4HQSA

Crystal structure of the pneumoccocal exposed lipoprotein thioredoxin sp_0659 (etrx1) from streptococcus pneumoniae strain tigr4
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
135
structure length
135
Chain Sequence
ADFELMGVDGKTYRLSDYKGKKVYLKFWASWCSICLASLPDTDEIAKEAGDDYVVLTVVSPGHKGEQSEADFKNWYKGLDYKNLPVLVDPSGKLLETYGVRSYPTQAFIDKEGKLVKTHPGFMEKDAILQTLKEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Streptococcus pneumoniae
publication title Molecular architecture of Streptococcus pneumoniae surface thioredoxin-fold lipoproteins crucial for extracellular oxidative stress resistance and maintenance of virulence.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin family protein
total genus 38
structure length 135
sequence length 135
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hqsA00
5E59A 2VM1A 1V98A 1ON4A 2VCTA 3TKSC 1XXUA 12GSA 4N0ZA 2GVPA 2V32A 2VCXA 4IJ3A 2R6KA 1SK0A 4XCSA 5IMFA 1DBYA 4L5OA 4MA9A 3FZ4A 5B7CA 5B6NA 3H93A 2FUG2 5DALA 2VO4A 1M99A 3IDVA 4JU5A 2M72A 2CT6A 1K0DA 2WB9A 2A4VA 3LQ7A 2OE1A 2HZEB 3VLNA 3M0FA 5D9WA 3R2QA 4F03A 2E7PA 3ZMKA 1OE8A 4KDYA 1JZDA 1BYEA 3KGKA 4NMUA 2VLUA 1BJXA 2CA8A 5D9XA 4YQMA 2VAFA 1HNCA 2LUSA 5ECHB 2PUKC 4K0NA 1TP9A 3HA9A 3NIVA 1JHBA 1GSFA 4ULXA 2K18A 4K7IA 4ZBDA 1AW9A 2VCVA 1YEPA 1XFLA 3WD6A 4DEJA 3US3A 1X5CA 2ZUPA 3DIEA 1W89A 5KEJA 3LXZA 1OC9A 1BEDA 1X5DA 2PVOC 3ISOA 4OO5A 1EGRA 1FOVA 1V2AA 1ZL9A 2YNXA 1WE0A 3GKMA 4RQRA 4LMWA 1JFUA 2ZCTA 6GSUA 4FH8A 2BJXA 1ZZYA 2P5RA 1A24A 3KP8A 1B48A 4G10A 4HEA2 1XWCA 4NV2A 2YN1A 2YWNA 4IS0A 5B6MA 3D21A 4IKHA 1TRVA 4F82A 1X9MB 4MABA 2GTUA 4KDUA 2FWEA 2H0GA 5D9VA 1K3OA 1TDIA 1I5GA 1XWAA 3J7Yk 5H5QA 1SYXA 3UMAA 1PN9A 1O7UA 