3GKNA

Insights into the alkyl peroxide reduction activity of xanthomonas campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped intermediate/ligand complex structures
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
MTDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGATTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris
publication title Insights into the alkyl peroxide reduction pathway of Xanthomonas campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped intermediate-ligand complex structures
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 47
structure length 159
sequence length 159
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gknA00
1K3LA 4PQIA 4Q5RA 1OE7A 2EIRA 2I9HA 5JWRB 2LS5A 4OO4A 2L5LA 3PR8A 3HJPA 4FYCA 4ZBBA 1B4PA 1TTZA 1LJRA 1WWJA 2B1KA 2L4QA 2WZ9A 2FA4A 4IP1A 13GSA 5CNWA 4RUVA 5CRGA 5CRHA 2NVLA 1K0AA 1GUKA 1GWCA 4I8BA 2WRTA 5LCZA 1PKWA 2C3TA 1IYHA 4MA9A 3LWAA 1AQVA 2JL4A 4XS4A 2XHFA 5DDLA 4HZ2A 3QCPA 1TU7A 2E2MA 4KA0A 4CHSA 1TDIA 1GUMA 1YF0A 1O7UA 1SJIA 4V2NA 3IXRA 2N5BA 4ZBAA 3TDGA 4K0NA 2B5YA 3KTLA 1A2JA 3KGKA 9GSSA 4WBRD 5GZZB 2RM6A 1T1VA 1SD8A 1XPVA 1PX6A 4OCFA 1DE1A 2MZCA 2FWGA 1GLQA 2H1GA 4NHZA 4GXZA 2B6MA 3FKFA 4PNGA 4HEA2 1HYUA 4WEYA 4I97A 5KN0A 4KGIA 4IVFA 2A2RA 1KTEA 16GSA 2H6YA 2VL9A 1AW9A 2KLXA 1ZMAA 2O7KA 4XS6A 4BVXA 3ZTLA 3VWVA 4JU5A 3GIXA 3W6GA 2B7KA 4ISDA 1EGOA 3LYKA 1ZL9A 1M9AA 2B3SA 2L6CA 1A0RP 2YWMA 3WYWA 1OC9A 1G6WA 2RIIA 2DJKA 4L0UA 2GZZA 4HZ4A 4TR1A 2P31A 1M2DA 1U87A 2DSAA 3EU4A 3F9UA 3VURA 1UVZA 4KDUA 5DALB 3F3QA 4AJ7A 2LV3A 1Z7PA 3EMPA 4RQRA 3IDVA 2NBSA 4LMWA 2I1UA 5H5QA 2A4VA 2PBJA 2LQQA 1JZRA 2P0GA 1GSFA 4QL9A 2CV4A 4AF2A 3TKSE 1ZZYA 3ZMLA 3EURA 4ID0A 3IPZA 1GSSA 2HNLA 2O89A 3RDWA 3LG6A 1S3AA 3RPPA 2PVOC 5D9TA 2MBSA 3DVWA 1G6YA 1SENA 4ML6A 3GTUA 5AIVA 3UVHA 5IOXA 1GL8A 5L71A 2LTKA 4X1UA 3CRTA 2PERA 1BX9A 3I6AA 2LJRA 2LKUA 3FZ9A 17GSA 4EKZA 5DCHA 2HRNA 4J2FA 2VM1A 2YZUA 3TJBA 5HR0A 4PQHA 2VL3A 1WOUA 3APOA 5IMCA 4MK3A 4WR4A 2LSTA 2PU9C 3IAM2 