1NHOA

Structural and functional characterization of a thioredoxin-like protein from methanobacterium thermoautotrophicum
Total Genus 13
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
13
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
MVVNIEVFTSPTCPYCPMAIEVVDEAKKEFGDKIDVEKIDIMVDREKAIEYGLMAVPAIAINGVVRFVGAPSREELFEAINDEME
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
publication title Structural and Functional Characterization of a Thioredoxin-like Protein (Mt0807) from Methanobacterium thermoautotrophicum
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable Thioredoxin
total genus 13
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1nhoA00
1G7OA 1B4PA 4JR4A 3GKXA 2K18A 2CVDA 3HZ8A 3K8NA 4JBBA 2VO4A 4MJBA 1ZCPA 1SU9A 2PERA 3GFKA 2R3XA 3BOAA 2C3QA 3Q74A 1KBNA 1M2DA 4TN8A 1WMJA 3TRQA 1SD9A 2GQKA 5G2ZA 3WYWA 1ERUA 2FY6A 4EE0A 4P3YB 2GZYA 5INYA 3F3QA 5C00A 1THXA 1F9MA 2DSAA 2B3SA 5DDLA 3VWVA 2LUSA 1FB0A 4DEJA 1GP1A 5AIVA 3VK9A 4ZB8A 3FZ9A 1X9SB 1I9DA 3H8QA 1G0TA 1TU8A 2G0FA 4ZILA 1ZYEA 3ERWA 3GNJA 4YQVA 3KM6A 4X0XA 1ZMAA 5ELGA 4MDCA 5J3RA 3EVIA 5HFGA 4X43A 2AV4A 1J08A 4O32A 2CT6A 2HRNA 2H1AA 1GH2A 3IHQA 3D5JA 4K9ZA 1GLQA 5DVBA 3KIJA 2B5YA 4F9ZA 2VCWA 1NSWA 1W4VA 1WP0A 5GZZB 1USBA 1PL2A 4ZIJA 3CRTA 3GH6A 3UIWA 5ELAA 1F37A 5DALB 4E8EA 3N9JA 1PQNA 1GTUA 2WFCA 4ML6A 3IDVA 1ERWA 2K8SA 2LS5A 2WCIA 1EGRA 4BVYA 4FYCA 1A0RP 3GL5A 4PQ1A 1LBKA 5B6MA 3KEBA 4GXZA 4PUFC 1YKCA 1K0BA 4LLRA 2C0DA 1GTAA 3FRCA 1S3DA 1TOFA 5CNWA 4K0GA 2A4VA 1NW2A 1ZL9A 3C1SA 5G5FA 1SKRB 2YANA 3MNGA 4BL7A 2H6XA 4MZWA 2HSHA 2LV3A 1MDIA 1YF0A 1XOBA 4XRAA 5ECOB 3UEMA 1QK8A 3UMAA 19GSA 4RI6A 18GSA 2EIQA 1FAAA 1SJIA 5HFKA 3UAPA 3H79A 2V1MA 2WB9A 5DALA 3I9V2 5E4WA 4L5LA 2CZ3A 2YNXA 3CBUA 4HU9A 2FHEA 3FEUA 1XXUA 3TRPA 5LNKe 3GH9A 3ERGA 4EUYA 5CYYA 1GNEA 1M0UA 2VL2C 4RI7A 3QD9A 1OE7A 1PX6A 1WRYA 5H5QA 1THOA 5AIXA 3EMXA 4YQMA 5JWOB 2E2GA 2RUFA 4O7HA 1ACVA 5CRHA 2B5EA 1GUMA 1O8WA 3CSJA 1V57A 3EYTA 5A4WA 2H76A 4RQRA 1KEBA 3M1GA 5J41A 4JU5A 