3ZZXA 2FY6A 4E8EA 2X64A 3TJBA 1HQOA 4TR0A 2WULA 3APSA 3QOUA 2V6KA 4J56E 3CRUA 1VF1A 2OKAA 2F8AA 3G9BA 2J9HA 8GSSA 3FR6A 1O73A 2I3YA 3W6GA 4QQ7A 3KMNA 2P31A 2A2SA 4PUAA 1GLQA 3TRPA 1ERUA 2MYGA 3CYNA 3DMLA 3VURA 1X9WB 1GSQA 3KEBA 1A23A 4XS6A 5HR0A 4K0GA 3UOMA 1MTCA 3A2XA 1N2AA 5CYYA 1PL1A 1DE2A 3U5RE 1XW6A 2VLVA 1V57A 2CZ2A 2JU5A 4GCIA 5ECMB 2C8UA 3ZRDA 1AC1A 1TI1A 2GSQA 3GMFA 3UVHA 2DJ0A 3HD5A 1YJ6A 2B6MA 3M8NA 2LNTA 4EVMA 2LSTA 2CVDA 2YOIA 2D2ZA 2H72A 3GNJA 4GWRA 4NV5A 4RI6A 1HNAA 2L57A 3WT1A 2V1MA 2LJKA 4V2NA 1XZOA 2OE3A 3LYKA 5A5KA 3HKRA 1K0MA 3A5WA 3ZTLA 1K3LA 1WWJA 5AIVA 2PVQA 3D5JA 3FYGA 1B4QA 1R5PA 1S3DA 1RW1A 1K3YA 3TUEA 2OBKA 3BJ5A 3BOAA 3GTUA 1WRYA 4BL7A 4JBBA 4WR5A 4HZ2A 2LQOA 1O8XA 5DJLA 1XWBA 1EV4A 4MCUA 1SKSB 3GSTA 1EGOA 3EE2A 2X8GA 2EC4A 1MEKA 1TK0B 1TRSA 1NSWA 1QFNA 4NHZA 3L4NA 1YQ1A 1ZMAA 3EU3A 4HJ2A 2HSHA 4RI7A 5ABRA 3VPTA 5IMAA 3GKKA 3H8QA 1TJDA 2H73A 2LJRA 1H4OA 2C0GA 2CAIA 4MH3A 3U6VA 4ZIJA 2PU9C 4I8BA 4EDYA 4E8HA 4K1FA 1F3AA 3E9JB 4CHSA 4JE1A 4TR3A 3RDWA 5DVBA 2LRCA 1A0RP 3VWUA 2VL9A 3HJPA 1A2MA 1Y25A 2XHFA 4GQCA 1EEMA 2DLXA 3KTLA 1YF1A 4GSTA 1IYIA 3IBHA 3TKSE 2GSTA 4PQHA 3ZFBA 1G7EA 1PGTA 2PGTA 1VF4A 2I4AA 3QCPA 4FYUA 2L59A 4LLRA 1EZKA 2AJQB 17GSA 3ZVJD 3ERGA 3MWHA 4POLA 1WPIA 4DSSA 1A2JA 4IGJA 2WDUA 1BAYA 1FHEA 2FWFA 2REMA 5AN1A 1B8XA 5CRDA 4MK3A 5JWRB 2BMXA 2LRNA 1Z7RA 2X8CA 3I43A 4XRAA 3QPMA 2O89A 3HVXA 2LNSA 1A8YA 5IOXA 3FY7A 5A4VA 1QMVA 2IMDA 2CVBA 4I6XA 2FCHA 4PURA 2FA8A 4ZILA 1DSBA 2YPMA 3IAM2 2LEGA 1USBA 2OE0A 4ML6A 1B4PA 4LA1A 1MDIA 1Z9HA 2L4CA 4YAPA 4NAXA 1J9BA 2WFCA 2H1BA 4PNGA 4KUNA 5KN0A 1FO5A 2HRFA 1LJRA 4OWYA 3QAWA 1K0NA 3TJGA 2I1UA 1CQHA 1UC7A 5D8IA 5ELGA 1PKZA 4K8MA 2FHEA 3IHQA 3CTGA 