3EC3A

Crystal structure of the bb fragment of erp72
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
SPPSKEILTLKQVQEFLKDGDDVVILGVFQGVGDPGYLQYQDAANTLREDYKFHHTFSTEIAKFLKVSLGKLVLMQPEKFQSKYEPRMHVMDVQGSTEASAIKDYVVKHALPLVGHRKTSNDAKRYSKRPLVVVYYSVDFSFDYRTATQFWRNKVLEVAKDFPEYTFAIADEEDYATEVKDLGLSESGGDVNAAILDESGKKFAMEPEEFDSDALREFVMAFKKGKLKPVI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Isomerase
source organism Rattus norvegicus
publication title Structure of the Noncatalytic Domains and Global Fold of the Protein Disulfide Isomerase ERp72.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A4
total genus 66
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2008-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ec3A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ec3A01
4EDZA 1HQOA 1A24A 3CBUA 1A0RP 2R2JA 3KTBA 4EKZA 3GSSA 3WD6A 1BJXA 4EDYA 1GSQA 2WRTA 12GSA 4MZWA 1Z3EA 4H86A 5ID2A 1X9MB 1VF1A 2HSYA 4DSSB 4MJCA 4HOJA 3GA4A 2WGRA 3ZZXA 1U6TA 2YV9A 3VWUA 2RLIA 3U6VA 4YQVA 2F8FA 2R4VA 2HRNA 3HCZA 1QGVA 1TI3A 4K2DA 3UEMA 1WMJA 3GL3A 4K6XA 3MNGA 4AJ8A 3APQA 1TRSA 1JHBA 4X1UA 4J2FA 1EP7A 3EMPA 2H0IA 4KGIA 4KH7A 5CO3A 4K7IA 3IE3A 1YKAA 2ES7A 1M9AA 3RPPA 5AN1A 2X8HA 4OWYA 1W89A 4IKHA 4DSQA 3KTLA 4WKWA 1A0FA 3ZL5A 2C3NA 1ERVA 1DSBA 3DIEA 1M7TA 5C00A 2GLRA 2VLTA 2YCDA 3VPTA 3VPQA 4KDXA 3QFBC 4LLRA 3BOAA 3GN3A 3DGQA 4F2IA 3FR6A 4PQIA 1TW9A 3U5RE 4NHZA 1KTEA 1CQHA 3FEUA 2GZPA 1SJIA 2V32A 2VL9A 3HXSA 1GUHA 2AV4A 3G7IA 2KP1A 1PA3A 4OFNA 3F0IA 1XOBA 1V9WA 2VL2A 4GQCA 3I9V2 5E4WA 1WE0A 4EC0A 1FAAA 4BA7A 1ZYEA 1XXUA 5B7CA 1H75A 1FHEA 5ID2B 2DMMA 3A3TA 2LSTA 1HNCA 1UVZA 3KMOA 2YJ7A 2CVKA 4ZIJA 1M2AA 1YY7A 2DJKA 3ERFA 1EOHA 2CVDA 3TJFA 