3HVVA 3W8SA 5A4WA 3GN3A 1VF4A 5H5RA 1M2BA 2IMEA 1N2AA 4LA1A 4Q5FA 4XRAA 2CT6A 2F8AA 1TP9A 2XBQA 4HOJA 4IKHA 2F9SA 2DJ3A 1F2EA 1PMTA 2A2SA 4HJMA 1JZDA 3ZL5A 3CSIA 1JLVA 5CREA 5DBQA 3M9JA 2DJJA 2IFQB 2KHPA 1XW6A 2VL2C 4EE0A 2QSIA 4MZBA 3ZLPA 2VCXA 3F4SA 3A2VA 1EP7A 2DIZA 2H75A 4Z7XA 2GSSA 3UMAA 3HA9A 4MP4A 1YEXA 2IN3A 3K8NA 4PQ1A 4OD7A 3KP8A 3P90A 1ZYQB 5C00A 4KCEA 3SWLA 5CO3A 3F3RA 5IMZA 2HSYA 2VCZA 3N9JA 5KEJA 1JZWA 3ERGA 4HQZA 2E0QA 3L0HA 2L57A 4F03A 4KH7A 5HR1A 2H01A 3I9V2 4KDXA 4KCAA 2C3QA 6GSYA 4XS1A 4XCSA 2AJQB 3O76A 4DSRA 1F3BA 4IJIA 2YPMA 1GH2A 1N8JA 3DXBA 2XBIA 1T4ZA 3F6DA 3DVXA 1EV4A 1TJDA 1JLWA 1Y6EA 2CZ2A 4PGTA 1AIUA 2Z9SA 3C73A 2H1DA 4DEJA 3DWVA 3KH7A 5ELGA 4O32A 2KUCA 2ES7A 4ZB9A 3L4NA 2LRNA 4PUAA 2IL3A 4RQXA 3GYKA 2IPAA 1H4OA 2JU5A 3DEXA 2D2ZA 1SK0A 1B4QA 1ZGNA 1ERTA 1Z5YE 2FWEA 2GGTA 3ED3A 4P3YB 2KP2A 1SL0B 2M80A 5HFIA 1XFLA 3RPNA 2AV4A 3TKSA 5ENUA 2FUG2 2TRXA 2HYXA 2F8FA 3EINA 2CVDA 3LORA 4F0BA 2AB6A 2CQ9A 3VWWA 4TN8A 2V1MA 1GRXA 3DGQA 1PRXA 1AXDA 1F37A 3Q19A 1Q4JA 1WE0A 2VD1A 1GTUA 1NHOA 4HU9A 1EEMA 1ST9A 1T00A 1FAAA 2LEGA 1KEBA 3O6TA 4JBBA 4GRFA 3GV1A 2CX3A 4MLYA 1OVNA 1TU8A 2M46A 4JR4A 5AIXA 5JWQB 2VCTA 3TJFA 2H71A 4CW9A 1JFUA 3G7IA 4YQVA 1S3DA 1SK1A 3BOAA 1XW5A 3HYPA 4IGJA 3GRXA 2H6XA 2KP1A 5DVBA 1LBKA 2ON7A 3GL5A 2WB9A 4LL4B 3ZFBA 4ECIA 1J9BA 1T4YA 4HUAA 5ECHB 2LRTA 1M7TA 1M99A 3GA4A 1K0MA 5IMDA 4L5LA 3QFAC 3BD2A 5A4UA 2VLTA 1EP8A 3I43A 2JZSA 3QAWA 2E2GA 1FVKA 2L6DA 2DLXA 1O6JA 3BCKA 4MF5A 4O5RA 2X64A 2GDRA 3IV4A 1F3AA 2O8VB 2H72A 4ZL9A 3TRXA 2XPDA 3IK7A 1GSEA 1UA5A 1WMJA 2GLRA 1PL1A 1SK2A 3KEBA 2C0GA 3W8JA 1OAZA 1MDKA 6GSUA 4MCUA 4Q5QA 3BCIA 3FZ4A 4WR5A 4NAXA 3ZVJA 1TKDB 1E2YA 2VD0A 3GH6A 5ECOB 1TK0B 3DIEA 3VLNA 2C0FA 2YOIA 4IW9A 2RM5A 1NM3A 4ULXA 1VGLA 4MZWA 2WCIA 1GSQA 1FO5A 6GSVA 5AN1A 3L9UA 2H70A 3OR5A 4HDEA 2O87A 2J9HA 1V2AA 5GSTA 5A5KA 3LJRA 3KD0A 5ECLB 1F9MA 2C8UA 5KN1A 3TB2A 4XRDA 2MMOA 4PX1A 3WT1A 2PN8A 1XOBA 2C1YA 1BAYA 4E8EA 1K0BA 3DYRA 3GKKA 3WGXA 2IJYA 4PUFC 3L9SA 1OC3A 4ZB8A 3CBUA 