1O8XA 4ULXA 3MWHA 2Z9SA 4ECJA 1SYRA 2IN3A 1G7EA 5HR2A 2CZ2A 4BPYA 2JSZA 4D73B 16GSA 1VF2A 4MJEA 1TI3A 1TK0B 4POKA 3GN3A 3HVSA 2GT6A 2FLSA 3W8SA 5ID2B 4WF5A 4I8BA 4TR3A 3QFAC 2N5FA 3IE3A 4ZXGA 2QC7A 5D9XA 1OYJA 1O85A 3M9JA 5COHA 5HQPA 4IELA 2OE1A 2E2MA 2V32A 1H75A 5F0GA 1GTBA 1AQWA 1XBSA 3Q6OA 5D93A 2K8VA 5JWRB 4PURA 2GTUA 2PWJA 2MBTA 1SKWB 2OKAA 3IRAA 3QR6A 3GURA 3V1WA 4NHWA 3TUEA 2GVPA 4AGSA 2GLRA 4MJCA 3Q19A 1RW1A 1M9BA 3TKPA 17GSA 5H5SA 4ZBDA 2YCDA 1MEKA 3QPMA 1E2YA 3KH9A 1SL0B 1O73A 3TJBA 4D73A 4GQFA 4EO3A 1F3AA 5D96A 2LJRA 4ECIA 2NPBA 2IPAA 5G1LA 1XW9A 2YZHA 5ID2A 4L8EA 2H01A 2JZRA 4OCEA 5G5EA 2DJ0A 4MLYA 1K3LA 2PN8A 1N8JA 1NHYA 3US3A 4NAXA 4YQUA 3GUSA 2C8UA 1TW9A 2HNLA 1TRSA 2H6YA 4ECCA 4KCAA 1T8EB 1K0NA 1ML6A 4K6XA 1XOAA 1YEPA 1JZRA 5G30A 3VLNA 3DIEA 3H93A 3R2QA 2ALBA 4WBRD 2R2JA 4NV2A 3RAZA 2OBIA 3QAWA 2IMFA 2P31A 5CREA 3F4TA 1AQVA 3VI7A 5EL8A 1Y6EA 2M46A 4TRXA 5B8BA 2PU9C 1FG4A 1IYIA 1FVKA 12GSA 1MTCA 3ZMLA 1V98A 5IIZA 2N5BA 13GSA 3CTFA 3FZ4A 1IYHA 1XFLA 2FD3A 2JU5A 2YOIA 2DLXA 1RK4A 2MMAA 3KP9A 1M2AA 2HZEB 1J0FA 4YAVA 5IOWA 5KEJA 4NXIA 1TJDA 2LNSA 1O7UA 4H86A 1OE8A 2PMTA 1GTIA 2GSRA 2IFQB 3MAKA 4N30A 2H74A 4AJ6A 1EGOA 1SJ6A 1OAZA 1HYUA 2C3TA 1ERVA 1OC8A 3L78A 5DQSA 3IOSA 1DE1A 2OADA 1SENA 4BA7A 2H66A 3ISOA 2R37A 2EIOA 1A0FA 3IK9A 2H71A 4PQHA 4TXVA 4CHSA 3GKMA 1O81A 3TCOA 1EP8A 2WGRA 2DBCA 2CVKA 4POLA 1B4QA 4JR6A 1F3BA 5AGYA 3W8JA 2K6VA 3HD5A 3TKRA 4GLTA 2VD1A 4MCUA 1VF3A 1QQ2A 3HDCA 1S3AA 4OFTA 1U6TA 4JZQA 5DJLA 1AXDA 2C3NA 2HZEA 2O87A 3TGZA 4PGTA 1ZZYA 2KUCA 3ZVJD 2IMKA 4Q5QA 5J4UA 2H8LA 3F63A 2M72A 2C80A 4V2NA 2GSQA 2H1BA 1A2MA 3BCKA 1Z7RA 3DKSA 3IV4A 4GSSA 5IMVA 4K8MA 5B8AA 3I69A 4IJ3A 3E3EA 2TRCP 8GSSA 4I6XA 1Z7PA 2JZSA 4QL7A 4TW5A 3EE2A 2H6ZA 3F9UA 1W89A 1QXHA 4IVFA 1K0OA 3VWUA 1F6MC 1HQOA 4ISDA 4N10A 2RIIA 5A5KA 2GSTA 5G1KA 1Z6NA 5GAND 2LKUA 1UC7A 3CXGA 3GHAA 2WRTA 3M8NA 5HFIA 3ZRDA 4HI7A 2FNOA 3PR8A 2KHPA 6GSTA 3GX0A 1C72A 1ON4A 4RUVA 3P90A 9GSSA 2ZCTA 1SL1B 3DEXA 2E7PA 1LU4A 1SD8A 3ME8A 3G9BA 3LG6A 