2M80 | Genus

Total Genus 24

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	24
sequence length	109
structure length	109
Chain Sequence	MSAFVTKAEEMIKSHPYFQLSASWCPDCVYANSIWNKLNVQDKVFVFDIGSLPRNEQEKWRIAFQKVVGSRNLPTIVVNGKFWGTESQLHRFEAKGTLEEELTKIGLLP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Saccharomyces cerevisiae
publication title	Structure-guided activity enhancement and catalytic mechanism of yeast grx8 pubmed doi rcsb
molecule keywords	Glutaredoxin-8
total genus	24
structure length	109
sequence length	109
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-05-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00462	Glutaredoxin	Glutaredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	2m80A00

1HNAA 3C73A 5H5SA 1YJ6A 4JR4A 2CAIA 3ISOA 5EY6A 1G7EA 1SENA 4MZWA 3J7Yb 1EGOA 2VM2A 5C04A 4V1Ag 1JHBA 5KN3A 4K1FA 1SJZA 1FVKA 3DEXA 2I1UA 3TJKA 1X9WB 5G5FA 4ID0A 1GSUA 1XOAA 4K7OA 2CQ9A 4WKWA 3IA1A 1T4YA 2I4AA 3C8EA 1OAZA 2CVKA 1M7TA 1BEDA 1TRVA 4PURA 3TRXA 2VLTA 1K0CA 1O81A 4AJ7A 2WFCA 4F0BA 3GV1A 3N9JA 3F63A 2VCVA 1R5PA 4DSSA 1OYJA 3TB2A 3G7YA 2LJAA 2JACA 5F8BA 1KNGA 2OA7A 3IRAA 1BQ7A 1O7UA 3VI5A 3GUSA 2NVLA 3VWWA 3FK8A 3KM6A 2JSYA 4IN0A 2QC7A 1UC7A 4O92A 4GF0A 1OVNA 1X9SB 2HI7A 5ABRA 2YJ7A 1FB6A 2VM1A 3EU3A 2A2SA 1PN9A 2H30A 1S3AA 1M9BA 2JADA 2IJYA 3ZLPA 4JR6A 3FY7A 4TRXA 3HJMA 5AIXA 1OC9B 5CO3A 3IPZA 1B4PA 1GP1A 2IL3A 1E6BA 4YAVA 4WR5A 10GSA 2BTOT 1X5CA 2WJUA 1F37A 2VCWA 3O76A 4HJMA 1EP7A 1C72A 4GSTA 3U5RE 3ZVJD 2X99A 5D73A 2C8UA 7GSSA 2B3SA 1XOBA 2OE0A 5A5KA 1MDKA 2O85A 2DMMA 3KMOA 3P7XA 3LYPA 1I5GA 1WRYA 1N8JA 1A0FA 4OFNA 2MBTA 1AQVA 2ON7A 1SK1A 4TR0A 3UBLA 2YPMA 2LSTA 2C0FA 3EMXA 1XVWA 5ECPB 5ELAA 5GZZB 4X43A 3KGKA 1SL1B 1KEBA 3QAGA 2VAFA 1Y6EA 4HU9A 2GSRA 1GSYA 4TR1B 4TR4A 1JZOA 2PMTA 3EVIA 5ENUA 3G7IA 1T8EB 4ZL7A 2CT6A 5CP1A 4X0XA 1FAAA 2FWFA 4OMVA 1VF4A 5CREA 5G31A 4YQUA 5G2ZA 1FOVA 4DEJA 1V2AA 3DKSA 2N5BA 4EKZA 4IBPA 1GTIA 1YDKA 1JLVA 3HXSA 2MMAA 3ZREA 2HZEB 2JZSA 4K0GA 2YV9A 3BCIA 3WD6A 1TK8B 2B1LA 3EC3A 3E0UA 4RQRA 1TK5B 