3EC3A

Crystal structure of the bb fragment of erp72
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
SPPSKEILTLKQVQEFLKDGDDVVILGVFQGVGDPGYLQYQDAANTLREDYKFHHTFSTEIAKFLKVSLGKLVLMQPEKFQSKYEPRMHVMDVQGSTEASAIKDYVVKHALPLVGHRKTSNDAKRYSKRPLVVVYYSVDFSFDYRTATQFWRNKVLEVAKDFPEYTFAIADEEDYATEVKDLGLSESGGDVNAAILDESGKKFAMEPEEFDSDALREFVMAFKKGKLKPVI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Isomerase
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A4
publication title Structure of the Noncatalytic Domains and Global Fold of the Protein Disulfide Isomerase ERp72.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 66
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2008-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ec3A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ec3A01
4L5OA 5G31A 2WGRA 1A8LA 3FYGA 3ZYWA 9GSSA 4FO5A 3BOAA 3H79A 3N5OA 1CQHA 2N5BA 2IIYA 4PXOA 1R5PA 2ON7A 3Q18A 2PVQA 3TKSE 4GQCA 1JFUA 3P7XA 4OO4A 2CX3A 1Z5YE 3G7JA 2LRNA 4KSMA 5HR0A 2XPEA 3HDCA 4NPBA 3U6VA 3HJMA 1BX9A 2AV4A 1BEDA 5F06A 5DBQA 4EF0A 2C3QA 1TU8A 1K0NA 3J7Yk 3GSTA 3FRCA 1OC9B 4OFNA 1H75A 2YOIA 3P90A 3SBCA 5IMZA 4WF4A 1OKDA 3U5RE 4EKZA 3DIEA 3L78A 3QFAC 3FEUA 5ECIB 1WIKA 1X9SB 2C0GA 6GSUA 4MJEA 2CX4A 3GIXA 4L5LA 3BCKA 3HZ4A 1PD21 2GQKA 2DLXA 5G2ZA 2PGTA 3WGXA 2AB6A 3KP8A 3KTBA 2E2MA 5AIVA 3QPMA 4DSRA 1R26A 1LJRA 1SL2B 4NWYA 1BYEA 2LQQA 2EIQA 4LL4B 2VL2A 1U87A 2VL2C 1PL2A 1OC3A 2RLIA 1K0OA 2K18A 1SJZA 1EZKA 3MNGA 3TB2A 1N2AA 3KD0A 4OCFA 3DWVA 3UARA 3D4TA 1MD4A 1XOAA 5D9XA 1G6WA 1SK2A 2VO4A 4ULXA 1O7UA 4XS4B 2FGXA 1PX6A 5IOXA 2H1AA 1B9YC 4KCEA 4DEJA 1THXA 4V2NA 3Q19A 3LYKA 2QSIA 1Q98A 3TJKA 4PQHA 2F9SA 2RUEA 4IN0A 4AJ8A 