3EC3A

Crystal structure of the bb fragment of erp72
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
SPPSKEILTLKQVQEFLKDGDDVVILGVFQGVGDPGYLQYQDAANTLREDYKFHHTFSTEIAKFLKVSLGKLVLMQPEKFQSKYEPRMHVMDVQGSTEASAIKDYVVKHALPLVGHRKTSNDAKRYSKRPLVVVYYSVDFSFDYRTATQFWRNKVLEVAKDFPEYTFAIADEEDYATEVKDLGLSESGGDVNAAILDESGKKFAMEPEEFDSDALREFVMAFKKGKLKPVI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Protein disulfide-isomerase A4
publication title Structure of the Noncatalytic Domains and Global Fold of the Protein Disulfide Isomerase ERp72.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Isomerase
total genus 66
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2008-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ec3A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ec3A01
2X8HA 5J4UA 3ZYWA 3DVXA 1SKSB 5IPHA 3TUEA 3TJGA 4IP1A 3LJRA 5DAKA 4RQXA 2O87A 2YZUA 1FVKA 5IMCA 1ZYQB 1B4PA 3TKSC 1SK1A 5DBQA 3TRXA 14GSA 4MLYA 1TRSA 1K0NA 2WJUA 1A2LA 1T1VA 2VLTA 2MBSA 2TRXA 2GZYA 2DJKA 4OFNA 4AJ6A 3TDGA 1TTZA 2E7PA 2XPDA 1SJ6A 3G7JA 1TP9A 1B8XA 4YAVA 2V32A 4TR3A 4BWSA 1JLWA 1XZOA 4KGIA 1B48A 1HNCA 1AW9A 5EPFA 4ECJA 1XW6A 2JADA 1PL2A 4L8EA 2O8VB 4H86A 3PINA 3LFLA 1JZOA 1O81A 3BOAA 2LRTA 2JZSA 4JE1A 3MAKA 4PXOA 1GLPA 2LRNA 3KMNA 2KOKA 2E0QA 5DJMA 3IV4A 1O6JA 3W6GA 5KN0A 1V40A 1EGRA 4IHUA 5KN3A 4WBJA 3L9SA 1EEJA 4ZB6A 3ERGA 3U5RE 1Y6EA 2AAWA 4JRRA 4PQHA 1JZRA 1SK0A 3FY7A 1M9AA 3CRTA 1TK0B 2TIRA 1VF3A 4AJ8A 4D73B 3RHCA 2IFQA 1HNBA 4YQUA 4DSSB 3CTFA 1TU8A 4NPBA 4DEJA 5J9BA 2VCWA 1N8JA 20GSA 2IMKA 3ZMLA 5ECLB 4N0ZA 3E3EA 2G0FA 2LKUA 4G9HA 2ALBA 5HR2A 5JCWA 1PX7A 1ZOFA 3C7MA 2RM5A 4OD7A 3QD9A 1VF2A 3GHAA 1HD2A 2F9SA 1YQ1A 2CZ2A 