1TRWA

The high-resolution three-dimensional solution structures of the oxidized and reduced states of human thioredoxin
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDAQDVASEAEVKATPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
publication title The high-resolution three-dimensional solution structures of the oxidized and reduced states of human thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 22
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1trwA00
4ACSA 4L0WA 3D0ZA 1A23A 4FYCA 3UVTA 2FA4A 3VLNA 5EPFA 4PUAA 1JHBA 3DVWA 1EGRA 2VAFA 4DSSB 2A4VA 5KN0A 2LS5A 2H6ZA 1M0UA 4ISDA 1YDKA 1AIUA 2O89A 2IN3A 4WBRD 2NVLA 4ZL9A 3F4SA 2IFQA 1ST9A 3BCKA 1XZOA 4DSRA 5IOXA 2Z9SA 2WFCA 1DE1A 4BWQA 2JSZA 4IS0A 4YQUA 1TRUA 4HJ2A 3VK9A 3KGKA 3P90A 5JWQB 3KJYA 2N5AA 4ZL7A 4GSSA 1QXHA 3F8UA 2XPDA 4L8EA 4GRFA 1TK8B 3TKRA 5D9VA 2H01A 1AQWA 1XOBA 5B6NA 4ML1A 5CYYA 3BOAA 3BD2A 2LJRA 2J23A 4GQCA 3WGDA 3ZFBA 4FYBA 4MZBA 1VF2A 1GULA 3BCIA 2M46A 1TJDA 4K7OA 4K6XA 4HUAA 2I3YA 2N5FA 4L0UA 6GSUA 3TJBA 2X8CA 2O87A 3VURA 4TRXA 3ZLPA 3HA9A 4QL9A 4L5OA 1DSBA 5G2ZA 1S3AA 1B9XC 4POKA 1XXUA 1BJXA 2E7PA 2IJYA 3ERGA 3ERWA 1X9SB 1W4VA 5HR1A 2IMKA 2LV3A 2VM2A 1K0CA 3FR6A 4MLYA 2LRNA 2CA8A 4EUYA 1ACVA 2WULA 1OC3A 5D93A 2IFQB 2KOKA 1PSQA 2C8UA 2H0HA 4EVMA 4NV2A 3FKFA 4FH8A 14GSA 2H71A 1R26A 2GSRA 1WOUA 4K7NA 4WF4A 3M0FA 4GSNA 1PA3A 1GLQA 5LCZA 4KDUA 2FA8A 4KAEA 3R2QA 5GZZB 4K0NA 3GX0A 4MZCA 4ZBAA 2H73A 1FB0A 4XS4A 2MBTA 2V2GA 3VWVA 2FWGA 4OFTA 1YJ6A 2L57A 1PX6A 2OACA 3HJOA 4V1Ap 3M3MA 4RQXA 4JR6A 2YN1A 5GAPD 2ZUPA 2N5BA 17GSA 1M99A 2K9FA 4BWSA 1V98A 2QGVA 1O6JA 2R37A 4PGTA 4J57E 3C73A 2HE3A 4IQ1A 1XWBA 4MF5A 5ECOB 2XBIA 3ME8A 4K7IA 4MP4A 2ON5A 4KGIA 4YQVA 3LYKA 3EWLA 3VPQA 2WGRA 1ABAA 4ID0A 1H4OA 1T4ZA 3UL3A 4KUNA 1GL8A 2C0EA 2B7JA 3UBLA 1IYIA 4EE0A 4D73A 2PUKC 3OR5A 3WD6A 19GSA 3UJ1A 2C3TA 2LTKA 3IDVA 2O7KA 3QR6A 2P5RA 5C00A 1T8EB 4V1Ag 3LFLA 2GDRA 4DSQA 2H30A 2H1BA 2LNSA 5D9XA 3CSHA 2DC5A 1O8XA 