1YY7A 1O85A 4OO5A 2ZUPA 1ST9A 1B9XC 1GLQA 1V9WA 4J57E 6GSXA 4GRFA 3C7MA 1XWBA 1ERVA 1QGVA 4MF5A 4JR6A 5IPHA 1ZGNA 3P8WA 2A2RA 4F0CA 4OWYA 3F4RA 5DCGA 2VCQA 1UA5A 3VI7A 2L4CA 4TVEA 2LTKA 1U88A 4F0BA 1NSWA 2G0FA 4YQMA 2FHEA 1X0RA 4YQUA 3IC4A 4BL7A 2JU5A 4FYCA 4IBPA 4EO3A 5D9WA 2I4AA 3CRTA 3GV1A 2IJYA 3EURA 1GTUA 3ZTLA 2PWJA 3ERFA 5CYYA 1XZOA 3MAKA 1FAAA 4KB3A 1C72A 3M1GA 4TR4A 2XBIA 1TTZA 1GTBA 4HI7A 1B4QA 3HKRA 1KBNA 1SK1A 5LD0A 1K0AA 2JZSA 2V2GA 3ZVJA 3KGKA 11GSA 3GKKA 1V98A 4ZILA 1EV4A 3UVTA 4EDZA 5ECMB 3QCPA 2H66A 3HJOA 1YEPA 1AXDA 1WWJA 1HD2A 2C8UA 5DQYA 2VCWA 3Q6OA 3CBUA 5FT3A 5JWOB 1EEJA 1OE8A 2X8GA 1B48A 3HVXA 3IDVA 3ZFBA 3UBKA 2WJUA 3KM6A 1A24A 2R2JA 2REMA 2IMFA 5IMCA 3GMFA 3GL3A 1THOA 4PQIA 1GUKA 3IRAA 4X43A 2GTUA 3RPPA 5JWRB 2XPDA 3LYPA 5DVBA 2VL3A 3WGDA 6GSSA 2R6KA 2G2QA 4D73B 5DAKB 5B8AA 3GKMA 4TR3A 1EOHA 4LMWA 1MDKA 2HI7A 3QFBC 5HFGA 1SKRB 1HQOA 2JSZA 4G10A 4ZBBA 4KCAA 3TKPA 1AIUA 1TRUA 4CW9A 1XOBA 1FOVA 4ZXGA 3IE3A 2YCDA 5D9VA 3GX0A 2X8CA 1WPIA 3ZZXA 4L0UA 4JR4A 2VCZA 3C1RA 17GSA 3A2WA 4XRAA 3W8JA 1HNCA 2OBKA 1MTCA 1LU4A 4RQRA 1AQVA 4CDOA 3FZ4A 1FB6A 2DIYA 4DSSB 2VIMA 1GNEA 7GSSA 1GSEA 2R5GA 3GKXA 4XTSA 2X99A 4I5QA 2AHEA 2XHFA 3IA1A 4O7HA 2H74A 5IO2A 2WRTA 2YANA 2LSTA 3KIJA 5J4UA 3D0ZA 4Q5QA 3HD5A 1XW9A 4JBBA 6GSTA 1SK0A 3KMNA 1KTEA 1SD9A 1QMVA 2VD1A 3BJ5A 2A4VA 2AYTA 4WBJA 1O81A 2K8VA 4IQAA 1GSDA 3L0HA 3NIVA 4EVMA 4HZ2A 3UOMA 1OC8A 3LG6A 1W89A 5ECKB 1ZL9A 4POKA 3KTLA 3IHQA 2KP1A 2HZFA 3DYRA 4DSQA 2DMMA 4V2LA 1M2AA 19GSA 5INYA 2YJHA 2GSSA 2YWOA 5B8BA 1VF2A 2FWHA 1SL1B 5J41A 1SJIA 3I9V2 1PN9A 4O32A 3GL5A 1XW5A 1KEBA 4PUFC 4F03A 4K0GA 2CVBA 3A5WA 4MZCA 1XWKA 2P31A 4J2FA 3GFKA 4MF6A 1TXXA 4E8HA 3F4TA 2WS2A 3HCZA 