1AAZA

The structure of oxidized bacteriophage t4 glutaredoxin (thioredoxin)
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
87
structure length
87
Chain Sequence
MFKVYGYDSNIHKCVYCDNAKRLLTVKKQPFEFINIMPEKGVFDDEKIAELLTKLGRDTQIGLTMPQVFAPDGSHIGGFDQLREYFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structure of oxidized bacteriophage T4 glutaredoxin (thioredoxin). Refinement of native and mutant proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN
total genus 19
structure length 87
sequence length 87
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1aazA00
3CSJA 3GL5A 3TOTA 1U3IA 3A5WA 4OFTA 3FZ4A 4ZL9A 3GUSA 5FHIA 2VL2A 1LJRA 4LL1B 4WXTA 5GAND 1R26A 2VCWA 3WT2A 13GSA 1U6TA 1W4VA 3JCML 4ECCA 1FOVA 3F4RA 3DXBA 2DSAA 4ILFA 2IFQB 3GA4A 3NOFA 6GSUA 5KN2A 1TXXA 5ECKB 1B8XA 4DSQA 1URMA 2GDRA 1VRSD 2MMAA 4XHMA 5CRGA 14GSA 1V57A 3IC4A 3IAS2 5ECLB 4L8EA 1XPVA 3IAM2 5HQPA 2C0FA 5ELGA 2GTUA 2WRTA 2NTOA 5B6NA 2GVPA 19GSA 4MF6A 2VD1A 4KUNA 4E8HA 2CVBA 3WT1A 1JLWA 4K7OA 5ECQB 1TW9A 1R5AA 5B8BA 2I1UA 4QL9A 4EVMA 4K2DA 5DVBA 5DBQA 1YEPA 4MLYA 1XVWA 4NV2A 2GSQA 5D9WA 1EV4A 3LORA 4OWYA 2GZZA 4EO3A 3P8WA 1SKRB 1MD4A 3N5OA 5D9VA 1WOUA 3QPMA 3WGXA 4YQUA 3IDVA 4PGTA 2B7KA 3LXTA 2G0FA 4RQRA 4KCAA 5CRDA 1V9WA 1FAAA 3ZMKA 4AGSA 2QC7A 1XVQA 3A3TA 3F9UA 4TRXA 1KBNA 1RQMA 2L59A 4ZBDA 5IPGA 2M72A 3N9JA 1UA5A 4PNFA 5IMFA 1B4QA 3TJBA 2F8FA 1R7HA 2WULA 4I2TA 1V58A 1OAZA 3TKRA 4OCFA 2DMLA 4G2EA 1GSUA 1WIKA 3CSIA 3FY7A 4I2UA 4K7NA 3IHQA 4WBJA 2H74A 2X99A 3VPTA 4PQ1A 4DEJA 1XWBA 1G6YA 1VGLA 3DWVA 2F9SA 3HXSA 4JR6A 3HDCA 4TR1B 1G6WA 3RDWA 4Q5NA 4XCSA 1HNBA 4ZBBA 3PR8A 2VAFA 1O81A 10GSA 5CYYA 1A8LA 2DLXA 2EC4A 1T00A 3TGZA 2C8UA 2TRCP 1IYIA 1JZWA 3M3MA 5LD0A 3HZ4A 4FYCA 4EDYA 2DJ1A 3KM6A 1F3AA 4AJ6A 3KP8A 1U87A 4HS1A 1YKAA 4MCUA 5A4VA 3LG6A 3OR5A 2JL4A 1O6JA 3ZYWA 4JU5A 1TU7A 1Z6MA 1AUCA 3CSHA 1GWCA 1IYHA 2PU9C 2WFCA 3GN3A 1Z7RA 4GSSA 1O7UA 2VM2A 1TRWA 3UBLA 1W89A 4JE1A 3QFBC 4ZILA 3VI5A 2LTKA 4HU9A 2LJKA 4EXJA 1YF1A 