2VUPA

Crystal structure of a type ii tryparedoxin-dependant peroxidase from trypanosoma brucei
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
AASSIFDFEVLDADHKPYNLVQHKGSPLLIYNVASKCGYTKGGYETATTLYNKYKSQGFTVLAFPCNQFGGQEPGNEEEIKEFVCTKFKAEFPIMAKINVNGENAHPLYEYMKKTKPGILKTKAIKWNFTSFLIDRDGVPVERFSPGASVKDIEKKLIPLLEST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords GLUTATHIONE PEROXIDASE-LIKE PROTEIN
publication title Structural and Mechanistic Insights Into Type II Trypanosomatid Tryparedoxin-Dependent Peroxidases.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma brucei
total genus 48
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 1.11.1.9: Glutathione peroxidase.
pdb deposition date 2008-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00255 GSHPx Glutathione peroxidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vupA00
4ID0A 1E2YA 4BL7A 3TJJA 2I9HA 3V1WA 2C4JA 4BVYA 1PQNA 4FYUA 5A5KA 4WBRD 5ECSA 2RM5A 1SKRB 1TXXA 5J3RA 1ON4A 1KBNA 2FCHA 3C7MA 3F0IA 2E2MA 1GH2A 2L4CA 2HZFA 3IOSA 2H6XA 1TRVA 4OWYA 1SYRA 3ZTLA 1AC1A 1WPIA 2LJAA 4L5LA 1OC9A 4N11A 3HHVA 2CX3A 3WT2A 3FYGA 3TOTA 22GSA 1DBYA 2HRNA 2EC4A 3L9VA 4KW6A 1WWJA 2VL2A 4GXZA 4ML6A 2GZYA 2O89A 3M8NA 3LQ7A 1K0AA 4GSNA 4CHSA 4KX4A 5GSTA 1OE7A 3HVXA 3DEXA 2C80A 4EL1A 4OCEA 3BJ5A 3WGDA 20GSA 2GDRA 1BX9A 4BWSA 3CMIA 1PX6A 2LS5A 4RQXA 1B8XA 1BEDA 2FWEA 3HCZA 4H86A 4QL7A 3HZ4A 3HY2A 3UBKA 2C3QA 3GURA 2PVQA 4GRFA 3CRUA 3FRCA 3LFLA 5IMDA 3LEFA 2WJUA 4J2FA 4N10A 4ECJA 5G5FA 2IFQB 11GSA 1AIUA 1GSDA 1U3AA 2JU5A 1A2MA 3CBUA 5F07A 4IVFA 9GSSA 4NHZA 2B1LA 4RI6A 1J08A 5HFKA 2VD1A 2IWTA 3DVWA 2L6CA 2FY6A 3S9FA 5DQYA 2GSTA 2MZCA 1I5GA 3US3A 3H4KA 2CVDA 2A4VA 2H75A 