2A2PA

Solution structure of selm from mus musculus
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
MTNYRPDWNRLRGLARGRVETCGGCQLNRLKEVKAFVTEDIQLYHNLVMKHLPGADPELVLLSRNYQELERIPLSQMTRDEINALVQELGFYRKSAPEAQVPPEYLWAPAKPPEEASEHDDLEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mus musculus
publication title NMR Structures of the Selenoproteins Sep15 and SelM Reveal Redox Activity of a New Thioredoxin-like Family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Selenoprotein M
total genus 22
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08806 Sep15_SelM Sep15/SelM redox domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.50 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2a2pA01
2A2PA 2A4HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CP1A 1OKTA 4TXOB 1H75A 3APOA 4E8EA 2MMAA 1TRVA 1MDJA 4GTUA 2EIQA 20GSA 1TXXA 5IOWA 1YF0A 4XCSA 3ZL5A 2DKHA 4V2NA 1OE7A 1S3CA 2X8HA 2DJ2A 2LJRA 1SD8A 1SYXA 1YEPA 4XIHA 2Z9SA 2BTOT 2A4VA 2NVLA 3TJFA 4RI6A 5EL8A 4YAPA 5B7CA 1G6WA 6GSXA 4XTSA 4V1Ag 2CZ3A 5JWQB 4TR1B 2LJKA 2GT5A 2LNTA 1J0FA 3GFKA 5HFKA 4ZB8A 2P0GA 4KNDA 4KCEA 4NV5A 4JEDA 4K2DA 4KSMA 5GAND 4JE1A 2VD1A 2OE1A 5ECOB 1K0OA 5D9TA 5DBQA 4JR4A 1G7OA 4CY6A 3CTFA 3L9SA 3PR8A 4MH2A 2VOCA 2OBIA 2VIMA 1U87A 1WMJA 1O85A 3KD0A 5H5RA 4L8EA 4P3YB 2FNOA 3FKFA 2L4QA 1UC7A 1TRUA 2ZCTA 3KMNA 1BQ7A 4OO5A 5GAPD 5B6NA 3QFBC 2B3SA 4EKZA 2WRTA 2AUVA 3KCMA 4IJ3A 1TK8B 1K0AA 3KIJA 1AIUA 3IC4A 4FH8A 2DBCA 1VF1A 2GT6A 2B5EA 1ML6A 3F3RA 4ID0A 2YJHA 4DVCA 5KN3A 3A5IA 3LSZA 3IBHA 4EXJA 3EU4A 1GSDA 5F0GA 4Z2UA 4MABA 2K8SA 2FLSA 1O73A 3MIXA 1ERUA 5GZZB 2WFCA 1M9BA 2X49A 3MNGA 3DEXA 1KNGA 1OC8A 2M72A 3F8UA 4QL7A 4L5OA 4K7OA 4IS0A 1GP1A 1GLQA 4RI7A 1G0TA 4FYCA 18GSA 2J9HA 1Q4JA 1FVKA 2VLVA 1EV4A 2E0QA 4KGIA 5KN1A 