3A2WA

Peroxiredoxin (c50s) from aeropytum pernix k1 (peroxide-bound form)
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
244
structure length
244
Chain Sequence
PGSIPLIGERFPEMEVTTDHGVIKLPDHYVSQGKWFVLFSHPADFTPVSTTEFVSFARRYEDFQRLGVDLIGLSVDSVFSHIKWKEWIERHIGVRIPFPIIADPQGTVARRLGLLHAESATHTVRGVFIVDARGVIRTMLYYPMELGRLVDEILRIVKALKLGDSLKRAVPADWPNNEIIGEGLIVPPPTTEDQARARMESGQYRCLDWWFCWDTPASRDDVEEARRYLRRAAEKPAKLLYEEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of peroxiredoxin from Aeropyrum pernix K1 complexed with its substrate, hydrogen peroxide
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable peroxiredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Aeropyrum pernix
total genus 76
structure length 244
sequence length 244
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 3a2wA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3a2wA01
4F82A 3E3EA 3W8SA 5D93A 2O85A 1R4WA 1UN2A 2LNTA 3M0FA 2JADA 3KH9A 2VD1A 3LXTA 3HA9A 1M9AA 1JZWA 4BL7A 5J9CA 1O73A 1VF2A 2H0HA 1K0AA 2H6ZA 4YQVA 2HI7A 1B48A 2I9HA 5GZZB 2VL9A 4LA1A 4PGTA 3HY2A 1NW2A 3IAM2 1X5DA 1XWGA 2I81A 2PGTA 3Q18A 1TI3A 2RM5A 3KD0A 1U3AA 4HQSA 2OE1A 2L4QA 5DALB 2O87A 3GHAA 1TXXA 4P3YB 4EC0A 1K0CA 2DC5A 3FHKA 2H30A 1PX6A 4ECJA 4F03A 1A8LA 1GSEA 4MJAA 3W8JA 4AF2A 3VWVA 3VFIA 3PH9A 1Z6MA 2HFDA 2MZCA 5HFKA 2EIQA 4NV2A 4OFTA 1ZOFA 2VOCA 1BX9A 3F4RA 2X8HA 4TW5A 5IMFA 4ZBAA 4NHWA 4GXZA 2LUSA 1W89A 3QD9A 4F0BA 1VRSD 4JBBA 1SK0A 5B7CA 3DMLA 4PNGA 2VO4A 3G7YA 5INYA 3GKMA 5ECIB 5ELGA 1B9YC 2TRCP 4TN8A 1S3DA 2JACA 2OE0A 4PNFA 1PKZA 3VI5A 3G7IA 1T7PB 2YWNA 1SK2A 1RW1A 4V1Ap 2F8FA 5COHA 5IMDA 1EP8A 3KXOA 3GKKA 4EO3A 4KAEA 2IIYA 4V2LA 4OFMA 1TRSA 1F6MC 1SYRA 2LQOA 5D9XA 