5JCGA 2LQOA 2DIZA 1CQGA 4MCUA 2VCTA 3F0IA 4ECIA 4G2EA 1GSUA 3WGEA 2FWEA 5J5NA 5D73A 3MWHA 1V40A 2NBSA 1ACVA 3CXGA 1PQNA 1WP0A 2FUG2 5ID2B 4EUYA 4GF0A 4YQVA 3I6AA 1T00A 4G9HA 3FZ9A 5KN0A 3W8SA 4IJ3A 3W6GA 5CREA 3LXTA 4FYUA 1HYUA 3O3TA 2LNTA 1M9AA 12GSA 2CT6A 3F8UA 4HJ2A 3C71A 3UBLA 2VM1A 1GSFA 1HNAA 2DC5A 1EGOA 2FNOA 4K7NA 1XW6A 3QMXA 5ECPB 4OCEA 5F0GA 1ERTA 5DALA 1EGRA 4HUAA 4EC0A 4ECJA 3GKNA 5DALB 4EDYA 3ZRDA 5JWQB 4NXIA 3TJGA 2C0FA 3PH9A 1GUMA 3A2VA 4ZBAA 18GSA 1T8EB 3ZMLA 2VLUA 2HSHA 3M9KA 3EINA 1J9BA 4V1Ap 5D9TA 2LKUA 4GLTA 4FYBA 2K8SA 2WZ9A 3UVHA 1SYRA 5B6NA 4HOJA 3VI5A 2R4VA 3H4KA 8GSSA 1XVWA 2PERA 2PN8A 22GSA 1ON4A 3WYWA 2WULA 4LL1B 4KDXA 2OACA 1OC9A 2DSAA 5DJLA 2MMOA 5A4UA 3E3EA 1Z6NA 2JZTA 2F51A 5IMDA 3PGTA 3F9UA 4K7OA 4I6XA 4ZB6A 4L8EA 4XIHA 5F05A 3LJRA 3RDWA 3DXBA 1JZDA 3EMXA 2B5XA 4ID0A 5CRDA 2XC2A 4PQ1A 4XS6A 1X9WB 2OE0A 2X8HA 4IHUA 1YEXA 2CAIA 4IP1A 1GTAA 5IIZA 2LNSA 4ZL8A 1UN2A 3DMLA 2L59A 2L6DA 1RW1A 2AUVA 1ZCPA 20GSA 3IR4A 3APQA 1GNWA 3EYTA 1YQ1A 4K1FA 3A2XA 5JCUA 5CRHA 5A4WA 4NMUA 4P3YB 5D93A 5EPFA 1X5DA 3PINA 5B6MA 5IMVA 3KP9A 2JSYA 3CSIA 3VLNA 3LFLA 2KOKA 2VCXA 2DJ0A 4XS4A 1GSYA 1MD3A 2FWFA 5CAXA 5KN3A 1S3AA 2OA7A 1GSQA 4MMMA 1K3YA 3WT1A 2QC7A 3M8NA 5DJMA 1QXHA 2HSYA 2VUPA 3R2QA 3GNJA 4FH8A 2LJRA 1URMA 3GH9A 1F2EA 4EXJA 4POLA 1RK4A 4PUAA 3CSJA 4KA0A 3K8NA 4NAXA 4ZB9A 2LRTA 1EEMA 4GTUA 1BAYA 4JU5A 4ACSA 2L5LA 1AAZA 1R5AA 1PSQA 3ERGA 1J0FA 2EIRA 5HFKA 4MP4A 3F63A 4NHWA 1JZWA 4GSTA 1TJDA 3F3RA 4ISDA 2B7JA 2NTOA 1YKAA 3AY8A 2HRFA 2NDOA 2EC4A 2V32A 1A0RP 2OKAA 4BVYA 2MYGA 1K3LA 4IJIA 1SJ6A 3CTGA 4K0NA 4OFTA 3TRXA 5J3RA 4KX4A 4JE1A 4Z7XA 3C8EA 1BQ7A 2VD0A 4KH7A 4TXVA 4F82A 1USBA 2OJLA 1EP7A 3GTUB 4HS1A 