2FD3A

Crystal structure of thioredoxin mutant p34h
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGHCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant P34H
rcsb
molecule keywords Thioredoxin 1
total genus 30
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fd3A00
2O87A 5IPHA 3TKSA 2J9HA 3HKRA 3WGEA 3H79A 4GQCA 2FNOA 5GZZB 1V2AA 4G19A 4IGJA 3FKFA 4MPGA 1XCCA 5DALA 2WJUA 3G7JA 12GSA 4CDOA 3DEXA 1B4QA 4HI7A 1TRVA 1PGTA 4BVXA 2FY6A 3HJPA 5ECLB 1K0OA 1PQNA 4I5QA 2LRNA 1XBSA 2H1BA 1RQMA 1JZDA 2J23A 2H1AA 3L9VA 1G7EA 4ILFA 3LQ7A 2QKEA 3A2WA 5DCGA 2NBSA 5D9VA 2C4JA 1Z9HA 3WGXA 3GH6A 3VFIA 2CZ2A 1MDJA 1GWCA 5AN1A 2VO4A 5A4WA 1TRWA 2VD0A 3DXBA 1AQXA 1SL1B 4TR0A 4K0NA 3FR3A 1A8YA 4ZILA 1KEBA 3GIXA 3RDWA 4RQXA 1A23A 4N11A 4TR3A 2YZHA 2FA4A 1B9XC 1FAAA 2ON5A 3Q19A 2RM6A 2IMFA 1JLVA 4TXVA 2VLTA 2LV3A 4ZB8A 3UAPA 4JE1A 1YF1A 3LORA 4BWQA 2WZ9A 2C0GA 4DSSA 1VF4A 3A3TA 3F6FA 2TRXA 1W4VA 2CAQA 1GUMA 4EC0A 4YQMA 1GUKA 4ZL8A 2CX4A 5DVBA 5ID2A 4IBPA 1O85A 5EVOA 5HR0A 1IYIA 2VLVA 4HQSA 1JZOA 1T8EB 1N2AA 3M9JA 3WGDA 4I6XA 2MBSA 4RI7A 2IMIA 2LRCA 3C1SA 4O32A 1XWKA 1JZRA 1PMTA 3EE2A 2YV7A 1M7TA 3D4MA 4IELA 5ECMB 3C1RA 1G7OA 2LQOA 4OO5A 2IJYA 5FWGA 1QFNA 4X0XA 1NM3A 4ZBAA 3J7Yk 2IMDA 3QPMA 4JBBA 4NMUA 4YQUA 2FHEA 3H1NA 1LJRA 2D2ZA 1UVZA 2DJ2A 2L4QA 1A24A 3PINA 4LMWA 2PWJA 3K8NA 1M9AA 4POMA 3KMNA 2XBQA 3F4TA 4K7NA 2HYXA 5C04A 4MPFA 4ZIJA 1JLWA 3UBKA 5HFKA 3HDCA 1JZWA 1WIKA 1OVNA 4KB3A 5IPGA 3GL3A 2VUPA 4ZL7A 2H19A 1T4YA 4POBA 3LWAA 4IVFA 2JU5A 5D9WA 6GSVA 3BCKA 1XW9A 3ISOA 3EU4A 2F51A 3GFKA 4D73A 4ZL9A 1PD21 4G2EA 5IMZA 5IIZA 2KOKA 5CNWA 1SYRA 3LSZA 1AW9A 1A2MA 3EWLA 4RQRA 4YH2A 1V57A 2GQLA 3GYKA 4XS1A 2H6XA 4ZXGA 3LEFA 4GSNA 3HYPA 1Z6NA 2PERA 1XVWA 3TJGA 1BYEA 2V41A 2LTKA 3KD0A 3SWLA 1YKAA 3N5OA 2EC4A 3FK8A 5F0GA 1X0RA 3F0IA 2CT6A 3D22A 1TJDA 1M9BA 5LNKe 2AUVA 5DQSA 4FYCA 1FVKA 3ZVJD 1TP9A 1GUHA 2HZFA 1DE2A 3QD9A 1G6YA 4HOJA 1EZKA 3KIJA 5D93A 2V32A 