2E7PA 4FYBA 1VGLA 5HR0A 4DEJA 5J3RA 3US3A 3CSJA 3DD3A 2GSQA 1VF3A 1F3AA 2L59A 3F3QA 3J7Yk 4V1Ag 2CV4A 3EWLA 4HOJA 2BTOT 4J56E 1GNEA 2H19A 1XWKA 4V2MA 3C1SA 3TKPA 3QCPA 1WRYA 3P90A 1EZKA 1G6WA 3LJRA 1N2AA 5D96A 3P7XA 2GQLA 1FG4A 3ERFA 4WKWA 3SWLA 2EIRA 3GSTA 2E0QA 1HD2A 3NZNA 2PBJA 4F0CA 3GRXA 4EDYA 2AHEA 4Q5QA 1AC1A 2VL2C 5IMAA 3M8NA 1A2LA 1R7HA 3I9V2 2WB9A 1G6YA 4N10A 4CW9A 1YKCA 2J23A 5IPGA 1AQWA 5ECHB 3GV1A 4J57E 1TJDA 1PKWA 1Z3EA 5G1KA 5E59A 1Z9HA 3GTUA 1GUKA 1S3CA 3CTGA 1PL1A 1TDIA 1T00A 2O7KA 3KGKA 2ALBA 2FY6A 1ACVA 3Q19A 4YAPA 2GGTA 1ZZYA 3UIWA 2MMZA 4GSTA 4ULXA 1PRXA 1O85A 2QSIA 1H75A 4I5QA 2V41A 2H70A 2DMLA 4GF0A 3D4MA 1HNBA 2MBSA 2IJYA 1MEKA 1B8XA 2FNOA 3HJMA 3TRQA 3F4SA 1K3LA 2K8SA 5HR1A 1AXDA 4RQXA 2B6MA 1LU4A 1XZOA 2CZ3A 5ECOB 3O6TA 2PERA 2OA7A 3J7Yb 16GSA 2LNSA 1K3YA 4N0VA 4MDCA 4YAVA 2R37A 3HDCA 3TKSC 1ABAA 1LBKA 4K0NA 3FR9A 3EC3A 2VM1A 5HFGA 4RQRA 4POKA 1MDIA 3KMOA 4BA7A 2HZEA 2R5GA 3MNGA 1WMJA 3GTUB 3TOTA 3OR5A 2ON5A 2X99A 1KTEA 4OWYA 5F8BA 3F9UA 1TK8B 2NPBA 5C00A 4WR4A 1TRVA 1ERUA 1V57A 5DBQA 3ZIJA 2IMDA 3A2XA 4EL1A 5J41A 1O6JA 4OO5A 22GSA 4EF0A 3GYKA 2IFQA 3D22A 3E9JB 3DYRA 4YQMA 4EDZA 2HRFA 2PU9C 3ZL5A 2K8VA 3HHVA 3G7JA 2FA8A 4OMVA 3D21A 5ELAA 2MYGA 3A3TA 3UVTA 2CVKA 1T3BA 3KP9A 2DJKA 2IN3A 4Z7XA 3QR6A 4IQ1A 5DVBA 1MD3A 1O81A 1OAZA 1SD9A 2CZ2A 3UL3A 4MMMA 5H5RA 2IMFA 2V6KA 2WZ9A 5IO0A 3UBLA 2HZEB 1WPIA 2H74A 1JHBA 5HQPA 1FO5A 2I4AA 4HS1A 1V2AA 4ML1A 3FKFA 3IRAA 2LRNA 1FB0A 3L4NA 4NPBA 4I2TA 4BVXA 5ECKB 1ZL9A 2IWTA 3KEBA 4G10A 3K8NA 1IYHA 2VLVA 3ZIVA 4ACSA 3WT1A 2VM2A 3IXRA 4XS4B 1IYIA 3ZREA 4ECBA 5ECPB 3HXSA 3WD6A 2LSTA 5D9TA 4ZL7A 2YV9A 5A4WA 3HVSA 3UARA 3TJJA 1XXUA 3TKQA 1GTUA 2XBIA 4KGIA 2I3YA 3HZ4A 2HSHA 