2CX3A

Crystal structure of a bacterioferritin comigratory protein peroxiredoxin from the aeropyrum pernix k1 (form-1 crystal)
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
LVELGEKAPDFTLPNQDFEPVNLYEVLKRGRPAVLIFFPAAFSPVCTKELCTFRDKMAQLEKANAEVLAISVDSPWCLKKFKDENRLAFNLLSDYNREVIKLYNVYHEDLKGLKMVAKRAVFIVKPDGTVAYKWVTDNPLNEPDYDEVVREANKIAGELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Aeropyrum pernix
publication title Crystal structure of a bacterioferritin comigratory protein peroxiredoxin from the Aeropyrum pernix K1 (form-1 crystal)
rcsb
molecule keywords bacterioferritin comigratory protein
total genus 42
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2cx3A00
2J23A 2E0QA 3HKRA 3CMIA 2L4CA 4V2NA 4J57E 5F0GA 2XPEA 3GX0A 4MP4A 3P7XA 3AY8A 3TJBA 2L57A 2BMXA 4RI7A 5DAKA 2GZZA 1EOGA 1R4WA 5COHA 1A2MA 4WEYA 1M2DA 4KSOA 1BQ7A 4MPFA 2O7KA 5AIVA 2KUCA 3TRPA 4D73B 4L8EA 1O8WA 1GTBA 3IPZA 5CRHA 5EL8A 1NM3A 4TR1B 4BL7A 1K3YA 2PVQA 5H5QA 1K0AA 5DQYA 2H75A 2AHEA 3A5WA 4MPGA 4EDYA 1GP1A 2HZEA 5HR0A 5B7CA 2OKAA 4Q5FA 1USBA 4OMVA 4MMMA 1XIYA 3KTLA 4ECIA 4V1Ap 4LL4B 4F9ZA 3L4NA 1SKSB 4BVXA 2ALBA 5IMVA 4POBA 5ECMB 3FYGA 1B4PA 19GSA 5CAXA 1JZRA 1F37A 2IWTA 3CBUA 2YP6A 1GUKA 5KN0A 5G1LA 3ME8A 11GSA 3KIJA 1F3BA 3WGXA 1SENA 2DJ0A 2YWOA 3BJ5A 5IMFA 4PQIA 5ID2A 6GSWA 1G6WA 1WP0A 2PUKC 5IO2A 2K6VA 3KMNA 4MZWA 1SL1B 4HU9A 2B6MA 4EL1A 1HQOA 2H1DA 1OE7A 4X0XA 4LMWA 3WD6A 2VL2C 2VL2A 2IMIA 3EC3A 2HT9A 1MD3A 3FZ9A 1H4OA 1PN9A 4Q5RA 4DVCA 2K8VA 1N2AA 4RQXA 3GKNA 3M0FA 3MDKA 4OO5A 1T8EB 3O3TA 1YEPA 1WRYA 4WBRD 5CREA 3D6IA 2LSTA 1RK4A 3HY2A 1S3DA 2B5YA 1AQXA 4X43A 1X0RA 2CVKA 1URMA 5JWQB 3DYRA 2LJAA 1X9SB 5INYA 5HQPA 