1MD3A 4KX4A 2YWIA 2LSTA 3GTUA 3GX8A 3DMLA 2BTOT 3HA9A 4L5OA 4WBRD 5IMCA 4KNDA 3GN3A 2L4CA 5INYA 1O8WA 4LLRA 2GSSA 1K3YA 18GSA 1WMJA 1FB0A 3ZL5A 2AYTA 5IQYA 2F8AA 1ACVA 5HR2A 3I6AA 5IOXA 4XIHA 1MTCA 1JFUA 2FD3A 2FUG2 3DD3A 3D6IA 4MZBA 1SK0A 2LS5A 3GHAA 8GSSA 3EU3A 3FR9A 1GTUA 2LRTA 3TRQA 1MEKA 1SENA 2H01A 1GTIA 3U5RE 3F6DA 4V2MA 5G30A 1GSYA 2I81A 3SBCA 4HU9A 2RIIA 3QAGA 1ERTA 3FR6A 4AGSA 2MMAA 3AY8A 4MF5A 2MYGA 5G1KA 2ES7A 1J9BA 3DRNA 2KHPA 3WT1A 2HLSA 4V1Ag 4IHUA 1BX9A 4GSSA 1XVQA 4KA0A 1R5PA 1TW9A 2H71A 3ZITA 2XPDA 2O7KA 4K9ZA 1XW5A 3VI5A 2C3TA 4PUFC 2RM5A 1TK5B 1BQ7A 5DALB 1LBKA 3TOTA 3TCOA 1SD8A 3G7YA 1XOBA 1XWBA 5ECPB 2K8VA 3IAS2 1SKSB 3LJRA 3CSHA 1OAZA 1F2EA 2VL9A 3KH7A 2VL2C 2H74A 2KUCA 3EINA 2B1LA 2NVLA 3HY2A 1CQGA 1WWJA 1ON4A 3PGTA 1YZXA 3W8JA 1RW1A 3I9V2 2C3QA 4LMVA 3OR5A 3MSZA 4PURA 1VF2A 4L0WA 3KCMA 3CSIA 4XCSA 1NHYA 2KLXA 4N10A 3C8EA 4XRAA 2GT6A 2LUSA 1UC7A 3GV1A 2O89A 2AHEA 3IK7A 1WPIA 2H30A 1Z5YE 1GTAA 5LCZA 3L9UA 4WKWA 4POKA 3M9KA 3UEMA 5AISA 4PXOA 2H1DA 2WULA 3TDGA 1K0NA 1BJXA 2DLXA 2C0FA 4HU7A 2WCIA 4JEDA 3HVXA 2H0GA 3S9FA 1G6WA 4O5RA 5DQYA 1A8LA 4KCAA 3DVWA 1R5AA 4ML1A 3DWVA 3ZZXA 1PSQA 2B5EA 1U3IA 2V1MA 1FVJA 4LA1A 3ED3A 2WFCA 4TVEA 2JACA 4WETA 3HVSA 4Q5RA 2VM1A 3PR8A 1ZCPA 4TW5A 2H75A 1FO5A 4OFTA 3TB2A 2OKAA 3G7IA 5IO0A 17GSA 2FWEA 1WE0A 1CQHA 4O92A 3IV4A 2IWTA 5KN3A 2WGRA 3IA1A 3CSJA 1YY7A 4DSQA 1AUCA 4WF4A 2HI7A 4BA7A 4NHWA 3GKKA 2R3XA 1QUWA 4HZ4A 1F6MC 2AAWA 2MBTA 1VF1A 1ZGNA 2HXKA 1SKWB 3FY7A 1K3LA 1X5CA 1GTBA 1XWAA 20GSA 4AF2A 3APQA 3GUSA 5G1LA 2DBCA 1Q4JA 1U6TA 1OC8A 5G5FA 4XTSA 4OO4A 2V6KA 2HSHA 2JZSA 5A4VA 1VF3A 4EF0A 4GLTA 1MDKA 3U6VA 3KP9A 3A5WA 1M0UA 1Z7PA 3H93A 1GSQA 2VL2A 5EPFA 2X64A 4EXJA 2H0HA 1EOHA 4PX1A 4OFNA 3Q74A 1PN9A 1X9SB 1HNBA 1A2JA 3FYGA 4IS0A 5JCGA 3HD5A 3J7Yb 2HZEA 5CRWA 3M3MA 2AB6A 5D73A 2DIZA 1H75A 1XPVA 3KH9A 1B8XA 3D5JA 3GX0A 1ERVA 4KCEA 4TN8A 4AJ7A 1O8XA 1TOFA 2PUKC 2WS2A 4MH3A 2E2MA 