3IK9A 2DMLA 2AHEA 2NVLA 5ECOB 3FKFA 18GSA 3TKSA 1YZXA 3CSIA 4V1Ag 2C0FA 3GHAA 4KAEA 3C7MA 6GSSA 4PNFA 3GUSA 1FVKA 3APOA 3PR8A 4POBA 2H66A 2HRNA 1V58A 1X5EA 5JWQB 1M9BA 3Q74A 5IOWA 2IN3A 2GT5A 2GZPA 1TRUA 4EE0A 3ZREA 1TK8B 14GSA 3O76A 2RM6A 2FWHA 2TRXA 4XS1A 3EURA 4HDEA 5D9TA 4TXOB 4X43A 1WMJA 5LD0A 3TB2A 4TOPA 2LKUA 2O8VB 5EPFA 3QDNA 3VPQA 3W8SA 1HYUA 3C8EA 5DDLA 3NZNA 3VI7A 1SK1A 3SWLA 4ZBBA 2KP2A 3EINA 4MJCA 1YKAA 2VLTA 4KH7A 4ECBA 4N10A 3HZ8A 3L9SA 4AGSA 4XS4B 1T7PB 2JSYA 1Z5YE 1PQNA 2JADA 1XOAA 4YH2A 2H1DA 4IVFA 2YANA 4AJ6A 3P2AA 2YWIA 3F4TA 5G5FA 1R5AA 2R2JA 4EC0A 2YWMA 3F6FA 2EIOA 4KDXA 5DQYA 3ED3A 3QAVA 1MDJA 1OE7A 1GSSA 3DYRA 1XPVA 1F3BA 4XIHA 3O3TA 4WXTA 3VK9A 3CSHA 2C4JA 3FRCA 16GSA 13GSA 4MF5A 1DUGA 3UJ1A 1JZRA 5DALB 2IMIA 3NOFA 19GSA 2GSRA 4IQAA 1I9DA 1GSDA 2MMZA 2IPAA 3LG6A 1A8LA 4IELA 5ID2A 4OD7A 4DSQA 3WGDA 1ILOA 2QKEA 2J23A 5GZZB 4OO4A 5DCGA 4WF5A 4XHMA 1T4ZA 2H1AA 1JLWA 1XVQA 2N5BA 1A2LA 1YDKA 2OBIA 2C0EA 1PMTA 2B5EA 4HI7A 5G1KA 5F06A 4KW6A 5DQSA 1AQWA 3DEXA 1K0CA 4ID0A 2H0IA 2PN8A 1EP7A 4WKWA 2K8SA 1BX9A 1OC3A 3C1SA 5CP1A 3I6AA 5FT3A 4KE3A 5CO3A 4N30A 3PH9A 3FEUA 1OC9B 2WCIA 5AISA 1SKRB 2DJ1A 3WGEA 3UBLA 3F63A 1GLPA 5J4UA 3IA1A 4POMA 4TXVA 1GUHA 1MD3A 2GSSA 5ECPB 2HSYA 1GRXA 6GSYA 1M2AA 1OYJA 1U6TA 4PQIA 2F9SA 3BCKA 2G0FA 2HE3A 2H75A 2MBSA 1EOGA 1GWCA 2JZRA 1YY7A 3P90A 1N8JA 1YEXA 1F37A 4K6XA 4TR4A 2DMMA 2P0GA 4TR1A 6GSWA 1TI3A 2QSIA 4D73A 3D22A 5H5SA 6GSVA 1S3AA 4MPFA 3LFLA 3L0HA 3K8NA 4EL1A 9GSSA 1VF3A 3IRAA 2HXKA 1F2EA 2H8LA 1EP8A 1O8WA 3FZ5A 4H86A 4AJ7A 3TKQA 5EY6A 4IHUA 3D4MA 1U88A 3KJYA 4F0BA 5ECRB 1ERWA 3WGXA 3HJMA 1PD21 2F3MA 1G0TA 1J08A 4ZB8A 1GULA 4KCEA 3E3EA 20GSA 2LV3A 1GH2A 2LQQA 4ZL9A 