2P0GA

Crystal structure of selenoprotein w-related protein from vibrio cholerae. northeast structural genomics target vcr75
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
78
structure length
78
Chain Sequence
KAQIEIYYCRQCNWMLRSAWLSQELLHTFSEEIEYVALHPDTGGRFEIFCNGVQIWERKQEGGFPEAKVLKQRVRDLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Selenoprotein W-related protein from Vibrio cholerae.
rcsb
molecule keywords Selenoprotein W-related protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Vibrio cholerae
total genus 22
structure length 78
sequence length 78
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10262 Rdx Rdx family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2p0gA00
3RDWA 4OMVA 5H5SA 5G5FA 3IAS2 1GSFA 1YF0A 1TKDB 2V32A 2A2RA 1HNCA 1O8WA 3DMLA 2LJRA 2KUCA 4YAPA 1XWBA 1ON4A 13GSA 3F6DA 2LNSA 2GDRA 1T4YA 1B48A 2V2GA 4V1Ap 3A2XA 2GLRA 3ZVJD 1XWKA 4WF4A 1A2JA 1FB6A 1Z6MA 4ECCA 3GH9A 1Z3EA 3KCMA 1R7HA 1J0FA 2OBIA 1OAZA 1YEPA 1U6TA 2VLVA 2YJHA 2H6XA 5ECOB 4K7OA 2IMEA 4IJ3A 4BWSA 2YN1A 3VPQA 1A2LA 4NHZA 4XS6A 3KD0A 1M7TA 2MMAA 2JZTA 2OE1A 2A2SA 3DVWA 5DALA 4BA7A 1MDKA 2LNTA 2PMTA 3I43A 5C04A 2XC2A 1GSYA 3ZITA 3RAZA 5J3RA 5COHA 2CV4A 2YZUA 2G2QA 5J9CA 3LWAA 1G7OA 1NSWA 3C8EA 3UMAA 2EIQA 3PGTA 4HEA2 1X9WB 5D9VA 2VL2A 2DJ1A 1THXA 5CRGA 5HFGA 2CVKA 5CP1A 5E59A 2WDUA 2VD0A 3VI7A 4HU7A 4GQFA 2H0IA 3VK9A 4FIWA 1SKWB 5GAPD 3GIXA 3O3TA 1Z7PA 4MF6A 4I6XA 3E0UA 4RUVA 4GSSA 3GSTA 2JU5A 1PSQA 3KEBA 1NM3A 2IWTA 2I3YA 1T4ZA 5ELGA 4XS1A 2AAWA 5IOWA 2GZPA 2HFDA 4PQHA 1TI1A 3IE3A 2AHEA 3DRNA 4ISDA 3RBTA 3A5WA 4HZ2A 2GSRA 4RQXA 3BCKA 3SWLA 4GQCA 1TP9A 1CQHA 4RQRA 4F2IA 1K0AA 2OJLA 3CYNA 4O32A 1EGRA 1Y6EA 5FT3A 2KHPA 2H19A 3GTUA 4EXJA 4MZCA 2GQKA 1X9MB 1FO5A 2YZHA 1E2YA 4GTUA 1FW1A 1O8XA 3GL3A 3HZ4A 2AJQB 4MH2A 2LEGA 3EMPA 4GLTA 1XVWA 4K0GA 1MDJA 1CQGA 2X8CA 3TKSC 3H79A 3U5RE 1WRYA 1FHEA 1WWJA 3UVHA 3F3RA 3APOA 1AQVA 2KLXA 1EGOA 3TCOA 3VWXA 1QQ2A 4TR4A 4G9HA 2V41A 4TXOA 4OFTA 1TTZA 2H8LA 3DEXA 3QAWA 4K7NA 2FGXA 4PX1A 