1BAYA 3M8NA 5CREA 2B5YA 3TJJA 4TXOB 2YNXA 1HNCA 1A0RP 2WDUA 5B7CA 3EURA 2Z9SA 5B6NA 5DJMA 3GMFA 2JADA 2CAIA 3GA4A 4GF0A 4XRDA 5COHA 4ECIA 4PQ1A 3TOUA 1IYHA 2JSYA 3UBLA 1SD9A 3FZ5A 2I4AA 5KEJA 3D21A 2HRNA 1MDIA 2GQKA 2H76A 5IMAA 3ZIVA 2F3MA 3GSSA 2LNSA 1FOVA 3TKQA 1O6JA 1U87A 2MZCA 5B6MA 3FRCA 4ML6A 5ENUA 4MF7A 4ID0A 4KDUA 3D0ZA 1J0FA 3GTUB 2B7JA 2PBJA 2R2JA 3L9SA 2VCQA 4EVMA 1SJ6A 1NSWA 3LFLA 4J2FA 5J41A 1X5EA 5HR3A 5E4WA 3GNJA 5F06A 4LL4B 3M0FA 6GSXA 3EVIA 1XZOA 4FYUA 1TK8B 2H6ZA 1YEXA 5E59A 2GQMA 2LEGA 4WXTA 2GTUA 4MF6A 3E9JB 4XS4B 4V1Ap 2MMOA 3CRTA 2H73A 1FB6A 1R26A 2VD1A 2NDOA 3TKSE 4YAPA 4NXIA 1OKTA 2PU9C 1Y6EA 3UOMA 2C3NA 4NV2A 2DMLA 1T1VA 3F3QA 3KGKA 3HCZA 6GSSA 2PN8A 2GZYA 3C7MA 1XIYA 3F8UA 2LJRA 3R2QA 1N8JA 2DJ1A 5G31A 2H0IA 1F37A 3CTGA 5H5SA 2X99A 5J5NA 5J9BA 1WRYA 3APSA 4JZQA 1QXHA 3LYKA 5IMDA 2WB9A 5EL8A 5DBQA 4GSTA 2M46A 3QMXA 2XPEA 4X43A 3HZ8A 2DC5A 5F8BA 2DSAA 3HXSA 4JU5A 1GNWA 4GTUA 1O7UA 3IRAA 5IOWA 2OACA 4MK3A 4L0UA 1YKCA 5CP1A 1R4WA 2R37A 4V2NA 1GULA 3VWVA 3DVXA 3W8SA 1M2DA 2I9HA 1E6BA 3HJMA 2L5LA 3TJFA 2O8VB 2PPTA 3GKNA 1SL2B 4KGIA 4G10A 2GS3A 1DBYA 4ZB6A 3ZFLA 4MDCA 3VPTA 5D9XA 3I69A 1OYJA 1XW6A 3JCML 1WP0A 3A2VA 3TRXA 3ME7A 3P8WA 3UVHA 5AIXA 11GSA 3VI7A 2RLIA 3MNGA 1TTZA 2NTOA 1URMA 2GZZA 1M2AA 5A5KA 2YWMA 2NPBA 2YWNA 2FWFA 1BEDA 5ECSA 2GSQA 3MAKA 1WOUA 1XOAA 3UL3A 1Y25A 4ECCA 3C73A 4I8BA 4NV5A 2ZCTA 4PGTA 4GRFA 2FWHA 1EGRA 5GAPD 1KBNA 3IAM2 6GSYA 3HHVA 1S3AA 1PKWA 2OJLA 5EY6A 1B4PA 1BG5A 1FHEA 2DJ0A 1EGOA 4MA9A 4KW6A 2O85A 2BJXA 5G5EA 1W89A 2CZ3A 3P90A 2VM2A 1J08A 5ECRB 2ZUPA 2OE1A 4Q5NA 2R5GA 1PRXA 3BBYA 5IMFA 4YQVA 2GZPA 3P2AA 1B48A 3H4KA 3FHKA 4DSRA 4MZWA 4Q5QA 1X9MB 5IMVA 3IBHA 1SU9A 3O3TA 3L4NA 2ON7A 1TK0B 4LL1B 4K6XA 4KDXA 2JSZA 2R4VA 3GKXA 1UA5A 2AJQB 3HJOA 2DJ3A 4TR1A 3Q6OA 1XXUA 4J57E 4TRXA 3N9JA 5ABRA 2AV4A 3ZLPA 4WF5A 4MCUA 2P5RA 1SJZA 3L0HA 1AXDA 2K6VA 2VCXA 5JCWA 3LXZA 3D4TA 2N5AA 2QSIA 1GSFA 2G2QA 3NOFA 