4N0ZA

Crystal structure of cisplatin bound to a plasmodium falciparum glutaredoxin 1 (pfgrx1)
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SEAVKKWVNKIIEENIIAVFAKTECPYCIKAISILKGYNLNSHMHVENIEKNPDMANIQAYLKELTGKSSVPRIFINKDVVGGCDDLVKENDEGKLKERLQKLGLVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Interaction of Cisplatin with plasmodium falciparum Glutaredoxin 1
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 37
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2013-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4n0zA00
2ALBA 2XC2A 3F6FA 4DSQA 3H79A 18GSA 2IFQA 1X5EA 3NOFA 1K0BA 3J7Yk 1TK5B 4ZL7A 5J5NA 1HNBA 3GV1A 4HQZA 1BYEA 1OC9A 4V2NA 4WETA 3ZMLA 3P7XA 1SKSB 1Z6NA 1Y6EA 2AUVA 2QKEA 2LV3A 5HFIA 1G7OA 2Z9SA 3UBKA 5GSSA 4PNGA 1UN2A 2R2JA 1SU9A 3DKSA 4RI6A 1K0DA 4NV5A 3CYNA 1QFNA 1V9WA 3IAM2 1JHBA 3PH9A 3F4SA 1B4PA 3C71A 1XWCA 1T00A 3IHQA 3HXSA 1GUKA 1OKDA 3ZVJA 2WULA 1EV9A 2QSIA 3BBYA 3IR4A 1Y25A 2PMTA 3L9UA 2CT6A 1M9AA 1SYXA 4MJEA 2YJHA 2DIYA 2DJ1A 2IMFA 1PX7A 1VF3A 3KTBA 5EPFA 4G9HA 4EUYA 3VWVA 2GLRA 1XFLA 3GTUA 1WP0A 2WRTA 2L6CA 1M2AA 3WD6A 3LGCA 1NM3A 1FW1A 1K3LA 5CREA 1GULA 3ZFBA 1K0MA 3L78A 1GP1A 4GSSA 1NHYA 3N9JA 1HYUA 4I6XA 1QMVA 1W89A 3C1RA 1TXXA 4TR1A 2I1UA 5AIVA 2QGVA 2I81A 2FWEA 4JU5A 1LBKA 4NWYA 2DJKA 2R4VA 2GZPA 2J9HA 4HI7A 2VD1A 4OCEA 5ECKB 5D93A 2VLUA 2HZFA 4PURA 4P3YB 1Q98A 2R5GA 1R4WA 2A2RA 3F4RA 4KH7A 2JZSA 3GHAA 3Q74A 4GQFA 4K9ZA 1DBYA 1M2DA 1J08A 3HY2A 1BQ7A 5B8BA 3EVIA 3TOTA 4FYBA 4ML1A 1OE8A 3IAS2 5H5SA 4OWYA 5CP1A 1ZCPA 2RM6A 4RQRA 1GTUA 1WOUA 5CNWA 2F8FA 3HKRA 4GCIA 5D96A 3D6IA 3KP9A 1V57A 3UVTA 4I8BA 1AQWA 2NTOA 4OO5A 2VL2A 5FT3A 4J2FA 3WGEA 2VM1A 3IXRA 4WR4A 1O85A 1ZYQB 1SJIA 4HU7A 3WT2A 1RQMA 3I69A 4MCUA 2C0GA 4FH8A 3PR8A 3TUEA 1XVQA 5J41A 2C0EA 4HS1A 4MZWA 2PERA 2GQLA 1U3AA 1TRSA 2FCHA 3IDVA 5JCGA 1WPIA 2DMMA 3TJKA 1YJ6A 2OE0A 5LD0A 4Q5FA 1TTZA 1A2JA 2M80A 2GSQA 3FZ9A 2O87A 2NVLA 2VL3A 3QAVA 3O76A 1GLPA 3FEUA 3Q18A 4K6XA 5COHA 1XPVA 2FNOA 