4AJ7A 3UIWA 1TXXA 3NIVA 2N5AA 13GSA 1OE8A 3IK7A 2TRXA 4ZB6A 5ECNB 2YWMA 2MBSA 3QFAC 3KP9A 4RI7A 2KP2A 5ECSA 1PX7A 4XRDA 1Y6EA 3KIJA 5DDLA 1A2JA 3ZITA 2XC2A 1QFNA 4ECIA 2IMFA 4KB3A 2J23A 3KZQA 2XBQA 2X64A 1BQ7A 1LBKA 2P5QA 4IBPA 4TOPA 1Q98A 5EPFA 3E0UA 2PVQA 2P5RA 2FA8A 3EE2A 2YWNA 1GTBA 1XWGA 1ACVA 3Q74A 1IYIA 3I6AA 2YWIA 4HZ4A 3GMFA 2O8VB 1O8WA 2LRNA 3EU4A 3UVHA 2GGTA 1X9SB 2H73A 1TU8A 3M1GA 4K0NA 2GTUA 3KJYA 4JE1A 1ABAA 3C1RA 2CVBA 5ECIB 2C0DA 2GQLA 4TN8A 4I2TA 1VF4A 3F9UA 4K0GA 1T8EB 4V1Ag 1GLQA 2H0GA 1GTUA 1NM3A 3I43A 4ZB8A 2RIIA 1PKWA 4XIHA 3IC4A 2FCHA 3DRNA 2FY6A 4CDOA 4ML6A 4PUFC 2C3QA 4NPBA 1TRWA 3GX0A 3L78A 1OC8A 4L8EA 2F51A 5IMZA 2E7PA 3QCPA 4G9HA 3Q18A 3G7YA 1ERTA 4KA0A 2H30A 3ME7A 2H6YA 3TUEA 4PNFA 3PR8A 2WJUA 5IM9A 2LJKA 1SL2B 4NWYA 3ERGA 4MLYA 2WFCA 4EO3A 2WCIA 3ZRDA 1XFLA 1ILOA 4MPFA 3W8SA 3EMXA 1QK8A 1TP9A 2HI7A 5A4WA 1FOVA 4QL7A 1NSWA 2DBCA 2EC4A 5IMVA 2B7JA 3TGZA 1M9BA 1O85A 2LRTA 3ZYWA 4OFMA 4DVCA 3TKSE 4TR1A 1LJRA 5D9XA 1XOAA 3S9FA 2PERA 2FNOA 2GSSA 5ELAA 5A4VA 1BX9A 1T1VA 5DVBA 1A8YA 2V1MA 4POBA 2H1AA 3O3TA 3ZMLA 3F63A 2H66A 4MH2A 3P90A 3TRPA 2C4JA 3VI7A 4AF2A 2PGTA 4TXOA 4IGJA 1I5GA 1Z7RA 4WR4A 1MTCA 3OR5A 4GRFA 4JR6A 5CRHA 4N10A 1PL2A 4POKA 3IBHA 4V1Ap 1GUMA 1FW1A 2V2GA 2FUG2 2FWFA 3BJ5A 3DMLA 2LQOA 4G2EA 3HJOA 5CP1A 3FR3A 2R6KA 1K0NA 5IQYA 3NOFA 5J5NA 3VLNA 4HJMA 1GNWA 5ECPB 1TK8B 2JL4A 4HQSA 1F2EA 2EIOA 3EYTA 4Z7XA 5DQYA 2NTOA 4FH8A 2QSIA 5D9TA 2C0GA 2KOKA 3F3RA 1SL1B 2G0FA 1TK5B 9GSSA 1F9MA 4XS6A 1ZOFA 3N5OA 6GSYA 2QGVA 3RPNA 4ECJA 2IFQA 1F3AA 5JCUA 3GIXA 4MH3A 1WPIA 2CA8A 3GTUA 5DJMA 1Z6MA 3KH9A 1XVWA 3RHCA 4WF4A 4BVXA 3TOTA 2IWTA 3BBYA 2RM6A 1A23A 4DSSA 2OE3A 2BTOT 4KSOA 2LNSA 2WDUA 1ZL9A 3HJPA 1RQMA 