5AIVA 1USBA 3P90A 1GLQA 4TXOB 1T7PB 2JADA 1MDIA 5HFIA 5ENUA 3E9JB 3F3RA 4I97A 3C71A 1EGOA 1XVWA 1ZMAA 3GHAA 4PXOA 1O73A 4POKA 4YQMA 4MJBA 4PNGA 4Q5QA 1TOFA 3L9SA 2FWHA 4KAEA 2H74A 1ZYQB 4YH2A 4KH7A 4AJ8A 1DE2A 2O7KA 4IGJA 4E8EA 3UEMA 2H66A 1EEJA 3UOMA 1FVJA 4XTSA 5CP1A 1EV9A 2VLUA 4ECIA 1Z3EA 1FB6A 1B9XC 3M9JA 2OADA 5ID2A 1OYJA 4OFTA 3IXRA 3TGZA 1AQWA 4NV2A 1NM3A 4ISDA 2G0FA 5F8BA 1S3DA 1SL2B 4N0VA 2LQOA 4NPBA 4HQZA 1QGVA 3UBLA 2OE0A 2C0EA 5CAXA 2CA8A 4WEYA 2C3TA 4PNFA 5FHIA 4J56E 2CQ9A 1ERVA 4BPYA 1GTIA 5GAND 3EMPA 2V41A 3QMXA 4KUNA 1CQGA 3KXOA 1CQHA 3ZYWA 5DALA 3KZQA 1F6MC 1XOAA 3F4TA 2YP6A 2A2SA 3IC4A 4EE0A 4P3YB 4TKYA 5CRDA 4DVCA 1HYUA 2LJKA 1OC3A 4POBA 3FHKA 3H8QA 3RHBA 3KP9A 2VUPA 4TXOA 1K0MA 3Q6OA 1ILOA 1THOA 3QDNA 3GKKA 1XWBA 2L5OA 2X64A 1Z6MA 2I4AA 3N9JA 3ZLPA 1H4OA 2B7KA 2C0GA 1EP8A 5H5SA 2LRCA 2YCDA 4OO5A 3LYPA 4HQSA 3GSTA 2FLSA 2I81A 1G7EA 2EIQA 3VWWA 2NPBA 5IMCA 2H73A 4K1FA 3A2XA 1YY7A 1X9WB 4I6XA 4HZ4A 3H93A 1B48A 3I9V2 2O87A 2HSYA 3GL3A 5D9VA 3VWVA 3EYTA 4GCIA 2C0DA 4IJIA 18GSA 4ECBA 3GKMA 4ZBBA 1H75A 3I6AA 1FB0A 5ECHB 5IMZA 3RAZA 2F8FA 5DCGA 2H0GA 1M9BA 2YANA 4NXIA 1A23A 1QUWA 4V2NA 3VLNA 2B5EA 1K3LA 3WGXA 2OA7A 4G2EA 1QMVA 1FHEA 4FO5A 2LRTA 1UC7A 1SD8A 2PU9C 4Q5FA 2ALBA 3WYWA 4ML1A 1HNCA 3GL5A 1SJIA 3VFIA 1GSQA 1GNWA 4XS4B 1TP9A 3PGTA 2ES7A 4KDXA 1YEPA 5B8BA 3TRXA 3KGKA 3W8SA 3F8UA 2K9FA 4JZQA 3BCKA 4WXTA 5IPHA 2HSHA 1WRYA 5CRWA 3GA4A 5KN1A 5DQSA 4MA9A 3PH9A 3UARA 3KP8A 1N2AA 2O85A 4KA0A 1EOGA 1XZOA 3L4NA 1EWXA 1FW1A 3HDCA 2WCIA 3GH6A 1YZXA 4OO4A 4MZBA 2MBTA 2KOKA 3TRQA 5IOXA 1QK8A 4EUYA 1MDJA 2H1DA 4JEDA 2OKAA 4KCEA 1GUHA 4MLYA 3BCIA 1YEXA 3VI5A 4MABA 3NIVA 3SWLA 5ECQB 1O6JA 4HZ2A 1AQXA 1PRXA 2YPMA 4XS6A 1OC9B 