4FO5A

Crystal structure of a thioredoxin-like protein (bdi_1100) from parabacteroides distasonis atcc 8503 at 2.02 a resolution
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
141
structure length
136
Chain Sequence
KLTEGVNPGDLAPRIEFKASFHNQLGRYTLLNFWAAYDAESRARNVQLANEVNKFGPDKIAMCSISMDEKESIFTETVKIDKLDLSTQFHEGLGKESELYKKYDLRKGFKNFLINDEGVIIAANVTPEKLTEILKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Parabacteroides distasonis
publication title Crystal structure of a thioredoxin-like protein (BDI_1100) from Parabacteroides distasonis ATCC 8503 at 2.02 A resolution
rcsb
molecule keywords thioredoxin-like protein
total genus 38
structure length 136
sequence length 141
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4fo5A00
3IOSA 1MDIA 4HZ2A 1A23A 3GL5A 3GHAA 4DSSA 5J5NA 1KBNA 3FW2A 1A0RP 1TKDB 1TI3A 1BYEA 4K7OA 2X99A 4MDCA 1H75A 2C3QA 2N5AA 4PNFA 4EO3A 1TRVA 3M9KA 1YF0A 3BBYA 5CRDA 5GAND 5ELGA 1WWJA 1B8XA 1BQ7A 2LJRA 2L6CA 5E59A 4GWRA 3UBKA 4XIHA 5ECSA 2QKEA 1JZWA 4NV5A 4Q5QA 2RIIA 1GNWA 2PVQA 3G7YA 1ERVA 2FWFA 4NWYA 3TKSC 4YH2A 1PN9A 5FT3A 3P7XA 5ECQB 4LMVA 4K0NA 6GSSA 1K3OA 3UAPA 2GQLA 2IMIA 2F8AA 2QGVA 4PUAA 1HNAA 2LEGA 3SBCA 3TJFA 4KE3A 1SL1B 4OWYA 1BJXA 2IN3A 2KOKA 1U3IA 3DVXA 3M3MA 3EMPA 4WR4A 1F3AA 2L4QA 4EKZA 4XS1A 4JZQA 2H73A 4PQIA 2E0QA 1ABAA 1NHOA 2JU5A 2CAIA 3U6VA 3KJYA 1X5CA 2HI7A 2CX4A 3HY2A 5HFIA 3W8SA 2NPBA 1FW1A 4IQAA 1GSUA 2DJ2A 4ISDA 3LG6A 3MSZA 3LEFA 3IXRA 4HI7A 2B3SA 1PKZA 1SENA 2DMLA 1W4VA 2VAFA 4V2MA 3LYPA 1DBYA 2O8VB 3OR5A 2KP1A 2O7KA 2BMXA 3LQ7A 4PQHA 4IJIA 2CVBA 5DBQA 4CDOA 3GURA 4TOPA 4TXOB 4BWSA 2KHPA 2LNTA 1B9YC 2KP2A 1SL2B 4RQRA 1WP0A 4XRDA 3TGZA 3Q18A 2ZUPA 2H75A 3K8NA 