1OE7A 2DJ2A 2KHPA 4GRFA 4NAXA 2H71A 1M7TA 1GUHA 2HNLA 4XRAA 4EUYA 3O3TA 5IPHA 1GL8A 2IMKA 3H8QA 1XWBA 1SL1B 1JZRA 5CP1A 4L5LA 3DKSA 1PD21 1BAYA 4WXTA 4QL9A 4IBPA 2FCHA 2NTOA 2JZRA 3LGCA 2H0IA 2MMAA 3TB2A 1BG5A 1UVZA 5AIVA 1DSBA 4IN0A 1TOFA 1M0UA 4K1FA 2KP1A 4MLYA 1WJKA 3CRTA 2GZZA 5ECNB 3EURA 4PUFC 3V1WA 1GH2A 1C72A 2VCZA 1U88A 2YNXA 4RI7A 5ECRB 5JCGA 2LV3A 4L0UA 1T4YA 1YF0A 3IV4A 1CQHA 2C8UA 4EKZA 2DBCA 3C71A 4X1UA 1FB6A 2AJQB 2H66A 4XS6A 3TRPA 3F6DA 5IOXA 3S9FA 2GS3A 1GTAA 1TRUA 1AW9A 5F06A 3ZMKA 1N8JA 1YKAA 2FWFA 3QAVA 5AISA 3L9UA 1GTIA 2E2GA 4IP1A 3ZVJA 3MWHA 3WGEA 3FRCA 4IVFA 2WULA 4G2EA 1OC3A 1TTZA 2B7JA 4QL7A 1KBNA 1GSUA 4FO5A 5AIXA 3KCMA 5G31A 2N5AA 4GLTA 5CNWA 1V40A 5DQYA 2GT5A 4GTUA 1PGTA 2H0GA 3GX0A 1YEPA 2X8GA 2BMXA 3IPZA 3P8WA 2V6OA 1YZXA 3FY7A 3NIVA 1Q98A 4E8HA 3KIJA 3PR8A 1K0NA 1EGRA 1ZYEA 2YJHA 5JCWA 4L8EA 2G2QA 1B4QA 5G5EA 2QC7A 3GL3A 4POBA 2A2RA 1XVWA 2MMOA 2H76A 1XFLA 3EMPA 1CQGA 1XW9A 5JWRB 2DJ1A 4LL1B 3RHBA 3BJ5A 2C0GA 5IM9A 2CX4A 3EVIA 5DJMA 2KUCA 3A2VA 1K0MA 4GQCA 4DVCA 1DE1A 1GULA 4TR0A 3WGDA 2GT6A 1PX7A 4K7IA 3DVXA 2NDOA 2WS2A 3ISOA 2GSRA 5G5FA 4XS1A 1R5PA 3UJ1A 4D73A 3TUEA 1VF4A 5IMCA 3FZAA 2YANA 4I2UA 4DSQA 2HYXA 3FR3A 3TJKA 2B1LA 4X43A 1XW5A 4GSSA 3VWWA 2DLXA 1HNAA 4ISDA 2OADA 4XHMA 4K7OA 2LJRA 3APOA 5IOWA 1UA5A 4IS0A 1MDKA 2H6YA 1YF1A 1GSFA 2RUFA 4I97A 4MJBA 4IGJA 4NV5A 5B8BA 4OCEA 5LD0A 1O7UA 12GSA 1AQVA 5D9WA 2LKUA 4EXJA 4K6XA 4L0WA 2CX3A 4HZ2A 1TU8A 2V32A 4HU7A 3N5OA 4N11A 1T8EB 4HJMA 2F8AA 2H01A 2HZFA 1JLWA 5ECLB 2LRTA 3WGXA 1THXA 3ME8A 2DJJA 2H72A 2YP6A 4ZXGA 1F3BA 1QGVA 4YH2A 1GWCA 5GSTA 4JU5A 4D73B 4POLA 1TU7A 1XOBA 5G30A 2CVDA 2VLUA 4TRXA 5EPFA 4IW9A 1YJ6A 4E8EA 3CYNA 3TRXA 1GUMA 1OKTA 4ILFA 