1A2MA

Oxidized dsba at 2.7 angstroms resolution, crystal form iii
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of reduced and oxidized DsbA: investigation of domain motion and thiolate stabilization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
molecule keywords DISULFIDE BOND FORMATION PROTEIN
total genus 58
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1a2mA00
1H4OA 1TRVA 2CX3A 4XTSA 1M9AA 1MEKA 1OYJA 5ABRA 1KEBA 5KN3A 1AQXA 3GX8A 2CX4A 2LKUA 5IMFA 2NVLA 2H0GA 2BMXA 5D73A 14GSA 3MWHA 3M1GA 3PH9A 2KHPA 3C1RA 3WGXA 4POBA 2IFQB 1EGRA 1GTBA 2B5YA 3GFKA 4Z7XA 4PQIA 4WF4A 2HRFA 4ZBAA 5JWRB 3TUEA 4K7IA 1XFLA 2ZUPA 3IRAA 3KH9A 5GZZB 4EUYA 3M9JA 2LQQA 1VGLA 1M7TA 1JFUA 1XWGA 4IQ1A 3UOMA 4TW5A 4MMMA 2LRNA 3HJPA 2GTUA 1FB6A 2WCIA 1BAYA 3R2QA 5D93A 2ES7A 1T1VA 4P3YB 3BD2A 3J7Yk 2FGXA 4MF7A 1VF2A 3GA4A 1K0AA 1DE1A 3HVVA 1A2MA 2C1YA 1FO5A 2DJ1A 3M3MA 1ZOFA 3GNJA 1UA5A 1PGTA 4RUVA 4IBPA 3MAKA 1J08A 4I6XA 3IXRA 1GSUA 3IAM2 2K6VA 5IOXA 2C0FA 1GSSA 3M8NA 5J9BA 3EMXA 2VIMA 2P5RA 1K0DA 3LQ7A 1B4QA 4Q5RA 3TGZA 2MYGA 3P7XA 4ZBBA 4BA7A 3UARA 1HYUA 2IL3A 5CYYA 2FY6A 4NV2A 3QFBC 4ID0A 2H6YA 3DIEA 1GSDA 6GSVA 4KGIA 1S3CA 2H0IA 1ABAA 4BVYA 1O73A 1TP9A 1G0TA 2OBIA 3NOFA 3VLNA 1SJZA 2C80A 3CRUA 5B7CA 3C73A 1SENA 2A2SA 2O89A 1JZOA 5GSTA 3F6DA 3WD6A 4PX1A 2G2QA 1XZOA 4OFMA 4WBRD 2C4JA 1XVQA 2FWEA 5B8AA 5B6MA 9GSSA 2J9HA 3DRNA 1TU7A 4TR1B 2WS2A 3DEXA 4MJEA 3E0UA 3VWUA 2JSZA 4CW9A 3WT2A 2F51A 3HDCA 5LD0A 2C3QA 2VL9A 3H93A 4J2FA 1A2LA 1I9DA 4IKHA 1QK8A 4KSOA 3O76A 3IC4A 2REMA 3DD3A 2L57A 4ML1A 4QL9A 2OE1A 3L9UA 4JZQA 1NHOA 4WR4A 1VRSD 2OADA 3GH9A 2WFCA 1XWCA 5AN1A 5IM9A 1ZZYA 2FWFA 3D21A 1BX9A 3QPMA 1VF3A 3IV4A 2P5QA 5EL8A 3VI7A 1PKWA 3MNGA 4HZ4A 1TK8B 4I8BA 3D0ZA 2H70A 1U87A 2JU5A 4IW9A 4ML6A 6GSSA 3RBTA 2VOCA 5IIZA 2HXKA 3UBLA 1U88A 1EGOA 1ZYEA 2ON7A 1GTAA 3ZFLA 5DCHA 4TR0A 2B1LA 2FA8A 5HFGA 3TKSA 2YWMA 1A8YA 2F8FA 5D9TA 2XHFA 4AJ7A 1BYEA 4KDXA 2HT9A 1XPVA 4HI7A 2M72A 