1AAZA

The structure of oxidized bacteriophage t4 glutaredoxin (thioredoxin)
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
87
structure length
87
Chain Sequence
MFKVYGYDSNIHKCVYCDNAKRLLTVKKQPFEFINIMPEKGVFDDEKIAELLTKLGRDTQIGLTMPQVFAPDGSHIGGFDQLREYFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords GLUTAREDOXIN
publication title Structure of oxidized bacteriophage T4 glutaredoxin (thioredoxin). Refinement of native and mutant proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
molecule tags Electron transport
total genus 19
structure length 87
sequence length 87
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1aazA00
4TXOA 2H76A 3UARA 2HNLA 3JCML 2MZCA 1PL1A 1XBSA 16GSA 4KSMA 5LCZA 1K0NA 2C1YA 3F8UA 1GUKA 4DVCA 2REMA 2LV3A 4O7HA 2LTKA 2FWEA 3TKPA 1XWAA 3F6FA 4LL1B 1TRSA 4K7IA 2V41A 4KDUA 1PKZA 3ME7A 2B5YA 3KTBA 4MH3A 2B7JA 2Z9SA 4L5OA 4N0VA 4MJAA 2B7KA 4J2FA 2WDUA 1XVWA 2NBSA 1QMVA 22GSA 2PERA 3C71A 2GQLA 4F03A 4WKWA 2FGXA 3A2VA 4KW6A 4ZL9A 1PRXA 5JWQB 2N5FA 1VF3A 3WYWA 1TI3A 4WBJA 5HFGA 3TRQA 1PN9A 4EDZA 4GSSA 4RQRA 3GHAA 3M9KA 2WFCA 3V1WA 1GUMA 3CTFA 3TDGA 2LEGA 6GSTA 5EPFA 2PPTA 2V6OA 2KHPA 2XBQA 3HVXA 5ECPB 4TXOB 3O3TA 3CSHA 4JR4A 4I8BA 4OD7A 4WEYA 1U3AA 3VWWA 1EOHA 4KNDA 2CAIA 2FY6A 5J9CA 3LFLA 2H75A 3UEMA 1KTEA 5EVOA 4ECCA 1TXXA 3F3QA 3GNJA 4OMVA 2IN3A 3KP9A 2YNXA 4I6XA 1AUCA 1Y6EA 1OE7A 3TJKA 1QQ2A 2JACA 3VPTA 4TR1A 4KH7A 2H1DA 1T4ZA 3OR5A 3CSJA 5D9XA 5CNWA 4OFNA 3A2WA 2RUEA 1K0BA 5IMVA 1R5PA 3TKSE 3CXGA 2KP2A 1LU4A 3GKXA 1HD2A 5IO0A 1AIUA 1HYUA 3IPZA 4ZL8A 3QMXA 2XC2A 2FNOA 3D6IA 3ZMLA 3TKRA 3ED3A 6GSWA 14GSA 1SK1A 11GSA 5JCUA 4XRAA 1GNWA 3ZVJD 4PGTA 2HSYA 1TK5B 1JFUA 1PGTA 1M9AA 4MZBA 3ZREA 2E2MA 2PU9C 3GFKA 4GRFA 5J3RA 1WMJA 3CRUA 1TOFA 3ZITA 1EV9A 3VWXA 5LD0A 4PUFC 1SENA 3QPMA 1I9DA 2VUPA 4DSQA 4N10A 3C8EA 3M9JA 3GMFA 1V58A 5CRHA 3VWUA 1GSQA 1MD4A 5ECRB 2DJ1A 4HI7A 4MJBA 13GSA 1AAZA 5J9BA 1GSDA 3QR6A 5CREA 4TR1B 2VAFA 2VCTA 1ST9A 3WT1A 3I9V2 2AHEA 2PUKC 3DD3A 2F8AA 1WRYA 17GSA 