4N0ZA

Crystal structure of cisplatin bound to a plasmodium falciparum glutaredoxin 1 (pfgrx1)
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
b'SEAVKKWVNKIIEENIIAVFAKTECPYCIKAISILKGYNLNSHMHVENIEKNPDMANIQAYLKELTGKSSVPRIFINKDVVGGCDDLVKENDEGKLKERLQKLGLVN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Interaction of Cisplatin with plasmodium falciparum Glutaredoxin 1
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin
source organism Plasmodium falciparum
molecule tags Oxidoreductase
total genus 37
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2013-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4n0zA00
5E4WA 1TI1A 3MWHA 1J0FA 3EWLA 3DD3A 4MH2A 1ML6A 4QL7A 2E2MA 4WF4A 4V2NA 2R5GA 3I6AA 1R5AA 2Z9SA 3K8NA 2GS3A 1NW2A 5DJLA 5CP1A 2H1DA 2VCQA 5G1KA 1EV9A 1M7TA 1Q98A 2VCVA 3CTFA 4MJCA 1MEKA 3TJGA 2CX3A 3FW2A 3VWVA 2L57A 3F4TA 3I43A 2PVQA 3M8NA 1B4PA 4EF0A 2VL2A 3UBKA 1Z7RA 4ZL9A 3NZNA 4JBBA 5ECQB 4EL1A 2XPDA 1ZYQB 1SU9A 1XBSA 2OBIA 3GKNA 1KTEA 5IOWA 4K6XA 2C8UA 5G5FA 2FA8A 1F9MA 3HDCA 1YF0A 3VK9A 2HRNA 4TR1A 4GF0A 3ME8A 3KXOA 2NTOA 4MZWA 5ECLB 5DAKA 1XWCA 3F8UA 3BOAA 1AQWA 3KJYA 4N30A 4O7HA 4K7NA 2X8CA 1HNCA 1OC3A 5DBQA 3CTGA 4LMVA 2REMA 3QMXA 2LSTA 5H5SA 2FWGA 2V1MA 5GZZB 4JRRA 5AGYA 4DVCA 1O73A 4Q5RA 1TOFA 1VF3A 5AIVA 3P90A 4AJ6A 2H1GA 3D6IA 2DBCA 1ZGNA 1SENA 3ERGA 1WOUA 1FW1A 1T00A 1T3BA 1G7OA 2L4CA 1GSEA 1PGTA 1Z9HA 3VI5A 1SKRB 2V2GA 3F63A 2LRTA 4WBJA 4K0GA 11GSA 1EGRA 3R2QA 2WULA 3LORA 4HQSA 4ZB9A 2KOKA 3P2AA 4WBRD 3HZ4A 4ZIJA 1GUHA 2YWMA 4XS6A 2CZ3A 2OACA 4MP4A 3G9BA 2VCXA 5DQSA 3TKSA 4QL9A 4OFNA 1MD3A 2B1LA 1GH2A 2C0FA 5KEJA 2LEGA 4RI7A 4NWYA 1ERTA 2C0GA 3DGQA 2DJ0A 1EZKA 1WE0A 1F2EA 4OMVA 3FZAA 5IOXA 1GLQA 4EVMA 2LRCA 3HVVA 4LA1A 2XBIA 2VO4A 3NOFA 3GX0A 4BVYA 4MMMA 4MZBA 2HRFA 3WT2A 4KAEA 2GQLA 3RHBA 2IIYA 4EKZA 1X5CA 1VF4A 3LSZA 2O7KA 1S3AA 4NHZA 2C0DA 2LQOA 4LLRA 3GKMA 2DJJA 2MMZA 2YCDA 1BQ7A 3LYKA 4K1FA 3ZFLA 3APSA 2G0FA 3GX8A 1URMA 2IMDA 4L8EA 3UAPA 2WS2A 10GSA 2B6MA 3KH7A 3D4TA 