2P0GA 4TVEA 3EMXA 2XPDA 1XIYA 1TI1A 2OKAA 2HT9A 4ZL9A 3MDKA 1XPVA 4OD7A 3ME7A 2ZNMA 3D6IA 1EV9A 2VL2A 1SJ6A 1OKDA 2HXKA 3TGZA 3KZQA 2NBSA 1B9XC 1E2YA 1YY7A 4ML6A 4KH7A 3DWVA 1QUWA 3LORA 4F2IA 4NXIA 5D8IA 3LYPA 3DEXA 4LMWA 2R2JA 4JZQA 2N5FA 2YN1A 2KOKA 3JCML 3IR4A 5EVOA 2VCTA 3CSHA 2H1BA 3KTLA 3GX8A 2B5YA 2AYTA 4I8BA 4KDXA 3W6GA 1GNWA 4ZIJA 2P5RA 4OCFA 2ON7A 5B6MA 3QPMA 1B4PA 1Y25A 2AUVA 3RDWA 2VUPA 4TR1A 3ED3A 2GZPA 3HVXA 1JZOA 1BJXA 3VLNA 1YEXA 1FW1A 5IQYA 3H4KA 1O8XA 2DIYA 3MSZA 1SL0B 2OBKA 5JWQB 2C0FA 3WT2A 1M2BA 4PQIA 5KN3A 4MZWA 3PGTA 3CXGA 1FAAA 3APQA 3I6AA 3F6FA 4NHZA 1QXHA 3MAKA 1BQ7A 2GSTA 4TR3A 2M72A 2VL3A 4JR4A 4K8MA 1JFUA 4BWSA 2G0FA 2PUKC 4KDUA 2NVLA 2C3TA 2YWOA 1EOHA 5CAXA 4MP4A 5CRDA 3O76A 3TKSA 3DRNA 3HYPA 1GSDA 2GDRA 1FVKA 1GTBA 4FIWA 1Y6EA 1TK5B 2K6VA 5HR2A 1KNGA 3F0IA 4YQUA 3P2AA 4OO4A 4TR1B 4MK3A 4O92A 1SD8A 2XHFA 3VWXA 4XS4A 4KDYA 3TJFA 2C4JA 1EP7A 3TDGA 1QFNA 2JL4A 1F9MA 4WEYA 4K2DA 2PWJA 1U87A 3IC4A 4WR5A 4HQZA 5ECSA 4CHSA 5CYYA 2YJ7A 2GSSA 2O8VB 3M9JA 1PN9A 1V98A 3EU3A 4IQAA 4HJ2A 1SK1A 5FHIA 3RHCA 2E2MA 1OE8A 1V58A 2YWIA 5JWOB 3LYKA 3E0UA 4DSRA 1HNCA 4AJ6A 3VURA 4ECIA 4O7HA 2R3XA 2VLTA 3UVHA 2V1MA 3FZ5A 3IHQA 1AAZA 5F07A 3SBCA 4AJ8A 3WYWA 1OVNA 1GSYA 3IOSA 2X64A 2VCWA 3ZVJD 3F3RA 2MMNA 3FZ4A 4ZBBA 5G2ZA 4EVMA 2H6XA 3RBTA 4I6XA 1ZMAA 2PPTA 5G1LA 3ERWA 3CSIA 1USBA 5A4VA 2OACA 2X8CA 2C3QA 2GQKA 3HKRA 5A4UA 2LQQA 3D5JA 4IKHA 3M3MA 3C8EA 2D2ZA 3TJBA 2CA8A 2VCVA 5HFIA 3VPTA 1TKDB 1X5CA 1DBYA 1R5AA 4PUAA 1ERVA 2XPEA 4TKYA 4ZB8A 3FR6A 1U3IA 2JSYA 1SKSB 3IE3A 2GZYA 2YOIA 2ZUPA 20GSA 4Q5FA 4NWYA 1SENA 2OE3A 1W4VA 3VK9A 2EIOA 3DIEA 4MH2A 1DE2A 2VCQA 4KCEA 3KJYA 5CRWA 2LS5A 1I9DA 2JZTA 5H5SA 5F05A 3EINA 4NMUA 11GSA 