1ZOFA

Crystal structure of alkyl hydroperoxide-reductase (ahpc) from helicobacter pylori
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
170
structure length
170
Chain Sequence
MVVTKLAPDFKAPAVLGNNEVDEHFELSKNLGKNGVILFFWPKDFTFVCPTEIIAFDKRVKDFHEKGFNVIGVSIDSEQVHFAWKNTPVEKGGIGQVSFPMVADITKSISRDYDVLFEEAIALRGAFLIDKNMKVRHAVINDLPLGRNADEMLRMVDALLHFEEHGEVCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Helicobacter pylori
publication title Crystal structure of alkyl hydroperoxide-reductase (AhpC) from Helicobacter pylori.
pubmed doi rcsb
molecule keywords alkyl hydroperoxide-reductase
total genus 50
structure length 170
sequence length 170
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-05-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1zofA00
3E9JB 1GL8A 16GSA 3FR3A 2IN3A 3RPPA 3QMXA 3UIWA 3LYPA 3U5RE 4AGSA 1AQVA 2R4VA 3BD2A 2GQKA 2YPMA 5EY6A 2M46A 1XIYA 1NHOA 1Z5YE 3L4NA 5DAKA 1U88A 4JR4A 1GRXA 5A4WA 3GSTA 2YZUA 2RM6A 1WJKA 5CP1A 3WD6A 3HVSA 2IMKA 3UAPA 2F3MA 1H4OA 5IMZA 3RDWA 1JZDA 2RLIA 3F4SA 10GSA 1XW9A 3P2AA 4PXOA 4WBJA 1M9AA 4KDYA 3ZFLA 3WGXA 1SD8A 3LFLA 4WETA 1LBKA 3KP8A 2GZZA 2OBIA 3DWVA 4MJEA 3IC4A 4MPFA 1PN9A 3HJOA 1WP0A 5DQSA 2GVPA 4TXOA 3TGZA 3VWXA 4ECJA 2MBSA 11GSA 3GIXA 4V2NA 4JR6A 4XCSA 1G6WA 1O73A 3WGEA 2KOKA 4EDZA 4LMVA 1OAZA 4Q5QA 1CQGA 3LEFA 4YQUA 2DMMA 1QXHA 5IMDA 4MABA 4I8BA 1XBSA 1JZRA 2C1YA 4KCAA 2QSIA 17GSA 1Z7RA 2H0HA 2G0FA 2LJRA 3H4KA 1KEBA 2GSRA 5C04A 4IQ1A 2XBIA 4GQCA 3KD0A 3KZQA 3WYWA 1F3AA 2R5GA 4DVCA 1SD9A 2YWNA 1TRUA 2VD0A 1Z6MA 3D4MA 5IO0A 6GSTA 4BA7A 1W89A 2VCWA 1GTUA 2R6KA 2KP2A 3ZZXA 4HU7A 5KN2A 1YKAA 2DJJA 5IM9A 5IPGA 3W8SA 2VCQA 2GDRA 5B6MA 1X9WB 3KEBA 4ZB9A 