2J9HA 3KMNA 2GT5A 3BJ5A 3GKXA 3F4RA 4TXOA 2FCHA 1NSWA 2GSRA 2MYGA 2LKUA 2ES7A 2QGVA 4JR4A 3UARA 1XVQA 2VLVA 4KNDA 1F6MC 5A4WA 1PRXA 4ACSA 1XOBA 2N5AA 1M2AA 5IM9A 4HI7A 3HVSA 4V1Ap 4MJBA 4IN0A 2HI7A 4P3YB 3TDGA 1GSDA 3ZIJA 3ZZXA 1SKWB 2DMLA 1K0OA 1DE1A 2PVOC 5ELAA 3LWAA 2M46A 4BWSA 4RUVA 3MNGA 1MTCA 3GIXA 1K0MA 1BYEA 1MDJA 1G0TA 4AJ7A 1HD2A 1I9DA 4Q5QA 1EOHA 3QR6A 3TUEA 2HZFA 3FZ4A 1SKSB 2M80A 4F9ZA 5HR1A 2CAQA 2H1AA 2VD1A 2VD0A 4ML6A 1DSBA 1USBA 2OE3A 1V58A 1XW9A 1G7EA 1SJ6A 3P7XA 3TCOA 1ZL9A 2XC2A 5IO0A 3KH9A 5HR0A 5FWGA 1JZWA 3DXBA 3EU4A 1K0DA 4IHUA 2C0EA 4D73B 5G1LA 3EC3A 4AGSA 5IMFA 2VL9A 3D22A 1K3OA 2QKEA 2IFQB 1PKZA 3F3QA 4X1UA 3PINA 3FKFA 1YQ1A 2HSYA 1GRXA 1V98A 2OADA 2A2RA 3KZQA 4K7OA 4POBA 2WB9A 2RUFA 1U6TA 4ECCA 2K9FA 2CAIA 3LJRA 1B8XA 2HLSA 2HXKA 1QUWA 4PQIA 19GSA 2AAWA 3ZMLA 5DCGA 4LMWA 4WETA 1O8XA 5HFKA 5ECKB 4IELA 2H19A 4MDCA 3L78A 4CW9A 2OE0A 3DEXA 5ECHB 2LJRA 2EIQA 1ZCPA 20GSA 2N5BA 1U3AA 2PERA 2VUPA 2PN8A 3LYPA 4K7IA 3GH6A 1KBNA 5ENUA 1XW5A 4HOJA 2H0IA 1Y6EA 1PMTA 4ML1A 1V57A 4KCEA 2VLUA 5B7CA 3G7IA 1M9BA 2L4QA 1HNBA 3KMOA 2JZTA 5G30A 4RI6A 1JZOA 5G31A 1WP0A 5IQYA 1M99A 1WWJA 5D8IA 3BCIA 4IGJA 4ECIA 4H86A 3HKRA 3ZTLA 3CSJA 1HYUA 1XPVA 4ZBDA 3KD0A 1GSYA 1YEPA 1NM3A 2TIRA 5LCZA 4ZILA 5J3RA 1FOVA 4E8HA 7GSSA 2PPTA 5ECOB 5DCHA 5CREA 3QAWA 4GWRA 4MA9A 4YQVA 3VWUA 1A2LA 1UN2A 4ZBAA 3LXTA 4HZ4A 2H0HA 5F8BA 1TRVA 1I5GA 4TW5A 2HNLA 4RQRA 1TI3A 2WGRA 2YANA 4KDYA 2IJYA 1LJRA 1FVJA 4YQUA 3DWVA 3LEFA 3TKPA 3KTLA 3IA1A 3CBUA 3PR8A 3PH9A 2WZ9A 3NIVA 3E9JB 4GTUA 4D73A 4MZCA 1GSUA 4ZB8A 3QAVA 4I5QA 1Z7PA 2F51A 5IMDA 1B9YC 3A2WA 2IFQA 5AIXA 1B9XC 3TOTA 3M9JA 4K2DA 2HE3A 2IMKA 1SJIA 16GSA 1EWXA 3KEBA 3LQ7A 1R7HA 2PU9C 3IK9A 1OKDA 1FB0A 1GLPA 1W4VA 3C1RA 4PGTA 4HU9A 4BPYA 5F05A 4OCFA 1BAYA 1GUKA 5G5EA 1K0CA 4IS0A 2HZEB 3QD9A 1OVNA 5C00A 2AUVA 3KIJA 3EVIA 2I1UA 4BA7A 5EL8A 1OYJA 2MMOA 5ECRB 3CSHA 4BL7A 3Q19A 3WGDA 2H1BA 1OE8A 2YWOA 3IC4A 1ERWA 5B8BA 1EGOA 3W6GA 3APOA 4N0VA 1UC7A 4NMUA 4BVXA 3DVWA 4X43A 2IWTA 