4XS4B 5DAKA 1SKWB 3IOSA 2H1DA 1T4YA 2XHFA 1TTZA 4MMMA 5G31A 3KP8A 3TJGA 2WJUA 3RBTA 1ZZYA 2VL2C 2TRXA 4NAXA 1OVNA 2AJQB 1XW9A 2R5GA 4EDYA 5ECHB 3GNJA 4JU5A 1WIKA 5ECIB 5B7CA 2IMIA 3D21A 2GVPA 3FZ9A 1A2LA 3UBKA 5J5NA 4HOJA 1OKDA 3TKQA 5IPGA 2FD3A 1NHYA 1TW9A 3IAS2 3IBHA 4D73B 4MCUA 3ZVJA 1FG4A 1ON4A 2AB6A 1S3CA 2YPMA 2QSIA 2HSYA 1YF0A 1PKWA 1K3YA 1K0OA 1YKCA 3AY8A 1EP7A 1GNEA 1YKAA 1SL2B 5DDLA 4TR4A 1XOAA 5DAKB 3ZZXA 5AGYA 2H1GA 1DE2A 4KB3A 5IMVA 3EU3A 2HNLA 3C8EA 1XCCA 4HEA2 4HI7A 3JCML 4TXOA 3GN3A 5ABRA 4Q5FA 3APSA 4XS1A 2PU9C 5CRGA 2H75A 4LMVA 3QAVA 4OD7A 3GL5A 5F07A 1TI3A 3KCMA 5AIVA 2HSHA 4F0CA 2OA7A 5HFKA 1V2AA 4OO5A 3KM6A 3F0IA 2L59A 2B3SA 2R6KA 1PD21 4POBA 3TCOA 2DJ1A 3KXOA 1JZWA 1WE0A 5LD0A 5LNKe 1OC9A 4TVEA 1EEJA 3QCPA 4ZB8A 2FWEA 2OBKA 2ON7A 2P0GA 2YZUA 2QC7A 3SWLA 3D5JA 3ZTLA 1XW6A 5DQYA 2JL4A 1PX7A 3VI5A 1K0DA 4IELA 2CV4A 3P2AA 1SYRA 5D9WA 2K18A 5IMZA 3TDGA 1VF4A 1IYHA 1O81A 5HR0A 2YV9A 1GSUA 1AUCA 2YOIA 3Q74A 2B6MA 1I5GA 3FZ4A 3KH7A 4IBPA 2RIIA 2VCXA 3M1GA 5G1KA 1TRWA 4MDCA 1GP1A 2GSSA 4EL1A 2G0FA 2CAQA 2GZZA 2H6XA 1TDIA 2GQMA 2EIQA 1KTEA 5IPHA 2L6DA 3TKPA 1GRXA 1YY7A 1UC7A 1UN2A 3MWHA 3N9JA 2JSYA 1GUMA 5KEJA 1XBSA 3E9JB 2GSTA 3SBCA 3C7MA 4F03A 4KCAA 2LSTA 1M9AA 3EYTA 1RK4A 3WGEA 4F2IA 4JBBA 4QQ7A 1GUHA 2R4VA 1OC9B 3M8NA 5JCWA 2K8SA 4DVCA 3EMPA 1KNGA 3FZ5A 8GSSA 5IO2A 4YQMA 2DIYA 1Z6NA 2F8FA 2VCVA 1EWXA 4J56E 3GSSA 1YEPA 1OE8A 2DBCA 3KTLA 2CZ3A 3GKKA 1THOA 4I97A 4KDXA 4IP1A 4ML6A 2XC2A 1QQ2A 3G7IA 1HNAA 4BVYA 3ZL5A 3C71A 3N5OA 2F9SA 4HZ4A 4IKHA 2DJJA 5B8BA 3PR8A 2B1KA 2MMAA 3QPMA 5AIXA 4NHZA 3HJPA 4PXOA 3GFKA 3HCZA 1K0BA 3FHKA 2I1UA 3F3RA 1TRVA 3ED3A 4GXZA 3I43A 3TKSC 2DJKA 1USBA 1T1VA 3U5RE 5FT3A 3EURA 2IMEA 4IQAA 2FNOA 3K8NA 5ECSA 4O5RA 4N10A 3L4NA 3IK9A 2MMOA 4KH7A 3WT2A 3HVXA 4MH2A 2OADA 4PX1A 2I9HA 2VD0A 4KE3A 3ZIVA 1GWCA 3TJJA 3GIXA 1NHOA 3F6FA 2YJ7A 4MZWA 4ZBDA 4N0ZA 5CAXA 5JCGA 2C4JA 2XPEA 1GSEA 2C3NA 1OE7A 1MDKA 4HU7A 4MF7A 1EZKA 1PQNA 4MH3A 4ECIA 2GZPA 