1O8XA 1T1VA 2GS3A 2J23A 2GT5A 1XFLA 1FHEA 2HYXA 4TN8A 3L9UA 3HZ8A 3C73A 3G7YA 4GSNA 2LRCA 5GSTA 1JHBA 1XPVA 2WCIA 1XWCA 1WE0A 3ZIJA 4K2DA 10GSA 1B4PA 2DMLA 3BCIA 1OVNA 5CNWA 3KCMA 2BJXA 4PGTA 5HFIA 6GSYA 2N5FA 2RIIA 3ZVJD 2VAFA 2ES7A 1V58A 4TR1A 2B5YA 2B5EA 2LS5A 1TKDB 4RI6A 4TR1B 3IBHA 1K0DA 5HR3A 4TW5A 2FCHA 2I81A 3D22A 4N0ZA 2X64A 1JZOA 3HJPA 4X1UA 3M0FA 1V2AA 1JLVA 1YF1A 13GSA 3CSHA 1MEKA 1XCCA 1OE7A 3RHCA 4ML1A 16GSA 3TUEA 4YH2A 5IMAA 2MZCA 3EMPA 1PGTA 1OYJA 3VWWA 1M9BA 4MJCA 3J7Yb 1XIYA 4D73A 5DAKA 1OKTA 2CVKA 1VF1A 3APSA 2MBSA 4YAVA 2N5AA 1YF0A 1E6BA 4MLYA 5DDLA 2CZ2A 1DBYA 1TK8B 4MPFA 3TKSA 4BWQA 3TKSC 14GSA 2L57A 5ELAA 4HU7A 3VWUA 2PPTA 4MDCA 3S9FA 4MH3A 1Z9HA 4IS0A 1EV9A 3ME8A 3KEBA 3MSZA 4DSSA 1DE2A 1N8JA 2BTOT 2RM6A 2GQLA 2H1BA 1K0BA 4MH2A 3GX8A 4HJMA 1KNGA 2DJKA 3QD9A 5B7CA 4TOPA 1VF4A 3GN3A 4X0XA 3RBTA 3IPZA 2O7KA 2YJ7A 1GH2A 4LA1A 5GAND 4IVFA 2FD3A 3M9JA 4NV5A 4RQXA 2CVDA 3TRQA 4GQFA 3ZREA 5G1LA 2WDUA 4GXZA 1R4WA 2GZZA 5ECLB 4QL7A 4N11A 2PUKC 1ERUA 3LXZA 3DEXA 1F3BA 2M80A 5D96A 2MMZA 3FKFA 1K0CA 1G0TA 2V6KA 5ECRB 3QR6A 3HVSA 2GSQA 5ECHB 2VL9A 1G6YA 5A5KA 1GSSA 1YJ6A 3A3TA 5F07A 3F6FA 4O92A 5LNKe 2NVLA 4LMVA 1EP8A 2LJAA 2LUSA 3HY2A 6GSVA 4XCSA 1R7HA 1F6MC 2IPAA 5DQSA 2YPMA 2JZRA 2HZEA 4IP6A 3UMAA 2R3XA 4WR4A 1GRXA 2HZEB 1SYXA 1X5CA 5L71A 2C1YA 1OAZA 3CRUA 5IQYA 5CO3A 2TRCP 5AISA 2DJJA 4IKHA 2FY6A 3VPQA 2HRNA 1RQMA 2HXKA 4XS1A 4MPGA 4GCIA 1TU7A 3RAZA 5G5FA 2GSRA 1DSBA 1SENA 4Q5FA 3DRNA 1GULA 3VPTA 1ML6A 1O8WA 2DJ3A 4KGIA 1TDIA 5ID2A 2VCVA 1A23A 3TJBA 2JL4A 1O6JA 1VF3A 2VOCA 1B8XA 1PRXA 4N10A 1HNBA 5C04A 1TK5B 4POBA 3Q74A 2PBJA 2V6OA 5ECSA 4KUNA 2HNLA 3TCOA 3GYKA 3IAM2 2I9HA 5COHA 2PU9C 4PX1A 4RI7A 1ZYQB 