3ME8A 3M8NA 1JZRA 4HI7A 3ZMKA 1XWAA 1N8JA 1QMVA 3EC3A 2C0FA 4V2LA 2M72A 3EWLA 2ZUPA 4IQ1A 4OCFA 2VD1A 1Z5YE 4TXOB 2DIYA 3FZ4A 1S3CA 1DUGA 1EGOA 2H01A 16GSA 1SD9A 2OKAA 1PD21 4GSNA 6GSWA 1PGTA 2NPBA 2KHPA 2VCQA 5FWGA 1GTIA 4IN0A 1A2LA 5J9BA 1DE2A 4XS4A 2VD0A 1EGRA 3QAVA 6GSXA 2AB6A 4ML1A 2L6DA 5JWQB 4LMWA 1OKDA 2IMDA 3EU3A 4JBBA 2LS5A 4XHMA 2ON5A 5DQSA 1X5DA 2HNLA 2DJ1A 3UL3A 3UVTA 2NDOA 4BWSA 2CZ3A 3M9JA 1IYHA 4WETA 1XW6A 2C80A 3ZIVA 2B1KA 3FZ5A 4L5OA 4V2NA 4TXVA 1JZOA 3KD0A 3D6IA 3ERWA 1GH2A 2H71A 3CSHA 4O5RA 2VOCA 4ZXGA 5ECOB 3QR6A 3LXTA 3PGTA 2AHEA 2CAIA 2QC7A 3J7Yk 3ZVJA 4WBJA 2O87A 1QXHA 1EP8A 1YDKA 2HE3A 3LWAA 3RBTA 3RAZA 2E2GA 2IFQB 2XBIA 1E6BA 3TKSA 1T3BA 3GTUB 3CMIA 1EV9A 1ZMAA 2KLXA 3WGEA 5B8BA 4NMUA 3WGDA 4IP6A 2X99A 3TJGA 1PN9A 2DJ2A 5DCHA 5AISA 1VGLA 5IOWA 2HXKA 1ST9A 5IMFA 3GKXA 3L9SA 3VI5A 1V2AA 3L9UA 3MDKA 5D73A 3VK9A 2NVLA 3FK8A 1K0DA 2XHFA 4F0BA 2CX3A 1OYJA 5F0GA 2F3MA 5L71A 1TU7A 4E8EA 1X5EA 3UAPA 2IMEA 1Y25A 1XWKA 4ZB9A 3ZTLA 4IHUA 2VCTA 10GSA 2E2MA 5G31A 2LV3A 3FY7A 2DJJA 1GSYA 4PQ1A 3KEBA 2I9HA 3QAWA 1FG4A 1EOGA 3QOUA 3APOA 2H6XA 4XS4B 4G10A 2MZCA 1K3OA 4MMMA 5D8IA 2H75A 1F37A 1F6MC 18GSA 1GTAA 5F05A 2OJLA 1PL1A 1SD8A 2IIYA 14GSA 5DAKB 3CSJA 1U88A 2LUSA 1OC9A 2K8VA 1B9YC 4XCSA 3JCML 4EL1A 4WBRD 1FVKA 3IRAA 4JZQA 4KE3A 4PX1A 5F06A 2WB9A 3M9KA 1R5PA 2F9SA 1CQGA 1GUKA 2GT6A 3KCMA 4KW6A 20GSA 1SK2A 1TDIA 2IN3A 2J9HA 1H4OA 1YJ6A 5HFGA 1HYUA 1U3IA 1GNEA 3CXGA 5E59A 4CHSA 4AJ6A 1K0MA 1AUCA 3H79A 3CSIA 3WT1A 3D21A 4XS1A 5G1KA 1G0TA 2FD3A 1GSUA 2OADA 2MBTA 4IQAA 4QQ7A 3W8JA 2GSRA 2B3SA 2VM1A 2GDRA 2MYGA 5HR1A 5EL8A 2C8UA 3E9JB 1G7OA 4IJIA 1QUWA 4QL9A 4BWQA 5LD0A 2DJ0A 4MCUA 4ZL8A 3CTGA 1FB6A 3QAGA 2P0GA 5J4UA 3GYKA 