3ISOA 4ZIJA 4FIWA 2LNTA 4TN8A 2L5OA 2C0GA 4V2LA 2DJ3A 2QKEA 1BYEA 2MZCA 4XIHA 1X9MB 3F6DA 1GSFA 2H8LA 1GTIA 2B5XA 4F9ZA 1XWGA 3ERFA 4ECBA 1JZDA 2EC4A 4PNGA 3UMAA 6GSVA 5IO0A 3HXSA 2VCTA 3TRQA 1PN9A 4XTSA 4ZB9A 1XVQA 2YV7A 2B7KA 11GSA 2YWMA 3IV4A 5DVBA 5H5QA 3GTUA 2LRCA 3F63A 5CRWA 2GGTA 5H5SA 1M2AA 3IA1A 1WPIA 3IRAA 3F3QA 1V58A 2I4AA 1OKTA 5E4WA 3WGXA 1T00A 1ERWA 3HKRA 2FWHA 2GLRA 5G5EA 1SU9A 4LMWA 2A2RA 5G5FA 1RQMA 4MJAA 3IAM2 3NOFA 4TR1B 5GAND 4E8HA 2PBJA 3TGZA 1O73A 3TJKA 3F9UA 1TKDB 3A5WA 1CQGA 2HRFA 4BA7A 5ECNB 4L5LA 2LJKA 1Z3EA 1OC8A 6GSTA 2C0DA 1F3AA 1TK5B 4K0GA 5J41A 4Q5RA 3WYWA 4MJEA 1ZMAA 3Q19A 3D6IA 2YJHA 4NMUA 5L71A 4JEDA 2A2SA 2C80A 4TOPA 4WR5A 4EO3A 5KN1A 4MK3A 3BJ5A 1NSWA 3NZNA 4WF5A 3CTGA 4IGJA 3J7Yb 4WR4A 1LU4A 4Q5QA 3DXBA 1U87A 2X99A 3HZ8A 5A5KA 5ECRB 4HZ2A 4V2MA 1UVZA 3GTUB 4RQRA 2K6VA 2RUFA 2C3QA 2VL9A 4WETA 4JE1A 4MABA 1R5AA 4HJMA 3GHAA 2I81A 4XRDA 1F37A 2VO4A 2VIMA 3H4KA 4I2UA 1MTCA 3KTBA 4LA1A 5GSSA 3LJRA 2JADA 3PINA 1BAYA 2WRTA 3MAKA 1G7OA 1U88A 1JZRA 4IJ3A 3HDCA 4OFNA 1HYUA 2X8GA 3IPZA 2H19A 1ERUA 2ZCTA 2AV4A 3M9JA 3LGCA 1A2MA 1MD4A 1ZCPA 5DALB 3IE3A 2HYXA 4WXTA 4EC0A 1A2JA 5D96A 1C72A 5FHIA 3EINA 2VD1A 3LORA 3QDNA 4IP6A 4CHSA 2VCQA 3HVSA 4K2DA 1SJ6A 1PRXA 1N2AA 2H70A 3V1WA 5CO3A 4G9HA 3HD5A 3S9FA 3VFIA 1R4WA 3H79A 4ZB6A 5HQPA 5J9BA 3UOMA 2YWOA 1AQVA 3MDKA 1DBYA 2CT6A 1T7PB 2YWNA 2ZNMA 4NHWA 5HR2A 1YEXA 3IK7A 3GYKA 4EKZA 4OCEA 4AJ7A 2VL2A 4RI6A 2VL3A 3U6VA 4PURA 1G0TA 3O76A 5F05A 1TRSA 3QOUA 1U3AA 5J9CA 3LQ7A 2FGXA 3KIJA 1ZOFA 4H86A 1GTUA 3CTFA 4KSMA 3D4TA 4TR0A 2DLXA 2YWIA 5CP1A 2VUPA 1EV4A 4EXJA 5B6MA 5EVOA 1X9WB 1V57A 1U3IA 4IVFA 1HNBA 1M7TA 3KP9A 1ILOA 4ECCA 3L9UA 1GUKA 1B8XA 1K0NA 1O8WA 4IW9A 4ZL8A 3TUEA 3GUSA 2HXKA 1K3LA 5ECKB 2CAIA 2CX4A 2G2QA 2DMLA 2V41A 3GL3A 1AXDA 1DUGA 1AC1A 2JZSA 2OBIA 2V1MA 6GSYA 4I2TA 1SL0B 3P7XA 3DGQA 3KZQA 4PQ1A 1VF1A 4F82A 2H0IA 3ZFLA 1O7UA 1TI1A 4FO5A 2PVOC 1FB6A 1V40A 3ZMLA 2DSAA 4POLA 3QFBC 2IIYA 2IL3A 2KP1A 1TK0B 2V6OA 