3HXSA 1H75A 3KXOA 4ZB6A 3CRTA 4ID0A 5ECQB 4ML1A 1FB6A 2ZNMA 3EVIA 5DCHA 2OE3A 5HR1A 5IMDA 5ELGA 1YEPA 3ZIVA 1J9BA 3R2QA 1T8EB 2XPEA 4TXVA 4EC0A 4POBA 3AY8A 3FZ9A 1SL0B 1B9YC 4PXOA 4XIHA 1DUGA 4HU7A 3J7Yb 4K8MA 1S3CA 19GSA 4IKHA 4GTUA 2GQMA 3FZ5A 1QXHA 4JR6A 3DKSA 4QQ7A 4JRRA 3NZNA 2VCVA 2YWNA 1AXDA 1XW9A 2OJLA 2WRTA 3M1GA 5G2ZA 2K18A 1Y25A 3N5OA 4ZILA 3J7Yk 2R5GA 5IOWA 1GUHA 1CQGA 5GSSA 2FA4A 3ZTLA 6GSUA 2WB9A 1Q4JA 5CAXA 2J23A 3L0HA 4Q5FA 4EO3A 5J5NA 1MDIA 1V2AA 2IFQA 3FR3A 2AYTA 4KSOA 4MZCA 2MMZA 4I97A 7GSSA 5A4UA 2HZEA 1MTCA 2VCZA 2V32A 3GKNA 4WR5A 4WXTA 1AQXA 4GLTA 2HZFA 3NOFA 1S3DA 1M2AA 4L8EA 5CYYA 4HZ2A 5E59A 2L4CA 2H6XA 3GL3A 4JEDA 3GKMA 4J56E 3G7IA 5DDLA 3FZAA 2B3SA 2LRTA 4Q5RA 4KGIA 1IYHA 1X9WB 1XW5A 4K7NA 2H1BA 1A2MA 3TOUA 1ZGNA 20GSA 3F4RA 4EUYA 3LYKA 1PX6A 1RW1A 5F8BA 2GT6A 5ENUA 1YKCA 4J57E 2C4JA 3GH6A 1EP8A 4GSNA 1FOVA 2YWOA 3G9BA 2IMKA 2H01A 5D96A 5F0GA 2DBCA 3SBCA 5JCWA 4RI7A 4G19A 2CVDA 1ILOA 1M0UA 2IMDA 1Z6NA 5G30A 2IFQB 4DSSA 1WOUA 3D22A 2F3MA 4JZQA 2H73A 1FVKA 2HZEB 4KDXA 1SKSB 4I5QA 4WF5A 3A2XA 5H5QA 3EC3A 3QDNA 3QFBC 3LSZA 2PGTA 4FH8A 5JWOB 2FWFA 1Z9HA 4TKYA 1A8LA 1GULA 3I43A 3BCIA 3TRXA 1SYXA 3FR9A 3VK9A 4L0WA 4LMWA 5DBQA 2JL4A 2JSYA 2ES7A 1X9SB 2WS2A 3GYKA 2AUVA 2L6DA 4CW9A 5KEJA 1C72A 3HJMA 4PQHA 3GX8A 4G9HA 1A2JA 1AQVA 2VL3A 4PNFA 4G2EA 2H0HA 1MD3A 2E0QA 1M7TA 5H5SA 5HR0A 2I81A 1B8XA 1GH2A 3EE2A 4LL4B 1SKWB 3WT2A 5DALA 2M72A 2L57A 3L9VA 1YF1A 2BMXA 2HLSA 5HQPA 2JU5A 3EMXA 3TOTA 2VM1A 3GL5A 4DSRA 1VF2A 5IIZA 2CX3A 4K6XA 4DSSB 4IW9A 2HI7A 5KN0A 2OBIA 3P90A 2RM5A 1X5EA 1G7OA 1B9XC 8GSSA 2L5LA 2YWMA 5IMCA 4F0CA 2FHEA 3EURA 4K9ZA 5B6MA 1TU8A 2XPDA 1YF0A 2FWHA 1GSEA 1KNGA 3KEBA 4AJ8A 3CBUA 3D21A 1QFNA 1EZKA 1F3BA 2VCWA 4MP4A 4BWQA 1HNBA 2A2RA 3TCOA 1W4VA 1XWBA 5D9WA 1BYEA 1YZXA 1TRUA 5F07A 6GSYA 4CDOA 2DLXA 2CT6A 1K0AA 4NPBA 3CSIA 3TJJA 5D8IA 5D9TA 5DALB 3FRCA 4V2MA 4K1FA 5GAPD 1S3AA 2IMIA 2VIMA 3PINA 2YZHA 3N9JA 3LORA 2L6CA 5F06A 4EKZA 1WP0A 3DVWA 3E0UA 3KD0A 1Z7RA 1SK2A 2IJYA 3F6DA 5HFIA 