4JE1A 4NPBA 1E2YA 3IOSA 5HR3A 13GSA 2X99A 2YZHA 3F8UA 1BEDA 1QFNA 2NTOA 4TXVA 5AISA 2H66A 1SKRB 1K0OA 5J4UA 1YF0A 4KW6A 2KP1A 2HSYA 4FO5A 3GUSA 4LA1A 5IMAA 6GSTA 2IMIA 3KTBA 1FB0A 3WYWA 4I97A 3LYPA 1USBA 2O85A 1U3IA 4YAVA 3GX0A 1TI1A 3HCZA 2L4CA 4WKWA 3LG6A 1TXXA 4KDYA 2WB9A 1U6TA 3GKNA 2GQKA 2PPTA 1WP0A 1GNWA 1EOHA 1M0UA 4TXOA 2L4QA 3H1NA 4KUNA 1TRWA 1Y6EA 1EV4A 2F9SA 4GTUA 18GSA 3LGCA 4IJIA 1SYRA 5AIXA 2WGRA 2GDRA 5D9WA 5GAND 2CZ2A 2LV3A 5G5EA 4MLYA 1T4YA 3VPTA 4TRXA 1QQ2A 2YWNA 4MP4A 3VI5A 3QMXA 2DC5A 2VLTA 1XWAA 4EF0A 2FLSA 2JSYA 4Q5QA 11GSA 2VM2A 4ZL8A 2LJKA 2LRCA 2B3SA 3H8QA 3RAZA 3E9JB 5DALB 5DJLA 2R2JA 3KP8A 3ZL5A 1SK2A 4MZCA 2LQOA 5DCGA 2GSQA 3I6AA 2WULA 2X8GA 3A2WA 4GWRA 3VPQA 2YWIA 1QXHA 1E6BA 2I81A 4RI7A 5COHA 1EEJA 3O3TA 2VAFA 1ST9A 3I9V2 1GUHA 5G2ZA 1XIYA 2H1AA 2KOKA 3QCPA 3F4RA 5CRGA 3RHCA 3KH7A 2GS3A 4N30A 4IGJA 3D6IA 3KMOA 5D96A 2VL3A 5IMZA 4KA0A 1MD4A 1V57A 2B7KA 4I2UA 4GRFA 5A4UA 3M0FA 2PN8A 2BTOT 3FZAA 4HJ2A 4ACSA 4GXZA 1XW5A 4EKZA 3LORA 2DJ2A 4K1FA 2P31A 1V2AA 5FWGA 2V6OA 2PVOC 2VCXA 3D5JA 2Z9SA 1F3AA 5KEJA 1HNAA 2YOIA 1FW1A 1W89A 3FW2A 2H76A 4DEJA 3KEBA 3GV1A 1KTEA 3HVSA 1F3BA 2RM5A 2HZEA 5F05A 5HFKA 2RM6A 3IA1A 2X8HA 5F8BA 1K0MA 1I5GA 1FOVA 1WJKA 5CP1A 1ML6A 1SK1A 3UMAA 4YQMA 1TW9A 2EIRA 3ED3A 5G31A 2YJHA 3UAPA 1SL0B 5A4WA 1XW9A 3N5OA 4POKA 1MTCA 3TOTA 4TR1A 3IK7A 2GVPA 4GF0A 1OC3A 1OKTA 1YZXA 2GSTA 3GKXA 1TI3A 3H4KA 3D4TA 1FVJA 2LNSA 3C8EA 4V1Ag 2HSHA 1F2EA 2H72A 5JCUA 4HDEA 1S3AA 2RIIA 2V32A 5ECQB 3SBCA 2IMDA 2CVDA 3P2AA 4EC0A 1F6MC 1BG5A 4HJMA 1R7HA 2PVQA 3TJGA 5DVBA 1VF1A 1TKDB 2LRTA 3APQA 3VWWA 1TTZA 1FG4A 1QGVA 5C00A 4XS1A 4FYCA 1XBSA 4MCUA 1SD8A 4K7OA 3W8JA 1AUCA 2YJ7A 1LJRA 3IPZA 1M9BA 2H1GA 4LLRA 4N11A 5DJMA 4LL1B 1PA3A 4MA9A 3FR3A 5IO2A 2HRNA 2GZYA 4XIHA 4OFTA 5ID2B 10GSA 1HD2A 4KB3A 2TRCP 2O8VB 4ZL9A 1THXA 1A0RP 4EE0A 5ECPB 4XS4B 4YAPA 5ECIB 3S9FA 4JR4A 4KDUA 3GRXA 2MMNA 5C04A 4K0NA 1OAZA 2HI7A 5JWQB 4AJ6A 2QKEA 3K8NA 2V6KA 