1F9MA 4IN0A 3CRTA 2YNXA 2JACA 1SKSB 1LJRA 2FY6A 5ECMB 3APOA 1Z7RA 3ZYWA 2FCHA 3LXTA 3CYNA 2KP2A 2VM1A 2GZYA 1AQXA 5F0GA 2O85A 2GS3A 3ME7A 1TP9A 1B9YC 2IMFA 1SD9A 4JR4A 2V32A 2NPBA 1AAZA 3FEUA 5G1LA 5E59A 2GQLA 2HLSA 1SL1B 2IPAA 2GTUA 2VCZA 3VWXA 1XPVA 2OE3A 1FW1A 3GURA 3CXGA 1PGTA 5H5RA 3CBUA 5ID2B 4DEJA 4ZBBA 2OE1A 4K1FA 3LSZA 1GNWA 3DMLA 1K0AA 3J7Yk 1R5PA 3GA4A 2GSQA 2E2MA 1GH2A 4CDOA 4AJ8A 5ECPB 3RAZA 3GX8A 2BMXA 3GRXA 3VWWA 2TIRA 1ZGNA 3QD9A 3TKSE 4TW5A 2M80A 3QAWA 5FWGA 4CW9A 2PVQA 2OJLA 3O6TA 2HZEA 1EGOA 3IC4A 2H1AA 5IMCA 4XHMA 4ILFA 5ELAA 1QGVA 4LL1B 1Z9HA 1TXXA 2IWTA 5ECQB 3W8JA 2HFDA 4LL4B 1JFUA 5CNWA 5AISA 1KBNA 4AJ6A 1N8JA 2TRCP 1SJZA 2GT6A 5J4UA 1YQ1A 3MNGA 1MD3A 3FYGA 3TJFA 1OYJA 2E2GA 3CRUA 3H8QA 4GLTA 2BJXA 3RHCA 2VLUA 3HY2A 4WKWA 5J3RA 2WB9A 3L9SA 5A4WA 2FWFA 4TR3A 1FO5A 3LWAA 1LBKA 5DQSA 3TOTA 3KMOA 1G6WA 5F8BA 1ERVA 1XIYA 3US3A 2C1YA 4TR1A 5B8AA 3A3TA 4OWYA 3UIWA 4JZQA 1X5DA 2WDUA 2KLXA 3ZMKA 3RHBA 1X5EA 4KSOA 1URMA 1JZOA 2LQQA 3HZ4A 3UEMA 1V9WA 1TU8A 4PQHA 4PNFA 4NPBA 1Q4JA 4YAPA 3TKSA 2CZ2A 4PQIA 3ZREA 2MMZA 1QMVA 2E0QA 3EU4A 1I9DA 2EIRA 2HZEB 1K0MA 1J9BA 2H6YA 2PN8A 4EDZA 2F51A 1THXA 3Q18A 4V2NA 1XWKA 3KEBA 3VWUA 3KH9A 1YF1A 5CRHA 1WWJA 3GKMA 4I5QA 4BL7A 1OAZA 1HD2A 2BTOT 3D4MA 2GQKA 1VRSD 2AHEA 3TB2A 2NTOA 2MMNA 2X64A 4KDYA 4GSTA 3HVVA 3P8WA 3EC3A 1A0RP 5EY6A 4ECJA 3HJMA 3UARA 1FVJA 3LG6A 1PL2A 1GLPA 3KD0A 4RUVA 4POMA 5HFGA 4QL7A 2MBSA 1KEBA 1E2YA 2LUSA 2L4QA 1GTAA 12GSA 3DRNA 4TKYA 2RUEA 4ZXGA 4J2FA 4OO4A 1B48A 4O32A 2YCDA 1H75A 3GMFA 3EE2A 3TRPA 4MF6A 2PPTA 3DVXA 3QAGA 1G7EA 5DCHA 2WZ9A 4HQZA 18GSA 9GSSA 3FW2A 4KW6A 4AF2A 3VI7A 4F0BA 5IMDA 4OFMA 1SK0A 5DALA 3I9V2 5D9TA 2O8VB 4GWRA 4HS1A 3FY7A 5A4UA 3UVHA 4GCIA 2KHPA 2MYGA 5C04A 2VLTA 7GSSA 3FZAA 2P31A 1M2BA 1ZL9A 5DJLA 1A8LA 3G7YA 4XCSA 4G2EA 1AW9A 4KNDA 5IIZA 4GF0A 5EL8A 4X0XA 5A4VA 4EF0A 1EOGA 5CRDA 2PERA 1VGLA 1HNCA 3QFAC 4N0VA 2AAWA 1S3DA 1FOVA 3EVIA 6GSXA 3TOUA 3F4TA 1QUWA 1R7HA 3DKSA 5D8IA 1FVKA 