1JLVA 3CTFA 1FVJA 4Q5NA 1F3BA 4ZB8A 3UBLA 5IMVA 2B7KA 2H74A 1LJRA 2HE3A 3CSIA 5ENUA 1YF1A 3NZNA 3DRNA 1XOAA 2X8CA 4K0NA 3ERWA 1WMJA 4OFMA 5EY6A 3F8UA 1XXUA 20GSA 2WFCA 5IO0A 2CV4A 2DJJA 3C73A 1I5GA 3HVXA 3HJPA 3ED3A 1SL0B 4JE1A 4HDEA 1PKZA 4BA7A 4HEA2 3BCKA 2ZNMA 2PN8A 4POLA 5J3RA 3U5RE 3MSZA 3G7IA 1B4QA 5DJLA 2K8VA 2LJKA 4IBPA 3GX0A 5LNKe 2D2ZA 1EGOA 1MDJA 2DC5A 2XPDA 2H19A 1GTAA 1G6YA 1T4ZA 4EVMA 2LUSA 3RHCA 1ABAA 4HOJA 5ECPB 1R26A 3LG6A 5LCZA 4JZQA 4I2UA 4MMMA 3UJ1A 1B48A 3OR5A 4GRFA 1TP9A 2GT6A 2FUG2 2C0DA 2EIQA 3I9V2 3HZ8A 4XRDA 2C80A 3EU3A 5KN3A 3VLNA 5IM9A 1FOVA 3GL5A 3GKKA 2V6KA 3S9FA 1Z7PA 5DJMA 5ECSA 3P90A 4V1Ap 2MBSA 1GLQA 2K8SA 3KD0A 1VF1A 1F37A 1ERTA 4POMA 4ZILA 4X43A 2LNSA 2GVPA 2HZEA 3VI7A 1FAAA 2DLXA 3FRCA 4YAPA 2IN3A 2IJYA 3J7Yb 3R2QA 6GSUA 4N0ZA 3HD5A 2IIYA 3ZRDA 4DVCA 1GRXA 4LL1B 2GDRA 3UAPA 3D4MA 1V58A 3RDWA 1A0FA 2DJ2A 2KLXA 1SK1A 5ID2A 3BCIA 3CRTA 1PA3A 1M0UA 1Q4JA 2M72A 4YQVA 1X0RA 2VCVA 3HZ4A 2H1AA 4OD7A 1EV4A 1Z7RA 2P5QA 4ZBAA 2H1DA 1SK0A 3EURA 2H1BA 1FHEA 1XBSA 3TJBA 2MMZA 2IPAA 4BVYA 4H86A 4EDZA 5JCUA 1BX9A 1ILOA 1SKRB 5DALB 2HXKA 4DSSA 3N5OA 5EL8A 1TU8A 2C1YA 1A2MA 5GAPD 6GSXA 5ECQB 2E0QA 5HR2A 1PSQA 3E9JB 4I5QA 1JZOA 3IBHA 2O7KA 2C0FA 4TXOA 1F6MC 3GRXA 3H1NA 4CW9A 2C3QA 2PBJA 1EEMA 5B7CA 1GSUA 2VL9A 4K7IA 2CVDA 1QQ2A 2DBCA 5HR0A 3DVXA 3HVSA 2P31A 1EP8A 1XWGA 4JEDA 4BPYA 2B3SA 3L4NA 2NPBA 2NDOA 2FLSA 2VM2A 1AXDA 5IMDA 1VF2A 5GAND 5FHIA 1QXHA 3D0ZA 3CSHA 3TKSA 3ZYWA 3HJMA 3TKPA 6GSSA 1S3AA 1M7TA 3IK7A 1ST9A 4ECJA 2L4CA 2VCQA 3GKMA 3BJ5A 3H4KA 1H75A 3VFIA 1SYRA 3AY8A 1MTCA 4MZCA 4MZBA 3IRAA 1G6WA 1ERVA 4EF0A 2AYTA 1WJKA 3IOSA 4KSMA 2H66A 3ZVJD 2VOCA 1AQVA 3F6DA 3KH9A 3M0FA 1TI1A 2C3TA 1O81A 1ACVA 1BJXA 1AIUA 4LLRA 2CX3A 3BD2A 1JFUA 4MP4A 3KMOA 4KB3A 2MMNA 3UEMA 1TRVA 3W8SA 5CO3A 2H76A 5IIZA 3Q19A 5J9CA 3G7JA 4YH2A 2GQMA 4QL9A 1GSQA 1UVZA 1TDIA 1YDKA 2K18A 4LMVA 3HCZA 1HNAA 3HYPA 3W6GA 2DJ0A 4NV2A 1ZMAA 3KXOA 4G2EA 3P8WA 4K7OA 5F07A 4KCEA 3ZLPA 3G9BA 2V41A 3VWXA 1CQHA 