5AIXA 6GSSA 2ES7A 3KIJA 1AAZA 1YY7A 1BQ7A 2H0HA 1N2AA 3HJOA 4CDOA 1SJZA 2VLUA 4IP1A 5KN3A 1QXHA 5DQSA 3D22A 3DD3A 3HVVA 1RK4A 3HCZA 2GVPA 5H5RA 4FYCA 5B6NA 1QUWA 1GLQA 2AB6A 2J9HA 5AN1A 1ERVA 2CX4A 2MMZA 2CAQA 2K6VA 17GSA 1A8LA 2DC5A 5KN0A 2X8GA 3SBCA 1EV4A 1XW9A 5D96A 2M46A 1GULA 4V2LA 4MF7A 3N5OA 3WT2A 5IIZA 2VCQA 1Z7RA 4K1FA 2L4CA 1Z5YE 3DXBA 4Z7XA 1W89A 3TRQA 2KP2A 4MMMA 3FY7A 1BX9A 5ELAA 2GSQA 3D4MA 3Q6OA 2VL2C 1PGTA 2EIOA 1EOGA 1AXDA 2QC7A 4MJBA 3HXSA 5G2ZA 2LJAA 2LJKA 4V2NA 3HJPA 1SENA 1F37A 3APQA 1OVNA 1GSUA 1TDIA 3I9V2 3TKSE 1PD21 5J9BA 1AQWA 2DLXA 4YAVA 3LORA 1YF1A 5B6MA 1FG4A 3CSHA 3M9KA 2LTKA 2YWOA 1G6WA 1IYHA 1GH2A 1ZOFA 4MDCA 1KTEA 2L5OA 3GFKA 3HA9A 1X5CA 2A4VA 2V6KA 4NAXA 2FWHA 2XPEA 4DSSB 4F0CA 4OWYA 1SYRA 2L59A 4OCFA 4KAEA 1ZZYA 3RHCA 3D6IA 1TXXA 3H8QA 5IQYA 3KXOA 3VLNA 2N5FA 2FY6A 5HR3A 1AQXA 2IFQB 4BVXA 4TR1B 3KGKA 1HNAA 2B5EA 2YCDA 2M80A 1R26A 4I2UA 1A8YA 1V57A 4ACSA 3CSIA 3I6AA 3GUSA 2HT9A 1XCCA 2CZ3A 3G7JA 1HQOA 2WZ9A 8GSSA 3WGDA 4ZILA 3ISOA 4LL1B 4FH8A 3ZVJA 1WP0A 4YQUA 4IP6A 1BG5A 5HQPA 4WR4A 1PL2A 3GNJA 3LFLA 2VOCA 3DIEA 2X64A 4EE0A 1QMVA 2R6KA 3GH6A 1GTBA 1K3OA 1BJXA 4KDXA 5IMAA 1FVKA 1PQNA 3FR9A 1O81A 2OA7A 4H86A 4ECIA 18GSA 4IBPA 2LSTA 1T00A 2C1YA 4MJCA 1JLWA 2AYTA 2RUFA 5GAND 3QAVA 1LBKA 2HRNA 5FHIA 2XBIA 2CVBA 2ON5A 1LU4A 1PKZA 3KP8A 2H73A 1B8XA 1AC1A 3CTFA 4NXIA 3MNGA 1R5AA 2GZZA 4TW5A 2IMKA 2VL9A 2WB9A 4I2TA 3KZQA 2TRCP 4IQAA 4ZBDA 3L9VA 4KW6A 3ME8A 5EPFA 3MWHA 2O7KA 3IAM2 5DCHA 2I9HA 2C0EA 3EYTA 1SJ6A 2MYGA 3FK8A 2JL4A 4MH3A 1WPIA 4FYBA 2LQOA 2PU9C 1S3DA 2NDOA 1GSSA 4ZB8A 5LD0A 3GN3A 3GURA 1PRXA 3VPTA 1SU9A 3UIWA 5DVBA 4EVMA 1SJIA 4K9ZA 2VCVA 5D73A 3EC3A 5HFKA 2YWIA 4JRRA 3QAGA 4J2FA 4K2DA 4TOPA 1YEXA 4KDYA 5J4UA 4L5LA 4TR3A 22GSA 3M3MA 5H5QA 2FLSA 3C7MA 5IPGA 1TK5B 2B1KA 4FO5A 3EVIA 4OD7A 1U3IA 4HQZA 1A0FA 2HLSA 5A4VA 3N9JA 1XXUA 1GTUA 2FUG2 3C1SA 2JZRA 3GX8A 2P5QA 4HUAA 4ZBBA 5A5KA 5B8BA 1O6JA 3A3TA 1O7UA 2JZSA 1LJRA 4HDEA 4XIHA 1Y25A 5IMZA 5HR2A 1TOFA 3LJRA 1ACVA 3EINA 1K0DA 3F0IA 3L0HA 