2VL9A 3WYWA 2IFQA 2IMKA 2KUCA 2FWGA 2LRNA 3FR6A 1EWXA 3HVVA 1K0BA 4WF4A 3TKSC 5KN0A 3QAGA 3FHKA 2HT9A 2E2GA 1PQNA 4MH3A 3IRAA 1RK4A 2VLVA 3VURA 1EEMA 5G30A 2ON5A 2F3MA 5IMVA 2WDUA 1YQ1A 1HNCA 2R2JA 3TKSE 2WS2A 3DIEA 5JWQB 3C1SA 1GRXA 1WWJA 2YJ7A 4GRFA 3QD9A 4YQMA 3ISOA 4OFNA 4IP6A 1SL1B 1EP8A 4PNGA 4K0NA 3EC3A 1FW1A 1GP1A 1CQGA 3PGTA 3E9JB 1SK0A 4BPYA 2XPDA 3W8JA 3PH9A 2DIYA 2HXKA 2PVOC 3FZ5A 4KAEA 1ZOFA 2PGTA 3D4TA 4FYUA 5CREA 5B6MA 2ALBA 4KDXA 1WRYA 2CX4A 2WB9A 3L4NA 3LSZA 1F6MC 2GZYA 3LQ7A 2GT6A 2H0GA 1QFNA 1SENA 17GSA 2FLSA 1HNAA 4HZ4A 4NHWA 3ZVJA 2GSSA 3VWVA 4TR1A 2IN3A 4AF2A 4CW9A 4IQAA 4MP4A 2H19A 12GSA 3VLNA 4IN0A 2C3QA 1H75A 4YAVA 3LFLA 1ERTA 3NIVA 4XS6A 3BD2A 1JHBA 2P5RA 5GAPD 5HR2A 1NM3A 4ZB6A 4K8MA 3P2AA 1O8WA 4I97A 5J3RA 5ID2B 1XW5A 2HSHA 2H1GA 3LWAA 4POKA 3CMIA 3KMOA 4KH7A 1BG5A 5F07A 3ZTLA 4AJ7A 1TTZA 2PUKC 3KTLA 2JZSA 1I5GA 2H6ZA 2QSIA 5ABRA 4MZCA 2ON7A 1K0DA 3VK9A 2FWEA 3VFIA 3GURA 3KZQA 4ISDA 4MMMA 4RI7A 2GQMA 4YQVA 4JR4A 3KH7A 3RPPA 1QMVA 3QAVA 3M9JA 2XBIA 1SD8A 4KNDA 2LRCA 1A8YA 2KP2A 1RW1A 2B1LA 5DAKA 5ENUA 4AJ8A 4O5RA 1MDIA 1M9BA 3QR6A 5GSSA 2JZRA 2C4JA 2V6KA 3F0IA 4TR3A 2H66A 1BYEA 4EUYA 3UJ1A 5IIZA 2HSYA 4L5OA 2I81A 1KNGA 4KB3A 1ACVA 4HDEA 1JZOA 5ECRB 3F4SA 3HA9A 3KMNA 5DDLA 4Z7XA 3J7Yb 4MF7A 5EVOA 1USBA 3H93A 3ZZXA 1EGRA 3FYGA 4N10A 1SKSB 2O87A 3CRUA 3R2QA 5KN3A 2JU5A 1TP9A 3F4TA 1PKZA 5JCUA 4XRAA 4WEYA 3QDNA 5CAXA 1WPIA 4V2LA 5JCGA 1VF4A 3LYKA 3ZMLA 2NVLA 2X64A 6GSVA 2CA8A 3TKSA 4NWYA 2A4VA 3UVHA 2Z9SA 4HJ2A 2L57A 1MTCA 3UMAA 4F9ZA 2MBSA 3ZL5A 2ES7A 4BVYA 4MJEA 5E4WA 1DSBA 2M80A 3TKQA 4HEA2 1M2BA 2J23A 4ZBAA 4PQHA 1V98A 2NPBA 2HNLA 4ECBA 3GFKA 3CTGA 4LA1A 2CVKA 5ELAA 4JBBA 1NW2A 1TJDA 3FW2A 1YZXA 5A4UA 3C1RA 2CZ3A 3ERFA 5J4UA 3SBCA 4ZL8A 1GULA 2J9HA 1PKWA 4OO4A 2R37A 3GH6A 2ZNMA 5G1KA 2DJJA 4YH2A 2VL3A 1ERWA 4OCEA 4V2MA 1SL2B 2H8LA 5ID2A 1GSDA 4TW5A 4NHZA 4EF0A 1XBSA 3TJFA 4TN8A 1GLPA 4KDUA 2CVDA 4MF5A 1G0TA 1TK0B 1X5DA 4ML6A 5J9CA 2H1AA 3M9KA 5CO3A 4DSSB 2KOKA 3QFAC 5HFGA 