5JWOB 2XHFA 1DUGA 2TRCP 2WULA 1SJZA 1Z7RA 1TRSA 5L71A 1OKTA 1GUMA 1WE0A 2BMXA 2VM2A 4ZB9A 4ZBAA 3EE2A 2H6ZA 5B7CA 4V1Ag 3N5OA 4CDOA 3CTGA 3FZAA 2GQLA 5DJMA 1DSBA 5G30A 3HKRA 1Z6NA 5A4WA 1ERUA 3W6GA 1G6YA 4TR1B 5J9BA 4KE3A 3FW2A 2H1BA 4EXJA 3GX8A 1BG5A 2WDUA 5ECIB 3DRNA 2DJKA 1JFUA 3VI7A 2L57A 3CSHA 2VL9A 2GTUA 3DGQA 1QFNA 4MH2A 1TI1A 4K9ZA 1EOHA 1EGRA 3JCML 4ILFA 1PA3A 4KDYA 1JLWA 2ON7A 2PVOC 2H6YA 4NMUA 1WOUA 1M2DA 5ECLB 3ZIJA 3GX0A 1Z9HA 2ZNMA 3CXGA 6GSWA 6GSXA 1UVZA 2K6VA 2V1MA 1K0CA 1GTBA 1O85A 1AXDA 2RLIA 5IO2A 3LXZA 4KGIA 1HNAA 2N5AA 1TK8B 4X1UA 1A0RP 4F0CA 1GTAA 3RHCA 3GMFA 1XWGA 3Q19A 5CREA 2J9HA 2H01A 3M3MA 5JWRB 1TKDB 1T4YA 4IN0A 5D9WA 4MJAA 7GSSA 1FAAA 3VURA 2YJHA 1M9AA 1XOBA 2IMKA 1VGLA 4GWRA 2GT6A 4GLTA 1SKSB 3F4SA 2QSIA 4POLA 1ZOFA 2F8AA 4MMMA 4PUFC 2NVLA 4TR3A 4JR4A 2V2GA 5D9TA 2GLRA 3KMOA 1V98A 4LMWA 4QL9A 2E2GA 4GQFA 2LJRA 4K6XA 17GSA 3U6VA 3EU3A 1X5DA 1YDKA 1JZDA 4MZCA 2WGRA 4F0BA 5J9CA 2VLVA 2H30A 2HXKA 1W4VA 1NW2A 3MSZA 4ACSA 2B7JA 1KEBA 4TR1A 1V9WA 3ZREA 1F3BA 1SL0B 1XFLA 1GSUA 1SJ6A 3FEUA 5G5EA 2OBIA 2AYTA 3UVTA 4D73B 2O8VB 1YF0A 3IPZA 4CW9A 5ID2B 4IHUA 3UMAA 1FVKA 3QAGA 3IE3A 1J9BA 5EPFA 2N5FA 5J5NA 2H0HA 3VPQA 5ECOB 3APOA 5KN0A 4JRRA 4OFNA 3ZRDA 2WFCA 3IDVA 4Z7XA 5D93A 2YWMA 1A8YA 1YQ1A 1F2EA 1C72A 3GRXA 1THXA 2JSZA 1GULA 3IK7A 1GLPA 5CRGA 4HUAA 2WRTA 4O5RA 4O92A 5B6NA 4PGTA 5DALB 2VD0A 5IQYA 2L6DA 4NWYA 3A2WA 2R4VA 4HI7A 5CO3A 2VO4A 2PERA 2LEGA 4V2MA 2JACA 4J57E 3IA1A 2GZZA 3DD3A 2B6MA 2DLXA 3M0FA 5HR2A 3TKRA 3ME8A 4IS0A 1TRUA 4PUAA 1E6BA 1TDIA 2HT9A 2DIYA 3QCPA 3IBHA 3D4TA 4JR6A 3VPTA 2TRXA 1TJDA 1Z7PA 2B5YA 4LA1A 3D4MA 5D8IA 3ED3A 1G7OA 3KH7A 2A2RA 3CSIA 2WB9A 5D73A 5D9XA 2B3SA 3TOUA 1DE1A 2X8HA 1LBKA 