2TRCP 4MJCA 3U5RE 4TR0A 18GSA 2OBKA 3LXZA 4MPFA 5DJLA 2HSHA 2JSYA 4V2LA 1THOA 5C04A 4IS0A 2HT9A 1EEMA 3ZVJA 1TDIA 3ERFA 12GSA 1GRXA 4Q5NA 1YQ1A 1Z7PA 1XWBA 3IC4A 1H4OA 2GZYA 2PPTA 3HHVA 4JE1A 5AISA 1M7TA 2C4JA 3RAZA 4HQSA 3TOTA 3PR8A 3M9JA 5FWGA 2YV7A 4DSQA 1T4ZA 11GSA 4O5RA 4TR3A 2VL9A 4MZCA 1GSFA 3VWUA 4XS6A 5D96A 1JZDA 5F05A 3IR4A 6GSWA 4I97A 1T1VA 1G7EA 2ES7A 2Z9SA 4N30A 5IMAA 1M2BA 1EZKA 3E3EA 3PGTA 3EU3A 2LRNA 1DSBA 1YJ6A 3LWAA 3HJMA 4IN0A 3GYKA 3CRTA 3A2XA 2C3NA 3VURA 1RK4A 4BWQA 3LSZA 3ZITA 5HR1A 4K6XA 3F4SA 2P0GA 4XS4A 3TJBA 4ECJA 2GVPA 3UBLA 2LV3A 3KGKA 4ZBDA 3ZVJD 1SYRA 4WF5A 3ERGA 1F37A 2EIRA 3VPTA 1T7PB 1ERTA 3GTUA 2NDOA 2NTOA 4KDUA 4ML1A 2TIRA 3RHBA 3D4MA 5KEJA 1S3CA 2HE3A 1LBKA 2FWGA 4NXIA 4POKA 3A2VA 2DJKA 4GQCA 1O8XA 2C3TA 2VLTA 4O7HA 4PQ1A 3D22A 2VLVA 4AJ8A 3I43A 2H0HA 4FYUA 3N5OA 2HNLA 1MD3A 2X8HA 1XW5A 3C73A 1Z9HA 2EIQA 1JZOA 1SJ6A 2BJXA 1OC3A 3GIXA 1TOFA 2GGTA 2YANA 4Q5FA 1XW6A 3EWLA 1JHBA 2YJ7A 4OCFA 3KXOA 3ZREA 5D73A 3TKSE 4NV2A 3CSIA 3GRXA 4N11A 5EY6A 3KP8A 1K3YA 4GTUA 1Z6MA 5A5KA 1USBA 4KNDA 2MMOA 2MMZA 3TB2A 4Z7XA 2WCIA 3QAVA 5KN1A 1X9WB 2V32A 1JLWA 7GSSA 1K0OA 1ZGNA 3HKRA 2O85A 4I5QA 4TR4A 4MF7A 1XIYA 3HA9A 1ML6A 2XPEA 4OFMA 1FOVA 2NVLA 2YZUA 3TRXA 4X0XA 3US3A 2CVKA 2LKUA 1BAYA 3N9JA 4KAEA 3EINA 2AJQB 4ZBBA 2VCQA 1SKSB 3TRPA 4MJBA 4D73A 3GSSA 5H5QA 2EIOA 2H1DA 4F0BA 1QMVA 3GMFA 4WBJA 2X8CA 1U87A 2A4VA 3FZAA 2HYXA 3C8EA 4K7NA 1IYHA 4EVMA 3KTBA 2RUFA 1O6JA 2FUG2 1GSEA 4RI7A 5CRGA 2CAQA 3LXTA 2FCHA 5HQPA 2WRTA 5LD0A 4PUFC 4MABA 2H66A 3Q19A 1QK8A 5JWOB 3APOA 1TRSA 3KTLA 5ECIB 2H01A 5ELAA 3I6AA 2JADA 2PU9C 3QAGA 3BD2A 2XC2A 3EVIA 3QFAC 1EOHA 1HYUA 3G7JA 2PGTA 3L78A 4N0ZA 2FA8A 3EMXA 