1SJZA 5ID2B 2VAFA 5LD0A 9GSSA 1RW1A 4DSSB 3TRQA 5D9VA 4I8BA 6GSYA 5HFIA 4IQ1A 4FYUA 1JFUA 1S3CA 2RM6A 3P8WA 2DLXA 3U5RE 1VF2A 3I69A 2QC7A 3FK8A 3IHQA 2B5YA 2GDRA 4GQCA 1PQNA 1E6BA 5G2ZA 1IYHA 3EINA 5A4VA 2LJKA 1K0AA 3M9KA 3LFLA 5IMAA 2TRCP 5J9CA 1TU8A 1XOAA 4TXVA 4F82A 3H8QA 2NBSA 5IMZA 3EMXA 5DALB 2EC4A 4I2UA 2PWJA 3V1WA 3JCML 5LNKe 3EU3A 2AV4A 2OBKA 1BG5A 2L5LA 2E2GA 1AQXA 2J23A 2JZRA 1PKWA 1DBYA 1T1VA 3CRTA 4MF7A 3CSIA 3FR9A 3FRCA 2F8AA 3TKSE 2GZZA 2QSIA 3FR3A 4ECBA 4V1Ag 4ISDA 3A3TA 3GUSA 3S9FA 2FWHA 1PSQA 4HU7A 3FR6A 6GSUA 4PXOA 6GSTA 2R37A 4KCAA 4HZ2A 1T4ZA 3TRPA 5KN3A 4KDUA 5FHIA 5IMCA 3O6TA 4L5LA 2HZEA 4GQFA 2ZCTA 2K6VA 4IKHA 3VFIA 1JZDA 2CZ2A 2C3QA 4EC0A 4MH3A 2LNSA 4HQZA 4POKA 1FB6A 2L6CA 2AYTA 2FY6A 1TDIA 1TRSA 2IPAA 4HS1A 3GURA 3TOUA 4FIWA 1TRUA 3ISOA 1QGVA 4KE3A 5ID2A 4XS1A 1QMVA 4FYBA 2FHEA 4DSSA 5GSTA 1WJKA 4F0CA 1GTAA 1U88A 1XXUA 2L59A 2MBSA 1TJDA 5C04A 4ID0A 18GSA 1XWGA 1NHYA 4MABA 3ZL5A 4V2LA 2EIRA 2DJ1A 5ECPB 4F2IA 4YAVA 3ZITA 5AISA 1TP9A 2YZUA 1GSFA 2F3MA 5IPHA 1ZOFA 4TR4A 2EIOA 5GAND 5H5QA 3HZ8A 4PUFC 3D0ZA 2H72A 5DALA 1ERVA 3DVXA 4EUYA 1VGLA 2LRNA 2CX4A 1FAAA 5IMVA 3L9SA 2DJKA 3TJJA 4KW6A 4WR5A 3QFAC 5JWRB 3ERFA 1TRWA 2X64A 4J2FA 2VM1A 1SL1B 1BEDA 3HJPA 4ZL8A 5HQPA 3TRXA 4L5OA 1AIUA 1GULA 5F07A 3UIWA 3C8EA 3F3RA 13GSA 4MPFA 2I4AA 5DDLA 1WIKA 4EXJA 6GSSA 1WRYA 4YH2A 1MDIA 4ZXGA 1FO5A 3E3EA 2R6KA 4DSRA 3IDVA 4G19A 5D96A 2O87A 4MK3A 1XVWA 1DUGA 2B5EA 1EP8A 4NHWA 3F6FA 1K3LA 4WF5A 2IMFA 1CQHA 4IVFA 1EOGA 3TJBA 2C3NA 1OAZA 2HFDA 2BMXA 3RPNA 4FYCA 1WPIA 3ZIVA 1Z6NA 2DJ3A 4OD7A 3QDNA 1Q4JA 2JSZA 2RIIA 3G7JA 1PX6A 3VPQA 3A2XA 4PQHA 2L6DA 4G2EA 3TB2A 2XHFA 4WXTA 2H6ZA 3LXZA 1F3BA 1X9WB 1YKAA 4I97A 2YJ7A 2XPEA 1ZMAA 2V6OA 5EY6A 2H6XA 2FWFA 4RQXA 4IP1A 1ST9A 4FO5A 4PX1A 2DIYA 3KM6A 4KSMA 3IBHA 5DQYA 2M72A 4NXIA 4ECJA 1ZYEA 2VL3A 2H8LA 1MD4A 2HYXA 1X9SB 1K0BA 4HDEA 5JWOB 3D4MA 4TOPA 5GAPD 1AXDA 1XCCA 4WEYA 2CV4A 3LG6A 3N9JA 4AJ8A 3GSTA 2LJAA 1JHBA 3DYRA 4AF2A 2JU5A 2H76A 1GSQA 2WRTA 3FYGA 5D9WA 