4EDZA 3SWLA 1R5PA 1SENA 4BVYB 4KUNA 3OR5A 3UVHA 1R26A 4WF4A 4OWYA 2CVKA 4KDYA 2FHEA 3IHGA 3KZQA 5IQYA 1PKZA 5CREA 3UOMA 3EVIA 3FZ5A 1OC9A 3IV4A 3HJOA 5DQSA 1Z5YE 2PVQA 3PINA 2DJ1A 5F07A 3TJGA 5AGYA 2H8LA 4MJAA 1F37A 5CAXA 3TKPA 3C1SA 5ECQB 2YZHA 4GSSA 2AJQB 4HJMA 2PWJA 1WJKA 22GSA 5A5KA 2GSRA 4NXIA 4POMA 2HNLA 1XWAA 1F6MC 3HYPA 4KAEA 5IOXA 4TR4A 4OO4A 1FOVA 1A8YA 4NHZA 1FOHA 2VO4A 2K6VA 2GSTA 4WEYA 4ZB9A 1M2DA 1EWXA 2X8CA 2YCDA 2KOKA 1XG8A 2WB9A 4JR6A 4EUYA 3GL5A 1I5GA 5DQYA 1GLPA 1FG4A 5HR3A 2PU9C 12GSA 4BA7A 4RQXA 4DEJA 2B7KA 1PD21 5CYYA 2OE0A 1JZOA 2YP6A 1PMTA 1O7UA 3IHQA 2LKUA 5AISA 2PERA 5IPGA 4WBJA 4H86A 1THXA 5ECKB 5GSTA 5E4WA 1XFLA 2A2RA 3TKSC 1XW6A 3MDKA 2HFDA 4IJIA 2B5YA 2AV4A 4ZBBA 5J9CA 2ALBA 2CAQA 4PQHA 4KE3A 2J23A 3KJYA 1YEXA 3RHCA 3DVXA 3BD2A 4O5RA 4ZILA 2XPDA 3BCKA 4JZQA 1M7TA 4AF2A 3Q18A 3R3EA 4NV2A 1NM3A 1KBNA 5KN2A 1LU4A 4I5QA 1CQHA 3O76A 3ZLPA 4FYUA 3DIEA 4K5RA 5ECIB 3CSJA 4MK3A 4G2EA 3MSZA 1Z7PA 3HVXA 1XCCA 4LMWA 4WR5A 3TKRA 1GSYA 3HVVA 1A24A 4QL9A 5IMVA 2MBTA 5L71A 1ERWA 5CRDA 5KOXA 4N30A 1SL0B 1IYIA 4D73A 4TW5A 3TRQA 3KP8A 4Q5NA 2JL4A 2YWMA 3DD3A 4CDOA 4HSCX 3I69A 2LV3A 2XPEA 3TKQA 4IQAA 2DJKA 2LTKA 3H1NA 1Z3EA 4ZBAA 5DVBA 4PGTA 3DKSA 1ZZYA 3U5RE 4ILFA 1ERTA 2GVPA 4YQMA 4IBPA 5IMDA 2ZUPA 2MMZA 5IMAA 4I8BA 5HFIA 3NIVA 1A2LA 3F6DA 8GSSA 4GRFA 5ECRB 4MJEA 2GTUA 2OBKA 1XOBA 3EYTA 2LRCA 1SKSB 3M8NA 2GQKA 2K18A 5D8IA 3IOSA 4YKGA 2WGRA 1HNBA 2C4JA 2EIOA 4IHUA 1JHBA 2H6YA 2L6CA 4BWQA 4V1Ap 4MDCA 3C1RA 3HKRA 1M2AA 2EIRA 3Q74A 3A2XA 2DSAA 2E7PA 3C71A 2NTOA 4O5QA 2H74A 4J56E 2MMOA 5HR0A 3EPTA 4Q5RA 5J9BA 1EOGA 1OKDA 1PGTA 5EY6A 3DRNA 4KB3A 4MJCA 4MJBA 1B48A 3F4SA 4Z2TA 2N5BA 1TJDA 3LJRA 2F8FA 1K0DA 1O81A 4PNGA 1HYUA 5IO2A 1A2JA 3PH9A 3D4TA 5B8BA 4MPGA 3APQA 5COHA 3LYPA 1XVQA 2PBJA 