1B4QA 2K18A 4PXOA 5H5QA 2B5EA 4ZL7A 1M99A 4TRXA 1RK4A 2PMTA 1XWCA 1SKSB 4NV2A 1ML6A 2AYTA 1B9XC 3GKKA 4PNGA 2WZ9A 1R26A 4FIWA 2IPAA 3G9BA 4D73A 1NW2A 4LL1B 4LA1A 4ZBAA 3LFLA 1V98A 4OFTA 1VF2A 2CT6A 3DYRA 5D93A 5J41A 4X43A 5C04A 3UOMA 3VWVA 3P2AA 4KCAA 4RQXA 1OC9B 2LEGA 3GX8A 4OO4A 2JZRA 5IO2A 5IMCA 3KGKA 3F4RA 2PVOC 2GQKA 5G30A 3I69A 4NHWA 4OD7A 5ECMB 4ZILA 3ZREA 4KNDA 1B4PA 1OE7A 3C8EA 3KH7A 1AQWA 4MABA 1XVQA 3TKQA 1XZOA 5ELGA 2CZ2A 3D0ZA 4BVYA 2VAFA 4O32A 5ENUA 2GT5A 3V1WA 5CNWA 3E3EA 5D9VA 5HR0A 4IJ3A 3FZAA 4AGSA 4MF7A 2H70A 5GSSA 5CRDA 2FWHA 2BMXA 1HNAA 5AGYA 4MK3A 1TOFA 4RI6A 2YN1A 4JRRA 2YZHA 1U3AA 2VLUA 3A2XA 4Q5RA 2CX4A 3NZNA 4Q5FA 5H5SA 1SK0A 4KSMA 4N11A 2CAQA 3A5WA 2CV4A 2L6CA 11GSA 4MPGA 2H0HA 1ON4A 1GULA 2VL2C 3O6TA 3MWHA 4MJAA 5GSTA 2L4QA 4YAPA 3H4KA 3IXRA 4GTUA 3TB2A 2A2RA 1ZGNA 4D73B 3C73A 3HHVA 4N0ZA 4MA9A 2HZFA 1ZYQB 2OA7A 5HQPA 2M80A 5FT3A 2IL3A 1SK1A 2B1LA 3KMNA 4FYUA 1K0BA 4Q5QA 2RUEA 1TKDB 3G7JA 2YP6A 3GL5A 3EURA 1GRXA 2FWEA 2FA4A 2P31A 4F9ZA 5ABRA 3L9VA 4F82A 5CREA 4I8BA 4LMVA 1G6YA 3C71A 3F4TA 1V58A 1ERUA 1FVJA 4OCEA 3GH9A 3C1SA 4YH2A 1SKWB 1YZXA 5B8AA 2YNXA 4YQMA 3ZLPA 3TJJA 2I81A 3P8WA 3HVSA 4P3YB 1K0AA 3GKNA 4PGTA 5HFKA 3VFIA 1GL8A 1JFUA 5JWOB 2OBIA 2PU9C 4ISDA 1SL0B 1V40A 3W6GA 3M0FA 2GZYA 4I2UA 4N30A 3QDNA 1A2MA 4IS0A 1PX6A 1JZWA 3MAKA 4GXZA 2O85A 3IAM2 2I4AA 4KDUA 2FHEA 2B5YA 1KNGA 1G7EA 3F8UA 2IMIA 5EY6A 3AY8A 6GSUA 4TKYA 1J9BA 5JCGA 2H1GA 3GV1A 2H6ZA 3ED3A 1MD4A 5DALA 4MDCA 4HS1A 2MMNA 4MP4A 3UARA 2JSZA 3UJ1A 1PRXA 1MDIA 1G6WA 1E2YA 3DWVA 3HVVA 2OE1A 22GSA 4K1FA 5DJLA 5J3RA 5IO0A 3VWWA 3F6FA 19GSA 2VO4A 2WS2A 2FWGA 3LXZA 3IA1A 1T4ZA 1I9DA 3DEXA 4GLTA 4NAXA 4X0XA 1AIUA 3P7XA 1FB0A 3LGCA 2HZEB 3L4NA 3D4MA 