2RM5A 5C00A 3HVVA 4OCFA 3FYGA 1XOAA 1MD3A 2PBJA 3Q19A 1OC3A 1ZGNA 4PX1A 1SL1B 1EEJA 2OACA 2PMTA 3FKFA 2L4CA 4GRFA 2JACA 4RQRA 2H72A 1ST9A 4LL1B 2H76A 4MP4A 3EINA 1DBYA 1YY7A 1YDKA 3HJMA 2VLVA 3PGTA 2DC5A 3ERGA 4EKZA 2H1GA 1W4VA 1XWCA 5DCGA 4N0VA 1V2AA 1SJIA 3VLNA 5J9CA 3KGKA 5D9XA 2GQLA 5G1LA 1GH2A 3TOUA 2B5EA 4CHSA 3VPTA 1FO5A 5IMAA 4FYCA 3KTLA 2L5LA 2VCVA 3MSZA 4L0UA 2EIOA 2LRNA 2J9HA 4Z7XA 2IFQA 1GTIA 2O85A 5ELGA 1PX7A 5F0GA 3QOUA 3HHVA 3M3MA 1UN2A 1XZOA 2VL3A 2YWIA 1OC9A 3D4TA 3F0IA 2B1LA 1DE1A 4K6XA 4HJMA 2GSQA 4KH7A 3QAGA 4KSMA 1O85A 1ZL9A 3APQA 2LQQA 5E4WA 2XPDA 3EVIA 1PSQA 3Q18A 2YANA 4IJIA 2HZEA 1EP8A 2NDOA 3FY7A 3LWAA 3M1GA 2M80A 3IK7A 1B9XC 4D73A 4PQHA 1ZZYA 5ECSA 3HJPA 4KCEA 4I5QA 2JZRA 3TJKA 1THXA 1QMVA 2JL4A 2P0GA 3C73A 2HFDA 1GUMA 3GUSA 5G5EA 4EDYA 5GAND 3GL5A 3DYRA 2P5RA 1PD21 1TRWA 1M9BA 3CYNA 2ES7A 5D9TA 2KUCA 4XRAA 2CAQA 1Z3EA 5DQYA 2N5AA 2FWGA 2DLXA 3CRTA 4NHZA 4IBPA 2GZYA 3GKNA 1AUCA 3F6FA 2V1MA 4MLYA 3J7Yb 4G19A 4AJ7A 3TKPA 5ECKB 20GSA 1PA3A 1G0TA 5IMCA 3HKRA 4IS0A 3BJ5A 3KH9A 3IAS2 3HZ8A 1WPIA 3KIJA 3GKXA 5ECRB 1K3OA 3EMPA 2AUVA 2DJ0A 3ZL5A 1V57A 4V2LA 2IIYA 3GHAA 1F37A 5B8AA 2OBKA 1THOA 4POMA 1X0RA 4ML6A 4TR1A 2PERA 2JU5A 3QD9A 3UVHA 4KA0A 2FD3A 3QFBC 3UVTA 2MYGA 4O5RA 6GSUA 4LA1A 1E2YA 2VD1A 5F07A 1V58A 2FUG2 5JWRB 1G7OA 3IK9A 2CVBA 1HNCA 1TOFA 4WF5A 1XCCA 1XOBA 4GWRA 1XWBA 3GN3A 4L0WA 3EC3A 1VF2A 3IBHA 1V98A 1USBA 1GTAA 18GSA 3G7YA 4IP6A 3UBKA 3TB2A 5ABRA 4GSSA 2E0QA 3LYKA 2LUSA 2N5FA 2L59A 4HZ2A 1MDJA 1E6BA 3ZREA 2ZCTA 4MJCA 1J08A 3TJBA 1SKSB 3A5WA 3JCML 3UJ1A 1V9WA 3ERFA 9GSSA 5CYYA 1WWJA 2FA8A 3C71A 3ZFBA 1Y25A 3I6AA 5AIXA 2IMIA 4NV5A 1QQ2A 3HZ4A 2AYTA 3GTUB 4DSSB 1EGOA 1OE7A 4TR3A 1EV4A 