1S3AA

Nmr solution structure of subunit b8 from human nadh-ubiquinone oxidoreductase complex i (ci-b8)
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
GLREIRIHLCQRSPGSQGVRDFIEKRYVELKKANPDLPILIRECSDVQPKLWARYAFGQETNVPLNNFSADQVTRALENVLSGKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The oxidized subunit B8 from human complex I adopts a thioredoxin fold.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
molecule keywords NADH-ubiquinone oxidoreductase B8 subunit
total genus 22
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature ec 1.6.5.3: Transferred entry: 7.1.1.2.
pdb deposition date 2004-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05047 L51_S25_CI-B8 Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1s3aA00
4HOJA 2LSTA 4E8HA 2LUSA 5IMCA 3CTGA 5JCWA 1JZRA 4PURA 3WGDA 2DJ1A 1YF1A 2PPTA 3TOTA 1GTIA 2A2SA 4IP1A 1TRSA 5DALB 2H01A 19GSA 2O87A 4F9ZA 4POKA 5CRWA 3HVXA 1B9YC 1JZWA 4CDOA 2VCTA 4IGJA 5IIZA 3DVXA 1PA3A 4IN0A 1M9AA 4TR1B 1JLWA 2ON7A 3C1SA 3VPQA 3C73A 3O6TA 4EC0A 4EDZA 1JZDA 2FNOA 5ID2A 2YWOA 4DSRA 2WS2A 2F8AA 1GP1A 2DJ2A 1JLVA 4L0UA 5ABRA 3TGZA 3M0FA 1K3OA 2VM1A 3IR4A 1G7EA 4KSMA 3P8WA 1ABAA 2V41A 4F2IA 4GSTA 2GSTA 3HDCA 3HXSA 3ZRDA 4K7IA 1K0BA 4J2FA 1J08A 4FYBA 2ON5A 3F6DA 1KTEA 4Q5FA 1WIKA 1GTBA 5AGYA 2L5OA 1TU7A 3ERGA 1WP0A 3DGQA 2HRFA 1FAAA 2HZEA 5DQSA 3KMNA 1M2AA 3GFKA 3U6VA 3FR9A 2TRCP 3QD9A 3HVSA 4FO5A 2G2QA 2C1YA 4ZBBA 5F07A 5B8AA 3FZ5A 2L5LA 4ZILA 4ZL8A 1GSEA 1SJIA 2PMTA 1A23A 3MAKA 4ZBDA 3VFIA 2YNXA 4RQXA 1Q4JA 4BWSA 4D73A 1T8EB 4TW5A 5H5SA 1AIUA 2HLSA 1YDKA 2DLXA 5ECKB 4HZ4A 4POLA 2B5EA 3HZ8A 1AQVA 1GTAA 2RM6A 2H6XA 2OBIA 16GSA 4K8MA 3F4RA 3VLNA 5DALA 2L57A 1ZOFA 3R2QA 1RQMA 2HRNA 4KNDA 4MJBA 3DD3A 1GH2A 1R5AA 4O7HA 1AQXA 3VWWA 5G31A 5ECQB 1BQ7A 2VCXA 3KP8A 4TR1A 3EMXA 2IMIA 2FHEA 2X8HA 2DSAA 2CZ3A 5J41A 6GSXA 1TRVA 4JEDA 4JZQA 5IMZA 3D21A 5J4UA 4HQZA 3W8JA 1TXXA 1WE0A 2NDOA 3NOFA 3QMXA 4TOPA 2HYXA 3LXZA 5J5NA 1TTZA 1TI3A 3Q6OA 3C8EA 1EP7A 2IMFA 4O32A 3UAPA 1ZL9A 2DJKA 2VIMA 2N5BA 