1Z9HA 3TKSA 4NPBA 2GT5A 1XVQA 2HZFA 4J56E 2HZEB 4AF2A 5JWQB 3IHQA 1AW9A 2H71A 2IN3A 2OACA 3HYPA 1TRWA 2H74A 1Q98A 4HQSA 1AIUA 1PL1A 4KE3A 5IMDA 1F3BA 3C73A 4IQ1A 4XTSA 3KP9A 4AJ6A 2O89A 3QPMA 1OC9B 2I1UA 1O85A 3D5JA 5EL8A 4HJMA 2R2JA 5J5NA 4K6XA 1ERTA 4F82A 2YPMA 4LLRA 3H4KA 2VM1A 3DYRA 3TJKA 3ZREA 2IPAA 1V9WA 3TGZA 2KP1A 2R37A 3L9SA 1WIKA 1XW6A 3VI5A 2LUSA 1OKDA 1ZCPA 4WBJA 3LXTA 1F6MC 3UARA 3IK7A 4EDZA 4TKYA 1URMA 2GT6A 5INYA 2REMA 3WGEA 2P0GA 7GSSA 5B8AA 1VRSD 2O85A 4KB3A 2MMOA 5HFIA 3K8NA 3ZIJA 2DJKA 4ZIJA 1W4VA 4POMA 4XS4B 3RPPA 2HSYA 3QD9A 1XWCA 2PN8A 3LSZA 11GSA 2C0GA 3GKMA 5IMVA 2B5YA 3BBYA 3GKNA 5EVOA 4PUAA 1GUMA 1SKRB 5ECQB 1OC3A 1TI3A 2GTUA 1MTCA 1EP7A 4ZB9A 1M99A 4I8BA 2OBKA 5DDLA 1C72A 2IMIA 2JADA 1I9DA 2BTOT 6GSXA 2I4AA 4LA1A 1VF3A 3EU3A 1T8EB 3FEUA 2ZCTA 4KGIA 1VF4A 1X5DA 2PERA 2C80A 3ZYWA 4ZL7A 1U3AA 4DSSA 4X0XA 4KNDA 1ZMAA 2TRXA 2H1DA 2E7PA 4QL9A 1PX7A 4KDUA 2XHFA 2IFQA 1MD3A 1K0OA 5DCGA 2K9FA 4TR1A 1ML6A 2JSZA 3UBKA 5LNKe 1XOAA 5KEJA 3OR5A 4BVYA 5F8BA 2VUPA 2H01A 4AJ8A 4IN0A 3NOFA 3IPZA 5ECSA 2PGTA 2FD3A 2B1LA 4OO5A 4DVCA 1BYEA 1HD2A 3RPNA 4X1UA 2GZYA 1K0NA 3A2VA 2FA4A 4EDYA 3QMXA 3HKRA 4YH2A 2GQMA 1THOA 2FHEA 4NMUA 6GSUA 2DMMA 4F0BA 4EC0A 2C4JA 4TR0A 2IMDA 3KH9A 4GSTA 2PBJA 1ZGNA 1U87A 5D9XA 3D4TA 4N0VA 3HVXA 1TRSA 1DUGA 3LYKA 4PNFA 1RQMA 2DIYA 2VCZA 1O73A 3UOMA 1SD8A 5DBQA 2K18A 1GUKA 2VO4A 1WJKA 1S3CA 1SK2A 2PVOC 3G9BA 2N5BA 5IO0A 4XRDA 2OE0A 1TU7A 3J7Yb 2C8UA 1UVZA 14GSA 3F4RA 3TJGA 1T7PB 1FOVA 4QQ7A 1UN2A 4TRXA 2H1AA 4KUNA 3ZMKA 1XWGA 2LKUA 3PR8A 1X5EA 3E3EA 4LMWA 3ME7A 4KSOA 2H75A 2WRTA 2C3QA 4IGJA 4ML1A 4PQ1A 4GSNA 2D2ZA 2NTOA 5D8IA 5F07A 1A23A 1F3AA 3J7Yk 2PVQA 1JLVA 2F8FA 5D9TA 2PWJA 3QFAC 4NV5A 2HE3A 2NBSA 4MZWA 4ECJA 4PNGA 5F0GA 1YJ6A 4E8HA 1M9BA 2WJUA 1SL1B 1RW1A 5IM9A 1X0RA 1M2DA 3DGQA 2B7KA 2K8VA 3F6FA 1XPVA 1EZKA 4P3YB 4RI7A 3W8SA 4HZ4A 4DEJA 1DE2A 3VFIA 2L4QA 3IOSA 2AUVA 3TJBA 3TOTA 3FZAA 1XFLA 4G2EA 4EUYA 6GSWA 1J08A 4PQIA 1ZL9A 2WCIA 1YDKA 4DSQA 3W6GA 2B7JA 1SYXA 3ERFA 3LXZA 3KJYA 4L0WA 