1G6YA 2WGRA 3D22A 18GSA 3UOMA 4MCUA 4EKZA 1GTBA 1KNGA 1XVWA 5ELAA 2IMEA 5CAXA 1K0OA 1BQ7A 1LU4A 2H76A 2C4JA 5ECQB 3LORA 1A23A 2ZUPA 1O8WA 2LQQA 2OBKA 5E59A 2CX4A 1PKZA 1WMJA 2BMXA 2VO4A 2V1MA 1SJZA 5F0GA 3DWVA 3QFBC 1YY7A 4HZ4A 1TRVA 2RUEA 1TXXA 3CBUA 2P0GA 3D5JA 5COHA 3L0HA 5AIVA 2YWIA 3VI7A 3KP9A 4ID0A 4F03A 6GSUA 4WR4A 1OC9B 1ERVA 5IIZA 2B1KA 5CREA 2JL4A 1UC7A 1OC8A 2V41A 1GSQA 4V2NA 2HT9A 5IM9A 1SD8A 2H0IA 3TKRA 4F82A 2KUCA 1DE2A 1X5EA 4AF2A 3KTLA 3N9JA 3VLNA 2JU5A 2BTOT 3O6TA 5ECKB 3ME7A 1O73A 3GL5A 4K1FA 2ZNMA 3TJFA 2O89A 4PGTA 2C0EA 4MF6A 3I6AA 1E2YA 1AUCA 1EEMA 4MZBA 1U6TA 4DSSA 4JEDA 1YF1A 1GUKA 5F06A 3LEFA 3D0ZA 1CQHA 1PN9A 3O76A 4WR5A 3ZTLA 1W89A 1PSQA 3DVWA 2B5XA 5D9VA 5EL8A 3ZREA 3EWLA 2N5FA 3GL3A 3SBCA 4NXIA 1PGTA 1NW2A 1JLVA 2B5YA 2NVLA 4KCAA 4BVYA 4BPYA 1URMA 4RQRA 3TCOA 1FG4A 2Z9SA 3GX0A 2E2GA 2HRFA 4ECBA 1OE8A 1XWAA 4KA0A 1U3AA 3HVVA 2R5GA 4OCEA 3A2VA 5H5SA 3TB2A 4G10A 11GSA 1AC1A 2LEGA 4TXVA 3GYKA 4PUAA 3ZZXA 4MPFA 5B7CA 3EINA 4FYUA 4QL9A 2P5QA 1YDKA 1O7UA 4GXZA 3UBKA 1S3CA 3HY2A 1SL0B 4Z7XA 2VCQA 1VF1A 2H71A 4FIWA 1V58A 2HSYA 4KNDA 2OACA 2H1GA 5J3RA 1OC9A 4XRDA 2X64A 1RQMA 1YEXA 4I2UA 1AIUA 4JR6A 3ED3A 2VLUA 2A2SA 3IC4A 4HQZA 1FW1A 1OC3A 5HR3A 4ZL9A 5DVBA 1XWCA 2DJ0A 3ZLPA 2YV9A 2CAIA 5KN1A 3VK9A 5IMFA 1QMVA 3HD5A 6GSTA 1OAZA 4ZB8A 5F05A 3IE3A 2X99A 4JU5A 1XIYA 1A8YA 5B8AA 4TRXA 2PWJA 3WGEA 4OO4A 1GLQA 2H6ZA 3C1SA 1M9BA 3GSTA 3MWHA 4PX1A 3QDNA 3L78A 3F3QA 4MJBA 3GKXA 4WETA 1MDIA 2DIZA 1SL1B 1ZZYA 4PUFC 2R2JA 2CT6A 3JCML 2KP1A 3M9JA 4MH3A 4BL7A 1ILOA 1ERUA 1TW9A 5JCGA 4YQMA 3KJYA 3C71A 1GSEA 2PPTA 1K0BA 4G19A 2FWFA 2DJ1A 3GIXA 2WRTA 3ZIVA 2E2MA 4MDCA 2CA8A 1YKCA 4X1UA 4L5LA 1HYUA 3ZIJA 2NTOA 1TU7A 