4WKWA

Crystal structure of a conserved hypothetical protein from mycobacterium leprae determined by iodide sad phasing
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
202
structure length
197
Chain Sequence
SVKYQADLWFDPLCPWCWITSRWILEVEKVRDVEVHFHVMSLAILNENREDLTENYLENITKAWGPARVVIAAEQANGASVLDPLYTAMGIRIHNEDNKNLDEVIKRSLADTGLPAELAAAAQSNAYDDALRESHHAGMDVGTPTVHVNGVAFFGPVLSKIPRGEEAGKLWDASLTLAAYPHFFELKRTRTEPPQFA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Uncharacterized protein
publication title Crystal Structure of a Conserved Hypothetical Protein from Mycobacterium leprae
rcsb
source organism Mycobacterium leprae
molecule tags Structural genomics
total genus 68
structure length 197
sequence length 202
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4wkwA00
1FB6A 2MBTA 2GZYA 1E6BA 4XTSA 4I6XA 5B8BA 1GUHA 2KLXA 3IA1A 3QOUA 1Z6MA 1XVWA 4ECIA 2YJHA 4YQMA 3O6TA 1YJ6A 1SJ6A 1THXA 5D9XA 5LNKe 4TXVA 1SL1B 4OO4A 3GA4A 2C3TA 1AAZA 1EEJA 3G7JA 1USBA 5D73A 2XBIA 5D96A 1EOHA 3O3TA 4XRDA 3F3QA 4IW9A 4MJAA 11GSA 1F37A 3ZMLA 4EDYA 2AYTA 4BL7A 4WF4A 2IWTA 3UEMA 4L8EA 1X9WB 4LL1B 4GQFA 5A4WA 3GKNA 2HRNA 1GUKA 4XS6A 5DJLA 3KGKA 4F9ZA 1TRUA 1T4YA 3HVSA 2VL9A 3E9JB 5ECKB 1PL1A 3FK8A 3IAM2 3H93A 5ENUA 3U5RE 1ABAA 3QMXA 5D9VA 2H74A 3DYRA 2VO4A 2YV9A 2CZ2A 2KP1A 2PBJA 5J4UA 2C4JA 2PVQA 3DKSA 1XWCA 1HNBA 1V9WA 4G19A 2DMMA 4H86A 1I5GA 1ZYQB 3IBHA 3Q19A 1NHYA 4MA9A 3HVVA 4I2UA 2MZCA 1LBKA 2LRNA 3DEXA 5F05A 3NIVA 2IIYA 4NPBA 1F6MC 5FHIA 3GRXA 4QL9A 2HE3A 4ZIJA 3ZLPA 2DBCA 2XPEA 3IPZA 4MPFA 2YNXA 3TKSE 1AQXA 3TGZA 4HZ4A 2R5GA 5B6NA 1T4ZA 3A3TA 3DMLA 3EINA 2H1GA 5GZZB 2LQOA 1F2EA 3GIXA 3TKSC 5JWRB 1Z3EA 13GSA 2JACA 1YQ1A 1SK2A 4EC0A 