2VCTA 3PR8A 2YWNA 3IK9A 2OBKA 4HQSA 4LL4B 3J7Yk 1HQOA 1M2BA 4ZB6A 2FWGA 4BWSA 5A4VA 1YKAA 3US3A 1GTUA 5D9XA 5ECSA 2HYXA 4HZ4A 3KCMA 3L9VA 2VCXA 2O87A 1A0RP 3UAPA 1HD2A 2QKEA 1DE1A 1Z6NA 4L0WA 3ZVJA 3KD0A 1PQNA 1PA3A 5ECOB 5DBQA 3RAZA 1B9YC 2M72A 3I43A 1M2AA 3GA4A 2C3NA 3BOAA 4XS6A 1YZXA 1XBSA 22GSA 5J5NA 2LJRA 3HYPA 4MF5A 2F3MA 2FCHA 4OO5A 5FHIA 3MNGA 1SU9A 1BAYA 5B8AA 3DIEA 4ML1A 5A4WA 4OWYA 5IMFA 1K0MA 3CSHA 4GWRA 4EO3A 4LA1A 3LWAA 2XHFA 3ZZXA 3CTFA 3ZIJA 2V41A 4MMMA 5B6NA 1SD8A 3FYGA 5ECKB 2REMA 4K7NA 3DYRA 1ERTA 3GL5A 2H8LA 4IP1A 4O32A 1ZYEA 2GT6A 3KXOA 1DE2A 2DJKA 20GSA 2HLSA 2HE3A 3GX0A 1MD4A 3QCPA 2PN8A 4OFMA 4WXTA 1VF3A 5IIZA 5IPHA 4AJ6A 2YANA 2DC5A 2F51A 4CW9A 1Y25A 1ERWA 1GSSA 2GGTA 5DALA 1TRSA 1U87A 2B1KA 1TI3A 4IELA 4YQVA 2K6VA 3CRUA 4KDUA 1QK8A 3TGZA 2GSQA 3GSTA 3FR9A 2RUFA 3FEUA 3IK7A 2IWTA 1T1VA 3I6AA 4J56E 2EIRA 4Q5RA 1XWAA 3TKRA 1ST9A 1FG4A 1M0UA 2FD3A 1H75A 2CVBA 1AW9A 3K8NA 5E4WA 5D9WA 3ZTLA 4LMVA 2YJHA 5GAND 5EVOA 1X5EA 2AYTA 4NV5A 3D5JA 5J3RA 4N30A 3G7JA 4DSSB 1A8YA 2WULA 5L71A 3VPTA 4WEYA 3TUEA 2J23A 2DBCA 4ZBAA 1SYXA 1GTBA 1SJ6A 3UMAA 2R37A 1GSEA 3A3TA 4KSOA 1OE8A 3CBUA 3Q6OA 3P90A 2H6YA 4NAXA 3D6IA 1XXUA 4GTUA 4KGIA 2GZZA 4PNGA 1GSFA 1I9DA 5IMDA 3LEFA 3TKQA 5B6MA 6GSYA 3NIVA 1YEPA 1EV9A 2GS3A 2ALBA 1PKZA 1WP0A 2L5LA 2CA8A 3MDKA 5AGYA 4TR3A 1V98A 1PRXA 3ZMLA 4ZL9A 4H86A 3QDNA 2LUSA 4F82A 3DGQA 3KJYA 4KE3A 2ZUPA 3DVWA 3FZ5A 4JEDA 1VGLA 4BA7A 2GT5A 3GN3A 3GX8A 4BVYA 5LCZA 3VPQA 2DJJA 3HHVA 3ME8A 2B6MA 5G5EA 1LU4A 1GRXA 2B5EA 2EIOA 4GXZA 1GUMA 4V2NA 2PERA 1UVZA 5IO0A 2F9SA 5C00A 4AF2A 4MPFA 4ZB8A 5H5RA 1OE7A 3TRQA 3GHAA 5CRDA 5ECRB 1ZGNA 3HKRA 1TRUA 4IP6A 4JBBA 1EWXA 4V2MA 17GSA 3ME7A 4ZXGA 3P2AA 2H75A 1TK0B 1PL2A 1UN2A 3FZAA 4F0CA 3M3MA 2OJLA 4L0UA 5HR1A 4GQFA 3GH9A 2YWMA 1XPVA 2FWHA 1SK2A 1YF1A 2V32A 3FR3A 1A2MA 1AQXA 4EUYA 5ECNB 2KHPA 4Z7XA 1AAZA 3RHCA 2QGVA 2GTUA 4MH2A 1ZL9A 4IJIA 5DAKA 1AIUA 2C3QA 5JWQB 5HFIA 2K8VA 1NSWA 1K3YA 2KP1A 5D9TA 3F4TA 2E0QA 3APQA 1WOUA 2H6ZA 6GSXA 3JCML 1GL8A 19GSA 3VK9A 2IMDA 5IOXA 3WGXA 4MF7A 2VD0A 