3D4MA 3TRPA 1MTCA 5ECSA 1NHYA 1Q98A 1F37A 2IPAA 1SK2A 2HRNA 2BJXA 1SD9A 1USBA 3M0FA 5ID2A 3A2XA 1MD4A 1QFNA 3LYKA 3W8SA 4P3YB 1AQXA 1GNEA 2PGTA 3ZL5A 1TI3A 2CQ9A 4F9ZA 5AIXA 4K7OA 1A24A 2O85A 4KDXA 4N30A 1A2MA 5IOWA 3BJ5A 3EYTA 4GQCA 3HXSA 1M7TA 3KIJA 3O3TA 1R5AA 5CRDA 1SJIA 3H79A 2K6VA 4ACSA 1B9YC 4POBA 4MJCA 2GT6A 4XIHA 1FOVA 4N0VA 4ZBDA 2VCZA 5ECOB 1J9BA 2YNXA 4TR0A 4IP6A 2B7JA 4ILFA 4EC0A 2CVKA 3FKFA 1O85A 1TI1A 3C1RA 3TOTA 3ZRDA 1ABAA 5ECPB 2HZEB 2MBTA 5DCGA 1RK4A 2CZ3A 1XOAA 4KUNA 3NIVA 3F63A 4MF5A 4ISDA 4HI7A 4G2EA 3ERWA 3DD3A 4LLRA 2X8CA 1GP1A 2JACA 5IQYA 4Q5QA 4V2LA 1GH2A 2R37A 3GMFA 2HXKA 1EZKA 1VGLA 5F8BA 1Z3EA 1ZYEA 2R4VA 4WF5A 3RBTA 1QK8A 2FWHA 2G2QA 3UAPA 3HJMA 5DALB 4LMWA 4EDZA 1KBNA 3DKSA 4GSTA 3M9KA 3UMAA 2IIYA 1AXDA 1G6WA 5GZZB 4JBBA 2GZZA 3KH9A 2B3SA 3J7Yb 4KX4A 1T4YA 1M2DA 2FHEA 4KB3A 5D9WA 3QCPA 4GWRA 3CTGA 3IK9A 1SYRA 2YPMA 1B9XC 5J41A 16GSA 3IBHA 5AGYA 2YN1A 5CRWA 5D73A 1BYEA 4GF0A 2WZ9A 3GNJA 5IO2A 3I9V2 3ZITA 2VD0A 1ST9A 1SU9A 2H74A 2VD1A 3F4SA 1Z7PA 1EWXA 1H75A 5G1LA 4IQAA 3C8EA 7GSSA 4NHZA 6GSSA 1PX6A 2LV3A 2H0HA 22GSA 5IMZA 3QFAC 4KCEA 2TRCP 3R2QA 3GKKA 2XPEA 4MZWA 2VM2A 3BBYA 3MDKA 3AY8A 3K8NA 4V1Ap 2YOIA 4F0BA 3KGKA 2XHFA 3VFIA 2L6DA 1XXUA 1E6BA 2DJ3A 1WPIA 5G31A 1DSBA 1EP8A 1U88A 2HZEA 1U3IA 3LYPA 2YZHA 2A2RA 2K8SA 5B6NA 3GTUB 2YJHA 1S3AA 2FCHA 3FHKA 4CDOA 4AJ7A 2WDUA 1F6MC 3HJPA 1GTIA 1M0UA 5B6MA 2REMA 3S9FA 2OE1A 2H6YA 4I5QA 2K18A 5DALA 2PVQA 4I2TA 4CHSA 2HI7A 3CSJA 3NZNA 2DC5A 1B4QA 2WFCA 4K8MA 4XRAA 2PERA 2L5OA 4K7NA 4IJIA 5HR0A 2ON5A 1OVNA 5J9CA 2PBJA 1EOGA 3OR5A 3TOUA 4IBPA 1F3AA 4O5RA 1F9MA 1NM3A 4EDYA 5CYYA 3A2WA 1XVQA 4HU9A 2EIRA 2CV4A 1A8LA 4ZL8A 1XWBA 1AAZA 4ZIJA 3ZVJD 3HYPA 