4WBJA 1OC3A 3ZIJA 5KN0A 1TU8A 2VCVA 4RUVA 1OC9A 4BPYA 2GLRA 1V58A 1K0CA 5ECHB 5A4UA 3APOA 4ECJA 3CBUA 4F0CA 4OD7A 1TI1A 5CYYA 3IHQA 2C1YA 3QFAC 2LNTA 4FH8A 2PMTA 2YJ7A 4F2IA 3QAWA 1GP1A 7GSSA 1K0BA 3ME8A 1VGLA 1ZL9A 3RBTA 4EL1A 1YDKA 2ALBA 2HZEB 2JZRA 3TJKA 4BWSA 4CW9A 2B5XA 2FLSA 4F82A 2V6OA 2E2GA 4EDYA 3ZYWA 2C8UA 3QCPA 1K0DA 2L57A 2OA7A 4I2TA 1ZZYA 2M80A 1TXXA 1THOA 5F07A 4DSSB 5HFIA 2B6MA 2JZTA 3I43A 4K8MA 10GSA 4AJ6A 4MP4A 2GSTA 5ID2B 4IJ3A 2TRCP 3MDKA 4MZCA 1FW1A 2I1UA 4NAXA 3IR4A 2X8HA 1SKRB 2V2GA 4OMVA 4Q5FA 1UN2A 3GH9A 1I5GA 5IM9A 1V9WA 2FWGA 1M99A 2CVKA 3KP8A 5L71A 3CXGA 1V40A 4F9ZA 1EV9A 4KAEA 1ABAA 3P7XA 1ML6A 3FW2A 5GSSA 13GSA 2LJAA 3FZAA 5ECQB 2B3SA 5GAND 2LKUA 1TRUA 3KTLA 4DEJA 3V1WA 3BJ5A 1AQWA 1SK1A 1EEMA 4HZ2A 3KMOA 1NW2A 4HJ2A 3IE3A 3GURA 2CV4A 4I2UA 3F4SA 2VCZA 3BD2A 2HT9A 3ZRDA 4MJBA 2WRTA 4JR4A 4IKHA 4IN0A 2YN1A 2BMXA 2DJKA 2L6CA 4OWYA 5ECKB 3LXTA 1EP7A 2IPAA 4ECBA 1O73A 4N0VA 3KXOA 1GRXA 2H66A 1ZYQB 4PQHA 1PL2A 1QGVA 1S3CA 3CYNA 3F9UA 4P3YB 4D73B 4EUYA 1YF0A 2N5BA 4JR6A 4FYBA 5JWOB 4ZBBA 1GSUA 4ULXA 3A2XA 1HNAA 4BL7A 4PUAA 2OBIA 3E0UA 5ELGA 1SL0B 1T4ZA 1EEJA 4X1UA 1F3BA 4MJAA 4OCFA 2HRFA 2DMMA 3RHCA 1V98A 4HJMA 1EV4A 3LYPA 4IQ1A 3BOAA 2F9SA 1NHOA 14GSA 1X5DA 3EC3A 2YOIA 1U3AA 3KEBA 1EOGA 5H5RA 4HQZA 4N30A 1R7HA 4POLA 1T7PB 2L6DA 2OBKA 4MH2A 1O81A 5B8AA 1TRSA 2E0QA 3ZTLA 2CQ9A 4F03A 1B9YC 1Z3EA 1G0TA 3M1GA 4G9HA 4N0ZA 3IOSA 2PVQA 2X8CA 1HYUA 4TKYA 1JHBA 3VWXA 4E8HA 1TDIA 2IFQA 2B7KA 2VAFA 3IK9A 1SK2A 1K3OA 5ELAA 2QC7A 1HQOA 1ZMAA 5D96A 3ERFA 2OE3A 4KSOA 2H8LA 4TR4A 3VURA 1GNEA 2K8SA 4ZBDA 1Q98A 2LJKA 4BVYA 5DAKA 2XHFA 4XHMA 2H1GA 1MD4A 3WYWA 2CVDA 2E7PA 4NHZA 4MLYA 3W6GA 2N5FA 5KN2A 3TJBA 5DJLA 2EIOA 2IL3A 2X8GA 4RI6A 1A2LA 3ZREA 2IMEA 3RPPA 3UMAA 3KTBA 1OE7A 2KP1A 1E2YA 2YP6A 4CHSA 3GRXA 2R6KA 3QDNA 2YZUA 3EYTA 4J56E 2OE0A 3US3A 4HEA2 5J9CA 3LGCA 2LQQA 2C80A 4K7OA 3F4RA 1DSBA 3FEUA 4XS6A 2XC2A 2F8FA 2IN3A 3GKMA 4KH7A 