5IOXA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure luss
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
157
structure length
155
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGCTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 42
structure length 155
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5ioxA00
1EV4A 3GH9A 3M0FA 5ECQB 3HVSA 4MH2A 2E2MA 1Z7RA 5IIZA 1S3DA 2YWNA 1UN2A 5EVOA 3P90A 1PQNA 4OFTA 2H66A 5B6MA 1A24A 4TR1B 2D2ZA 3QOUA 4TR0A 1BX9A 5CP1A 5LCZA 1ZMAA 4KSMA 4YQMA 1HNCA 4MA9A 2YV7A 1VRSD 4PQ1A 4MJEA 4HUAA 6GSVA 3KJYA 3HJMA 4L0UA 1QGVA 3BD2A 4HOJA 3ZLPA 5AIXA 1GUMA 4FYUA 4IGJA 3TOTA 3EMPA 3A3TA 2GTUA 1ABAA 1WP0A 3IAM2 1WIKA 1XWGA 4NAXA 4OO4A 3US3A 3RHCA 5JWQB 2DJ1A 3D6IA 5E59A 2YNXA 2YOIA 3EVIA 5ECOB 3TDGA 3FZ5A 3VPQA 4Q5RA 2GSRA 4XS4B 4IHUA 1JZWA 5JWOB 2KP2A 1AC1A 4WKWA 1K3OA 1TDIA 2FCHA 1T4YA 3A5WA 1DE1A 3DIEA 2GQKA 1U88A 3RPPA 4L5OA 1XXUA 3R2QA 4YAVA 5HR0A 3U6VA 4XRDA 1YY7A 1YEXA 2QGVA 3A2XA 3IK9A 1SENA 3HJPA 3EE2A 1O73A 3DKSA 2REMA 1TOFA 2A2SA 2XHFA 2GSTA 1FB6A 5ECLB 1FW1A 4GF0A 5B7CA 4HQSA 2MYGA 3ED3A 4DSSA 4MH3A 2WULA 3HYPA 5IMZA 3D4MA 1ERVA 4DSQA 4POBA 3ZZXA 2F9SA 2DLXA 3EC3A 5G31A 3ZVJD 4CHSA 3U5RE 1XFLA 2LNTA 2H6YA 4KDXA 3IV4A 3F4RA 5E4WA 2G0FA 1PN9A 1F9MA 2V6OA 4TVEA 1V40A 3LORA 1T3BA 4H86A 3CRUA 1EEMA 2L5LA 2VCTA 4I97A 3ERWA 2IMFA 1W4VA 1B9XC 1I9DA 2HE3A 2FY6A 2HRFA 4WXTA 2TRCP 3BOAA 3KZQA 4ZBBA 17GSA 3UVHA 2IPAA 3F0IA 2MZCA 6GSWA 3KP9A 1O6JA 1LBKA 1BEDA 5KN1A 1YKAA 3FR9A 2OA7A 5IQYA 2IMDA 4IP6A 1SYRA 4ID0A 2JZRA 1K0NA 3DXBA 1A2LA 1M7TA 2DMLA 1O7UA 3RAZA 1RQMA 2R6KA 3PH9A 2GSQA 3IXRA 5AISA 3L9VA 5ELGA 4ZBAA 4F0BA 1GH2A 1K3LA 2X8GA 1FVKA 2N5AA 1TI3A 1SD8A 1SL0B 1KNGA 3IR4A 3BBYA 1WPIA 4ISDA 3Q74A 5G5EA 5ECSA 5F8BA 4F9ZA 4WEYA 5D9TA 1HQOA 3DRNA 4DVCA 1Z9HA 3F4SA 4RUVA 1JZOA 5FWGA 1KBNA 3GRXA 2CVDA 2H72A 4MJCA 1GP1A 3H79A 3IDVA 2IFQB 5L71A 2E2GA 1XW6A 1K0DA 1SJIA 1TU8A 1XBSA 3MSZA 4IQAA 4I5QA 4P3YB 