1AQVA 4AJ7A 3F0IA 4PGTA 2CVDA 4NMUA 5F06A 3DIEA 3OR5A 1EGOA 3A2VA 4MJBA 5B8AA 2DJ2A 3NIVA 3QR6A 4GLTA 4MCUA 4OD7A 2N5AA 2O85A 1Z5YE 3ZITA 4MLYA 2HSYA 2RUFA 4JZQA 1T00A 1TI1A 4HZ2A 3F3QA 2VCWA 1G0TA 1PRXA 2PVOC 4NHWA 2YV9A 5LNKe 1FW1A 4ILFA 3P8WA 1GULA 3F6DA 4WF4A 3EMXA 2R3XA 2YV7A 4ID0A 3E9JB 3US3A 4XS1A 3VLNA 4O7HA 1YKAA 4N30A 4MJCA 18GSA 3HHVA 3IOSA 4KE3A 4DSSA 3HJPA 5IOXA 1EEJA 1W89A 3ISOA 5DALB 2RUEA 5D9XA 3UVTA 1T4ZA 1Z9HA 1GUMA 2L59A 4K1FA 2OE3A 3UL3A 4I2TA 1S3CA 2C3NA 2FWFA 1SYRA 1A0RP 1GLQA 3H8QA 1XOBA 1PKWA 2LV3A 3UBKA 4MDCA 4OFNA 3VI5A 5KN3A 4KW6A 2LEGA 4IVFA 2OACA 4WKWA 2NDOA 2GZYA 1EV9A 1MD4A 1EV4A 4JU5A 2HE3A 4H86A 2F9SA 2KLXA 1XOAA 4FYCA 3ZYWA 3C7MA 2OA7A 2R2JA 5H5SA 5ENUA 4WBJA 3TCOA 3NZNA 5IQYA 3F8UA 2C0EA 4F0BA 3VFIA 2GVPA 5KN2A 3CTGA 5G5FA 3DMLA 4IELA 1SU9A 2V32A 2BTOT 3FZ4A 5G31A 4GSNA 1OC9B 1JFUA 2IN3A 1YF0A 3IV4A 1X5CA 3VWWA 2JZRA 1HNAA 2MYGA 2R5GA 10GSA 1AQWA 1S3AA 1XBSA 3UIWA 4K7OA 2K9FA 3GA4A 1J0FA 3LSZA 3LXZA 1DE1A 3FR3A 1K0DA 2B7KA 3BOAA 1C72A 1THXA 3G7JA 1H75A 3FK8A 4I8BA 4ECCA 5IPHA 4ZB8A 2V6KA 5IIZA 4K7IA 1M0UA 2C0DA 3L9SA 2XBIA 1OKTA 3FW2A 3GUSA 1K0CA 4TOPA 5G30A 2TIRA 2YZUA 3DD3A 4HUAA 2F51A 4JEDA 2OE0A 5DQSA 4E8HA 2H74A 2YZHA 2I3YA 4V2MA 3IHQA 3F9UA 4LA1A 4Q5QA 4AF2A 3WT2A 3R2QA 3HVVA 4NXIA 4JE1A 1MDJA 3HD5A 1OVNA 2YANA 3LWAA 1ILOA 1V2AA 1R5AA 1U88A 2REMA 3GKKA 2CT6A 1G7OA 5EVOA 2FA4A 5A4WA 3TOUA 4EXJA 5AGYA 6GSYA 1A24A 2AJQB 5DVBA 3ZLPA 2DJ1A 5G1KA 1B4QA 1FB0A 1PGTA 3APOA 3PR8A 4OCEA 4POKA 3A3TA 2WS2A 3D22A 2LRTA 2VM1A 3ZFLA 2H76A 3O76A 4GQFA 3L78A 4FIWA 1VGLA 5H5RA 2M72A 1ML6A 4FYUA 2FWEA 1KEBA 1T7PB 3IAM2 2C0GA 4QQ7A 1GSYA 1TK8B 2YWNA 1OC3A 2B5XA 1XWCA 2GSTA 1KNGA 