3HA9A 5ECOB 4J57E 1Z5YE 5KN2A 4ZB8A 4JR6A 1DSBA 4OCFA 1GNEA 2H19A 3CTFA 2B6MA 3VURA 4BVXA 3N9JA 4IN0A 2GZPA 1K0NA 3KGKA 4ZIJA 2AAWA 1CQHA 1LU4A 3ZIJA 1R4WA 4PXOA 1LBKA 3U5RE 1ERTA 3ZZXA 2L6DA 4Q5FA 4K2DA 1F9MA 1U3AA 2GT6A 3DWVA 1SYXA 3SWLA 2CZ3A 1DE2A 2XBQA 3A5WA 5E59A 2WZ9A 4X0XA 4RI6A 1T00A 2LTKA 1XWKA 4WETA 6GSWA 2K9FA 4OCEA 3JCML 1PD21 1WMJA 1V58A 1XOAA 1EWXA 5G1LA 3TKSE 1ZMAA 5IO0A 4ISDA 4MH2A 2YANA 4I2TA 1FHEA 2X64A 5A5KA 5ENUA 1OC8A 4NXIA 5H5QA 4KCEA 2VM1A 3IAS2 2N5FA 2G0FA 2IWTA 4JRRA 4L5LA 2HZFA 5IMDA 5FT3A 5F06A 1OKDA 3HVXA 1PL1A 4TR3A 1ZGNA 1UN2A 5F07A 1IYHA 4X1UA 2YWOA 1O8XA 1GWCA 3HYPA 2VL2A 1GSYA 2DJ0A 4O7HA 4F03A 1TU8A 2H30A 1GL8A 2R4VA 2K8SA 2XBIA 3QDNA 2E0QA 2ALBA 5DALA 1AQWA 4JBBA 2XPEA 5JWOB 4JEDA 1QUWA 3F4TA 1URMA 4O32A 3IHQA 1K0BA 2DMLA 2H8LA 3ERGA 1TRUA 2IIYA 2FWGA 2PUKC 4WEYA 1A23A 3ZTLA 4PUFC 2OE0A 5ELAA 3GSSA 3L78A 3CTGA 1A0FA 3HD5A 3Q74A 3DXBA 4GCIA 4HU7A 2MBTA 3Q18A 3FZ5A 3HZ4A 2IJYA 2NBSA 3D4MA 1Z7PA 2AV4A 1M2BA 4ZILA 1T3BA 5CRHA 1CQGA 3V1WA 1O81A 3ME7A 1IYIA 5AGYA 3PGTA 5EPFA 3ZYWA 1H75A 4D73B 3KCMA 3EE2A 4BWQA 1TK5B 4EL1A 3GSTA 5D8IA 1JZRA 4MF5A 4HOJA 3FR9A 2NDOA 12GSA 6GSYA 2JL4A 1MDIA 2DJKA 3ZMLA 3TB2A 3TJBA 2VO4A 1JZDA 3QR6A 3TJKA 2PU9C 1RK4A 3GMFA 4HS1A 1GULA 4EDZA 3BCIA 2CT6A 4IQAA 1GTIA 4V2MA 5DAKB 2A2RA 1F37A 2M80A 3LYKA 1A24A 2VLUA 2ZNMA 1R5PA 1ERVA 1T4ZA 2C0DA 5JCGA 2LJRA 3ZMKA 5HR0A 4F9ZA 2CA8A 4PQ1A 3KM6A 3QAGA 5ECRB 2ZCTA 5INYA 3TDGA 1GSEA 1X5CA 4EO3A 4K7NA 4L0WA 3WGDA 5ECHB 3AY8A 4MJCA 2TRXA 3EINA 2KUCA 3KP9A 5KN0A 5DDLA 2DIZA 3L4NA 2L5LA 4ZB6A 20GSA 4HQZA 3NZNA 1K3YA 3FZ4A 3TKRA 4OO5A 3FK8A 5CRDA 5J5NA 5G30A 4DVCA 3WT1A 1AAZA 1TRSA 4IHUA 1SU9A 4YH2A 3APSA 3LEFA 1M99A 2OKAA 3EC3A 3VFIA 1NW2A 4AF2A 1FVKA 4FIWA 4KSMA 2IN3A 1JZWA 4N0ZA 2IFQA 3EYTA 5HFIA 3EMPA 5ECNB 4G10A 3KMNA 2H01A 4OO4A 1C72A 3KIJA 3OR5A 3APOA 2E7PA 3QFAC 1B4PA 5H5SA 3W6GA 1B48A 3IK9A 1TJDA 1W4VA 1SJ6A 1X9MB 4Q5NA 5ID2A 4PQHA 5H5RA 5ECMB 2C0EA 2QC7A 