4N0ZA

Crystal structure of cisplatin bound to a plasmodium falciparum glutaredoxin 1 (pfgrx1)
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SEAVKKWVNKIIEENIIAVFAKTECPYCIKAISILKGYNLNSHMHVENIEKNPDMANIQAYLKELTGKSSVPRIFINKDVVGGCDDLVKENDEGKLKERLQKLGLVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
publication title Interaction of Cisplatin with plasmodium falciparum Glutaredoxin 1
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin
total genus 37
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2013-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4n0zA00
3ZVJD 3GKXA 2LJAA 2A2SA 3NOFA 1K3OA 4JE1A 5CAXA 2FHEA 2HXKA 3A2VA 3ZRDA 4POKA 3HVXA 4KCAA 1V9WA 3VI5A 2WB9A 3LWAA 3L78A 5D9VA 3KH7A 4D73A 2MMOA 3NZNA 1PMTA 3WT2A 3FR3A 4JZQA 1S3DA 3F3RA 3TJFA 3TRPA 3CXGA 1DBYA 4YH2A 1A2MA 1DSBA 1XW5A 3F9UA 1EV4A 3IXRA 1S3CA 3ZZXA 1WWJA 1Z3EA 1EZKA 1SKWB 1BQ7A 1I9DA 3HZ4A 3IR4A 3TDGA 3MNGA 22GSA 2VAFA 4F9ZA 1MD3A 3IBHA 1AIUA 4TVEA 4EO3A 2G2QA 5IO0A 1YDKA 1UC7A 1A0RP 4ZB9A 3H1NA 4ZB8A 3R2QA 1PKWA 2WCIA 1ZGNA 5IOWA 1YY7A 2HNLA 1LJRA 2FLSA 5JWQB 3MSZA 5EY6A 4HS1A 1GWCA 1SKRB 3GA4A 3ZTLA 1Z6NA 3UBLA 1EEMA 3UOMA 14GSA 2L4CA 1M0UA 5DALB 2QSIA 3VWVA 5J3RA 5JCWA 3IOSA 6GSXA 5CREA 5G30A 4Q5FA 1VF4A 3EU4A 5IQYA 2YANA 1T4YA 1B4QA 2KHPA 1TRUA 3N5OA 1V40A 1U3IA 3P8WA 2AUVA 2OKAA 4YQVA 1R4WA 5B8BA 2BMXA 2MMNA 3P2AA 3IAM2 2YWNA 4BWSA 5GSTA 2YZHA 1QFNA 5CRWA 5D9WA 5KN3A 3QAVA 1JZWA 1N8JA 3N9JA 1X9SB 4RUVA 3QAGA 1SYXA 2L5LA 3FZ5A 2Z9SA 1V57A 2GS3A 4Q5NA 3GH9A 1MDIA 3H4KA 3F4RA 1NM3A 1IYIA 4ZBDA 1E2YA 2E2GA 2KUCA 2VCWA 1HNAA 5ECHB 4JBBA 1QUWA 4KH7A 4PURA 4BWQA 2YOIA 6GSWA 2VL2C 3C7MA 1NSWA 4KAEA 1YKCA 5ECLB 3J7Yk 2C0FA 1TI1A 2H8LA 4MPGA 3P90A 4V1Ap 5DALA 5IMZA 5LCZA 5INYA 3GL5A 1X5CA 3IK9A 3ZFLA 2HZFA 4AJ7A 1M99A 5KEJA 3FRCA 2H70A 4V2LA 3FY7A 3IDVA 4JR6A 2A4VA 3IA1A 4MK3A 3I6AA 2CVBA 3DGQA 2LV3A 5C04A 3LORA 5J4UA 3C1SA 1SD8A 3GL3A 3G7YA 1ERWA 4ID0A 4MA9A 1EOHA 4EXJA 1AAZA 3GN3A 3GURA 4WR4A 3ZREA 1XVWA 4GWRA 4PUAA 