4CY6 | Genus

Total Genus 181

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	181
sequence length	582
structure length	561
Chain Sequence	SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution. pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus	181
structure length	561
sequence length	582
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date	2014-04-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4cy6A03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4cy6A01

5HHFA 3UOXA 3NK0X 3AE9A 2YLRA 4U8PA 1BKWA 3EANA 2YR5A 5J7XA 1H84A 2QA2A 2ZZ0A 1X31B 4H4TA 4AT2A 4GRTA 1D4EA 1GERA 2C73A 1NHSA 4FK1C 1MO9A 1TDEA 1PBCA 3LZWA 3KU9A 3LADA 1PBFA 4OPCA 2BACA 4RG4A 4CCRA 4YSXA 1FEBA 5DBJA 3KVEA 2BK4A 3NT6A 1OJ9A 2DKHA 3IWAA 1XHCA 4A6NA 4IA6A 3K30A 1OJAA 3ZDNA 3C96A 1CHUA 1CC4A 1YQ4A 4M52A 4YKGA 1IUXA 2YG5A 3CN8A 5U25A 1K0JA 3RP8A 1ZY8A 3BI2A 4A5LA 3P1WA 2J3NA 2BK5A 2WPEA 3QSEA 2B7SA 2JB1A 3B6DA 5EOWA 1V59A 4HA6A 5EBKA 4ZN0A 2ZBWA 4JY2A 1JOAA 3AD8B 2WDQA 4EQRA 5KVHA 4YTNA 1L9CA 4CY8A 1TYTA 3AEAA 1FL2A 1K0LA 3AEEA 1JNRA 5HY5A 2A8XA 3BNMA 1CC6A 4H2NA 4MJWA 4NTCA 2NPXA 3GSIA 4USQA 1ZX9A 1QO8A 3LOVA 1DODA 1IUVA 3COXA 3FPZA 3NNEA 4Y4NA 4EQSA 2GRTA 2VVLA 3M13A 3BHKA 4BJYA 2JB3A 5FS8A 3AB1A 3IC9A 3DGZA 3RP6A 2YM1A 2XFOA 1TDNA 4GDPA 4IVOB 4J57A 3QJ4A 1PBDA 3AE5A 3GMCA 4ZCCA 2JB2A 2A87A 1O94A 4U8OA 2VZ2A 2YVJA 3AE2A 3ADAB 2A89A 1ZMCA 1FECA 2VVMA 4X9NA 1PJ6A 4Z44A 1N1PA 1NG4A 2VVLG 2VQBA 1IJHA 2FJEA 3GWDA 4NEWA 3NLCA 4IV9A 1SEZA 4U2LA 3WE0A 3K7TA 4B65A 1TDOA 1F8SA 4YSYA 1DOEA 2V6OA 1KNRA 1H83A 4JQ9A 3V3OA 2R46A 4BK2A 2GR0A 2RGHA 3P9UA 1GSNA 2PHHA 5U63A 3FBSA 2R4EA 2QA1A 4A7AA 1QJDA 4UDQA 1EBDA 3ICSA 1LPFA 3BI5A 2C3CA 1YY5A 1PXBA 3QVPA 2XVJA 2QCUA 3GMBA 3UKFA 3NTAA 3BNUA 4EQWA 2R9ZA 4H7UA 3V3NA 1HYUA 4PABA 1GRGA 3RP7A 1IUTA 3SFEA 3ALJA 2Z5XA 2W0HA 3AYLA 4U8IA 1GXFA 2B9YA 4OPLA 3AYJA 2XLRA 5ER0A 