2P0GA

Crystal structure of selenoprotein w-related protein from vibrio cholerae. northeast structural genomics target vcr75
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
78
structure length
78
Chain Sequence
KAQIEIYYCRQCNWMLRSAWLSQELLHTFSEEIEYVALHPDTGGRFEIFCNGVQIWERKQEGGFPEAKVLKQRVRDLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Selenoprotein W-related protein from Vibrio cholerae.
rcsb
molecule keywords Selenoprotein W-related protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Vibrio cholerae
total genus 22
structure length 78
sequence length 78
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10262 Rdx Rdx family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2p0gA00
5F07A 1SKSB 1JFUA 3GUSA 3FZ9A 5CRHA 4TR3A 1EV4A 2ZNMA 4I8BA 2HZEA 4OFNA 4Q5RA 2GSSA 2YWNA 3D22A 4AJ7A 1Q98A 1GSDA 2WCIA 1HQOA 3Q74A 4KH7A 4GXZA 1A23A 2B3SA 1E6BA 2VLTA 4HOJA 2VO4A 2VD1A 1TI3A 4K1FA 3KMNA 5G30A 3F9UA 3D6IA 1HD2A 4FYUA 3IR4A 3A2XA 4MABA 4ECJA 1QXHA 1GWCA 3P8WA 1R26A 3M3MA 3GX0A 3TRXA 5EPFA 2H01A 2V32A 2CZ3A 4K0GA 3LFLA 4XIHA 2IIYA 3BJ5A 3C71A 4XS6A 3KD0A 5IMVA 5H5QA 4I2UA 3A5WA 1YKCA 2VM1A 4O7HA 3CSIA 5LNKe 1S3AA 2YCDA 1OC8A 2B5XA 1BQ7A 4GRFA 3P7XA 3IC4A 3I43A 2IMKA 4MMMA 5GZZB 3F3QA 3O6TA 3HZ4A 1B9YC 12GSA 3DRNA 3HVXA 2YP6A 4ECIA 4WBRD 1FHEA 1TKDB 5F06A 1BYEA 3FYGA 3TKSC 2J9HA 1DSBA 3UEMA 2E2GA 1GNEA 1TI1A 2P5QA 1XXUA 4MDCA 2I4AA 3H4KA 2H70A 2A4VA 4PUAA 1Z6MA 5ECNB 2YPMA 1SK2A 6GSUA 3KP8A 3IDVA 2K8SA 1U3IA 3F4SA 2LRCA 4HZ4A 1FVJA 1MD3A 3QFAC 1ZMAA 3M8NA 1O81A 2G0FA 5ECSA 5JCGA 2IFQA 4QL9A 1XIYA 2ES7A 3HCZA 1Y6EA 5ECLB 1SJ6A 5HR3A 4MLYA 5KEJA 3U6VA 1K0MA 3N5OA 6GSWA 2VCVA 3A3TA 2CX4A 3LGCA 5J4UA 3GTUB 3TKSA 13GSA 2GQKA 4PQ1A 5AN1A 2DJKA 4KDXA 4DSSB 4NXIA 1XW9A 5JCUA 1QGVA 1YDKA 1CQHA 3PR8A 5HR1A 3L4NA 3TJBA 3F63A 2H1AA 3P90A 2CZ2A 4RUVA 1LBKA 2YNXA 1Z6NA 4AJ6A 2C4JA 3ZRDA 3D0ZA 1AC1A 4N0VA 1EGOA 4MZWA 2IMEA 5CO3A 1MDJA 2L4CA 2Z9SA 1G6WA 4JRRA 1TXXA 3GV1A 4KDUA 3TRQA 2R37A 4MK3A 2LNSA 2XPEA 1ILOA 5KN1A 2HXKA 2WS2A 