3F4RA 3ZVJA 2VD1A 5G2ZA 1KNGA 2BMXA 4EUYA 5KN2A 3IC4A 4LA1A 4IQ1A 1SL2B 5ECLB 2H8LA 5CNWA 3KCMA 2K18A 5KN3A 1N2AA 3UIWA 1VF1A 4PNGA 4KX4A 5C04A 2F8FA 1JLWA 1LJRA 3D21A 4HOJA 3A5WA 1PQNA 3QAWA 2FWEA 2LNTA 2O89A 3TKRA 1M7TA 5F07A 4MH3A 1SL0B 2XC2A 2HSYA 4CW9A 1Q98A 2G0FA 4POMA 3WYWA 1VGLA 3IHQA 4XCSA 3SWLA 7GSSA 3ZREA 4Q5NA 2R6KA 2RLIA 2TIRA 2HRFA 4ZB9A 2CZ3A 2FWGA 4DVCA 1TDIA 2FCHA 2H6XA 1GL8A 2N5BA 5A4VA 1WIKA 3IK7A 4RI7A 1GSUA 1RQMA 4HS1A 5AIVA 4I2TA 1EOGA 3O76A 1K0CA 2O87A 5D9WA 4POLA 2C3QA 1VF4A 5DQYA 3GNJA 1EV9A 1NHOA 3EWLA 2M72A 4YH2A 2CVBA 4POBA 5GSTA 4KA0A 4KDXA 5DCHA 4MF5A 3WD6A 4WXTA 9GSSA 5ID2A 2A2SA 4IP1A 1EGRA 3IE3A 2PN8A 3CSJA 2WRTA 1MTCA 1ZOFA 1RW1A 1QFNA 1PX6A 2CX3A 3MDKA 4ZBDA 4YQUA 4WBRD 3MWHA 5ABRA 1B9XC 4TR4A 2AB6A 5CREA 2G2QA 1BJXA 5D93A 2PPTA 1FB0A 2HI7A 3WT1A 3EU4A 3ZIVA 1HYUA 5CYYA 4GSNA 4YAPA 3KZQA 3SBCA 5G30A 1U6TA 1XXUA 3C7MA 3J7Yb 2YN1A 3US3A 1ZGNA 4P3YB 5B6MA 1MD3A 3FW2A 2JZSA 4XS1A 3GN3A 2LSTA 1XOBA 4ZL7A 1M9AA 4OFMA 4EE0A 2KUCA 4GF0A 4MZBA 4I8BA 3GL3A 1YZXA 3L78A 4DSSA 1ST9A 5CO3A 3M1GA 4L0WA 2GSQA 2RIIA 1HNCA 1FO5A 2X8HA 3Q6OA 1TXXA 3KTLA 3ZL5A 1OE7A 1K0NA 2H01A 5HFGA 3KP9A 4NXIA 2EIOA 4OO5A 1KTEA 5HFKA 4DSSB 4HI7A 1XWBA 2LJRA 1XPVA 3L4NA 5IMFA 3LXTA 1UA5A 5GAND 3FZ9A 3LFLA 2HNLA 2RUEA 3UOMA 2FWHA 2MMAA 2P31A 4FIWA 4TW5A 1UC7A 1XIYA 5DAKA 3IXRA 1T00A 2B6MA 5IIZA 2N5AA 2B5XA 3L9UA 3QPMA 3BJ5A 2VL3A 5ECIB 5H5QA 4TRXA 1SKSB 4J56E 1F3AA 4GRFA 2M46A 4J57E 2I4AA 3RHCA 1Y6EA 5AGYA 3RPNA 5CRGA 1ILOA 2H1BA 3CYNA 5DAKB 4NV2A 4Q5RA 1OE8A 2GT5A 1FHEA 3D5JA 1K0OA 4I5QA 3KIJA 5KN0A 4F0BA 1YEPA 4NHWA 12GSA 4MP4A 3QCPA 3VFIA 4EKZA 3ZFLA 2OADA 2WB9A 1A24A 1GH2A 1S3DA 1HNAA 3L0HA 4TR1A 4AJ8A 2VCXA 