3GKN | Genus

Total Genus 47

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	47
sequence length	159
structure length	159
Chain Sequence	MTDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGATTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	Bacterioferritin comigratory protein
publication title	Insights into the alkyl peroxide reduction pathway of Xanthomonas campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped intermediate-ligand complex structures pubmed doi rcsb
source organism	Xanthomonas campestris pv. campestris
molecule tags	Oxidoreductase
total genus	47
structure length	159
sequence length	159
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2009-03-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3gknA00

1GSFA 3C8EA 2C4JA 5ELAA 1O8XA 1KBNA 1ZZYA 3GL5A 5F07A 5ENUA 5H5SA 2FA4A 2VCTA 3FR6A 2B6MA 5B6NA 2F8AA 5ECIB 3Q18A 1WP0A 4K0GA 1GULA 1XWGA 2GSQA 2DJ2A 3GTUA 2I9HA 4POMA 3KGKA 5CAXA 2KHPA 5KN2A 2HE3A 2CQ9A 1XZOA 3A2WA 1YJ6A 2HYXA 3QCPA 4GF0A 6GSWA 5ECPB 3IRAA 4NV5A 1PN9A 1T3BA 4K7OA 4PNFA 4KB3A 5IQYA 1X9SB 2LRCA 2YJHA 3ZVJD 4KH7A 3KP9A 2CVBA 4N11A 1EOHA 1M2DA 3QR6A 3D6IA 1DE2A 1XOBA 3KP8A 3KTBA 1A2MA 4V2LA 5IM9A 2CAIA 2EIQA 3D22A 3D4TA 5F05A 2IMIA 2RLIA 1FOVA 1Z5YE 1O73A 3EMPA 2GQLA 4TXOB 1MDJA 3LGCA 4FYCA 2VCWA 4MJEA 2HT9A 3HZ8A 3UARA 4ML6A 1U3AA 3TRXA 4MDCA 5D96A 5AN1A 2YWOA 5DQSA 4V1Ap 3TKRA 4NMUA 1C72A 2QGVA 4XS1A 1A2LA 5DQYA 1GNEA 1VRSD 3QOUA 2L5OA 4AJ6A 2DJJA 3MNGA 4TR4A 4TXOA 3TDGA 5CNWA 3ZFLA 3F0IA 2VD0A 4WXTA 3EYTA 2R5GA 1SENA 2YZUA 3CTFA 2HZFA 4K0NA 4LA1A 2HNLA 2ZCTA 3G7YA 1XIYA 2EC4A 4OFNA 1G6WA 3UBLA 2B3SA 4IHUA 2GDRA 3GH9A 4ZXGA 5J4UA 3QMXA 4PUAA 4I8BA 1J0FA 4HQZA 1QMVA 4EF0A 2H30A 3FZAA 2XBIA 3OR5A 5FT3A 1VF1A 5IMCA 5GAND 1G0TA 3F4TA 4OD7A 3E9JB 3VWXA 3D5JA 2WB9A 2PWJA 3K8NA 4HU9A 3QAWA 4XHMA 1N8JA 4JBBA 1BQ7A 2O85A 1YKAA 4BL7A 3W8SA 2ZUPA 4FIWA 2DIYA 2YWMA 3L9UA 4V2MA 5F06A 3HD5A 4MLYA 1GWCA 3F3QA 2C3TA 2GQMA 2A4VA 5CRDA 1GRXA 1TRWA 3TKSC 2YZHA 4DSQA 4NAXA 2OJLA 3PGTA 3KH9A 