1M2DA 5IMCA 4HJMA 4POLA 3QAGA 1QUWA 4AF2A 5CRDA 2H0HA 2MMAA 4EL1A 1BYEA 1QMVA 4ECIA 3KP8A 2GDRA 2H70A 5IMAA 4HDEA 2OE3A 3TRQA 4GWRA 2O85A 4JR6A 3AY8A 4MJBA 2AYTA 2X8HA 3WGDA 2BMXA 2FUG2 3APOA 3M1GA 4N0ZA 3ZTLA 2HNLA 2JADA 1GULA 2FA4A 1A0FA 1CQGA 3P7XA 3V1WA 3FZAA 1SK0A 3HA9A 3HKRA 4EVMA 4BPYA 4G10A 2VLVA 4Z7XA 1V2AA 5GZZB 1GTBA 3IPZA 2VL9A 1PSQA 5DAKB 5J4UA 2VL2C 3O3TA 1B9YC 4XCSA 3M9JA 1U6TA 1SKSB 5HFIA 1NHYA 1OC8A 2AHEA 4V1Ag 1TRVA 2YANA 1T7PB 2H0IA 2HZEA 2ALBA 4K7NA 3QD9A 2YV9A 4NV5A 16GSA 4ZIJA 1ZYEA 1MD4A 5ECRB 4JR4A 1O81A 4JRRA 1OE7A 2M46A 1X5EA 3RHBA 2VAFA 4YQVA 5DCHA 5G1LA 3KTBA 2VM2A 2MMZA 1K0MA 4KNDA 1X9SB 2A2RA 2X8CA 4ML1A 4WR4A 5A4VA 1YZXA 4K7IA 4I6XA 2R4VA 1GUHA 4HU9A 4YAPA 5H5SA 5J9BA 5ID2B 1T1VA 4JU5A 5G2ZA 4PUFC 2FLSA 2J23A 2TIRA 3IK7A 5D9VA 5D73A 2PERA 2JACA 2JZTA 1MDIA 3CSIA 2C1YA 4I2TA 4OFNA 4TXOA 2PVQA 4EDYA 2HYXA 2LV3A 3LWAA 4PQHA 1HNBA 3JCML 4I2UA 3VWXA 2HZFA 3CSHA 2RM6A 4E8HA 2YZUA 2YP6A 4LL4B 4QL7A 3UEMA 3UARA 3EURA 4KGIA 2X64A 3Q6OA 4MF7A 3L4NA 2VCWA 3GNJA 2HT9A 4EXJA 1GTAA 3WD6A 2I3YA 3DGQA 3BJ5A 1TJDA 2H71A 2K6VA 1PKZA 3CSJA 4HS1A 1O8WA 3QMXA 2IIYA 1MD3A 2GLRA 2BJXA 4MP4A 3VURA 4LL1B 2LRTA 1YDKA 2P5QA 3ME8A 1F6MC 2GZPA 3GYKA 1XWCA 5IO2A 1TP9A 1W89A 4J57E 5IPGA 2IMKA 2J9HA 2CVBA 2YPMA 3HDCA 5KEJA 1R5AA 1GNWA 2WB9A 2OE1A 2G2QA 1GSSA 2GS3A 2H6ZA 3QR6A 1V9WA 3GKNA 5KN2A 1R7HA 1WWJA 2H1BA 3HHVA 3ZFLA 4K9ZA 2CA8A 4IW9A 2OBKA 3MAKA 3UL3A 2DBCA 1WMJA 3LYPA 1UVZA 4GQCA 2HI7A 2LKUA 3DYRA 1BQ7A 1VF1A 1V98A 3FEUA 1MDKA 1UC7A 3H93A 3GL5A 1WJKA 1F3AA 2EIOA 5CO3A 1AIUA 2O87A 3QDNA 4V1Ap 1QFNA 1XW5A 4HZ2A 4N11A 4KDYA 4O32A 4N30A 1TRUA 2DJ2A 2B1KA 1U3IA 4G9HA 3GA4A 5IMDA 5HFKA 5DQSA 2H1GA 6GSTA 2B5XA 4MLYA 5LNKe 3C71A 3D0ZA 4PX1A 3DVWA 5CYYA 3GKXA 1XWKA 4WF4A 2LJKA 1R4WA 1XVWA 1M9AA 3KIJA 3GKMA 5IOXA 2GT5A 1J08A 1OKTA 1G6YA 4WETA 5F0GA 5EY6A 1XCCA 1TK8B 3CBUA 3L78A 4Q5QA 4OMVA 1M2BA 3ERFA 2H74A 1ZL9A 3F3RA 3UAPA 1ZCPA 2JL4A 3QAVA 2QSIA 