2OBKA 3O6TA 1X9MB 2M80A 1TU7A 4GCIA 3HZ4A 2IMDA 4ZL7A 3U5RE 3ZTLA 1TP9A 1GWCA 1K0AA 1ZGNA 1PA3A 3C8EA 3M0FA 2DJ2A 5J9CA 3IXRA 2VL9A 2IWTA 2O7KA 2REMA 4DVCA 2AHEA 1CQGA 4TR1B 7GSSA 1G6WA 4J57E 5EPFA 3CTGA 4KX4A 2I81A 5B7CA 1TRWA 5ECSA 2XHFA 3C71A 4NHZA 4IQAA 3F0IA 1ILOA 1ABAA 5IM9A 4F82A 2WDUA 2YP6A 4ZB9A 2CAQA 3O76A 3P7XA 4PQIA 5IMFA 3A2VA 2YZUA 1E6BA 4O92A 1YJ6A 1JZWA 3HYPA 1ERTA 1HD2A 3C1RA 1PKZA 2AJQB 1U87A 3CSHA 4F2IA 1UN2A 2R5GA 1T4ZA 3GSSA 2VUPA 1XW6A 3EMPA 11GSA 1VF1A 4GSNA 1BX9A 2OJLA 2DC5A 4HS1A 4FIWA 3D22A 1WWJA 3OR5A 3KTBA 4POBA 5IMCA 5E59A 5IMDA 2YN1A 4XS6A 2DJKA 4TR1A 3KZQA 2L6DA 1B9YC 4NPBA 3C73A 1T4YA 1SYXA 4KCEA 3TJKA 2B6MA 4MF6A 4OMVA 5DJMA 4J56E 4OFNA 4POMA 3P2AA 2HE3A 4ZL9A 2PVQA 4PNFA 2K9FA 4WR4A 1AQXA 3DRNA 3VPTA 2H19A 4I2TA 5A4UA 1Z9HA 2YJ7A 1DE2A 1O6JA 3KCMA 2VLTA 3HXSA 3FY7A 2L5OA 2VM1A 5ECHB 4OFMA 1YY7A 1JZDA 2ON7A 1FO5A 4AF2A 1NHOA 4MABA 5IPHA 5AISA 3GL3A 3UL3A 1GUKA 2IMIA 4JEDA 2YV7A 2VOCA 1TKDB 3ME7A 1R5AA 2HXKA 3KJYA 5IO2A 1BYEA 2H1DA 3MSZA 2LQQA 14GSA 3RHCA 3G7JA 3GV1A 4OO4A 1FW1A 3WT1A 3I6AA 3HKRA 3U6VA 1X5CA 2GQMA 4F0CA 4FH8A 3PH9A 2H72A 4EF0A 2N5AA 2CX4A 2OACA 1A2LA 3ZIVA 2DJJA 4YAPA 3GKNA 3DD3A 1UVZA 2BMXA 1SK1A 3KD0A 3NIVA 2J23A 3DWVA 2VD0A 3DGQA 4O5RA 5JCUA 1PD21 2C0EA 3TKSA 4DSSB 5D73A 2D2ZA 4IJIA 5CRGA 6GSYA 1XPVA 1GRXA 3DYRA 2GQLA 1A2JA 3S9FA 3WGXA 1T00A 1X0RA 2H0IA 1B9XC 5ECRB 1OVNA 3F3RA 3BCIA 4MJAA 2I3YA 3M9KA 3MDKA 4L0UA 5CAXA 2C4JA 2H0HA 2I4AA 2TIRA 4HZ4A 4I2UA 2L4CA 1EOHA 2V41A 5B6NA 2E0QA 3WD6A 2F3MA 1ZYQB 3FZAA 1YDKA 3IPZA 4XS4B 1TRUA 4ML1A 4JRRA 3NOFA 4Q5FA 1XWKA 2V2GA 1EV4A 1Z5YE 1PMTA 1X5EA 2YPMA 3GMFA 2LEGA 3SWLA 2MMNA 4KA0A 1QGVA 2QKEA 3RPPA 2R6KA 3VWWA 1K0MA 3E0UA 1X9WB 3N5OA 2NBSA 3KP8A 4PXOA 5KN0A 4OO5A 2AUVA 10GSA 1XIYA 5AN1A 2FWHA 2KOKA 1WE0A 2I1UA 2HFDA 4DSSA 5D9WA 2AB6A 2CA8A 6GSVA 3VI5A 4LA1A 4TKYA 2F9SA 1TRVA 3HJPA 2O85A 1WIKA 3EWLA 2FCHA 4MH3A 4DSQA 2BTOT 2C0FA 2L59A 2DMLA 3BBYA 2I9HA 5ECLB 3PGTA 2B7JA 4KGIA 2NVLA 5FHIA 2L4QA 4XS4A 2B7KA 1K3OA 3GTUB 4MK3A 