1BG5A 1GP1A 4TKYA 3US3A 4NPBA 1F6MC 5ABRA 2FNOA 5HQPA 3APSA 3LG6A 1I9DA 1B4QA 2R6KA 4P3YB 4QL7A 4E8HA 3PINA 2IMEA 3VWVA 3IOSA 3D21A 4N30A 2FCHA 1HQOA 3D0ZA 1XWCA 2PVQA 1M2AA 4PURA 1ERWA 2C0GA 1SD9A 1HYUA 1K0OA 3ZREA 1H4OA 2IJYA 3RDWA 2LKUA 3E3EA 2GGTA 10GSA 2VUPA 2A2RA 1GSQA 2DJ3A 3LEFA 2X8HA 1AAZA 3GX8A 1O6JA 1SJ6A 6GSYA 2DMMA 1EGRA 2GLRA 1G7EA 4K1FA 5ID2A 5HR3A 2DIZA 1TK8B 3HJOA 5DJMA 2I1UA 4K7NA 3GYKA 3UVHA 1WOUA 2H0GA 2PPTA 2GT6A 2M72A 1A23A 3IAM2 3TRQA 2C0FA 3I9V2 2OKAA 5IO0A 1MEKA 4BVYA 1E2YA 2L5LA 2WFCA 2C3QA 4GQCA 2YJ7A 2H6ZA 3CSHA 1PX7A 4BWQA 4Q5FA 4K8MA 1DSBA 1GSDA 2ON7A 3HJPA 2ES7A 2LQQA 2XPDA 3VWWA 1IYIA 5IOXA 3EC3A 1ABAA 3GMFA 2DC5A 1RQMA 4AGSA 2V1MA 4G19A 2G2QA 2H1BA 2HLSA 1QGVA 4K2DA 2VD1A 1AQWA 3VWUA 13GSA 2GZZA 5B6MA 5B8AA 1YEXA 1YF0A 1K3OA 17GSA 3HY2A 2QSIA 2C3NA 2V6OA 1SK1A 1T7PB 4ZB6A 3RAZA 2GSSA 4TR3A 1OC8A 5CYYA 4ZB9A 1R5PA 1O85A 5CRWA 2LNSA 1F37A 4CDOA 4LL1B 1QXHA 2FWGA 4YQMA 3IK9A 4AJ8A 4RI7A 3G7IA 1T8EB 2BTOT 4MF5A 2YV9A 1KEBA 2WZ9A 1ZYQB 3FZ4A 4PX1A 3H79A 2F51A 4I6XA 3L4NA 4HQSA 3FYGA 3WGDA 3BJ5A 3HJMA 4HUAA 1JLVA 2WS2A 4XTSA 4N0ZA 1LJRA 4EXJA 1GLQA 2FA8A 3KTLA 6GSXA 1BJXA 3F6DA 1NSWA 1W89A 2GQKA 2JZSA 2VLUA 2LV3A 1TJDA 4BVXA 5JWRB 1TI3A 5ECKB 3LJRA 1UC7A 2LNTA 1B48A 3KXOA 1PA3A 3WT1A 5CREA 2WULA 3GV1A 1Z3EA 2IWTA 1B4PA 2HSHA 2MYGA 1PKWA 1QUWA 4IW9A 4HI7A 2J9HA 1XVQA 3SBCA 5B7CA 4OFTA 4MJBA 1J08A 2AV4A 4JR4A 4GSSA 3P7XA 5A4UA 5ECRB 2HFDA 6GSUA 3KD0A 2R37A 3ZL5A 14GSA 4MP4A 4HU7A 3I69A 5G1KA 5HFKA 3F63A 4F03A 5J9CA 1M99A 5C00A 3CSIA 5A5KA 1NHOA 1S3CA 1CQGA 1R26A 2HI7A 3UIWA 4I97A 2VM1A 3RBTA 1EV4A 5IO2A 3R2QA 3TJGA 1R7HA 4KE3A 1MTCA 1X5EA 5IMDA 4POLA 2B1LA 5IPGA 1FO5A 4PQHA 3S9FA 3H93A 3EU3A 4RI6A 5FWGA 4PQIA 2LQOA 1WPIA 3QAVA 3IHQA 1AC1A 1H75A 4GWRA 3NZNA 2P5RA 3KMNA 2G0FA 4KAEA 1E6BA 3GKNA 4EDYA 4L5OA 3C71A 2YWNA 3FZ9A 3TKQA 11GSA 1OVNA 2FWFA 2LRTA 5A4VA 2FWHA 3RPPA 3LFLA 3KIJA 1YF1A 2CT6A 1JZRA 4HZ2A 2N5AA 4EE0A 4J57E 1X0RA 4RUVA 1JFUA 5KN0A 1Q98A 4MJCA 3TKPA 3M9KA 3ME8A 3HVXA 2YNXA 3VI5A 1EOGA 1AXDA 2V2GA 