4G2EA 4WR4A 1XFLA 2FNOA 1FVJA 2L4QA 2FGXA 3QD9A 5AN1A 5J9CA 5JCUA 3VLNA 2I81A 2RM6A 4XCSA 1J08A 3KH9A 4MJAA 2F8AA 3HA9A 1GSQA 1XW6A 2YZHA 1DBYA 1GWCA 2YZUA 1A2JA 3ERWA 2PVQA 2LNSA 4HU7A 1YKCA 4DVCA 3HJPA 4MK3A 3QFBC 3D21A 1SD9A 2IN3A 3Q74A 2H66A 4IQ1A 2K8SA 2LRNA 2K18A 3IOSA 1X0RA 5JWOB 2ZNMA 1PX6A 2TRXA 2M80A 3GNJA 3W6GA 4ZBDA 3TKSA 5INYA 2D2ZA 3H79A 3UARA 1O8WA 3LSZA 3GTUA 4XHMA 3LXZA 2IFQA 4ILFA 1G6YA 1EGRA 1F3BA 6GSUA 3EE2A 1O85A 3EWLA 3GKKA 4TOPA 1Z7PA 1PL1A 4K0NA 2LEGA 2L6CA 3TKPA 1TXXA 2ES7A 3WT1A 4WF5A 4GLTA 3FZ9A 1EV4A 5ID2A 4IKHA 4ZB9A 1QUWA 2DJ1A 2N5FA 3MAKA 5D96A 4N0ZA 2L5OA 4MA9A 4ACSA 4E8EA 6GSSA 1A24A 3FR6A 5DVBA 3F6FA 2XPDA 2A4VA 5HFKA 4XRDA 1TJDA 1VRSD 5IMCA 2GQKA 3MWHA 1B48A 3GKMA 5GAPD 2GVPA 3G9BA 4D73A 2H74A 2LRCA 1YY7A 2TRCP 2PPTA 1WMJA 4XS4B 2YP6A 2RM5A 4PQ1A 3LJRA 3GH6A 2HNLA 1OC3A 1DUGA 1ABAA 2DJ0A 4CDOA 3A2XA 1PGTA 4GSSA 1TRWA 5HR3A 4FO5A 1XZOA 2VL9A 4MZCA 4XIHA 2C3TA 6GSVA 1AXDA 3CMIA 3QFAC 2MMOA 5LD0A 1SL2B 1BX9A 4HDEA 3IAM2 4EDZA 3KTLA 3L0HA 3H1NA 4FYUA 3LORA 2GSSA 4LL1B 4XTSA 1K0NA 4PQIA 6GSWA 4ECBA 3NOFA 3UVTA 2C0DA 3GIXA 4TKYA 3ZFLA 1R5AA 3DVXA 3E3EA 2H6XA 3ZIVA 3W8JA 2ON5A 1DSBA 4J57E 4HS1A 2CV4A 2H76A 3IBHA 4O5RA 3U6VA 4Q5NA 3QPMA 3EU4A 3I69A 2LQQA 5ECQB 5IPGA 2DSAA 4TXVA 3EURA 1G6WA 4NHWA 1AQWA 2E2GA 5GSTA 1CQHA 2VD1A 5DDLA 1T00A 2LV3A 1MTCA 3SWLA 5D8IA 2C0EA 5F05A 8GSSA 4HQZA 1F3AA 2NDOA 4OD7A 4KA0A 3FKFA 2E2MA 1SJIA 4Q5FA 4Q5QA 2F8FA 5ELGA 3N5OA 3ZITA 2KP2A 3ZL5A 3GURA 2YN1A 3CSJA 3TJBA 2FLSA 4ZIJA 4NMUA 2EIQA 3RBTA 2LKUA 13GSA 2KLXA 2DMLA 4HZ2A 1X5DA 4I2UA 3DWVA 3CSIA 1USBA 1THOA 4JU5A 1OKDA 4AGSA 1ZMAA 2LJKA 3SBCA 5IOWA 4POLA 1EEJA 2VCQA 1OC8A 1YQ1A 2AB6A 4L5OA 4BPYA 3M0FA 3F3RA 3KEBA 2KOKA 1IYIA 3MSZA 2C0GA 4PNFA 1B9XC 2GQMA 3Q18A 4ZILA 4EVMA 1UA5A 4ML6A 1XWCA 12GSA 2O7KA 3TJJA 2V2GA 3A2WA 2OBIA 4NHZA 2C1YA 3KTBA 1AUCA 5E59A 3ZRDA 1RW1A 2JU5A 5HFGA 2VLUA 2A2RA 4G10A 3BJ5A 5ECMB 4FYCA 5ECIB 4ZL8A 4TR1A 2RIIA 1GLQA 3C1SA 3EMPA 3KH7A 1NHYA 3FHKA 4YQMA 4GSNA 4N10A 4TXOA 2OE1A 1CQGA 1K0BA 2LS5A 3M9JA 4ULXA 4JE1A 