3TJJA 4MJCA 5IM9A 2LJAA 1R4WA 5CYYA 2B5XA 2IFQA 2GSRA 1MEKA 1U3AA 3ZYWA 4IBPA 2MBTA 4X0XA 4WXTA 1ACVA 3IE3A 3D4MA 3ERWA 3O3TA 4DSQA 1X9SB 3TRQA 1U88A 3WT2A 2OE3A 1FG4A 3GSSA 4K9ZA 2DC5A 1IYIA 1TK5B 4TXOB 3ZREA 2X8GA 4FO5A 3VWUA 3GKXA 4EL1A 4PNFA 4KX4A 4KSOA 1X5CA 3GX8A 5J9BA 1JZOA 5JCGA 1SYRA 2ZCTA 3C7MA 4TVEA 3J7Yk 2C0DA 4O7HA 1B9YC 1A23A 4XTSA 1WP0A 2E7PA 2K8VA 2HXKA 5IMFA 5GAND 1SKSB 4IHUA 4Q5NA 4POLA 1MD4A 1FOVA 3LXZA 4CDOA 2I4AA 1SL1B 4F0CA 2YV7A 2TIRA 2R5GA 3HDCA 1YY7A 3UAPA 1FHEA 3Q18A 3ME8A 3FZAA 4IELA 2FNOA 1TI1A 3D5JA 4WKWA 4TOPA 4BVYA 2PGTA 2VAFA 3WD6A 1ZOFA 1GSYA 1USBA 1CQHA 4MABA 5ECIB 5FT3A 1BG5A 2GZPA 1TOFA 3DMLA 4FYUA 2QC7A 1NHYA 1GTIA 4GQCA 2H66A 4PXOA 6GSXA 4IQ1A 3FR3A 4HI7A 1HD2A 3KM6A 4EC0A 3PH9A 3A3TA 3GL3A 2P5RA 5ECMB 2GT6A 3IOSA 2CX4A 1NSWA 4G9HA 4KUNA 1ILOA 1O85A 2GVPA 2I81A 1UN2A 5DAKA 2YN1A 4POBA 5F06A 3MNGA 1GSUA 3SBCA 1V98A 2NTOA 1M9BA 4L0WA 1J08A 1URMA 4LL1B 2K18A 2EC4A 2YZHA 4XIHA 3QAGA 4H86A 3UARA 5EY6A 1ZYEA 2HZEA 3U5RE 3EYTA 2H1AA 5F05A 4JE1A 4WETA 1SD9A 3GFKA 2GSQA 3TOUA 3QPMA 4RI7A 4AJ6A 4MPFA 4IS0A 2GZYA 5CRDA 1A24A 2VLUA 1EGRA 2GQMA 3KMNA 4X43A 5D73A 1XIYA 5HFGA 3KZQA 1PX7A 1PQNA 14GSA 3F4RA 1KNGA 4ECCA 2HLSA 1AAZA 2V6OA 1TK8B 3IHQA 2OACA 1X5DA 4YH2A 4WBJA 1GNEA 4F2IA 4BPYA 3CMIA 3CRUA 4DVCA 4WF4A 4K7NA 2XPEA 1X5EA 2F51A 4GLTA 3ZRDA 11GSA 1TRVA 4TW5A 8GSSA 1EOGA 5G1KA 4BWSA 1V40A 5B8AA 3H4KA 4DSSA 3CSHA 1MTCA 1A8LA 1AUCA 3J7Yb 2AAWA 5ECKB 3APSA 2BJXA 3UIWA 3QFBC 2OBKA 2AHEA 3KJYA 4K0GA 4BA7A 5HR3A 2YANA 4N10A 1ERUA 4EUYA 1QGVA 3FZ5A 1Z9HA 2H74A 3GKMA 4KB3A 2FWHA 1XVWA 2C0EA 1MD3A 4GSNA 4I5QA 2WS2A 4EXJA 1TRUA 3P8WA 5D8IA 5J41A 4J56E 4HS1A 2JADA 3RBTA 4IJ3A 5FHIA 1A2LA 1SJZA 1EEJA 2L5OA 3IAS2 4KSMA 3GSTA 1GULA 4I6XA 3C71A 5DJLA 1EWXA 1QMVA 3ZFLA 1H75A 2LQOA 4TR1B 1Q98A 4IN0A 3D21A 4I2UA 3QAVA 1K0CA 4MH3A 2RUEA 4EDYA 3D6IA 3MDKA 3P7XA 1ERVA 5EL8A 2DJ1A 1R5AA 4AJ8A 3TCOA 1K0DA 2LNTA 3M9KA 2HZFA 3TKRA 2RLIA 2ALBA 5INYA 5DCGA 4TXVA 4NXIA 3TKSC 5DQSA 5J9CA 3VPQA 4MJEA 3FW2A 3UJ1A 4YQUA 