1TRSA 1U87A 2LJRA 1DUGA 1ZOFA 4F2IA 1HNAA 1GSUA 2O89A 5ECOB 3ISOA 5CP1A 4ILFA 1UVZA 5EL8A 1Z6NA 5IMVA 2YCDA 1GH2A 1T00A 2H6YA 4ISDA 2FLSA 2FWEA 4LMVA 1TKDB 1V40A 1A0RP 3MWHA 2PGTA 3FY7A 3HVSA 5DCGA 3V1WA 3BBYA 3VURA 2MBTA 2RM6A 4NWYA 1PSQA 3ZITA 2WDUA 2MMAA 1GUMA 5KEJA 4NXIA 3C1RA 2VM2A 3Q19A 1V2AA 1OE7A 5GAPD 4X43A 4K6XA 5GSSA 4GLTA 5IPHA 2QKEA 2B5XA 1XW6A 2JZTA 3IBHA 2MBSA 3M0FA 3NIVA 1O7UA 1YEPA 2IL3A 3GNJA 1SYRA 4OWYA 4MABA 1LU4A 3CRUA 4ML1A 4MMMA 2JSZA 3ZRDA 3MDKA 1SL0B 1GSSA 2P31A 1USBA 3L9VA 4O32A 3M1GA 5EY6A 5IMZA 4L0UA 1Z6MA 4V2NA 4MA9A 1SL2B 1XW9A 3IDVA 2HZEB 2NPBA 4XS4B 3GN3A 3HYPA 2LJKA 1ZMAA 1FB6A 2XHFA 4WEYA 2VIMA 4K9ZA 1FB0A 1A24A 2VL3A 2OBKA 5AIVA 1FAAA 3IR4A 1V9WA 2VLTA 3CMIA 3MAKA 4HOJA 1JHBA 4KDUA 4IVFA 2B5EA 1ERVA 3IC4A 1A2JA 2IN3A 2F9SA 1K3LA 4NV2A 2MMZA 1PL2A 2HZEA 3PR8A 3QDNA 1PQNA 2O7KA 3HVVA 3IXRA 5DAKB 4O7HA 2IMKA 1EWXA 2GZPA 5D73A 4DVCA 2YOIA 1NHYA 1SK2A 1ACVA 4DEJA 1HNCA 3BCKA 5J9BA 1EP8A 1QQ2A 2DJ1A 1PKZA 1NM3A 1RK4A 1TK5B 4DSRA 1B8XA 1K3YA 3GA4A 3ZYWA 4D73B 2Z9SA 3AY8A 1SYXA 2H71A 2FGXA 4KCEA 4V1Ag 5C04A 2E7PA 4QQ7A 5DAKA 3TGZA 1BX9A 4OCFA 3W8JA 1XPVA 1X9WB 3EINA 1QK8A 3EVIA 2WJUA 2YP6A 4TXVA 4G9HA 4NHZA 4HJ2A 1MD4A 1WIKA 3UEMA 2NDOA 3IA1A 4JR6A 3RPNA 2AYTA 4D73A 3GHAA 2P0GA 4JEDA 2LSTA 4MZCA 2IIYA 3BD2A 3M3MA 2L4CA 3DIEA 1V98A 2GVPA 4ECJA 1AW9A 1EEMA 2VLVA 2YWIA 1ON4A 2V41A 3DWVA 2PVOC 2B7KA 1OAZA 2B1KA 20GSA 1X9MB 2TIRA 5G2ZA 4GSNA 4X1UA 2M80A 4TN8A 3GURA 2PU9C 1AUCA 3GFKA 2R4VA 2VAFA 3FZ5A 2MMNA 3WGEA 2VOCA 4ZBAA 1MDKA 4GRFA 1ML6A 3C1SA 4MH3A 2K9FA 4EKZA 4ZILA 1A8YA 3IV4A 4ZL8A 3GSTA 4AJ7A 2H1AA 4GQFA 5ECQB 3ED3A 2H6XA 4NHWA 4RQRA 1FW1A 1OKDA 1GNWA 4MCUA 6GSTA 5ECHB 16GSA 4PNGA 2F8FA 1SL1B 3HZ4A 3GKKA 2DJKA 2YANA 2H8LA 1FG4A 4YQVA 1T4YA 2JL4A 2H74A 4EC0A 1T4ZA 1TTZA 1DE1A 3TJJA 1OE8A 3LWAA 4MPGA 2MZCA 4OCEA 4GSTA 1FHEA 5IMFA 2H0IA 4KA0A 2I81A 3UL3A 1U6TA 2I4AA 2ON5A 3LQ7A 2VL2A 3TKSE 1MD3A 1GL8A 4EL1A 4ZL9A 3VLNA 2R2JA 3O3TA 3EWLA 4IS0A 1AIUA 4LMWA 5ECSA 3UAPA 1K0BA 1PMTA 3A2VA 2E2GA 3F4SA 3M9JA 