1VF2A 1U6TA 1UN2A 3E0UA 5A4WA 4XRAA 3ED3A 4E8HA 4EVMA 2NVLA 4PNGA 3LWAA 3CSJA 3QCPA 5B6MA 2H75A 5KN0A 4NV2A 1ZCPA 2REMA 4GF0A 2A2RA 2HT9A 1MEKA 1FB0A 1F6MC 2ON7A 2GS3A 4K7IA 3QPMA 5D9TA 1OYJA 5ECHB 5COHA 5B6NA 4V1Ap 1G7EA 4G10A 3TKRA 2VL2A 2ZCTA 3KMOA 2YZUA 3ZFLA 5ELGA 4KSMA 4KUNA 2VM2A 3IOSA 1CQGA 5IO2A 3UL3A 1PA3A 1XBSA 3BBYA 2VCXA 5CRWA 1MTCA 2C0GA 3ZVJA 2GZPA 4EDYA 3CRUA 1KBNA 2H0HA 1IYIA 4FYCA 5IPHA 1JZRA 3O76A 2YZHA 3R2QA 3WYWA 1J0FA 3ZVJD 1Z7RA 4AJ8A 1GSFA 2O8VB 4FIWA 4TKYA 4ZL9A 1SK0A 2OJLA 2G2QA 3DGQA 1AUCA 4GSNA 3MDKA 3QAVA 2NTOA 1GL8A 2IL3A 4H86A 1O6JA 3GSTA 5HQPA 2B1KA 1LU4A 2F8AA 1PSQA 2NDOA 1NHOA 5INYA 3V1WA 2LKUA 2WFCA 1QUWA 4K9ZA 4ZIJA 1JZOA 1LJRA 1ERTA 2OBKA 4ZILA 4NHZA 4WR4A 3NOFA 2WB9A 3ZL5A 2CQ9A 1BAYA 1WOUA 5CP1A 2R5GA 3VK9A 5A4UA 3C1SA 4YH2A 2JZSA 1R4WA 4PURA 4OO5A 1K3YA 2L5OA 1BJXA 4BVXA 6GSYA 5HFKA 4F03A 1PX6A 20GSA 2VL9A 3RAZA 5ID2B 1X9SB 2N5AA 2EC4A 2YN1A 3GSSA 3I6AA 1K0DA 3VI5A 3TUEA 2K8VA 1TU7A 1VGLA 2LQQA 4CDOA 3CYNA 3FY7A 1YKAA 2PVQA 1EOGA 1G0TA 1YJ6A 1ACVA 3K8NA 3D4TA 3DXBA 1OC3A 3L0HA 2F9SA 1K3LA 3IPZA 4TOPA 2H74A 4KX4A 4LA1A 2VCTA 5CREA 2FLSA 1TRVA 5CRDA 3EC3A 2VD0A 1GLPA 2HNLA 4V2MA 3FZ5A 3LJRA 3WGEA 3ZMKA 1M2BA 4MA9A 1IYHA 3C1RA 3E3EA 1TDIA 1T3BA 1XWCA 2AAWA 3ERWA 4NWYA 3TKQA 5C04A 4MZCA 3EU4A 4IJ3A 3P2AA 3D21A 3L9UA 4IJIA 3UIWA 1MDKA 3EWLA 4TR1A 3VPTA 1B8XA 2MZCA 3AY8A 3RHBA 2RUFA 3U5RE 2OA7A 3H93A 2X99A 3GHAA 1WMJA 3MSZA 3DIEA 2OADA 1JLWA 1SKWB 3QAWA 1URMA 2RLIA 4HI7A 4DSRA 2TRCP 1V58A 4POBA 3BOAA 3M9JA 7GSSA 2M46A 3LEFA 4RQXA 2ZUPA 1WWJA 1Z9HA 2HI7A 22GSA 5IO0A 1O7UA 2YJHA 1O73A 4K8MA 1JZWA 4YAVA 1AQWA 3DVWA 4L5OA 2H66A 3FR6A 4IQ1A 2YV7A 3ISOA 3HKRA 1KTEA 2L59A 3A2VA 5ECOB 3HY2A 4LMVA 3VI7A 3PH9A 2N5BA 3GL3A 3ME8A 3G7YA 3EMXA 2JU5A 3LYPA 2H71A 1PKWA 1WPIA 2X8HA 2D2ZA 3EINA 4BA7A 3M9KA 2FNOA 5DJMA 2DSAA 3W8JA 1HYUA 1M9AA 3IBHA 5B8BA 2L57A 1XCCA 3IRAA 2YWIA 3CTFA 1NHYA 1GP1A 3NZNA 3GX8A 4GQCA 2CAQA 3Q18A 4WBJA 5H5RA 4IW9A 2IN3A 3UVHA 1EGRA 4O32A 1FG4A 2KLXA 3VLNA 4K7NA 3PINA 1PN9A 5G5EA 