4NAXA 1QGVA 3I6AA 3HY2A 3IOSA 2LQOA 4HDEA 1BAYA 3I69A 2CQ9A 2YZUA 2LUSA 5DCGA 2FWGA 2OA7A 2NVLA 1ML6A 1XOBA 4OFTA 5B7CA 2BTOT 2X8HA 4JBBA 2C3QA 3D4MA 1JHBA 4PX1A 4L0UA 1A23A 2H6ZA 3UAPA 1XZOA 2HRNA 1PL2A 3TUEA 5L71A 3FKFA 5GSTA 3DWVA 3Q6OA 2R6KA 3UMAA 3VLNA 5IMFA 3GH9A 2XBIA 1B4QA 1U3IA 3DGQA 3GX0A 2C3TA 3L9UA 1T4YA 1FHEA 3IA1A 4ZB9A 2F51A 4YQMA 4IJIA 1ACVA 2HSHA 2IWTA 1XWGA 3F4SA 4ZB8A 2CX4A 2N5AA 3IBHA 2I4AA 3HVSA 3GRXA 2HT9A 3DXBA 4GQCA 4I2TA 1FO5A 2AV4A 1R26A 4X0XA 3TKSA 2G0FA 1YQ1A 5ABRA 3ERWA 3VI5A 1PA3A 1GRXA 3KGKA 1KBNA 3HKRA 4CHSA 4ULXA 2YJ7A 2KLXA 4JE1A 2M80A 1SJ6A 3ZFLA 2GSTA 1X5DA 5JCGA 5H5RA 3PH9A 2AAWA 2C0FA 2CVBA 5ELAA 2B1KA 1FAAA 1XCCA 3HZ4A 3BCKA 2KUCA 2B5EA 1IYIA 5D73A 3H4KA 4NHZA 2MMAA 5AGYA 2B1LA 1FW1A 5CRGA 4BPYA 4X43A 3GSSA 1O73A 3PR8A 2WJUA 5DVBA 2P31A 3LQ7A 1XFLA 2O89A 3IXRA 5G5FA 5IQYA 3F63A 1Z5YE 3W8SA 2VD0A 1M99A 1E2YA 1GTAA 3H8QA 3WD6A 1K0DA 5HFKA 2EC4A 1ERTA 2OADA 1O85A 4ILFA 3TKQA 3ZL5A 3GA4A 1BX9A 4AJ6A 4PQIA 1TP9A 4TN8A 4PNGA 3G7YA 1T00A 1LJRA 4TVEA 4ZBAA 2IMEA 5ECKB 2DJKA 2AB6A 4FYBA 1GWCA 3QFAC 2R2JA 3IHQA 2F8FA 1N8JA 2CA8A 1O8WA 3U5RE 3IK9A 5J4UA 3KJYA 1FVJA 1TW9A 2RLIA 1ZL9A 3M0FA 1A8YA 5C00A 5AIVA 3MDKA 3ZMKA 1PX7A 2MMNA 1THXA 3IK7A 4OCFA 1V98A 2CAQA 4MPFA 2QGVA 4LLRA 4OO4A 1V57A 4V1Ap 4X1UA 3P8WA 3LXTA 1XWCA 5HR3A 3IC4A 1R4WA 2NPBA 1J0FA 2VOCA 4WF4A 1TI1A 3APSA 1TRWA 3H1NA 2H70A 5FT3A 4GSTA 2HRFA 4POMA 3MNGA 5DJMA 4Z7XA 1A0RP 3KMOA 1JZDA 5ECMB 2B6MA 1OE8A 2GSQA 4YQUA 3ZIJA 1ZCPA 3VURA 2H74A 4MA9A 4Q5QA 4BWSA 3KZQA 4GF0A 2PBJA 4O32A 1GSYA 3L4NA 2NDOA 3TKSC 5D93A 5G5EA 3C1RA 4N30A 5J41A 4RI6A 2PVOC 1A24A 1PSQA 2WULA 4NWYA 2X8GA 3C7MA 1A0FA 2TIRA 2QSIA 5INYA 2IL3A 5D9VA 2LS5A 2H19A 2YWIA 3UVTA 4ZBDA 4EDYA 4E8EA 1M2DA 2X99A 3HZ8A 1UC7A 3RPNA 2JZRA 2JZTA 3W6GA 1GTUA 5A4WA 4MF7A 4OCEA 3F0IA 2V2GA 4ZBBA 1BQ7A 4YAVA 4AF2A 4MPGA 3UBKA 2FD3A 2H0IA 4F0BA 2VLUA 5B8BA 3LYPA 1V40A 4ZL7A 1EGOA 2XHFA 3GKKA 3FK8A 4K2DA 2EIQA 1URMA 4POKA 5IO2A 2K6VA 1SKRB 2LJRA 5G1LA 4K7OA 3BBYA 1YEXA 2GSSA 