3ZVJA

Crystal structure of high molecular weight (hmw) form of peroxiredoxin i from schistosoma mansoni
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
MVLLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVCPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITINDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
publication title Moonlighting by Different Stressors: Crystal Structure of the Chaperone Species of a 2-Cys Peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE
total genus 33
structure length 165
sequence length 165
chains with identical sequence B, C, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zvjA00
3TKSE 4MH2A 5D93A 2H76A 2I4AA 2HSYA 2QKEA 3C8EA 5CP1A 1V98A 5L71A 1HNBA 3CTFA 3CBUA 1KTEA 3FR3A 1GSEA 4LL1B 4ZBAA 2L5LA 5ELGA 5FWGA 2VLTA 4TR1B 4O7HA 2HZEB 1B9YC 2PUKC 3TRXA 1O8XA 2L4QA 1UA5A 2H8LA 3D22A 5IMZA 3GN3A 3G7JA 4TXOA 3DYRA 3TKRA 5FT3A 1SJZA 1NSWA 1XVQA 2K9FA 4BPYA 3MNGA 3FR9A 3RHBA 4V2LA 1EGRA 1ZMAA 2B7JA 2XBQA 2LRNA 2LRTA 5AISA 2FWEA 3VPQA 4N11A 3SWLA 2GDRA 3FW2A 1M0UA 4GCIA 3UVTA 3EC3A 5DCHA 2RM6A 2CZ3A 1RQMA 2H73A 2JACA 3TJKA 3DVXA 1ZOFA 3CMIA 2FWFA 4TKYA 6GSYA 2MMOA 3ZVJA 2G2QA 3TOTA 4V1Ag 3L4NA 3F6DA 2GSSA 4F2IA 4IP1A 3VI7A 1T4ZA 4WR4A 4GWRA 5DAKB 1BG5A 1XWGA 1H4OA 3UAPA 2FD3A 2HT9A 3ZITA 4HUAA 2CX3A 4EVMA 3GL3A 4BL7A 4GF0A 1PSQA 2YWMA 4GRFA 2HLSA 4LMWA 1Z9HA 2KLXA 6GSXA 3GX8A 2GLRA 2WRTA 4QL9A 3RPPA 4PX1A 4XCSA 1T3BA 1AUCA 3E9JB 5IOXA 5B8AA 3ME7A 1TJDA 3DXBA 2AUVA 2XPDA 2F8FA 3RAZA 2PBJA 3DRNA 4IQAA 2FY6A 1N2AA 1J08A 2GQLA 4MH3A 2FA4A 4XIHA 3TJGA 1QQ2A 3GKXA 4ZL8A 1JHBA 3M8NA 2PN8A 2AV4A 3GH9A 4AJ8A 4ZL7A 4EXJA 1EGOA 2TRXA 3Q19A 1Z5YE 2EIRA 2VCZA 3TJJA 3BCIA 1YEXA 3QAGA 2YP6A 1AXDA 1K0AA 2PPTA 3ERWA 3Q6OA 2GS3A 1XVWA 1YZXA 4FYUA 4Q5QA 1SKRB 1PRXA 1ML6A 3QFBC 5E59A 5IQYA 3VWVA 2LQQA 2C0GA 1A2MA 1HD2A 3F4SA 4MF5A 1TTZA 2GSTA 5COHA 6GSWA 1R4WA 1TU8A 4IVFA 3GL5A 2MMAA 2OKAA 4NXIA 2NDOA 2M80A 5HFIA 1M2AA 2VCXA 2YN1A 1TP9A 3NIVA 2C3NA 3GIXA 2H1BA 4D73B 