4K7IA 4KH7A 5CRDA 5LCZA 2HZEA 1SL0B 3FW2A 4J57E 3L4NA 2ON7A 2JACA 2VLTA 4GF0A 5DAKB 4MJEA 1G0TA 3GKKA 3Q18A 2H1BA 1K0CA 12GSA 3US3A 3TKRA 1ZYQB 1NHYA 2I81A 4N30A 4GXZA 1GLPA 1OC9A 1K0MA 1EP8A 6GSTA 1YKCA 3ZL5A 3EURA 2YP6A 2GSSA 2NVLA 3JCML 4QL7A 3LQ7A 4MCUA 5FWGA 4V1Ag 3VWVA 1R4WA 3M9JA 2K8SA 2C3NA 4G19A 4WBRD 4JE1A 3CRUA 4BL7A 3IDVA 3I69A 2WULA 1BEDA 3ZRDA 4N0ZA 5HR0A 2J23A 3HVSA 10GSA 2C3TA 2LRCA 5ECPB 3KMNA 2QKEA 1XBSA 2FCHA 5ECNB 1TRVA 2L57A 2RM5A 2ZNMA 1XZOA 2HYXA 1GSEA 4XS4A 3NZNA 5JWOB 2H66A 3FHKA 3IV4A 2DJ0A 2B5XA 2C0DA 1TRUA 3GHAA 2H30A 2PUKC 2JSYA 1M2AA 5G1KA 3WT1A 3CXGA 3QCPA 4E8EA 2WGRA 2EIRA 3V1WA 2L5LA 4ILFA 3IC4A 5A4WA 5GSSA 1EV9A 3GYKA 4KX4A 4YQVA 1GL8A 2AV4A 3C71A 4ZBAA 2XPDA 3UEMA 4XCSA 2MZCA 1MDIA 5F05A 1T3BA 2H76A 5GSTA 3FRCA 1OKTA 3UL3A 3FZ9A 3KTBA 1PN9A 3LGCA 2DSAA 4IJIA 4PXOA 3GKXA 2XBQA 5ID2B 3GV1A 2VCTA 4WETA 1V98A 2V6OA 1B4PA 5IPHA 2F51A 4OCEA 5JCUA 4Q5QA 1GWCA 4DSRA 4EL1A 5A4UA 5KN1A 3ZTLA 6GSVA 1WOUA 2MBTA 1ERWA 4O7HA 2YWNA 1HNBA 4POKA 1DE1A 2YANA 1YQ1A 1OC8A 4XRAA 1BAYA 3LEFA 3M0FA 4IHUA 5DQYA 2X99A 3UVTA 1ST9A 4V2MA 1JZRA 3NIVA 1V2AA 1B9XC 1PKWA 3D0ZA 4IS0A 5D93A 4F03A 2N5AA 3F8UA 4RI6A 3A2WA 1V40A 5ECIB 1SKSB 3GMFA 4I5QA 3EU4A 4D73A 2CX3A 4MPFA 3M1GA 2YOIA 1JZDA 3WYWA 3GRXA 5DJLA 5ENUA 3KTLA 2HRFA 3M8NA 2LV3A 2R4VA 1DBYA 2BJXA 3MAKA 1GP1A 3MSZA 1NHOA 3QR6A 1GNEA 3F3QA 2BMXA 1JZWA 4YQMA 2IL3A 2H6YA 5ECRB 3PINA 4PGTA 2R3XA 3GSSA 3CSJA 3Q19A 4PURA 2H70A 1F2EA 1ERUA 2VM2A 5CYYA 5DJMA 3VWUA 4JZQA 4PUFC 1H75A 2R5GA 2DBCA 3IK9A 4O92A 4WF5A 4ULXA 1NW2A 4AJ7A 2M72A 3MDKA 3ZZXA 1GNWA 2OADA 1UA5A 1V58A 3BOAA 2GS3A 3LG6A 5IMFA 5ECMB 4L8EA 5HR1A 3GL5A 4NV2A 2P5RA 3HD5A 3PH9A 1S3AA 1ILOA 3TJFA 1QK8A 3APSA 1TK0B 2ALBA 5L71A 1M9AA 1A24A 1YKAA 2EC4A 3TKPA 5JCWA 2GSTA 3UAPA 2QSIA 2CAIA 2YJ7A 3RHBA 3F4TA 3P8WA 2G0FA 2RIIA 4MP4A 3FZ4A 3TRPA 4CHSA 3KM6A 4L5OA 5IOXA 5B7CA 4KCAA 2F8AA 1EEMA 1XWAA 3QOUA 5CRHA 3DKSA 4G10A 2B6MA 3L9UA 3ZLPA 9GSSA 3FYGA 4O5RA 4ZL8A 3FR6A 4LL4B 2DJJA 4TVEA 19GSA 5C00A 3HJMA 4WEYA 