2LJAA 1NW2A 3LYKA 1FVJA 2AB6A 2ZNMA 1TXXA 3GIXA 3WGXA 3E0UA 4MF7A 1F3BA 5HFIA 3FHKA 5B8BA 4ECIA 6GSVA 1KNGA 1VF3A 3FRCA 3J7Yb 2FHEA 1M0UA 1X5CA 4EVMA 5JCWA 5F0GA 2H73A 1THXA 4Z7XA 2N5BA 3GL3A 3LYPA 12GSA 4KDYA 5AIXA 3MSZA 3TB2A 2VCXA 2CA8A 4PXOA 4AF2A 1XXUA 5LNKe 5AGYA 1OKTA 2F3MA 2LRNA 2C8UA 2IPAA 2L4QA 2KP2A 1ILOA 3QFAC 3JCML 4WR4A 4IKHA 3CBUA 1K0NA 1EZKA 3H1NA 1W4VA 3QFBC 5DALB 2R3XA 1XWAA 3GKXA 1WE0A 3Q6OA 4IBPA 4MZBA 1GLPA 9GSSA 3VPTA 1JZOA 1TRVA 3G9BA 4Q5NA 3QD9A 3LSZA 4WBJA 3GH6A 1GUKA 2K6VA 2TRXA 3BCIA 3J7Yk 1XW5A 1ZYEA 5DALA 4ZL7A 2KUCA 4ZBDA 2YN1A 5F8BA 1OYJA 1K0DA 3QAGA 1S3AA 1A8LA 2NBSA 5DDLA 3W6GA 3GRXA 4F0CA 1PGTA 1OC3A 4IELA 3DXBA 1VF2A 4O5RA 3A3TA 4BPYA 2C80A 1IYHA 4IGJA 3RHBA 1SU9A 1GSYA 4LLRA 2LTKA 3ZIVA 4JZQA 2FD3A 2J23A 3TJFA 5G31A 4N10A 2FY6A 3KCMA 3LXZA 1TW9A 3GX0A 4IP1A 5HR2A 4KX4A 4XS6A 2EIRA 2PERA 3CYNA 3SWLA 5DBQA 3DVWA 5ECNB 3TRPA 3FEUA 2X99A 3KMOA 4KGIA 1K0CA 5ECLB 2V32A 1VF4A 1SK0A 1U88A 4OO5A 1YQ1A 2WCIA 3TOUA 5EPFA 3ZFBA 1T1VA 1XWBA 5D93A 4KDXA 4TR1B 2OE3A 4N0VA 4G2EA 1B9XC 2BMXA 2WRTA 3VPQA 4F82A 1M2BA 3KEBA 3D4MA 1I5GA 2K8SA 2PN8A 5J5NA 3L0HA 4ZIJA 3ERWA 4IJIA 4ACSA 1TU7A 5CO3A 7GSSA 2CVKA 5LD0A 4KUNA 4K7IA 1UA5A 2DBCA 4QL9A 4ULXA 1CQHA 2C1YA 3HXSA 3UBKA 4WKWA 2H66A 5GZZB 4TR1A 1TP9A 1Y25A 1JLWA 4JU5A 1HNBA 2H72A 1GTBA 2HXKA 5HR0A 3F9UA 2KLXA 3G7JA 4OO4A 1KTEA 4KNDA 3TJBA 3QPMA 4TRXA 4MH2A 2CX3A 3FR9A 3I6AA 1LBKA 2H0HA 5D9TA 2O8VB 2IMDA 1GSEA 1ERUA 2PMTA 4WETA 3ZZXA 2X64A 1EV9A 3NOFA 2VCVA 4YAPA 3KH7A 3HDCA 3PH9A 1V57A 1M7TA 1BEDA 5KN1A 1WMJA 2VL2C 2PUKC 2BJXA 3EU4A 1R5AA 2DJ0A 2N5FA 4IN0A 5E59A 1A0FA 3RHCA 2L57A 2JACA 4ID0A 4EO3A 3TCOA 3UJ1A 1BYEA 2AJQB 1SD8A 1TU8A 1G6YA 2WGRA 4XRAA 4HJMA 4E8EA 3U6VA 1TI1A 4F9ZA 4MK3A 4ECCA 1XOAA 3DMLA 1YZXA 4IQ1A 4O92A 5ECMB 3ZVJA 3DD3A 2KP1A 5D8IA 1VGLA 2DSAA 2AAWA 3GSSA 1SKWB 2MMOA 3F6FA 3APOA 4X0XA 4Q5RA 4KW6A 5COHA 2K18A 2H70A 1XBSA 1B9YC 1AQXA 3UOMA 3KJYA 4OMVA 4MPFA 2OA7A 2CZ2A 4XRDA 2E2MA 2LUSA 4IQAA 4YQUA 6GSSA 4XS4A 5E4WA 3H4KA 5GSTA 5HR1A 2YPMA 4ZB8A 4WF4A 