2DLXA 4ULXA 2N5AA 2ES7A 1YY7A 1DBYA 3G7JA 1WRYA 2HLSA 1V9WA 2N5FA 2VM1A 2A2PA 4ECCA 3P2AA 3KMOA 1R5AA 1R4WA 3I6AA 4TVEA 1K3OA 3LW9A 5IIZA 4EDYA 1HD2A 6GSUA 1BX9A 1J08A 4I2UA 2LS5A 4O92A 1DE1A 1A0FA 4MF7A 4G19A 3ISOA 1OVNA 2VCVA 3F4RA 1F2EA 1K0CA 3D6IA 4G9HA 2PGTA 5BMUA 5KOWA 4YH2A 2YZUA 1RK4A 2HSMA 3P90A 5DALA 3LQ7A 1XWCA 3P8WA 1GNWA 4HEA2 5G2ZA 2WULA 2O87A 3FZAA 5C00A 4HU9A 5F05A 2RUEA 1GSQA 1PKWA 2R0CA 1OC9B 3DVWA 4GSTA 2YJ7A 1XWKA 3TDGA 3GURA 2VCTA 5EVOA 2PVOC 1SKWB 1MEKA 2BJXA 1NW2A 3IK9A 1VF3A 3AY8A 1X5EA 4V2MA 3VWXA 1G7EA 1FAAA 3KH7A 1SK1A 4MLYA 2GZZA 1PRXA 4G0KA 1S3DA 2QSIA 1JLWA 1U3IA 1V58A 1XZOA 3TUEA 2O85A 3DGQA 2CA8A 5BRTA 1JZRA 3V1WA 3JCML 1PSQA 2DIZA 5G1LA 4EIPA 2DJ3A 5DAKA 2LQQA 5IMFA 1X9SB 3RAZA 3ZMLA 1X0RA 2CAIA 4HU7A 3EURA 3LORA 4EO3A 4AJ7A 1ZMAA 3LYKA 2F9SA 3GSTA 2D2ZA 4POKA 1EZKA 2VUPA 2VL3A 3W6GA 2YWOA 1TRWA 3QCPA 5E59A 1T8EB 2CVDA 2H01A 3TB2A 3WGDA 1ILOA 1WIKA 3ZZXA 4JBBA 3BCIA 4NAXA 2P31A 1TKDB 5LD0A 3D22A 3LG6A 1EP8A 2VM2A 2HI7A 4GXZA 2V32A 4N0VA 3GMFA 3FEUA 4K1FA 4XS4B 4OFMA 1M3JA 4OCEA 4DSRA 1PX7A 4MCUA 2FWHA 4BIKA 1Z6NA 1XW5A 1B4QA 1SL2B 2AHEA 3FYGA 4HI7A 1T4YA 2TIRA 1GUKA 1RW1A 1B9XC 1GUMA 2FWGA 2X99A 2H71A 1Y6EA 5CRWA 5DCHA 3VLNA 5D9WA 1AQXA 1V2AA 5HQPA 3M9KA 2VCXA 3KGKA 1LJRA 3F6FA 1MTCA 4I6XA 3E9JB 2BMXA 3M9JA 5DCGA 1Z9HA 3DYRA 3W8SA 2GZYA 4L0UA 1H4OA 3M0FA 1FB6A 5IM9A 3UL3A 3ZVJD 4PX1A 1YF1A 1XIYA 1MDIA 2B1KA 3KM6A 3W8JA 3EINA 3IE3A 2H72A 4HJ2A 2YANA 4BVXA 2LRNA 4N11A 2FA8A 4D73B 3CXGA 5A4VA 4XRDA 3F9UA 10GSA 1LBKA 4GWRA 4IN0A 2CV4A 1E6BA 2WDUA 2DKIA 4L5LA 2H19A 1U6TA 4PUFC 4XS6A 2DIYA 4ZL9A 1U88A 2MYGA 4MA9A 1T7PB 4HUAA 1R7HA 4OMVA 1F3AA 2C1YA 2P5QA 5ECSA 1T1VA 5ECHB 3U6VA 1TU7A 3WT1A 4WKWA 3GV1A 4IW9A 1AQWA 5G30A 3MWHA 2R5GA 4F0CA 1CQGA 1GULA 4PURA 5F8BA 5D93A 