4CY6A

Apo structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase hbpa
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
582
structure length
561
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 181
structure length 561
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy6A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy6A01
2C64A 4KX6A 4NEVA 1GNDA 3AE3A 1CC6A 3K30A 1P2HA 4AT2A 3L1RA 1GEUA 4C5OA 4GR1A 3GWFA 3LJPA 5IQ1A 3UTFA 1EL5A 2BC0A 3II4A 1YQ3A 4BK2A 3AE4A 4K7ZA 1B37A 1GRTA 1TYPA 3GYJA 2XVHA 3DJGX 5FMHA 2YVFA 4OPGA 4TM3A 4NZHA 3WE0A 1IJHA 4JDRA 2YM2A 3BI5A 3C4AA 3LB8A 2GQFA 4C3XA 3IF9A 2XVJA 1PS9A 2VQBA 4Z2RA 4H4SA 2CDUA 1GT8A 4Z2UA 3CTYA 1H83A 1Y56B 1PBFA 2C66A 3O0HA 4N9XA 3DK4A 1IUSA 2XFOA 2O9ZA 4U8OA 1CBOA 1VDCA 3D8XA 4U8JA 1DOBA 2FJDA 3VRBA 4YKGA 1PXAA 1NDAA 2OLOA 3F8RA 2WETA 3GSIA 1S2QA 4CNKA 5BULA 2WPCA 3C96A 4H4PA 5JCLA 4Z2TA 3DJEA 4I59A 3KU9A 4UDPA 5JCKA 2EQ7A 2GAHB 5LV9A 1Q1RA 2B9XA 2X8GA 2EQ8A 3HZLA 3GYIA 1GPEA 1KNPA 2APGA 2WOWA 1FEBA 1LTXR 2XVEA 3NHOX 5KOXA 2Q0KA 5U63A 4DGKA 2H89A 1D5TA 2WS3A 2NPXA 3DGZA 4H4TA 5EB4A 1CC2A 2ZZ0A 4NTEA 4CY8A 3ITJA 1HYUA 3B3RA 1E1KA 2BS4A 2VVMA 3ALJA 3V76A 3AE6A 3K7MX 3K7TA 4X9NA 5GRTA 5IQ4A 2Y6QA 1IUXA 4H2QA 4U2TA 2HQMA 2VRMA 2CFYA 1D4CA 2YVJA 4H2NA 2R0PA 1ZK7A 5KWFA 4H2RA 4J33A 3AEDA 1JNZA 1V59A 2BS2A 3Q9TA 3V3NA 4A65A 4BK3A 1LQTA 4HA6A 4H4XA 3RHAA 1IUUA 3AECA 2ARDA 3UP4A 3AE7A 5TR3A 4NTDA 1GV4A 2AQJA 2C65A 2WEUA 1F8WA 1VG0A 2GR3A 1JEHA 3S61A 1JU2A 1PJ6A 1B4VA 2PHHA 1E7PA 2YVGA 3H8IA 1TDFA 4AOSA 3S5WA 1B8SA 1VG9A 2ZZBA 1YKJA 4U8NA 1GXFA 4J36A 1GRGA 2V6OA 2YLZA 1GTHA 4OPUA 4BURA 3AD7B 3AE5A 4BJYA 1PDHA 1EL8A 3AEGA 4H4WA 3B6DA 2C75A 2X50A 3DK8A 2GH5A 4A5LA 2W0HA 3P4PA 3VR9A 2XCGA 4DSHA 4CNJA 4LU6A 4FK1C 3BNUA 3AYJA 1N1PA 3KLJA 5CKUA 2YG6A 3AE2A 1CC4A 1F3PA 4IV9A 2WESA 4YSYA 4H4YA 4K8DA 