2PERA 2I81A 1TTZA 4F2IA 4ZB9A 3N9JA 1GSUA 4K8MA 3RHBA 3D21A 5ECSA 3VI7A 2MMOA 4ZILA 1VF2A 1BYEA 2GQLA 2CQ9A 9GSSA 2EIQA 4I97A 4POLA 4MF5A 1YF1A 4I2UA 3D0ZA 2PN8A 2HFDA 3C8EA 3CRTA 2HI7A 1ST9A 2G2QA 2DMMA 17GSA 4TXVA 4IBPA 2XC2A 1QFNA 1Z6NA 3UMAA 3W8SA 1AXDA 2LRNA 2NPBA 6GSSA 3IR4A 2CX4A 4GF0A 1W4VA 2V2GA 2KHPA 3GH6A 4KDUA 4L0UA 4EVMA 1X9MB 2IMEA 4HZ4A 3KEBA 3IK7A 4EKZA 1O81A 3F4SA 2H71A 3DXBA 1QXHA 2VCQA 3UJ1A 2YOIA 2RM6A 7GSSA 1N8JA 2VCZA 2MBTA 4E8EA 4PUFC 13GSA 6GSVA 3VK9A 3BCIA 2CA8A 2J9HA 1TRWA 1FAAA 1GTIA 2GSRA 4NV5A 1Z3EA 3LORA 2E2MA 3P2AA 3FR6A 4L0WA 5IMCA 3HZ8A 4TKYA 3FHKA 4AGSA 3M9KA 5ECQB 3APSA 1ZGNA 2QGVA 1GRXA 1FB6A 2IFQB 2H0IA 3QCPA 4KUNA 5D96A 4BVYA 4KDXA 1GLPA 5F07A 3W6GA 2VL9A 5AIXA 3GKMA 3GTUB 2LRCA 3UEMA 3ZRDA 4POMA 1ZZYA 3S9FA 4GSTA 5J9BA 3ERWA 4QL9A 4KCAA 5L71A 1PX6A 2KP2A 1KTEA 3TKQA 2C4JA 4L5OA 1MTCA 1YJ6A 2AAWA 5IMDA 2BJXA 2VL3A 2DJ3A 2VCXA 2A2SA 1B9XC 1M2AA 1JHBA 1MDKA 3FZAA 1YQ1A 4G19A 2I9HA 3HYPA 2K8SA 1O8XA 2E7PA 1F9MA 5JCWA 3APQA 1DBYA 1XW6A 4G2EA 1AW9A 1GSQA 2ZUPA 4K9ZA 1SJZA 3KZQA 6GSTA 2YJ7A 4P3YB 3UBLA 4KB3A 1B9YC 2X8GA 3GSTA 3EU3A 4LMVA 1XFLA 3GHAA 3EU4A 2IMKA 3SWLA 2M46A 3GURA 3QMXA 4WF5A 1E2YA 1DSBA 2VAFA 1SYXA 4OCFA 5FWGA 2XHFA 1THOA 4O32A 1PQNA 2VCTA 1YDKA 1G7EA 3GN3A 1A2JA 4XS4A 2B3SA 4EF0A 5HR1A 2CAQA 4PX1A 3ZVJA 2CAIA 2GQMA 3TB2A 3F6FA 2WFCA 4TVEA 3EYTA 2H6ZA 4TXOA 1PKZA 1LJRA 1O7UA 1GTUA 1WJKA 1UA5A 2CX3A 1V58A 4HQZA 1TJDA 3HJOA 5DAKB 2M80A 1TP9A 4O5RA 4IP1A 4BWSA 3QOUA 1HNCA 3DWVA 3MSZA 2GTUA 1MDIA 5ABRA 2FY6A 4KA0A 1XWBA 4BWQA 2OADA 5DDLA 1GNEA 1XCCA 5ECRB 1VRSD 1R5PA 3LEFA 2ZNMA 2YN1A 4NV2A 1TK0B 2I4AA 1GTAA 2P5QA 2DLXA 3M1GA 1M2BA 2X8HA 2OBKA 1AAZA 3QDNA 