4KGIA 3UOMA 3KMNA 5F0GA 3NZNA 4PX1A 3G9BA 1WMJA 5JCGA 4F0CA 4NMUA 1G6YA 4KH7A 4GCIA 1B48A 3FY7A 5F07A 3BCKA 2HFDA 1Q4JA 5DQYA 1VF1A 5JWQB 2K18A 3DKSA 1F3BA 4QL9A 2LNSA 3EC3A 5LNKe 5EL8A 3DD3A 2AAWA 14GSA 3DGQA 3DWVA 3ZFLA 4MLYA 3C7MA 3GKMA 19GSA 1A8YA 2WJUA 2ON7A 4WR5A 4K0GA 3FRCA 3ME8A 1YDKA 3ME7A 1WPIA 3F6DA 2O87A 1XBSA 2C8UA 3UIWA 2XBIA 1ZYEA 2C0DA 1YY7A 1V40A 2H6ZA 3HVSA 3MNGA 3RPPA 5G31A 2OJLA 1EV9A 1VRSD 1W89A 4MP4A 4YQMA 2DLXA 1OE8A 5G1LA 3KZQA 2YWIA 3M8NA 2H71A 4ZL8A 4BVXA 3GA4A 5DCGA 2G0FA 1I5GA 3HCZA 4GSTA 1YF1A 4MK3A 4EDYA 3TKSA 1OKTA 5AGYA 1XCCA 3WYWA 3GX8A 4MJEA 3HVVA 3LGCA 2L4CA 3GSTA 2OE1A 5CAXA 4JR6A 2H6XA 2VIMA 1V2AA 2E2GA 4X1UA 1FVKA 1PL1A 3KH7A 1UA5A 5D9TA 3D0ZA 3L0HA 2FWHA 1X5DA 3GKXA 2H0IA 2GSSA 2HLSA 2R3XA 1SJIA 2DJ0A 4K8MA 1GUMA 1SK1A 1BX9A 4WXTA 1JFUA 3GL3A 4JEDA 2G2QA 2JZSA 1N8JA 1T8EB 1QQ2A 1AUCA 4X43A 3JCML 1DE1A 1A8LA 1HNCA 4LLRA 2VOCA 4F2IA 5ECNB 2EC4A 2F51A 1ZYQB 4O92A 3IA1A 1OC8A 2OKAA 3FZ5A 4HEA2 1XWAA 1SD8A 2PERA 3I9V2 1AQVA 2J23A 2H1AA 2FY6A 6GSVA 2HRFA 2YP6A 1GH2A 4P3YB 3GV1A 1FHEA 3QD9A 4BVYA 2GS3A 2CT6A 5FHIA 9GSSA 1XW9A 3GKNA 3L9UA 5DJMA 1B9XC 4IP1A 3GH9A 3F3QA 2REMA 4TR1B 3IBHA 4G10A 3DYRA 4K1FA 3QCPA 2OADA 5G5EA 4GXZA 1WIKA 4KCEA 1OC9B 5IOXA 2H6YA 4GSNA 4Q5RA 3UJ1A 2YV9A 4IQ1A 4GLTA 2V2GA 3A3TA 1CQGA 4E8HA 1NM3A 3EE2A 1OAZA 2H19A 4ZIJA 3M1GA 2I1UA 3D5JA 3KP9A 3NOFA 1AW9A 1YKCA 3LYKA 3IRAA 3APSA 3EU4A 4KUNA 1GUHA 3H8QA 3CBUA 1GWCA 4EC0A 4ILFA 2VL3A 4IJ3A 2R5GA 3L4NA 5DALB 4BA7A 3F8UA 3VI7A 2MMAA 1AIUA 4NPBA 2VUPA 1IYIA 1F6MC 3CRUA 2JZRA 2PBJA 4I8BA 1K0DA 1OKDA 4ZB6A 4MCUA 2VCZA 4GQFA 1Q98A 4HUAA 4BL7A 1O81A 2V41A 2HZEB 4HU7A 1TU8A 1EEJA 4MF5A 5B8AA 1ILOA 1HD2A 1SL0B 2F3MA 