1REOA 4U8IA 4U2LA 1TDKA 3SQPA 5EB5A 1IUTA 3CNSA 3KVEA 3P4RA 2Z5XA 1PBBA 2C76A 1E1NA 1K0JA 4H4RA 2JK6A 3CGCA 4H4QA 3CGDA 4EQWA 4GCMA 4AP1A 2WPFA 3RNMA 1COYA 1RSGA 2WDVA 3URHA 3AEBA 4A79A 1ZOYA 4DSGA 4K22A 4GUVA 4TLXA 3SFDA 1ZMDA 3IC9A 2ZBWA 4D03A 4EQXA 1XHCA 1E6EA 3FMWA 2E1MA 3AE1A 2X8CA 3FBSA 5FS9A 3M13A 1D4DA 1NHSA 1TDNA 2AR8A 1JRZA 2X3NA 2B7RA 2BXSA 1O5WA 1O94A 2XLTA 4OPCA 1D4EA 1PXBA 1ZY8A 2BK4A 4K5RA 4YSHA 2XLSA 1PBCA 4YSXA 2JB1A 2OAMA 3LZWA 2WOIA 2GRTA 4Y4NA 4EIPA 3RP8A 1BF3A 2BS3A 3FG2P 3GWDA 4K5SA 3R9UA 1H7WA 3QSMA 2WOVA 4I58A 1ZOVA 1FOHA 4YWOA 1E39A 3F8DA 2ACZA 5JCMA 2BC1A 2R0GA 5KVHA 2X99A 5KRQA 1NEKA 2CVJA 3BNMA 4U2SA 1GALA 3ISHA 4O5QA 3SFEA 4B67A 2UZZA 3AWIA 3DGHA 1MXTA 4FX9A 3CNJA 3G5RA 3GDNA 1S2YA 2YQUA 4JNQA 4YTNA 1XDIA 4PABA 1S3EA 2BCPA 3H8LA 3AEEA 4GF7A 3GD3A 4JY2A 4OVIA 3UKHA 2CULA 2WP6A 4B69A 2XLPA 1EBDA 1GRFA 3BI2A 4LIIA 4APNA 1ELIA 1MO9A 2YG3A 2WP5A 3OC4A 1W4XA 2V61A 1JRXA 2WU5A 2VOUA 3LADA 1FL2A 4TM1A 3UP5A 3IHGA 4J31A 2NVKX 3CNDA 2F5ZA 3EPTA 4ZN0A 3P1WA 3UTHA 2E5VA 2YLSA 3PO7A 2TMDA 4YTMA 3ICSA 2GB0A 1GRHA 3SM8A 3UKFA 3BHKA 3P4SA 4C74A 2EQ6A 3AB1A 3UOVA 1LVLA 2RGJA 2GVCA 2BCGG 2Q0LA 3JSKA 4K2XA 3NK1X 1GERA 1BZLA 3BI4A 3COXA 3DK9A 1NPXA 4NEWA 4OPLA 2YG7A 3NGCX 4J57A 4U8MA 1E1LA 4A6NB 2V5ZA 3K7QX 2A8XA 4IVMB 3UKLA 4H4VA 1LJ1A 3NKSA 4B63A 5HY5A 1F8SA 3QSSA 5U1OA 4B64A 2XFPA 4MJWA 2IIDA 2WHDA 3I6DA 3NYEA 4YTPA 1PXCA 3AE8A 3IWAA 3KKJA 3LXDA 3M0OA 3NK0X 2YR4A 4JNAA 4Z43A 4UDRA 2EQ9A 3M12A 2QAEA 4Z26A 5C2TA 1N4UA 3AEFA 1Y0PA 1N4VA 4C3YA 3GDPA 2FJBA 4A9WA 1P2EA 2RABA 5C3JA 5BRTA 3ADAB 4Z44A 3AEAA 2C3CA 1KDGA 3DMEA 4ECHA 2FBWA 2YWLA 4TM4A 2Z5YA 3NRNA 3UKKA 4IVOB 4E0VA 1ZP0A 1XANA 4CBQA 4XWRA 3UCLA 2I0ZA 3DA1A 1CJ4A 1F8RA 3ALMA 5HXIA 5ER0A 1PJ7A 4J34A 1BGNA 5EBKA 2R4JA 4JN9A 4OCGA 3G5SA 3VR8A 2XDOA 2AAQA 3NG7X 2B9YA 3RP6A 3P9UA 4XXGA 4UP3A 