1V9WA 1BEDA 2R4VA 1O8WA 1ZYQB 5J9BA 4CDOA 4XIHA 2WJUA 4Q5NA 3U6VA 1H4OA 5ECQB 3LEFA 2V2GA 4MA9A 4MCUA 4WBJA 3BCIA 1T1VA 1M2DA 3PINA 2IL3A 3HD5A 3F4TA 3H79A 4WETA 1X5EA 4BVYA 9GSSA 3DGQA 4KCAA 2YPMA 1FHEA 3GNJA 1XCCA 4MPFA 1G7EA 4XRDA 2DSAA 2P31A 4KB3A 1Z7RA 3KP8A 5DDLA 4TXVA 2B1KA 3L78A 1NHOA 2IMEA 1WIKA 3HVVA 4MZBA 3QOUA 3BBYA 1A2JA 4TR4A 4MZCA 3QMXA 4HUAA 3KH7A 1A24A 3IAS2 2QGVA 3TJGA 3GMFA 1J0FA 4HZ4A 3GH9A 2L57A 4PXOA 3KTBA 4IHUA 2RLIA 1UC7A 3GURA 3IDVA 1GLQA 4FH8A 1QQ2A 3H93A 2O89A 4FYUA 2LTKA 1EGOA 4TXOA 2AV4A 1K3OA 1SJZA 3VWUA 3ZYWA 1SU9A 1ERTA 2OJLA 2VCXA 3HJOA 1X0RA 2JSZA 2ZCTA 4EE0A 4ZILA 4G9HA 5FWGA 3GA4A 5IO2A 2C3NA 1URMA 2VD0A 2R6KA 3HZ8A 2N5BA 4V2NA 5LNKe 1I5GA 5J5NA 3LQ7A 2B3SA 4KUNA 2AAWA 2C80A 5GSSA 3H1NA 13GSA 3C73A 2L4CA 1PSQA 3BD2A 4F9ZA 2YWMA 1MTCA 3ZFBA 2VIMA 3FZ9A 3ZTLA 2FA4A 1FVJA 1WE0A 2TIRA 1Q4JA 4WF5A 4TXOB 1ILOA 3EU4A 1PQNA 5DAKA 5DJLA 3LWAA 1A2MA 1EV4A 1TW9A 3CTFA 1Z6NA 2K18A 5CRGA 4KW6A 10GSA 3QFBC 1QK8A 4XTSA 4JR6A 4ZL8A 5LCZA 5FT3A 2GQMA 4ID0A 4GSNA 4DSSA 1J08A 3C1RA 5L71A 2DJ3A 1RK4A 1ZCPA 2CT6A 1A0FA 3CRUA 1WP0A 2Z9SA 1MD4A 4G19A 5EY6A 3N9JA 1A0RP 4KA0A 3AY8A 5IMVA 1WOUA 4MF6A 2OBIA 2DMMA 1HQOA 1F2EA 3EYTA 4AJ7A 3Q6OA 4HI7A 3L9SA 1X9MB 1KEBA 2FGXA 4K9ZA 4JEDA 2B5XA 1E6BA 3D4TA 2GTUA 3R2QA 3F63A 2XBQA 2H1GA 4Q5RA 3U5RE 2LRCA 4KSOA 5JCUA 2KP2A 5DCHA 3A2WA 4MJEA 1AIUA 3FW2A 5DAKB 2YZUA 2JU5A 4MPGA 4ZBDA 2CVBA 4FYCA 2LJAA 4DSSB 4KE3A 3TOUA 3IA1A 1S3AA 3ERGA 1ERWA 2PVOC 5ECMB 3FK8A 1SKWB 5C04A 4MABA 3GKXA 1OYJA 5ENUA 2F51A 1JLVA 2F9SA 6GSXA 3TKSE 5A5KA 2HRNA 3CBUA 3EE2A 2BJXA 5CREA 3QFAC 4L5OA 3C7MA 2J9HA 3GN3A 1SYXA 2WFCA 1EOGA 4LLRA 2H1AA 4O32A 5ID2A 2CAQA 2P5QA 3GH6A 5B8AA 3GFKA 4GWRA 2FD3A 1GLPA 