3BD2A 1XW9A 3TJGA 1EZKA 3ZFBA 3BOAA 4D73A 5CYYA 2HNLA 4L0UA 4N0ZA 4YQUA 4EC0A 1YKAA 3GKNA 1R5PA 1EP7A 2K18A 1NHYA 4EDYA 2P31A 1F3AA 4PQHA 5ELGA 4N30A 2MMZA 2TIRA 4F82A 3D5JA 1HNBA 3P7XA 4EO3A 5ABRA 4FH8A 1XVQA 6GSYA 2AHEA 2DJ2A 1JZOA 3QD9A 3QOUA 5C04A 3P2AA 4HU7A 1AQVA 2FA4A 4IQAA 2B1KA 2BTOT 4I5QA 1O8XA 2B5XA 3D22A 5ECPB 2R5GA 4IJ3A 3EVIA 2F51A 4MK3A 2YJ7A 1K0OA 1RQMA 6GSVA 2VOCA 4HU9A 4OFMA 3O3TA 3RDWA 5EL8A 1XBSA 4WF4A 2KUCA 2NTOA 1I9DA 1MEKA 2D2ZA 3GV1A 3QAVA 1VF4A 3TUEA 2Z9SA 13GSA 2H1AA 3HZ8A 4HJMA 3ME7A 1M99A 3CYNA 3ZIVA 5HFGA 5AGYA 2N5BA 3HYPA 4WR4A 3LWAA 2XPDA 3MDKA 1YJ6A 2H19A 3E0UA 3DVXA 4WR5A 4TXVA 1ZGNA 2IPAA 4AGSA 2C8UA 2YWNA 1R7HA 1T00A 1BQ7A 4KNDA 4IW9A 2OACA 3RPPA 2DJ0A 3RBTA 2PWJA 5G1KA 3EWLA 3F9UA 1JZWA 2C0FA 3G7YA 2CV4A 3G7IA 2XPEA 4MPGA 2HYXA 2JZRA 4ZB6A 8GSSA 2M72A 4TVEA 4ZXGA 3HXSA 5AN1A 3OR5A 3H1NA 1K3OA 5JWQB 1XXUA 1M7TA 1URMA 5HQPA 3LORA 1GWCA 2HLSA 3GN3A 2VM1A 2YOIA 2JSYA 2DJ3A 3CSJA 3KD0A 1A2JA 1PKZA 3C73A 4K7IA 4KSOA 4TR0A 5IM9A 4K7OA 3E3EA 3HJPA 3ZITA 3LXTA 4XRDA 1HD2A 4MCUA 3WT1A 4KCAA 1SENA 5ECMB 4GF0A 4ZL7A 3FZ5A 5C00A 3AY8A 2VCTA 5DJLA 2CAQA 19GSA 1V40A 5ECRB 3KCMA 1MD4A 1ERWA 4XCSA 2L59A 1SK1A 2L4QA 3G9BA 2HRFA 4HEA2 4K8MA 6GSTA 2YN1A 4IQ1A 2PUKC 3WGEA 3J7Yb 14GSA 1J0FA 1K0NA 1BYEA 1G0TA 1B9YC 1T4ZA 3UIWA 5INYA 1A2LA 3HD5A 2CVKA 2KHPA 3TJFA 1WJKA 2QGVA 1X9MB 1HQOA 2GZPA 1TW9A 2IL3A 3J7Yk 4RI7A 4RQRA 3GSSA 1A24A 2V32A 4MF6A 3ZMLA 2V6OA 1A0FA 2R6KA 3L9UA 2YZHA 5IIZA 4K7NA 4RUVA 1TK0B 4AF2A 3UL3A 5DDLA 4ZL9A 1ZCPA 3W8JA 4NHWA 2ZCTA 3ERFA 3H79A 5LD0A 5JCGA 3Q74A 4BWQA 1UN2A 3KTBA 3TKQA 4DEJA 2IMDA 2VLTA 1R4WA 5G31A 5G1LA 1T3BA 2PPTA 1TI3A 4HDEA 4I8BA 5IO0A 4IKHA 1LU4A 1M2BA 2AV4A 3IK9A 1VF3A 2DJ1A 