1S3AA

Nmr solution structure of subunit b8 from human nadh-ubiquinone oxidoreductase complex i (ci-b8)
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
GLREIRIHLCQRSPGSQGVRDFIEKRYVELKKANPDLPILIRECSDVQPKLWARYAFGQETNVPLNNFSADQVTRALENVLSGKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords NADH-ubiquinone oxidoreductase B8 subunit
publication title The oxidized subunit B8 from human complex I adopts a thioredoxin fold.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 22
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature ec 1.6.5.3: Transferred entry: 7.1.1.2.
pdb deposition date 2004-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05047 L51_S25_CI-B8 Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1s3aA00
4JE1A 4MZCA 5L71A 1EWXA 5CRDA 3UBKA 3ZL5A 1I5GA 4PQHA 1TOFA 4I5QA 1VF2A 2WZ9A 3LYKA 1DE1A 1YF0A 5J9BA 3FRCA 3GUSA 2LKUA 4POMA 3F3RA 1XOAA 5ECNB 4NV5A 5HR2A 3HCZA 4TVEA 1M2BA 4RI7A 1AUCA 5A4VA 4POBA 3L0HA 1JHBA 1M9AA 3JCML 3GKMA 2WJUA 6GSWA 3HZ8A 3GN3A 3GKXA 4PQ1A 1Z7RA 4OCEA 2LRNA 2Z9SA 4BPYA 3HA9A 4OFTA 1J08A 5ECSA 1ZZYA 1MTCA 4O92A 5CRGA 1V57A 1GSDA 3EWLA 5B6NA 3C71A 3GL5A 4PNFA 3C1SA 1VRSD 5JWQB 6GSVA 2OBKA 3NIVA 3QFAC 1KNGA 5DQSA 4ZB9A 1FVKA 2GSSA 4O32A 1JZWA 2O8VB 1XWAA 3Q74A 4KAEA 2GQMA 2WB9A 4LL1B 1U3AA 4WXTA 5DQYA 2H19A 2XBIA 4DSSA 2I4AA 5ECOB 3IRAA 2H30A 1ML6A 4L8EA 5IOXA 1YKCA 1HYUA 3FK8A 2H1AA 1ZYEA 1YZXA 4WR4A 3GKKA 6GSSA 2PVQA 1MD3A 1URMA 1TI3A 2DMLA 2I9HA 4IQ1A 1TDIA 4LMVA 2YN1A 3D5JA 1ZOFA 3RPNA 1TP9A 4PUAA 4ZL9A 1ILOA 2NDOA 1SL2B 1GSYA 5HFGA 2CAIA 4IVFA 4POLA 2A4VA 1TK5B 3TKPA 1O6JA 2X8CA 3GSTA 3KIJA 3QPMA 4YQUA 3DD3A 5J5NA 5EPFA 4NHZA 2C1YA 3Q19A 2AB6A 3IHQA 2GLRA 2LSTA 4EL1A 3UL3A 1R5AA 1XWBA 5INYA 3DVWA 3F3QA 1THXA 5LNKe 2DIYA 2RUFA 3F63A 1U87A 5DJLA 2VIMA 4OFNA 3A2WA 2JSYA 4DSSB 2DIZA 1G6YA 6GSXA 1S3CA 1QMVA 1HNBA 3E0UA 2MBSA 1AQXA 2LS5A 4OO5A 2ZNMA 3I9V2 1M7TA 2ZCTA 4HUAA 3TKQA 3ME8A 3Q18A 2F51A 1JZOA 2AAWA 5F07A 1GUKA 2JSZA 2DBCA 3GKNA 4H86A 1TRVA 1ERUA 2BMXA 1GSEA 1QUWA 2HFDA 