1QUWA 5E4WA 3FY7A 2MMNA 3M8NA 1GSDA 4TXOA 3GUSA 4JZQA 5ID2B 2HSHA 4GTUA 4NHWA 2BMXA 3G7YA 4YAVA 4HU7A 4F82A 2GS3A 1GP1A 3HZ4A 1DE2A 6GSWA 3Q74A 2IIYA 5B8BA 1XWCA 5A4VA 3I69A 1XXUA 3KH9A 4MF7A 3CTGA 4GCIA 1ABAA 2R2JA 3F0IA 1XZOA 2IMDA 3QR6A 3CSJA 3UL3A 1QFNA 4OMVA 1ON4A 4NPBA 2JSYA 3TJGA 4GSTA 3EU3A 1XOAA 2JSZA 5ELAA 2BTOT 2CAQA 3M1GA 7GSSA 1RW1A 4FH8A 4N30A 3C1SA 3FEUA 2C4JA 5DALA 1YJ6A 1JHBA 3TRPA 4TR4A 6GSSA 5IMAA 3VI5A 3C8EA 2R37A 2IMKA 2XC2A 2EIQA 2OADA 4RI6A 5G1LA 5DJMA 5G31A 2O85A 1O8WA 3GMFA 3ERFA 5IMVA 4OFMA 4L5OA 4N0ZA 3LQ7A 3D0ZA 3HJOA 1FW1A 5GAPD 3F8UA 4KW6A 1WIKA 4ZL7A 1F6MC 1Y25A 3F4TA 3WGEA 3DD3A 2ZUPA 2H1BA 5HQPA 3H8QA 18GSA 2OE1A 5ECSA 1U3IA 5IO0A 1TW9A 3G7JA 3MAKA 4V2LA 5HR2A 1BJXA 1VRSD 2H0GA 1SKRB 1PKZA 3UBKA 3HCZA 2YP6A 1DUGA 2N5AA 3TKQA 4D73B 3QOUA 3UVTA 1V57A 4KE3A 4KAEA 5JWOB 2VCWA 5LNKe 1AQWA 2PPTA 19GSA 4KNDA 2YCDA 3F63A 4GWRA 3S9FA 3TKPA 2FY6A 1SJ6A 4POMA 4PURA 2NPBA 1UC7A 1THXA 1RQMA 1SYXA 1XBSA 3G9BA 3HVXA 5D96A 5IOWA 3C1RA 4ECJA 4AGSA 2PMTA 2VM2A 4BWQA 1GNWA 3F6FA 3BJ5A 2I3YA 2ON5A 3FRCA 3Q6OA 1AQXA 5CRWA 1V58A 2HT9A 2CA8A 5D93A 5COHA 3U6VA 4XHMA 1YKAA 2R6KA 3LXTA 2PUKC 1CQGA 2JACA 1EOHA 5ECNB 4ZBDA 3FHKA 3GURA 3NIVA 3UEMA 3TOTA 3CXGA 1EZKA 2EIOA 2WDUA 3PINA 2JZRA 3D4TA 2NDOA 3VK9A 3A2XA 1KBNA 1GTBA 2QKEA 4ZB6A 1RK4A 2LUSA 2X99A 1MDJA 2KOKA 5E59A 20GSA 1W89A 1VF1A 5D9VA 4TKYA 2FD3A 3ZIJA 2GTUA 3P2AA 3DRNA 2LNSA 3BBYA 3H1NA 3QDNA 4WF5A 1K3OA 3VPTA 1I9DA 6GSTA 1FB0A 1SL2B 1B8XA 2VCQA 3CYNA 4YQMA 3E3EA 1YF1A 12GSA 2FHEA 3M0FA 4G19A 3QMXA 1XWKA 3LEFA 5CP1A 2H8LA 4K7OA 1B48A 1M0UA 2WFCA 3IC4A 2H0IA 4EO3A 1W4VA 4TR3A 4FIWA 4IP6A 1EV9A 1Z6NA 2FCHA 3GH9A 3TUEA 5IPGA 2LRCA 2JZTA 2HRFA 5G30A 4GF0A 4MJAA 5J4UA 2B7JA 2J23A 1YQ1A 2MMAA 3E0UA 3ZVJD 3EWLA 4K1FA 5JCUA 1PGTA 5F0GA 2L4CA 1XVQA 4ZXGA 1XCCA 3HXSA 2H76A 3L9VA 4NV2A 3L78A 4OFTA 5J3RA 1YDKA 1PA3A 1K3YA 3M3MA 2H19A 1SU9A 4K2DA 3HJMA 5G2ZA 3KXOA 4MPGA 1A2MA 3IR4A 1G7OA 5CAXA 3KP9A 5ID2A 2DJ0A 2MMZA 1QK8A 2PWJA 4EVMA 3A5WA 2AYTA 1K0OA 1OC8A 3ZMKA 