3ZIVA 5B6MA 4K7OA 4MF5A 1R7HA 1HNBA 5J9CA 3ZFBA 5LNKe 1LU4A 2HE3A 1OC3A 4HU7A 1J08A 1A23A 3H79A 3TUEA 4F2IA 1TI3A 1PD21 3WGDA 3C1RA 4E8EA 2OBKA 2GQLA 2B3SA 3I43A 4I8BA 3ZMLA 2NBSA 1XOBA 4AJ8A 1W4VA 4G2EA 2KP1A 3HVSA 1AQWA 3IAS2 2CV4A 5HFKA 4TXOA 4ISDA 1PGTA 4PXOA 2HRFA 1K0DA 3BD2A 5L71A 1NW2A 5LD0A 4PNFA 4OO4A 2CZ3A 3H93A 1YZXA 4GTUA 3APSA 1G0TA 2M80A 1RW1A 4PQ1A 2YN1A 1CQHA 1U88A 1QXHA 2I9HA 2LSTA 6GSTA 4TR0A 5CRDA 2PPTA 2R6KA 1O8XA 4EF0A 1VRSD 3DVWA 1W89A 2R5GA 1XXUA 4IW9A 4LL1B 4WF4A 6GSYA 1GSSA 4TR4A 3BOAA 4WR5A 1RK4A 5KN2A 1T7PB 3Q74A 1ZL9A 2H71A 2VLUA 1FVJA 4L5LA 1XVQA 1Z9HA 1TU8A 4NHZA 1MDJA 2DIZA 2GLRA 2IMKA 3TKSA 3G7JA 3PGTA 2YWMA 2H0GA 4HJ2A 2H6YA 4IJ3A 3UEMA 1B4PA 1WP0A 2JADA 12GSA 2AJQB 1HD2A 2CAIA 16GSA 3FR6A 2DJ2A 5G5EA 4QL7A 1XW6A 2F8AA 1TTZA 1H75A 2HYXA 3LEFA 1BG5A 3F0IA 1XOAA 3US3A 1DUGA 2JACA 2C3QA 2IWTA 1YEPA 4XS6A 4YQUA 3ERFA 3DIEA 4GCIA 2FWGA 3HKRA 4HUAA 1OE7A 4HQSA 1K3LA 2H72A 2YWOA 2OA7A 1V2AA 3FKFA 3QMXA 2YPMA 1KTEA 1AQXA 2DJ0A 5F05A 1AW9A 4HDEA 1WPIA 3TJKA 2HSHA 2L59A 1TU7A 3EMXA 5ABRA 2VCQA 1VF2A 4MP4A 5G5FA 1AC1A 3QOUA 1JZOA 1OKTA 1G6WA 2CAQA 1GRXA 4KDUA 1G7OA 3BBYA 3MWHA 2F3MA 5H5SA 1XW9A 3VK9A 4V1Ag 4WETA 1TW9A 4YAVA 2RIIA 4Q5QA 2IL3A 3ZL5A 3AY8A 1FB0A 4OWYA 3OR5A 2O85A 5IMAA 2O89A 2N5FA 3DKSA 1TXXA 1MDKA 2HZEA 4GQFA 2L6DA 4EDYA 1GSEA 4ACSA 1SJ6A 2VCVA 4NXIA 3ME7A 3L9UA 3KMOA 5G2ZA 2AYTA 4XTSA 3L9SA 1Z6MA 2FA8A 3KEBA 4ECIA 4XS1A 3GUSA 1GL8A 13GSA 1U6TA 3TB2A 1MEKA 4TN8A 2PVQA 2FWEA 4N11A 2V6KA 1OC9B 4LLRA 3MAKA 4NWYA 1AUCA 5B7CA 3LJRA 1GUHA 3GRXA 4KSOA 2O8VB 2MBSA 5DJMA 4GF0A 1WE0A 2GVPA 2LRCA 1Y25A 1G7EA 3ZMKA 2OE3A 2DBCA 4OMVA 2C0GA 2K6VA 1JLWA 5A4WA 2LQOA 3TKQA 2RM5A 3TKSC 1DE1A 3ZLPA 1SJZA 1EWXA 2CA8A 3FYGA 2PU9C 3HYPA 3TKSE 5B8AA 3P7XA 1Q4JA 3LYKA 1OC8A 18GSA 2OBIA 4ZBBA 3PR8A 2GGTA 3KTBA 2H30A 3UVTA 3Q19A 2DJKA 3G9BA 2V41A 3SWLA 4H86A 5E4WA 1MTCA 4G10A 2GQMA 3EU3A 5ECMB 3EINA 4LL4B 1XWKA 4FYBA 1TDIA 2B7JA 3GX8A 4XRAA 3KXOA 4IELA 4EUYA 5IMDA 3GKNA 5C00A 1T3BA 