4JBBA 2H71A 2LEGA 5KN0A 4ZIJA 1RW1A 1XWAA 4ULXA 3V1WA 4BL7A 2RIIA 4F03A 1B8XA 2BTOT 3G7JA 5D9WA 1ERVA 1J9BA 2GQMA 3LQ7A 1WRYA 3CRUA 4KDUA 3TUEA 2YJHA 3UOMA 3ED3A 1R5PA 1EP7A 2H6ZA 1BG5A 1K3LA 4MA9A 3EYTA 4WBRD 3K8NA 4GTUA 1QK8A 3IA1A 5B8BA 1TDIA 2N5BA 1FVKA 4PNGA 3UL3A 1EV9A 2LTKA 3TKQA 4I2UA 5IOWA 5IIZA 3F4TA 5GSSA 4EC0A 2I4AA 1ERTA 1OKTA 1CQHA 4LLRA 5DAKB 2DBCA 4NAXA 2VUPA 1H75A 2YOIA 3GX8A 2WGRA 1J0FA 4HDEA 1JZWA 1PL2A 1K3YA 2A4VA 3A2XA 2H1BA 4HZ4A 2YN1A 2WULA 3GKKA 4AF2A 4MCUA 8GSSA 1GSEA 1HNAA 1QGVA 4N10A 1AC1A 3M9KA 14GSA 2MMZA 4YQMA 1LJRA 1VF4A 2F51A 2X8HA 3TJFA 2O7KA 2G2QA 2CZ3A 1NW2A 4ZILA 3QPMA 3CSHA 3D22A 1VF3A 3G7IA 3SBCA 2K18A 5KN1A 2E7PA 4H86A 4XS1A 1GSUA 3UMAA 4POLA 1X5EA 3QCPA 1SYRA 1ZYEA 2O89A 2H6YA 3R2QA 3GV1A 5G31A 1SENA 1F6MC 1MTCA 2B7JA 4I2TA 4OWYA 3ZIVA 2AB6A 3LSZA 2AV4A 4Q5NA 1ZCPA 1GWCA 5LNKe 1X9SB 3ZITA 2A2SA 1T4YA 1WMJA 2L4QA 3GA4A 3ME7A 2BMXA 1TK5B 2C0EA 12GSA 1XXUA 3TOTA 1XFLA 3D5JA 3MNGA 1PRXA 4O92A 4EF0A 3PR8A 1GUKA 4P3YB 4WF4A 2JZSA 2FHEA 3LJRA 1BAYA 4MDCA 4MZBA 2GT6A 3L9UA 2HT9A 1YJ6A 1GP1A 4WXTA 4AJ8A 2H75A 1JZOA 1ZMAA 2V41A 1NHYA 2K8SA 2YP6A 3WT1A 3H79A 1ZOFA 1ON4A 1AIUA 1GSQA 1OC8A 3C8EA 1GNEA 3AY8A 3J7Yk 1SKRB 4MH2A 1U3AA 22GSA 1VF1A 5L71A 2X8CA 3FZ5A 2WDUA 1TK0B 2IMFA 4J2FA 4KE3A 3FEUA 3L0HA 1A2JA 1EOGA 2CQ9A 4I6XA 5GAPD 1GUHA 5GZZB 4IW9A 3A2WA 5J5NA 2I3YA 6GSVA 2C0DA 3DEXA 1MEKA 2IMDA 1IYIA 2LS5A 3KTBA 3TJJA 4F2IA 1K0DA 4QQ7A 2QC7A 1Z6NA 3QDNA 4MMMA 1A2LA 2LSTA 4IJ3A 3NZNA 4CW9A 3IOSA 3TRPA 3VFIA 3A2VA 3GRXA 2VLTA 1KBNA 5IMFA 2H01A 3GH9A 5LD0A 1SK2A 1TRSA 1M2DA 3VI7A 2XBQA 1GSFA 1IYHA 4ZXGA 2ON5A 1EEMA 5HFGA 3D6IA 2HLSA 3OR5A 2AAWA 5ECIB 4F9ZA 1A24A 3ZTLA 1U6TA 3ZVJA 4TR0A 