2FD3A 5JCUA 4DVCA 3ME8A 2R4VA 1NM3A 3EU4A 1ZYQB 1QK8A 2H71A 2AAWA 1SJZA 1W4VA 3J7Yb 3HDCA 3UEMA 5C04A 3HY2A 1T8EB 2V2GA 4KA0A 2TIRA 3TGZA 4V1Ap 1PX7A 4TVEA 2GZYA 2C3NA 2RM5A 3ZIVA 2H30A 3G7JA 22GSA 2DIYA 5KN3A 5COHA 2DBCA 3FK8A 2ON5A 5J41A 2RIIA 2GLRA 4XTSA 1R26A 5G30A 2FWGA 1SD8A 2IL3A 4P3YB 5KN2A 5ECLB 2N5AA 1E6BA 3ERWA 1G7OA 4ILFA 4O32A 4K2DA 3H4KA 4MH2A 1X0RA 3GRXA 3MSZA 4WETA 5DJMA 3H1NA 1AUCA 1PSQA 5CNWA 3D4TA 3TJFA 4OFNA 1FB0A 4K9ZA 3VFIA 4IP1A 2YZHA 1XIYA 3F3QA 4HQZA 2B1LA 1HD2A 3GTUB 2GGTA 5HFKA 3TRXA 2B7KA 1G6YA 4ML1A 1FAAA 2E2MA 1FG4A 1TOFA 1XOBA 2GS3A 4K7NA 2VOCA 2PBJA 3E0UA 2YCDA 3DWVA 1H75A 1SJIA 3QD9A 4MDCA 4FYCA 2H6XA 3GIXA 10GSA 1JZOA 2L5LA 3ZIJA 3FZAA 4EF0A 5ECNB 4J57E 1UA5A 1ZYEA 2GQMA 4V2LA 2GDRA 2KP1A 3MDKA 4O7HA 3IPZA 3KIJA 4KCAA 1GNEA 1JZWA 1TK5B 1U87A 3RPPA 1BG5A 1GNWA 2OACA 5F05A 4MJAA 1F6MC 4HZ4A 2RUFA 2VD1A 2XBQA 1KTEA 3LORA 1M0UA 1ERVA 1FB6A 3EC3A 3F4SA 4GQFA 3Q18A 2CQ9A 3DD3A 3MNGA 3QR6A 2FLSA 1M2BA 3GYKA 3W8JA 1FVJA 4F0CA 3Q6OA 3IE3A 5D73A 2XBIA 2QGVA 11GSA 4TKYA 3ZL5A 2YWOA 1XW5A 2FA4A 4JR4A 1NHYA 4ZL8A 2H0HA 2YZUA 3D0ZA 5L71A 2I9HA 1AQVA 4DSSB 1K0AA 1XVWA 2AV4A 1Q4JA 2YJ7A 1S3CA 4QL7A 6GSXA 4ZBAA 2WGRA 3UARA 1BQ7A 1VRSD 5ENUA 2ON7A 2MMNA 1UVZA 5G5EA 2K6VA 2MZCA 4EDZA 1GTUA 4G19A 3HXSA 1LBKA 1UN2A 2H76A 2DJ2A 4JEDA 3GH9A 3TOTA 3QFAC 2WJUA 3M1GA 4OFMA 5IMDA 3ERFA 2JL4A 1TU8A 3S9FA 2OADA 3ZYWA 3CBUA 3A2WA 3HVSA 3F8UA 2JZTA 2HI7A 1Z3EA 4IJIA 5EVOA 4PUFC 1QUWA 1M9AA 3GN3A 5J9CA 5F8BA 5DAKA 4Q5QA 3HCZA 3Q19A 2KOKA 4F2IA 5HFGA 1QXHA 1GSEA 5JCGA 5ELAA 2PMTA 4L0UA 1KNGA 5CRHA 4HUAA 1AQXA 3EMXA 4RUVA 3C73A 4TW5A 3KM6A 3ZMLA 2GZZA 5C00A 4IBPA 1Z7PA 2HT9A 2H6YA 4AF2A 4IW9A 2I81A 4XRDA 1XBSA 3M9KA 5AIXA 