5CNWA 5LNKe 1NW2A 2CVDA 2C4JA 2M46A 2PWJA 1K3OA 2HSYA 2G2QA 4HEA2 2V1MA 3UJ1A 1A8LA 1GNWA 1YF0A 4LMWA 1RQMA 2JZRA 2IMIA 2FA8A 5JCGA 2DIYA 4BL7A 3LQ7A 1K0DA 2P5QA 1VF1A 4I6XA 1NHOA 2HZEA 1U88A 2H73A 1TTZA 4L5LA 4EXJA 3RHBA 5CRWA 3VWUA 3A2VA 2CZ3A 3CYNA 2HRNA 3L4NA 1J9BA 1TKDB 5COHA 3IHQA 1ZZYA 1QGVA 5B7CA 5F07A 4K8MA 5IMVA 2H0GA 4IVFA 2XBIA 3R2QA 3TCOA 3A5WA 5JWRB 2GZPA 4I5QA 4MDCA 1URMA 1ZCPA 4KDYA 3VWXA 4GQCA 1QXHA 1GULA 2XPEA 3EINA 3TDGA 2L6DA 1PMTA 1SKSB 1F2EA 2VL2C 1QMVA 4ECIA 3IDVA 1F9MA 4DSRA 2FA4A 1LBKA 4MJCA 1JZRA 3GMFA 1FHEA 3O3TA 2BMXA 3DXBA 3VFIA 2DIZA 4KCEA 2BJXA 5D93A 1SKWB 1YEXA 1V9WA 1GUKA 2PBJA 4F9ZA 1OKTA 2AV4A 1S3DA 2WB9A 5F0GA 2RUEA 2LTKA 3IV4A 1FB0A 3GL3A 4G9HA 4KSMA 1GLPA 5AIVA 3H4KA 1WJKA 4KH7A 2CAQA 1Q98A 3CRTA 2MYGA 1M9AA 4WETA 3F8UA 4POKA 1V58A 3PGTA 4YAPA 4P3YB 5DJMA 4LLRA 1W4VA 1GTAA 4NWYA 5KN0A 1TDIA 2GZYA 5HR2A 4PUAA 3BD2A 4QQ7A 1HNCA 3BBYA 3L78A 1JFUA 2YCDA 1S3CA 2P5RA 2VOCA 4MLYA 1NM3A 1ON4A 1XW9A 5GSSA 2VL3A 5J41A 1T4ZA 1N2AA 1VF2A 2H70A 1Z6MA 2YOIA 2H0IA 3ZYWA 2MMZA 2LRTA 1SKRB 2H01A 2OE3A 1GH2A 4GCIA 2B7KA 2CZ2A 3IAS2 2OADA 2R3XA 2PU9C 1ZOFA 5EPFA 4GRFA 3O6TA 4X1UA 1O6JA 3PINA 5DCGA 2GQLA 2H0HA 1M2DA 3UVHA 4HJ2A 3UL3A 5KN1A 3HD5A 3D22A 2VUPA 2VCZA 2HFDA 2CX3A 3VWVA 5F06A 1G7OA 2YNXA 1JLWA 3TKSC 1G0TA 3APOA 1WIKA 4MABA 4I8BA 4PQHA 3M8NA 1MDJA 1TW9A 1SYRA 4KNDA 4POBA 4PUFC 11GSA 1JZDA 1Z5YE 1R4WA 4F03A 1KTEA 1TU7A 2NTOA 1XIYA 3ERGA 2WS2A 1AC1A 3V1WA 1K0OA 2L57A 3GYKA 4K7IA 1EOGA 1ERUA 3M1GA 2H1AA 1EP8A 2L4CA 1A2LA 1X9MB 2FHEA 4OCEA 2JZTA 4TW5A 3LFLA 1WE0A 2AUVA 4PGTA 4K6XA 4E8HA 9GSSA 2MBSA 1A23A 2B5YA 3OR5A 3QAWA 3C1RA 3WGEA 2WRTA 2X8CA 2PUKC 3KMNA 4MCUA 4XS1A 2J9HA 2XC2A 4F2IA 5CRHA 3FRCA 1E2YA 3LYKA 2WGRA 3UIWA 4KUNA 1LJRA 3TOTA 5J4UA 1MDIA 4OFTA 3M9KA 18GSA 3F9UA 2LQOA 3NZNA 3IE3A 1T3BA 5DALB 3WGDA 4KB3A 2VO4A 2DJ2A 2QSIA 3BCKA 5B8BA 4HOJA 3QAVA 3AY8A 4NV2A 2IMKA 1O8XA 3P8WA 5EL8A 3KP8A 1PSQA 2R5GA 2TIRA 3IR4A 4IHUA 1O73A 4NPBA 2IIYA 3GFKA 4V1Ap 1WPIA 3HJOA 4MP4A 4TXOB 2MMNA 5CYYA 2FUG2 2N5AA 2NBSA 1K3LA 4IGJA 2YWIA 