5CNWA 1K0NA 5A4UA 2B1KA 1A2MA 2PMTA 5IO2A 1V9WA 1YEXA 3OR5A 2PGTA 3KGKA 2H30A 5AN1A 3HHVA 1G6YA 4EDYA 2YWNA 4PNFA 5EPFA 2MMAA 4GCIA 4PQ1A 1N2AA 2K8SA 1T8EB 3UMAA 2YOIA 1THOA 3GL3A 1OC9B 1GWCA 4DSQA 3F4SA 2VLTA 1O81A 3GH9A 3F6DA 2KHPA 4F0BA 4N11A 2MBTA 2OA7A 2P31A 2P5RA 2NVLA 3FZ9A 1GNEA 3EURA 4O92A 1HNAA 1U3IA 4KUNA 3BCKA 3F0IA 1A0RP 3IOSA 1M2DA 3WGEA 2P0GA 3IPZA 2YWIA 3DKSA 5D73A 1ZZYA 1FG4A 4MCUA 4IW9A 2I81A 3MDKA 1M9AA 2PBJA 4CHSA 5ECNB 5D93A 2YJHA 4NV5A 4NV2A 2L5OA 4TR0A 3IXRA 2GTUA 3CRUA 4PNGA 5CRGA 3ZREA 1TK8B 2ALBA 2GSTA 4O32A 4N10A 4OO4A 1SL2B 1QFNA 1LU4A 2CA8A 3GN3A 4JE1A 1GUMA 1Z5YE 1V2AA 3VWXA 2WJUA 2MMNA 1UVZA 3PGTA 4HJMA 4XRAA 2O8VB 3D21A 4MF6A 2KLXA 3KCMA 3CXGA 5GSSA 4O5RA 4JR6A 1UA5A 3MAKA 3ZFBA 2V32A 4IBPA 4IQAA 4CDOA 3ZYWA 3I9V2 3QOUA 5ABRA 3C7MA 3UVHA 3L4NA 1SK0A 1X0RA 3HY2A 5F06A 2GSSA 2P5QA 3C71A 3IAM2 1XZOA 4YAPA 3IK7A 3HD5A 2WDUA 1AAZA 2YNXA 2FGXA 2IMEA 1O6JA 1SYRA 2ON5A 3KTBA 4ULXA 2H74A 3C1SA 2JADA 5JCGA 1QXHA 5DVBA 1GTUA 3J7Yb 1OC9A 2VM2A 1DE2A 4E8EA 4I6XA 3J7Yk 3ZVJA 2CT6A 5A5KA 1X5DA 3QPMA 2GT6A 1VRSD 4K9ZA 3VPTA 2GQKA 3FHKA 1TK5B 4IP6A 1GP1A 2IMIA 4G9HA 3G7YA 4GSTA 1EP7A 3IR4A 3N5OA 3L9VA 4HUAA 3HXSA 3GTUB 1X9MB 4OCEA 3HVXA 8GSSA 3H4KA 1RK4A 2I3YA 5H5RA 1ON4A 2E0QA 5ECMB 17GSA 3M1GA 3US3A 1TTZA 1SK2A 2RUEA 2HT9A 3GHAA 3FZ5A 2DMMA 1RQMA 2GVPA 4KX4A 4Z7XA 5COHA 5JCWA 1ILOA 1SL0B 2YV9A 4KSOA 4TR3A 4JEDA 3BBYA 1TW9A 1M2BA 3ZVJD 4MLYA 4PURA 3ERWA 4KB3A 12GSA 4G10A 4TVEA 2WCIA 2PUKC 1O7UA 3U6VA 1F37A 2BJXA 3IE3A 3W8SA 5D9TA 4JZQA 2KP2A 4TN8A 5IPGA 2G2QA 3WT1A 1R4WA 3UL3A 4HEA2 1EV4A 3GKKA 3FEUA 5EVOA 1ABAA 4EE0A 3IV4A 1OKTA 5B6MA 4XRDA 4ZL7A 1SD9A 5J5NA 3LGCA 1CQGA 5DJMA 1TU7A 1YZXA 14GSA 3WD6A 5HR3A 3CMIA 2OE1A 3GYKA 3RHCA 1GTBA 4J56E 4OFTA 4TKYA 4J57E 5KN2A 4TXOB 3UBLA 2YP6A 6GSVA 4K0NA 2B5XA 4NPBA 1GTIA 1W89A 4XIHA 3EYTA 3EE2A 1G6WA 1XWBA 2A4VA 3D5JA 2K8VA 1AC1A 5CAXA 4BWQA 2H01A 1A8YA 2VCWA 2C3TA 4OO5A 2DC5A 5INYA 1S3DA 3DRNA 3L0HA 4WR4A 2B7JA 1BX9A 1IYIA 1U87A 2WFCA 1E2YA 2K18A 2YN1A 