2IIYA 1C72A 3PH9A 4WR5A 4MJEA 2YJHA 1DE1A 3KZQA 1T00A 2A2RA 5DDLA 4WEYA 1ERWA 2XBIA 2G0FA 3VK9A 3NZNA 4IP6A 4OCEA 4TR1B 2YV9A 4GQFA 2JL4A 3TKRA 4I97A 5HR1A 2PGTA 2HNLA 5HFGA 4HDEA 2YCDA 3L78A 4F0BA 4ACSA 2HSYA 3QOUA 2H6YA 4AJ8A 2KP2A 2H72A 2YANA 3UIWA 3ZMLA 2GGTA 5DCHA 1Z7RA 1ILOA 2L5OA 22GSA 1K0MA 1OE8A 4H86A 1ZYEA 1GLPA 4KE3A 4TXOA 4QQ7A 4K1FA 1SJIA 3HVVA 4ZB9A 3CTFA 5KN1A 1OC9B 3ZVJA 2P5QA 3EMPA 4QL7A 3TRPA 1GLQA 1FG4A 3FZ9A 1YQ1A 4MABA 1PX7A 3TKPA 4Z7XA 1ZOFA 3DGQA 1GSSA 2MMNA 4O7HA 1RK4A 2CA8A 2REMA 3GL5A 3DIEA 5J3RA 4EO3A 1A0FA 4GXZA 3C71A 2VL3A 4K0GA 1QMVA 4NWYA 3WT2A 5FHIA 5ECNB 19GSA 5J4UA 4EDZA 2GT5A 5JWRB 2EIQA 2L59A 2H70A 4EE0A 4KUNA 3FZ4A 3IPZA 3DYRA 3EMXA 2GSRA 2DJJA 3DKSA 1GSDA 1TI3A 3IDVA 4K7IA 5LD0A 2YPMA 3GSTA 1GL8A 3H8QA 3KJYA 3Q18A 1M2BA 3VLNA 3RAZA 3WD6A 4XS4A 2FA8A 2HE3A 5C00A 5ECIB 4KDYA 3ERGA 5AGYA 2VLUA 1PKZA 2VCTA 1GH2A 2MMZA 3RPNA 1TKDB 1F3AA 4WR4A 4GWRA 1EP8A 1SYXA 2TIRA 3O76A 1K0AA 2I3YA 3CRUA 4EKZA 4NPBA 2QGVA 4PQIA 3TKSC 2RUEA 2FGXA 3HZ4A 3ERWA 2FCHA 4PNFA 5CAXA 1USBA 5D9TA 1OKDA 5D8IA 4E8EA 16GSA 5IO2A 3F3RA 4OFMA 3NIVA 5B8BA 3TUEA 2HFDA 5CRDA 3QR6A 5HQPA 1XWCA 3KM6A 4MJCA 4TOPA 1PA3A 2K9FA 4GCIA 2OADA 3CMIA 4IP1A 3VPQA 2VIMA 3ZMKA 6GSWA 3QFBC 3ZFBA 3VWUA 1PX6A 5CRHA 5JWQB 1PL1A 2GDRA 2VCWA 4MMMA 4L5LA 2PVOC 5ECOB 1QK8A 4PNGA 3G9BA 2CVBA 2C0DA 2B1KA 2RUFA 4DVCA 1I9DA 3O6TA 2GVPA 2ZNMA 2IMKA 2DIYA 3UJ1A 1AIUA 3TGZA 1ERUA 5CO3A 2A4VA 3IXRA 3UVTA 6GSUA 1Z6MA 3LG6A 1LU4A 1GSEA 3IC4A 5AIVA 3QAVA 1DUGA 4ISDA 2M72A 3MWHA 1AQVA 1H4OA 3VWWA 1X9WB 4K2DA 3E3EA 1ST9A 1THXA 1QQ2A 2C0EA 1KTEA 4IQAA 1T3BA 1WJKA 2P31A 1YEPA 4HUAA 1EWXA 4HS1A 5G2ZA 5FT3A 5CRGA 4L8EA 2K18A 3UARA 4IJIA 2CX3A 2EIRA 4QL9A 5JCUA 4JRRA 1YJ6A 1TU7A 3RHBA 5GSTA 1AC1A 5H5QA 2P0GA 4FIWA 1XFLA 2YWOA 1S3DA 2VOCA 6GSTA 2A2SA 4KSMA 4YAVA 3BCIA 1KNGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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