3A5WA 5G2ZA 4HS1A 4WBJA 2LNSA 12GSA 3EMXA 2VCWA 2MMAA 3EC3A 2LQQA 2VL2C 1XWCA 3EURA 1GUKA 5F0GA 2BJXA 5E59A 2FGXA 4MJEA 2VIMA 3DWVA 2VCXA 4V2LA 2P0GA 2DBCA 3GNJA 3PR8A 4DSSB 5GSSA 1RK4A 1G6WA 3QAWA 2FNOA 2RM6A 4MF7A 4EDZA 4ULXA 2YNXA 3UVHA 1X9SB 3QPMA 4XHMA 1S3AA 4O7HA 1FOVA 1XW5A 5A4UA 5AIXA 2LTKA 2DMMA 4WETA 1PSQA 10GSA 5HR3A 3FKFA 5GZZB 5B6MA 1OKDA 2V6KA 4FIWA 3TCOA 4GSSA 3NZNA 2MMOA 5IPGA 2LV3A 1EEMA 2IJYA 2PN8A 3F4RA 5EVOA 3PINA 2GSSA 1JZRA 3IAM2 2H8LA 2IMEA 3CTFA 1N8JA 4I2TA 1SK0A 2GVPA 5FWGA 1A8LA 4IELA 4LMVA 3APQA 4JE1A 4KDUA 3M9KA 2MYGA 4POMA 4TOPA 4LL1B 1OC8A 2XBIA 2RUFA 6GSUA 5IMAA 2IIYA 1GL8A 2LRNA 4EVMA 1PX7A 3TJBA 1K0BA 5IMFA 2MMNA 3EINA 3LYKA 2CT6A 4ZL8A 4TN8A 4JBBA 4F03A 2VAFA 3LJRA 4ZIJA 3KJYA 1LJRA 1TTZA 1W89A 5CRHA 2GSRA 5J41A 3EU4A 2OJLA 2FD3A 3LSZA 2OBKA 1T8EB 5LCZA 4NV5A 3QR6A 3FZ9A 2P5QA 2REMA 2XBQA 2P5RA 3ZVJD 4NAXA 3GTUA 1SD9A 2HFDA 4DSSA 1PD21 4YAPA 4WF5A 5AISA 5HR1A 3IAS2 2LNTA 3TKSC 2DMLA 2H70A 1U3IA 1R26A 3MWHA 4L0WA 1F9MA 2GS3A 2RUEA 1SKWB 1RW1A 3KMNA 4G9HA 2YZUA 1Q98A 5H5QA 4ZBDA 1GTUA 5KEJA 3D21A 1FO5A 4IP1A 3TKSE 1PL1A 1M2AA 1UA5A 1TU7A 5ECKB 3QFAC 5B8AA 2XC2A 3MAKA 1GSSA 3WD6A 1VRSD 3HVVA 2X8CA 4XS1A 3I43A 3F63A 1ML6A 4FYCA 1EV4A 3HJOA 2CAIA 1O81A 1GP1A 3K8NA 4K0GA 2CZ2A 3VWUA 2VCQA 2FWGA 2RIIA 1WIKA 5JCWA 2IMIA 5IOWA 2DJJA 3KIJA 3IHQA 1OVNA 2I1UA 2R37A 3DMLA 3F6DA 4X0XA 1F37A 4HJ2A 1XCCA 2FA8A 2QC7A 4YQVA 5E4WA 3FR9A 4K2DA 3FY7A 4KSMA 2NBSA 2H72A 1PL2A 1X5EA 2C1YA 3TKSA 3GKXA 4MPFA 4TW5A 2DSAA 3TDGA 2HZEB 3APSA 1O7UA 4PX1A 1SYXA 3KM6A 1B4PA 3BBYA 5ECNB 1MTCA 3HA9A 3UAPA 2IN3A 1TU8A 3O76A 2PBJA 2WZ9A 2IFQA 1GNEA 3G7JA 1PN9A 2GT5A 4X43A 1BAYA 4MF5A 1U88A 2JZTA 2L5LA 3Q18A 2FHEA 3F3QA 1SK2A 4L5OA 