1PSQA 2F3MA 4XS4A 4H86A 2EIQA 3GH6A 5IMCA 2O87A 1Z6MA 4LL4B 2L59A 1PL2A 1PQNA 1SL1B 1WIKA 2HYXA 3KTLA 1K3OA 4GQCA 2JZTA 2R6KA 1B9YC 5G1KA 4OD7A 2C8UA 4NAXA 1DBYA 2PMTA 3L9SA 5EY6A 1QMVA 4MZBA 5ECSA 3FZ9A 5J9CA 2YV7A 3GL3A 3J7Yb 3A2XA 4WXTA 2VCVA 3L9VA 4NHWA 2GZZA 4XCSA 3IE3A 4ZL7A 4QQ7A 1OE7A 6GSXA 5HR2A 3VK9A 3F0IA 1Y25A 3G7IA 1FAAA 1GLQA 2O7KA 2YNXA 3UL3A 4L0UA 3DKSA 2B7JA 1EZKA 4NWYA 3TRXA 1EP8A 4PURA 1T8EB 2H6ZA 1HNBA 2H0HA 17GSA 19GSA 2PWJA 1NSWA 2K18A 3FKFA 1DUGA 4KNDA 3O6TA 2M46A 5IQYA 3ZVJD 2FHEA 1RW1A 3DMLA 4CDOA 3G7JA 2HE3A 2NPBA 5JCWA 3GYKA 4DSSB 4O5RA 1HNCA 4F82A 3CXGA 4HUAA 1X5EA 2H1BA 1RQMA 4G9HA 2H75A 2AUVA 2VUPA 1M2DA 3HJOA 2L6CA 4F0BA 1X9WB 1YKAA 2P0GA 3P8WA 5L71A 2EIOA 4WR5A 4MF6A 1MDKA 2HNLA 1A8LA 3TJJA 1SD9A 3GIXA 4L8EA 3MSZA 4PUAA 1GRXA 2I4AA 3EURA 4IJ3A 1YDKA 2YPMA 3FYGA 2JACA 3EVIA 3TCOA 1SL2B 4WBJA 2MMOA 1XCCA 4ZB9A 2YP6A 2TIRA 1GLPA 2YN1A 2N5AA 5IPGA 3BCKA 4FYUA 3D22A 3PR8A 4GSTA 1SJIA 1THOA 2DJ3A 5LNKe 1WRYA 2MMAA 1OC9B 4OFNA 5CNWA 4G19A 2VCZA 1X5DA 3KXOA 3GURA 3IR4A 4HU9A 4K9ZA 2C3NA 2ON5A 1EOGA 3GTUB 1O7UA 2VL2C 2OACA 4V2LA 3LFLA 4LMWA 4K0GA 3UVHA 2DMMA 1N2AA 1O8WA 2GT5A 1TOFA 4NV5A 5G5FA 3ZLPA 1YEXA 1AXDA 4KH7A 4EVMA 3LXZA 2BJXA 3LWAA 2XPDA 1TK0B 4IELA 5ECKB 3F9UA 5LCZA 4D73A 3ZRDA 2H6XA 3CMIA 3DVXA 4CHSA 1XOBA 2LUSA 1SKWB 2AYTA 3C7MA 4POMA 4XRDA 4MJAA 3TKSC 3W8SA 5DBQA 3P90A 4V2NA 1WPIA 2GQMA 4IS0A 7GSSA 4GSNA 2KLXA 3TRPA 4FH8A 4TKYA 1T7PB 2RLIA 1YJ6A 1ZL9A 3F63A 5DAKA 1XW6A 1YF1A 2C3TA 1A2JA 1Z6NA 1TDIA 2DBCA 4N0VA 2GQLA 2AJQB 1NHYA 5E4WA 2IMEA 3UBKA 2HZEB 5D9VA 4WF5A 2LJAA 3KZQA 3QD9A 1AW9A 4I5QA 3KD0A 5D9XA 1J0FA 4XRAA 3HZ8A 1NM3A 4HEA2 1G6YA 4TOPA 1Q98A 4QL7A 2E2GA 1B8XA 22GSA 5ECLB 4DSRA 5CAXA 1GH2A 4YQVA 1R26A 2LSTA 4ZBDA 4V1Ap 3H79A 4MABA 3M9KA 4IP1A 2EC4A 3RPNA 5GSSA 1G7EA 3BJ5A 3DGQA 1PX7A 4YQUA 3RDWA 1PKZA 5IOWA 4RQRA 5A4VA 1X9SB 2V41A 1O6JA 2OA7A 3EU4A 3DYRA 3I69A 3GN3A 3HXSA 4KAEA 1BJXA 1GUMA 4K6XA 1X0RA 1MDJA 4KE3A 