2YWOA 2GZPA 2VM2A 3GYKA 1ST9A 5G31A 6GSUA 5DCGA 5ECNB 4PUAA 3IA1A 2XC2A 3C7MA 3EU4A 2GT5A 3LJRA 3ZIJA 4K1FA 1Q4JA 1DSBA 5KN3A 2PGTA 1SK0A 2VAFA 3QOUA 2KLXA 2WZ9A 3HCZA 5CRDA 3L0HA 3TJJA 2B1KA 3LORA 2YWMA 3D21A 5F07A 3DVXA 4K0NA 2ZUPA 3W6GA 2A2SA 1R5PA 1V40A 2DMMA 2RUEA 3APSA 5D9TA 2JZTA 3LEFA 2FA4A 2VL3A 3RDWA 2FWEA 3LFLA 2G2QA 1BAYA 4HOJA 4FO5A 5ECQB 2EC4A 3H1NA 2ES7A 2IMEA 4KDUA 2A2RA 4K7IA 1T1VA 2JSYA 1XWGA 2GS3A 3GTUA 5ECPB 1Y25A 4OCFA 4TVEA 3FK8A 2B1LA 4WEYA 3DXBA 2AAWA 4GRFA 4MF5A 4XRDA 3FR9A 2H70A 4ILFA 2P5RA 1YF1A 1DBYA 4IP1A 4KW6A 4IS0A 1AIUA 1EEMA 4K2DA 2MYGA 4V1Ag 4EVMA 1V9WA 3GA4A 2NTOA 3GSTA 3A2XA 5GSSA 3LWAA 4IGJA 1SL2B 3HJOA 2O89A 4WXTA 4LMWA 1EV9A 4EKZA 2H73A 1R4WA 3HY2A 4TXOB 4EDZA 4OWYA 4NWYA 1CQHA 3HJMA 1FOVA 3F6FA 2TRXA 3F6DA 4NMUA 2JL4A 1BG5A 4KDYA 4AJ7A 22GSA 4KSMA 1BQ7A 3L4NA 4ID0A 1RQMA 2JACA 3SBCA 1XVQA 1PKWA 4XTSA 2O8VB 3ERFA 4ZBBA 2CQ9A 3UARA 1U3AA 3G7YA 2X99A 4LMVA 1QFNA 1HNBA 1R26A 1U3IA 2LRNA 3ZFBA 3CYNA 2L6CA 2CVBA 1HNAA 1VGLA 4G2EA 2EIRA 2F8FA 2HT9A 2WJUA 2H75A 3UOMA 4MA9A 1QUWA 1VF4A 1Z6MA 2OE0A 2HI7A 2VIMA 4F0BA 3F4RA 2FUG2 3D4MA 2IJYA 1KTEA 5F8BA 4TXOA 5EVOA 3TOTA 1GSDA 1PN9A 6GSXA 4MPGA 3TJFA 3LGCA 5EY6A 2P5QA 3F4SA 4AJ8A 5GAPD 2OA7A 3IK7A 5CO3A 3FHKA 4HJMA 3UBLA 4HQSA 4E8HA 2VCQA 4GSTA 4KNDA 4GTUA 2YWIA 2RM6A 3FYGA 3G7IA 1JZOA 2QGVA 1N2AA 4BWQA 5IQYA 3Q18A 3KTLA 3RPNA 5KN2A 3LXZA 1K0CA 1V2AA 2PPTA 1JFUA 1TXXA 3IBHA 4I97A 4KSOA 1SK2A 3GX8A 5CRWA 2L5LA 3M3MA 3ZMKA 1U88A 4XIHA 5ECIB 4CW9A 1PRXA 2RLIA 2PBJA 2LQOA 1SKSB 1A8YA 1EWXA 1PSQA 1A23A 5J5NA 4J2FA 4IP6A 3D0ZA 4NV5A 3H4KA 4KDXA 2X8CA 4QL9A 4XHMA 1I5GA 2VCTA 3TJGA 1XCCA 4MF7A 20GSA 2BJXA 1XWCA 4JE1A 4MPFA 2AYTA 2PUKC 1WJKA 1GSFA 1LJRA 1GSQA 4QQ7A 4RQXA 5F06A 1OC3A 4Q5NA 2P0GA 4KE3A 4MZBA 2YWNA 3IC4A 2WS2A 2C1YA 5H5RA 2XBQA 4LL1B 1H4OA 1JLWA 4TR4A 4ACSA 1XZOA 2QSIA 4IN0A 1M2BA 5FWGA 4MMMA 2XPEA 1GSSA 3L9UA 2ON5A 1GNWA 4FYUA 4MZCA 2DIYA 2X8GA 3VWXA 4V2MA 6GSSA 1MDKA 1JLVA 5HR1A 1K0DA 2V6OA 3CRUA 2MMOA 2WULA 2NDOA 1T3BA 1XWBA 2OE3A 