3HJMA 5LNKe 1IYHA 5HR0A 5H5RA 4XIHA 2E7PA 1V2AA 5IMVA 1O8WA 5DAKB 2DC5A 4BA7A 3ZL5A 4QQ7A 3ZFLA 3QFBC 3LGCA 3R2QA 4ZB8A 1XW6A 1V57A 1MD3A 1MDKA 4MJCA 1U6TA 1TRWA 1ZL9A 1Y25A 1AUCA 3TB2A 2R2JA 4Q5NA 2CZ3A 4MZWA 1VF2A 2FWFA 4IBPA 2WS2A 3KEBA 5ELAA 4PURA 1QXHA 3F6FA 2YV9A 2M46A 3IV4A 1K3YA 1TK5B 3VWXA 3FZ4A 5DVBA 2K8SA 3FR3A 3D0ZA 1JHBA 4I2UA 2X99A 4PQIA 1AW9A 2OE1A 4EF0A 4BVXA 5GAPD 2VCZA 2J23A 3CRTA 4F2IA 1QQ2A 2F9SA 2EIRA 3FK8A 2VL3A 1X0RA 3TRPA 2IMFA 2HZEA 3C1SA 2LUSA 3NOFA 2H71A 2NDOA 3KTLA 4ZILA 2H0IA 2GQMA 3U5RE 3GYKA 4LLRA 2PGTA 6GSSA 1ST9A 2JZSA 5FT3A 2ON5A 2QKEA 2I3YA 2R3XA 1K0DA 2G2QA 2CX4A 4DSQA 3VK9A 2HE3A 3LG6A 3KH9A 16GSA 1OAZA 3DKSA 4DSRA 1Q4JA 5DBQA 4OCFA 1ERTA 1JLVA 1KTEA 3HVSA 1B4QA 5JCUA 2MBSA 4JU5A 1V58A 1XWAA 4HOJA 5A4VA 4MDCA 4E8HA 5DAKA 4L8EA 1ZYEA 1ZZYA 3ZVJA 4EKZA 1R5AA 1GRXA 3DIEA 3SBCA 4F9ZA 1KNGA 1WMJA 4GTUA 3ERGA 3P8WA 4WKWA 1Z5YE 2LSTA 5F05A 4TRXA 3TJKA 1FG4A 2CVBA 1M0UA 4PQ1A 2EIOA 3ZMKA 4K0NA 4OD7A 1PMTA 4AJ7A 4YAVA 1YF1A 2C3NA 4GSTA 5DCHA 1VF1A 1OE8A 1NSWA 4XRAA 2H76A 2FUG2 1GSFA 2JL4A 3O6TA 5KN2A 3ISOA 4MP4A 3DYRA 4G10A 3MNGA 3A2VA 5KN3A 1SU9A 3DXBA 1XPVA 2F3MA 5D96A 3IR4A 2YWOA 4O32A 3IRAA 3GFKA 1AAZA 4OMVA 2OE3A 4G19A 2LKUA 1GSEA 2AAWA 3ERWA 3C1RA 1PGTA 3TKPA 2KP1A 2K8VA 2VCVA 1NHOA 2X8GA 1T1VA 1S3CA 2AUVA 4Q5RA 5CNWA 5EY6A 4TR4A 1IYIA 1BJXA 4V1Ap 2DIZA 2GQKA 4ECCA 1WP0A 2M80A 3L0HA 3M1GA 2KP2A 2AB6A 5COHA 1YKCA 5J4UA 2GGTA 2HI7A 3L78A 1ACVA 3GTUB 4XS4A 4AJ6A 3UJ1A 1U87A 3GUSA 2KLXA 4LL4B 4IP6A 5F06A 1PKWA 3C8EA 2H1GA 3FR6A 1Y6EA 3ZZXA 2YWIA 4GQCA 3GH9A 3RPNA 3I69A 1X5CA 3A3TA 2GSQA 1SL1B 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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