1FOVA 5IOXA 2VAFA 3EU4A 2HZEB 4FYUA 1HNBA 2FCHA 1MD4A 1YF0A 2AHEA 13GSA 2VCTA 3ERWA 1V40A 1T3BA 5DJMA 1DUGA 1BX9A 4MF5A 2LRTA 2FWHA 4KGIA 3TKSA 4F0BA 2WFCA 2EIRA 5A4UA 1SKWB 3HDCA 4MPGA 1SJZA 1TJDA 4OFNA 3KXOA 3P8WA 3W8JA 2B3SA 1A0RP 1ERWA 1SL2B 1U87A 2B1KA 1OE8A 3HY2A 4N30A 4XS6A 2CV4A 2XC2A 3IHQA 5JWQB 2DSAA 1TI1A 4G10A 2MMAA 4K0GA 2JSZA 2M72A 4HQZA 1T7PB 3H93A 1ABAA 3C1SA 3IRAA 2K6VA 4HJ2A 5E59A 3RBTA 3F63A 4I97A 1NSWA 2FY6A 2C0FA 5J3RA 2LJAA 5F05A 1SK0A 1S3AA 4O32A 2CX3A 1T1VA 2IPAA 1AW9A 5HFKA 4KNDA 2E2GA 1NM3A 5A4VA 5INYA 3FK8A 4GSTA 4RQXA 1GSDA 4MZWA 4YAPA 4L8EA 3P90A 2GS3A 1B4QA 4K2DA 2V6OA 2C3NA 4PUFC 5D93A 2WCIA 2YJ7A 1DE2A 3E0UA 2YNXA 1JLWA 4K7IA 4IGJA 4FYBA 4MJBA 4NPBA 3CBUA 2GSTA 2VM1A 2YWMA 2H8LA 4JRRA 2XHFA 4Q5FA 3C1RA 5CO3A 3DIEA 1XVQA 3HXSA 3O3TA 2H1DA 4J56E 2HRFA 5DVBA 5DALB 1YQ1A 3FHKA 5B7CA 1TW9A 1RQMA 4HQSA 3O6TA 4HU9A 4G9HA 1EWXA 3GL3A 3HCZA 5GSTA 4XTSA 1PQNA 1TKDB 2I81A 4ZL9A 4EUYA 1FHEA 5HFIA 3GFKA 3VPQA 4IQAA 2DIZA 2KHPA 4K7NA 1A0FA 1K0CA 4PNFA 4EVMA 4ZBBA 3US3A 4KAEA 1UVZA 5CNWA 5G1KA 2DIYA 1SK1A 3MDKA 2JADA 1TK8B 5CRGA 2JZTA 1WIKA 3IR4A 3PINA 4OFMA 4IHUA 1GNWA 3EURA 4IVFA 2O8VB 5D9VA 1ACVA 1URMA 2NPBA 2H1AA 7GSSA 3APSA 5H5QA 4CDOA 2HYXA 1TXXA 4MF6A 4ZB6A 4HUAA 4E8EA 3ZLPA 3GKMA 2L6DA 1GLQA 4LMWA 3F3QA 4K7OA 3VWUA 3FR6A 5JCUA 2C4JA 2DJKA 3FW2A 3LORA 1ERUA 2FGXA 4PQ1A 5DJLA 5ID2B 3TCOA 4N11A 1K0OA 3SWLA 1O6JA 2WS2A 3NOFA 1SU9A 2FNOA 6GSXA 4YAVA 2VL9A 2YWOA 1KNGA 2WJUA 2PVQA 2IWTA 4E8HA 4OFTA 3LG6A 1JFUA 4XS4A 3Q6OA 2H0IA 1YEPA 5FWGA 2Z9SA 4MZCA 1FG4A 1FB0A 4DSSA 3BCKA 1BQ7A 1BEDA 3L9VA 5ECNB 2QKEA 4F82A 4YQVA 5J9BA 2FWFA 1M2BA 3KJYA 1TP9A 2VM2A 4DEJA 1HQOA 4K8MA 3ZRDA 2DJ2A 5JCGA 3DRNA 