4QL9A

Crystal structure of c-terminus truncated alkylhydroperoxide reductase subunit c (ahpc1-182) from e. coli
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
MSLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEITEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYAVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVASHPGEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Key roles of the Escherichia coli AhpC C-terminus in assembly and catalysis of alkylhydroperoxide reductase, an enzyme essential for the alleviation of oxidative stress
pubmed doi rcsb
molecule keywords Alkylhydroperoxide Reductase subunit C
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 48
structure length 165
sequence length 165
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ql9A00
1OVNA 1QQ2A 3HHVA 4CW9A 1IYHA 3O76A 2LQQA 1ZCPA 1BQ7A 4TXVA 1MDJA 5G5FA 4JZQA 2CVKA 2HSYA 3FR6A 2FWFA 2GSRA 4YQVA 1GL8A 3CRUA 2V2GA 3M1GA 2VCWA 3TJJA 2GZYA 3CRTA 1GH2A 5AGYA 1R5PA 2PUKC 3D21A 2FLSA 1DUGA 2H0HA 7GSSA 4XHMA 1TP9A 12GSA 4FYCA 5KN2A 1TTZA 1VGLA 2H72A 1QMVA 3VPQA 4BWSA 1YKAA 1SYXA 3M3MA 2VCZA 1DSBA 3C1SA 4LA1A 3W8JA 4Q5FA 3TRQA 2FHEA 3P7XA 1AQXA 5CO3A 2OA7A 3O6TA 4KDUA 2RUEA 1MTCA 1A2MA 3CSJA 1HD2A 3VWUA 3HVSA 5A4UA 1R7HA 5J4UA 4EXJA 3F8UA 2IMIA 4K0GA 3GMFA 4L0WA 3HJMA 3J7Yk 3NIVA 3ZZXA 1FVKA 4ZL8A 3SWLA 4V2NA 1IYIA 1MD3A 4KCAA 4WR4A 3FZ9A 3G9BA 2MMNA 3FW2A 4QL9A 1PRXA 3ZFBA 3EINA 5GSSA 3EMPA 1WWJA 2PERA 1GSSA 4X0XA 4F03A 3GURA 1PN9A 4TOPA 2AAWA 4IW9A 2H30A 2I3YA 4ZL9A 1M99A 4OCFA 1I5GA 3C73A 3ZREA 2FD3A 4TR4A 4Q5RA 3F63A 4IQAA 2C0FA 4POMA 4AJ8A 4TR0A 2M46A 5HR0A 4F0BA 1SYRA 1VF1A 1OE8A 2GQLA 2OE0A 2VL9A 3HCZA 2VD1A 3U6VA 1XBSA 4MCUA 2XPDA 5H5QA 2XC2A 3EWLA 3C71A 4TRXA 1N2AA 2G0FA 1F9MA 3CSHA 3L9SA 5J5NA 3GX8A 1R5AA 1VF2A 3L78A 1B8XA 2JL4A 1G0TA 2KOKA 1XVWA 1OYJA 1SL0B 3HYPA 1ERUA 2IFQA 1T4YA 1O6JA 2TRXA 2I4AA 2HLSA 3ERGA 1RW1A 1RQMA 4RI7A 1GSDA 1HNBA 4MF7A 1TDIA 1FB0A 4DVCA 4D73A 3KH7A 1JLWA 2HZEA 2VM1A 2H1GA 1X5EA 4GWRA 3Q18A 3GN3A 3VPTA 3WD6A 