2DJ2A 5GAND 2ZUPA 1ZYEA 3TJBA 2G2QA 3ZRDA 3DVXA 1THOA 3L78A 2CZ3A 3FEUA 3BOAA 1WPIA 1XOAA 4HJMA 1SL2B 4K0NA 1GL8A 4KAEA 2LNSA 5IM9A 5COHA 2IPAA 1R5AA 4XCSA 1DE2A 3ERGA 1ZMAA 4BL7A 3EU3A 5ECSA 2HFDA 2OE0A 1I5GA 5DJLA 3US3A 1RQMA 1T7PB 3C1SA 1F3AA 1GNEA 2TRXA 4RUVA 2B5XA 4OWYA 4ISDA 3RAZA 2D2ZA 2PWJA 3HVVA 5KN1A 4ZIJA 1XPVA 5C04A 3F4TA 3D5JA 3KCMA 2VL9A 4QL9A 3NIVA 4KUNA 5JWRB 1K0CA 1X0RA 5LNKe 4MZWA 2O87A 3WGXA 3IDVA 2GVPA 1BJXA 2VCXA 5DQSA 4XTSA 4KA0A 3EWLA 1VGLA 4WR4A 1NHOA 1EV4A 5GZZB 2C0GA 1QK8A 4D73A 4XS1A 5DAKA 3LXZA 5F05A 3ZYWA 3F9UA 3VI7A 3S9FA 3DRNA 4BA7A 5CO3A 2K9FA 2O7KA 1FB0A 2C0EA 1TJDA 1GP1A 4PUAA 1Q98A 5ECOB 4PQ1A 2DJ0A 1F9MA 1JZOA 2LKUA 5ID2A 1SJZA 2GQKA 2YJHA 3GSTA 2PMTA 4MLYA 4TOPA 1GSSA 2AJQB 4MJCA 2J9HA 1UN2A 4KCEA 1YKAA 2LJAA 2X8CA 2I9HA 3KH7A 3E9JB 3VPQA 4V1Ag 2H71A 1JLWA 3D4TA 2OE1A 2CVKA 2DSAA 1GLPA 3DYRA 2GZPA 2LRNA 4OO5A 5AISA 3WGEA 3TJFA 2EIRA 1G6YA 4MABA 2MMOA 5DQYA 2M46A 10GSA 1O8XA 1TKDB 4ML6A 5EY6A 3HJOA 1TDIA 4KDYA 1OC3A 1SJIA 2LRCA 4MK3A 2FUG2 4YQVA 1M9BA 1F37A 4D73B 2O8VB 3RHBA 5DAKB 1B48A 4IELA 4POLA 3IAM2 2DC5A 1O7UA 2YV9A 1OKDA 4NMUA 3DEXA 1EGRA 3Q18A 1HNAA 3IE3A 5CRDA 4E8HA 2MBTA 1ON4A 1USBA 5HR2A 3HDCA 1EP7A 5ID2B 1XIYA 4IP6A 4IN0A 4AJ7A 4KB3A 4NHWA 4O5RA 3GIXA 3CMIA 3FHKA 4EVMA 2LJKA 3KMNA 5CP1A 1EWXA 1PQNA 2YOIA 2P0GA 2JSZA 1JZWA 2H66A 5E4WA 4HU9A 3BJ5A 4IQ1A 3RPPA 2RIIA 2H8LA 1O81A 4ACSA 12GSA 2DMMA 6GSXA 5ECLB 2QC7A 5IPHA 1AC1A 2VL2A 2MYGA 2NTOA 2VD1A 2FLSA 1G7EA 4ZXGA 1Z3EA 1JZRA 2CZ2A 2GGTA 2DIZA 5B8AA 4EXJA 4KE3A 4XRDA 3LEFA 4MDCA 4IP1A 4HUAA 3QD9A 4NV2A 1U88A 2LNTA 4FYUA 3QAVA 1JLVA 4JU5A 2HXKA 6GSVA 1BEDA 2KOKA 2YN1A 1X5CA 1KEBA 2OBKA 2YP6A 3GTUA 3RDWA 1XXUA 1TTZA 5A5KA 2YPMA 1GTBA 3IRAA 1YJ6A 1MEKA 4Q5NA 3GURA 3O76A 4GWRA 3KH9A 1K0MA 1M2BA 4KX4A 5IMAA 2VM2A 2MBSA 1UVZA 1CQHA 1SYRA 1TU7A 2GSRA 4LMVA 1SD8A 4YAPA 3UJ1A 1G6WA 2VO4A 1YY7A 2H1AA 2WCIA 2V6KA 3ISOA 4HZ4A 4EL1A 4IJ3A 1YDKA 4MF5A 4O92A 3HJPA 3VWVA 1K0OA 1ZZYA 2GDRA 3IAS2 2P5RA 4BVXA 3PGTA 1DE1A 1WJKA 