHA 4KCAA 5D8IA 4AJ8A 3IR4A 5KN3A 4PXOA 4WF5A 2KOKA 3KMOA 1J0FA 1B8XA 4AJ7A 3LXZA 4HU7A 4OFNA 2FGXA 3F6DA 1E6BA 2JZRA 4POKA 4XS4B 1HNCA 4FIWA 4MPFA 4KAEA 2O7KA 2DIZA 4ML6A 4PUFC 2MMAA 4POLA 3IK9A 1SKSB 2X8GA 5FT3A 1SL1B 3RBTA 1G0TA 2GZZA 2M72A 3AY8A 1B9XC 5ENUA 3UVHA 3GURA 1LBKA 2P5RA 2GT6A 5KEJA 2HLSA 5ECSA 1A8YA 1OC8A 1AQXA 4ILFA 3EU4A 1XCCA 1QMVA 3TDGA 4KSMA 5EY6A 3M3MA 4JZQA 4EDZA 1AXDA 2JSYA 3QPMA 3LYKA 3EU3A 3L0HA 1K0OA 3UMAA 1YEPA 3ZVJA 2FHEA 3KP8A 4LMWA 2GSQA 1THXA 4HZ2A 4J57E 5ECOB 1HYUA 4BWSA 1SYRA 1DBYA 2O85A 2JZTA 3LFLA 17GSA 3C73A 2YCDA 1VF4A 1FAAA 2LKUA 1XPVA 1PD21 2WGRA 1QFNA 5J5NA 1XWCA 5G31A 4F03A 3ERGA 1WJKA 1FB0A 3QAVA 1A8LA 18GSA 1FG4A 2LV3A 2CAIA 1VRSD 3U6VA 4P3YB 5LNKe 1SK2A 1T1VA 2JADA 5JWQB 3ED3A 3VWXA 2KP2A 1J9BA 5ID2B 1V2AA 2YN1A 4NV5A 1S3DA 1O8XA 5G1LA 1XVWA 4RQRA 1EGOA 2XBQA 5F0GA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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