1K0IA 3DH9A 4YSZA 4OPDA 2XLUA 1DXLA 3AYLA 3P4QA 4H50A 1CHUA 2OA1A 3QVRA 3VRAA 4FK1A 2YLXA 1X31B 1Z6LA 2RGHA 4OPIA 1ZKQA 1H84A 2A87A 3AYIA 4U8LA 1CJ2A 2C67A 1PN0A 2YG5A 3GMCA 4YKFA 3CGEA 4D04A 3OZ2A 3CN8A 2V3BA 3T37A 1BKWA 4CRTA 2YLWA 1FECA 2B7SA 1BWCA 1GETA 2BACA 2B9WA 4Z25A 2Y6RA 1PHHA 3C4NA 2C3DA 1NHRA 1LV0A 5M0ZA 4EMWA 1GRAA 1YQZA 3QSEA 3SGLA 3EANA 4B68A 1D7YA 3FPZA 3KA7A 1H86A 2Q7VA 3LOVA 4X9MA 5FS6A 1KNRA 5EOWA 3NNEA 1O95A 3G5QA 2X8HA 3ZDNA 2JKCA 3VQRA 4J56A 1DNCA 4JY3A 3UOYA 1TDOA 3CGBA 3KD9A 1FCDA 1H82A 3PVCA 1L9EA 2A89A 4FDCB 4H4ZA 1K0LA 3KPFA 3NTDA 2GEWA 1OJAA 2B76A 2XFQA 3AD9B 4WX1A 4XWZA 3CPIG 4Z24A 1JRYA 2TPRA 4BK1A 4IA5A 4EM3A 3QFBA 2IVDA 1H7XA 2YLRA 2YR6A 5DBJA 1L0VA 1NHPA 3ZYXA 3ATQA 2JAEA 3UOZA 4H7UA 1H81A 1L9CA 4CCQA 4Y4LA 1DODA 4H2PA 5M10A 4ICYA 1M64A 1NG3A 4BV6A 3NLCA 1YY5A 3NH3X 1CJCA 1MOKA 1RP0A 3UKPA 4U8PA 1F6MA 4NTCA 1L9DA 3V3OA 1VRQB 1EL7A 4JQ9A 1BGJA 3DJJA 3QFAA 3E1TA 5FS8A 2XFUA 4USRA 2WBAA 1TYTA 3NTAA 2OALA 3AE9A 2JB3A 2OLNA 1TDEA 2WU2A 1JNRA 3D1CA 4CY6A 1DJNA 4YT0A 2BABA 2RGOA 1N4WA 3ABVA 1E1MA 2IVEA 5JCNA 3CNPA 1XPQA 3AXBA 2VZ2A 1IUWA 1VQWA 4EQRA 3Q6JA 2GQWA 4U8KA 1QLBA 2GMJA 2YLTA 4USQA 1OJDA 1M6IA 3CPJG 1TRBA 5J60A 2XVFA 1CL0A 3GRSA 4RSLA 3GMBA 5U25A 3UKQA 2XLRA 1AOGA 2R4EA 3CIRA 4CCRA 1Y56A 3ALLA 4TLZA 3VRDB 1JOAA 4AT0A 5HHFA 3NN0X 4UDQA 2BXRA 1D7LA 3NN6X 2BK5A 3UTGA 4B65A 1Q1WA 2GR1A 4IA6A 1DJQA 5HYMA 4C77A 2C7GA 1LQUA 1PBEA 5IPYA 3ICTA 1OJCA 3ICRA 3EF6A 3LZXA 2QCUA 2WQYA 4YXDA 4ZCCA 1GOSA 2BK3A 1GTEA 2J3NA 4AP3A 1Q9IA 1B5QA 2JBVA 4X4JA 4GRTA 4RG3A 2QA2A 1KSUA 2WDRA 3QVPA 4Y4MA 3NIXA 1ZX9A 5FS7A 3H4KA 1RYIA 5GSNA 1NHQA 5KXJA 1KF6A 2VVLA 3CNTA 5KVIA 3NK2X 4BJZA 3BHFA 2VQ7A 5KOWA 2GR0A 3CPHG 3REDA 1S3BA 2XFNA 4PAAA 4A6NA 2R9ZA 4J2WA 1KFYA 1SEZA 3IHMA 1CJ3A 2R0CA 1OJ9A 2XYOA 3NYCA 2E4GA 2FJEA 4EIQA 4OPTA 4TM0A 2YM1A 3NT6A 