3UMAA 2H1BA 4ULXA 2V6OA 2GT6A 3ERWA 4XHMA 20GSA 2QC7A 2FWEA 4ZXGA 1F9MA 2XPDA 1TRWA 2P5QA 2YWMA 2LRCA 5JWRB 2AHEA 2LQOA 3GKKA 1AC1A 1CQHA 3WD6A 5DAKB 4GRFA 4LMWA 3W8JA 5KN0A 4ZB9A 5ECOB 17GSA 1A0FA 1Z5YE 3VFIA 1AQWA 2JACA 4IHUA 5GZZB 3QDNA 1FG4A 2AUVA 1NSWA 2V1MA 3CXGA 3VI5A 4L0UA 1YKAA 4EXJA 5ID2B 3O76A 4TXOA 3ZMKA 3PINA 4ZL7A 2H30A 4J56E 2GQKA 1K0CA 5IMFA 2YWNA 4K7IA 4ZBAA 5F06A 2NBSA 3DXBA 2GT5A 3FEUA 2FLSA 4CHSA 1X9MB 2RM5A 1M0UA 2H0GA 3TUEA 4ECCA 2IWTA 5ABRA 5F8BA 2CVDA 3GNJA 3IAM2 4AGSA 1PMTA 2RUEA 5IMVA 2B1KA 1T00A 2YNXA 2FD3A 1U3AA 3TDGA 2H74A 4KSOA 4TVEA 3H79A 1S3AA 2B7JA 4IBPA 4ACSA 5G1KA 5J9CA 1ZOFA 4XRAA 3CTGA 3GH6A 1O73A 3CSHA 4IGJA 2GDRA 1Z3EA 2V6KA 5CRWA 5LCZA 3VPQA 1BG5A 2VLUA 1PX7A 1M9AA 3VWVA 4ZB8A 1RW1A 4EL1A 3WGEA 1A2MA 1V98A 2LJKA 2HXKA 5ECPB 5IM9A 4TKYA 5ECHB 1R7HA 2L6DA 2YN1A 3UVTA 5CREA 1KTEA 2XHFA 4TXVA 4KDXA 1E2YA 1TK5B 2R6KA 1TK8B 3MAKA 4YAPA 1J0FA 2LQQA 4HDEA 1ERWA 5CRHA 4HJ2A 1K0NA 3IV4A 1PQNA 3ZLPA 5KN2A 2IFQB 4L5LA 3ISOA 3KD0A 2YPMA 5IO2A 5J3RA 1XZOA 2B5YA 2IMEA 4E8EA 2IL3A 3ZZXA 1T3BA 2CZ2A 3GUSA 3G7IA 2ZCTA 4OFNA 4OD7A 3H4KA 2L57A 4ZILA 4IVFA 2WS2A 1U88A 5GAPD 2ZNMA 5INYA 2YJHA 4V1Ag 1GTBA 1GSSA 2JZTA 2L5OA 1MEKA 1TRUA 5ECKB 5IMZA 3E9JB 1QUWA 1I9DA 1JLVA 3QAWA 3QMXA 3MDKA 1M9BA 1V57A 1YEXA 4G2EA 2B6MA 4ID0A 4DSSB 1UC7A 2IIYA 6GSUA 1WRYA 4JRRA 3TKQA 2YWOA 3IDVA 1AAZA 3HD5A 4KX4A 1X0RA 2DMMA 1LU4A 1MD4A 3EURA 2WDUA 3O6TA 2J9HA 2GQMA 2FGXA 4WKWA 4KB3A 6GSYA 2P5RA 3P8WA 2CV4A 3TRQA 5HR3A 2H1GA 2LUSA 1SK0A 3BOAA 3WGXA 1O85A 4YAVA 2CZ3A 1B4PA 2O89A 3IAS2 3C1RA 3NIVA 4KSMA 1R5PA 1EGRA 3GFKA 1GL8A 4IP6A 3ZIJA 4AJ6A 2F8FA 1G0TA 1G6WA 1R5AA 3F4RA 3KM6A 3LORA 1VF3A 2PN8A 4EE0A 3PH9A 