3ZTLA 1NHYA 2FGXA 1XWBA 2LV3A 2C0EA 1URMA 1UN2A 2LQOA 5JWQB 2CV4A 5A4WA 3KEBA 1NM3A 5JCWA 1J0FA 1O73A 2F8FA 5JWOB 1J08A 3TKRA 4I97A 1W4VA 2VLVA 1JZRA 4FYUA 4FYBA 5DAKA 3WGEA 4TKYA 2KLXA 5A4VA 3UOMA 5HFIA 3RPPA 2VLTA 4HZ4A 5D9TA 4IP6A 4MJBA 4LLRA 3UBKA 1T7PB 4MA9A 4IVFA 5G31A 6GSSA 5ABRA 5DDLA 1ST9A 5DALB 1JLVA 2J9HA 2CQ9A 1X9WB 3IOSA 1GLQA 1NSWA 4EUYA 2PGTA 1LU4A 2NBSA 2AYTA 3F6FA 2K18A 2C0GA 1U6TA 1O8WA 2WJUA 1SJIA 1E2YA 1YZXA 1XCCA 2EIQA 4TR3A 1WPIA 2GVPA 4ZBDA 1M2AA 3QOUA 3KCMA 1ILOA 3D22A 1XWKA 4LL4B 1A0FA 3HY2A 2GZZA 2C3QA 4JE1A 4PQIA 3S9FA 4G19A 4GQFA 1XW9A 1ON4A 2AV4A 3GKMA 3EC3A 4XCSA 1SU9A 1YEXA 2HXKA 2XHFA 2V6OA 1XPVA 3E9JB 1VF4A 1J9BA 5EY6A 1T3BA 1H4OA 4GF0A 1WE0A 4F2IA 2H1DA 2MYGA 3H4KA 3TKSA 2LRNA 1OKTA 3APQA 4JEDA 5ID2A 4JRRA 1FHEA 2DJ3A 3GRXA 5HR2A 3A3TA 1QGVA 3G7JA 1V58A 3SBCA 4EVMA 3ERWA 5G1LA 1UVZA 4NMUA 4TXOA 3D4MA 1YY7A 4KH7A 5C00A 4IGJA 4MH2A 1Z6NA 1SD8A 3HDCA 2L59A 3UARA 2L5LA 2OJLA 3A2XA 4WBJA 2R3XA 3IK7A 1YQ1A 5G1KA 9GSSA 2HZFA 1O85A 2CVDA 2FA4A 4FH8A 3VLNA 1EP8A 1MEKA 3M9KA 4CHSA 3TUEA 2H74A 5F0GA 1THOA 2GQKA 1EGRA 3C7MA 3FY7A 3FYGA 3HD5A 2H6ZA 2LRTA 1HQOA 2YJ7A 1ACVA 3US3A 2YP6A 3IA1A 3EU4A 1X5CA 1CQGA 4K7NA 5AIXA 4PNGA 2VCTA 1E6BA 2QKEA 5D9WA 1GUMA 1Z7PA 1SL2B 3TGZA 1KEBA 3DVXA 5JWRB 5CREA 3DGQA 5D93A 3QFBC 4Z7XA 2DJJA 2P5RA 5GZZB 1SENA 1R26A 5AISA 2JACA 3WT2A 2O7KA 2IL3A 3F4TA 1ZOFA 4HZ2A 1WP0A 4ZBAA 4ML1A 3RHCA 2DIYA 1PKWA 2N5AA 3ZYWA 1KTEA 3G7IA 4L5LA 4N10A 1TOFA 2PMTA 2X99A 3DWVA 3GL5A 1JZDA 4HU9A 3DVWA 1EV9A 2DJKA 3LGCA 3UIWA 2IIYA 3I6AA 5E59A 2OE3A 3GFKA 1THXA 4I6XA 2E7PA 4ZL7A 3F0IA 1OC3A 4J56E 1WMJA 3FZ5A 1C72A 4AF2A 1X0RA 3DEXA 4MF6A 4IELA 1HNAA 5DQYA 2QGVA 2H66A 2LTKA 5B8BA 5IM9A 2IMDA 4ULXA 4HUAA 3KD0A 3AY8A 1GSFA 1AIUA 1G7EA 1WRYA 5CRHA 1WOUA 1GSEA 2K6VA 4XTSA 2ES7A 5IOXA 1Y6EA 3RPNA 3VWWA 3VI7A 2PWJA 4JBBA 2K8SA 3UMAA 1VRSD 5EPFA 4BL7A 2KUCA 3TKSE 2CA8A 3E0UA 5ECKB 1U87A 5DBQA 3TKPA 2YPMA 8GSSA 1SK1A 1AC1A 4WXTA 3H1NA 3UBLA 2L4CA 4KNDA 4Q5NA 3D5JA 3GNJA 4MJAA 1A2JA 1SJ6A 4IN0A 1XVQA 2B5EA 1OC9A 3A5WA 4K1FA 1T00A 4MJEA 3IC4A 1EGOA 1XOAA 4I8BA 2VL2A 3MDKA 5D8IA 3DD3A 4MZCA 1FW1A 3ZL5A 2D2ZA 1SKRB 4FIWA 4IP1A 3TRXA 1TI1A 5E4WA 1F37A 2QC7A 2YOIA 2RM6A 3DYRA 1PL1A 5IO2A 3ZMLA 1Z9HA 5LNKe 2JZRA 4EE0A 3GX0A 3EE2A 3LJRA 4XS1A 5ECOB 1Y25A 2B7JA 1Z6MA 2K8VA 1BAYA 2HT9A 3O3TA 3F3RA 1AQVA 3D4TA 3EYTA 3ME8A 2WZ9A 3LG6A 5F07A 3GTUB 3FZ4A 3BD2A 1R4WA 2GQMA 1HYUA 3TOTA 3IHQA 2I1UA 2VM2A 3GKKA 4F82A 3I69A 1YEPA 4IHUA 3KP8A 1Q98A 5FHIA 2CAQA 2ZCTA 4EDZA 4JR6A 3FEUA 1B48A 6GSXA 5IQYA 4DSQA 2WRTA 3VI5A 1WJKA 3LSZA 3CBUA 1TI3A 4DSSB 5C04A 2CX3A 1KBNA 1A0RP 1G6YA 2ALBA 2WS2A 1GTAA 1S3AA 5IMCA 1TK0B 2HRFA 4X1UA 2A4VA 1K0MA 1USBA 1PA3A 4MLYA 2LS5A 2Z9SA 2VCVA 3LQ7A 4TR1B 5ECQB 3DKSA 3KMNA 2CX4A 1EOHA 3PGTA 1ERTA 2F51A 1TW9A 4XS4B 2WGRA 1A2LA 3GKXA 1OAZA 3I9V2 3MWHA 3KGKA 4LL1B 3E3EA 1K0DA 5D9VA 3TJFA 4ZIJA 1M9AA 1FOVA 13GSA 5G30A 4OO4A 4WETA 4OMVA 1A23A 4WF5A 2NVLA 3WGXA 6GSYA 4LMVA 1I9DA 1GSUA 2VUPA 1F6MC 1X5DA 4OWYA 2DLXA 3WGDA 2YZUA 1K0NA 2R37A 3H79A 2YANA 1GTUA 3L0HA 1BG5A 1O7UA 2OE1A 4K8MA 1XIYA 2CZ3A 4RQXA 4WF4A 1PSQA 4PXOA 1ERWA 3KTLA 2MMAA 4POLA 4ZXGA 3GA4A 3BOAA 3IRAA 2C80A 4MJCA 4EF0A 3GSTA 4IJIA 4BA7A 4MABA 5GAND 4GQCA 3FRCA 3PINA 5IMVA 3TKSC 3VURA 3P2AA 2H6YA 2OACA 4N30A 2IMFA 5H5RA 5ELGA 4KCEA 2E2MA 1PD21 2OADA 4RI6A 4KSOA 4KX4A 1PL2A 4ZBBA 5IO0A 2GLRA 1VF3A 1EEMA 3I43A 2XBIA 2L6CA 2B1LA 3LORA 2EIOA 1GRXA 1ABAA 3F3QA 2YWOA 5JCUA 2RM5A 1B4PA 3QPMA 2I9HA 3ZFLA 2R2JA 3HVVA 3KTBA 2GZPA 3OR5A 2V41A 4ECIA 2L5OA 3MAKA 4O92A 2HRNA 5ECLB 2V1MA 3P90A 1XW5A 1GULA 2FY6A 2BTOT 2R4VA 4IKHA 3LXTA 4K0NA 4MDCA 4AJ7A 4MZWA 3CYNA 3W6GA 4HEA2 4ISDA 5CNWA 3P8WA 2RUFA 1U3IA 3WT1A 1GLPA 4V2MA 5DVBA 2FWGA 2H73A 6GSTA 3ZVJD 3JCML 3ZITA 1W89A 4IJ3A 3IV4A 1B9XC 3BJ5A 2LJAA 1DE1A 1G7OA 1XFLA 1ZYEA 3CXGA 3IR4A 4MZBA 1BYEA 3BCKA 3RHBA 4F0CA 5ECSA 5B6MA 2TIRA 3CSIA 4NPBA 4POKA 3LEFA 5JCGA 2MBSA 3D0ZA 4GXZA 14GSA 2JZTA 4QQ7A 1ZZYA 3KXOA 4L5OA 5F05A 5KN3A 2YV9A 3HVXA 5LD0A 1BEDA 5H5SA 5IOWA 4J57E 4E8EA 2H1BA 3K8NA 3QAVA 2F8AA 2IWTA 2O85A 2PN8A 5IPGA 4HS1A 4KDXA 5ECIB 5GAPD 3QCPA 1TRSA 2N5FA 3HJPA 1V57A 3IAS2 1AXDA 3IK9A 1XOBA 2JU5A 3KIJA 3U5RE 4DEJA 2PBJA 4O32A 2LNTA 2XBQA 2BJXA 3RDWA 2GS3A 2X8GA 2VOCA 1OKDA 2O8VB 2H6XA 4MP4A 2H71A 1AUCA 1O8XA 3C1RA 3QAGA 4NAXA 2C3NA 5IMDA 1PQNA 4G10A 4DSSA 2ZNMA 2GSQA 5J9BA 1TJDA 4K9ZA 2H8LA 4BVYA 1F2EA 1YDKA 3QFAC 4OO5A 3LXZA 3IE3A 5EVOA 2GSTA 5DQSA 4WKWA 4BPYA 2AHEA 4P3YB 1JHBA 4ECBA 2LKUA 4PUFC 5KEJA 1S3DA 2B1KA 1LJRA 3H8QA 2IFQB 1ZMAA 1EOGA 2REMA 3KMOA 3D6IA 1ERVA 1A8YA 2M72A 2GTUA 1M7TA 3HZ8A 4CDOA 1S3CA 2NDOA 3GL3A 10GSA 4NXIA 2HYXA 2ZUPA 2GDRA 2VL2C 2YV7A 1H75A 3GH6A 3APSA 4GTUA 2HZEB 1DE2A 2CVBA 3QD9A 4ECCA 2PVOC 1SK2A 3BBYA 2V6KA 5KN0A 2YCDA 3KZQA 3VK9A 3QMXA 4TN8A 2L57A 1JFUA 4WBRD 2H70A 5LCZA 1KNGA 1FAAA 2AUVA 5CRGA 5HR3A 1YJ6A 1U3AA 3C8EA 2C1YA 2JADA 1SJZA 4V1Ap 5COHA 1Q4JA 2X8CA 2H76A 4KE3A 2P0GA 4YQUA 2A2SA 1EWXA 2HFDA 2O87A 2P31A 3ZVJA 1SK0A 5CAXA 4I5QA 4KAEA 2WFCA 2GT6A 3CTGA 11GSA 5G5EA 4NHZA 20GSA 2R6KA 1ML6A 3N5OA 4YQMA 5B8AA 1AAZA 3ED3A 2GT5A 1PX7A 2XPEA 1YF0A 4NV2A 4XRDA 2X8HA 2NPBA 4O5RA 2CT6A 2IPAA 4N0VA 1PX6A 1T8EB 3LYKA 1ZGNA 5DALA 1T4ZA 1EZKA 1B4QA 2IMKA 2DC5A 4HI7A 1X9SB 2VL3A 1FB6A 5DCGA 3F4SA 5GSTA 1XXUA 3APOA 3Q74A 1RK4A 5F8BA 3L4NA 4IBPA 3TJGA 2L6DA 3BCIA 2P5QA 2M80A 3G7YA 2B7KA 1GNEA 3ZRDA 2MMZA 1MD4A 4BVXA 4H86A 5INYA 3KJYA 2BMXA 5DCHA 5J9CA 5HFGA 4HJ2A 2K9FA 2KP2A 2KP1A 1ZL9A 5ID2B 1TRVA 2MBTA 3DRNA 18GSA 4KA0A 4TXOB 16GSA 4MPFA 3R2QA 2F3MA 2I81A 5AN1A 3F4RA 1XWCA 3GYKA 4KSMA 5CP1A 4RUVA 2C0DA 1K0OA 2YZHA 3GV1A 3IAM2 1TRWA 1BX9A 4FO5A 4ZB8A 1MDKA 5ECPB 2B6MA 2DIZA 2VCQA 1UA5A 2N5BA 2B5XA 4OFNA 4X43A 3QR6A 4ECJA 3CMIA 4GLTA 1AW9A 1QUWA 2MMOA 3UVHA 2EIRA 22GSA 1NHOA 2MZCA 5B6NA 3PH9A 5AIVA 4PQ1A 2PPTA 4ACSA 3HJOA 3FKFA 5EL8A 3WYWA 3ME7A 5ELAA 3QAWA 2VAFA 3MSZA 4IQ1A 1F3AA 3ERFA 4K6XA 2VLUA 5J41A 1K3LA 4YAPA 3ZLPA 4PX1A 1GTIA 4YH2A 1AQWA 1V98A 4DSRA 1G6WA 4POBA 2AB6A 3L9UA 2PVQA 5CRDA 1EEJA 5IIZA 2H01A 2B3SA 1HNCA 5HQPA 4XS6A 1BJXA 5IPHA 1GWCA 2LJKA 2WCIA 4KW6A 1GP1A 1FO5A 2LRCA 17GSA 2E0QA 1JZOA 3TOUA 4YAVA 3UJ1A 3H93A 1TRUA 4MMMA 1XWGA 5L71A 2RLIA 1B9YC 3TB2A 2J23A 2DJ1A 5J3RA 4PUAA 1TU8A 2TRCP 4O7HA 2DSAA 3ISOA 4G2EA 2L4QA 2FNOA 3HXSA 5A5KA 2F9SA 2IN3A 3GH9A 3EMXA 3DMLA 4OCEA 2IJYA 1MDIA 4KUNA 3DXBA 1K3OA 2LUSA 4HU7A 2H19A 3LYPA 4EC0A 2G2QA 1ZYQB 2WULA 6GSUA 4GSTA 1GUHA 3UL3A 3KH9A 4EDYA 1N8JA 3N9JA 3NZNA 2CAIA 3ZIJA 3TKQA 2KHPA 5F06A 3IPZA 1Z5YE 5DJLA 4ID0A 4KB3A 3FK8A 4ZB6A 6GSVA 1Z3EA 5CYYA 1GNWA 3FR9A 4I2UA 3HA9A 2GSSA 1V2AA 4PGTA 2R5GA 5ECNB 2PU9C 3TDGA 4EKZA 4K7IA 3RBTA 1TU7A 4ML6A 4JU5A 1SKSB 1GSYA 3IDVA 4GSNA 1OC8A 5FT3A 5CRWA 4JR4A 2B5YA 3VFIA 2JZSA 3QDNA 2HSHA 4GSSA 1NW2A 4TVEA 4PNFA 3FHKA 2LNSA 1OE7A 1FVJA 2LJRA 3FR3A 3J7Yb 2V32A 2H0GA 5IMAA 3VWXA 3GIXA 1TXXA 2C4JA 2H75A 4NWYA 1OC9B 3A2VA 4PURA 4Q5QA 2OKAA 2VD0A 3Q19A 1YF1A 5IMZA 2RIIA 2FCHA 3TCOA 5HR1A 2CZ2A 2IMEA 4NV5A 1TK5B 1A24A 2DMLA 1M2DA 1K0CA 2VO4A 4V2LA 4MK3A 5D96A 2DBCA 1M2BA 1QXHA 1F3BA 1A8LA 4EL1A 4GRFA 3TRPA 1M0UA 1SD9A 3HKRA 4MH3A 4NHWA 2VIMA 3F9UA 2A2RA 1QFNA 4XIHA 2FWEA 3IBHA 3EURA 4OFTA 4EO3A 1T1VA 1PKZA 4MF5A 3ZIVA 1O81A 6GSWA 5ENUA 1V40A 1GUKA 3V1WA 3A2WA 3M8NA 2WDUA 4KDYA 4OD7A 4F9ZA 1Z7RA 3EU3A 5ECHB 1TKDB 3RAZA 1CQHA 3F6DA 3Q6OA 2O89A 2YWMA 1PGTA 1XW6A 3DIEA 3PR8A 4J2FA 2JSYA 1LBKA 1EV4A 3VWVA 1JZWA 4N11A 5B7CA 3ZMKA 2DMMA 1YKCA 2LEGA 3GTUA 3L9VA 3FZAA 2EC4A 2VCXA 3LFLA 3CTFA 4QL7A 1K3YA 3M9JA 3KM6A 5ECRB 2HI7A 4I2TA 19GSA 1K0BA 4N0ZA 3MNGA 3GSSA 3TJKA 4RQRA 4TW5A 5HFKA 2JSZA 4KGIA 2ON5A 3HZ4A 4AJ6A 4OFMA 2GGTA 2ON7A 1GSQA 1M9BA 1TK8B 3LWAA 2LSTA 3UVTA 5ECMB 5FWGA 1WIKA 4HQZA 5D9XA 4ZILA 4TR1A 4MPGA 3UEMA 2YWNA 1DBYA 3EVIA 4XS4A 3GHAA 1GTBA 2OBIA 3GKNA 4L8EA 5IMFA 3KP9A 2E2GA 1EP7A 3TJBA 5D73A 4WR5A 1K0AA 5KN1A 4D73B 2OBKA 3W8SA 4HJMA 4WEYA 2YN1A 1QK8A 3M0FA 1U88A 2FA8A 2NTOA 3NOFA 2DJ0A 4BWQA 2YWIA 4XRAA 2C8UA 2HE3A 1XZOA 2FUG2 2WB9A 4G9HA 1X9MB 1V9WA 4ILFA 4LMWA 4AGSA 4PQHA 2X64A 4L0UA 2H1AA 4GCIA 2HNLA 4ZB9A 2QSIA 1FG4A 4E8HA 4K7OA 2YJHA 1SL1B 3GUSA 2YNXA 4HDEA 3UAPA 2C3TA 2H0IA 1PMTA 5G2ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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