5A4WA 4O32A 2X99A 4ILFA 4ECBA 5AIXA 2BTOT 2LJRA 4XHMA 4WBRD 3A5WA 4MABA 1XCCA 1K0NA 1SK2A 3LFLA 3UIWA 1UC7A 1GWCA 4K0GA 3E0UA 5ECHB 4GTUA 1SL2B 5G31A 3F63A 3VURA 5IQYA 2LQQA 5A4VA 2CVBA 5B8AA 3L0HA 2YP6A 3US3A 1YQ1A 4IJ3A 1KEBA 2ON5A 3M3MA 2AAWA 4NMUA 5ECIB 3TRPA 1N2AA 4MJBA 6GSTA 1XOBA 3QFBC 3QR6A 3ISOA 1T8EB 2HYXA 2CZ3A 3QMXA 3FZ5A 5IMZA 4L0WA 2YZUA 3VPTA 2WZ9A 4O5RA 1J9BA 1U88A 3EWLA 2WCIA 4TR3A 4MDCA 2YV7A 1ZGNA 1T3BA 4IQAA 5HQPA 1U6TA 1TI3A 5ELGA 2FWFA 1ZZYA 3KTLA 3EMPA 3DVWA 3BOAA 3RHBA 2OKAA 3LWAA 2H8LA 2IMIA 1BG5A 4G19A 3QAWA 2PVQA 3GX8A 5KN0A 4PQ1A 1JZDA 5JWRB 3CMIA 3NIVA 3QFAC 4XS4B 3CTGA 1WRYA 5G5FA 3SWLA 1Z3EA 3KZQA 3UL3A 2E2GA 1AUCA 2H75A 2REMA 1VGLA 1M2BA 1KNGA 3L9SA 4TKYA 4F0CA 3GFKA 4PXOA 4D73B 4F9ZA 3TKSC 3KM6A 5IMFA 4J56E 1MDKA 1SL1B 3C1SA 1FO5A 2N5BA 3KMNA 4ULXA 1O7UA 3VI5A 3CXGA 3D4TA 4V1Ag 3ERGA 4HJMA 4NXIA 1T7PB 4KAEA 3APSA 2FA8A 4EKZA 1WIKA 3PGTA 5JWOB 5HR3A 3CRUA 1PL1A 3DEXA 4OO4A 3KIJA 2B7JA 4YQUA 2RIIA 4EE0A 5E4WA 4EDYA 2TRXA 4ZL8A 8GSSA 1UA5A 3EMXA 1EZKA 1GTIA 2OADA 2GGTA 1N8JA 3GMFA 2OBIA 1S3DA 1B9XC 3DYRA 2DSAA 2WB9A 2CQ9A 1XW6A 2WS2A 3IC4A 4BVXA 2X8GA 2LSTA 2O85A 1ZOFA 3WT1A 3GYKA 3GKXA 1F2EA 3DGQA 2F51A 3FHKA 5B6NA 2OE3A 2PPTA 2YWOA 4OFNA 2GTUA 1HD2A 2OBKA 1O73A 4NHZA 4ZBDA 3LXZA 5ECMB 5D9XA 1X9WB 1YKAA 4IS0A 3FK8A 4TXVA 2MYGA 3KCMA 1K3OA 1EOGA 4WF5A 4D73A 1EEJA 3KP8A 4KCAA 4NAXA 2FA4A 2JSZA 2YNXA 5AGYA 2XHFA 3DXBA 16GSA 2OJLA 4PX1A 1WWJA 4IGJA 4LMWA 3RPPA 1XW5A 1OAZA 3V1WA 4J57E 1A24A 4CHSA 4KDXA 4WR5A 4KNDA 3I6AA 3IA1A 1IYHA 3M9KA 5EVOA 3ZMKA 5IPHA 1SENA 2HNLA 3HDCA 2V2GA 2EIOA 1T1VA 1SD9A 4O7HA 14GSA 3F0IA 1R7HA 4MF6A 1Z9HA 1TKDB 1XWBA 4GQCA 2LNTA 1OYJA 4NPBA 3TRQA 4X0XA 2K9FA 2HT9A 3KH7A 5JCWA 1A8YA 1U87A 4JRRA 1NW2A 2CAIA 5J4UA 1F3AA 4AJ8A 2JU5A 2LJAA 1R5PA 1PGTA 2YV9A 3KJYA 3TJFA 2HFDA 4AJ7A 2H6ZA 4FYUA 3TJGA 5F8BA 2DJ3A 2R3XA 1BAYA 2VL2C 1NSWA 1PKWA 4KA0A 2I3YA 1GUHA 4ZB6A 2H0HA 4TRXA 9GSSA 2M46A 2JSYA 4DSRA 1X5CA 2VLTA 1OKTA 2L5LA 1QUWA 5A5KA 3GNJA 