3HY2A 5F8BA 1GSSA 1YJ6A 4ZB9A 1TK8B 3ZRDA 1O85A 1OE8A 1GTUA 3FEUA 1BAYA 3KJYA 1QUWA 4XIHA 4MJAA 6GSYA 1PL1A 3EU3A 3KCMA 3O6TA 4KGIA 4OMVA 1PD21 3RBTA 3DEXA 5D9TA 2PN8A 3MWHA 2JSZA 3UAPA 5EY6A 1TRVA 1GNEA 2L6CA 3NZNA 1ERVA 2WGRA 4LLRA 4D73B 4ACSA 4GTUA 5ECIB 2VLTA 3HYPA 1GTBA 2CQ9A 2HLSA 22GSA 3IR4A 5D96A 3I9V2 4GWRA 6GSTA 1EGOA 5C04A 2IWTA 1GTIA 1OE7A 2PPTA 1M0UA 4HU7A 4GQCA 3HZ8A 4J56E 2B3SA 5IOWA 1G7OA 3A2VA 1T7PB 3I6AA 5ECNB 4MJBA 2LJRA 4J2FA 1XW6A 2F51A 1J0FA 1QK8A 3IE3A 5LNKe 3RHBA 3IBHA 2FHEA 4HJMA 3G7JA 1SK2A 2JSYA 1WE0A 3E0UA 2V1MA 2LEGA 3UVTA 2H71A 2K8SA 5DJLA 1K3OA 3E3EA 4N0ZA 2KP1A 2VCVA 4IQ1A 5E59A 5B7CA 4NPBA 2A2SA 5IPHA 3TRQA 2OE0A 3C71A 4ECIA 1TI3A 3APSA 4QL7A 4GCIA 7GSSA 4KX4A 3UIWA 4EDZA 3VWWA 2AUVA 5J41A 3WGEA 2B6MA 2K9FA 5IO2A 4FO5A 3VPQA 1B4PA 5IMCA 2L5LA 4I8BA 3F6FA 3L9VA 5IMZA 4IJIA 1GTAA 1N2AA 5ECHB 4GSTA 4K0GA 1XXUA 3M1GA 3BCKA 2C80A 4DSSA 2GGTA 3G7IA 3US3A 1GLQA 2H70A 4O7HA 2FNOA 2YNXA 1NSWA 4H86A 4HQZA 2LQQA 2MMNA 2BJXA 2DJKA 1K3LA 5DAKB 2JADA 3ZLPA 2WCIA 1QQ2A 3DYRA 2YANA 3IK7A 2L4QA 3VWXA 1MDJA 1THXA 3KH9A 20GSA 2LSTA 4D73A 4IELA 1ZYEA 1HQOA 2CZ2A 2R6KA 1VF3A 3QOUA 4PUAA 1R4WA 1K0CA 5EPFA 1X9WB 3GKXA 4X43A 4EKZA 4X1UA 1V2AA 1A2JA 1YDKA 2OACA 6GSXA 4XS1A 1TK5B 3GTUB 3SWLA 3LYPA 4TXOB 3IK9A 1Z7PA 5COHA 2H75A 1M2DA 1WJKA 5CP1A 2DIZA 3DVXA 5IO0A 1TU8A 3FK8A 3EVIA 1HYUA 1T1VA 6GSSA 11GSA 1ZGNA 4IGJA 4O32A 1K0OA 3GNJA 5IM9A 1PL2A 2YWNA 3D0ZA 3GMFA 4JEDA 3BJ5A 2I3YA 3TJKA 5F0GA 3LXZA 4KW6A 4LMVA 1O8XA 5AIXA 2N5AA 3CXGA 1ZCPA 1ZZYA 2QGVA 4BWSA 3UBKA 4XTSA 3HCZA 2FWHA 2H1BA 2K8VA 3C8EA 2WZ9A 5D9XA 9GSSA 3IXRA 2YCDA 4TVEA 4IJ3A 4OD7A 4POMA 3I69A 1ML6A 2YWMA 2CV4A 3GYKA 3KD0A 4TOPA 1G7EA 1I9DA 3D21A 2GZPA 4KDYA 3BOAA 2PBJA 2MMZA 2RM5A 1YKCA 1KTEA 4IHUA 2DC5A 2LQOA 2V2GA 1PGTA 3TOUA 2N5FA 3A2WA 2P31A 1AXDA 2VIMA 4ID0A 5INYA 2O85A 3MSZA 3Q19A 4PUFC 1GSYA 5G1LA 2H01A 1S3AA 3H79A 5FT3A 4MDCA 2DMMA 4Q5QA 1OC8A 1XWAA 1Y6EA 3EYTA 2H72A 1OKDA 2IMEA 2X8GA 2E0QA 1FVJA 3ED3A 2GLRA 3HJPA 