1ERTA 3WYWA 3TRQA 2IIYA 3IHQA 2JSZA 4O92A 4WF5A 1GTAA 1OC9A 3TGZA 2H75A 2WGRA 2H76A 4I97A 4RI6A 4TR1B 3FZAA 3O6TA 4IS0A 2VD0A 1T4ZA 2VCZA 3ZYWA 1BX9A 4WBJA 1K3YA 3HVVA 3KZQA 1VF3A 1A0FA 3HJPA 2HFDA 3GH6A 1JLVA 5HFGA 5JCUA 4F0CA 2WDUA 1ACVA 2C0DA 1TK5B 3D4TA 1XIYA 2YNXA 3LQ7A 3ZIJA 1SL2B 2F9SA 1TOFA 2FUG2 2PBJA 3QFAC 5JWOB 3UVHA 4DSRA 2R3XA 3QD9A 4IVFA 3CSHA 5IM9A 3TJGA 4L0UA 1SK1A 4GSSA 2IN3A 2I4AA 3DWVA 1XPVA 4L5OA 4OFNA 2DC5A 4L8EA 4NV2A 1EP7A 2DJJA 3FEUA 4KA0A 2GZZA 4OD7A 4MF6A 3QDNA 2AHEA 3LXTA 6GSVA 1MD4A 3DRNA 2H1GA 3QFBC 1OVNA 2J9HA 4GXZA 1XZOA 2C3TA 1GLPA 4ECCA 1BEDA 4TR1A 2D2ZA 4BPYA 1SYRA 2MZCA 1Z5YE 1R5AA 1YQ1A 2R2JA 2XPEA 4K7IA 3W8JA 2VL9A 4TXOB 2FNOA 1XBSA 4ZBAA 1XWCA 3WT1A 1EOGA 3RBTA 4P3YB 5ECOB 1KEBA 3D21A 2YV9A 5CRHA 4MCUA 3UL3A 2EIOA 2M72A 5DVBA 1SJIA 1CQGA 1O85A 4QL9A 2IJYA 2P0GA 4F82A 5ENUA 1B9XC 1UVZA 2B7KA 3CBUA 3ME8A 3A3TA 1TRSA 4OFTA 1WJKA 17GSA 2OADA 5HFIA 2V2GA 4X1UA 4PGTA 4J56E 1GTIA 4J2FA 3UAPA 4LMWA 4F03A 4G9HA 5IMVA 4YQMA 5KN1A 3BCIA 2HRNA 2VLVA 3ED3A 3FK8A 2CZ2A 2VM2A 2RLIA 4I2TA 5DQYA 1SK0A 1PL2A 4MJBA 1WOUA 5AGYA 1USBA 2R4VA 4IBPA 1A2LA 2YP6A 2TIRA 3FW2A 4KX4A 3ERGA 3PH9A 2X8GA 3W8SA 2PVOC 5HR1A 1XWAA 5FT3A 1URMA 2YV7A 2K18A 1ML6A 4GRFA 4K8MA 5GSSA 1T00A 2H73A 5AISA 5A4VA 1GSQA 1FG4A 3QPMA 2LRNA 1GSFA 2LTKA 5IPHA 1ILOA 2CVDA 3TJBA 10GSA 1EP8A 1V98A 3BJ5A 2LNTA 5CRGA 2H0IA 4K1FA 2VCXA 2PGTA 2YJ7A 3FR9A 4OCEA 4MZWA 6GSSA 2BJXA 2XBQA 3F4SA 2X8CA 4PQIA 5A5KA 2VL3A 1K0OA 4Q5RA 3M1GA 5DQSA 2MBTA 4BVXA 4OCFA 1PL1A 3Q6OA 3VLNA 3ERWA 3DYRA 4N0ZA 5DJLA 2CT6A 2C1YA 3GNJA 3LG6A 3WGXA 1PA3A 2PN8A 1GUMA 4J57E 2KOKA 5G1LA 3HY2A 5ECIB 4WKWA 3M8NA 4O32A 2EIRA 4CDOA 2IMEA 2NPBA 2O87A 2XHFA 4BVYA 1B48A 4OFMA 5AIVA 3CTGA 4K6XA 2MMZA 3E3EA 3GX0A 4PX1A 1Y6EA 2L5OA 1M7TA 3FHKA 1T8EB 2ON5A 2WJUA 4XHMA 4ZXGA 1ST9A 2HZEB 4FIWA 3WD6A 3LFLA 2EC4A 2VOCA 1HYUA 1ZMAA 4LMVA 1ERVA 2DMMA 3F3QA 1SD9A 1YKAA 1B9YC 3KCMA 4MH3A 4I2UA 3KIJA 3CSIA 1E6BA 5IOXA 2F51A 1GTUA 2FGXA 2N5BA 1VGLA 1J9BA 4PNGA 3CYNA 