4IN0A 3F3RA 3LSZA 4QL7A 2C4JA 3HHVA 2ZCTA 5E59A 1THOA 3GUSA 1YF0A 2L5OA 4OMVA 1DUGA 4G10A 5A4UA 4IHUA 3Q6OA 3O6TA 3FR6A 5HFKA 2YJ7A 4O92A 4Q5QA 5INYA 5DDLA 4X1UA 1TJDA 2IWTA 4BWQA 3KGKA 1KTEA 4GF0A 2V32A 4IELA 2HLSA 1GH2A 3D5JA 1GNEA 2B1KA 2YWMA 1S3CA 2WGRA 2ZUPA 2CAQA 4ZB9A 1GUMA 2QC7A 1A2LA 3ZITA 1OC8A 4HJ2A 2MZCA 2JACA 3CSJA 2O8VB 4AGSA 3DWVA 4WXTA 5DQYA 3EC3A 3EYTA 1T4YA 5ECNB 2RLIA 1ML6A 1TK0B 1ERWA 2F3MA 1X5DA 4MH2A 1YEXA 3FR9A 1K0OA 2YWNA 3EE2A 5FWGA 5IMCA 1B8XA 3WGDA 1LU4A 5F0GA 4N10A 4YQMA 2YPMA 4F82A 3RAZA 4PUAA 1SKWB 5D73A 5HR1A 4L0UA 1M99A 1GL8A 2FWHA 3RBTA 4OCFA 2P5RA 3UMAA 5G30A 2RM5A 1CQGA 3DD3A 2H0IA 1TOFA 3D21A 4GXZA 4TVEA 4MLYA 2GQKA 4GSTA 2VCWA 4MPGA 5DALA 1X9SB 1C72A 4OFTA 1HNCA 1PRXA 2L59A 1OVNA 1SJZA 1K0CA 3D22A 4Z7XA 2R37A 2H6YA 2C8UA 2GSTA 4F2IA 2RUEA 4HUAA 1PQNA 2A2SA 6GSWA 4RQXA 2PU9C 3IV4A 1E2YA 4KGIA 4TR1B 2DMLA 5C00A 4HZ4A 4MH3A 4TR4A 5G1KA 2I4AA 5AN1A 2CVKA 1PL2A 3FYGA 1Z6MA 2FHEA 4XIHA 4WKWA 3GN3A 2FY6A 3MWHA 7GSSA 2VAFA 2BMXA 3LEFA 2N5AA 5DVBA 3ZTLA 3GIXA 3TJJA 2JL4A 2HRFA 3KEBA 5D8IA 3UARA 4K1FA 4ZIJA 2AHEA 2P0GA 3FKFA 1IYIA 2X64A 4WBJA 4XRAA 3JCML 1SD8A 1WE0A 1AC1A 4JR4A 2AJQB 5L71A 1AW9A 5HFGA 3GH9A 1YZXA 2VIMA 1XIYA 3LJRA 17GSA 3QCPA 5JWQB 3UVHA 3VPQA 1TW9A 3TKRA 2OACA 4ZXGA 2A4VA 3ME7A 4XCSA 1GSYA 5J9BA 2H70A 5IO2A 5C04A 1FVKA 5DQSA 2GSSA 4PUFC 2PUKC 4K7NA 2FD3A 3C7MA 3ZZXA 3L9VA 2TRCP 1OC3A 4BL7A 2KHPA 5AISA 4KUNA 3ZL5A 2HSHA 1E6BA 1O6JA 4MA9A 3E3EA 3A2WA 4FO5A 5IOXA 6GSYA 2CX4A 2H30A 3QAGA 2JZRA 4ACSA 1YEPA 4XS1A 3GA4A 4TOPA 1PX6A 3RPNA 2G2QA 4I2TA 4KDUA 2MBTA 1K3YA 4ECCA 3SBCA 2WJUA 2DIZA 2GT5A 2H6XA 2MMAA 5ECRB 1TRUA 4POBA 2H0GA 2PGTA 3EU4A 3H8QA 4V2LA 4MF5A 2K6VA 2X8HA 4L8EA 2YWIA 4IP6A 6GSVA 5CRWA 3FZAA 3UOMA 2HSYA 1OE7A 3M1GA 5CRHA 1J0FA 3H93A 3C8EA 1YKCA 3QD9A 3TKQA 3F4TA 4L5LA 1DE1A 3GSSA 4N30A 4PGTA 4KSOA 1A23A 5CAXA 4RI7A 1FG4A 2AB6A 3P2AA 2GSRA 11GSA 2G0FA 5CRGA 3HJOA 2VCXA 4Q5RA 1KBNA 2XBQA 3F9UA 3TOUA 5F05A 2H72A 4ID0A 2LTKA 1RK4A 4ZBBA 5ABRA 