1HD2A 4POMA 5CRGA 3TDGA 3GH6A 2LKUA 3ZVJD 3GFKA 4GF0A 5AIVA 5DAKA 1XIYA 5CRWA 1X5CA 1FO5A 1XWBA 4GSTA 3O76A 3LQ7A 4MZCA 1GWCA 2VM2A 2DSAA 5ECQB 2PN8A 2L5OA 2X8GA 3MSZA 4HJ2A 3TKRA 1NHOA 1S3DA 3Q19A 2GSTA 1SU9A 1YF0A 4NV5A 3UBKA 1WWJA 1EWXA 3RDWA 1X9WB 1GSEA 3FW2A 2C0EA 2H1DA 3BD2A 3HD5A 2TRCP 4CW9A 4O7HA 3GHAA 3GSTA 1ZCPA 2XPDA 4IP1A 3IAS2 2O7KA 1UN2A 4ILFA 2L59A 5KN0A 2PBJA 5DALB 1R7HA 4GQFA 3TCOA 3CRUA 3FRCA 8GSSA 2HFDA 5G2ZA 1SYRA 3IK9A 2PPTA 2LTKA 3GNJA 1X0RA 1Q4JA 1OKTA 3HZ8A 3IV4A 4L5LA 2YV7A 3LYKA 1UC7A 1AAZA 3US3A 5INYA 3LSZA 4EF0A 2QKEA 2K6VA 1K3LA 3D4TA 1SENA 1YF1A 2DJ3A 1EEMA 2RM5A 2O89A 1YEXA 2JZTA 1URMA 3H93A 2JU5A 4ACSA 1M0UA 2AJQB 2REMA 1UA5A 1F3BA 2FLSA 4GWRA 3TRXA 3TJKA 2LJRA 1A8LA 2H74A 2OE0A 4ZL9A 2NBSA 3L0HA 2LJAA 1K0CA 1BEDA 5ECRB 1Z6NA 2H19A 3ISOA 3HA9A 4HU9A 4F0CA 3VURA 3GKMA 5B6NA 4WXTA 3A2VA 1GP1A 2YWOA 5JWRB 1YEPA 1R4WA 3HZ4A 3DVXA 3D22A 1T00A 3SWLA 1BYEA 2H8LA 2OBKA 5DBQA 3UBLA 1V57A 4KDYA 1MD3A 2B6MA 1MDKA 2AUVA 1O8XA 3IOSA 2A2SA 5DCGA 5AIXA 4TR3A 4ZBDA 5LNKe 2LRCA 2EIQA 4ID0A 1WJKA 1TTZA 4F03A 2HLSA 4EE0A 2V6OA 7GSSA 4XTSA 3TRQA 1KEBA 3PINA 5IPGA 1Z7PA 4MF6A 4V2MA 1OC3A 2OACA 3HY2A 5IOXA 2C1YA 2PUKC 4KCEA 4E8HA 2IJYA 3WYWA 2A4VA 2HYXA 2WULA 2VCZA 4JEDA 1ZZYA 4I97A 1BAYA 1YKCA 4MJBA 5D96A 2TIRA 5KEJA 3TJBA 3QPMA 3HVXA 4J56E 2V41A 1TK0B 1QQ2A 2FGXA 4TR0A 4WR5A 1GLPA 3KXOA 1JLVA 5CAXA 3TKSC 4LL4B 5GAPD 2GQMA 5GZZB 2DC5A 3KM6A 4BPYA 4K8MA 4RUVA 4J57E 3A2WA 5KN2A 2D2ZA 5ECKB 5G5EA 5F07A 1K3YA 2VCVA 1XCCA 3IPZA 1VRSD 1EV4A 4N0VA 2DIZA 4KAEA 3EVIA 1DE1A 2VCWA 2XPEA 2M46A 1USBA 4TR4A 3H8QA 2MMAA 2JACA 3WT2A 2B5XA 2Z9SA 3IHQA 1O6JA 4WF5A 2JZSA 4PURA 2IMKA 4OMVA 2ZCTA 1THXA 3DKSA 1M2BA 5IPHA 1DBYA 5G1LA 1MEKA 