1SD8A 3EVIA 1XWGA 4MZBA 1LBKA 3KXOA 1WJKA 1G7EA 5HQPA 3DD3A 5AN1A 4RUVA 3D5JA 4AGSA 5AIXA 3IXRA 1A2LA 1A2MA 3VWVA 2VLVA 1FO5A 5LCZA 4HEA2 3SWLA 1TI1A 1TRVA 2P5RA 4IQ1A 3ZL5A 3ZMKA 1NM3A 3ED3A 2BMXA 1XVQA 1ZYEA 1WRYA 3QOUA 1SKSB 2YWIA 5ABRA 4WKWA 5H5RA 3FZAA 1PA3A 4FIWA 5EY6A 4OMVA 1QQ2A 3FR9A 4HU9A 2YWNA 2HLSA 2YZUA 4K8MA 2C0EA 1PX7A 4EL1A 1I9DA 2F8AA 1U6TA 2GZPA 2H30A 1GLPA 3VFIA 1X5EA 2H70A 1ZMAA 2GGTA 2YP6A 2IMKA 2H71A 4MZWA 2PVOC 1GTIA 4O5RA 5A4VA 4JZQA 2YV7A 3ME7A 2H6YA 4TXOA 4Q5NA 2CZ3A 3L9SA 1F9MA 1I5GA 5H5QA 3H1NA 2GLRA 1JLWA 2KLXA 1WMJA 4TXOB 3JCML 4OD7A 2RUFA 1J08A 3FHKA 4HDEA 2TIRA 4V2MA 4KW6A 2FWGA 3PR8A 3L4NA 2ALBA 4L0WA 5C00A 1H4OA 2O89A 4NHZA 3D21A 3O6TA 3FR6A 2K9FA 1O73A 3WD6A 3G7IA 3TKQA 1DE1A 4TR0A 3APOA 2HFDA 5E59A 2HE3A 4ILFA 4CHSA 4KAEA 3C1SA 3DKSA 3GURA 2R37A 2H1DA 1FVJA 5EL8A 2B3SA 4KNDA 1T7PB 2H6XA 4ZIJA 3HXSA 3EWLA 3IAS2 1Z3EA 2DBCA 5IO0A 1XXUA 1TW9A 3HA9A 3UAPA 3GH6A 5FHIA 4HQZA 4QL9A 1SU9A 4I97A 2AAWA 2FA4A 1JZRA 4WXTA 2NPBA 1T4ZA 3LGCA 2L6CA 5ECNB 2AJQB 4PNGA 1IYHA 1YKCA 1M2DA 1A8YA 3QAWA 1U3AA 1TK0B 1ILOA 3CYNA 4BWSA 3TOUA 3UJ1A 2H8LA 2EIOA 4TRXA 2YV9A 3F4SA 2P0GA 5FWGA 1SL0B 2M46A 2MMNA 3N9JA 3EE2A 2C3TA 1A2JA 3IV4A 1TP9A 3ZITA 2C3NA 3DGQA 2RM5A 3F6DA 5D8IA 1PKZA 4HZ4A 3M3MA 1M2BA 1NHOA 2B1KA 2V41A 2YNXA 2H0GA 4F9ZA 2D2ZA 3BD2A 4KDYA 3KH7A 2B7KA 1PMTA 3CTFA 1Z7RA 4KDUA 2IMEA 5ECQB 5GAPD 2JADA 1VGLA 5CP1A 3US3A 4MF7A 3GTUA 4J56E 1XBSA 1AUCA 3FY7A 3I69A 2IL3A 2H01A 1AQWA 2OE1A 4K9ZA 3GA4A 4ZBDA 2TRXA 3LWAA 4N0VA 2PMTA 2C80A 2O8VB 3EC3A 1Y6EA 2E2GA 2GSTA 3UIWA 1F37A 3VK9A 1M7TA 1E2YA 3HYPA 2V1MA 2CQ9A 4NV2A 3HVVA 3RHBA 2H1GA 1ZZYA 2XBQA 4ZL7A 2H0HA 4DVCA 2E7PA 2QKEA 1Y25A 5H5SA 5KN1A 3KH9A 