2K6VA 3I43A 2LSTA 1ACVA 3DWVA 5G1KA 3CRUA 2REMA 3R2QA 1TRUA 4IW9A 4AJ6A 4KDYA 3PGTA 3UBKA 3TKSA 3UJ1A 4HDEA 3F6FA 22GSA 2P31A 2YZUA 3FZAA 2E2GA 3M9JA 5JCGA 4FH8A 2CZ2A 1OC9A 4KUNA 1F6MC 3DEXA 1A24A 2OJLA 2BTOT 2L6CA 3ZFBA 5GSTA 3F63A 3ME8A 3TJBA 3UOMA 1XWAA 2O87A 1QFNA 3GA4A 1XPVA 3A2XA 4MJBA 1GL8A 1BYEA 4TVEA 3EU4A 5IMCA 1PL1A 1S3DA 5G5EA 4IKHA 3KMNA 5FHIA 5J9BA 2WS2A 4KCAA 3G7YA 3C1RA 3VLNA 1XCCA 2OBIA 3FR6A 1Z3EA 5D9VA 5ID2B 1BAYA 2I81A 2YWNA 3GTUB 1AQWA 2DC5A 5JCWA 5DBQA 1PKZA 2DIYA 4LA1A 3C73A 4IELA 5ECNB 5CREA 2YCDA 1DE2A 2AAWA 2E7PA 1IYIA 3HDCA 5DQSA 1BEDA 2VOCA 4K7IA 6GSTA 3CSJA 1PL2A 4ML6A 4F82A 1Z7PA 4XS1A 14GSA 2YZHA 2DJ3A 2V1MA 1SKWB 2LNSA 1Q98A 2H1GA 5C04A 3CXGA 1A2JA 4HQZA 3LORA 1MTCA 1AQXA 1DBYA 3UVHA 1HNCA 1WJKA 3LWAA 1TW9A 4WBJA 2PERA 2R4VA 5ECSA 4RI6A 4OFNA 2L59A 3ZMLA 1GP1A 3LSZA 1HNAA 4N10A 4GSNA 1TU7A 1PKWA 4MMMA 3EYTA 1TI1A 1XOAA 3A2VA 2AYTA 2WFCA 4CHSA 4BVXA 1K3LA 3U6VA 4TXOB 3EURA 3F4RA 1TK5B 1X9WB 3D0ZA 3PR8A 1GWCA 3FK8A 1XWCA 4MJEA 4ZL9A 1V57A 2BMXA 1JZRA 1DUGA 2NTOA 5D8IA 5IO0A 2O85A 5ECOB 2E0QA 2RM5A 1ERTA 3EMPA 5AIXA 4MDCA 1J0FA 4EC0A 4EF0A 2M46A 1PMTA 1QGVA 5JWOB 4I2TA 1K0MA 4PUFC 1N8JA 4PXOA 5ECQB 1DSBA 3RHCA 2C3QA 5IMFA 4OO5A 1GRXA 3FHKA 1GLQA 4JR4A 3GHAA 2H0HA 1TKDB 4HZ2A 1ILOA 2DJJA 2DMMA 2JZRA 5F0GA 5LNKe 4OFMA 1YF1A 1M9AA 3FEUA 3UBLA 1BQ7A 1YEPA 5EL8A 4ZXGA 3HYPA 3P7XA 2CVKA 2IFQB 2FCHA 4RI7A 3IK9A 1F9MA 1Y6EA 4G2EA 4KB3A 2M72A 2X99A 3NZNA 4PQ1A 1SU9A 19GSA 5KN1A 2CQ9A 2V2GA 3UL3A 3HJOA 1TOFA 1X5DA 4X0XA 2MBSA 3IAM2 1G7EA 3HCZA 3DGQA 1TRSA 1E2YA 1GUMA 5CAXA 3D21A 3UMAA 2VCVA 4KDXA 5LCZA 4XRDA 2B6MA 2V6KA 1A0RP 2FNOA 1XW9A 11GSA 2C0EA 1OE7A 5HFGA 3DKSA 4WKWA 5HR1A 3GKMA 4XTSA 1TDIA 4L5LA 3TKPA 1WIKA 1GULA 1X0RA 1SD8A 1XIYA 2MYGA 5G2ZA 1FVKA 1RK4A 1V58A 5J9CA 2K8VA 3APQA 3ZIVA 1MEKA 4XRAA 1U87A 4EO3A 2I1UA 1GSFA 2B1KA 4ID0A 4POKA 2XHFA 3FZ5A 4GXZA 3ZIJA 1OC8A 3I9V2 4HQSA 1GSSA 2H66A 3HVSA 5J3RA 2IMFA 3H8QA 1PX7A 4KE3A 3FYGA 4L0UA 4OMVA 1GUHA 2HRFA 17GSA 3GSTA 2PU9C 