4ZIJA 3FR9A 1Z3EA 4ML1A 2V6KA 3H93A 4K6XA 2GQLA 1ZCPA 1LU4A 5B6MA 5AGYA 2G0FA 4MMMA 22GSA 1HNCA 1C72A 1X9MB 4K7IA 2GQKA 4V1Ag 1AC1A 1YEPA 1XWAA 3HVSA 2DMLA 4OFNA 3HY2A 4GQFA 1VF2A 2CAIA 2VOCA 1T7PB 1HNBA 5AISA 1TXXA 2IMIA 3KIJA 4OWYA 3D22A 5IIZA 3ZITA 4LLRA 3ISOA 2K6VA 2RUFA 1YZXA 3H79A 1FB6A 1X9WB 4V1Ap 4N11A 2MYGA 3EC3A 4K8MA 1G0TA 3DKSA 2VL2A 4ZL8A 5IPHA 4OO5A 5ECPB 3UBLA 2V41A 2VCVA 2HE3A 4XS4B 3KCMA 3R2QA 2YJ7A 3LYPA 2GT5A 5EPFA 2C3NA 2B5EA 3WGDA 4HQSA 3FR6A 3RHBA 2K9FA 3MWHA 1PN9A 3N5OA 1WRYA 2OBIA 2H0HA 2TRCP 5G5FA 2YWNA 2GSTA 3EE2A 4G2EA 2L59A 3US3A 4POKA 4F9ZA 3IK9A 3CTFA 1HNAA 5G5EA 4O92A 5ECRB 5B7CA 4J57E 1BYEA 3APQA 4I2TA 1ML6A 2DBCA 2YNXA 4D73A 3RHCA 4TRXA 2P5QA 2DIYA 3QD9A 3HKRA 2F3MA 3KMOA 1B9XC 1R26A 3HHVA 2K8SA 3RAZA 5EVOA 3PGTA 5C04A 1OC9B 1XWBA 3IRAA 3JCML 2OKAA 2HI7A 3UOMA 1OE8A 1U6TA 3GX0A 3E9JB 5D9WA 2R4VA 4G10A 1BQ7A 3FK8A 1BEDA 2H73A 5HFKA 1TI3A 2FA8A 2X8HA 2QGVA 2WGRA 2ZNMA 3LFLA 1DBYA 4N0VA 1I5GA 4MDCA 5KN2A 1TRSA 1V9WA 2VLVA 2DJ2A 3ZZXA 5JCWA 5H5SA 2R3XA 2B1LA 2G2QA 5LD0A 2IWTA 2YV9A 2FLSA 3FYGA 4JR6A 4MF6A 3IA1A 2WULA 2N5FA 3VI7A 2X8CA 3GNJA 5ECQB 1OKTA 3HD5A 1M2AA 2VIMA 4OCEA 5D9XA 2YWOA 4QL7A 1QXHA 1GTAA 3GKNA 1O73A 3LSZA 3EMXA 4QQ7A 2CVKA 1HQOA 3GTUB 1ERWA 2REMA 3A2WA 2PVQA 5DAKB 10GSA 2OE0A 3NOFA 1Z6MA 5FWGA 5F8BA 1NW2A 1THOA 2VO4A 4ILFA 1OYJA 4JEDA 3MSZA 5F07A 4YAPA 3EVIA 2H30A 4ECBA 4KDYA 1R7HA 1X0RA 2HZEB 4MZCA 4E8HA 2WJUA 3LGCA 4NWYA 1A0FA 1OKDA 4MH2A 5DQYA 1J0FA 4EDZA 4EF0A 1T8EB 1TRWA 4ZILA 3VFIA 3KTBA 2V32A 4L8EA 1WPIA 1E6BA 1WJKA 1VF3A 2YWIA 5IQYA 2HFDA 2YJHA 4ACSA 4NV5A 2DMMA 2V2GA 1DSBA 5KN3A 1Z7RA 2FWFA 1PSQA 5GSSA 4IQAA 1GUHA 4GSSA 2OA7A 4V2MA 1PD21 4JRRA 1A8YA 4FYBA 3HZ8A 2M72A 1G7EA 2LJKA 5IO2A 4MJBA 1R5PA 2AUVA 4NMUA 3NZNA 1K0NA 3TGZA 1O8XA 4HJ2A 2VUPA 3AY8A 4BL7A 4DSSB 3ZIVA 2OJLA 3ME7A 1YKCA 1GLPA 2FGXA 1MDIA 5B6NA 1S3CA 3VWXA 2CZ3A 1XW9A 5J5NA 1O81A 3TJKA 1T3BA 1XWGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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