1EP8A 1GLQA 1XOBA 4CW9A 3FYGA 4TRXA 3C71A 2FNOA 1R26A 3WT2A 3M0FA 2GSQA 3J7Yb 16GSA 4JU5A 3H93A 5G2ZA 4YQVA 3BCIA 4F9ZA 1EP7A 2VO4A 4DSRA 1XVQA 1KEBA 4V1Ap 5HR2A 3APQA 5D9VA 4XCSA 1X9SB 1MDJA 3DMLA 1MDKA 2B5EA 1TXXA 5ECRB 3A2WA 5DDLA 2LSTA 5IPHA 5HFKA 3D6IA 1WE0A 5H5SA 3LFLA 1SKRB 4NHZA 2N5BA 4F03A 1J08A 4BPYA 4MA9A 3QPMA 1A24A 1G7OA 2F9SA 2LRTA 3MWHA 4JR4A 2AV4A 2GLRA 4DEJA 4K9ZA 1TTZA 1PD21 1TP9A 2DC5A 1M2AA 1TJDA 3FR6A 2PWJA 1AXDA 5G5FA 1Y6EA 4JBBA 3HDCA 4FO5A 3DRNA 5COHA 2MZCA 1MTCA 1S3DA 3AY8A 3L9VA 3DIEA 4QQ7A 1A2JA 3HXSA 1PX6A 2M46A 10GSA 1KNGA 2IMDA 4OFTA 3RPNA 5J4UA 2JL4A 5B7CA 5E4WA 4MZWA 4GSSA 1UN2A 3CTFA 5B8BA 1J9BA 3WGDA 1JZRA 1M2DA 2FA4A 5B6NA 3SWLA 2P31A 3CMIA 3D21A 5IQYA 2E2MA 2RM6A 2C0FA 3VLNA 3A5WA 3FZ9A 2MYGA 1URMA 5DCHA 3HZ4A 1E6BA 3KH9A 2MMNA 1GUKA 1FAAA 5D93A 4GF0A 4FIWA 2XBQA 2PUKC 5C00A 3HJPA 2L59A 2TRXA 3FR9A 3ZYWA 1OYJA 1R4WA 1SYXA 4TW5A 1PKWA 5CNWA 5G30A 2H8LA 3RBTA 1WJKA 1GNEA 5AIVA 5KN3A 2N5FA 2LJAA 2R37A 1X5EA 1RQMA 3F4TA 4WF4A 1OE7A 4MPGA 6GSXA 13GSA 2E7PA 4TN8A 4XS4B 3IE3A 5JCUA 3ZTLA 3RHCA 2DIYA 2H70A 4NHWA 5IOWA 1AQXA 1V58A 3S9FA 1BEDA 3L9SA 3ZIVA 3GTUB 4TR1A 5JCWA 4ECBA 4WBRD 4MF6A 1U6TA 2GTUA 2GSTA 3TJKA 1OC9A 3W6GA 3R2QA 2DBCA 3IK7A 2VCXA 3H1NA 4XTSA 3FR3A 2L5LA 1K0AA 2LTKA 3KCMA 4HU9A 2GZZA 1GSDA 2R4VA 4IELA 4OO5A 3ZRDA 1PL2A 2QSIA 3CSJA 5A4VA 1GSYA 1ACVA 5H5RA 1YZXA 1ZZYA 3FZ4A 2KLXA 2DJ1A 2DSAA 4OMVA 5IMDA 4ZL9A 4ML6A 5J41A 2ON5A 2VM1A 3BJ5A 2CQ9A 2D2ZA 2VCTA 3UARA 1Z6NA 2C0GA 3Q74A 5AN1A 1XOAA 3EYTA 1O8WA 5DALA 2C0EA 1SU9A 2I3YA 5EVOA 5IO0A 1FO5A 5IMCA 1FVJA 3TJGA 2K6VA 2H72A 3E0UA 1SJZA 1K3LA 4LL1B 2OACA 1SKWB 3DEXA 2M72A 1GTAA 8GSSA 1THXA 4ECIA 4FYCA 2HZEA 2CX3A 4HS1A 