4ECIA 3GL5A 2H6ZA 3KZQA 3P8WA 2HZFA 4NXIA 2H01A 3GKNA 5H5RA 4G2EA 3MAKA 4HJMA 5B8AA 1DE1A 2E2GA 3I69A 1R4WA 1URMA 4MJEA 4L5LA 3FHKA 2XC2A 2X99A 3LXTA 1A0FA 5HR2A 2LRTA 1T1VA 5IMVA 1SD9A 3CTFA 3VWXA 1SJ6A 2V41A 2EIRA 3FR9A 4ZB6A 4PQ1A 2HZEA 1NW2A 3N5OA 4KNDA 2HFDA 1AAZA 4OFTA 3ZLPA 4HOJA 1SL1B 2XPDA 2LS5A 4WBJA 1WJKA 2R5GA 3QAGA 3IXRA 2L6DA 1Y6EA 4WEYA 3DRNA 4GTUA 5J3RA 4JR6A 1G6WA 3QMXA 5IIZA 3LWAA 2KLXA 3GH6A 4HQSA 1SYRA 1MDKA 4O92A 1VGLA 1OC8A 4BPYA 4LL1B 2JSZA 4GRFA 2H74A 5HQPA 3VWWA 4OCFA 2R37A 4PGTA 4WR4A 3KMOA 4I2UA 1OAZA 1EWXA 3G7IA 5ID2B 1ZGNA 4I2TA 1ST9A 3TCOA 1B9XC 3GL3A 5J9BA 1KBNA 3L9UA 1TU7A 2VL2A 3UBKA 5HR3A 2GQLA 4G9HA 4FYBA 3TKRA 3ZFLA 4Q5FA 2VCZA 2QC7A 1KEBA 2IWTA 3KCMA 4KSMA 4OCEA 2EIQA 2WS2A 5ECQB 5DBQA 2PWJA 4MP4A 3IR4A 3GA4A 4J2FA 4ACSA 4WF4A 4Z7XA 3HJOA 4ZL7A 3VWVA 4GSNA 1XW9A 3A3TA 3O6TA 4CW9A 2LJAA 5GAPD 3EMPA 3ZVJA 2F8FA 3TDGA 2V6OA 4MZWA 2B5YA 4AJ8A 2CVKA 3QFBC 5LNKe 5IMCA 2K9FA 1E2YA 3GV1A 2GT6A 3HHVA 4MZCA 1TW9A 5INYA 2RLIA 3M3MA 2VCQA 2RUEA 4MZBA 5CAXA 2DC5A 1T4YA 2FNOA 1ERTA 4ECJA 4MMMA 4GXZA 2VL3A 3EWLA 2O7KA 2WZ9A 2VL2C 4IP6A 2VCWA 3RAZA 4TR1B 2ALBA 4D73B 5GSSA 3CRTA 5CRGA 1GSUA 1LU4A 3LGCA 4MPGA 4MF7A 3M9JA 1V9WA 1PRXA 4X0XA 3CSJA 4HU9A 4ZB9A 4CDOA 5FHIA 2NTOA 1GTIA 5A4UA 3TRQA 3EVIA 1PX6A 2DIZA 4JZQA 1PL2A 4KSOA 5G2ZA 2HNLA 2BTOT 1EV9A 2OA7A 2YJHA 1TRWA 2VUPA 1T3BA 4MF6A 2ZNMA 2HLSA 3IOSA 1SENA 3TKPA 2PERA 1F9MA 2DJ3A 5HR1A 5F07A 3F9UA 5D93A 3TOUA 5IO0A 2C1YA 5IM9A 4TRXA 1ZCPA 2VD0A 3IV4A 3HVVA 3AY8A 3UVTA 7GSSA 5JCWA 3HZ4A 1GP1A 1ZOFA 4K7OA 3C71A 2O87A 2B7JA 1GUKA 1XWKA 4NPBA 1AXDA 3CMIA 2MMAA 4EO3A 4LMVA 3IK7A 3V1WA 2B1KA 5ECKB 3OR5A 1NHOA 3PGTA 2ES7A 4L0WA 4BWSA 4L8EA 4GLTA 3JCML 2B5XA 