4OO5A 5HR0A 3O76A 4ML1A 1GUHA 3ZFBA 3P90A 3EE2A 5HFIA 3K8NA 3CYNA 2IMFA 3TDGA 3ZIVA 4L0WA 3GKMA 2FA4A 1AC1A 2L5OA 2KHPA 1K0NA 3D5JA 1SJZA 4PQIA 1X0RA 2FD3A 2IPAA 5IMAA 3HD5A 2F8AA 2C0GA 4RI6A 1GL8A 4HQSA 2LNSA 1Q4JA 1XFLA 1XOBA 2VO4A 3GTUA 1XWCA 2DJ2A 2M46A 2CAQA 4TXOA 4MH2A 3ERGA 4N30A 2OE3A 3HVXA 3GSSA 3ZVJD 4YAPA 3P7XA 4HOJA 1EOGA 2NDOA 4RUVA 1VF1A 2LJAA 3EMXA 3HVSA 1K0AA 3L0HA 1M9AA 2E7PA 3DVWA 2ZCTA 2ZUPA 3ZIJA 3GKNA 1S3CA 2YWIA 5KN1A 3GKKA 2AYTA 2B1KA 2JACA 1FG4A 1UN2A 4N11A 1AAZA 3AY8A 2X8HA 5HR3A 1ABAA 1AW9A 4NXIA 4NV5A 1TDIA 2IMDA 3H8QA 1FO5A 1SJ6A 3QAWA 2A2RA 1EP7A 2FUG2 1OYJA 3FZ9A 3KP9A 4G9HA 1GNWA 3C7MA 2PERA 3DD3A 3CTFA 1GUMA 5F06A 3IV4A 4P3YB 4L5LA 2IL3A 1B9XC 4ULXA 3HHVA 4ZB8A 1GSQA 1XZOA 5JWOB 4MK3A 5H5QA 1E6BA 5A4WA 4KSOA 1PRXA 1XIYA 1T4YA 1ON4A 1FVKA 1J9BA 1TOFA 2LRTA 3TUEA 3DRNA 1AIUA 4CDOA 4K6XA 2OBKA 2GT5A 2FY6A 2GS3A 3H1NA 1ZYQB 4I6XA 4BVXA 4WETA 1MDKA 2YPMA 2BTOT 1A2MA 1PMTA 2VUPA 1XW9A 1WMJA 2HZEB 1X9SB 2FA8A 4V1Ag 3UOMA 3ZITA 2YOIA 3TRXA 4RQXA 1YF0A 2XPEA 2YZUA 4HI7A 1DE1A 2RUFA 5AN1A 2LNTA 1JZDA 1T3BA 4WR4A 3F8UA 2OA7A 3I43A 1SYRA 2HI7A 3CBUA 2HRFA 2OBIA 5GSTA 5DQSA 3U5RE 3PINA 2R4VA 2I4AA 1NHYA 3EINA 2EIRA 3D4MA 2GQKA 2V32A 3GX0A 1F9MA 1C72A 4ZIJA 2I9HA 1EZKA 2QKEA 5G31A 3LEFA 6GSWA 1U88A 2PMTA 1EEJA 2RM6A 4GQFA 3TCOA 1SK1A 1PA3A 4FH8A 1UC7A 2YJHA 5AGYA 2CAIA 2C1YA 2PWJA 5B8AA 2D2ZA 3BBYA 2AHEA 1Q98A 4F82A 1M2AA 3DMLA 3QCPA 3GH9A 5ECOB 1FB6A 4WKWA 4IKHA 1ZL9A 16GSA 4GXZA 1Z5YE 4FYBA 4XS4B 1N8JA 5LCZA 4BWQA 3FKFA 3F3QA 2JZTA 1J08A 4O92A 5JWRB 1BJXA 1DBYA 4J57E 5DJMA 1PX6A 3KXOA 2REMA 1WP0A 2GQLA 1EV9A 1K0MA 4LL4B 5DQYA 2LKUA 1U3AA 3S9FA 2HYXA 3W6GA 3RHCA 1YY7A 1OVNA 4F0BA 4TXVA 3EWLA 5J5NA 3QMXA 1DUGA 1H4OA 5KEJA 1QXHA 2OADA 1SJIA 2H0HA 2IMIA 1SYXA 2OE1A 1ILOA 3FR3A 1ZMAA 2BMXA 1THOA 1OC9B 2HZFA 3ERWA 3LJRA 4WF5A 1FHEA 5IMDA 4POLA 1MEKA 3V1WA 1E2YA 3FRCA 5H5RA 5G5EA 5AISA 1TRSA 4MZBA 4MA9A 2L4CA 1Z9HA 3F6DA 3W8SA 2K18A 1SD9A 4LMWA 3M0FA 2GSRA 2HZEA 4POBA 3O3TA 3DKSA 3EMPA 