2I9HA 3GMFA 2CAIA 4XIHA 4Q5QA 2GSTA 3UL3A 5IPHA 2I1UA 4WEYA 3UMAA 2IJYA 1ZZYA 1MDIA 3PR8A 2JADA 1VF2A 2VL2C 3HDCA 4E8EA 4V2MA 2L4QA 5J9BA 1TJDA 2REMA 3VI5A 1GNEA 2H0HA 3KXOA 1OAZA 2JL4A 2FNOA 4TR1B 4KCAA 4PXOA 1H4OA 4RUVA 2GT6A 3W6GA 2AV4A 1XWAA 3LSZA 3ME8A 3HKRA 3CTFA 1Z9HA 6GSTA 2JSYA 4JR6A 3PH9A 2ZCTA 3GKMA 4V2LA 1AC1A 3TOUA 2HT9A 4NV5A 5FWGA 5IOXA 2GVPA 2P5QA 3C1SA 2L59A 1A2LA 5HFIA 4ML6A 3TJBA 3TJKA 4OCFA 4DSRA 3HJOA 3D4MA 3N5OA 4FO5A 2YWOA 1T1VA 5G1LA 2V1MA 1GRXA 5CRHA 16GSA 5JCGA 1TK5B 2KOKA 3ERFA 3C1RA 2WULA 1Y25A 3H4KA 3GH6A 3GUSA 1ERVA 4ECBA 4MJBA 1O7UA 1B48A 1QMVA 1O8WA 3TRXA 2IMFA 4KB3A 4DEJA 3CRUA 2F8AA 4IP6A 2X99A 1GTUA 1LU4A 2IL3A 1R5AA 3ZTLA 4PQ1A 3UVHA 1K3YA 1ERTA 2IPAA 2X8CA 3GL5A 4O32A 3HD5A 1CQGA 5B8AA 2PMTA 2L5OA 3Q74A 2V32A 4WBJA 4MJEA 1OC8A 1TI3A 2A2RA 5A5KA 1Z6NA 3KMOA 2E2MA 1MDJA 1QQ2A 3GV1A 5F0GA 3PINA 3IR4A 3HJPA 4K9ZA 5HR1A 1M2DA 2GTUA 2IMEA 2H6ZA 2HLSA 2JZTA 2O8VB 1M99A 1FAAA 1OC3A 6GSYA 3QAGA 3VPQA 2FHEA 2I81A 3TJFA 1GLPA 3E3EA 3H1NA 1ZMAA 4HEA2 1JHBA 2JSZA 3A2XA 1VRSD 3FR9A 5DALA 3VPTA 1J08A 3GTUA 3D0ZA 3RDWA 2X8GA 3QAVA 1TRWA 3EMXA 4NHZA 4MK3A 4WR4A 1V40A 2F9SA 4O5RA 3IAS2 1U3IA 1G7EA 1K0AA 1OYJA 4K2DA 4ACSA 5ELAA 2MMOA 2L57A 1WOUA 3I43A 3HYPA 5DALB 2A4VA 1PKZA 2QSIA 3TDGA 3GTUB 2YWNA 2IMIA 5KN1A 3S9FA 3M0FA 2GZZA 4LL4B 4X1UA 22GSA 5EY6A 2VCZA 3G7YA 3EMPA 4RQRA 1QUWA 6GSXA 1K3OA 4GQCA 4OFTA 2HZEA 1G7OA 1IYIA 1G6WA 2WZ9A 2C0FA 4J2FA 4BWQA 3CSHA 3HCZA 3LYPA 3F8UA 3P90A 3GFKA 2DMLA 2DJ1A 2MMZA 1T7PB 1R4WA 3I9V2 3M8NA 4XS4A 2CA8A 2HZEB 3FZ5A 2H1AA 3M3MA 4V1Ag 2GSRA 5EPFA 3UBLA 1IYHA 1VF3A 2GLRA 1M9BA 2LKUA 5G5EA 10GSA 2H73A 4L0UA 5ECHB 4K7IA 1DE2A 3W8SA 1JZOA 2GQLA 3LJRA 2C3NA 4WETA 3VK9A 