2RUFA 3VPTA 3LXTA 3LEFA 3I9V2 4GQCA 2CX3A 4IGJA 3HHVA 4MF6A 3QAGA 2I4AA 2AAWA 3ZFBA 2M46A 3UMAA 17GSA 1UA5A 1I9DA 1X5DA 2IN3A 2MBSA 2F3MA 3S9FA 1FHEA 1TK5B 2F51A 4X0XA 1USBA 3A2WA 1XPVA 2H73A 2L57A 5LNKe 3O3TA 1VF4A 1SKRB 1GRXA 2YN1A 2OJLA 2G0FA 2C0EA 4TN8A 1TK0B 3HXSA 1TP9A 2I81A 3QAVA 3MAKA 1FVJA 3O6TA 3ZREA 2L5OA 5ECMB 4X43A 3FK8A 2PN8A 4TR1A 2C0FA 2MZCA 1ZYPA 4LA1A 4LL1B 2HZEB 3QD9A 4Z7XA 3PGTA 1W89A 3KTLA 1QMVA 2AB6A 1ZYQB 4CY8A 3GHAA 4TR3A 1GSFA 4ICYA 5HFGA 5JWRB 5LCZA 2QA1A 1KEBA 1GTIA 1UVZA 4ECIA 4ECBA 3GRXA 2G2QA 4NHWA 3J7Yb 4GQFA 1M0UA 1EP7A 2E2MA 3MYDA 3TJKA 5ECLB 4RQRA 5ECNB 3F4TA 2NDOA 4LL4B 2JZTA 2HT9A 2PPTA 7GSSA 2GQMA 2V1MA 2JZSA 3GL3A 3UAPA 3GH6A 1GNEA 3DXBA 4KW6A 3FZ4A 5DALB 5ID2A 2FY6A 1GSSA 2A2SA 2JZRA 4N0ZA 4MPFA 2GZPA 2WS2A 1WP0A 5H5SA 4MF5A 2FA4A 2FGXA 2VL2A 3HY2A 5ECPB 4PQIA 4YKFA 1TTZA 2X4AA 1GWCA 5CRGA 2H6ZA 3M1GA 3ME8A 1SL1B 16GSA 5ENUA 2H66A 3HDCA 2B6MA 2DMMA 3ZIJA 4YQUA 3TRXA 2KP2A 1A2MA 2PMTA 3APSA 3ZYWA 3L0HA 5AIVA 1XWBA 4MH3A 4E8HA 2CZ2A 1PN9A 2IFQA 3FR3A 2OADA 3KH9A 5HR2A 3FY7A 4GCIA 4Q5QA 3CRTA 2H1BA 5D96A 5DAKB 1O8XA 2R37A 4WF5A 2H76A 1K0MA 2H6XA 4BVYA 4PNFA 2V6KA 5FT3A 1YQ1A 2VCWA 1NHOA 4XHMA 4KDUA 3Q19A 5JCGA 2JU5A 4TR0A 2K8VA 2P5RA 2H1GA 5G31A 4EF0A 1T4ZA 2CT6A 1JFUA 3ERFA 2VCQA 3J7Yk 3F3QA 1EEMA 1GSUA 3L9UA 3GKMA 2VLUA 3Q6OA 3DMLA 4F2IA 5G5FA 1QXHA 2O89A 4POBA 4IP6A 6GSWA 1NHYA 1K3LA 4TOPA 1ZYNA 2C3NA 3QAWA 6GSYA 4PUAA 4YAVA 4Z2RA 4ZL8A 3KP9A 3G7IA 1TI1A 2QKEA 2X64A 3M3MA 2L5LA 4KF9A 4GLTA 4I97A 5KN0A 2C0DA 3LGCA 4LLRA 2C3QA 4K0GA 4F0BA 1K0NA 1WE0A 5KEJA 1J9BA 4HOJA 4XRAA 4EIQA 3QPMA 2VAFA 2AYTA 3GKNA 5ELGA 5INYA 3VWUA 1OYJA 1TDIA 3NOFA 1K3YA 4OFNA 3ZITA 1FO5A 3HZ4A 3G9BA 3KEBA 4IQ1A 2IPAA 2TRCP 2CX4A 4K9ZA 4WETA 2IMDA 4X1UA 3ZMKA 4BVXB 3BJ5A 2ZNMA 1SYRA 1ON4A 