3DEXA 1TKDB 1EOHA 2LJAA 2C8UA 1CQHA 3PGTA 2K8SA 2ES7A 1ON4A 4N0VA 4IKHA 1ST9A 4EC0A 1DSBA 1J9BA 4NXIA 1AUCA 1SYXA 3A2WA 1GSYA 3MWHA 5JWRB 2IMEA 3TKQA 4FYCA 1TI1A 2KP1A 4V2LA 4WF5A 4L5LA 3VK9A 2C3QA 5F05A 2FWGA 2IWTA 3LSZA 2N5BA 19GSA 4E8EA 3J7Yb 4G19A 4BWSA 1G7EA 3W6GA 1C72A 2C80A 1NW2A 5CRGA 4ILFA 4CDOA 4EDZA 2I1UA 5KN0A 2VOCA 3M3MA 4IBPA 1N2AA 3TKPA 1K0CA 1TK5B 4GSNA 4IP1A 3F3QA 1AAZA 3Q18A 5DALA 4EUYA 3I6AA 2Z9SA 4ZBDA 2LUSA 3TGZA 1B4PA 1AQVA 2FHEA 4XS1A 3ZFBA 2OKAA 2VL3A 1X5CA 3F4TA 4DSRA 3ME7A 2LTKA 12GSA 1A0RP 3NZNA 1UA5A 1XIYA 3FR6A 5EL8A 4AJ8A 5B8BA 1HYUA 3HCZA 5INYA 2XPDA 4EKZA 1N8JA 4WR5A 3J7Yk 3TRPA 5IMVA 1K0AA 2OACA 1DUGA 1Z6MA 3MNGA 2DMMA 4GTUA 4FYBA 2H8LA 1J0FA 11GSA 2OADA 1V57A 3TKSE 2JSYA 2VD1A 4PGTA 2LSTA 1AW9A 4BWQA 2FWHA 3LXTA 3D22A 4XS4A 4EE0A 5IM9A 2OJLA 2CX3A 4GCIA 3O76A 5ECMB 5HR1A 3GIXA 3P2AA 1R5PA 2YJHA 4MPFA 1XZOA 1FAAA 4XTSA 1OC9A 2BTOT 3SBCA 2V41A 1X9WB 4TKYA 3LJRA 2R3XA 5DDLA 2GZYA 3H1NA 1AQXA 1THXA 5HQPA 4MZWA 6GSXA 2PN8A 4HZ4A 4LMWA 4L0WA 2NBSA 4F2IA 1FOVA 2RUEA 2WGRA 3GSSA 4ZL8A 3IHQA 3CTGA 1USBA 2ZCTA 1ILOA 3TKSC 3DVXA 2ON5A 3UJ1A 3GX0A 1FB0A 2TRXA 2EIQA 1Y6EA 2LEGA 3QAWA 4PQIA 2C4JA 4MDCA 1ML6A 3FY7A 4ECCA 1A8LA 1QXHA 2VLUA 4HI7A 4L8EA 3I43A 5FT3A 4POKA 2I9HA 3EWLA 1FVJA 2RM5A 4BL7A 4F0CA 3GHAA 3F6DA 1FG4A 5AN1A 4XHMA 3CYNA 3WYWA 3APSA 1AXDA 5HR3A 5D93A 2O8VB 1NSWA 2GSSA 2VUPA 3G7IA 1U3AA 2C0DA 4JBBA 3TJJA 5D8IA 1R26A 2ZUPA 1X9MB 5LD0A 3EINA 5HR2A 4PNGA 2VL2A 1SJZA 5ELAA 3KEBA 2ZNMA 2I81A 1GUKA 1V58A 3QPMA 3LXZA 2PVOC 5JCWA 3N9JA 5A4UA 3F8UA 13GSA 3I9V2 1GL8A 1Z5YE 1GLQA 5G30A 4NPBA 2WFCA 1A2JA 2H0GA 2K9FA 2VCQA 4KUNA 5HFGA 5DCGA 2NTOA 4K1FA 3HVVA 1XOBA 2B6MA 4J2FA 5IO0A 4O5RA 1VF2A 3RPNA 4QL9A 3OR5A 2XBQA 2FWFA 2WDUA 4KE3A 4QQ7A 4BVXA 3FHKA 2CQ9A 3S9FA 2R5GA 4LA1A 4ZB6A 4XS6A 5DBQA 2O89A 2PU9C 3N5OA 2PBJA 4K6XA 3TUEA 1XVQA 5C04A 3GV1A 5G5FA 2JSZA 2CX4A 1K0BA 3ZMKA 1URMA 6GSUA 1F37A 2YWIA 2CZ3A 1F2EA 4K0NA 4TXOB 1QQ2A 2B7KA 4AJ7A 3GSTA 1A8YA 2HLSA 2P0GA 1SD9A 4MABA 4PXOA 3E0UA 4XIHA 3Q19A 2VLTA 4BA7A 1OAZA 4IJ3A 2KOKA 4D73B 5FHIA 4NV2A 3KMOA 3H4KA 4OCEA 3FZ9A 3ZITA 3GTUA 5H5RA 3IC4A 1SKWB 3C1RA 2GVPA 3DD3A 1EWXA 4KB3A 4MCUA 3IBHA 1Y25A 3FR3A 3W8SA 4KCAA 4GLTA 1ERTA 1XWAA 5COHA 1GRXA 20GSA 5GSTA 2HRNA 2H75A 5DAKA 1THOA 4O92A 2QC7A 3GN3A 5F07A 4LMVA 3TCOA 1EZKA 2KUCA 2HSYA 2GQMA 2DIYA 1GSDA 3F6FA 2O7KA 2VO4A 3GUSA 1M2AA 4Q5FA 2F3MA 2LQOA 2DJKA 4ZB9A 3L9UA 1M9BA 1YJ6A 5ENUA 2YWOA 3SWLA 1O8XA 4NHWA 1EEJA 5DQYA 4NHZA 4KW6A 3BCIA 3IA1A 1GLPA 2PUKC 2H73A 2AV4A 3HJOA 4HJ2A 5ECHB 2JU5A 3FRCA 5IPHA 3ISOA 2NDOA 1GWCA 2L6CA 1VF4A 1ZYQB 1JZDA 1GSUA 2LJRA 3UMAA 2E7PA 4RQXA 1BG5A 3C8EA 4RI7A 5J41A 1H75A 2WZ9A 2NPBA 1EOGA 3LYKA 1OC3A 2VIMA 3D5JA 10GSA 4RQRA 2C0GA 3C1SA 5IMFA 2H1DA 2AB6A 3RDWA 2MMNA 4KAEA 3ZL5A 1GNEA 4X43A 4WBRD 5CRWA 2B1LA 2CV4A 3M8NA 1EGRA 3KTLA 4TN8A 3FZ4A 2C3TA 2IMIA 2L59A 4F03A 2VM1A 4CW9A 3LGCA 3GX8A 3TOUA 3LEFA 2AUVA 3QCPA 2H6XA 1K3YA 2YCDA 2MMOA 1I5GA 3E9JB 2HXKA 1ERWA 1SU9A 1YF0A 2M72A 1BJXA 5DVBA 5DJMA 4FIWA 2YZHA 2CVKA 3ZMLA 1PX6A 5JCGA 4LLRA 4OFMA 4IQ1A 5GAND 5DALB 1K0OA 5ABRA 3ZREA 4HU7A 2HFDA 1E6BA 1M99A 1YQ1A 8GSSA 2N5FA 2C3NA 4ZB8A 2OE0A 2JZSA 5J5NA 3DWVA 1G0TA 1PL1A 3IRAA 2QKEA 3ZIVA 1PL2A 1WRYA 1OKDA 2B7JA 2B3SA 3KMNA 2DJ0A 2VD0A 3ZIJA 3HXSA 2P31A 1OVNA 1PGTA 1ZZYA 3G7JA 1MEKA 3WT2A 4MJAA 3VWWA 4I8BA 2PMTA 3CTFA 4MF5A 5G1KA 1YKCA 6GSYA 3LG6A 1GSEA 2XPEA 4OCFA 2V1MA 4DSSB 3GMFA 2KHPA 2WJUA 3EU3A 1ZOFA 1WE0A 1JHBA 1X5DA 7GSSA 1NHOA 3TKRA 3G9BA 1TTZA 5AGYA 4TR1A 1A23A 4EF0A 1ERUA 1SK2A 2LRCA 2CAIA 3EYTA 2WCIA 3MDKA 5GAPD 1RK4A 2DC5A 1EP8A 2FD3A 2FGXA 3TJKA 3VWVA 4AGSA 4F82A 1OC9B 3KCMA 3UOMA 1JLWA 1E2YA 3KD0A 4PNFA 1XPVA 2MBSA 1JFUA 3TRXA 1B48A 3CRTA 4J56E 3HVXA 4MZBA 2IJYA 1QK8A 3L9SA 4Q5NA 2PWJA 3PR8A 1Z7PA 1FHEA 3TKSA 1B4QA 2CT6A 4K0GA 4IELA 3I69A 4O7HA 1EV9A 1F3BA 3O6TA 2NVLA 4TOPA 4TRXA 2FA8A 2R37A 1A2MA 2C0EA 2CZ2A 3GL3A 2WRTA 4HQZA 2K18A 3CXGA 