4JRRA 1BG5A 4MJBA 4WEYA 1Y6EA 5JWRB 2LQOA 1WP0A 5INYA 2WCIA 5GSTA 4O92A 5DJMA 3NIVA 4K8MA 3TRXA 3DYRA 3VPTA 4IHUA 2RLIA 2FLSA 3W8SA 5IM9A 5COHA 5G30A 3ZVJD 3RPPA 3PGTA 1NW2A 13GSA 4XRAA 4XS6A 3IR4A 3FRCA 1CQHA 2PGTA 1Y25A 1QFNA 3EMXA 3LXZA 4YAVA 5AN1A 2B1LA 2H76A 5IMAA 1F3BA 2AYTA 2KUCA 5ENUA 2FUG2 4KX4A 3C1SA 2CVBA 3FR3A 3IHQA 3APQA 4N11A 2R2JA 1J0FA 5HR3A 3F4RA 2C0FA 1XW5A 2HZFA 3E0UA 1NM3A 2JZRA 1GSYA 4X43A 5ELGA 1HQOA 1EV9A 1ERTA 2H66A 2FHEA 1GSQA 4WBJA 2YANA 4NWYA 3G9BA 1ML6A 2DIZA 1X0RA 1WMJA 1M9BA 2EIOA 1K3OA 4KA0A 4TXVA 6GSSA 3UAPA 1EP8A 5JWOB 3E3EA 4MJCA 1MEKA 3BBYA 2R3XA 1GTBA 2X8HA 1YZXA 3A2WA 5JCUA 2L5LA 5KN2A 1FHEA 2H0GA 4ULXA 4I8BA 2K8VA 1G6YA 1PKZA 2AUVA 1BQ7A 16GSA 3DD3A 4MPGA 4YH2A 3GKXA 2VCWA 3L78A 2F3MA 1WRYA 3WT1A 1EOHA 3DIEA 2RM5A 5DCGA 3I69A 4AGSA 1XWAA 1FAAA 4PUFC 3LEFA 4KCEA 1Z6MA 1A0FA 10GSA 5HFIA 1Z7PA 2J9HA 2PMTA 1A8YA 3IXRA 4HU9A 2B5EA 1F6MC 2H72A 4G10A 4E8EA 4ZILA 2DMMA 6GSWA 1GSDA 1SENA 4N30A 3FR9A 3DEXA 1ZYEA 4MA9A 2LRTA 1W89A 3RDWA 2CVDA 5ID2A 2H74A 1X5CA 1Q98A 3QMXA 4FYUA 5CREA 3GKNA 2HRNA 1EEMA 3A2XA 3PH9A 3GV1A 4LLRA 1XWCA 1SK1A 3O3TA 2VOCA 2YP6A 2L4CA 3GSTA 5D73A 4BVXA 2WS2A 1U6TA 3CSIA 1B4QA 1TU7A 3KMNA 4K9ZA 1E6BA 3G7JA 4GTUA 3ZRDA 22GSA 1J08A 1T3BA 1VF3A 4NXIA 2DJ0A 2JZTA 2HI7A 4O7HA 3GH9A 4X1UA 2M72A 2D2ZA 3GH6A 2PWJA 1ZYQB 3HYPA 4G19A 1QK8A 3RPNA 2VLVA 1F2EA 3ZIJA 3H1NA 2LKUA 4TXOB 2XBQA 4BPYA 4Z7XA 4HQSA 1JLWA 3C1RA 2NBSA 5IQYA 4DSSA 2B5YA 2L6CA 4OCFA 2P5QA 2ES7A 2YZHA 5KN3A 3DWVA 2OE0A 1SD8A 1O85A 1XVWA 4IJIA 1UA5A 2HT9A 3L9VA 4GQFA 1MDJA 3I6AA 4MPFA 1BX9A 3W6GA 1SYXA 2NDOA 4I6XA 3CMIA 4RI7A 1WJKA 5DBQA 3Q6OA 3HHVA 1SKRB 1TOFA 2CVKA 2REMA 2JU5A 2GT5A 2LEGA 1PMTA 4NV5A 3ZITA 2ALBA 2IMDA 2V6KA 3M9KA 4Q5NA 3A2VA 2DJ2A 5F06A 4OMVA 1SK2A 4HDEA 3CSJA 1M2DA 1SJIA 3D22A 1XFLA 3L0HA 5ECLB 3MSZA 5IMFA 2CQ9A 1B4PA 5IOWA 1Z5YE 1MDIA 3FK8A 2OKAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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