1K0NA 5H5RA 4IN0A 4TXVA 5D96A 5ECHB 4TW5A 3N5OA 4ZBDA 2OADA 3FZAA 3G9BA 2WRTA 4X1UA 4OO4A 4HOJA 1A2MA 1DSBA 5ECMB 4BVYA 3KH7A 2NBSA 1U3IA 3A3TA 3UARA 2R2JA 3U6VA 2JSYA 3I69A 3EWLA 5DDLA 2IL3A 4KW6A 4ML1A 2K9FA 6GSWA 4TXOB 1R4WA 3BBYA 3ME8A 1A8LA 3H8QA 4XIHA 1YF1A 2VO4A 1AQWA 2KLXA 1A23A 3IDVA 4RI6A 2HZFA 5DCHA 2LQOA 3GNJA 2PPTA 1GULA 3H1NA 2VL2C 3UBLA 3QR6A 2TRXA 1MDIA 4PGTA 1BJXA 4HEA2 1UA5A 2LJKA 2H70A 3FZ9A 3M9JA 5B6NA 2DMLA 1O8WA 2KP1A 2C3TA 3F8UA 3DD3A 5G2ZA 4GF0A 5CAXA 2PVOC 2B5YA 5LCZA 4KX4A 1FVJA 3DVXA 3EE2A 2DJ1A 5JCWA 3CXGA 1HD2A 5HQPA 4MK3A 4GXZA 1R5AA 5A5KA 2HXKA 4ZL7A 3VWWA 1O81A 2J23A 2HSYA 3MAKA 1O7UA 5J4UA 2VLUA 3ISOA 4JEDA 2OA7A 1X9MB 1AQXA 2FA4A 2EC4A 4WKWA 4ZBAA 3NIVA 3IXRA 3Q74A 2GT5A 3ZMLA 5IO2A 2C8UA 2LRCA 2MZCA 1YEXA 2F8FA 5AISA 2TIRA 4L5LA 3DXBA 4X43A 2L6CA 1OYJA 1G6YA 1XW6A 3TKSC 2MMNA 4MJAA 4TKYA 2D2ZA 2OJLA 2CX4A 1O8XA 3DGQA 5DBQA 4IKHA 2R37A 4TN8A 4J57E 4MF7A 4JE1A 3GX0A 5ECOB 4ECIA 2X64A 3F9UA 3GURA 3GH6A 4K1FA 1Q4JA 3D0ZA 2HNLA 4EXJA 2FLSA 2VL2A 4GSNA 3WGDA 1EOHA 3HA9A 4ISDA 4O7HA 1K0BA 5D8IA 2YZHA 2IJYA 3P7XA 2L57A 5JWOB 2XPEA 5HR2A 1XPVA 4V2MA 3HVXA 5J41A 3L78A 2CA8A 5COHA 2IFQB 3I43A 3FRCA 1SL0B 1PL1A 4BPYA 5AGYA 2P31A 5EPFA 3GMFA 4Q5RA 1GSYA 4NWYA 4BVXA 1OC9B 2CVKA 3VURA 2E2MA 5CREA 1T8EB 3IV4A 2VOCA 1B9YC 4PQIA 3M0FA 4NV2A 3ZIJA 2RUFA 5ENUA 1BYEA 4POKA 2DJ3A 5F06A 2B6MA 1ML6A 1SYXA 4EL1A 1M99A 1GTBA 3DKSA 4DSRA 3EMXA 2H66A 4OCEA 4XHMA 1LU4A 4FIWA 2VIMA 5F8BA 3ZYWA 1OVNA 3RHCA 2H30A 4FO5A 3QAWA 5IQYA 2H74A 4D73B 2CT6A 3CTFA 2V32A 1QFNA 2C3QA 3O76A 5HR3A 1G7EA 3E3EA 1F2EA 4TOPA 2B7KA 2LNTA 2HRNA 2PU9C 1PKWA 1R7HA 4ECBA 2OKAA 5KEJA 2WZ9A 3QFAC 2V2GA 5D73A 2ZUPA 5FHIA 2F8AA 5AN1A 