4X0XA 4EE0A 1T00A 2GVPA 5CRHA 1V2AA 1V9WA 3F4RA 1FVJA 3F8UA 5G1KA 5GAND 2H1AA 2XBIA 5ENUA 3UVHA 3D21A 4POMA 4RI7A 3RDWA 3QR6A 2DMLA 2I81A 5D93A 4KE3A 1LJRA 4Q5RA 1I9DA 1UA5A 1ZGNA 2O7KA 1DBYA 4BVXA 2OE3A 3F4TA 2KHPA 1DE1A 4IW9A 3FZAA 3LXTA 4K9ZA 4D73A 1PRXA 3EE2A 4N10A 4GSNA 4GLTA 1JFUA 1FO5A 2VCXA 3VWUA 4E8EA 1XWGA 3WT2A 1G7EA 1NSWA 3HJOA 5AISA 2KP2A 3H93A 2YCDA 1PMTA 2H72A 2C0GA 1MD3A 2LSTA 4PURA 2MYGA 3KMOA 2IMIA 1K3YA 2PVOC 5JWQB 3H1NA 1T3BA 2GLRA 4EL1A 2FY6A 3GRXA 1WIKA 2B5EA 4O32A 1X5DA 3EMXA 3IHQA 4CW9A 3APQA 1Z9HA 1A0FA 2QSIA 4MP4A 4HS1A 4V1Ag 3F6DA 3GA4A 5HR1A 3P7XA 3QAWA 2LNSA 4FO5A 3UIWA 3HVXA 3RPNA 2GSQA 2V2GA 5DJLA 1VF4A 4TR4A 3CMIA 5DCHA 4EO3A 2VL3A 1GULA 4XS1A 4ZB9A 4Q5FA 3TKPA 5A4UA 2FA4A 5DQSA 3TKQA 4WXTA 3RAZA 1K0DA 2C3TA 2H8LA 2K9FA 5D96A 1WRYA 2M46A 5G2ZA 1GSFA 2RIIA 4TOPA 1IYIA 2OA7A 2VL2C 3E9JB 3WGXA 1ZMAA 4KAEA 4FH8A 3EU3A 3VWWA 3V1WA 3M1GA 1TK8B 1BAYA 3ISOA 4K7IA 2CVDA 5H5RA 2N5AA 2F3MA 1Z6MA 3LGCA 2NDOA 4IGJA 3GN3A 4OFTA 1V57A 2C0FA 2OE0A 4K2DA 4YAPA 1XW5A 1G0TA 2HLSA 1LBKA 1THOA 1ZL9A 2VM1A 4DSQA 2LS5A 1J0FA 4L5OA 2K8VA 1G7OA 2YP6A 1XPVA 3KH7A 1FB6A 1ON4A 3G7YA 1UN2A 4JR4A 4F0CA 4TW5A 3APSA 2YV7A 1JZWA 1KEBA 1GSDA 2NBSA 1GWCA 2V6KA 4GRFA 5ECRB 4ZXGA 2FWEA 1MDKA 6GSVA 3G9BA 4TVEA 2H19A 6GSWA 5D9TA 4KDUA 3UARA 1YJ6A 5FT3A 4I8BA 3EVIA 3L4NA 1YKAA 5D9XA 5HFGA 4OCFA 4IN0A 2F51A 1RW1A 3LXZA 4MZCA 4V2MA 3L9VA 4KDYA 3P8WA 4KSMA 5H5QA 4IELA 1PKWA 2MZCA 3KEBA 4JZQA 3IK7A 1GNWA 2MMNA 4N11A 5DAKB 3FR3A 4GSSA 1MEKA 3UL3A 4MPGA 1X9WB 4MJAA 2IN3A 1K0AA 1GUMA 3KZQA 2C8UA 4HJMA 3RPPA 3H4KA 1EGOA 3GUSA 1XWKA 2LUSA 4WEYA 4TKYA 2H75A 2LTKA 1TRWA 5LCZA 1M2AA 5JWOB 2LQOA 4NHWA 2FWGA 2MMOA 2A4VA 2FGXA 3UJ1A 4I97A 