4LMVA 2FWGA 4N30A 2IMIA 4IELA 1M2AA 1ST9A 1TRWA 5EL8A 3FEUA 2DIZA 5KEJA 3I43A 4JE1A 1U6TA 3IK9A 4IJ3A 5DCGA 3VPQA 2FWHA 4WBRD 1ON4A 6GSWA 4MH3A 4POMA 2GLRA 1OC9A 5GAPD 1GRXA 1A8YA 5H5QA 1R26A 4QQ7A 3BCKA 1SJIA 4GQFA 1FOVA 3G9BA 5AGYA 5IIZA 4MF7A 4KNDA 3F8UA 3IBHA 4LL4B 4H86A 1K0OA 1XOAA 6GSVA 4TOPA 4PX1A 1YDKA 2H8LA 3GUSA 3UEMA 2JZSA 3KM6A 3LSZA 1MDJA 3GSSA 3VI7A 2HE3A 3NOFA 1F37A 1GSSA 1PL2A 6GSUA 2REMA 3RAZA 5D9VA 2XC2A 5ID2B 1XW6A 3UOMA 5B6NA 1GP1A 1VF1A 2L6CA 2YCDA 4KSMA 1G7OA 1XWAA 18GSA 2CAIA 3I69A 2FLSA 3KMNA 3UMAA 1ML6A 3ZLPA 2CQ9A 3ZRDA 3ZMLA 1YQ1A 1X9SB 1THOA 3BOAA 2HLSA 1RQMA 4MJCA 5F0GA 1M9BA 1WWJA 3L9VA 1OC9B 3GIXA 1A23A 1JZDA 5KN2A 4PURA 2VAFA 3FYGA 1DUGA 3TCOA 3M9KA 6GSTA 4XCSA 1Z7PA 5J4UA 14GSA 4O5RA 2F3MA 2FHEA 1XBSA 1PA3A 1XVQA 3TKRA 2I1UA 2B5EA 2H75A 1Z5YE 6GSSA 2FUG2 4HU9A 2IPAA 2LEGA 3Q74A 3RPNA 2M80A 1GSQA 3QDNA 3GKNA 5D73A 3L0HA 3QAGA 2QKEA 2WDUA 2WRTA 4K7NA 1BYEA 3IK7A 1K0DA 4PQ1A 2RIIA 4PQHA 5GAND 3GL5A 3LXZA 1AUCA 3QAWA 8GSSA 2HSYA 2PVQA 4ECCA 4RI6A 3ZITA 1G0TA 2H73A 3M1GA 1NSWA 3RPPA 3ZZXA 1SL2B 1M99A 2YV7A 2L6DA 3CMIA 17GSA 4MF5A 1T4ZA 5DQSA 2RUEA 7GSSA 2IFQB 2YZHA 4IJIA 5CRHA 3HCZA 5E4WA 2RM6A 3ZFLA 6GSYA 1J9BA 4ZB6A 19GSA 1TK0B 1TP9A 4IP6A 2WCIA 2A4VA 4BPYA 4BWQA 2M46A 2EC4A 4J2FA 2L5OA 5AN1A 1OC8A 2B7KA 2K9FA 4OFNA 3HJPA 2C1YA 1PMTA 4WF4A 1EEMA 2DJ0A 5KN1A 2PN8A 1XWCA 2A2SA 1NHYA 1HYUA 4N0ZA 1K0BA 2AB6A 2C0DA 4X0XA 3D0ZA 3DVWA 4K0GA 2LJKA 4JRRA 5ABRA 3APSA 2PMTA 2C0EA 2GVPA 1SKRB 5IMZA 2H1DA 3A5WA 1QMVA 2WGRA 4AGSA 3LG6A 2TRXA 1X9WB 4RUVA 4KX4A 1AQXA 5HR3A 2L5LA 3UAPA 2ES7A 1NM3A 4HEA2 4HDEA 1ZGNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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