2R37A 2HZEB 3ZVJD 3NOFA 1B8XA 2DBCA 2VIMA 1PA3A 1X5DA 1YKCA 4ULXA 5ECKB 2WJUA 2L5LA 1DUGA 2H1BA 1UVZA 5ELAA 1BEDA 3WGDA 5C00A 3IC4A 2KOKA 2JZSA 4XRAA 1I9DA 2LS5A 3KCMA 4PQHA 2NTOA 4TR0A 1XWGA 3GSSA 20GSA 4CHSA 4ZL7A 3KJYA 3TRQA 4KDYA 1GSDA 4YAPA 5ID2B 2LTKA 1NHOA 3U6VA 14GSA 5J3RA 2V41A 1FVKA 1VF3A 3LJRA 1EWXA 1U3AA 3KP9A 3Q6OA 4GTUA 2F8FA 4JR6A 4N0ZA 1F6MC 5B6MA 3HVSA 4XS6A 3KMOA 4MJEA 4HQSA 1EGRA 2KP1A 5JWRB 5CRGA 1IYIA 1JZDA 1WIKA 5EPFA 2LNSA 4EE0A 2VUPA 2L6DA 3FY7A 3H4KA 1A2LA 4TN8A 3FEUA 5E59A 1XPVA 3A2WA 2H0GA 5A5KA 2JU5A 2FNOA 1XW9A 3TJKA 1QUWA 3TKPA 2JSZA 4TR4A 4I5QA 1TU8A 3UARA 4EDZA 2MZCA 3V1WA 4YAVA 3D4TA 1U87A 3Q18A 2FLSA 2VO4A 2WCIA 4ZL8A 1K0OA 6GSUA 5FHIA 5HR2A 1K3LA 4D73A 4ECBA 5B6NA 3QAGA 1V9WA 4ZBDA 4OWYA 2L5OA 2GQKA 4IJIA 1SJIA 1EEMA 5D8IA 2GSQA 3CTFA 3TGZA 3QFAC 4TR1A 4ACSA 1LU4A 1OYJA 3ZMKA 2HZFA 1BG5A 3PGTA 2B1LA 1YY7A 4O92A 2RM5A 4GXZA 3D4MA 5HFGA 4MH2A 22GSA 5JCGA 1KBNA 1VF4A 3IXRA 1HYUA 2O87A 1ERUA 1AC1A 1NSWA 5IOWA 3EMPA 5C04A 5B8BA 4N0VA 4N10A 5JCUA 1K0BA 4KH7A 4EUYA 3MAKA 4F0CA 2EIRA 1PSQA 2LJRA 1E6BA 3LQ7A 3IRAA 1X9WB 4BA7A 3G7YA 3MNGA 4MJAA 3ZMLA 2C80A 3LFLA 4TRXA 4LLRA 1U3IA 4DSSB 2FD3A 2H72A 4AJ6A 3RHCA 5D9VA 1A23A 3WYWA 2CVBA 3H79A 2FUG2 3TJJA 2VCVA 1CQHA 3F4TA 3N5OA 4V2LA 2DC5A 2FWGA 3M9JA 1B48A 3C73A 2GS3A 5KN1A 2N5FA 1ZYQB 1ERTA 2NVLA 5ELGA 3GIXA 4RI6A 2PPTA 3EINA 3GKXA 2IL3A 3MWHA 3FKFA 2WZ9A 3PINA 4X1UA 4YQUA 5HR3A 1I5GA 2L4QA 2GT6A 4XIHA 1TI3A 3DGQA 3KH7A 3HDCA 3L9VA 2P0GA 2LUSA 1XW5A 3PH9A 3A2XA 1M9BA 4NHZA 4K2DA 4XCSA 3O6TA 4MH3A 4ZXGA 2EC4A 3H1NA 1SK2A 1OE8A 1BX9A 1EP8A 2IPAA 4JR4A 1QMVA 1OC8A 2GDRA 5D9WA 3IAS2 3RPPA 1FHEA 2H6YA 2C3TA 4IN0A 4GSSA 3HA9A 3LGCA 