2L4CA 1CQHA 1SL1B 2V32A 2NBSA 1SK2A 2H74A 5IOWA 3F4TA 3SBCA 2R37A 1S3AA 1NSWA 1ZCPA 3CBUA 1OC3A 1X9WB 2C3NA 2R3XA 2QC7A 3J7Yb 2GS3A 3LWAA 4ZXGA 1VGLA 2L5OA 2RM5A 3HDCA 1UVZA 3EU3A 4HOJA 2V1MA 1XW5A 4MK3A 5J4UA 5CAXA 3KMOA 1OYJA 2N5AA 2NTOA 4IN0A 5GAPD 3QD9A 5C04A 1A0RP 2GT6A 2ZUPA 1XW6A 3GV1A 3E3EA 3QR6A 3DEXA 4WBJA 1JFUA 4MLYA 3G9BA 2GSQA 3L4NA 3C7MA 1EEJA 3TCOA 1FB0A 2R5GA 2VL2A 3VLNA 4WBRD 3FY7A 2YANA 1V9WA 1A8YA 2DMMA 2B5EA 3HYPA 3FZ4A 1YY7A 4N11A 4E8HA 2YWIA 3CYNA 2V6OA 3GYKA 3GL3A 4KCAA 1U3IA 2YWOA 2IMDA 5FWGA 4YAVA 1SKSB 3CSHA 4KDUA 2KHPA 4IBPA 4BWQA 2C80A 3ERWA 5AIVA 2WS2A 5KEJA 1GH2A 4PNGA 5AGYA 3KD0A 1V98A 3I43A 4ECBA 4NMUA 1PD21 4I8BA 2VL2C 2P0GA 7GSSA 4KSMA 4ZB8A 4MZWA 4KA0A 2IL3A 2LRTA 1M99A 2OJLA 1GSUA 1XW9A 3IBHA 3QOUA 4WF4A 4WETA 4Z7XA 3BD2A 3GFKA 3O6TA 1HNAA 3UVHA 2IIYA 1A2JA 2GQLA 1E6BA 2JU5A 1SENA 1SKWB 2VOCA 4GWRA 4EE0A 2D2ZA 3WT2A 2B5YA 3L9VA 5AIXA 5DVBA 1LU4A 1MDJA 4ECIA 2H76A 4PURA 1F37A 1ZGNA 1PL2A 4DEJA 2VCZA 2HLSA 4MPFA 4HU7A 1ERWA 4I6XA 1A2MA 1T00A 1V2AA 1NM3A 1G7OA 4NAXA 1T4YA 2K18A 3VURA 1GUMA 1GULA 2H8LA 4X0XA 1WRYA 2B6MA 3H4KA 4LMWA 4TRXA 1BG5A 4EKZA 3ZRDA 4KW6A 3KCMA 1Q4JA 4K0NA 1MDIA 2YPMA 2H0IA 4MJEA 2FUG2 2GZZA 5DCGA 3VPQA 3IK9A 3DIEA 1T1VA 4ZBAA 2OBIA 2EC4A 18GSA 1M0UA 4IJIA 1N2AA 2XHFA 2WRTA 2B7JA 4IKHA 4OMVA 1GTIA 3CRTA 3CSIA 3GMFA 3M0FA 4O7HA 4FO5A 4HZ4A 2JADA 2MMNA 4N30A 5GAND 2YJ7A 2MYGA 4PQIA 4GTUA 1NHOA 1XPVA 1N8JA 4YAPA 4WKWA 3WT1A 1GNEA 2LQQA 3UARA 3FKFA 1X5EA 4QL9A 3U5RE 2HNLA 1XWGA 3QMXA 1QK8A 1GL8A 2WDUA 2LTKA 1M2AA 1XBSA 3WYWA 5C00A 5ELGA 4HU9A 1JLWA 2N5BA 3CTFA 1PA3A 1Z9HA 1G7EA 3TJGA 3LSZA 2FWHA 2MZCA 1NW2A 1ON4A 3EURA 3ISOA 2K9FA 2O87A 5ECQB 1GSSA 3U6VA 4IQAA 5G1LA 3IOSA 1BX9A 5D9XA 1KTEA 2V41A 1G0TA 4HQZA 2VO4A 4IP6A 2L57A 4IW9A 4L0WA 5D9WA 2L59A 2FCHA 2VAFA 2R6KA 1XVQA 4MABA 2FA8A 3P2AA 2IPAA 3VPTA 1SL0B 8GSSA 3M8NA 3IXRA 2E2MA 4MJCA 2CV4A 2CA8A 5ECPB 3MAKA 5IMFA 2F8AA 3IDVA 2TRCP 3FR3A 2H1DA 4CW9A 4TR4A 2DJ2A 2YOIA 1WJKA 5E4WA 3W8JA 2GSTA 2VL9A 2L6DA 3F0IA 5LCZA 5IQYA 1XXUA 