1AC1A 3IR4A 5IMDA 1WRYA 4L0UA 4IW9A 5H5RA 1OVNA 5IMAA 4NXIA 4TW5A 2AAWA 2DLXA 4ULXA 5HFIA 3ZFLA 2V6KA 5A4UA 5FHIA 4JR4A 4YQUA 1JLWA 3F6DA 1THOA 1XW9A 3FR9A 4TVEA 4POLA 1TI1A 1Z9HA 4Q5NA 1VF3A 2R37A 4FYCA 2BJXA 2JSYA 1XW5A 4FYBA 3ZFBA 4PQHA 3WGXA 2KUCA 1ERWA 2F8AA 3HDCA 1WOUA 4HDEA 3QD9A 2ON7A 1R5AA 3TKPA 1YQ1A 5ECHB 2H1BA 2YANA 2VL3A 3C7MA 5KN3A 2VUPA 2X8CA 2I3YA 2DMLA 3APSA 2R5GA 3BCIA 3HYPA 2YJHA 5HR2A 1AXDA 3ZIJA 4MZBA 2R3XA 4KUNA 3FHKA 3FKFA 4ECCA 1PMTA 1HNBA 1M2DA 1OAZA 3RHBA 5B6MA 1SKRB 3K8NA 2L5LA 1GSFA 3DXBA 5F8BA 1RW1A 3LG6A 2VIMA 5EVOA 2ALBA 3R2QA 4ECBA 4EUYA 2HSHA 17GSA 3LORA 2YZUA 1BG5A 3TOUA 3Q6OA 2K9FA 2HZEA 2MMZA 3CTFA 3IDVA 5HR3A 1SJ6A 3GRXA 2HRFA 3F3QA 4BL7A 4HQZA 5GAND 2VCXA 2CQ9A 2MMOA 3LYPA 2H72A 2EIRA 3FZ9A 2E0QA 1T4YA 1PKZA 3H1NA 2I1UA 1LU4A 1GSDA 2VLVA 4RQRA 1MDJA 4K9ZA 1PSQA 3SBCA 2YOIA 1W4VA 1AW9A 3HKRA 1GSSA 1C72A 5JCWA 2H76A 4DSRA 3CRTA 3GURA 4ZBBA 4O92A 3N9JA 4K7OA 5KN1A 1PQNA 3GUSA 2LQQA 3UMAA 4JU5A 1KBNA 4HZ2A 1NHYA 4HU7A 1XPVA 3VWXA 4L0WA 1AQXA 1K0OA 2K8SA 2C3TA 5G5FA 3CYNA 4TR1B 2RUFA 3DD3A 1O73A 4PUAA 4XRAA 3HJMA 1EZKA 6GSVA 4HUAA 3F4SA 1WIKA 4WEYA 3M3MA 1SJZA 1B8XA 4DEJA 4EVMA 2GS3A 2HT9A 4I5QA 4OO5A 1TJDA 3FYGA 3LEFA 1XBSA 5D9WA 4G19A 4I6XA 2JADA 3D5JA 4K7NA 2N5BA 1TRVA 2LNTA 3LJRA 1J0FA 4HEA2 1J08A 4MJEA 4EXJA 2G2QA 1O7UA 3EINA 4GCIA 1U87A 3BCKA 3KP8A 4GSSA 1N2AA 2PWJA 5COHA 1EEJA 1O81A 5ECLB 6GSSA 3DVWA 3J7Yb 4MF5A 5CYYA 1SYXA 3QMXA 6GSTA 4IELA 4YAVA 1T7PB 1AQVA 1TRUA 2ZNMA 3PH9A 4FO5A 2GSQA 2L4CA 1WP0A 2B7KA 5J9CA 2L57A 1JZDA 4IVFA 5IIZA 2YPMA 5LCZA 4KX4A 2GZZA 1B48A 5A5KA 2GVPA 2N5FA 1S3AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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