4HS1A 1TXXA 1YEXA 1NW2A 5D93A 4FYBA 5F05A 3IE3A 1XZOA 4GQCA 4IJ3A 3L9UA 2HRFA 1NHYA 5GAPD 1OKDA 2OE1A 5A4VA 1TKDB 1R7HA 2R6KA 3ZFBA 3KD0A 3ZZXA 3WGEA 1GSFA 5D73A 3TKSC 1UC7A 3TKSA 1PL2A 4MA9A 2VM2A 5CP1A 1SD8A 2H0HA 4HI7A 2YPMA 2WB9A 4WETA 2O8VB 4N11A 4K7NA 4L5LA 3GFKA 1V98A 2C8UA 2PMTA 2F3MA 2FCHA 3F63A 2D2ZA 3TDGA 4FH8A 2LQQA 3D5JA 1V40A 3CRUA 3I6AA 2JACA 4WR4A 4PQ1A 1FOVA 4NAXA 2JZTA 5DALA 3TOTA 1ACVA 4RQRA 3IA1A 3CYNA 4J56E 3P90A 1F3AA 1TRVA 2VLUA 3TJGA 3ZREA 5ECLB 4GRFA 4RUVA 2TRCP 3QAWA 4DSQA 4ECJA 4F03A 4NPBA 5CO3A 4HJMA 5IO0A 1XVQA 5DBQA 1Y25A 1GL8A 1R26A 2VD1A 2B7JA 3ERGA 4TR3A 5IMZA 4ISDA 1EP7A 1PL1A 1GWCA 5DJLA 4PNGA 2G0FA 3CSIA 3HVXA 4PNFA 3VURA 3CSJA 1ON4A 2H01A 1XVWA 3VWUA 5E4WA 1QQ2A 1ZL9A 2JL4A 6GSXA 1JZWA 1V57A 4AJ8A 4MF6A 1OC9A 2ZCTA 3J7Yk 2P5RA 16GSA 3UAPA 2LKUA 2H6XA 4PURA 2DJJA 5LD0A 4MF7A 4CDOA 3F4RA 1GH2A 1XWAA 5EY6A 3W8JA 1BJXA 3IK9A 2V6OA 2FGXA 5J9CA 3G9BA 2ES7A 2MMAA 2C0FA 1RQMA 4ZBAA 1WMJA 2HXKA 3EURA 5A4UA 5GSTA 2AYTA 2VLTA 2PBJA 5KEJA 1M9AA 3Q74A 2FA8A 1O73A 2DSAA 5ECHB 3DVWA 1Z6MA 3DVXA 4K0NA 4Z7XA 1GSEA 4KNDA 4DSRA 4XTSA 3EVIA 5ECNB 3Q19A 1U6TA 2LQOA 1GNWA 3TRXA 1PMTA 2AUVA 3F3RA 2Z9SA 2H66A 2B1KA 3ZIVA 1UN2A 1K0MA 4IQ1A 2F8AA 1Z7PA 2H1AA 3CXGA 3HZ4A 4HU7A 3CSHA 4JRRA 1YZXA 5CRDA 3RAZA 4K0GA 1SD9A 3RBTA 4IHUA 4IS0A 2YWMA 1BAYA 5CNWA 1ABAA 2AB6A 1WPIA 5J5NA 2VLVA 1ZCPA 4MABA 4ML1A 2X8CA 1Q98A 1EOHA 1FO5A 1A8YA 1WE0A 1X5EA 2EIOA 5J4UA 1EZKA 2O89A 3L0HA 3VPQA 3E3EA 3RPNA 3E0UA 3ZL5A 1O85A 2N5BA 1PX7A 2AV4A 2JADA 1SK1A 1WWJA 2RIIA 3M8NA 5IPGA 3TKSE 3QD9A 4G9HA 1VF1A 2WDUA 5GSSA 2FHEA 1RW1A 4FO5A 2H1GA 2V1MA 2VOCA 1HD2A 4KX4A 4NWYA 1TK5B 1ERVA 2CV4A 1TDIA 3LXTA 1JLWA 2HSHA 