2FCHA 4DSSB 4JRRA 5FHIA 2LRNA 4OO4A 2KUCA 4CW9A 1FB6A 3J7Yk 1BJXA 4EXJA 1E6BA 2VL9A 4Q5NA 4HU7A 2E2GA 1LU4A 1ERTA 5CNWA 4EKZA 3F63A 1R4WA 4TKYA 2GSSA 1B9XC 4QL9A 2OA7A 4GF0A 2QKEA 3P90A 2JSYA 4AJ7A 3U5RE 1N2AA 5IOXA 1ERUA 2YJHA 1RW1A 3QAWA 2H0IA 4L5OA 3M9KA 2PVOC 1SENA 2E0QA 1XIYA 2IIYA 3CMIA 5B7CA 3H1NA 2M80A 2H72A 2LEGA 5KN0A 2DMMA 1VRSD 3KH7A 4HU9A 2I81A 4F0CA 4LL1B 3QFBC 4PNFA 1YJ6A 1DUGA 2K18A 1WWJA 1NHYA 4MF6A 2RM5A 2C0DA 4WETA 14GSA 4NV5A 3HVVA 3NIVA 3HYPA 4IJ3A 1M0UA 1WJKA 5B6MA 1G6YA 4EF0A 4IS0A 5GSSA 2OJLA 5AIXA 3GL5A 1XVQA 3SBCA 3VURA 3EVIA 4PNGA 2L6DA 2JZSA 5JWOB 4BPYA 4ACSA 3VI5A 3HA9A 4K9ZA 3MSZA 3LQ7A 3VPTA 1FOVA 2I3YA 2LJAA 3DMLA 3ZVJA 4BL7A 2F8FA 2N5AA 4BA7A 2VO4A 4ECCA 1AUCA 4ECBA 2IL3A 1K0CA 1NW2A 2FGXA 2JSZA 2GT6A 5G1LA 2LNTA 1R7HA 4Q5RA 2H73A 3GKMA 2RUEA 3ERWA 3HY2A 1X5CA 2CV4A 1ZMAA 3HJOA 3UJ1A 3TKRA 1VF1A 17GSA 1K3YA 5ECLB 1FB0A 3JCML 3LJRA 3ZZXA 3VK9A 3GNJA 3ZIVA 4YQVA 4KCAA 2XHFA 2VD0A 4EUYA 3DWVA 1SL0B 3D22A 2MMZA 2WCIA 5J9CA 1K0NA 4KX4A 2HSHA 3GN3A 4GSNA 2B1LA 2CA8A 3ZVJD 4V1Ag 1TW9A 1EOHA 1JFUA 4MDCA 1M7TA 4LA1A 2H30A 2BJXA 2NVLA 1FVJA 1SL2B 3D6IA 4XRAA 4AF2A 5HR2A 3GX8A 2L4CA 3KP9A 5D9TA 4L8EA 2VCVA 2WB9A 2PWJA 2FWGA 2VD1A 4ECIA 2GS3A 1LJRA 1YQ1A 2AB6A 3NZNA 3ZLPA 3A3TA 4I8BA 1U3AA 4V1Ap 3O3TA 3IBHA 4OWYA 2O7KA 1GUKA 2C0EA 4K7OA 3ME8A 2YJ7A 5GAND 3G7JA 5DJLA 2C3TA 2YOIA 1O8XA 3ZIJA 3ERFA 5EVOA 1OVNA 5E4WA 5ELAA 2BTOT 2R3XA 4N11A 1ERVA 2YV7A 1EP8A 2GQKA 4GXZA 2H75A 4N30A 3TKQA 4TXVA 3GSSA 2VL2A 1XWGA 3Q19A 1YEXA 1B4QA 2CT6A 3VWXA 1GLQA 4IW9A 1AW9A 2GQLA 3IDVA 3BJ5A 1O6JA 8GSSA 2MBTA 1OKDA 2J9HA 2DJ3A 3QOUA 4KAEA 5DBQA 4K7NA 4YQMA 5JCGA 3RAZA 3TCOA 2L4QA 1MTCA 5HQPA 2V2GA 5JWRB 1OE7A 3I6AA 4IJIA 1UC7A 4V2LA 3W8SA 2M72A 3CSHA 1G6WA 1BX9A 4WBRD 2OKAA 3UVTA 1BEDA 1MDJA 5DCGA 1XWCA 2ZNMA 1Y25A 5CO3A 4X1UA 1V57A 1SU9A 2PVQA 3A5WA 2IMKA 2P5RA 1MD4A 5ELGA 2VLUA 5KN2A 1PGTA 2WRTA 3FEUA 2QSIA 1WPIA 2LRTA 4HEA2 3DRNA 3TJFA 2VLVA 3L0HA 2B5YA 4FIWA 4OMVA 3HZ4A 3TJKA 5E59A 2PBJA 3GHAA 4JR4A 5ECMB 4ZXGA 4HUAA 3VWUA 