3HA9A 1ST9A 3GFKA 2PGTA 5JWRB 3W8SA 1SD9A 2RUFA 5B6MA 3DIEA 2V32A 2VLUA 4ZIJA 2CAQA 3VPTA 5CYYA 2HZFA 3H4KA 2HRNA 5B8BA 3VWWA 3M9KA 4ML1A 4G19A 5IO2A 5J41A 4DVCA 2IIYA 5EPFA 3C71A 1SL1B 3KP8A 3D6IA 2WCIA 3F3RA 1ERVA 1OC9B 2EIOA 1ZYEA 3BD2A 2X8GA 1V2AA 1H75A 1Z7RA 5KN3A 3EU3A 3K8NA 1VRSD 3G7IA 3H93A 5CRWA 2H0GA 1AQVA 5ECIB 4DSSB 3UARA 4CW9A 2YV9A 2C3TA 4MK3A 3GUSA 1EP8A 2CVDA 2FHEA 3GKNA 3I69A 3ZL5A 2C0DA 2VLVA 4K8MA 5JWQB 5A4UA 2ON7A 1F37A 5DALB 3L9UA 5IM9A 5G31A 1PA3A 1KBNA 1A2LA 1CQGA 2DLXA 1B8XA 1MDKA 5AIVA 5B6NA 2VL3A 1ABAA 1SJIA 2V41A 1EV4A 3ZVJD 3TB2A 1G7OA 10GSA 2C8UA 1M2DA 2GQMA 5ECLB 2X8HA 1EEJA 1C72A 4N30A 2B1LA 3CSHA 1ZZYA 4F9ZA 2H6XA 2VL2C 3IXRA 12GSA 4ZB9A 5GAND 4IGJA 3H1NA 3ZMKA 4HI7A 3ZYWA 2C80A 2R37A 2JSYA 4GQCA 2E2MA 1SK0A 4BA7A 4KA0A 3LXTA 4ECBA 2WB9A 2PVOC 1GTUA 3JCML 3ZREA 20GSA 4GQFA 2PWJA 2OE3A 3A5WA 1B4QA 3J7Yk 3U5RE 4MJAA 2H75A 1F3AA 2B7KA 1WOUA 2GGTA 3A3TA 4WETA 3E0UA 1UVZA 3WGXA 4ECCA 2KUCA 4EDZA 1CQHA 1GLPA 2F8AA 4FYCA 4I97A 2H6ZA 3FRCA 5H5QA 1T1VA 4YQVA 1B9XC 1VF2A 3GRXA 1U6TA 1K3OA 4H86A 2CV4A 3HJMA 2H19A 2IMIA 5DCGA 5ECHB 3ZLPA 1URMA 3F4TA 1Z6MA 6GSUA 2R2JA 4ZB8A 1K0CA 4O5RA 2WJUA 2G0FA 2WULA 2GQKA 2H70A 4TR1A 2HZEA 2QSIA 5GSSA 2HYXA 2ALBA 2L5OA 2R6KA 1A0FA 2AJQB 1WRYA 4HU9A 1FHEA 1WMJA 3WD6A 2KOKA 4TRXA 2A2RA 1XZOA 1WP0A 1VGLA 2QGVA 3V1WA 2OBKA 2XPEA 2GTUA 4X1UA 4KNDA 5HR3A 2LKUA 4EUYA 4YAPA 3EVIA 2H01A 1SKSB 1X5CA 5IMVA 1GUKA 4IJ3A 2LTKA 3L0HA 4ZB6A 4WEYA 2YWIA 3A2WA 2PVQA 4OCEA 2MMNA 3C1SA 1SK1A 2P0GA 1JZWA 2PMTA 4WF5A 3IPZA 5B7CA 2KP2A 1W89A 1MDJA 2J9HA 2WDUA 1XWKA 3BBYA 1S3CA 2MBTA 4XS4B 1LBKA 1Q4JA 4JBBA 2XBIA 2IL3A 3MSZA 1TK8B 1WWJA 4ILFA 18GSA 1R26A 2L6DA 5KN2A 5DAKA 4IN0A 3IBHA 4NV2A 1YDKA 4WXTA 1PGTA 2DJKA 3D4MA 3HZ4A 4ECIA 1XW5A 2HI7A 2ON5A 3N5OA 1WE0A 4TN8A 3IDVA 3HXSA 4X43A 2P5RA 4L0WA 1KEBA 5HQPA 4NAXA 4IP6A 3WGEA 5H5RA 3F0IA 2K18A 3L9SA 3TKQA 3TDGA 1XW6A 2GZZA 5EY6A 3HY2A 1TRWA 1TRVA 1V9WA 1OYJA 4MABA 3IAS2 4E8EA 3TCOA 2X8CA 1V40A 2B5YA 4MZBA 1ZCPA 3TUEA 2IMKA 