4IKHA 2B1LA 3A2VA 1H4OA 2GZYA 4FYCA 3IPZA 3EINA 1V40A 4MK3A 3LYPA 5B6MA 2C3NA 3TB2A 2GZZA 1GSEA 2B5EA 2MMOA 3IE3A 1EWXA 1W4VA 5D9TA 2FWGA 5DAKB 3DIEA 2VUPA 3HVVA 4HU9A 2HZEB 2N5FA 2PVOC 4IW9A 2KP1A 1U3IA 3VWUA 2YANA 3GSTA 2PWJA 1G7EA 3M9JA 3HA9A 2VCTA 4ML6A 4GSNA 4TR0A 3F3QA 2TIRA 1SJ6A 2LKUA 2RUFA 1MDIA 5H5QA 5IMAA 4XS4A 2YZHA 4NHWA 5ID2B 2JZTA 4K2DA 4POKA 2LRTA 2FGXA 4ISDA 5KN2A 2LQOA 2CZ2A 2B5XA 1VF4A 1AAZA 1HQOA 1A8LA 3MAKA 2B6MA 3APQA 4TN8A 2WDUA 1MD4A 3W8JA 1PN9A 1V98A 2EIRA 2H1GA 3DMLA 4GLTA 1YY7A 1NHOA 4DSSB 5H5RA 1XZOA 3QPMA 3LORA 3I43A 4MJAA 1MEKA 3FZ4A 2YOIA 1X9MB 2LEGA 4HQSA 2O89A 3FW2A 3TCOA 5IOWA 2NBSA 1G0TA 1GSDA 4TXOB 1GTBA 2BJXA 1ERUA 1I9DA 1EOHA 4DEJA 5G2ZA 4ECIA 4F03A 5G5EA 3LQ7A 1GNWA 10GSA 2IMEA 5CRDA 1USBA 2F8AA 2V1MA 3GURA 2J23A 2IL3A 19GSA 2JADA 4EC0A 4E8EA 1Z5YE 4EO3A 2ON7A 2EC4A 5KN1A 4YAVA 4KE3A 5DAKA 4N11A 2L4QA 2OE1A 2IMKA 3WGXA 2VCZA 1O8XA 2KUCA 4F0BA 3ZIJA 2XPEA 4LA1A 4RUVA 4I97A 4E8HA 2VO4A 1RW1A 1ON4A 1EP7A 4GWRA 1PMTA 4PQIA 13GSA 4EL1A 1DSBA 5DCGA 3LYKA 5ELAA 2V6OA 3VK9A 4TW5A 1DE2A 2E7PA 3APOA 3ZREA 5GSTA 2KOKA 4XTSA 2YCDA 1F9MA 2L57A 1JZRA 5KEJA 3QDNA 3QOUA 2E2MA 1XWAA 3A2XA 4XS6A 2R6KA 4WF4A 1TRWA 1AQXA 1QK8A 3ZFLA 2H01A 2VLVA 5IPGA 1TU7A 3K8NA 3M8NA 1THXA 1TK8B 3U6VA 4IJIA 4MPFA 4MF7A 3WYWA 3LXTA 2YN1A 2IFQB 5ECOB 1K0AA 1A0RP 2H73A 5ECLB 4N0VA 3O3TA 4ZL9A 4IP1A 1BEDA 4K8MA 5D9VA 1OC9B 3TKSE 4WEYA 1R5AA 4LL4B 5DCHA 4V2MA 2VD0A 5G1LA 3FY7A 5GZZB 3ME8A 3MNGA 3TRXA 2IMDA 4PNFA 4AF2A 3MDKA 4IQ1A 2LS5A 2HRNA 2HI7A 1XVWA 1QGVA 4FIWA 4HZ2A 12GSA 1O8WA 3FR3A 1ZL9A 4BWSA 2F9SA 2OA7A 4MJCA 5F06A 5CYYA 3ERFA 2L6DA 2CA8A 1URMA 1FB0A 1ZYEA 1B9YC 3IK9A 4KX4A 1GSFA 2GS3A 1M9BA 3G7YA 2H71A 4IVFA 3GKNA 1XW9A 1EGRA 4CDOA 4EXJA 1JLWA 3A3TA 2B5YA 1VRSD 2XBIA 3TGZA 2ES7A 1PD21 3GTUB 1GSSA 5DBQA 2I9HA 2LRCA 4JBBA 4AJ6A 4JR6A 3GH6A 22GSA 2AV4A 3PINA 3TDGA 2LRNA 3GL3A 4L5OA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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