3TRXA 4MABA 1R5PA 3IBHA 4NWYA 1VGLA 4F9ZA 4JR4A 2C0FA 3TB2A 2LRTA 3AY8A 3IXRA 5DAKA 2CA8A 1KNGA 2L6DA 4IKHA 2V1MA 3WD6A 5ECLB 4MJAA 5CAXA 2VL3A 1JHBA 4NHWA 2FWEA 4D73B 5CREA 3ZFLA 3EWLA 3O6TA 1K3YA 3KH7A 2E2GA 2CVDA 1EWXA 2MBSA 4BWQA 1JFUA 5DALB 3ED3A 2LRNA 1FB0A 4WXTA 5IO2A 3BCIA 3FR3A 5GZZB 1GSDA 1TW9A 1MEKA 2RLIA 2YWMA 3CBUA 2YV7A 1Z6NA 2O8VB 1U88A 5G1LA 2O87A 1WE0A 2GQLA 2DIZA 4I97A 2X8HA 4OFMA 1QGVA 2Z9SA 4POLA 1XIYA 1G7EA 4HU9A 5KN2A 1SK1A 5F06A 1MD4A 3W8JA 2DJ3A 2WFCA 2NPBA 1USBA 3ERGA 4TXVA 3HY2A 1UC7A 1PMTA 2CZ2A 4BPYA 3ZIVA 2H0GA 2FWGA 1GUHA 3ERWA 4AGSA 2IJYA 4WKWA 2H1GA 2YV9A 1ZYEA 1WMJA 4HI7A 2KOKA 3WGXA 3P90A 4TN8A 1T1VA 3S9FA 4LMVA 2E2MA 3UJ1A 6GSYA 4K8MA 1XW5A 2LQQA 3KMOA 2F3MA 2FA8A 2HNLA 3QFBC 1SD9A 3GTUB 2VCWA 4X43A 4Q5FA 3U6VA 3P7XA 1IYIA 2HI7A 2VIMA 2DMLA 5ECKB 3TKQA 4N11A 1OYJA 4MPGA 3IR4A 3FZ5A 2IMFA 1TU8A 5JWRB 1GTAA 1DSBA 3H1NA 2OE3A 1VF1A 2TIRA 4EKZA 4JEDA 2CQ9A 4POBA 3CTGA 2VAFA 1K0BA 1B4QA 4TXOB 4OO4A 1FVJA 20GSA 2FNOA 4IVFA 4MLYA 3CRTA 3QDNA 3GX0A 5ID2A 3LYPA 1A2MA 3HZ8A 4Q5NA 2LS5A 2HSHA 5AIVA 2FWFA 4XHMA 4MA9A 1K3LA 3F63A 3C1RA 1EEJA 2CT6A 4JBBA 2VCXA 2OKAA 1FAAA 3HDCA 3BD2A 1SK0A 1M0UA 4MF5A 1GSQA 1B9YC 3L78A 5ABRA 2L6CA 2H6ZA 5ECHB 4Q5RA 4MK3A 2QGVA 1HYUA 1I5GA 3D21A 3Q74A 4L0UA 2HXKA 3H93A 3ZFBA 2RUEA 3TDGA 4JR6A 1M2BA 1N8JA 4KCEA 1F9MA 1TJDA 3R2QA 5IMCA 1JZOA 1E6BA 4EO3A 3DVXA 3ZMLA 3EE2A 4JU5A 5AISA 1GRXA 3G7YA 3E9JB 2F9SA 1ABAA 3FKFA 3TOUA 2RM6A 3TJJA 2WS2A 4HS1A 1H4OA 5D9WA 1X9SB 3HHVA 3CMIA 5J41A 2YNXA 1KEBA 4IELA 3G7IA 5EY6A 2PPTA 3VWWA 4GRFA 5E4WA 1PA3A 4OFNA 2VD1A 1GTIA 4KSMA 1J9BA 2IIYA 1OE8A 3F4SA 3P2AA 3F9UA 5G30A 1VF2A 4ML6A 2E0QA 4WR5A 1G6YA 2B3SA 4KA0A 1EOHA 1SL2B 3DWVA 1A0RP 1PX6A 4ZL9A 1Q4JA 1AUCA 4FYUA 4MZBA 1OE7A 4ZXGA 5G31A 3IRAA 2DJ2A 3O76A 4CW9A 2P31A 3IA1A 1TK8B 5CNWA 5CO3A 3VURA 5JCGA 3UBLA 4K0NA 4ID0A 1KBNA 4IW9A 4N10A 1QFNA 4EF0A 4ZB6A 3TUEA 4GCIA 16GSA 4HOJA 2ZUPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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