4N10A 3D0ZA 3HZ8A 1F3AA 4HZ2A 3VI7A 4YAPA 1M2BA 6GSUA 2GQKA 4ULXA 2QKEA 4JRRA 4GSNA 5B6NA 1SKSB 1PSQA 1M2AA 3DEXA 3A5WA 2NVLA 2QGVA 5ID2B 2ON7A 3TOUA 4TR3A 2GT5A 2X64A 3EC3A 2WS2A 2CQ9A 3UBKA 5D8IA 2L57A 1F2EA 2JL4A 3KD0A 1NHYA 1OE8A 4KGIA 2J23A 4PUFC 3VPQA 1U87A 2BTOT 2A2RA 3O3TA 1QGVA 4JR4A 4RQXA 4EE0A 5DDLA 3UARA 3KTLA 4ML6A 2HI7A 4IQAA 4K0NA 2VO4A 4MZCA 3ZVJA 3J7Yb 4KDXA 9GSSA 5G31A 1JFUA 1FOVA 2LS5A 3NIVA 2AAWA 5GAPD 3FZ4A 3VWWA 4GQCA 1RQMA 4ZIJA 1YEXA 5IPGA 2GZYA 5GZZB 1ON4A 3LGCA 2I3YA 5IO2A 4TOPA 1F3BA 4MPFA 1QMVA 3IC4A 2V6OA 2GSQA 4K7NA 1ABAA 1FO5A 5F0GA 2E0QA 2LRTA 2LKUA 3RPNA 3QAWA 4N30A 2H01A 3ISOA 1WRYA 2L4QA 5AN1A 2M46A 1KNGA 2CVKA 5ID2A 3MDKA 4MJEA 2TRXA 2JZTA 1JZDA 3TRXA 2IPAA 2K8VA 1GNWA 1UA5A 1F9MA 2V1MA 4JU5A 1UN2A 2MYGA 3EMPA 3EVIA 1FHEA 4IKHA 2LQQA 1S3AA 3DXBA 1XWGA 3F6FA 5IIZA 1O6JA 2ALBA 1TKDB 4EVMA 4MJAA 3DVXA 1PN9A 2NTOA 5J5NA 2X99A 1TRWA 2I81A 3HCZA 4DVCA 2JSYA 3KMNA 2GDRA 3KP9A 4KE3A 1ZOFA 2GSSA 1K0AA 1M9AA 3HDCA 4KCEA 4GSTA 3BCKA 20GSA 4WXTA 4Z7XA 3TCOA 2FA4A 1C72A 1PKZA 4FO5A 5FWGA 4MMMA 1SL1B 5F06A 3GKKA 2EIQA 4ILFA 3Q18A 1WMJA 2E7PA 4ZB6A 2F8FA 4ECBA 3HJOA 2I1UA 3UJ1A 2G0FA 3U6VA 1PX7A 4HEA2 2B1KA 1BYEA 1GUKA 2DIYA 7GSSA 1X9WB 1QQ2A 1NHOA 2H74A 1H4OA 1XFLA 2R37A 4I6XA 1M9BA 1BJXA 3APOA 3L4NA 3H8QA 4HOJA 4G19A 2B5EA 4X0XA 4WEYA 5G1KA 1EGRA 1X5DA 2WRTA 1GP1A 4TXVA 5DAKA 3F8UA 1ZYEA 2GSRA 2IMDA 4V2NA 1K0NA 5J41A 2AV4A 4HQZA 4AF2A 1SK2A 4TKYA 2IMFA 1O73A 2H0HA 3KJYA 3M0FA 5GAND 1IYHA 3O76A 2L6CA 2RM6A 4KW6A 2FY6A 4IP1A 2JZRA 2V32A 3GV1A 3IK7A 1HNCA 1O8WA 2DJ3A 2IMIA 4AJ6A 4ZL9A 3LYPA 2ZUPA 1TK0B 3CMIA 1K0CA 3LXZA 2FD3A 1FB6A 4MH2A 2H6ZA 4MZBA 2TRCP 2ZCTA 4CW9A 1N2AA 1A2JA 2K8SA 3KH9A 2O7KA 4E8HA 2LJRA 2VCTA 3RHCA 4F0BA 2H1BA 3TOTA 5ECPB 2CX4A 5CO3A 3RAZA 2K9FA 4ECJA 2HSYA 4XS4B 4NMUA 1ZCPA 4PQHA 3VWXA 3KM6A 2RUFA 2H6XA 4O5RA 2B5YA 1PQNA 4NV5A 3I9V2 3GKMA 1K0MA 3TJJA 1K0BA 1T1VA 1B8XA 5DCHA 2P31A 3ZITA 3CRUA 2PERA 4IQ1A 5EVOA 2OJLA 3DMLA 4IN0A 4LA1A 4NHWA 5CNWA 3FZ9A 5ECNB 