2HT9A 4POMA 4HI7A 2X64A 5FT3A 2K9FA 3D4TA 2P0GA 2L59A 3Q19A 2H1DA 1XWKA 2PVOC 2H72A 2C80A 2WDUA 3TJGA 1EEMA 1U3AA 1PX7A 1MD3A 1XCCA 3QOUA 4CHSA 1W89A 2HZFA 4K9ZA 3HZ8A 3F3QA 3HVXA 2GDRA 3VI7A 2DJ3A 1PKWA 3KP9A 5HQPA 1M99A 2Z9SA 4IS0A 1K0AA 3F4SA 5G1KA 5JCWA 5ECLB 4RUVA 5KN2A 1HYUA 4N0VA 3APSA 3GRXA 1T7PB 3QR6A 3HZ4A 1FW1A 4EC0A 3QMXA 5HR0A 4KW6A 4RQXA 3HVSA 1F6MC 2B5XA 3ERFA 2X8GA 2XBQA 2OKAA 5ECHB 5DQSA 2E7PA 2LNTA 3I9V2 3UBKA 1PD21 2B7JA 1TI1A 3DMLA 1OC9A 3F0IA 3TRPA 4V2LA 3ZMKA 4MH3A 4PXOA 3PH9A 1U3IA 3IC4A 1ERVA 3C7MA 3FW2A 3C71A 4WBRD 4DSQA 2X8HA 4G19A 2P31A 2KUCA 1XW5A 1B4QA 3TOUA 4JRRA 4EE0A 2H71A 1BG5A 1BYEA 4L8EA 2V6OA 2PGTA 1U6TA 4MJBA 2I3YA 4BWQA 3S9FA 1KBNA 1TOFA 3LGCA 2MZCA 2HXKA 5IMAA 1H4OA 2IMEA 2DLXA 1FO5A 2H19A 4RI7A 4IW9A 3H93A 3RPPA 4BVXA 1HNBA 4RI6A 4KDXA 4AJ8A 1TU8A 4TN8A 1MEKA 3LG6A 3ED3A 3F4RA 4ECCA 3UEMA 3L9UA 3DD3A 4OCFA 3TKSE 5CAXA 5A4UA 4KCAA 5DJLA 4MPGA 3EYTA 2R6KA 3RDWA 1QFNA 5DAKB 1R26A 2AHEA 4XS4A 3F6DA 4KAEA 2V6KA 4JZQA 3H8QA 4FYBA 2O89A 4MF6A 1Z3EA 4YH2A 3D4MA 1V40A 5G30A 3VURA 4WBJA 5H5QA 1EOHA 1R7HA 1ML6A 4J2FA 5IQYA 1SL0B 4TVEA 2YV7A 5AISA 1QQ2A 4IJ3A 1JZWA 2JSZA 5CRGA 1EZKA 2FY6A 3KIJA 2EC4A 2CX4A 2IMFA 3W8SA 3HVVA 1BJXA 4EF0A 4XRAA 3HDCA 5D9VA 1ACVA 2YWOA 4WF4A 1GNEA 14GSA 2WZ9A 3GSSA 4NXIA 2AJQB 3FZ4A 3CTGA 3HY2A 3UOMA 2R4VA 4IQAA 5KEJA 1XWBA 1GUHA 1WWJA 16GSA 1Z7RA 2GSTA 5IO2A 1TP9A 4HUAA 1GSDA 1XVQA 2HRFA 4FH8A 3WT2A 2RLIA 3GKNA 4QL9A 1Z9HA 2GLRA 2ZCTA 4I97A 1SK0A 3D0ZA 2VIMA 1RK4A 4MZBA 3TJFA 3GTUB 1B8XA 2WCIA 5IMZA 2IFQB 4O7HA 2I9HA 4MJEA 4EDYA 1IYHA 3RPNA 1XWGA 5DCHA 2H1GA 3DRNA 4K2DA 4QL7A 2OACA 2G0FA 5DQYA 4KX4A 2IPAA 2JL4A 3ZFBA 4I2TA 1THXA 4ISDA 2R2JA 1Q4JA 3CXGA 3LXTA 4FIWA 5G1LA 5ID2B 1ILOA 2H1BA 4ECJA 1ZYQB 2VLVA 5J9BA 5FWGA 5IM9A 3IXRA 3HCZA 3KZQA 2AAWA 3L9SA 3E9JB 3GKXA 4ZBBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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2M80A

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sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations