3A2WA

Peroxiredoxin (c50s) from aeropytum pernix k1 (peroxide-bound form)
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
244
structure length
244
Chain Sequence
PGSIPLIGERFPEMEVTTDHGVIKLPDHYVSQGKWFVLFSHPADFTPVSTTEFVSFARRYEDFQRLGVDLIGLSVDSVFSHIKWKEWIERHIGVRIPFPIIADPQGTVARRLGLLHAESATHTVRGVFIVDARGVIRTMLYYPMELGRLVDEILRIVKALKLGDSLKRAVPADWPNNEIIGEGLIVPPPTTEDQARARMESGQYRCLDWWFCWDTPASRDDVEEARRYLRRAAEKPAKLLYEEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Probable peroxiredoxin
publication title Crystal structure of peroxiredoxin from Aeropyrum pernix K1 complexed with its substrate, hydrogen peroxide
pubmed doi rcsb
source organism Aeropyrum pernix
molecule tags Oxidoreductase
total genus 76
structure length 244
sequence length 244
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 3a2wA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3a2wA01
2CA8A 2NBSA 4F0CA 1TDIA 2H76A 3CTFA 4RI7A 2X64A 1TI3A 4GQCA 1A24A 1DUGA 2MMNA 1SD8A 4YQVA 1GSDA 3UARA 1A0RP 4AF2A 4N0ZA 1JZDA 1PX7A 3SBCA 3FZ5A 1Y6EA 2YV9A 3LYPA 1K0AA 4XRDA 1U3AA 4G10A 3CRUA 3WGDA 5GZZB 5ECNB 2VCXA 1XCCA 2H73A 3UVHA 4XS4B 4YQUA 1TI1A 1T4ZA 3BOAA 3CRTA 1X5CA 4TXOA 2LRCA 1Z6MA 2OACA 4GRFA 3GH9A 2ALBA 2V41A 4TOPA 1FB0A 3WYWA 1QQ2A 5B8BA 1YF1A 2YCDA 1UA5A 4MCUA 2I3YA 1XWBA 4K1FA 1U87A 4IS0A 2B7JA 6GSWA 2ES7A 3LFLA 5KN3A 1M7TA 3TUEA 4QQ7A 1HNAA 3F4TA 2GT6A 2YWIA 3HVSA 6GSSA 3P90A 5HFIA 5DQYA 3KEBA 1V57A 3I69A 2EIRA 1OC9A 4NXIA 5DBQA 2O8VB 5INYA 1Z9HA 4D73A 2HE3A 4Q5NA 3LEFA 5B6MA 3RHCA 4YH2A 3GL3A 1EGOA 2JL4A 3DRNA 2JU5A 3GKKA 2XBIA 5CRDA 1X5DA 2LQOA 2F8AA 4ULXA 3LQ7A 2TIRA 4KB3A 2H0IA 5F05A 2GTUA 5JCGA 3KTBA 3QPMA 1XBSA 3QFAC 1QFNA 3JCML 2LJKA 1EZKA 2MMAA 2C3TA 4MP4A 4V2MA 3D21A 1PRXA 3HA9A 4I97A 2N5FA 4EDZA 4LL4B 3TRQA 2M46A 4HEA2 1FOVA 3DXBA 4O32A 2VD1A 3VPTA 2J23A 3Q6OA 5E4WA 5B7CA 1GSEA 1XW9A 4OO5A 1GUMA 1MDIA 2HZEB 2M72A 5ID2A 3FR9A 2FUG2 1FAAA 4PUFC 3EU3A 3PH9A 2IMDA 4ECIA 1TOFA 3H79A 5H5SA 2AYTA 2I9HA 5D9VA 3W6GA 4DVCA 3HY2A 2RM6A 3TJFA 3LJRA 4FYBA 2VO4A 2LKUA 4Z7XA 1Z7PA 2RUEA 2LRTA 3GMFA 2ZCTA 3ZYWA 1WE0A 2PN8A 2O87A 3TKSE 1K3LA 3PR8A 3M9JA 2R37A 3ZLPA 2VL2C 2YN1A 1E6BA 3WT2A 5IIZA 1OVNA 1WP0A 2HSHA 1W4VA 2GS3A 4IVFA 3ZIJA 3EC3A 3QMXA 3ZFBA 4IELA 2YWMA 4PNFA 3HZ8A 3M0FA 2DMMA 1CQHA 2BMXA 1TK8B 3WGXA 5KEJA 3CSJA 2AAWA 4PUAA 5C04A 2HI7A 3NIVA 3I6AA 3K8NA 2E2GA 3EVIA 3M3MA 3UJ1A 5IO0A 5ELAA 4P3YB 1O8XA 4N10A 2FD3A 2H74A 4JE1A 4EVMA 1J08A 3C7MA 5ECOB 4K9ZA 2YNXA 3DVXA 2FWEA 2IMKA 4I8BA 5IMVA 4BVXA 3HDCA 2MMZA 1BYEA 1SU9A 3DKSA 3RPNA 1YDKA 3TKQA 1E2YA 2R2JA 3UOMA 3KM6A 2IMEA 2P0GA 3DGQA 1GUHA 4EUYA 3TGZA 4Q5QA 1SL2B 2IFQB 5DCHA 1O85A 3ZVJA 2H8LA 2YZHA 4V2NA 5IPGA 1J0FA 1WWJA 3UVTA 1GNWA 2EC4A 3KMNA 3F63A 3L0HA 4FO5A 4BPYA 1B48A 1NSWA 4IKHA 5CRHA 2DJ0A 3FR3A 2O7KA 1EV4A 1K3OA 4G9HA 3LG6A 2KUCA 3M9KA 4BA7A 1Q98A 1PX6A 4F9ZA 2KP1A 2VAFA 5DCGA 3CBUA 4L5OA 5AIVA 1Z3EA 3E3EA 3IC4A 4H86A 4IW9A 3F0IA 3HJMA 5IO2A 5LCZA 5HR2A 4FH8A 2XPDA 4WF4A 3KIJA 5A5KA 4G2EA 1EWXA 1AIUA 5J4UA 4IJIA 1V2AA 3SWLA 2RM5A 2V2GA 1THXA 3F6DA 3E0UA 4YAVA 2GDRA 1S3AA 2H6ZA 4E8HA 2R4VA 3DWVA 5CYYA 1ILOA 3IPZA 3BD2A 4NPBA 2GVPA 1DE2A 4DSSB 2ZUPA 1HD2A 5A4UA 4XCSA 1DSBA 3KZQA 4TR1A 11GSA 2B1LA 2B5EA 4ZL7A 1SJIA 2JACA 1USBA 1K3YA 2OA7A 5EPFA 1TRUA 1YZXA 4IJ3A 3GH6A 4KDUA 3IE3A 1RW1A 1Q4JA 3ZITA 1JLVA 2B5XA 5CO3A 1ZOFA 1WPIA 5FHIA 1QGVA 1XWCA 1VF2A 1SL1B 1M0UA 3VI5A 3FKFA 1XIYA 4GCIA 4HJ2A 5KN2A 1G6WA 2WDUA 4WXTA 2L4QA 5EY6A 3J7Yb 4ID0A 3GKNA 3HJOA 3P2AA 4IQ1A 1YQ1A 1YY7A 4MF5A 4MLYA 2I4AA 5DVBA 1JHBA 1K0DA 2MYGA 5AISA 5J5NA 1T00A 4TR3A 1GWCA 2VUPA 3IK7A 3D4TA 2K9FA 1TP9A 2REMA 5J9BA 4XTSA 3VWWA 1EP8A 2LSTA 4ML1A 1WJKA 4GQFA 1TU8A 4BWQA 4IBPA 1OE8A 1U3IA 4NV5A 4L5LA 4KSOA 3QCPA 4AJ8A 3GIXA 3IDVA 5DAKB 1TW9A 1GLPA 2X8CA 3LXZA 4MF6A 4HQSA 1ZZYA 3RBTA 2TRXA 3DIEA 3V1WA 1VF4A 1TRWA 3EU4A 2HYXA 2MZCA 1G7EA 3FW2A 2VIMA 2YANA 3IBHA 2DSAA 3F4RA 2H6YA 2OBIA 2LRNA 3ISOA 4K7IA 1PA3A 2QC7A 3GTUB 5JCWA 3IR4A 2H1GA 5HFGA 1AW9A 3TJKA 2C0GA 4MPGA 2YJHA 12GSA 3WD6A 4N0VA 1I9DA 1K0OA 3TRPA 3VWVA 2WZ9A 3GYKA 4XIHA 2IJYA 1PSQA 3TKPA 4PQHA 3F6FA 4EE0A 1LBKA 4IP1A 2NVLA 1H4OA 2HSYA 1B4QA 2MMOA 3QAGA 3UEMA 2C1YA 3HHVA 18GSA 4GSTA 2NPBA 4PQIA 5ECQB 3J7Yk 2L4CA 2DIYA 3TDGA 2JSYA 3ZMLA 5ECHB 3VPQA 3F3QA 2VCQA 5ABRA 2KLXA 4KAEA 3KH9A 1M99A 5ECKB 2RUFA 4ACSA 1J9BA 4ZL8A 1OAZA 1GNEA 4ZB6A 2H0GA 4N30A 2YWNA 4LA1A 1N8JA 2OE0A 4I2UA 1O8WA 1ZGNA 5F0GA 5GAND 1O6JA 4TW5A 4Q5RA 4KDYA 4FYUA 6GSVA 3TJJA 1TRSA 1QUWA 1V9WA 4KH7A 1TTZA 4L8EA 3RHBA 1H75A 1XXUA 1M2AA 5JWRB 3WGEA 3ZVJD 1T1VA 2B1KA 2CQ9A 1AXDA 3N5OA 3U5RE 2B5YA 2MBSA 1XW5A 2VL9A 3VFIA 1AQWA 1HNCA 3IRAA 3EWLA 2CX3A 4N11A 2V6KA 1ZYEA 10GSA 5FT3A 5KN0A 1F9MA 2YPMA 1GSUA 1ABAA 2PBJA 2V32A 3FR6A 2XHFA 4O92A 4AGSA 4AJ6A 3CXGA 4V1Ap 2VM1A 3IAS2 3UBLA 4MA9A 2CAIA 2R5GA 2WB9A 1EV9A 1SK1A 5DQSA 4V1Ag 5H5RA 2OBKA 4JRRA 5G31A 2C8UA 4HQZA 2F51A 3FZ9A 2QSIA 4BWSA 3Q74A 20GSA 3KP9A 3GRXA 3APQA 3Q18A 1XVWA 1TRVA 2L6DA 3QD9A 4G19A 5LNKe 2JADA 3ZMKA 1JZOA 22GSA 2PGTA 1GUKA 3APOA 1U6TA 2OJLA 1UVZA 2E0QA 5FWGA 1B4PA 2AV4A 3ZTLA 1SL0B 4OD7A 2H30A 2Z9SA 2G0FA 3QFBC 3PINA 4RQXA 5ECPB 5A4VA 3HVXA 5IPHA 5DJMA 4PNGA 4OFTA 1XOAA 2L6CA 4J56E 6GSYA 5G1KA 4JZQA 4QL7A 2B3SA 3VWUA 2GSRA 1K0BA 4HZ2A 3FK8A 1AAZA 5F07A 2GSQA 5JWOB 3KD0A 4LL1B 2PWJA 2FGXA 1GSQA 3O3TA 1SJ6A 4KW6A 4ZIJA 3DMLA 1UC7A 3KXOA 1THOA 1A8YA 3VWXA 2IPAA 1R4WA 1GL8A 6GSTA 1JLWA 3A2VA 2H19A 4WETA 1SD9A 1EOGA 2CVKA 1BG5A 2E7PA 1ERVA 2F8FA 2N5BA 3N9JA 4GXZA 2L57A 1FVKA 1GTUA 4JR6A 3L78A 1PL2A 3QAWA 3EMXA 3P8WA 1BJXA 4F82A 2IWTA 2PPTA 1A2JA 4POBA 3HCZA 3HJPA 2FHEA 2VOCA 2AJQB 5DALB 4IHUA 4OCEA 3ZFLA 3CMIA 4OWYA 4XS4A 1A8LA 2G2QA 3ZZXA 3EE2A 5LD0A 3D6IA 3HD5A 4JU5A 4KX4A 4HZ4A 4WKWA 2VCZA 4HI7A 2H75A 1FG4A 2CT6A 1PD21 1VF3A 3KP8A 2CV4A 2WJUA 4V2LA 1ACVA 3TKSC 4EXJA 3VLNA 3IXRA 3D4MA 1PKZA 1OKTA 4ZL9A 3LGCA 1GULA 4LMVA 1B9XC 5ECSA 3H1NA 4XRAA 2VL2A 2C3QA 4BVYA 2IIYA 4GLTA 5ECLB 4MABA 3Q19A 3G9BA 4KGIA 4KUNA 3RAZA 1SKWB 3EINA 2P5RA 3H93A 4ZBAA 1XW6A 3RPPA 2ON5A 3NZNA 3CSHA 1T3BA 3O76A 3MNGA 4OFNA 1HYUA 4TR0A 2DJ2A 1TK0B 2H70A 1ZYQB 3IAM2 1UN2A 4HU7A 2YP6A 2JZRA 4YAPA 1K0MA 3GKMA 2EIQA 4POKA 3FZAA 1K0NA 2XC2A 1NW2A 4J2FA 4YQMA 4TXOB 2HXKA 1C72A 3GA4A 1F2EA 3FYGA 1T8EB 1A2LA 2O89A 3I43A 1GTIA 1MTCA 3A5WA 2H72A 5GSTA 1GTBA 1JFUA 2O85A 3IHQA 1GH2A 3F4SA 1X0RA 3RDWA 3FZ4A 4DSRA 4HS1A 3ERGA 4MMMA 1RQMA 2WGRA 3FRCA 1WMJA 2GZYA 1ZCPA 2IN3A 1ERTA 2HZEA 2LNSA 4TRXA 2AHEA 2LNTA 2H01A 2VLVA 1AQXA 2WULA 5F06A 2GT5A 3QDNA 5B6NA 1NM3A 3IA1A 4O5RA 3DVWA 1OC9B 1GTAA 4WEYA 13GSA 5CP1A 4GSNA 3ME8A 2IMIA 4D73B 2HFDA 1R5AA 3LORA 5EVOA 2FWGA 1XWAA 3QAVA 1TK5B 4PX1A 3W8JA 3MWHA 4MZWA 4KDXA 2DJ1A 1YKAA 4BL7A 1M9BA 14GSA 2C0DA 5ECIB 4TN8A 1BAYA 4OMVA 2EIOA 2HLSA 1VGLA 4ECCA 4L0WA 2PVOC 1S3DA 2VCTA 4I5QA 1Y25A 1EOHA 4ZB9A 2H0HA 4GWRA 5L71A 2K6VA 3L9SA 2JZSA 2HZFA 1AUCA 5D93A 1MDJA 2GQMA 1K0CA 4MF7A 2JZTA 19GSA 3G7YA 4MK3A 3UL3A 4EL1A 1DE1A 2KHPA 5E59A 3KJYA 5ID2B 2OADA 2FCHA 4KE3A 5D73A 4NWYA 2HRFA 2H66A 1TKDB 3MDKA 5ELGA 3IV4A 2A4VA 3ME7A 4OO4A 1YJ6A 2LJAA 3EMPA 5GAPD 1S3CA 2DBCA 2F9SA 5JCUA 2XBQA 4ECBA 3MSZA 2LEGA 5C00A 3C71A 1V40A 1DBYA 2VLUA 2IL3A 3DYRA 2H1AA 2DIZA 1PN9A 4GSSA 3CTGA 2IFQA 5A4WA 1GSYA 1O73A 1SENA 4OCFA 2WCIA 2LTKA 3HYPA 3EURA 4MPFA 1SJZA 5CRGA 2CVBA 3L4NA 4K6XA 2JSZA 4OFMA 4KA0A 1Z6NA 1AQVA 1YEPA 4KCEA 5HFKA 4HU9A 4ZILA 3ZRDA 4I6XA 2K8SA 2XPEA 4ZBBA 3IK9A 1SYXA 2A2RA 1JZWA 1BQ7A 3P7XA 4I2TA 2DJJA 2H1DA 4WR4A 1PQNA 2WRTA 2OE3A 4CDOA 4PQ1A 2N5AA 17GSA 4PURA 5G30A 1FO5A 5F8BA 2FNOA 2FY6A 2CZ2A 2NTOA 1IYHA 3C1SA 5HR1A 3UAPA 1VRSD 6GSXA 3UIWA 1XVQA 1BEDA 2GLRA 3DD3A 3LYKA 4EC0A 5G5FA 2PVQA 4K0NA 5CAXA 2AB6A 4DSSA 5HR0A 1T4YA 5IMCA 3WT1A 1M2BA 4JEDA 1QK8A 3M8NA 4MJAA 4MJBA 3KCMA 4K7NA 1KTEA 3VI7A 2GQKA 1WRYA 2NDOA 5H5QA 3BCIA 1V98A 3IOSA 2C80A 3A2WA 1LJRA 2GGTA 4PGTA 1OKDA 1N2AA 1FB6A 1G0TA 1HQOA 2PMTA 1B9YC 4POLA 1PKWA 3KGKA 1XFLA 2CX4A 3BCKA 3CYNA 1GLQA 4EKZA 1TJDA 2VM2A 4LMWA 2AUVA 2CZ3A 2BJXA 3L9VA 3FEUA 2L59A 5IOXA 5D9XA 1A0FA 1AC1A 3G7IA 2C0EA 2K18A 2KP2A 1F3AA 5KN1A 3GSSA 4LLRA 4WF5A 1LU4A 1IYIA 4TVEA 3ERFA 2H71A 3LWAA 5J9CA 1URMA 2V6OA 1F3BA 4TR1B 1F37A 1ON4A 3TB2A 2GSSA 3I9V2 1XOBA 1V58A 5DAKA 9GSSA 2FWHA 2DJ3A 1MEKA 1KBNA 3O6TA 4KNDA 1XPVA 4K7OA 2CAQA 1YEXA 4F2IA 6GSUA 1XWGA 2YV7A 1T7PB 2YZUA 3FY7A 7GSSA 2YWOA 3G7JA 3HVVA 3D22A 1X9MB 4NAXA 1NHOA 3US3A 3CSIA 2GQLA 1KEBA 3D0ZA 4MH2A 2LS5A 2MBTA 3GTUA 4K0GA 3ZIVA 1SK0A 3GUSA 4CHSA 2OKAA 2TRCP 3L9UA 1R5PA 2WFCA 1U88A 3TJBA 2I1UA 3ZREA 3ED3A 3W8SA 2HRNA 4HUAA 4EF0A 4IP6A 4EDYA 1PGTA 4ECJA 2VD0A 3C73A 3PGTA 2QGVA 3M1GA 4E8EA 4HDEA 2GZPA 3R2QA 2X8HA 2HT9A 4MZCA 1FW1A 4TKYA 3MAKA 5JWQB 2FWFA 2LV3A 4MDCA 3GURA 4WR5A 1O81A 2B6MA 4MZBA 5HR3A 5G5EA 5D8IA 5ECMB 2VCVA 3TOTA 5IQYA 1OE7A 1XZOA 3HXSA 2A2SA 4K2DA 2L5LA 2C3NA 8GSSA 4X43A 4NV2A 1Z7RA 5J41A 1MD3A 1PMTA 16GSA 1KNGA 4GF0A 2R6KA 4TR4A 2GZZA 1ZL9A 2QKEA 5COHA 5IMFA 4AJ7A 2IMFA 1ZMAA 2RIIA 4RUVA 3GNJA 3TRXA 2VLTA 3FHKA 3KMOA 1CQGA 4DEJA 4DSQA 2YOIA 3H8QA 1R26A 1X9WB 1YKCA 4K8MA 2X99A 1ST9A 2P31A 3C8EA 4QL9A 5D9WA 3EYTA 5IM9A 2K8VA 3E9JB 3TKRA 3A2XA 1PL1A 5DJLA 2PU9C 1YF0A 5DDLA 4IQAA 3C1RA 2PERA 1HNBA 2P5QA 1GP1A 2OE1A 3AY8A 1FHEA 4Q5FA 1OYJA 3VURA 2YJ7A 3HKRA 1OC3A 1GSFA 1EEJA 1OC8A 1A23A 1EGRA 2DJKA 1SKRB 3ERWA 4POMA 4MH3A 2H1BA 3DEXA 5D9TA 4ZXGA 1JZRA 1TU7A 3TOUA 4TXVA 4CW9A 2BTOT 4HOJA 2GSTA 5ECRB 1ML6A 3GV1A 3H4KA 3TJGA 2F3MA 2FLSA 5ENUA 5AN1A 2PUKC 4IGJA 1Z5YE 4ZB8A 5CREA 5CRWA 3D5JA 1W89A 3TKSA 1EEMA 3GFKA 4L0UA 1A2MA 5CNWA 2M80A 1G6YA 5GSSA 2VL3A 2B7KA 4WBJA 4EO3A 4GTUA 4KSMA 2KOKA 4ILFA 4PXOA 1SKSB 4F0BA 1QMVA 3F3RA 2ZNMA 2LQQA 3APSA 4NMUA 1TXXA 3QR6A 4JR4A 4MJEA 4RQRA 3BBYA 2HNLA 4MJCA 5B8AA 1R7HA 5IMZA 3NOFA 3QOUA 2LJRA 3A3TA 3HZ4A 4XS6A 1I5GA 2LUSA 4X0XA 1BX9A 3TCOA 5D96A 1GSSA 4XHMA 2H6XA 2ON7A 3UMAA 5G1LA 3ZL5A 1MD4A 3KH7A 1XWKA 1ERWA 5EL8A 5IMDA 5HQPA 1MDKA 1EP7A 2FA4A 3GN3A 2V1MA 4JBBA 1SK2A 2L5OA 1GRXA 1SYRA 3F8UA 4F03A 2J9HA 2E2MA 1G7OA 3S9FA 3VK9A 2CVDA 2WS2A 4NHWA 4ISDA 2FA8A 2C0FA 4X1UA 4IN0A 4KCAA 4RI6A 3UBKA 1F6MC 5J3RA 2I81A 2X8GA 4O7HA 2VCWA 4XS1A 5IMAA 1RK4A 4ZBDA 3GX0A 3LSZA 1VF1A 3GL5A 1QXHA 5DALA 2DMLA 1M2DA 3BJ5A 3GX8A 2D2ZA 3GSTA 1WOUA 3GHAA 3KTLA 5AGYA 5IOWA 1WIKA 1X9SB 5AIXA 4FIWA 1B8XA 4NHZA 2C4JA 4HJMA 3LXTA 4J57E 1M9AA 3OR5A 2RLIA 4ML6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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