3ZYWA 4PX1A 4MH2A 4HU7A 3L9VA 2MBSA 3TKSC 2B5XA 3DVWA 3CSIA 4FYBA 1URMA 2LJKA 4L0WA 1UA5A 4TOPA 1EEJA 3WGEA 1OC9B 3HVVA 4G10A 5IO0A 2FGXA 3TKQA 3TKSE 1A8LA 3FZ5A 3QAVA 4HQZA 1J9BA 5ENUA 1OKDA 5HR3A 1JHBA 2XPDA 4DSRA 4N0ZA 1M99A 3DMLA 5F05A 2VLVA 4IQ1A 1WPIA 1BJXA 1AC1A 3ZREA 1AW9A 3UVTA 2LRCA 2HZFA 2YJHA 3TDGA 3ED3A 1VRSD 1B8XA 3A5WA 1OKTA 3LQ7A 2VCXA 3ZITA 5CP1A 2DJ1A 4CDOA 2C0GA 1MD4A 3JCML 2GZZA 2GDRA 2ZNMA 4KB3A 2H30A 4EC0A 2YV9A 3KH7A 1KNGA 1TI1A 4G9HA 3EC3A 1SJZA 4KUNA 4K7NA 3APOA 1OC9A 2VL2A 3RHBA 3HVXA 3KMNA 1TTZA 3F8UA 2CAIA 4WBJA 2F8AA 4ZB6A 4IW9A 2F51A 3EU3A 2IIYA 4L5OA 3HA9A 1Z3EA 3QFBC 1YKAA 3KXOA 1AUCA 1PL1A 2CX3A 2LJAA 3QCPA 1AAZA 1B48A 3E9JB 3WGDA 3TRXA 3IR4A 2XBIA 3FKFA 2IL3A 5JWQB 1T7PB 1K3YA 2X64A 4G19A 1FB6A 2VCZA 4KAEA 2RM5A 1Q98A 4HDEA 4V2LA 5HR0A 3AY8A 4XCSA 5DAKB 1X5DA 1YZXA 1YQ1A 3A2WA 4YH2A 5LD0A 5D9VA 2KP2A 5IMZA 3UBKA 3J7Yk 4N11A 5D8IA 4WETA 4HUAA 3A3TA 4IHUA 1GULA 4EXJA 3O3TA 3J7Yb 1NM3A 3BJ5A 1PX7A 1FVJA 5FT3A 2L57A 3GKKA 4MP4A 4BVXA 2GGTA 5IOXA 1BEDA 2MZCA 3KMOA 5A4VA 3FW2A 5L71A 2CV4A 1M7TA 3KGKA 4TR0A 5ECKB 4OD7A 2X8HA 2VLUA 4EDYA 1ZOFA 3VURA 3RBTA 5J9BA 3QAGA 5ECMB 3QDNA 4WF4A 2DJ3A 5DQYA 1GLPA 4LL4B 4GWRA 4HJ2A 5IPGA 5LCZA 5JCWA 2HYXA 1TK5B 4ZBAA 2FWFA 3VFIA 4GF0A 3FR3A 4PNGA 3D4TA 4HEA2 1FHEA 2LSTA 2HSYA 5DCHA 5DAKA 3PINA 3EURA 4IKHA 5GSTA 3QMXA 1HNCA 6GSWA 1EOGA 2LTKA 2MMZA 1YEXA 2KP1A 4IBPA 1WOUA 2VCVA 3ZL5A 1G6YA 2HRFA 3ZVJA 4ECBA 1EZKA 4KH7A 3WT2A 5JCGA 4V1Ap 3TOUA 3VPQA 1V58A 1XW5A 1DUGA 3UVHA 2FA8A 3LSZA 4EL1A 2JADA 3ZLPA 4XS1A 1EP7A 3NZNA 4I5QA 1GL8A 1PGTA 4K7OA 5DBQA 3UJ1A 2LNTA 4Z7XA 1F2EA 2HLSA 3APQA 3IAM2 2H0GA 1M9AA 2GSSA 3HHVA 1XVWA 2LRTA 2PVOC 3TB2A 2FWGA 3BD2A 3ZFLA 1MD3A 1TDIA 3IAS2 3LXTA 1QMVA 4F03A 4WKWA 3LYKA 3FR6A 4Q5RA 3GIXA 5ABRA 5IMAA 3P8WA 4WR5A 3ZZXA 4ZL8A 2R4VA 1GSUA 5C04A 3I43A 4N0VA 1GUHA 3LYPA 1GSYA 1S3CA 3CMIA 3L9SA 2DIZA 1A24A 4GQCA 2IFQA 4BWSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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