2DJ2A 3DRNA 1X0RA 3C73A 3AY8A 2R2JA 4PQIA 3IK9A 3KD0A 4ZB6A 4HU7A 18GSA 4XS4B 2VIMA 1C72A 3F6DA 3M9JA 1YKCA 1GTBA 4HDEA 4ZXGA 2IMKA 1GSDA 3LYKA 6GSWA 4G10A 2WGRA 4PURA 4MCUA 1XFLA 4MABA 1GNWA 2L4CA 1TU8A 2AJQB 5IMAA 4YAVA 4XHMA 3R2QA 4AJ6A 5J9CA 4KSMA 1B9YC 5F06A 1XOAA 3P2AA 2YWMA 2L6DA 3W8JA 3BBYA 2WFCA 1AQWA 2ON7A 2PUKC 1OC9A 1JZWA 1PN9A 1J9BA 1R7HA 3VI7A 5HR2A 1JFUA 2HYXA 3IRAA 2FUG2 1FOVA 2LRTA 5D8IA 2PERA 3MSZA 1R26A 2ES7A 2R4VA 3PGTA 2QC7A 1O6JA 1T8EB 2B1KA 2K9FA 1TK8B 1A2MA 1GSYA 5IMCA 4PNFA 5JCUA 3F63A 5DCGA 5ID2B 1ZYEA 4K6XA 2F51A 1GULA 1M2BA 2KHPA 3FZAA 2XHFA 3NZNA 1MD4A 4MMMA 3UBKA 4JR4A 3TB2A 4OD7A 1DUGA 4HZ2A 1X9MB 2R37A 3TCOA 2LUSA 1XZOA 1EP7A 2RM5A 4BVXA 4EDZA 3KH7A 1OKTA 4WF5A 1WPIA 3CBUA 4MF6A 2FA4A 4TN8A 3E0UA 1YDKA 4YQVA 2LS5A 3F6FA 3FHKA 1GWCA 2E7PA 1FW1A 1XBSA 1PSQA 3ED3A 1F9MA 3ISOA 2LEGA 1SK1A 1ZL9A 5E59A 4KH7A 4X43A 1BQ7A 1V57A 5JWQB 4GCIA 2H30A 1O85A 3HZ8A 1A0RP 1WMJA 2GQMA 2DJ3A 4MJCA 3G9BA 2E2GA 4X0XA 1K0MA 3GHAA 5ELGA 1QGVA 2OBKA 3QFAC 4KDYA 3I6AA 4CDOA 2H0IA 3N9JA 2DIZA 1H75A 4TR3A 3C71A 3KEBA 4GWRA 4L5OA 5H5RA 4CHSA 1AXDA 2VCTA 2YP6A 3Q18A 5G5FA 1WRYA 4GTUA 2C0EA 1R5PA 5LD0A 1FG4A 4OFNA 1CQHA 5DBQA 3BOAA 4ZL8A 2TRCP 1V58A 2GQKA 5HR0A 4GXZA 4K0NA 2DLXA 2QGVA 4K7OA 4KUNA 3RHBA 5L71A 4TKYA 3FEUA 3F0IA 3BD2A 4Q5FA 5AN1A 2OE3A 4OWYA 2DSAA 4GSSA 4QQ7A 3DVWA 3KJYA 2NTOA 3ME7A 1DE1A 1O8XA 3FRCA 3EC3A 3HY2A 2EIRA 2FD3A 3MNGA 4ZBAA 1JZDA 3TUEA 3ZMKA 1EGOA 3D22A 2VM2A 3CMIA 2FGXA 4ID0A 4HQSA 1K0DA 3D4TA 3UARA 3FR3A 1S3CA 2IFQA 1TRSA 4EF0A 2OJLA 3GYKA 4K1FA 2V41A 1SYXA 4V2NA 2C1YA 2RUFA 2PVOC 2HXKA 4NWYA 4HQZA 3A2WA 2VCWA 1GSQA 5DDLA 3DVXA 5ECRB 4MZCA 1K3LA 1M0UA 2VAFA 4ECJA 2X64A 1JLVA 4E8HA 