2AAWA 1EP7A 4ZILA 3KXOA 2A4VA 2LS5A 3VWUA 3ZRDA 5CREA 2M80A 4JEDA 4OWYA 3VI7A 2LRNA 3ERGA 3WGEA 4X0XA 2RLIA 2L5OA 2L6DA 4OD7A 2DJ3A 3UBKA 1WOUA 4WBJA 1TW9A 2F8FA 3L0HA 2L4QA 3VI5A 4ZXGA 1SL1B 4TR3A 3LQ7A 3HD5A 3QFBC 4GQFA 1MDJA 4ECJA 2C0FA 4GXZA 4K7OA 5KN3A 1VGLA 4YQUA 3WT1A 3NIVA 4GRFA 3IE3A 4OO5A 2EIRA 1M0UA 3G7YA 3P8WA 4MZCA 2F51A 5D96A 4V2MA 1FO5A 1ACVA 3QFAC 2H76A 3KGKA 2RIIA 2VCZA 3CMIA 3APQA 4KX4A 6GSSA 1KEBA 4MK3A 3VPTA 3HY2A 3TJGA 1PKWA 2GQLA 2VCVA 3TB2A 4X1UA 5CRHA 3F9UA 2H1AA 1PA3A 4GSTA 3KH9A 5H5QA 4MF6A 3FKFA 4K8MA 2HZEB 2P5RA 3HZ4A 4G2EA 3UVTA 4IS0A 1PD21 9GSSA 3VLNA 1Q98A 2V2GA 1HD2A 1TXXA 1LJRA 1VF3A 2GGTA 3KM6A 1T4ZA 4MMMA 1PMTA 1YEPA 18GSA 4IN0A 5DJLA 14GSA 3GTUB 5B6NA 1Z3EA 3IOSA 1T00A 3A2VA 1AQWA 4ZL9A 1X0RA 5J9CA 1NM3A 1JZRA 3TJFA 3FW2A 1JLVA 4JE1A 4AJ6A 1MTCA 3C73A 2KLXA 3F63A 3GURA 2H01A 2E0QA 3IAS2 1KTEA 3WGXA 2IFQA 2LNSA 4GSSA 2PPTA 4EO3A 5D9WA 1PRXA 1GSFA 1GSQA 2VCXA 1T8EB 4IVFA 4MPGA 5JCUA 5CNWA 3C7MA 3FYGA 3W8JA 2B5EA 1S3AA 2R2JA 5D9XA 1TU7A 2YN1A 2ON7A 4KSOA 2YJ7A 3UIWA 4FH8A 1G6WA 4KH7A 1EGOA 4BVYA 2V6KA 4KDUA 3M9KA 4TW5A 5ECPB 2AJQB 5AIVA 2PGTA 1Z6NA 4YH2A 5C00A 2L57A 5ECIB 2H30A 3GFKA 2X99A 2H19A 1YF1A 2GZZA 2IN3A 3FK8A 3BCKA 1TRSA 4XRAA 1GTIA 2CAQA 2EC4A 3LFLA 1TK0B 4K2DA 1XWBA 1DBYA 1Q4JA 4TR4A 3ZVJA 4DEJA 1DE2A 2DSAA 4TXVA 2K8VA 3KH7A 2GT6A 2XC2A 2DIZA 4V2NA 4ACSA 4HEA2 1B8XA 3H8QA 1SK1A 4ULXA 5A4WA 2F8AA 2L4CA 3D21A 2I4AA 3PINA 4PURA 22GSA 1SKRB 3GKKA 1TRWA 3GH6A 3VFIA 2IL3A 3D4TA 1LU4A 4IJIA 2OBIA 1S3CA 2YWMA 2WS2A 4PUAA 1IYHA 4D73A 4ZL7A 1RW1A 5A5KA 1SL2B 4JZQA 5B8AA 2HSHA 2XBIA 1O85A 2B5YA 3HZ8A 1XOAA 1IYIA 1GTUA 2FWEA 4NWYA 5ID2A 2DJJA 3K8NA 2V32A 1OE8A 5F06A 1BAYA 1XW9A 4KCEA 2LQQA 4NMUA 1HNAA 1U87A 4RI6A 5CAXA 1PX7A 3RBTA 3ZYWA 5IOWA 3TJBA 1OYJA 3EU4A 2MBTA 3DMLA 4ECBA 4FO5A 3EMXA 3UBLA 3E3EA 4KA0A 4POMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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