3UBLA 1XW6A 2K8VA 1K3YA 1VF1A 2OACA 1MDKA 1T1VA 1ABAA 2H30A 5G31A 1NSWA 2IMFA 1EEMA 2RUFA 3LG6A 1LBKA 3M8NA 1WE0A 4TR4A 2C8UA 3ZLPA 3FW2A 4GCIA 1Z6MA 3K8NA 3GTUB 4BVYA 1W89A 1N2AA 3HYPA 4RQXA 4V2NA 2E7PA 1TK8B 3FZ4A 2H1GA 1X9MB 5IOXA 5KN2A 3P7XA 3H79A 5A4VA 2CV4A 3E3EA 1SL1B 5ECNB 2FA8A 3L9SA 4MMMA 1OVNA 18GSA 1J08A 1V9WA 1EEJA 4IS0A 2TRCP 3Q19A 3QAWA 2L4QA 2RM6A 2WGRA 9GSSA 1ERUA 2X64A 1BG5A 2PVQA 1WIKA 3ME8A 3TB2A 5AIXA 4L5LA 1EOGA 4N11A 3CYNA 4WETA 4MCUA 3HD5A 1E6BA 4GQFA 2I3YA 1PD21 3C73A 2KP1A 2H72A 4V2LA 5FWGA 3DIEA 1WWJA 3WGDA 1PMTA 3F3RA 2DJJA 1NM3A 3H93A 3D0ZA 4FYCA 4LA1A 2LSTA 3HCZA 4OFMA 4G10A 1AW9A 2F9SA 4HQSA 2E2GA 1HNCA 3LWAA 5AN1A 4HEA2 2VL2C 2H6YA 1ZOFA 1SK0A 4IQAA 2QKEA 5CRWA 4AGSA 2ALBA 4NV5A 3EINA 4GXZA 2R37A 4IVFA 2GLRA 3KP8A 3QOUA 2ZCTA 3HHVA 1VF4A 4FIWA 4YH2A 4MF6A 3G7JA 3UL3A 3UIWA 3FYGA 1ERWA 5KN3A 1XVQA 1VRSD 3ERFA 2ON7A 1DBYA 3APQA 2EIOA 2V1MA 4ECIA 2IIYA 2PN8A 3CTGA 6GSSA 1SU9A 1UA5A 2HYXA 3FY7A 3DMLA 5EL8A 1HQOA 5ECHB 3KM6A 2DJ3A 1OKTA 2A4VA 2OKAA 4IBPA 3IR4A 2C80A 1Z7PA 4TRXA 2VLVA 1PKWA 1T3BA 1NHYA 3LJRA 4TW5A 3RHCA 2GZYA 4K0GA 3A5WA 4IGJA 1TK0B 2GS3A 2H0GA 1SD9A 1F2EA 1R7HA 3UOMA 3ZFBA 5ECIB 2I1UA 4HOJA 4F82A 3LGCA 3Q74A 3GV1A 2JADA 3A3TA 3BD2A 3MWHA 2DMLA 2HE3A 2L59A 2YV7A 4XHMA 1AQWA 1ZYQB 1OC9A 1G0TA 4EF0A 1U6TA 1GSUA 3HA9A 3TJGA 4IHUA 2R4VA 4I2UA 1OYJA 3EYTA 3KIJA 1TRVA 4PURA 3UVHA 1XWKA 1QUWA 3O6TA 1K3OA 3TRPA 4MH2A 5IPGA 1RK4A 2O85A 2BJXA 3EMPA 4XS4A 3VFIA 4XS6A 3P2AA 1A2LA 1GSFA 1DSBA 4P3YB 4MJEA 1U87A 2LQQA 3APOA 1F6MC 2ON5A 4HQZA 4ECBA 2YANA 4F2IA 4H86A 4HS1A 5G1KA 1ERVA 2VCQA 1FG4A 1OC8A 3RBTA 5FHIA 3EU4A 4DEJA 3IV4A 2A2SA 4NXIA 2L5OA 1GLQA 5B6NA 4N0ZA 1OAZA 4ECJA 1OC9B 3M3MA 2P5QA 4KCAA 4F9ZA 1GTIA 5IMZA 2C3NA 2GT5A 1MDJA 3ZVJA 4EE0A 3MSZA 2GTUA 1O6JA 2WZ9A 3KTLA 3TGZA 4QL7A 4FO5A 3W8JA 2DIYA 3QCPA 2GZZA 2K8SA 1H4OA 1NW2A 2C0DA 2JZSA 3ZZXA 2FCHA 3MAKA 3U6VA 4XS4B 4TR0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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