3C73A 1GNWA 1OE7A 4ZB6A 1R5PA 5CRDA 1B4QA 3GTUA 3UOMA 4ZBBA 2N5FA 1XFLA 1NHOA 1YF1A 3SBCA 1AW9A 1J08A 1Z3EA 2FUG2 2C80A 2XBQA 1SK1A 1GL8A 1KEBA 3ZLPA 1TKDB 5HFGA 2I9HA 2F9SA 1T4YA 3KP8A 3GRXA 4XS4B 2LS5A 2ON7A 1MDKA 1A24A 4XTSA 1C72A 3QCPA 1AQVA 1SD8A 2IL3A 3RDWA 1YY7A 2VL2C 2R4VA 4EO3A 2FD3A 4EDZA 2JACA 1A2JA 2HSHA 3ZRDA 4OWYA 4MF5A 1J9BA 5E59A 2A2SA 2B3SA 1YKCA 3ED3A 4FH8A 3WYWA 1JZRA 3HA9A 3HJOA 1A0FA 4KDXA 1EEJA 1JLWA 3M0FA 5J4UA 3BD2A 3HJMA 4IJ3A 5CO3A 4WKWA 2FWEA 2H0GA 3IRAA 4NAXA 4DEJA 4MPGA 2V41A 1QK8A 1PL1A 1GSSA 2C4JA 2CVBA 4Q5NA 1HQOA 4YQMA 4GXZA 4IJIA 1VF1A 2NDOA 3TKQA 1O8WA 4L0WA 2F8FA 3E0UA 1M0UA 2AB6A 5J9BA 1THXA 2LQQA 2H71A 3H79A 2DJ2A 2GZPA 3WGXA 2CVDA 2H6YA 5ECIB 5JWQB 1T7PB 4KH7A 1AUCA 3VWWA 2IN3A 3O76A 2OJLA 2GQMA 5ELGA 2AJQB 4GSNA 2O89A 4POLA 2R2JA 2X8GA 1FVKA 4V2MA 1YJ6A 5D9XA 5KN0A 4K8MA 3TJFA 3CYNA 1JLVA 2DSAA 1TXXA 2GSQA 2JSYA 4XS4A 3GL5A 3TKSC 1A8LA 3TKRA 1OC8A 4MJAA 3VI7A 4KGIA 1WMJA 4XCSA 2E7PA 1Y25A 3M3MA 6GSWA 3GSSA 1FHEA 3L9UA 4PUAA 4XHMA 3DMLA 2OKAA 1KNGA 1PX7A 3QAGA 1ACVA 4MJEA 5B8AA 2FLSA 2H70A 4OFMA 3O3TA 2H75A 2CQ9A 3Q6OA 3GV1A 2MZCA 3AY8A 2LNTA 3UJ1A 1EEMA 2X99A 2DIZA 3Q18A 1R26A 5JCUA 2KP1A 5B6NA 2D2ZA 4KA0A 3APQA 5CRHA 1H4OA 2H66A 4L0UA 2GLRA 1LBKA 1BJXA 2RLIA 1XIYA 4QQ7A 1V40A 4GRFA 3GA4A 2R3XA 3H1NA 2VOCA 4X0XA 3EMPA 4JU5A 2LUSA 3TGZA 2TRXA 2GGTA 4Q5FA 22GSA 3ZMKA 3UEMA 2YV7A 5L71A 1XW6A 5IIZA 2C1YA 3HCZA 3VLNA 1XWAA 5F0GA 2ZUPA 2VIMA 2CVKA 2LV3A 4HJ2A 3Q74A 3DIEA 2AHEA 3ME7A 1Z6MA 1F3AA 2B7KA 4POMA 1PA3A 5CRWA 4F03A 6GSXA 2LTKA 5ECSA 1YDKA 4LL1B 3RPPA 4TR1B 1X5EA 3KP9A 3F9UA 3FY7A 1K3YA 2NPBA 4LL4B 1B48A 1ERUA 1N8JA 2X8HA 1A23A 4I2TA 3UVTA 5DAKB 2GZYA 2JZSA 3RAZA 5J41A 3MSZA 2V6KA 3H93A 1SYXA 3HYPA 5HR2A 1PN9A 1PL2A 3VURA 2VCTA 4ILFA 3SWLA 1QQ2A 3IAS2 2ZNMA 1TK0B 2O85A 1PD21 2FA4A 3QFBC 1O85A 2YZHA 2H73A 3A5WA 5FT3A 2BTOT 4TRXA 5KN1A 3RBTA 3GMFA 4N0ZA 1H75A 3TJKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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