3E0UA 2EC4A 3LQ7A 1Z6NA 4WBRD 3KXOA 1X9MB 1QUWA 4L0WA 1PA3A 3GKNA 4PNGA 4WKWA 4HOJA 2C3QA 2AB6A 2FUG2 3BD2A 4KW6A 5AN1A 1T4ZA 2I1UA 3HKRA 1M99A 4I6XA 2L59A 4NAXA 2FA8A 3GV1A 5DDLA 2PN8A 4ECIA 4PNFA 3QMXA 3ZFBA 1SL2B 2FLSA 2GSRA 4YQVA 4MK3A 4RI6A 5C00A 2RUFA 4ECCA 2EIOA 2D2ZA 1X0RA 5EY6A 4PQIA 3C73A 2DSAA 3ERFA 1SENA 4MMMA 1OYJA 2C0DA 1YZXA 1BEDA 2IMDA 4K6XA 1Y25A 4X43A 3VWXA 3D6IA 9GSSA 2GDRA 3CSHA 5IMVA 2XC2A 3FR6A 1WOUA 3DEXA 2PMTA 3QAVA 4HUAA 1UVZA 2LJRA 1BG5A 3UVTA 5EVOA 3ZFLA 4LL1B 2V6OA 10GSA 5LD0A 2WB9A 4LL4B 2YJ7A 3NOFA 4LMVA 4J56E 1JZDA 4EUYA 1GSSA 1S3DA 5FWGA 1BX9A 1FHEA 5CP1A 1EV9A 3VPQA 1R26A 3IRAA 4BWQA 1Z7RA 3RHBA 4TR1B 3BCIA 2HYXA 3GURA 1TK5B 2H73A 3M3MA 1AQVA 1GSUA 5CNWA 2XBQA 1GTAA 3IDVA 3GH6A 3WGDA 2R3XA 3GX8A 1EOHA 3UEMA 5LNKe 3DIEA 4EXJA 2H0GA 2MMZA 3FK8A 3HA9A 2I9HA 4GCIA 4MH2A 4WF4A 4HDEA 5IMAA 5ELGA 2GQLA 4YH2A 2YWMA 3CYNA 1DUGA 3KM6A 1AQWA 1WP0A 3PGTA 4MABA 3IXRA 1Z5YE 1EV4A 2LNTA 2RLIA 4KH7A 2JSYA 3TKSA 2RM6A 1FB0A 1PQNA 2FD3A 3EURA 3HDCA 3QAGA 4HQSA 3VURA 3IA1A 1GUHA 4Q5NA 2C3NA 2ES7A 19GSA 5D8IA 1XW9A 2YANA 3MNGA 3KD0A 2ON7A 2L57A 5IO0A 5G30A 1FAAA 3FR9A 5L71A 1JHBA 3I43A 3IPZA 3FYGA 3TKSE 3P90A 4DVCA 1R4WA 1I5GA 4IJ3A 4PQ1A 3MSZA 3LG6A 3VPTA 2C1YA 4XS4B 4ULXA 5G5EA 1F2EA 3EU4A 1U87A 2HZFA 4HEA2 3DGQA 2AYTA 2F8AA 2VL9A 4HJ2A 1F3BA 2WS2A 2NPBA 4KSOA 2GS3A 3CXGA 2AV4A 3HZ8A 2VAFA 3F6FA 4XHMA 5GSSA 2GSSA 1TOFA 4HU7A 5A4VA 3IR4A 4TR1A 4BA7A 3IOSA 3BCKA 2VLVA 2DMMA 4L0UA 1J08A 3LSZA 1XCCA 3KCMA 3EC3A 2OJLA 4ZBBA 2H1DA 5GSTA 2I3YA 1QGVA 5ABRA 3Q6OA 3TJJA 1PL1A 4O92A 4AGSA 3WYWA 3N5OA 2GSTA 1OKTA 1TDIA 3TJBA 3M8NA 2F8FA 5KN2A 1K3LA 2GQMA 5GAPD 4LA1A 4F2IA 3HZ4A 2C80A 2GGTA 1YEPA 5INYA 1ACVA 3FRCA 