2KP2A 3ERGA 2H76A 5IMAA 1M0UA 2WGRA 1X5CA 1XWGA 2IMFA 2O89A 2AJQB 1GSSA 1QMVA 3WD6A 5ABRA 3VWWA 2GZYA 4FO5A 2HRNA 4TW5A 4TXOB 4MPGA 1EP8A 1T1VA 2KP1A 2LQOA 2N5FA 2CVBA 1RW1A 2RIIA 3SWLA 4ACSA 3QDNA 2GGTA 1ML6A 2LJKA 4WXTA 3FKFA 1EWXA 1C72A 2LJAA 3I69A 5CYYA 1PQNA 5ID2A 2C0EA 4X0XA 4JR4A 2K9FA 1PMTA 1TW9A 1XOBA 2ON5A 3VURA 4XS4B 3TGZA 4WEYA 4ZBAA 2CX3A 3IA1A 3VWXA 1T4YA 4N30A 2HSYA 2R3XA 1EOHA 1DE1A 4WETA 3H8QA 4OD7A 4ILFA 3DVXA 4K2DA 3EE2A 5DAKB 1KEBA 1DUGA 3Q19A 1OC9B 2C1YA 3APQA 4ECCA 2H0GA 2JACA 2RUEA 3KH7A 1U88A 1USBA 1W4VA 4G9HA 3FW2A 3UBLA 2GT6A 1GTAA 3BD2A 4IBPA 2C3QA 3ZMLA 4ZB8A 2GQMA 3DWVA 4EUYA 1PRXA 1F9MA 1A2JA 3ZLPA 3GFKA 2FWFA 2JZRA 1GLQA 2CA8A 2IMDA 4EKZA 1FB6A 1EZKA 2I1UA 1K0BA 2PUKC 1ZGNA 1E2YA 2AB6A 2L5LA 4MJEA 3DD3A 1PL1A 5LCZA 3GN3A 4IHUA 2LRNA 2QC7A 4BPYA 4ZL8A 4ML6A 2HRFA 4WF5A 1XPVA 2EIOA 1XOAA 5G1KA 2JADA 2H1BA 1YF0A 3QMXA 3HXSA 3DYRA 4IP6A 2C3NA 2GSTA 3FEUA 3PGTA 4AGSA 4GSSA 1B4PA 2DLXA 5A4VA 4JE1A 1K0OA 5DALB 2H1DA 2XPDA 4K7OA 1TOFA 4G19A 4HS1A 2LUSA 4NV5A 3DEXA 3JCML 3TKSE 4YQMA 5D8IA 2AYTA 2OE0A 4EXJA 2MMOA 1GSEA 1WE0A 3IV4A 2FWGA 3FR9A 5IMFA 3NIVA 4HEA2 2CVKA 2VCQA 5ECRB 5DCGA 4HUAA 4X43A 5GSTA 3C7MA 3WGXA 3HD5A 1GSQA 4QL7A 2DJ2A 2I9HA 1I9DA 1WRYA 2JZTA 3VPQA 1Y25A 1JZDA 4Z7XA 5EL8A 3KP9A 1OE8A 1PKZA 1TJDA 1AW9A 4ZB9A 1FAAA 2DIZA 2HFDA 3HVSA 1EV9A 3BCKA 5DQSA 2LJRA 1XWAA 4QQ7A 1T8EB 1B9XC 2IJYA 2BTOT 16GSA 2RM6A 5B7CA 4KA0A 2HZEB 1A2LA 3W8SA 4POLA 3CSHA 3KZQA 2QSIA 2DJ3A 1M9BA 4JU5A 4KB3A 4IVFA 3LSZA 3GKXA 1BG5A 2WRTA 2DBCA 1XWBA 2L6CA 4TXOA 4O5RA 1YEPA 4PUFC 1TRSA 2PU9C 5DQYA 1WP0A 14GSA 4HJ2A 4IGJA 2XBIA 2JSZA 1X5DA 2OE1A 5G2ZA 3HZ8A 3GKKA 2IMIA 4KGIA 3GKMA 1SYRA 5IMDA 1GTUA 5IMZA 10GSA 3IE3A 4DSQA 4NAXA 2PPTA 1AQXA 3G7JA 4K6XA 1J08A 3FZAA 4RI7A 2H8LA 1RQMA 2MYGA 2MBTA 4J2FA 3IHQA 4IQAA 3GA4A 3M0FA 3KEBA 1A8LA 5F8BA 1SYXA 2MMNA 1V2AA 3EMPA 1V9WA 4EL1A 2GLRA 3HDCA 1TK8B 1RK4A 5DAKA 2MBSA 1K0NA 2XBQA 2DJ0A 1M2DA 1OC9A 3D5JA 2YOIA 2TIRA 3RPNA 3QR6A 5J41A 4J57E 1UC7A 2YANA 3CRTA 3CBUA 4ZBBA 4HDEA 