3TJGA 3CSJA 4MH3A 2RUEA 4HS1A 2YV9A 1XW5A 4TR4A 3C7MA 4G2EA 3LXTA 4GLTA 4RI7A 3FZ4A 3IAM2 5CRWA 3F6DA 2OE0A 2A2RA 3HYPA 3N9JA 3TKRA 2H6XA 3TRQA 3LGCA 4X0XA 1GLPA 4NXIA 3KMNA 3BOAA 2K8VA 2GZPA 2VCXA 2H73A 4PUAA 3RHBA 1HYUA 1R26A 1M0UA 2LNSA 2R3XA 2YCDA 4KSOA 1X5CA 1OKDA 3L9SA 4TVEA 1TU7A 4FH8A 4GQFA 4ACSA 5IMVA 4ID0A 1AXDA 5ECPB 5G30A 2H0GA 1JHBA 1JLVA 3TDGA 3F3RA 4HI7A 3HD5A 1FW1A 2PGTA 2OE1A 3GSSA 1ZYQB 5FT3A 2X99A 1B4PA 4ECCA 3TRXA 3BCIA 1UC7A 1K0MA 4IELA 4TR1B 4WR5A 1WOUA 4RUVA 2GLRA 2I1UA 1PGTA 3F4RA 1VGLA 4NMUA 3CSIA 4JU5A 5EL8A 1MDKA 4QL9A 2WB9A 2CAIA 4F0CA 3ZVJD 4EO3A 4WEYA 1N2AA 4OMVA 2TRCP 2ZNMA 4ZL8A 4BWQA 1VRSD 3GYKA 1K0AA 2O87A 2P5QA 2CVDA 1F9MA 1M2AA 1TU8A 2F9SA 2EIQA 2FWEA 3IPZA 1FAAA 3CTGA 2ALBA 1PKZA 2QGVA 4OO5A 3ZMKA 1XWGA 5CRDA 3D21A 3VK9A 3WT2A 1EGRA 3KP9A 1TTZA 3S9FA 1GSSA 4JZQA 1PMTA 2REMA 3EU3A 3CMIA 3FR9A 3PH9A 1QUWA 3W6GA 5ECQB 1B48A 3VI5A 3UEMA 4V1Ap 5DALA 6GSYA 3APOA 4WR4A 2GTUA 1Z9HA 1I5GA 4K9ZA 3KCMA 5EVOA 1TRVA 5HR1A 4PURA 2NVLA 1FB6A 2HI7A 2HSHA 1N8JA 19GSA 4BWSA 1S3CA 2MMOA 4KB3A 2I9HA 2LV3A 4NHWA 1WE0A 4ILFA 4DSQA 1YZXA 2LKUA 2X8GA 2L5OA 1RK4A 1XVWA 2AJQB 1A8YA 2B5XA 4K0NA 5IPHA 5AIVA 4POBA 4XS4B 5ELAA 1PX6A 1EZKA 1Q98A 4OD7A 5ECLB 4XRDA 1T4ZA 1I9DA 3DMLA 1T00A 6GSSA 2PWJA 4V1Ag 4L5OA 2GSSA 2C80A 2PUKC 2CZ2A 3TKSE 3I9V2 2NTOA 4TRXA 4GCIA 4AJ6A 3KMOA 1S3DA 1AAZA 2C0GA 4EE0A 1YKCA 2V6KA 4ZB8A 2HE3A 3RAZA 3MWHA 3LXZA 1TI3A 3GTUA 4N0ZA 1X5DA 1Y6EA 4KUNA 2PN8A 1Z7PA 3M8NA 4QL7A 5G5FA 4IP1A 2BJXA 2ON7A 3IE3A 5ID2A 5KN3A 3DVWA 4KDXA 1ILOA 2VCZA 2GGTA 1F3BA 5HR0A 4LL4B 1KTEA 1C72A 3RPNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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