4G19A 1T8EB 3DGQA 2NBSA 1F3BA 4NAXA 4K1FA 5L71A 2VCTA 1DE2A 2HFDA 5ECSA 3MAKA 2RIIA 2VCZA 4G10A 2FWFA 2RLIA 2YV9A 4CHSA 1KEBA 2LUSA 2TRXA 2AV4A 2PVQA 4PURA 2YWOA 1BX9A 1XWGA 1TKDB 1HD2A 2MYGA 2WJUA 4KSMA 3D22A 3LGCA 5ECPB 3RAZA 5CRHA 1O73A 5IQYA 3G9BA 1XCCA 3HJOA 2P5QA 2O7KA 3GIXA 3ME8A 1ST9A 3GL3A 5DCHA 4QQ7A 3HKRA 4E8EA 2N5BA 2X8CA 2FCHA 2AAWA 1T4ZA 2CT6A 4Q5RA 5CNWA 1X9MB 2DBCA 3ZREA 4TKYA 1TRUA 4JZQA 2H30A 2HE3A 2FGXA 4BL7A 2VL2C 4XS4A 1M99A 4GLTA 1X5CA 2AB6A 5HFKA 1VF2A 5IOXA 1JLVA 4N0VA 3F63A 4EL1A 1PN9A 3TJGA 4DSRA 2XBQA 1Z6NA 1S3DA 4PX1A 2B5EA 5H5SA 3BCIA 4PXOA 2GSTA 4K9ZA 1AQVA 2TIRA 1SKWB 3J7Yk 3MNGA 5J9BA 3FZAA 1R5PA 3C73A 1B48A 5DALB 5C00A 1V40A 4F0CA 2OJLA 4HZ2A 5D73A 5CRWA 1F2EA 3D6IA 3APQA 4Q5FA 3FR9A 4ZL7A 4I5QA 4IVFA 5A5KA 3GHAA 1A24A 2DJ0A 4WR5A 1UVZA 4GSNA 4V1Ap 3MDKA 2O89A 3KEBA 3CRTA 4K7IA 1ERUA 5AIVA 1A0RP 1JZRA 3EURA 4WBRD 3UARA 3KGKA 2L6DA 4TR4A 18GSA 3GSTA 1OC9A 4TR0A 2H1DA 5JCWA 1XWKA 4IP1A 3IPZA 5ECMB 2R5GA 1GUKA 4NMUA 2B5XA 2YP6A 1BQ7A 4L0UA 2R3XA 2K6VA 3A2XA 4BA7A 1LU4A 2EIQA 5D8IA 4KA0A 2DJ3A 3G7YA 3ZFLA 1GH2A 4MJCA 4MABA 1SL0B 4JRRA 2C0EA 2CX3A 4V2NA 3Q6OA 3U6VA 1PSQA 1B9YC 1EOHA 3TB2A 4DVCA 3HJMA 5D93A 2E2MA 2IIYA 4EC0A 3Q18A 4IW9A 2XC2A 1QGVA 1A2LA 2V6OA 4MPGA 4MPFA 2VCXA 3GRXA 2VLUA 2MBTA 2KLXA 4F03A 2RUEA 2IJYA 1XOAA 4MZWA 1OKTA 4X0XA 2YZHA 3TRPA 3EU4A 2H6XA 4ZXGA 4F2IA 2B7JA 2C0DA 3RPNA 2AJQB 2C3NA 1M7TA 4KE3A 2VCQA 2YN1A 4FIWA 2O8VB 1JFUA 1OC3A 3F3RA 1AQXA 4XRDA 1F37A 5G2ZA 1GSFA 4KCEA 2EIOA 3UL3A 2P0GA 1K3YA 1BEDA 3IOSA 1X5EA 2C3TA 2VM1A 3L9UA 5GZZB 1LBKA 4IS0A 1NHOA 2MZCA 1A0FA 3KIJA 1A23A 3GX8A 2H0IA 5HR1A 4ECJA 3H4KA 1CQHA 2VOCA 3VI7A 3VWUA 1YEXA 2XHFA 1Z3EA 2H6YA 3APOA 3Q74A 3L9SA 2LV3A 2YV7A 5G5FA 2LS5A 8GSSA 5F05A 4EE0A 2V41A 3GV1A 5FWGA 2H76A 2OKAA 3WGDA 5DALA 4GF0A 3WD6A 3UEMA 1PX7A 1TI1A 2HRNA 2VD0A 2G2QA 1SU9A 3KTBA 2MMOA 4OFMA 5EL8A 2H73A 5DCGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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