1LJRA 3ED3A 3L9VA 4HU7A 4PURA 4KDUA 1O8WA 4OO4A 2B5XA 1EOHA 4L8EA 1SL2B 1PD21 1A23A 4PQHA 3QAWA 1YKCA 5CRHA 1FB0A 1HQOA 2H0IA 1ERWA 1G0TA 1J9BA 3Q18A 1BJXA 4BWQA 5IOWA 1OAZA 2RLIA 3KXOA 2YANA 2D2ZA 4MPFA 2B5EA 4MP4A 1O6JA 5D9XA 3E3EA 4GTUA 4IJIA 4K1FA 1A8LA 2VO4A 3BOAA 3CYNA 1R7HA 5ECPB 5ECKB 3P2AA 3LJRA 4TOPA 2HE3A 4I6XA 5A4WA 2B3SA 2C4JA 1TK0B 3GMFA 3IA1A 2ES7A 3ZFLA 3F9UA 2JZSA 3TRPA 1GSUA 4D73A 1O81A 3EINA 2CAIA 4JRRA 1ZL9A 3M0FA 1R5AA 4JZQA 4YQUA 4AF2A 4MCUA 4GSSA 2OADA 1B48A 4WR5A 1SK2A 4HEA2 2C1YA 1AW9A 2C0FA 5F07A 4ULXA 4HJ2A 2A4VA 2FLSA 4ECJA 4K6XA 2J23A 3P90A 7GSSA 1MD3A 5IMDA 3WT1A 3ERGA 5KEJA 4MZCA 3HVVA 4ZBDA 5D9WA 4MJCA 5DVBA 3IE3A 3O76A 1R5PA 1VF3A 4KAEA 3LYPA 4NMUA 3BCKA 5HR2A 1FAAA 3DD3A 2LS5A 3O3TA 3GKKA 2QC7A 2LJKA 1FW1A 4G10A 2FA8A 3DMLA 5ID2A 5A4VA 2MZCA 3O6TA 1YY7A 1AAZA 4EL1A 2VL9A 4N0VA 4HOJA 1F3BA 3KH9A 4QL7A 4I8BA 3VWXA 4ZILA 3ZTLA 2H74A 2VAFA 1UC7A 4JE1A 1K0DA 1YJ6A 2VCTA 3FKFA 4K0GA 3EMXA 2EC4A 3LEFA 3LFLA 1SL0B 2Z9SA 2LV3A 3GYKA 4MZWA 4CDOA 3KZQA 4LL4B 5A5KA 2YV7A 3FZ9A 2RIIA 2FGXA 1RW1A 2N5BA 2CVBA 4K2DA 5CO3A 1Y25A 3HD5A 1G6WA 3N9JA 8GSSA 2IMDA 2LNTA 4MF7A 2FUG2 1Z6NA 3KD0A 3QFAC 1GTBA 1I9DA 3MWHA 1B4PA 1MDIA 3EWLA 2CT6A 1O85A 2MMZA 4Q5NA 2V6OA 4HS1A 5GAPD 5CRGA 2NBSA 4J56E 5DQYA 5HFKA 1GTIA 5G1LA 2I9HA 4V2MA 1USBA 2LEGA 4PQIA 4G9HA 1TXXA 2AHEA 4YH2A 2ZUPA 2NVLA 3QD9A 2VL2A 3CTGA 3J7Yb 4I5QA 3QCPA 1F2EA 3QOUA 13GSA 3QMXA 1GH2A 9GSSA 1O7UA 1OKDA 5F06A 5CRDA 5ECMB 1K0OA 1OVNA 2N5AA 2IN3A 2O8VB 2DBCA 5AN1A 1FVJA 4KSMA 3KM6A 2VD0A 3S9FA 3APOA 2HXKA 3IHQA 3VI5A 1FB6A 2VM1A 3KCMA 3VWUA 5KN0A 2GSQA 1A8YA 3HJPA 1GNWA 4AGSA 1OE8A 4JEDA 2IMEA 4YQMA 5J4UA 2GSRA 3APSA 1KNGA 4E8HA 3WYWA 3L78A 3Q74A 4POLA 2IFQA 2H6YA 2H72A 2WZ9A 3FY7A 2JADA 3GSSA 4KGIA 2GVPA 1QMVA 2L4CA 2F3MA 3OR5A 1ON4A 2VM2A 3LGCA 4POBA 2I3YA 4I2UA 3QAVA 4O32A 1XFLA 1G6YA 2OACA 2JU5A 2WGRA 4AJ7A 3TJFA 2GZPA 1PX6A 3D4TA 1M7TA 1T7PB 1FG4A 3MDKA 1EEMA 2VCQA 1K0NA 2LUSA 1XBSA 1QUWA 1NHOA 2DSAA 1THXA 4LMVA 4XHMA 2DJ0A 