4AJ8A 1S3AA 1XOAA 1M9AA 2VLTA 3HVNA 1SK2A 4ML6A 3RPNA 2O7KA 4DSSA 4GSNA 5CO3A 2E2GA 4WBRD 1PL1A 2F8AA 3ZRDA 2WZ9A 3VWVA 2YOIA 2H0GA 4AJ6A 1JZDA 4F9ZA 1NSWA 3D21A 3L78A 2HRAA 2GQLA 9GSSA 4DSQA 3EMXA 5IO0A 1QQ2A 4K7IA 1ZCPA 5ABRA 2VCZA 4IVFA 2HYXA 4J57E 1GSEA 1TI3A 4IELA 2R6KA 1A8LA 4MZWA 2YV7A 2UZ8A 3VI7A 14GSA 2H1AA 1XBSA 3CSIA 2DMLA 3GX0A 2KLXA 1JZWA 4WR4A 2LRTA 4KX4A 4WXTA 3GH9A 4QQ7A 2HZFA 1BEDA 2R3XA 3D4MA 3QR6A 1M3IA 4PTSA 4G0IA 4EC0A 6GSSA 3UVTA 1SD9A 1T00A 4HS1A 3CTGA 2TRXA 4KCAA 2GDRA 4RUVA 1M99A 3P7XA 1F9MA 3TOTA 4ZXGA 3GTUA 5ELAA 3GA4A 5DJMA 5A4WA 3QFAC 2M80A 4USSA 1AQVA 2YWIA 5CNWA 5HR1A 3QOUA 1MD3A 5J5NA 3L9VA 5F06A 2FWEA 2FUG2 3D5JA 4ZIJA 1AW9A 2H30A 4BPYA 3RPPA 3RBTA 2REMA 4BL7A 3RDWA 4FYBA 4O7HA 2C0GA 2GS3A 5B6MA 4NMUA 1WPIA 3FR6A 3UEMA 3HJMA 4O5UA 4F82A 3E0UA 1UN2A 3BOAA 2K9FA 3FRCA 2CQ9A 3CRUA 1HNAA 1DE2A 1EV9A 3DWVA 4PQ1A 1HNCA 3ERGA 5ID2B 4KH7A 3CYNA 2H0HA 4K0NA 2YWNA 3IXRA 5C04A 2IL3A 2KUCA 3CSHA 1A23A 2V2GA 5D9XA 3A2VA 2LSTA 3GKKA 4CW9A 5H5QA 1B9YC 1QUWA 2LUSA 1QK8A 1Z7RA 1O8WA 3HVSA 2GGTA 2KP1A 1AAZA 5JCWA 2QC7A 4MNNA 4TXVA 1VF2A 1V40A 5EPFA 3IRAA 1XXUA 2OE3A 4ML1A 3CMIA 2JADA 2LJAA 2HRKA 1SJ6A 3GKXA 5GSSA 1AXDA 5JCUA 3TGZA 1ST9A 1EOHA 1EGRA 3KTBA 1THOA 1XW9A 2IFQB 1M2BA 3F63A 2X8GA 4Q5FA 4K7NA 2DJJA 3WGEA 1T3BA 3LFLA 3HA9A 2OACA 4HZ4A 1OAZA 3N5OA 5B8AA 4O32A 1GL8A 2WJUA 3UIWA 3HZ8A 2QA2A 3IAS2 1SU9A 2VD0A 4HDEA 3ZFLA 1N2AA 3HD5A 3UARA 2YPMA 4AGSA 2L6DA 2RIIA 2ON7A 3WGXA 1YZXA 2IIYA 4G10A 1VGLA 3A5WA 4TKYA 2RM6A 4KA0A 4KSOA 3C8EA 5JWOB 3KXOA 4LMVA 4NPBA 4OFTA 1G6YA 4TXOA 1DUGA 1YKCA 3HCZA 2JSYA 3VPQA 3IA1A 6GSVA 3I43A 3ERWA 5J4UA 2V6OA 2L59A 1WWJA 4N10A 2VL2C 1ACVA 4MP4A 4ECJA 1BAYA 3H8QA 1EGOA 2R0GA 5IMZA 2MMNA 1FW1A 1GUHA 2RM5A 1O6JA 1B4PA 4KDXA 1YKAA 1ZYEA 1A0RP 1S3RA 