3KGKA 2XBIA 1OAZA 1X0RA 3IPZA 1Z7RA 5JWRB 4MABA 5JCGA 5ECKB 5IMFA 5D73A 4KUNA 2REMA 3D6IA 4POMA 3APQA 3PINA 1THOA 1TRVA 1YJ6A 3A2WA 1GSDA 5D9XA 1GLQA 5H5QA 3GSTA 4DEJA 5CYYA 5ECQB 5A4UA 2C3NA 2C0EA 3UIWA 2QC7A 1AQVA 5ELGA 2E2MA 4BA7A 1FVKA 2XPDA 1PX6A 2H19A 2VM1A 3EE2A 4IHUA 3C71A 2DSAA 11GSA 4XCSA 4XS4A 4HI7A 2WZ9A 4IP6A 5F8BA 2DMLA 5E59A 4EDZA 1OYJA 4IGJA 4CHSA 2B6MA 1TJDA 1X5EA 2VD1A 4NPBA 3A2XA 2LEGA 3EWLA 4XRDA 4XIHA 2NDOA 4ZILA 2OE1A 4KB3A 1U3AA 1GH2A 3TKPA 3IRAA 3F4TA 4K2DA 2IFQB 1SL0B 1XWBA 1ERUA 3GHAA 5ECRB 5CP1A 3HD5A 3E9JB 2C80A 5KN0A 3CTFA 2P5RA 3D4MA 2WFCA 5D9TA 3M9KA 4POBA 1WIKA 3TKRA 1GNEA 3F6DA 4BL7A 1AXDA 4DSQA 4ZL7A 4N0VA 3KP8A 5HR2A 5HQPA 1JZRA 4L0WA 5D96A 2RUEA 4FH8A 2H1AA 2YCDA 4ZL8A 4KSMA 3GYKA 1O81A 2OE0A 3G7IA 4MDCA 1JHBA 1J0FA 2DLXA 3VPTA 2CX3A 3V1WA 2H1DA 1F6MC 3S9FA 4MF7A 4JEDA 2GSTA 2LNSA 2YWIA 3JCML 2B5XA 1YF1A 3HJMA 3LSZA 2DJ1A 3GMFA 3U5RE 4KNDA 4NAXA 2VLTA 3EURA 5H5RA 1TP9A 5ELAA 3UMAA 3GSSA 2P5QA 3VURA 5IMCA 4QQ7A 3IV4A 1M2DA 3W6GA 1GULA 3GTUB 2FWHA 2ES7A 2H66A 1O7UA 2WULA 4WBRD 1EEJA 3DD3A 4I5QA 3K8NA 2IFQA 4MJCA 1FAAA 4ML1A 1SU9A 3QCPA 5EPFA 5FHIA 3M3MA 2YJHA 5D93A 3L0HA 3M9JA 2FWFA 2JU5A 2VUPA 3GIXA 2C8UA 4EKZA 5HR0A 4POLA 4MLYA 2LJKA 2AB6A 3E0UA 3QR6A 1R5PA 1PRXA 1LBKA 2OACA 2JZSA 4FYUA 3L9VA 1Q98A 1A24A 1OKDA 4GLTA 4DSSB 5EL8A 4RQRA 1THXA 5AIXA 3VFIA 3HXSA 5DCGA 4KDYA 1ZZYA 4TRXA 4IJIA 3RHBA 3D5JA 4HJMA 1F37A 1G6YA 1QK8A 1KBNA 2HLSA 3RPPA 4AGSA 4OO5A 1HQOA 2FCHA 3GFKA 2X8HA 2GZPA 4EL1A 4O7HA 5F07A 2N5AA 1FW1A 2VIMA 5DBQA 1GSYA 1XCCA 2PUKC 4D73B 4HZ4A 3GTUA 4EC0A 1ZYQB 1EGOA 1GSUA 3C73A 2B1LA 1SENA 3HHVA 4K9ZA 4TW5A 4K0GA 1VF1A 3D22A 1DE2A 5HR3A 3VWUA 19GSA 1I5GA 5ECSA 1R26A 4RI7A 8GSSA 3I69A 1EV9A 5COHA 5J9BA 3SBCA 2KLXA 2GTUA 3CSJA 1Z7PA 3WGEA 2ZNMA 3IE3A 4HU9A 1A8LA 2VL2A 3CRTA 3RDWA 1X9MB 1BAYA 2XC2A 3F63A 5DAKB 4DSSA 2YZUA 1YF0A 3HA9A 2C4JA 4X43A 2HT9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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