3F3RA 3HYPA 4KW6A 4MMMA 2HRNA 1VF2A 2WB9A 4MH2A 3P90A 4RUVA 2OE0A 1LJRA 1TW9A 5CO3A 5D9XA 1HNBA 3O3TA 3F0IA 3Q6OA 4OCEA 5DVBA 4D73B 3V1WA 5GSSA 2M80A 1V9WA 1DE2A 3GX0A 5DAKA 4AJ7A 4DVCA 3F6FA 4POMA 5J9BA 1ZL9A 4HQZA 5ENUA 1EGOA 2WFCA 2X64A 6GSTA 3J7Yk 2K8VA 1PSQA 4EF0A 2K9FA 3C1SA 4LL4B 2JSZA 2C1YA 2I9HA 1DUGA 3ED3A 5L71A 5ID2A 4KCAA 1XWKA 2WGRA 2IMFA 1EV4A 4O32A 3I69A 4WETA 3ZL5A 3ZFBA 3KEBA 2DJJA 3KIJA 2CA8A 3F63A 3TKPA 4L8EA 5IPGA 1GP1A 3QOUA 5D8IA 4PNGA 1F2EA 2OA7A 3HVXA 1A2LA 3IK9A 1GTUA 1ST9A 1XWCA 1EWXA 1UVZA 2PMTA 3VK9A 2H76A 4IKHA 3FKFA 5D9WA 4V2NA 2YZHA 4HJMA 1PA3A 1Z7RA 3QR6A 2OBIA 1NW2A 3UL3A 4H86A 1QXHA 1VF4A 3D4TA 5AIXA 5EPFA 2PVOC 3CYNA 3IHQA 4J57E 3IPZA 4EDZA 2VD0A 1NHYA 2RLIA 4EUYA 1EOGA 1WOUA 3LJRA 3QFBC 1XWGA 1N2AA 1VGLA 2B1LA 2AYTA 2FHEA 2VD1A 3TKRA 4MH3A 1GTIA 2R2JA 2VL2A 4LA1A 2MBTA 2VM2A 4POLA 1GSQA 2YOIA 4IW9A 4I2TA 4WEYA 2IJYA 2YCDA 1HQOA 3RDWA 1ERUA 2DIZA 2WZ9A 1Y25A 5IIZA 4KDYA 5HFGA 4RI6A 4QL7A 1OVNA 1QFNA 1SD9A 4G9HA 5A4UA 2HSYA 3TCOA 2I4AA 5B6MA 4L5OA 1TK0B 1C72A 1T4YA 2DJ3A 3FK8A 4HZ4A 1B4QA 2VL2C 1XVWA 2I81A 4FYBA 3F9UA 4KA0A 5CP1A 3UVHA 2VCVA 4YQUA 3GN3A 3TJJA 1TI1A 2C80A 3VWWA 4N10A 3DVWA 3FHKA 5ECLB 2A2SA 2ALBA 3P2AA 3ZMLA 1PRXA 5GSTA 2IFQA 2VCWA 2LS5A 1FB6A 2BTOT 2HZFA 2X8GA 3HZ8A 2GSRA 2IMKA 4MJAA 4AF2A 1GULA 5ECMB 2B5XA 5A4WA 1O7UA 3WT1A 2KUCA 3TOUA 1SK2A 4L0WA 1M99A 1XPVA 4FH8A 4I2UA 3KMOA 4MZBA 4POBA 4OO4A 2B7KA 2A2RA 2GZPA 4RQXA 2MBSA 4G19A 1FB0A 1YEPA 4NAXA 1ZCPA 3VWXA 4PXOA 3HJOA 1ZMAA 5CYYA 2WULA 1QGVA 22GSA 2AB6A 2OE3A 3UEMA 4HOJA 5DQSA 5HR0A 4F82A 1XXUA 4PURA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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