2DJ0A 3ZIVA 1VRSD 2DC5A 4ISDA 3GX8A 4I2TA 2LEGA 4L0WA 3ZTLA 3UBLA 4TRXA 1RQMA 3TRPA 1Q98A 3IDVA 5G1KA 3IC8A 3TOUA 1OE8A 1PX6A 3GIXA 3BBYA 4MZCA 5J3RA 1B8XA 4HZ2A 5DJLA 3IAM2 2A4HA 4FO5A 3VI5A 3CBUA 2V41A 2IMEA 2B5XA 4V2LA 2H0IA 2LNSA 3NZNA 2I1UA 5CRHA 2YNXA 3HJPA 5IPHA 3FHKA 2HRFA 4DSSB 3EC3A 1C72A 3H4KA 3VK9A 1DSBA 4XS4A 2HXKA 4OD7A 1YJ6A 3FW2A 3GUSA 1W4VA 3ME7A 4EVMA 3E3EA 4ZB6A 3VWWA 3L4NA 1HQOA 3PPUA 2VL9A 5FWGA 2HE3A 1TW9A 3UJ1A 4IP1A 3N9JA 3IR4A 2FCHA 3IK7A 11GSA 4G0LA 3EMPA 2NPBA 1GH2A 2IMKA 1SK0A 4JU5A 4GF0A 4CHSA 4J2FA 2XBQA 1X9WB 1X5CA 5FHIA 4XS1A 2H75A 3GYKA 3EWLA 2R0PA 2XC2A 3ZVJA 1MD4A 1X9MB 2L4CA 1YDKA 3VURA 4F03A 1TRSA 1ZL9A 1OC3A 1PL2A 3SBCA 1MDKA 3GNJA 1Z6MA 1PQNA 3FR9A 2KHPA 1PN0A 1PFOA 3RHBA 1KTEA 4HQZA 3TKSA 4FIWA 3QMXA 1BYEA 5J41A 3GTUB 2RLIA 3D0ZA 3GN3A 4MMMA 2R2JA 3ED3A 1BG5A 1XWGA 3K8NA 1GTUA 4IKHA 2NBSA 4K2XA 2C80A 2H1DA 3LXZA 4OCFA 4BL7B 4EL1A 1EEJA 2HSYA 1Y25A 4A5PA 3FZ9A 3EE2A 2C3TA 1WOUA 2YV9A 2OKAA 3CQFA 1PA3A 1QGVA 13GSA 3C73A 5G5EA 1IYHA 1E2YA 2B1LA 6GSTA 1U3AA 1QFNA 5A4UA 2IWTA 1ERVA 2I3YA 4FQUA 2FD3A 3FMWA 1AUCA 3UBKA 1JLVA 3QDNA 3TKSE 3EU3A 3C7MA 5AN1A 1ABAA 3H93A 3WD6A 4ACSA 2LQOA 2GSSA 2WCIA 3WT2A 4HQSA 1K0BA 3IPZA 2B7JA 2HZEA 4YQVA 3GSSA 2R4VA 3H79A 2EC4A 4MZBA 1URMA 2H70A 2HSHA 3VFIA 4NWYA 3US3A 3TJJA 2PUKC 1TOFA 2FWFA 2JACA 2HRNA 4PXOA 1ZOFA 2IMFA 1F3BA 5DDLA 1FB0A 1SJZA 2XHFA 1V57A 4X4JA 5AIXA 2QGVA 4ZL7A 2CVBA 1BJXA 4EE0A 2JSZA 3R2QA 4K5SA 4K8MA 3G7YA 1XVWA 1V98A 2GLRA 4ZBDA 1SJIA 2IJYA 1AC1A 3LWAA 19GSA 2ON5A 4BWSA 1ZGNA 2O8VB 3TJBA 2I9HA 5IMCA 5D73A 4K6XA 2C8UA 4JRRA 1TU8A 3TCOA 3WYWA 5D9VA 1GTAA 3A3TA 3F0IA 4POLA 2XBIA 2OA7A 2GSQA 2IMIA 1GTBA 1N8JA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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