4ZBAA 3J7Yk 2WULA 2YWNA 5HQPA 1V98A 4E8HA 3LWAA 2AJQB 3TJKA 1X9SB 2R6KA 5FHIA 2L4CA 5ECIB 1GTUA 3QPMA 5E4WA 4EF0A 2IJYA 1R7HA 5A4WA 1R5PA 3GTUA 3IAM2 4O7HA 1W4VA 1C72A 1ERTA 2IWTA 4OMVA 3U6VA 5J5NA 5DQYA 5HFIA 2CVBA 3HHVA 4IVFA 2HE3A 5IOXA 2GZPA 3CRUA 4XS4A 2GQKA 4XS6A 4POKA 1THXA 3Q18A 2GTUA 1WWJA 1K0MA 5ECNB 2JSZA 4OO5A 4QL7A 4K0GA 1K0CA 3PH9A 5JCUA 1K3OA 3VWVA 3APOA 1ML6A 2VIMA 3L9UA 4TXOB 2P5RA 1NHOA 2JZTA 3A3TA 3WT1A 2OADA 3GFKA 2VUPA 2GT5A 2HFDA 2M72A 4NMUA 2H6XA 2QC7A 2YWOA 3GH9A 3Q74A 4IS0A 1WE0A 4MJEA 4OFMA 4XCSA 4IQ1A 2OKAA 12GSA 3KTBA 3EMPA 3Q19A 3UBLA 2OBIA 2JZRA 2H01A 5B8BA 2DJ2A 3F9UA 3D4TA 5ID2B 3FZ5A 1BJXA 2FNOA 2LRCA 2VCVA 1TRUA 3US3A 1OKDA 4TN8A 3DXBA 4K0NA 4HZ2A 1SKRB 2DJJA 2KLXA 3FW2A 2LJAA 5CRGA 2H30A 1T8EB 4NV5A 3ME8A 4POLA 1XOBA 3ZVJA 3HCZA 13GSA 4FYBA 3A5WA 5IPGA 1OE7A 3TGZA 3KP8A 1PD21 1H4OA 6GSYA 2ZCTA 3HVSA 2VCTA 5KEJA 2QGVA 4ZL7A 6GSXA 2HSHA 1ZCPA 1A2JA 3G7IA 4J2FA 2WCIA 5CO3A 1EP7A 2VOCA 2DIYA 5JWRB 3ZMKA 2H66A 2VL2A 1GL8A 3TRQA 1X5CA 5IMDA 1VRSD 4MF7A 4ML6A 2CAQA 2HNLA 3GKMA 1SYXA 4TXOA 3P2AA 4GTUA 5ECHB 3DRNA 2AHEA 3DYRA 4IKHA 3SWLA 2X8GA 3DMLA 1SKWB 4J57E 2DBCA 5A5KA 1O8XA 3W8JA 2P31A 4MA9A 4XTSA 2EIQA 4DSRA 1XFLA 1HNAA 3GSSA 1WJKA 8GSSA 5C04A 2B6MA 2QKEA 2H70A 1A0RP 2AUVA 1MDJA 2H1BA 3IAS2 1GRXA 2L6CA 17GSA 4NV2A 3VI5A 2L4QA 1KTEA 2PUKC 1TJDA 4FYCA 2I4AA 3CSIA 4NWYA 4ZILA 5G5FA 5F07A 4OWYA 2DLXA 1TKDB 2J9HA 1YF0A 2B7KA 1N2AA 3H8QA 5HFKA 2N5BA 1QXHA 2LJKA 4QQ7A 1IYHA 2J23A 4GQFA 4ML1A 3QOUA 1HQOA 3FEUA 3FZ4A 2IL3A 1GSYA 4EVMA 2MMAA 3I69A 2L5LA 3FZ9A 1M2BA 3F3RA 1Q4JA 2B1LA 1QQ2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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