2PU9C 1QXHA 1B4PA 2RIIA 4NHZA 1XPVA 4HI7A 4KW6A 4F82A 4LMWA 2V6KA 3GKNA 2CVDA 4RI7A 5COHA 5EY6A 5IO0A 1FVKA 2GDRA 1AC1A 2R6KA 3FYGA 2DIZA 1YKCA 1EEJA 3GV1A 1KNGA 3KZQA 4RQRA 3PINA 1BG5A 4KSOA 4F03A 3GL3A 1M2BA 2JZTA 1ZGNA 1F3BA 2N5FA 1PL2A 1ZZYA 3LFLA 4K2DA 4NHWA 3IC4A 2LRCA 1JHBA 3C71A 4RUVA 3L78A 1GUHA 5HFGA 4BWQA 1OC9A 4NAXA 1S3AA 3ZFBA 4OFNA 4FYCA 4EL1A 1A2LA 2VAFA 3IV4A 5F8BA 3UARA 2HZFA 2H6YA 4OO5A 3VWVA 3N9JA 3DKSA 1BYEA 4NV2A 1R26A 3D4TA 4XCSA 4POMA 2O85A 2H19A 2AYTA 3ZFLA 5KN3A 3UEMA 1X9SB 1QK8A 1FW1A 2KOKA 4V2MA 2F9SA 2MZCA 4NPBA 2LS5A 6GSSA 1NM3A 5CP1A 4XS6A 4TVEA 2C4JA 3M3MA 4KUNA 3TB2A 4DVCA 3FK8A 1YF0A 1MDIA 9GSSA 4MMMA 1TRUA 2DC5A 5CYYA 4EVMA 3BD2A 1SKWB 1SYXA 2KP1A 5IPHA 5D93A 3DXBA 2WGRA 1AAZA 1N8JA 4MJCA 1H75A 1K0OA 1O8WA 2LJKA 4K1FA 4GRFA 1X5EA 4HZ2A 3QCPA 5HFKA 5J9BA 3CRUA 3GH6A 2VCQA 2K8VA 2JL4A 3UL3A 5B6NA 1OKTA 1OC3A 5G5EA 4WF5A 1YEPA 2DBCA 2JZRA 1E2YA 2IMEA 3RPPA 4GCIA 4KDUA 3RPNA 6GSWA 3UBKA 2CZ2A 5B8BA 4YAPA 2Z9SA 2YWIA 3KIJA 1TRWA 3APSA 2FWHA 1T1VA 2GZPA 2KHPA 4ISDA 1GLPA 1V98A 4PQHA 2O89A 4MZWA 3E3EA 7GSSA 3FY7A 2VLTA 1XW5A 1IYIA 4P3YB 3H4KA 1XVWA 3F3QA 4EO3A 2HNLA 3KGKA 3RDWA 2VL3A 3LG6A 3P7XA 2WDUA 2D2ZA 1A2JA 4MP4A 1PMTA 1XW9A 1PX7A 5FWGA 1NSWA 5C00A 4MZCA 4IP6A 1EV9A 4OFMA 3ZMLA 4HS1A 2C8UA 5A4WA 1EZKA 2X64A 2GTUA 1EWXA 2J23A 1K3LA 5IMDA 3EMPA 3L9UA 4TXOB 1OAZA 4G10A 4K0NA 1Q98A 1FO5A 2IWTA 4KCEA 3EU4A 4DSQA 1GL8A 2VCWA 3I43A 5G2ZA 3K8NA 2GQMA 4ZBAA 2FA4A 2YZUA 3FZ9A 2C3NA 4MH2A 4H86A 2NBSA 1DE1A 3WYWA 3G7IA 2YV9A 1B8XA 1PN9A 1XW6A 3TUEA 1CQGA 1ST9A 3M8NA 4WR5A 3IK7A 3C7MA 1GSYA 3KJYA 3F9UA 1UN2A 1A8YA 2MYGA 4GTUA 3Q74A 4BVYA 3F0IA 3TOUA 4O5RA 4IBPA 13GSA 3UVHA 4CHSA 2XC2A 2H0GA 5DAKB 5JWQB 3CSJA 1SJ6A 1F9MA 1QUWA 4MF5A 6GSVA 2R4VA 3UOMA 3L9SA 1KEBA 1J9BA 4DSSA 2X8GA 1URMA 3GTUB 1PRXA 5IQYA 2R5GA 4JU5A 1X0RA 2GSRA 1OYJA 1SK1A 1XFLA 3EE2A 2WZ9A 5DVBA 1XWAA 4JBBA 2AV4A 1RK4A 4TR0A 1XWBA 3SWLA 4ZIJA 5ECIB 1TKDB 5IM9A 4V2NA 4JE1A 4MH3A 4AJ6A 1Z9HA 1X9WB 2O8VB 2TRXA 1GSSA 3G9BA 3BCKA 5IO2A 4J56E 1ZYEA 3US3A 1THOA 1IYHA 1WRYA 1WOUA 3F8UA 4MA9A 1GSUA 2WFCA 5A4UA 1DBYA 5JCUA 5G5FA 2FY6A 2LQQA 2PGTA 5GSTA 3QFAC 5DJMA 2LNSA 3WT2A 18GSA 2VOCA 2B3SA 3TJJA 4WF4A 1EGRA 4OCFA 2R37A 1O85A 4GWRA 1F2EA 2GVPA 4MCUA 1T4YA 1M2DA 3DEXA 1EEMA 4G2EA 1ACVA 5D8IA 4PXOA 2YPMA 1MEKA 5IMAA 2EIOA 2K9FA 3MNGA 4RI6A 2IMDA 2H1GA 1OE8A 5ID2B 3QAVA 6GSYA 4GQFA 1MD3A 4TRXA 4XRDA 1V40A 1J0FA 3OR5A 1HNAA 4KDXA 2H76A 4L0WA 2AAWA 5ECSA 1YKAA 3C1RA 1SKSB 1XZOA 2AUVA 1I5GA 2B6MA 2PUKC 2HE3A 1TK0B 1T4ZA 3M9JA 3LXTA 6GSUA 1HNCA 1VGLA 3UIWA 4AJ8A 2LTKA 3L4NA 5A5KA 3I69A 4PGTA 1S3DA 4I97A 3GTUA 5J3RA 3PH9A 4HQSA 1F3AA 2GSQA 1A2MA 3UBLA 3HJMA 1DSBA 4OCEA 5F0GA 1T3BA 1SL1B 1GNWA 4KA0A 4J57E 3APQA 3KTLA 4FYUA 4N0VA 1YY7A 4ULXA 3PR8A 3IAS2 3FZ4A 5D9XA 3TJGA 3L9VA 1G7OA 4K0GA 4HDEA 3WT1A 2C3QA 1QGVA 2LJRA 4MK3A 3D4MA 4XS4B 2A2RA 4F0BA 2LKUA 2K6VA 2V32A 2AHEA 3V1WA 3GYKA 5ECHB 4ZL9A 3ISOA 1A0FA 3TKSC 1GRXA 3FRCA 3GSTA 4PX1A 2KLXA 3KH9A 4ID0A 5HR1A 2MMNA 3LSZA 4PUFC 4X43A 1GUMA 4O92A 2RUFA 1ML6A 1W4VA 4YQUA 5INYA 1PD21 3ZTLA 1F37A 12GSA 3GIXA 5CAXA 2FD3A 1EV4A 3S9FA 1W89A 4MABA 2ES7A 3M1GA 2CAIA 4IKHA 2M46A 2IN3A 2H1DA 3O76A 3KEBA 3CXGA 3ZMKA 1XOBA 1VF2A 3FHKA 3IA1A 2XPDA 5HR0A 3GKKA 3ED3A 3EWLA 5F06A 5AISA 4ML1A 2GZYA 2F3MA 4IHUA 4OFTA 3ME7A 3LGCA 3KCMA 1K0MA 3TRQA 2BMXA 3P2AA 1GSFA 2H66A 3EINA 1GTUA 2WJUA 2CQ9A 4XTSA 4ZB9A 3GA4A 3GX0A 2B1KA 3LYKA 4MLYA 1A8LA 1QMVA 2EIRA 5G1KA 2VL2C 1HD2A 1NHOA 5F05A 2KP2A 3A2XA 4KDYA 1A24A 2OBKA 1ON4A 2G0FA 3F3RA 3HHVA 2R2JA 5GZZB 1GWCA 3A2VA 4WR4A 2YN1A 2OE1A 3EURA 1PKWA 4IELA 1JZOA 1FG4A 5EL8A 1HQOA 4HJ2A 1M9BA 2E2MA 1PSQA 1Z5YE 1VF3A 3HD5A 2B5XA 1XBSA 1Z6NA 4XHMA 1Z3EA 1GULA 3W6GA 5A4VA 2FA8A 5ECPB 2VM2A 4IVFA 3CSIA 4XS4A 4GQCA 5CRGA 3CTFA 4K6XA 1AXDA 2ALBA 4PQ1A 2YCDA 2HT9A 1TK8B 1XXUA 3IRAA 5CRDA 3TDGA 5D9VA 3TKPA 2ZCTA 2MMOA 5EPFA 2A4VA 3TRPA 2AJQB 3DYRA 2VUPA 4NWYA 1SK2A 1V58A 2V6OA 4HJMA 5IMFA 1LBKA 5KN1A 1XCCA 3GMFA 4QL7A 5IPGA 1TJDA 3LYPA 4ML6A 2OE0A 4MPGA 2FWFA 4ZB6A 4JR6A 3F4SA 2PERA 3FR6A 4WEYA 1WMJA 2XBIA 2V1MA 4MJEA 3KTBA 4TN8A 1SKRB 1FHEA 1O73A 2L59A 1PKZA 3CBUA 2GLRA 2CX4A 1PQNA 3KXOA 2I1UA 3RHBA 1THXA 3IOSA 2CX3A 1ILOA 4IQ1A 4ZL7A 1TI1A 3RBTA 5LCZA 1SD8A 3KD0A 3IXRA 4TR3A 2L6CA 3QR6A 3BBYA 4GLTA 2ZUPA 4ECJA 1M99A 1ZCPA 3G7YA 3CYNA 5CRHA 2CVBA 2TIRA 3LWAA 2JADA 2H74A 2NTOA 4KGIA 2EC4A 4BVXA 4ILFA 2I4AA 1SJZA 4POBA 3GRXA 2OACA 3AY8A 3APOA 2XPEA 2CVKA 2EIQA 1EOGA 1TDIA 4G19A 4IQAA 2YANA 1Y6EA 1V9WA 3GKXA 3HCZA 4NXIA 1YZXA 2OADA 3IK9A 3CRTA 1U3IA 5AIVA 1EGOA 3MWHA 5DCHA 2I9HA 4I2TA 3QPMA 4LL4B 2GGTA 2C0GA 2FWEA 1X5DA 2H71A 1DE2A 1TOFA 1GSQA 1HYUA 3WD6A 3TRXA 3EU3A 2H1BA 2QC7A 3FR3A 2FLSA 5DDLA 4EDYA 3F6FA 3LORA 1MDKA 1HNBA 1XWKA 4I2UA 1X9MB 4YAVA 2JACA 1SK0A 1SD9A 3DVWA 1QFNA 5LD0A 4PUAA 2RLIA 3D0ZA 2X8CA 3HKRA 1V2AA 2IFQB 2YP6A 1Z7PA 2OE3A 1QQ2A 2LQOA 1ZYQB 5AN1A 3IE3A 1TU8A 4X0XA 5D73A 1VF4A 2HXKA 2WULA 4WXTA 2P5QA 1K0AA 3FW2A 4KB3A 2P0GA 2YZHA 3QDNA 3TKSE 4GSSA 1GNEA 2MMAA 11GSA 4LMVA 1F6MC 3HJPA 1BAYA 3E9JB 2F51A 22GSA 4I5QA 2IPAA 3QAGA 1CQHA 10GSA 3D5JA 1TP9A 2C80A 4OD7A 5CREA 2E7PA 3UMAA 3RHCA 3E0UA 3MDKA 4PQIA 5ECOB 6GSTA 4MPFA 2H6ZA 2CAQA 2B7JA 5D9WA 1A0RP 1AQWA 2DJJA 3WGEA 4TR4A 3F4TA 2C0FA 5ECNB 2GT5A 4L5LA 1C72A 2DIYA 2P31A 4WKWA 2HI7A 5DQYA 3IHQA 2DJ0A 3KM6A 2YWMA 3VI7A 4QQ7A 1UVZA 1U88A 1KBNA 2DMLA 1U87A 1XOAA 5H5QA 4WBJA 1T7PB 3TKSA 5HFIA 4N10A 5GAPD 2FUG2 4EE0A 2X99A 4TXOA 3GURA 2H70A 4ZB8A 1ERWA 2B7KA 2QGVA 1K0DA 4Z7XA 3ZL5A 3IPZA 1S3CA 4Q5QA 3BOAA 1G0TA 3GH9A 3H93A 1Z6MA 3N5OA 5ENUA 3J7Yb 3TJBA 1I9DA 2IFQA 5LNKe 1O7UA 1SYRA 1UA5A 3BCIA 4MF7A 3FKFA 1T00A 5ECRB 1O81A 2VCZA 5HR3A 5IMVA 4MZBA 4FH8A 3DIEA 2H1AA 2IJYA 3LEFA 5DAKA 4MJAA 5H5RA 2XBQA 4AGSA 4I6XA 5FT3A 4KH7A 1Z7RA 2HSYA 4E8EA 3H8QA 4NMUA 1USBA 2GZZA 3I9V2 4LLRA 20GSA 2REMA 3ZITA 2MBSA 2NPBA 1U6TA 5C04A 2PN8A 4KE3A 5G30A 3FZAA 5L71A 2K8SA 2HZEB 1PX6A 3GUSA 4XS1A 4DEJA 5IOWA 5KEJA 1B48A 1TK5B 1OC9B 3KMOA 2H8LA 3Q18A 1R5PA 2HFDA 1OC8A 4G9HA 3ZYWA 3A2WA 5D96A 2LV3A 3EYTA 3PGTA 2JU5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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