2L4QA 5GZZB 3TGZA 2MBTA 3DVWA 3KJYA 5IPGA 2H6ZA 2IN3A 2F8FA 4OFMA 2ZCTA 2MMAA 1MDJA 3QAGA 5KN2A 3V1WA 5CRGA 4F2IA 4POMA 4BPYA 1FB0A 4PURA 4Q5RA 4MK3A 4BA7A 5CRWA 1K3OA 2M72A 1S3DA 4MJBA 3IOSA 3TKRA 4AF2A 1F3AA 3ISOA 4WR5A 4JEDA 3LSZA 4BVXA 3NZNA 2IFQA 3QDNA 3TJFA 1UC7A 2CA8A 1X9MB 3GRXA 2IFQB 1AQXA 2H0IA 1QK8A 3OR5A 4EE0A 3GHAA 3GUSA 3ERWA 2OADA 2CAQA 2CV4A 4WETA 5IMFA 1ABAA 2K6VA 3RPNA 4YAPA 5AGYA 4HQSA 2VLTA 1EWXA 3VWXA 4H86A 5G1KA 3E0UA 2IMIA 2FA8A 3TRPA 4G19A 1U3IA 1GUHA 2I3YA 2KHPA 1V57A 3LQ7A 1AC1A 1M0UA 3FR3A 1BJXA 1EOGA 2H19A 2DJ2A 3WT2A 3MDKA 3ZIVA 4V1Ag 1GP1A 2L5OA 2LJKA 1IYIA 1T4YA 2ZNMA 4ECCA 2KP2A 3D6IA 4K7IA 2J9HA 2F3MA 1Z7PA 1PL1A 2VM2A 3DVXA 4MA9A 3CMIA 4WBRD 3IK7A 6GSWA 5HR1A 1UVZA 4I8BA 1DUGA 3FW2A 4IGJA 2H75A 3F3QA 3TDGA 2WB9A 5J9BA 1FVKA 2GT6A 2YWMA 1Z6MA 2WFCA 3IK9A 2JACA 3FK8A 2HT9A 2LEGA 4TKYA 1K0MA 1SKWB 4ZB8A 3UL3A 1Q4JA 1FG4A 1WOUA 2FLSA 3EU4A 4KE3A 3VURA 3NOFA 3EU3A 1M99A 2H73A 1YDKA 4AJ7A 4IELA 3LEFA 5G5EA 1PKWA 2O87A 5E4WA 2OE3A 1VRSD 4WF5A 4XRDA 1FW1A 5J9CA 2KUCA 5ECOB 2Z9SA 3GSSA 1QFNA 1S3CA 4JRRA 2GZYA 2GQMA 3UEMA 1AW9A 2OBIA 2O85A 2C4JA 5EVOA 4GWRA 5IM9A 2E0QA 2A2SA 3E9JB 3QAVA 4I2TA 1ZOFA 1QUWA 2I1UA 3TOTA 1NW2A 5KEJA 1TOFA 2IMDA 2B6MA 2H72A 3ZLPA 5GSSA 3LORA 4LLRA 1YZXA 4XHMA 3D4MA 2YZHA 1W4VA 2IWTA 3P2AA 4I2UA 4IW9A 2P5QA 3HHVA 4MJAA 4MABA 4KSOA 1NHYA 3KMOA 4ZL9A 4ML6A 2DJ1A 2GVPA 1TI3A 5HR2A 5ENUA 5F8BA 1MDIA 3ZFLA 5G30A 1XWAA 4K6XA 1TRWA 4N30A 5JCWA 4GSSA 4ECBA 3KZQA 2ON5A 3L9VA 1A0FA 4QQ7A 5IOWA 1GL8A 3BBYA 3G9BA 3FZ5A 4PNFA 1ERWA 2QGVA 2LV3A 5ELGA 2H76A 3H93A 1GWCA 1BG5A 2GDRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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