3ZFBA 1GUKA 2LEGA 3FEUA 3NIVA 2MZCA 2H74A 3E3EA 1Z3EA 2K8VA 2FWHA 5CREA 1JHBA 1UC7A 1OE8A 2FA4A 4MPGA 1XVWA 1SKSB 2VD0A 3ME8A 4PGTA 3QAVA 4MH3A 3G9BA 3CSJA 4E8HA 5B6NA 1XXUA 1O85A 3G7YA 4OMVA 2PERA 5F0GA 1EV9A 1WWJA 2AHEA 4F0CA 1B9XC 2FCHA 5HQPA 4AGSA 3BOAA 3TJFA 2D2ZA 1ZYQB 2PBJA 2VCQA 1GSFA 4ECCA 1UVZA 2GSSA 3GKKA 1GP1A 1G7OA 3LXTA 3TKPA 2IMFA 2YZUA 4IVFA 1YEPA 2DJJA 5AIVA 2HFDA 4ECBA 5J41A 3PINA 1EP7A 1WE0A 4XS6A 4PNGA 4MDCA 4BL7A 3UVTA 3UEMA 3CSHA 1Z9HA 4KCAA 5EVOA 1GTUA 4K8MA 2CQ9A 2JZRA 2QSIA 1S3DA 5IPHA 1VF4A 3ZREA 3KJYA 2MBSA 5ELGA 3UJ1A 3MDKA 4BPYA 1YQ1A 1ZCPA 3TRQA 1PX6A 4NMUA 4F2IA 2I9HA 1Z7RA 2KP2A 1ILOA 2FNOA 2J23A 4KX4A 3RHBA 4TN8A 3C1SA 3FHKA 2FUG2 5DQYA 4DSSA 1M2AA 1Q4JA 3F4SA 1ON4A 8GSSA 4X43A 1AC1A 3GKMA 4MJBA 4TVEA 2A4VA 1XWBA 2L5OA 1AQVA 3VWXA 3CSIA 2V2GA 2R5GA 2B1KA 1R5AA 2VLVA 2YV9A 2OE3A 3A3TA 2OBKA 2MMZA 2OJLA 4BWSA 2VCWA 1JLVA 4PNFA 1N8JA 4XHMA 2F8AA 2VD1A 3F3RA 1BQ7A 2C0GA 2FD3A 3C71A 5IMVA 1EEMA 4L5OA 5B8BA 1KBNA 3HHVA 3CYNA 4MZWA 3FY7A 2H73A 4ZXGA 2XC2A 3QOUA 4ECJA 1OC9A 3UIWA 2IPAA 2JZSA 5GAPD 3HY2A 1YKCA 16GSA 4FYBA 5CO3A 1OVNA 5HR1A 3GHAA 3BBYA 3IBHA 2R3XA 1G6WA 2H71A 4LMVA 4N10A 3GTUA 1PRXA 4EDYA 1K3LA 2CV4A 1V98A 2WRTA 3TKQA 3LSZA 1ERUA 2DIYA 1KNGA 4GLTA 2YCDA 4MPFA 1GSQA 3Q6OA 4GSSA 5FHIA 2CVKA 1ACVA 2I1UA 3ZITA 3ZIVA 4ECIA 2N5BA 2AB6A 2CAIA 3I43A 2GLRA 1AIUA 1ERWA 2V1MA 5KN1A 6GSUA 3Q19A 4TR4A 3US3A 2LS5A 4MK3A 3VWVA 3EWLA 4DSQA 2X8CA 2H1DA 3WGEA 3FR6A 3CRTA 3CBUA 3GL5A 4J56E 4JU5A 4HQSA 4NHZA 1V9WA 4POLA 4GQFA 4E8EA 3IDVA 1PMTA 1MD3A 1JLWA 2GGTA 3FRCA 3ZVJA 3ERWA 2GSRA 3F6FA 1YY7A 3QAWA 4RQXA 3HJMA 4HZ2A 3HKRA 3TOUA 2RUFA 3U6VA 4G2EA 2I3YA 3A2VA 2LNTA 2QGVA 3EU3A 2HLSA 2B5XA 4OWYA 2E2MA 1PN9A 2DLXA 2WJUA 3L0HA 4IP6A 2VCTA 2WDUA 5J3RA 2JADA 2B5EA 4ILFA 1K0CA 1V40A 2CVBA 2R37A 5DQSA 3ERFA 1SK0A 4TXOB 1WOUA 3RPPA 3ISOA 1HQOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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