2IFQB 1XVQA 3GURA 1QXHA 2PU9C 2NPBA 3QFBC 1ERWA 3V1WA 1SYRA 4BA7A 5IQYA 2RM6A 1SKRB 2DJ0A 3CRTA 5AISA 3J7Yk 1OVNA 4ZBBA 3VWVA 4F82A 1A8LA 1BX9A 1BG5A 2CVDA 4KW6A 3P8WA 3IOSA 3EU3A 1SJIA 3TOTA 2NDOA 4NAXA 2YJ7A 3UAPA 2LV3A 1I9DA 4PUFC 3VLNA 1UVZA 4N10A 5EL8A 4HJ2A 1YKAA 3KH9A 1AQVA 1Z7RA 4EO3A 3ZVJD 1YF1A 4JRRA 1K0BA 1G0TA 1MDKA 2V6OA 3G7IA 2ZNMA 1GSFA 2BJXA 4FH8A 3WGEA 3WGXA 3HJMA 2C8UA 3DGQA 4IVFA 5KEJA 3KMNA 4O92A 3TJJA 2LQQA 2YV7A 2AHEA 1EV4A 2L5LA 5FT3A 2IMDA 2HFDA 4PGTA 1ON4A 2H76A 1NSWA 5JWOB 4Z7XA 3EYTA 2B7JA 2HZFA 4BPYA 3FY7A 4ML1A 3QD9A 3TKSA 2FY6A 5HR3A 1S3AA 1RK4A 2MBSA 1YF0A 1ACVA 2DIYA 4AJ7A 1AIUA 4JBBA 4EL1A 5G1KA 4LMWA 2DC5A 4IKHA 2FWFA 2DJJA 1KEBA 3ERGA 4KDUA 1F3BA 2VLVA 1PRXA 4F03A 2LRCA 3KP8A 3VWXA 4KE3A 2ALBA 4KCEA 2CAQA 1BEDA 2B1LA 2CT6A 2NBSA 1KBNA 2VCQA 2MYGA 3K8NA 5GSSA 4POKA 1O81A 5J41A 2JU5A 1E2YA 2YPMA 5IO0A 1SU9A 4K8MA 2VLUA 1XW6A 3D6IA 2B7KA 3GKKA 1AW9A 1SJZA 2VLTA 3I69A 2M80A 4WKWA 2WS2A 4KNDA 1NW2A 1U3AA 2PWJA 5J3RA 4D73A 4WR5A 3FKFA 3BCKA 5JCWA 1WJKA 2C80A 3F9UA 3GX8A 3KTBA 4G2EA 2D2ZA 1EZKA 3APQA 3EVIA 2YZHA 3DWVA 2O7KA 1V98A 4AGSA 4MLYA 1A2JA 8GSSA 2GZPA 4RI6A 3WT2A 1XCCA 5IPGA 3ZZXA 5ECQB 3L9VA 3BCIA 1GSEA 1TU7A 4D73B 1HD2A 1GTIA 3CSIA 2GGTA 1EWXA 5IMDA 2K8SA 1A8YA 4TR0A 1ERUA 4IGJA 2ON5A 2QKEA 3TRPA 3U6VA 1TP9A 1TRVA 3HVXA 1URMA 2OBIA 2XBQA 4N0VA 3LEFA 3MAKA 4FYUA 2ZUPA 1QK8A 3ZYWA 5F8BA 1MEKA 4MDCA 1OKDA 2YOIA 5IMZA 1U88A 2GSSA 1GSSA 3EE2A 4LLRA 3GH9A 2CX4A 3F3RA 1X5DA 1NM3A 4ECCA 3TKPA 1Z5YE 2YCDA 4OCEA 1A0FA 5CAXA 3CXGA 4JEDA 2FA8A 4G9HA 1YEXA 3IDVA 3OR5A 3LXZA 4NMUA 2BTOT 1WP0A 4OMVA 2H1DA 2H19A 2WCIA 1TK0B 4ULXA 1PL2A 4MH2A 2VM1A 3UVTA 3HHVA 4RQXA 3UJ1A 1TTZA 1SD9A 2H70A 2WDUA 