4EE0A 5IIZA 4HJMA 4KE3A 2B1LA 1MDIA 4V1Ag 1U3AA 1EP7A 2DJ1A 4L5LA 2LTKA 1GUKA 2FCHA 2V41A 5FHIA 4G2EA 3GTUA 2C0DA 4XRDA 4MH3A 17GSA 3ZFBA 4DSSA 2PVOC 1AAZA 1ERVA 5JWOB 2O87A 4PXOA 4LL1B 2KOKA 4NMUA 1QFNA 1N8JA 1SKRB 1GTIA 3HYPA 2FUG2 4BL7A 2MMAA 4WKWA 3F6FA 2WDUA 3GMFA 3F4RA 5ECMB 1TRWA 2OKAA 1O85A 3TOTA 4HQZA 4TXVA 3VFIA 4FH8A 3GL5A 4IN0A 3TJKA 4MJAA 5DALA 2GVPA 5AIVA 2KHPA 2IPAA 4V2NA 4MJCA 5C00A 3IXRA 2V6KA 8GSSA 1PGTA 4GWRA 4IELA 3UBKA 3J7Yk 4N11A 3FR3A 5GAND 2EIRA 4TVEA 5D9XA 4RI6A 3GH6A 2C0FA 4J56E 4XHMA 3UJ1A 1W89A 4EF0A 5IQYA 2VUPA 2FA4A 4JBBA 4KCAA 4TN8A 3RPPA 5LD0A 1SD8A 2KUCA 1XZOA 4MF6A 3UARA 2GDRA 2V2GA 2P31A 3N9JA 3IAS2 3UAPA 4EC0A 4PX1A 1XW5A 4MPFA 4O92A 1SL1B 4F9ZA 5D9WA 1PD21 3APSA 1NW2A 1WJKA 1UA5A 6GSTA 5CRGA 5GSSA 2A2SA 1GSUA 2H6YA 3KM6A 2MMZA 2B5EA 2FWHA 2O85A 2F51A 3KCMA 3FHKA 4BVYA 1M2AA 2AV4A 3KH9A 1K0AA 19GSA 1XVWA 4KAEA 4TR4A 1B4QA 1OVNA 2VLVA 3OR5A 2F3MA 1GH2A 2XHFA 2PGTA 1VRSD 2PBJA 4ULXA 4X1UA 4EO3A 2I81A 5E4WA 1F3BA 3UMAA 2CV4A 2LS5A 1TK5B 2H73A 5CAXA 2PERA 3CMIA 4WF4A 4DVCA 1SD9A 1YZXA 3F8UA 2GSRA 3F0IA 3EYTA 1V98A 4Q5NA 4ML1A 4I6XA 1A2MA 1X5EA 2YWOA 3GKNA 3GRXA 3C8EA 1THXA 4MF5A 3M1GA 2V1MA 1QQ2A 3RHCA 4KNDA 5KN2A 4POKA 3G7IA 5IOXA 1BEDA 1I5GA 1O8XA 3I9V2 1OAZA 2L4QA 2FWEA 4F0CA 4K0NA 3KTBA 1SJZA 2LNTA 4OWYA 1R5AA 3H79A 5J9BA 4F0BA 3KXOA 3UVTA 4OFMA 4PQIA 2VCZA 3W6GA 1YQ1A 2NBSA 3TJGA 5ELAA 5ECIB 2NPBA 4F82A 1PL2A 3ERFA 1N2AA 3IK7A 3SBCA 2M72A 2PWJA 2WULA 4HZ2A 5G31A 4IKHA 1M99A 3MNGA 4HQSA 1GUHA 4Q5QA 4N10A 1GSYA 3LXTA 6GSXA 1HNAA 1PX7A 3DMLA 1OKDA 4MJBA 1YF1A 5FT3A 4GTUA 4L0WA 5DVBA 4RQRA 1FW1A 3DKSA 4POMA 2J23A 3L9VA 4F2IA 1U87A 11GSA 4OCEA 5D9VA 4D73B 4XS1A 2X8CA 2QKEA 5AIXA 1S3CA 1HNBA 2X8GA 4KSOA 1GUMA 3US3A 2E7PA 3F6DA 2CAIA 3CTGA 1X9WB 3EURA 5DCHA 1EEJA 4L8EA 3E9JB 4JZQA 1GNWA 4YQUA 2YWMA 4L0UA 3QFBC 3D4MA 1XFLA 1ZYQB 2R6KA 4DEJA 3FRCA 1MD4A 4ISDA 4BWQA 1ZOFA 1T4ZA 2K6VA 3J7Yb 4AF2A 4YQVA 2X64A 1KNGA 1V57A 2HSHA 4P3YB 4FYBA 2BJXA 3QOUA 1ABAA 4MF7A 2H19A 3F3RA 1EEMA 2P0GA 3HHVA 3TCOA 