3CRUA 3CMIA 3WGDA 2M46A 3IE3A 3BOAA 1KBNA 1EZKA 2I81A 4EVMA 1QXHA 1GRXA 1X9MB 1TXXA 3C73A 3TUEA 2RM6A 3GNJA 5EVOA 3G7YA 3EINA 3VWWA 4K7IA 3GRXA 4ILFA 4K9ZA 2PMTA 3F6FA 4EDZA 3IA1A 1SJ6A 3LJRA 2TIRA 4KNDA 2A2RA 4GLTA 1GNWA 1TRSA 2FWEA 1TRWA 3L9SA 5F05A 3EMXA 2VCWA 1WOUA 4Q5RA 2F8FA 4BVYA 4MF5A 4EDYA 4GCIA 2HZEA 2EIQA 4NV2A 4J57E 4KX4A 5G30A 2HSHA 1ZL9A 6GSYA 5G1KA 3APOA 4F0CA 2B1LA 2KLXA 4K0GA 3LORA 1H4OA 1F3AA 2B7KA 4F03A 3MNGA 3ERGA 3P90A 3QCPA 5AN1A 2VM2A 2IJYA 2PU9C 4V2LA 1K0CA 1O8XA 1Z3EA 4WF5A 2A2SA 3DYRA 2H73A 1K0BA 1AAZA 5F06A 2AV4A 5IIZA 1YJ6A 3TJFA 2GGTA 3PH9A 3W8SA 1OC8A 1X9SB 4G19A 1PN9A 5CO3A 4HQSA 1OVNA 1IYHA 2KP2A 5COHA 3UIWA 5G31A 5A4UA 3ZLPA 1DSBA 5G5EA 4YH2A 1SD8A 3PGTA 3RHCA 2RUEA 1Y25A 5HFIA 2BTOT 2V2GA 4G10A 3A5WA 2HZEB 3KM6A 2DJJA 4G2EA 1F9MA 4EF0A 5ECKB 2C8UA 2YJHA 3UJ1A 2H71A 3N5OA 1AIUA 1M2DA 1K3LA 2XC2A 3Q6OA 5JCGA 2YWNA 2LUSA 2RIIA 4TN8A 5IMDA 2V6KA 2B1KA 1K0NA 3F4SA 1QQ2A 3TJKA 2O89A 3HZ4A 2H0HA 3R2QA 5FT3A 3VWUA 4ML6A 1GLQA 4KSOA 2OE0A 1K3YA 2XBQA 3A3TA 4CDOA 3DRNA 3OR5A 1PGTA 5D9TA 2TRXA 3DVXA 2ON5A 3PR8A 1MDKA 1TTZA 4JU5A 3VI7A 2IMFA 3H93A 1O85A 1TKDB 2AJQB 5CNWA 2O7KA 1B8XA 2G2QA 3D6IA 2AHEA 2FLSA 5JCWA 1OE7A 4IS0A 3HVSA 4GQFA 2HXKA 2GQKA 3HKRA 4MF7A 3KMNA 4ULXA 2IMKA 2X99A 2F9SA 4OCFA 2EIRA 1WIKA 2IWTA 2YV9A 2PWJA 3BBYA 5DBQA 3G7IA 4G9HA 1X5DA 2FY6A 2LEGA 1K0DA 5CP1A 2HRNA 4QL7A 2H1GA 4HS1A 4XS6A 2JZTA 2CVKA 3EYTA 2K6VA 3TGZA 2OE1A 3CXGA 2LV3A 2FD3A 4F82A 5IMAA 4MP4A 2AYTA 4PUFC 1ACVA 4O5RA 4XCSA 2VD1A 2IMEA 3KJYA 4PGTA 4F2IA 2FNOA 3H79A 3M1GA 5JCUA 2VCQA 5DAKA 5IM9A 1ST9A 1U88A 1XZOA 2CX4A 3VK9A 2N5FA 2OACA 5B6MA 4QQ7A 5H5QA 3D4TA 17GSA 5ELAA 1UN2A 4FH8A 3KEBA 1USBA 2HT9A 3BJ5A 2JZSA 3IV4A 1O8WA 2REMA 2YCDA 3EVIA 1EOHA 2CX3A 1Z7PA 20GSA 1PX7A 2HZFA 2F3MA 3DXBA 1OAZA 2H66A 2RLIA 5JWOB 4XRAA 1OC9A 5DDLA 1OE8A 2M80A 3M9JA 1XFLA 3GTUA 2L6CA 3MSZA 3TB2A 4X1UA 2LQOA 1A24A 3RDWA 3DWVA 3E9JB 2ON7A 4JR4A 3MWHA 4JBBA 5FHIA 5IMCA 5B8AA 1TK8B 5KN0A 5DAKB 1XVWA 5CRWA 3NOFA 1Z5YE 4HJ2A 2KP1A 3F4RA 5D8IA 3I69A 1A8LA 4OWYA 1ERTA 4K8MA 2GTUA 2CZ3A 1O81A 4GSSA 2WCIA 3UOMA 4KUNA 2KUCA 2LJRA 2H1BA 1QGVA 2GZYA 5KN2A 3UMAA 3QFBC 2WGRA 1R4WA 2I1UA 1O73A 5F0GA 3ZIVA 3H8QA 4LA1A 4N0ZA 3KP9A 4GSTA 2PPTA 2FGXA 2YNXA 4K7OA 2VLVA 4XTSA 1OC9B 1X0RA 2E2GA 1GSQA 3WGEA 4Q5QA 4ZL8A 5IO2A 4GF0A 3EC3A 4EUYA 3HHVA 1Z6NA 2MMAA 4L5LA 3H1NA 3ZITA 2R4VA 3F9UA 5A5KA 2JZRA 3GURA 2PGTA 4Q5FA 2YZHA 4GXZA 3GSSA 4JRRA 2KOKA 2LNTA 1SU9A 3VWVA 2FWFA 4N10A 3D0ZA 1XWCA 3J7Yk 5B7CA 3L9UA 1R7HA 1FB6A 3HXSA 1T7PB 4V1Ag 4TXVA 2M72A 1FG4A 1SKRB 1K0AA 2J23A 2PBJA 4ISDA 12GSA 1UA5A 3QAWA 3FEUA 5A4WA 4YQMA 1TK0B 4TR3A 2I3YA 3RBTA 5HR3A 1TI1A 4Q5NA 1A2LA 2GVPA 4NWYA 2YWMA 5IMZA 5J41A 3NZNA 2MMOA 1AC1A 1HQOA 1TJDA 4AF2A 1AW9A 3APQA 2GT5A 4L5OA 3DKSA 1F2EA 1XWKA 3MDKA 3LXTA 2IN3A 3W6GA 2QSIA 2C4JA 2DSAA 4TR1A 3GH9A 4MMMA 22GSA 2JL4A 3HVXA 2H72A 4MH2A 4BWSA 4ACSA 4BL7A 2PERA 2H0GA 1B9YC 2GDRA 3ERFA 5GSSA 1DE2A 4P3YB 2ALBA 1JLVA 1OKDA 2OKAA 2QKEA 3KH9A 1W4VA 2P5QA 2MMZA 4NPBA 4V2MA 1EGOA 4HJMA 1MD4A 2HRFA 3UVTA 1YEXA 4MF6A 4JEDA 4EXJA 3FR9A 4DSQA 1EEMA 1EV9A 1PMTA 3TRQA 1A23A 2OE3A 2ES7A 3S9FA 1LJRA 4MH3A 2CT6A 3EE2A 4WR5A 1FO5A 4AJ8A 5EY6A 3TKSE 4ZILA 4IHUA 4MCUA 1R5PA 1KEBA 3TOTA 2NPBA 1BJXA 2E0QA 2X8GA 1GTBA 2C3QA 5DALA 4GRFA 4IELA 4F0BA 3TKRA 3FZ9A 1W89A 2OA7A 2FA4A 2LJKA 3VI5A 1J9BA 4TR1B 5ENUA 5HR0A 3KTLA 1HD2A 3LG6A 1CQGA 4BA7A 2H6XA 1FAAA 5DCHA 4K6XA 1XOBA 5HFKA 4MJBA 3G7JA 4ZIJA 5HQPA 5CRHA 5JWRB 3SWLA 3IAS2 3EMPA 3FZ5A 4BVXA 5ECMB 4XS1A 3ZREA 2VD0A 2LNSA 1V58A 1S3DA 1WE0A 1VF4A 4OFMA 3TRPA 3M9KA 3KXOA 13GSA 2O85A 3CTGA 5IO0A 2FHEA 4HI7A 3IPZA 3LGCA 4ECJA 4MA9A 1ZYQB 5DALB 3HJMA 4TW5A 3LFLA 1UC7A 1PRXA 2DJ1A 3L78A 3ZTLA 1DBYA 2MBTA 3PINA 4NHWA 4FYCA 4ID0A 5KN3A 1I9DA 1T3BA 2P5RA 3ZFLA 3D4MA 1C72A 4LLRA 3HVVA 1VF3A 1YEPA 1GUHA 4JZQA 1YQ1A 1PSQA 1G6WA 1Z6MA 3GHAA 1FOVA 3UBLA 3GA4A 1RQMA 3DMLA 4N0VA 4GSNA 1WWJA 2HE3A 4ZBBA 4HEA2 1DUGA 3VWXA 4YQVA 2C3TA 4EC0A 11GSA 1BYEA 4JR6A 2B5XA 3TOUA 3ED3A 5G5FA 3TJBA 1WP0A 2DLXA 3AY8A 4X43A 3O76A 2G0FA 5ECIB 5GZZB 3UEMA 1LBKA 3IK7A 4IJ3A 4PX1A 2R2JA 1B4QA 2K8VA 3LQ7A 3TRXA 2PUKC 6GSTA 16GSA 1SD9A 5D96A 1Y6EA 5ECHB 5J3RA 5CREA 2VCXA 1EV4A 5B8BA 1M9BA 4F9ZA 3TKSA 3KH7A 3APSA 4K1FA 3GIXA 1GSFA 2GSRA 2CQ9A 1ERVA 3GX8A 4ZBDA 4KDXA 1MEKA 4MJAA 2C0GA 1GP1A 4EO3A 2C0FA 1FHEA 5G2ZA 3A2VA 2J9HA 4IP1A 4ZB6A 3C1RA 4ECCA 4IGJA 3RPPA 2C0DA 3F6DA 1E2YA 4MZBA 1EOGA 5ABRA 1EP7A 1B48A 1B4PA 3M3MA 1FVJA 3HD5A 5IMVA 2HI7A 2B3SA 1TU7A 3TKSC 1H75A 1T4ZA 2LJAA 1F3BA 5KN1A 1RW1A 4MDCA 3HY2A 4HZ2A 3FYGA 3KZQA 3LEFA 3RHBA 3QAVA 4RQXA 4TOPA 3FZAA 1JZDA 3A2XA 4I2UA 1GTUA 2WFCA 1WMJA 3GH6A 4HDEA 4J2FA 1GTAA 1K0OA 3FW2A 3IAM2 3TDGA 3P7XA 2VCVA 2VM1A 5IPGA 4FYUA 4KCEA 1F6MC 2BJXA 1AXDA 3ZZXA 2HYXA 3ZMLA 2VLTA 1SYXA 2H01A 1SK0A 3P8WA 5J9CA 1BEDA 1JZRA 4CHSA 3O3TA 3HJOA 14GSA 1BAYA 4V2NA 1TRUA 1V40A 3K8NA 4FYBA 3US3A 3LXZA 2GZPA 3D22A 1FW1A 3I6AA 1XIYA 1ABAA 2VL3A 1PX6A 3VFIA 2HSYA 3QDNA 2YZUA 2AUVA 1U6TA 1YF1A 1PKWA 1K3OA 3FR6A 1K0MA 4TXOA 2CZ2A 5E59A 5H5SA 3V1WA 2VLUA 1XCCA 4KGIA 2H6YA 4RI6A 4OO4A 3BCIA 5H5RA 3EU4A 5HR1A 4RQRA 1T8EB 3F8UA 1EP8A 2OADA 2DC5A 5EL8A 4D73A 2H6ZA 1OKTA 4MPGA 2DJ0A 3IC4A 5ECRB 5GSTA 10GSA 1ZMAA 5DJMA 1EGRA 2FWGA 3ZYWA 5LD0A 4RUVA 4OD7A 4L0UA 4FIWA 4XRDA 2DJ3A 3GX0A 3ME7A 1PQNA 4I97A 3GTUB 2IFQA 3RAZA 4K2DA 4ZL7A 3D21A 4KB3A 4XS4A 2YV7A 4I2TA 5CYYA 2CVDA 4KH7A 1X5CA 4LL4B 2P31A 4DVCA 1A0FA 2XPEA 2H70A 5ID2A 2XPDA 4TXOB 4K7NA 4V1Ap 3C8EA 4AGSA 4GQCA 3ZVJA 2K8SA 2PN8A 2WULA 2YP6A 1AQWA 1GLPA 2NVLA 3BCKA 2EIOA 1NHYA 1J0FA 4D73B 2L5LA 3ZVJD 3QAGA 2VCTA 3ZIJA 4AJ7A 1WPIA 1SJZA 3LYPA 4DSRA 2E7PA 4KE3A 2H75A 1YDKA 2CVBA 2LRCA 1O7UA 3WGXA 4NXIA 1THOA 1YKAA 1IYIA 3KGKA 4AJ6A 3ZMKA 2L4QA 1TW9A 4E8EA 3DGQA 3WD6A 4TR0A 1SK1A 2C0EA 2IFQB 4XIHA 3HJPA 5IPHA 3KTBA 4PXOA 6GSUA 1Q98A 19GSA 2X64A 4XS4B 1QFNA 1R26A 1PL1A 5F8BA 4KDYA 1BQ7A 9GSSA 1HNCA 4POKA 3KP8A 5ID2B 1SYRA 3ZFBA 3FHKA 1VF1A 5D73A 1PKZA 4TKYA 5ECLB 2PVOC 3UAPA 5D93A 1GWCA 1B9XC 1AQVA 3CSJA 5AISA 3TJJA 4ML1A 2X8HA 2CAQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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