3NOFA 4F2IA 4BWSA 4TXOA 1BYEA 4L5LA 3VWUA 6GSVA 1WE0A 1SD8A 2YWIA 4IJ3A 4PQHA 4N30A 1GUMA 4LMVA 4PUAA 1Q4JA 3QR6A 1PGTA 3WGDA 1T3BA 1GP1A 2VUPA 2FLSA 6GSUA 3TKQA 3DD3A 3LORA 5IM9A 5IOWA 2NVLA 4TXOB 19GSA 1J0FA 1AUCA 2I3YA 5EVOA 3APSA 3APOA 1XWGA 5ECPB 2B3SA 1DSBA 2YANA 1OC9B 2LJAA 3FZ4A 1X5CA 2CQ9A 2EC4A 5G31A 2C0DA 2B5YA 2LJKA 3LQ7A 3GSTA 4AF2A 5ECOB 4JU5A 4IS0A 2OA7A 1PKWA 3F4SA 2PGTA 1UN2A 1EEMA 4HU9A 2DJKA 3HXSA 4GLTA 5A4UA 1PMTA 5E4WA 2YZUA 5COHA 6GSSA 4F0CA 1GLQA 2JZRA 1TI1A 4IJIA 2EIQA 5CRDA 4ZILA 1WWJA 4IHUA 3RAZA 5INYA 2P5RA 1FVJA 2VD0A 2K6VA 4KSOA 1B4QA 14GSA 2AAWA 2B5EA 5ECMB 3GX0A 4JZQA 5D9TA 5H5SA 1XWKA 5AIXA 3ZRDA 3RPPA 3C8EA 1ML6A 2TRXA 3LG6A 3IV4A 2VOCA 1TKDB 4I97A 5LCZA 4KGIA 1U87A 1SENA 3EURA 3LGCA 3DXBA 1V2AA 2LTKA 20GSA 1SK0A 3FYGA 4MF7A 2HSHA 2J23A 4MPGA 1BAYA 1X9SB 5ECSA 3ZITA 5J5NA 1FVKA 2J9HA 3TRQA 1X5EA 4IN0A 4O7HA 17GSA 1HQOA 4TVEA 5CP1A 3RBTA 2VL2A 1DBYA 3DIEA 4V1Ap 5ECNB 1EP8A 2GS3A 3FR6A 4N0ZA 4JE1A 3VURA 2H6YA 2R3XA 5DVBA 4EXJA 5B7CA 2C0GA 3M9KA 2VCVA 3P7XA 2H66A 2CVKA 4ISDA 3H8QA 2V2GA 4QL7A 2CV4A 2OE0A 2WJUA 2OE1A 3KM6A 2OKAA 4FYBA 3F4TA 3GSSA 2H72A 3JCML 4IQAA 1M2AA 4ZL9A 5IMVA 4MZWA 5HQPA 4IELA 3QDNA 4FYCA 3A2VA 2N5FA 2H0GA 2KP2A 4ZB8A 3ZIJA 2OACA 2LNSA 1GTAA 3ERWA 1PD21 1ZCPA 2GDRA 5DQSA 5C00A 5IO2A 1W89A 3GKXA 4TOPA 4BVYA 5CRWA 4DSQA 4HUAA 2XPDA 4IBPA 4KAEA 1TOFA 5DJMA 1PA3A 4PX1A 2O85A 1SKWB 4HJMA 1W4VA 3ZFBA 2L6CA 1PX7A 2F3MA 3H79A 1B4PA 4GSTA 5GAPD 1XW9A 1JZRA 4EVMA 2Z9SA 4ILFA 3L9SA 4XRAA 3HA9A 4N11A 3HZ4A 2AUVA 2V6KA 1Z7PA 1B8XA 2E0QA 3TJGA 2H71A 2IN3A 1O73A 2H75A 1G6YA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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