4CW9A 2VL2C 5FWGA 1OE7A 3FK8A 3FZ4A 3TJFA 2B5YA 1VF4A 5F0GA 2H6ZA 3UOMA 3TB2A 4OCFA 3APOA 2IWTA 2BMXA 1THOA 1TRUA 1AIUA 5G1LA 4V2LA 3HJOA 2FHEA 1NSWA 2E0QA 2LV3A 2GT5A 3ZIVA 1K3OA 1FOVA 3GH9A 1SL2B 5H5SA 2LRTA 5JWRB 6GSVA 3L9SA 2I3YA 1S3DA 3H1NA 4TR1B 2H30A 4PQHA 1DE2A 1TK0B 3TJJA 5J3RA 5AGYA 4MH2A 3ZTLA 4TR0A 1ZYEA 5F05A 4ID0A 4BWSA 2AHEA 3O3TA 2VAFA 2GSQA 5JWQB 3ZREA 5D93A 3LQ7A 5D96A 1V40A 2ALBA 2VOCA 3MWHA 1GRXA 1G6YA 4IS0A 5HR2A 4YAPA 1NM3A 2GTUA 4N0ZA 4XTSA 5EY6A 2R2JA 1XW6A 4KCEA 2EIQA 1HNCA 2CT6A 2HLSA 4KDYA 4NHWA 5ENUA 2VLUA 1TU8A 4EDZA 5DDLA 3HJPA 3ZYWA 4WR5A 4MZBA 3LG6A 1F3AA 3LXZA 1UVZA 3L78A 4OFTA 5JCWA 1XWKA 3HVVA 4MP4A 4ZXGA 2FA8A 2YJ7A 1Z7PA 3Q6OA 5B8AA 4Q5FA 2E2MA 2QGVA 2RM5A 1O8WA 1TTZA 5ECKB 3G9BA 4JEDA 2L6DA 5ECPB 1TP9A 2VL3A 2F8FA 1ERWA 1SU9A 3QD9A 3GYKA 1ZZYA 2DMLA 1QK8A 2VIMA 5HR0A 3KJYA 3IAM2 1H4OA 4HU9A 2H0IA 1SENA 1GULA 2H72A 2XC2A 4ZB6A 4GSTA 5D73A 5G5FA 2DIYA 1X0RA 4ECBA 5IMCA 1X9MB 2DMMA 5J5NA 2B7JA 2O7KA 2C8UA 1YEXA 4XCSA 1SL0B 5DBQA 1SK1A 4MCUA 4XS4A 1T7PB 3LYKA 5L71A 3LORA 3GNJA 1AQVA 1GTBA 2TRXA 4KW6A 3TOUA 4IP1A 1R7HA 1T00A 4OMVA 2OE3A 1M7TA 3TRPA 2LSTA 4OO4A 5AISA 2CVDA 3TDGA 3WT2A 1B48A 3KIJA 3ZIJA 4D73A 1Z3EA 5CNWA 5E59A 5HFGA 4I2TA 3ME7A 2R4VA 4I97A 5IPGA 5GAPD 2WJUA 4GQFA 3IK9A 2LEGA 1A8YA 1XVQA 1R5PA 4LL4B 2AUVA 3EVIA 1BX9A 1J9BA 4I5QA 5KN3A 2C80A 1WIKA 3RBTA 2H1GA 2P5RA 2GZZA 3KGKA 4GLTA 2HYXA 2K18A 4ZBDA 1A24A 5A5KA 1ON4A 3GURA 3ZITA 2H6XA 4GCIA 5IOWA 1F2EA 1A0FA 1ERUA 5DJLA 2JL4A 3GIXA 4ZL7A 1ZL9A 2M80A 4JR6A 4PGTA 2V6OA 3VWUA 1H75A 1FVKA 2IFQB 1JLVA 2HE3A 2YV9A 3WT1A 2FY6A 3HA9A 3A2WA 4NPBA 1F37A 1G7OA 3MAKA 3VWVA 1Z5YE 2WZ9A 5J9CA 1AXDA 3WGDA 5EVOA 3C73A 1VF1A 9GSSA 18GSA 5IM9A 6GSSA 2FGXA 3EU3A 3RDWA 1K0CA 2GQLA 2DJJA 4E8EA 3HJMA 5ECQB 2DC5A 2OBIA 2PMTA 2B6MA 2VCWA 3KTLA 4PNFA 2OACA 3S9FA 4LLRA 1OKTA 4CHSA 4HU7A 2B7KA 3QAGA 1YY7A 1DBYA 3ZZXA 1A0RP 2FD3A 5HFIA 2PN8A 2C3TA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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