1F2EA 3N5OA 1UN2A 1O81A 3CTGA 2ALBA 3ZMLA 4TW5A 3WYWA 2EIOA 3A2XA 4HS1A 2B7JA 3FR3A 3I43A 1EEJA 4WBRD 1Q4JA 1ERTA 5AISA 3ZIJA 3ZMKA 2H1GA 2VCQA 4FYUA 3ZLPA 4TR0A 4XCSA 1SJZA 4OFMA 3TOTA 2L59A 3F3RA 2RUEA 3P90A 5JCGA 4MF6A 4BA7A 1M9BA 2AHEA 3ERFA 5CRGA 1V58A 3IE3A 3WD6A 2IMFA 2GSRA 3ME7A 3DKSA 2H76A 5D9WA 4LL4B 3CRTA 1J9BA 4FYBA 4I2TA 4L0WA 5ID2B 1F9MA 1YKCA 4HDEA 4POKA 1N2AA 4HEA2 2IFQB 4JRRA 3C7MA 4IJ3A 3VFIA 4ZBBA 3P8WA 2GTUA 1GUHA 1YY7A 4FH8A 5KN3A 3FK8A 8GSSA 2OACA 4PGTA 5DVBA 2XC2A 2M46A 5IOWA 5DJLA 5ELGA 2JSYA 4CW9A 3CXGA 1TDIA 2O87A 2HRFA 1TOFA 1XFLA 1M9AA 2IFQA 2E0QA 4DSSB 2HRNA 4L5LA 4Q5QA 2JZRA 3VI7A 3DVXA 19GSA 18GSA 4RQXA 1F3AA 2CVDA 2PBJA 4HZ4A 2OBIA 1SKSB 1PRXA 2H19A 3TJKA 3N9JA 1GTAA 2RIIA 2RM5A 3A5WA 3FKFA 5H5QA 1QFNA 1S3DA 3ZTLA 4FO5A 3P2AA 1TK0B 4I2UA 4TVEA 1EGOA 4DSSA 3F8UA 2HSYA 4EDZA 2X8GA 3DGQA 2CX4A 2VCZA 2C0DA 3GUSA 1R4WA 4CHSA 5JCUA 3O6TA 4J2FA 2JADA 2CZ3A 2NVLA 3H8QA 1Y6EA 4G10A 3U5RE 4EUYA 1G7OA 4XIHA 1AQVA 2DLXA 2LEGA 1ZCPA 5CRHA 4ECBA 2JU5A 5DCHA 1WWJA 1PL1A 2DMLA 2CAQA 5D9XA 5G5FA 5JWOB 1ST9A 2X8CA 3DEXA 3Q74A 3HKRA 3GKMA 1EP7A 1X5DA 4L8EA 2TRCP 1GTUA 2LS5A 1YDKA 4JE1A 5G5EA 4KSMA 1DBYA 4I5QA 2H01A 3UMAA 1Z7RA 4MZWA 1BAYA 1O8WA 2CV4A 3ERGA 4TOPA 1OC9B 4GCIA 1GTIA 2YV7A 4GTUA 3HCZA 2GSTA 2H1DA 5J3RA 5INYA 2XBQA 3O76A 3TUEA 1TRUA 2OE0A 3DYRA 5G1LA 3EE2A 3EMXA 1MDIA 1PD21 3HHVA 3L78A 5G30A 2L6DA 3DRNA 3WT2A 1OC9A 1XWKA 4IP6A 4J56E 1URMA 5L71A 1Z9HA 2FUG2 4H86A 1K0MA 1PX6A 1THOA 1Z7PA 5FHIA 1ZGNA 1JZDA 4WR5A 2V6KA 3LXTA 2OE1A 3APQA 3TKSA 2NTOA 2GZYA 2GT5A 3EURA 5IIZA 5J41A 2A2SA 2GS3A 1HD2A 2C0EA 1U3IA 5H5RA 4MJAA 2AUVA 2RUFA 3L9SA 2QC7A 3UVTA 2VL9A 4GXZA 2K8VA 3IK7A 4WF5A 2P5QA 1K0AA 3HA9A 3KZQA 4POBA 2KOKA 3LORA 2L6CA 3CSJA 5JWQB 2REMA 1XCCA 1RW1A 4KSOA 2H75A 5EVOA 5HFGA 4YAVA 3C73A 3M8NA 2B5YA 4YH2A 1SKRB 5D9VA 5A4WA 5LCZA 4KCAA 1SJIA 1ZL9A 22GSA 3BOAA 3KM6A 1WJKA 3FW2A 4PUFC 3IPZA 2I3YA 3F4RA 4F0BA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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