3RHBA 1TTZA 4KB3A 2MMOA 1X9SB 2IFQA 3HYPA 5E4WA 4KX4A 1ML6A 4Q5RA 3DGQA 3LJRA 4DSRA 2YV9A 5EL8A 4FIWA 4KGIA 3RBTA 4MJBA 3EYTA 1TXXA 2DSAA 1ACVA 3ZITA 1M7TA 3P7XA 2CV4A 1OKTA 3UIWA 3DXBA 3KH9A 2H19A 2K8VA 2IFQB 4EKZA 2XPEA 3I9V2 4Q5NA 3FZ9A 4YAVA 2IIYA 2YP6A 5HFIA 2NDOA 1OVNA 4N11A 2Z9SA 3TJKA 3KP9A 2NBSA 3BCIA 5G31A 3DVXA 2JACA 3WT2A 2MBTA 1VF2A 2R3XA 3LYPA 4FO5A 4V2MA 2C80A 5GSTA 2TRCP 5IO2A 3GX8A 1WIKA 1O85A 4IN0A 4POKA 3BD2A 4ISDA 2PPTA 1MD4A 5CREA 4QL9A 2OJLA 4EUYA 4YQVA 3GFKA 4N0VA 1ABAA 4X1UA 3TJJA 3A2VA 2P5QA 3FW2A 1SK2A 1SKWB 1K0BA 4ZXGA 3F3RA 5AGYA 2M80A 3L9VA 1R7HA 3KD0A 1EEJA 4BA7A 3GURA 1THOA 3GX0A 2YV7A 1YKCA 4GSSA 2C3TA 5J5NA 2L4QA 3ME7A 1TKDB 2LTKA 5JWOB 2H1GA 3L78A 2N5FA 3VI5A 2IMFA 2CX3A 1FW1A 1C72A 2G2QA 4JRRA 4RQXA 1T00A 5A4WA 6GSTA 1M2DA 1GUMA 1QQ2A 2KHPA 4YQUA 4NHWA 3RPNA 3N9JA 3IC4A 5DCHA 3APQA 5IMZA 4TN8A 3F6DA 1RK4A 1O81A 2A2RA 3KTBA 5FWGA 5D96A 5ECSA 1GL8A 5IPHA 3KXOA 3F0IA 3DVWA 2L6CA 1AIUA 1Z6NA 1HNBA 1PA3A 4I97A 1RQMA 2IMEA 4PX1A 4HU7A 2VIMA 3CXGA 1QGVA 1THXA 4LL4B 2IMKA 1U3IA 2O85A 2C3QA 2CZ3A 1U3AA 3WYWA 1B9YC 3GSSA 4BVXA 2AUVA 1K0OA 2JZSA 4BVYA 1WOUA 1OKDA 3IAS2 2L5OA 2CX4A 3UL3A 4O5RA 4I5QA 2VM2A 4ECCA 5GAND 5IPGA 5IQYA 5F0GA 3GKXA 5KN1A 3H79A 5DAKB 3BBYA 3C1RA 3RHCA 5LCZA 2AYTA 1V40A 2E0QA 5ECIB 3G7YA 3KH7A 4TXOA 1SL2B 1PKWA 2WRTA 1GTAA 3DKSA 1Q98A 1WP0A 1CQGA 1EOHA 3SBCA 4F9ZA 3FR3A 2F51A 1GSYA 1O6JA 2DJKA 2FGXA 4NWYA 1XWGA 3LEFA 5CRWA 3F4RA 1IYHA 5B8BA 3LSZA 2IJYA 2M46A 4OMVA 1JLVA 2CAQA 1GTBA 2AB6A 4XS4A 2B3SA 2DJJA 2X8HA 4WBRD 1J0FA 1Z6MA 4MLYA 2GQKA 3PINA 1SL0B 4PXOA 4GF0A 2HYXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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