3KPFA 4IA5A 4LA1A 1H86A 2CULA 2EQ6A 2WP9A 2Y6QA 4CRTA 3QFAA 4YTPA 1LVLA 1D4CA 3CNPA 2EQ9A 2JKCA 3CTYA 3ABVA 2YLWA 2DKIA 3GDPA 5IPYA 4AOXA 2BXSA 4H2RA 3ALMA 3D1CA 1GRTA 5KRQA 3P4SA 4J34A 3URHA 4P9SA 2WU5A 2BC1A 1PJ7A 1D7YA 1Y56B 2Y6RA 4X9MA 1VRQB 1VDCA 1ZOVA 4TM3A 4B69A 4EMIA 1NG3A 2CFYA 2E1MA 3CGBA 3GYJA 1ONFA 4EQXA 1NEKA 2NVKX 2XVHA 4UDRA 1EL9A 1CJCA 2IIDA 4EIPA 3AEBA 3R9UA 4C5OA 1PN0A 4OVIA 3UOYA 1FOHA 3OC4A 1NAAA 2C67A 1S3BA 1MOKA 1CBOA 4NZHA 2F5ZA 3V76A 3P4PA 2R0PA 2BA9A 3QVRA 4C3XA 5J60A 4A65A 2BS3A 5FS6A 1PJ5A 4IVMB 3O0HA 1JRXA 1KFYA 3UOZA 4EIQA 4K2XA 1REOA 3AE7A 3NYFA 3SQPA 4CBQA 1PDHA 2C72A 4DGKA 4REKA 2V3BA 2YG4A 3JSKA 1S2YA 2WP5A 3CGCA 1YQ3A 1D7LA 1ELIA 3DJDA 2WDRA 4A99A 3ISHA 2WPFA 1GETA 3VRAA 1CC2A 1JNZA 1KDGA 2FJDA 3K7MX 3EPTA 3RHAA 1AOGA 3L1RA 2OAMA 4GR1A 1LJ1A 5JCNA 3P4QA 3DJJA 5KWFA 3PS9A 4Y4MA 4UP3A 2YR6A 1GRAA 3QFBA 3AD7B 4I58A 4Z2TA 5JCLA 2X99A 1Y0PA 2B76A 4AP3A 2YG7A 4EM4A 3Q6JA 4ECHA 4Z2UA 1B5QA 3S61A 2APGA 4O5QA 4H4WA 4O5UA 3DGHA 4BURA 1GREA 2RGJA 3PO7A 2XVEA 4U8KA 3UKLA 4DSGA 1JU2A 3AE3A 3UOVA 3NK2X 2X50A 3B3RA 3VR9A 2VQ7A 3QSMA 5BVAA 3SGLA 5JCMA 4HB9A 2XVIA 4JNQA 2WBAA 3II4A 3UTHA 2RABA 2ZZCA 3UCLA 3ZYXA 4A79A 1S3EA 4AT0A 4YSZA 2BABA 2OA1A 5C2TA 5JCKA 2CVJA 2RGOA 1GTHA 1Q9IA 3DJEA 3EF6A 1EL8A 4Z25A 1NDAA 1E6EA 5IQ4A 1JRZA 2X8CA 2AR8A 4EMJA 3S5WA 1RSGA 3GD3A 4ICYA 1GV4A 2HQMA 1GPEA 2WU2A 3NN6X 1CJ3A 1GRHA 3DK8A 4YTMA 2XCGA 2X8HA 5KVIA 4WX1A 1BGJA 1K0IA 3GD4A 2ARDA 1F8WA 4D03A 3KD9A 1OJCA 1PBEA 3CIRA 4K22A 2C66A 5M10A 2GAGB 3ITJA 3DK4A 4H4SA 1E1NA 2B9WA 2EQ7A 2XFNA 2JK6A 2GV8A 2B7RA 4C77A 1LQTA 4NEVA 5GSNA 1NHQA 3OZ2A 1D5TA 3F8DA 2C70A 4B64A 2VRLA 4ZCDA 2YR4A 2FBWA 2H89A 3GYIA 2X8GA 1GNDA 2WEUA 1PHHA 1RYIA 4TLXA 5C3JA 2WOWA 4Z2RA 1EL5A 3I6DA 1CF3A 4UDPA 5BRTA 3H4KA 2YLZA 2JBVA 1COYA 1KNPA 3P4RA 4J33A 3NN0X 4XXGA 4PAAA 1PBBA 2V60A 4FDCB 4LU6A 4YSHA 2BCPA 4OPGA 2GR3A 3D8XA 2BXRA 4H4RA 3BI4A 3AE1A 2YG3A 4I59A 2VRMA 1EL7A 1VG0A 3UTFA 3C4AA 3HZLA 4U2TA 1TRBA 3L8KA 1D4DA 1E39A 1Q1RA 2WETA 1KSSA 1P2HA 3Q9TA 2GAHB 1NHRA 1LV0A 3AWIA 3NHOX 4WCTA 1MXTA 1QLBA 3ICTA 3ATQA 3VQRA 4J36A 5HXIA 2WESA 3CNTA 2X3NA 5KOXA 5EB5A 1Y56A 3FG2P 3NKSA 2CDUA 3AE8A 3IF9A 1GESA 1E1MA 4CY6A 5FS9A 1TDKA 2TPRA 3AEGA 1YKJA 3ALLA 3T37A 2YAUA 4Z43A 1P2EA 4AP1A 2E4GA 4APNA 2R0CA 5TR3A 4BK1A 3LJPA 4B66A 1TDFA 3BHFA 4TM0A 1YQZA 2E5VA 4CNJA 2I0ZA 1H7WA 3FMWA 1F3PA 3AECA 4U8LA 1CJ2A 4OCGA 3CNJA 3H8IA 4U8MA 1KSUA 3DA1A 4B68A 3NH3X 4KX6A 5KXJA 2GEWA 2PYXA 1O95A 4B67A 4H4PA 4ADWA 2WDVA 1ZMDA 2BS4A 2XFPA 3I3LA 4J31A 3CPJG 4Z24A 2YG6A 3LB8A 2Q7VA 3CGEA 2BC0A 1N4UA 5JCIA 4JDRA 2XLSA 3VR8A 4KPRA 3UKKA 1W4XA 5FS7A 4H50A 1GTEA 4J56A 2IVEA 2XDOA 1F8RA 3G5SA 2H88A 4D04A 4JN9A 5IQ1A 4AOSA 1KF6A 2YLXA 3DJGX 4BJZA 1XPQA 2BS2A 4GCMA 3CNSA 4LIIA 3NK1X 4H4VA 3UTGA 2GH5A 2WP6A 3AYIA 2C7GA 4TLZA 2XVFA 3UKHA 2WS3A 1NPXA 1Z6LA 1ZKQA 4JY3A 4A6NB 1M64A 3DH9A 2XLPA 4GDEA 3NG7X 2C65A 2YM2A 2WPCA 5EB4A 2GR1A 1K4QA 4N9XA 4K8DA 1Q1WA 1DNCA 1GOSA 1GT8A 3G5RA 3GRTA 1S2QA 4U2SA 5U1OA 3ICRA 2AQJA 1DJQA 2GQFA 4CNKA 1JRYA 4USRA 2Q0KA 1B4VA 1BZLA 1TYPA 2GR2A 1F6MA 3EAOA 3NYEA 3NYCA 4FK1A 4GF7A 3RNMA 2FJBA 1CL0A 2OALA 5GRTA 3DK9A 4RSLA 2C76A 4J2WA 1ZDLA 3KA7A 3GRSA 4H4ZA 1GRFA 3DMEA 3H8LA 1H82A 2C3DA 3KLJA 4H4YA 3CPHG 4C3YA 1BGNA 3K7QX 3KKJA 1H7XA 2XFQA 2XLUA 4RG3A 4X4JA 1UKVG 4GUVA 4JNAA 2V5ZA 2WOIA 1OJDA 1FCDA 3M0OA 4K5RA 3UKPA 4EM3A 1DXLA 3LZXA 2TMDA 2XLTA 1GRBA 2GB0A 4Y4LA 4YKFA 2YWLA 2EQ8A 3PVCA 4OPDA 1DOCA 1JEHA 4OPTA 1LQUA 5FMHA 1PS9A 4Z26A 4DNAA 1E1LA 4U8NA 2ACZA 1ZOYA 3F8PA 1BF3A 2WOVA 2YLSA 4U8JA 1E1KA 3FIMB 1BWCA 2C75A 4NTEA 4OPUA 3UP5A 1L0VA 1CJ4A 4YT0A 1N4VA 3NIXA 3C4NA 1IUWA 1E7PA 1FEAA 2B9XA 2UZZA 1RP0A 2GF3A 3REDA 3SM8A 2C64A 4FX9A 4B1BA 4B63A 5BULA 2BCGG 4XWZA 4K5SA 3IHGA 3NRNA 4TM1A 4TM4A 2YVFA 3AE4A 2WHDA 1DOBA 2VOUA 4H4XA 3E1TA 3UTEA 3NTDA 2GMHA 2YLTA 4C74A 2XFUA 2QAEA 1PXAA 2R4JA 1VG9A 2GVCA 2BYBA 4H4UA 3LXDA 2Q6UA 3M12A 2Q0LA 1ZP0A 2WQYA 3GWFA 3CPIG 1B37A 3CNDA 4H2PA 3AEDA 5HYMA 1VQWA 1ZK7A 2AAQA 1O5WA 2OLNA 3IHMA 3NGCX 4A9WA 5LV9A 4BV6A 1GEUA 3QSSA 1L9DA 4XWRA 3UP4A 2GMJA 4E0VA 2FJAA 3VRBA 5BUKA 2Z5YA 5CQFA 1H6VA 3AEFA 4OPIA 3GDNA 2GQWA 4H2QA 4DSHA 1N4WA 2V61A 4BK3A 4YWOA 1PXCA 2OLOA 1H81A 2ZZBA 3UKQA 3VRDB 4K7ZA 4NTDA 3SFDA 4YXDA 4CCQA 1NHPA 2O9ZA 2IVDA 1DJNA 1NENA 5KOWA 3AD9B 2YVGA 3AE6A 4H4QA 1OJTA 1XANA 2XYOA 2R45A 3CGDA 3ATRA 2V3AA 1B8SA 1IUSA 4EMWA 1XDIA 2R0GA 5L46A 1IUUA 3AXBA 2BK3A 1M6IA 5CKUA 1L9EA 3G5QA 2JAEA 2YQUA 5M0ZA 1GALA 1LTXR 3UKAA 3F8RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3UOXA 3CTFA 2FWEA 2YP6A 4FYBA 1BKWA 3IE3A 4H4TA 4MH2A 1D4EA 2C73A 1A0FA 4CW9A 3UJ1A 2ON7A 3IDVA 4IS0A 1TDEA 3EWLA 1PBCA 3LZWA 5ECSA 3L78A 1PBFA 2IMIA 2BACA 3KU9A 1A8LA 2GQLA 2DMLA 3M1GA 2BRAA 1GSEA 1UN2A 3NT6A 4XRAA 2C0EA 5DQYA 4A6NA 4IA6A 3I6AA 1OJAA 2GLRA 5D96A 4II3A 3C96A 1CHUA 1CC4A 1AUCA 1EP8A 1TRWA 4M52A 4YKGA 1IUXA 2YG5A 5U25A 4A5LA 2P0GA 2FWFA 4KB3A 1YZXA 2E2GA 3PR8A 2WDQA 3KH7A 1FO5A 1L9CA 2QSIA 1JZWA 1ZOFA 1TYTA 2C3NA 1A8YA 3RHBA 4ECIA 2JACA 3BNMA 4H2NA 2LEGA 4MJWA 4NTCA 4HU9A 2NPXA 3GSIA 1QO8A 3LOVA 2HSHA 1WMJA 3M13A 2TRCP 10GSA 4RUVA 2GS3A 1TDNA 4J57A 2AYTA 1OKDA 3AE5A 1F2EA 2JB2A 4TXOB 2VCVA 3H79A 3TUEA 2OE3A 1FECA 2VVMA 3N9JA 2VVLG 1X9MB 2L57A 2VQBA 4NEWA 2MMZA 3GFKA 4TW5A 2B3SA 1Q98A 5DQSA 3GA4A 4BWSA 4JQ9A 4V2LA 1TDIA 4BK2A 2PHHA 3BJ5A 4ULXA 4A7AA 1QJDA 4ZBBA 2PGTA 4V2NA 2C3CA 1YY5A 1PXBA 2JZSA 3UKFA 3ERFA 1NW2A 5AIXA 12GSA 2Z5XA 4GSSA 4KE3A 1GTIA 3TJBA 5ER0A 4IA5A 2EQ6A 3ZVJA 3QFAA 5ENUA 4E8EA 3CNPA 4G74A 3E9JB 2EQ9A 2JKCA 3CTYA 4BPYA 4FH8A 3GDPA 3M9KA 3IBHA 1EEJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4CY6A

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

pfam database annotations