2XPDA 1K0NA 4YH2A 5D9TA 3GV1A 3DKSA 1T3BA 4IKHA 2X99A 3U5RE 4ZB6A 4LL1B 1ZYEA 1SL2B 2IMFA 5G5EA 4HJ2A 1SKRB 3I43A 1O6JA 4GCIA 1HNBA 2ON5A 1SKWB 2MBSA 2A4VA 3HXSA 2DIZA 1F2EA 5DCHA 2MMNA 3G7IA 2TRXA 4V1Ag 2L6CA 4XRDA 4QL7A 2IJYA 4HDEA 4WR5A 2P31A 5DJMA 3GRXA 5G2ZA 2H70A 3VPTA 3I9V2 4PUAA 2HRNA 3IDVA 3GH9A 2RLIA 4DEJA 4EO3A 1TRUA 4IW9A 2GZPA 3ED3A 2WULA 2HNLA 2C1YA 1GUHA 5AISA 3GYKA 3K8NA 3UOMA 3H93A 5J41A 2IIYA 3BBYA 3GL5A 5F8BA 2IMDA 2NBSA 2WRTA 5AN1A 3GL3A 2LJKA 2YNXA 8GSSA 1J9BA 1XWKA 1AUCA 1QK8A 1T1VA 3IBHA 3ERFA 1MEKA 3KP8A 2R4VA 12GSA 1JZOA 2I1UA 4MZCA 3VWVA 1ZMAA 3M3MA 1Z7RA 4MK3A 1IYHA 4XS4B 4ZIJA 1M7TA 4IP6A 4KSMA 1G6YA 3DEXA 3EWLA 3ZIJA 1ZOFA 3KTBA 2GSSA 4YQVA 2PGTA 4OFMA 2LNTA 3WT1A 3DRNA 2PWJA 2QKEA 4TXOB 1T4YA 1LBKA 4MZBA 5LCZA 1TW9A 1Y6EA 2K18A 3QPMA 2IFQA 3GMFA 1FVJA 2YCDA 2DJKA 1FG4A 3KM6A 1CQGA 2A2RA 2OJLA 4EC0A 5DCGA 2CZ2A 4KGIA 2GT5A 3GTUA 3TKRA 1GSSA 3TUEA 5HFIA 2H30A 4G10A 2XBQA 1DE2A 2GGTA 3BD2A 2WGRA 3FR9A 3UVHA 1XXUA 5CYYA 2VD0A 2B5EA 1A0FA 3KGKA 3C1RA 3FRCA 2OBIA 4ZBBA 1A8LA 3I69A 2E2GA 3VWXA 2HYXA 4YQMA 1TU7A 1JLVA 1WOUA 3EE2A 3LYKA 4J2FA 2FWHA 3KXOA 1SJ6A 1AIUA 3SBCA 1PD21 1SL0B 3TJFA 2GLRA 4Q5NA 4KCEA 2JSYA 4IGJA 5HFKA 4F82A 3C71A 3QAVA 2MMZA 5ECPB 2H8LA 2C3QA 2YWIA 5JWOB 3C1SA 3LYPA 4TW5A 3J7Yb 1QGVA 1ERWA 3GNJA 5ECIB 5GAND 4XHMA 5IM9A 2YJHA 3ME7A 1K3OA 3KH9A 1OAZA 2PU9C 1J08A 4IQAA 1Q4JA 4GWRA 4ML6A 3ZTLA 3FZ5A 5IMAA 2HLSA 1M99A 4JBBA 2ON7A 1TOFA 3RDWA 3HCZA 5GZZB 3HJMA 2H19A 2X64A 5FT3A 1SK0A 2H73A 5CRWA 3QFBC 3JCML 4PXOA 4K6XA 2CZ3A 3BCKA 4OFTA 2QSIA 4BPYA 4HEA2 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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