3KIJA 1GSQA 5IIZA 1DE1A 3EE2A 3IOSA 1I5GA 2TRCP 2YOIA 4TXVA 4MLYA 1VF4A 1T8EB 4K7NA 4J2FA 4DEJA 5IMAA 2YPMA 1NHYA 4V1Ap 2XC2A 1GTAA 3PINA 5AGYA 3TRQA 3US3A 3H79A 1JFUA 5GZZB 4TW5A 1GNEA 2OE0A 2FWGA 4MPGA 4OFTA 4Q5FA 5J5NA 2R5GA 1TI3A 1T00A 2GT6A 1FOVA 4HJMA 2IJYA 2TIRA 5LD0A 2VUPA 3ZRDA 1UN2A 4Z7XA 4NHZA 3WGDA 2GT5A 2JZTA 3QR6A 4IS0A 4HZ4A 4BVYA 3PH9A 1SYXA 4OCFA 4TR0A 1QXHA 1QK8A 1GSYA 5D73A 5C00A 3GURA 3LXZA 1X9MB 1AC1A 4IBPA 1THOA 4J57E 2YJHA 4WF4A 4XS6A 1ZGNA 5ABRA 5D9TA 5E4WA 4IQ1A 4KSOA 4WBRD 5CNWA 2ZCTA 1BX9A 3QDNA 3W6GA 2LJRA 2DJ2A 3CSIA 2L57A 4KX4A 2HNLA 1EZKA 3D5JA 4NPBA 2JSZA 2LJAA 4RQRA 2KP1A 1OC3A 2N5FA 3MAKA 3KTLA 5D96A 5EVOA 1U3AA 4GSTA 4OWYA 4PGTA 3VK9A 4DSSA 1EWXA 4NWYA 4FIWA 3TOUA 3ERFA 4NV5A 4F03A 1SYRA 3KP9A 5G30A 4OD7A 1IYHA 1JZDA 6GSSA 2VIMA 3VFIA 2OE1A 1XOBA 1EOGA 1MD4A 5DALA 1VF1A 2RUEA 2YJ7A 1YKAA 4DSQA 4RQXA 5HR0A 2IWTA 3FZ4A 5F05A 4KW6A 4BWSA 1T4YA 3M3MA 2DMLA 3QPMA 3VURA 3IK7A 2O7KA 1M2BA 4L5OA 5F8BA 1X5EA 4EE0A 2DJ1A 3TKSC 5INYA 3IC4A 3WT2A 2CX4A 3DVWA 5DJMA 3KJYA 3M1GA 1XWBA 1K3YA 3KTBA 2R3XA 1OKTA 3IRAA 2JL4A 3KGKA 1EV9A 1K0BA 3KEBA 4PNGA 2BJXA 5ENUA 1JLVA 2YWOA 4NHWA 4K9ZA 4K0NA 3HZ8A 4ISDA 1NW2A 2P5QA 4FO5A 1SJ6A 2H1DA 1JZOA 1HYUA 2H71A 1M99A 4LLRA 1M9BA 2VD1A 4GLTA 5JCUA 3GNJA 2AB6A 4P3YB 5G5FA 4F0BA 1WPIA 4QQ7A 4ZBBA 3RDWA 3ISOA 3SBCA 4ACSA 1AIUA 3LG6A 1S3AA 1YQ1A 2CA8A 1PN9A 3IR4A 1E6BA 2LQOA 2VCWA 3HKRA 5IPHA 3AY8A 4F0CA 4IHUA 3HVXA 2DIZA 1W4VA 2IPAA 4KH7A 5H5SA 3LQ7A 3P8WA 4TR4A 2OA7A 1XXUA 3LYKA 3ZZXA 3GX0A 2X64A 3F8UA 4FYBA 3GV1A 5ECRB 2KHPA 5DDLA 5ELAA 4KCEA 4PNFA 4O92A 3TGZA 3I6AA 2FWHA 2HSHA 4JR6A 2F9SA 3G9BA 4DSRA 3C7MA 2H1AA 1ERUA 1ZYQB 2A2SA 3GH6A 4EKZA 3KH7A 1FO5A 2F51A 1JLWA 4PUAA 1GSDA 4TR3A 2EIQA 1U3IA 4N0ZA 3W8JA 3CRTA 2HFDA 1PQNA 3RBTA 4POMA 2O89A 4JU5A 2H30A 3HHVA 4XS4A 4YAVA 4RUVA 3NOFA 4K7OA 2ZNMA 1U88A 2K8SA 5IPGA 3UIWA 3GTUA 2LRCA 3RPNA 1NM3A 1X9SB 16GSA 1EP7A 2YNXA 3BJ5A 4MF6A 4MA9A 2NPBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite