2DJJA

Solution structure of the a' domain of thermophilic fungal protein disulfide isomerase
Total Genus 20
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
20
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
GPLGSEGPVTVVVAKNYNEIVLDDTKDVLIEFYAPWCGHCKALAPKYEELGALYAKSEFKDRVVIAKVDATANDVPDEIQGFPTIKLYPAGAKGQPVTYSGSRTVEDLIKFIAENGKYKAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Protein disulfide-isomerase
publication title Solution structure of the a' domain of thermophilic fungal protein disulfide isomerase
rcsb
source organism Humicola insolens
molecule tags Isomerase
total genus 20
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2006-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2djjA00
3HCZA 3CYNA 1YY7A 3F0IA 3TJBA 1HD2A 4POLA 5DBQA 3UOMA 3LEFA 3C71A 3PR8A 1U88A 1Z5YE 2LEGA 4KNDA 3J7Yk 5JWQB 4KW6A 1DBYA 4ZIJA 3KMNA 3VFIA 3KH9A 3GFKA 5FT3A 4AJ8A 3BCKA 3GHAA 3DYRA 5ABRA 5J3RA 5H5RA 1XXUA 1K3LA 1DSBA 4N11A 5JWOB 2LV3A 6GSYA 1J08A 2B5YA 5AISA 5JCWA 1M7TA 4K0GA 1UN2A 4FO5A 2X99A 2WGRA 1THOA 3ZYWA 1YJ6A 2N5FA 3HHVA 4WBRD 1BJXA 1T3BA 4NV2A 1PA3A 2HT9A 2HXKA 1EP8A 1YDKA 2YV7A 4FYUA 1OE8A 6GSVA 4IQ1A 3TKPA 5IMVA 1C72A 3HY2A 1AQXA 2I81A 3UAPA 1ABAA 5CYYA 3O3TA 2H19A 5IQYA 4ISDA 5AGYA 2DMLA 3U5RE 1BQ7A 1TP9A 1XWBA 1KNGA 4ZILA 4L0UA 2I1UA 1XOBA 1LJRA 2KUCA 2YWIA 2H0GA 2NBSA 2GT6A 5CRHA 4Q5FA 4PQHA 1RW1A 1OYJA 4NXIA 2X64A 2VOCA 1X9SB 4MK3A 1SENA 3VK9A 4IVFA 2JL4A 1PKWA 14GSA 5CRWA 3LQ7A 5GAND 3ZLPA 2VL3A 1XBSA 3G9BA 4QQ7A 1WMJA 1TK0B 1YF1A 5DJMA 3Q19A 1A2MA 4MCUA 3DD3A 4K0NA 2H30A 3BBYA 5CRDA 3KGKA 2F8AA 5C00A 4AGSA 5DJLA 2FNOA 4OCFA 4KE3A 4OO4A 3UMAA 1O81A 2VL9A 1A24A 4DVCA 2E2MA 3BCIA 3UBLA 3OR5A 3IA1A 4HOJA 1O8WA 3NOFA 1W4VA 5A4WA 1DE2A 4Q5QA 4PNFA 5GAPD 1HNCA 4XS6A 1M0UA 3A2WA 2IMKA 1PN9A 1SYRA 4MJCA 3GA4A 1S3DA 4DSQA 4F0BA 4WEYA 2H6ZA 1ZOFA 5INYA 5G1KA 2DIZA 4MA9A 4L5LA 4IHUA 2HZEB 1EP7A 2H75A 2H1AA 3IE3A 1GRXA 1URMA 1PRXA 4YAVA 1O7UA 5HR1A 2YCDA 3KH7A 2AYTA 1FHEA 1UC7A 1XVQA 2FY6A 5ECRB 3ISOA 4RUVA 5HR2A 3QAGA 3CSJA 1R26A 3F9UA 4TR1B 4TR1A 3WYWA 4DSSA 3H93A 3I43A 2KHPA 4XIHA 4OCEA 3QD9A 2GDRA 3DXBA 1SYXA 2C1YA 1Q4JA 4IN0A 3GH6A 1K3OA 1N2AA 1N8JA 2IMFA 2VLVA 3HJOA 2HI7A 1LU4A 2K8VA 1EEMA 2GLRA 3FKFA 2M72A 2FGXA 5DQYA 4EDZA 1TOFA 1Z6NA 1NHYA 2GSRA 5D9VA 4AJ7A 1XIYA 3CMIA 2ZUPA 4TXOB 1XWGA 3TGZA 1TW9A 3ZRDA 2VCQA 3ME8A 3HVSA 1K0MA 1SL1B 4IP6A 3LORA 5D93A 1OAZA 1TU7A 1K0AA 4XS4B 2R6KA 3M9KA 4XCSA 4TOPA 3IC4A 2R37A 2VCWA 5JWRB 3LXTA 3F3RA 5LD0A 2L5LA 5LCZA 1BX9A 2NPBA 4OFMA 1Q98A 5IOXA 2AV4A 1GTBA 1Z6MA 1G0TA 4EXJA 1EZKA 5IO2A 2A2SA 1YKAA 4L5OA 5HFIA 3MWHA 3U6VA 3FZAA 2HE3A 5DAKB 3HJMA 1K0DA 4EL1A 2C0DA 4HZ4A 1TDIA 4KCAA 4K1FA 4K7NA 2GZZA 3UEMA 5CO3A 2YZHA 2Z9SA 3ERFA 1JFUA 3D6IA 3C8EA 3KM6A 2J9HA 1OVNA 2REMA 3FHKA 3LFLA 5CP1A 1AUCA 2YV9A 1TU8A 1A2JA 3QCPA 1CQGA 1PMTA 4ZB8A 5G5EA 3TJFA 4D73A 5ECLB 3WGDA 1FO5A 3MDKA 3D5JA 2CVBA 1NM3A 4YAPA 3HDCA 3A2XA 5D9TA 1AQVA 2V6OA 1T00A 4IJ3A 2IIYA 5H5QA 3ZL5A 2CX3A 1SD9A 3UIWA 3L9SA 2DJ3A 2JZTA 3KJYA 1K0OA 3GIXA 5GSSA 2BTOT 5L71A 1S3AA 4O7HA 5ECIB 5J9CA 1JZRA 1WRYA 2JACA 3WT2A 4X43A 1T8EB 4GSNA 2VLUA 5A5KA 3DVWA 3CSHA 3Q6OA 3Q74A 1F3BA 1GSEA 4EF0A 4ECCA 2MMNA 5AN1A 3GKKA 2TIRA 3WGEA 4YH2A 2WS2A 2FWFA 1Z9HA 3W8SA 3IHQA 4HU7A 1TRSA 6GSSA 2WZ9A 3LGCA 5KN2A 1EGOA 2VM1A 3G7IA 3VLNA 3TKSA 3IBHA 2IMIA 3TDGA 5CAXA 5IIZA 4AF2A 3IR4A 1ZMAA 4HJMA 2LUSA 2VAFA 5F8BA 1BAYA 4GCIA 3QOUA 1XWKA 1QGVA 3E9JB 1XPVA 2LKUA 2R4VA 4WF4A 4ZBDA 2K18A 1EV9A 2PBJA 4MF7A 5KN3A 4HDEA 3AY8A 1TTZA 2IPAA 1FG4A 2XPEA 3DKSA 4GWRA 3FZ9A 4KDUA 2ON7A 1RQMA 3QFAC 5IPGA 4RI7A 1BEDA 3LXZA 4NV5A 1J0FA 4ID0A 3EINA 4IGJA 5HR3A 4YQUA 1SL0B 5ECMB 3VPQA 1MDJA 3E0UA 3F6FA 4HEA2 1T4ZA 1JZOA 4JR4A 1Z7RA 1GSUA 2VD1A 5ENUA 3PGTA 2B5EA 1FOVA 3TJGA 3ED3A 4V1Ap 2LNSA 2IFQA 2RM5A 3TJJA 1B4PA 2B1KA 4MZWA 1EOGA 4P3YB 5KN1A 1KEBA 1YF0A 3F3QA 2M46A 5HQPA 1M2DA 2NDOA 4KDYA 5ID2A 3MSZA 4XTSA 4J57E 3IRAA 1S3CA 1XOAA 3IK9A 2BJXA 2FHEA 4JR6A 3H8QA 4NWYA 2WB9A 5DQSA 3FRCA 2QGVA 4NMUA 1YEPA 7GSSA 4WBJA 1V57A 3LSZA 2YJHA 1ERTA 3WGXA 2VL2A 1Z7PA 4KCEA 3P7XA 1OC8A 1THXA 2KP1A 2PN8A 4Z7XA 4JZQA 2FWEA 3GKMA 1SK0A 2VCTA 3CXGA 2FA8A 2C0GA 5DCGA 1B8XA 3FR3A 18GSA 3FZ4A 1XWCA 1J9BA 3HD5A 5ELAA 3EC3A 1TRUA 2V6KA 3ZMKA 3FW2A 1GUMA 4L0WA 1HNAA 1WWJA 4LL1B 1QQ2A 9GSSA 2O87A 2H76A 4BL7A 2AHEA 4EKZA 2YNXA 4KAEA 3FEUA 2H66A 4GF0A 5ECNB 5CREA 1M9AA 4JE1A 3FK8A 4FYBA 5EPFA 4IS0A 4I2UA 4IW9A 2O7KA 5KEJA 1U6TA 3P90A 3TJKA 2HRNA 1GNWA 2QC7A 2O85A 4MF6A 3LJRA 1NHOA 4J56E 2QSIA 5F05A 1ON4A 2K8SA 1SL2B 1TRWA 2WCIA 3TUEA 5FWGA 4ZBBA 4KSOA 2E2GA 4RI6A 1YQ1A 3HZ8A 4ZL9A 5ECOB 1JZDA 4XRDA 1XWAA 4Q5RA 3ZTLA 4NAXA 2LJRA 3QPMA 3QR6A 3HYPA 3SWLA 1JLVA 1EEJA 3EMPA 4QL7A 3N9JA 4YQVA 2VUPA 3ERWA 3L9VA 4F03A 3BOAA 4G10A 2PERA 4KA0A 2FD3A 1PX7A 3EWLA 2IMEA 1WP0A 1ZZYA 2C80A 3L4NA 1F37A 1G6WA 2VCVA 3NZNA 5AIXA 4I6XA 5B8AA 1T7PB 2LSTA 4O5RA 1X5CA 2V41A 4TW5A 3GUSA 1GSSA 2O89A 3IXRA 2FCHA 5IMFA 2FWGA 3LYPA 1NW2A 1SK2A 2K9FA 5ECHB 5C04A 2RLIA 2X8HA 3ZVJD 1G7OA 4ECBA 4DSRA 3KD0A 3EMXA 1K0BA 2NVLA 1FB0A 2XC2A 2YN1A 1MTCA 3A5WA 1KBNA 1OKDA 4NHWA 3KTLA 4WXTA 1PL1A 1TKDB 3I6AA 2XBQA 3FR6A 4KGIA 2EIQA 1K0CA 3ME7A 1T1VA 1FB6A 4DSSB 2WRTA 3GN3A 4GRFA 4PUAA 3TOUA 2OE0A 5EY6A 2F51A 2A2RA 4Q5NA 1T4YA 3PH9A 1XW9A 2DJKA 4AJ6A 4OFTA 4X1UA 2DMMA 4LA1A 2GQKA 1XW6A 2H0IA 4ILFA 4OD7A 2YWNA 2V1MA 2YWOA 3V1WA 1FW1A 1KTEA 4GTUA 2VCXA 4JBBA 3E3EA 5A4VA 2WFCA 5HFGA 2L6CA 4TN8A 3GX0A 4DEJA 2LQQA 4FYCA 1A0FA 3DIEA 5F07A 1G6YA 5ELGA 1V40A 6GSTA 2PVOC 1U3IA 4JU5A 2AJQB 3KCMA 4MZBA 3SBCA 2WJUA 4IELA 1IYHA 1WOUA 3ERGA 1SJZA 3GH9A 2R2JA 3VWVA 2FLSA 2WULA 1GL8A 1FVKA 1R5PA 2CAQA 3M8NA 1A0RP 4K7IA 6GSUA 1XVWA 1ZYQB 2AB6A 2H71A 2OBIA 1V58A 2E0QA 2P5QA 2VIMA 2G2QA 3D21A 1PQNA 2C3TA 2KOKA 3FZ5A 4MH3A 3ZREA 4LL4B 4I97A 1GWCA 1ZGNA 2H6XA 1EWXA 3EU3A 4J2FA 1UVZA 2CZ3A 2EIRA 3J7Yb 1GP1A 2H1DA 3TOTA 1O85A 3ZITA 1YEXA 2O8VB 5G5FA 5J41A 2PU9C 2GTUA 1GSFA 3GTUA 2YWMA 2GVPA 4D73B 1G7EA 4BA7A 3L0HA 2RM6A 1FVJA 5KN0A 1A8YA 19GSA 2LRTA 3G7YA 3L9UA 3M0FA 4G9HA 1TK8B 2H0HA 5IO0A 11GSA 3LYKA 2RIIA 3CTFA 3TRPA 3HA9A 3FY7A 4ZB6A 2JSYA 12GSA 2MMAA 1PD21 2QKEA 2NTOA 3O6TA 1PL2A 1FAAA 2JU5A 2GSQA 1IYIA 5ECSA 2XPDA 5GZZB 3FYGA 3W8JA 4ZXGA 3VPTA 5J5NA 2H1GA 4BWQA 4LMWA 4EO3A 2L59A 2VLTA 3HVXA 4OFNA 1B48A 3I69A 3F63A 4GXZA 4O92A 3IOSA 3GL3A 5EVOA 5B6NA 1O73A 5IMZA 1X9WB 3M3MA 2WDUA 2XBIA 3QDNA 4TVEA 3F4RA 1Y6EA 3FR9A 2B6MA 5G2ZA 1GLQA 4F82A 2CX4A 4X0XA 2H72A 4WETA 1PX6A 5IMCA 1H75A 2DIYA 3IDVA 5COHA 4ZBAA 5H5SA 2LJAA 4YQMA 5IOWA 2C3NA 5IMAA 1XZOA 5B8BA 1GSQA 3M9JA 4PQ1A 3GX8A 3W6GA 4TXVA 3GYKA 4I5QA 3F4SA 1RK4A 5DALA 1QK8A 2L6DA 3F4TA 1V2AA 4KUNA 1GUKA 4MPFA 4N10A 3D22A 3UVHA 2LRNA 3EVIA 1W89A 2MBTA 4V2LA 4ML6A 2HNLA 4OWYA 2DJJA 3HJPA 4PGTA 1TI3A 2MZCA 2OE1A 3EE2A 5LNKe 2IL3A 3I9V2 1GSDA 2OADA 3GRXA 4HU9A 2EIOA 1AIUA 2CAIA 4EE0A 3GMFA 2R3XA 2MYGA 2OJLA 2AAWA 1ILOA 2PVQA 2AUVA 2E7PA 4PUFC 1AW9A 1GLPA 3F6DA 4IKHA 4PURA 1I9DA 3CRUA 3ZVJA 2IFQB 3H4KA 5AIVA 4WR5A 4I8BA 4TR3A 1YKCA 3A2VA 3QFBC 3JCML 2JZSA 1M2BA 1R5AA 1SKWB 2GZPA 1AQWA 3IAS2 22GSA 3GSTA 16GSA 5CRGA 2CVDA 4MLYA 4MJBA 4QL9A 1GTUA 3ZFBA 1DE1A 4V2NA 4XS1A 5ID2B 1F3AA 5G31A 2RUEA 4K6XA 20GSA 2GT5A 2H6YA 4IJIA 1O8XA 1R7HA 5ECQB 1V9WA 1WPIA 3HKRA 1O6JA 4RQRA 3C73A 4HS1A 4K9ZA 4MABA 3UJ1A 3K8NA 5ECPB 2B7KA 1WE0A 5IPHA 1GTIA 3DWVA 4LLRA 3CTGA 17GSA 1GTAA 5J9BA 1B4QA 4K2DA 4ZL7A 2K6VA 3L78A 1F6MC 2F8FA 4WF5A 3TCOA 4NHZA 3CBUA 5EL8A 2ZCTA 2YP6A 4WR4A 2OE3A 4POMA 3TKRA 1MDIA 3EURA 2H8LA 2C4JA 3GL5A 4IP1A 2HFDA 1XFLA 1X0RA 4KDXA 2H01A 2BMXA 5F06A 4N0VA 2PGTA 1MD4A 1JLWA 5A4UA 5IM9A 1WJKA 3EU4A 2F3MA 2LJKA 4PQIA 1X9MB 1ZCPA 2P0GA 3RPNA 3VWXA 3UVTA 3KP8A 1H4OA 3UBKA 5D9WA 1SD8A 4JRRA 4HUAA 3P8WA 2DLXA 2VCZA 1E2YA 2CVKA 2FUG2 2J23A 4RQXA 1MDKA 5JCGA 3RHBA 3QAVA 1JHBA 4HI7A 3TKQA 1ERVA 6GSXA 4PX1A 2PMTA 1TI1A 3RHCA 4POKA 3LWAA 4E8EA 1JZWA 1EV4A 3KXOA 4BWSA 2YJ7A 3IV4A 3KMOA 5D73A 4F2IA 3N5OA 5DCHA 2RUFA 2MMZA 2VO4A 5J4UA 4V1Ag 2OACA 5DDLA 2H74A 2HRFA 3O76A 1ERWA 2I4AA 2L5OA 3TRQA 1PGTA 2HSHA 2DJ1A 4G19A 1ZYEA 2B5XA 2GQMA 4LMVA 3WD6A 2GSSA 4GQFA 1GSYA 2VD0A 5F0GA 4XRAA 3RBTA 3GURA 2ALBA 4KH7A 3P2AA 1CQHA 4O32A 1PSQA 3EYTA 4IQAA 1OKTA 2PUKC 3F8UA 4TR4A 4I2TA 3VI5A 3D4TA 3RAZA 1A2LA 2C8UA 4F0CA 1MD3A 4POBA 5D96A 2HZEA 2HYXA 5IMDA 4WKWA 2OBKA 3DMLA 4G2EA 1M99A 2ON5A 4CDOA 1HNBA 1VRSD 4HJ2A 1SKSB 2CZ2A 2D2ZA 2IJYA 2LTKA 2EC4A 1K3YA 3GSSA 1VF1A 1GULA 3APQA 2KP2A 2HLSA 2GGTA 4PNGA 3HVVA 3D0ZA 2A4VA 4GSTA 4L8EA 2B7JA 1TRVA 4TRXA 2X8CA 3KIJA 3QMXA 2LNTA 4MP4A 2CT6A 2GZYA 2TRCP 4OO5A 1Y25A 1QMVA 1ST9A 1ERUA 1V98A 5G1LA 1F9MA 2VM2A 5DVBA 2ES7A 2B1LA 2GS3A 2G0FA 1UA5A 2CV4A 2P5RA 5E4WA 1TXXA 1TK5B 3VWWA 2C3QA 2I9HA 4TXOA 2IN3A 5JCUA 2HZFA 1QUWA 3TKSC 4HZ2A 1SU9A 3VURA 1EOHA 2YOIA 1SJIA 2DC5A 4GQCA 3G7JA 2GQLA 3S9FA 1SK1A 1YZXA 4XS4A 1X5EA 1XW5A 5E59A 2OA7A 1VF3A 1F2EA 2YANA 3KZQA 3C1RA 4HQSA 2YPMA 1VGLA 2FA4A 5HR0A 2FWHA 3IPZA 1OE7A 3ZFLA 1U3AA 1DUGA 4ULXA 3VI7A 1EGRA 2IWTA 8GSSA 3TRXA 2L4QA 2JZRA 3D4MA 3H1NA 1USBA 4FIWA 5DAKA 3BJ5A 1HQOA 1M9BA 4N30A 1QFNA 1M2AA 2H1BA 1E6BA 2C0FA 2H73A 4KB3A 3GTUB 3WT1A 4ECIA 3GKXA 3DRNA 1OC9B 1OC9A 2C0EA 2MBSA 4ML1A 2DSAA 3GKNA 5GSTA 1I5GA 2LS5A 4MPGA 5D9XA 4EDYA 2IMDA 1A23A 1X5DA 13GSA 3VWUA 1VF2A 1B9XC 5B7CA 4GLTA 3HZ4A 3C1SA 1AC1A 1NSWA 2N5AA 3PINA 2TRXA 4K8MA 2LRCA 3CRTA 5G30A 4MJAA 3IAM2 2F9SA 2XHFA 2I3YA 3BD2A 4EUYA 3IK7A 4MZCA 4PXOA 4MH2A 3DGQA 4F9ZA 10GSA 3UL3A 4TR0A 1SKRB 1XCCA 1AAZA 1AXDA 1B9YC 3H79A 4V2MA 2L4CA 2L57A 3KP9A 3MAKA 2N5BA 4EVMA 1LBKA 4BVXA 4ZB9A 5ECKB 2M80A 2DJ2A 3APSA 1GUHA 5B6MA 2VL2C 2B3SA 2MMOA 4EC0A 4MDCA 6GSWA 5HFKA 5FHIA 3DVXA 4CW9A 4JEDA 4TKYA 1MEKA 3RPPA 2DBCA 4IBPA 5D8IA 2PWJA 2V32A 2GSTA 3R2QA 3DEXA 2HSYA 3LG6A 1ML6A 4MMMA 3NIVA 3US3A 3KTBA 1HYUA 3ZIJA 4CHSA 3RDWA 2OKAA 3CSIA 5DALB 4E8HA 1GNEA 4GSSA 1OC3A 1U87A 4H86A 2H70A 3A3TA 3ZMLA 4MJEA 1ACVA 4HQZA 1QXHA 4NPBA 2ZNMA 2R5GA 4N0ZA 4BVYA 3TKSE 2CA8A 3GNJA 3MNGA 1SJ6A 3M1GA 1Z3EA 1ZL9A 2YZUA 1BG5A 1R4WA 4ACSA 1A8LA 2KLXA 3HXSA 2JSZA 5CNWA 2PPTA 3ZIVA 4ZL8A 2CQ9A 2DJ0A 2JADA 3APOA 3ZZXA 1TJDA 4ECJA 4XHMA 2LQOA 2P31A 3Q18A 1VF4A 4BPYA 1GH2A 1WIKA 3C7MA 3QAWA 2X8GA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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