4HB9A 4ADWA 3PS9A 1GREA 4WCTA 1CF3A 4EM4A 1GRBA 2QA1A 1OJTA 1DOCA 3ATRA 4B66A 1ZMCA 2FJAA 2GR2A 3AD8B 1H6VA 1QJDA 1GESA 4GDEA 4P9SA 1IUVA 2WPEA 4LA1A 1NAAA 1FEAA 2YAUA 3F8PA 3GRTA 1PJ5A 4KPRA 1NG4A 1ZDLA 1KSSA 3UTEA 2V60A 4GDPA 3I3LA 4RG4A 4B1BA 1YQ4A 1PBDA 2H88A 1LPFA 5L46A 5BUKA 4EMJA 3UOXA 2C72A 4H4UA 2WDQA 4EQSA 3UKAA 4O5UA 2JB2A 2GMHA 2DKHA 2WP9A 4AOXA 3NYFA 2GV8A 5J7XA 5JCIA 1GSNA 2XVIA 1K4QA 3L8KA 2DKIA 2BYBA 1UKVG 3EAOA 5BVAA 3FIMB 3GD4A 4REKA 2ZZCA 2BA9A 2GAGB 1DOEA 2VVLG 2PYXA 2R45A 2GF3A 2Q6UA 4ZCDA 1QO8A 2C70A 4A99A 4A7AA 2R46A 3RP7A 3DJDA 2C73A 2VRLA 1EL9A 2YG4A 5CQFA 4DNAA 2YR5A 4EMIA 2V3AA 4M52A 1ONFA 3QJ4A 1NENA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YV7A 1LJRA 1O73A 3FHKA 1GNDA 4C5OA 4G73A 4CHSA 4F0CA 4DVCA 3TCOA 4PNGA 1EL5A 4BWQA 5B6NA 2LSTA 4AJ8A 1TYPA 4BL7A 2HSMA 2JSYA 3VLNA 5CP1A 1Z7RA 3ZTLA 1GT8A 1DE1A 3O0HA 3ZYWA 5HQPA 5EY6A 4U8OA 1PRXA 4PXOA 1FW1A 1DOBA 2FJDA 4CNKA 4BVXA 3F8RA 2WETA 5BULA 4G0LA 5E59A 5JCLA 1FB6A 2H70A 4KA0A 4Z2TA 4I59A 2GAHB 4ZBDA 3W8JA 3E3EA 3GYIA 1TW9A 1GPEA 5U63A 1IYIA 3DWVA 1X5EA 3TUEA 3UIWA 1NSWA 1T8EB 3QOUA 2HYXA 2VVMA 3ALJA 1PA3A 4GRFA 3TDGA 5GRTA 4H2QA 3EURA 3CSHA 3Q6OA 3TJGA 1AAZA 1ZL9A 2AHEA 2L59A 4J33A 2M46A 2C4CA 2GSSA 1V59A 3Q9TA 2GT5A 3V3NA 2PVOC 4WF4A 1XZOA 3HYXA 1GV4A 2AV4A 2AQJA 3MNGA 5B8AA 1G6YA 2GR3A 2C4JA 1JEHA 1JU2A 3GX0A 2YVGA 3H8IA 1SL1B 5DALB 1B8SA 1VG9A 4U8NA 1GXFA 2V6OA 2YLZA 1GTHA 3AD7B 3PR8A 1EL8A 1G6WA 4ZIJA 4H4WA 2NBSA 2C75A 1YEXA 1I9DA 4IELA 2ON7A 4CNJA 2H76A 1SKWB 1GTIA 5L71A 2G2QA 3UL3A 3P90A 4WR5A 1F3PA 2DMMA 3QD9A 2MMNA 1M2BA 2BRAA 2PGTA 1IUTA 3KVEA 1VF1A 3ZITA 4OMVA 1A24A 4GCIA 3HXSA 4ZL8A 4X0XA 5J5NA 1K0JA 1SK2A 4NXIA 1E6BA 2X64A 3L9SA 5IMAA 1RSGA 2IMEA 3URHA 2GTUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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