4CY6A

Apo structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase hbpa
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
582
structure length
561
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 181
structure length 561
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy6A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy6A01
2JB2A 2BA9A 4A9WA 3SFDA 3L1RA 3D8XA 4RG3A 5EB4A 1ZKQA 1CJ2A 2GQWA 3UOYA 3RP6A 3FIMB 1GREA 4Y4MA 3T37A 4CNKA 3VRBA 2C70A 2B9XA 3F8RA 4ICYA 3NN6X 3DK4A 1CJ3A 3AEBA 3UOZA 2WDRA 3HZLA 1QJDA 3SGLA 4EQRA 1GPEA 2BC1A 1MO9A 3QFBA 1E1KA 1N1PA 3ALJA 4B69A 1GRHA 3CPIG 2BC0A 4U8PA 1PN0A 5DBJA 2R0CA 1CHUA 5CKUA 3C4NA 1IUUA 2R0GA 2VRMA 3NRNA 1NEKA 1CL0A 1XPQA 4NTCA 4USQA 4DGKA 3SFEA 2TPRA 3B3RA 1P2HA 2V3AA 1VG9A 4FDCB 3Q6JA 4YKGA 2YR5A 5KVHA 1IUWA 1DODA 3UTEA 1IUSA 2OAMA 2R46A 1XHCA 1Y56B 3H8LA 1DNCA 2BS2A 2GAHB 2YAUA 4A99A 1FECA 3QJ4A 2JKCA 3NK1X 3L8KA 5C2TA 4UDQA 2WP5A 1NAAA 2XFUA 1E39A 2XCGA 3G5RA 3AWIA 2WPCA 4ZCDA 3UP4A 3BHFA 2V6OA 1DXLA 4U8OA 2Q7VA 4XWRA 4IA5A 1PJ6A 2EQ9A 3P9UA 4EQXA 4FK1C 4AT0A 1FCDA 3AE6A 3WE0A 1GRBA 4B68A 4J34A 4PABA 2GAGB 1FL2A 3P4RA 4UDPA 3GRSA 1PHHA 2TMDA 4U8LA 1NENA 2O9ZA 3DGHA 4TM1A 3FPZA 1PXAA 1TDEA 3ITJA 4A6NA 5EBKA 3UKFA 4H4WA 1ZOYA 4O5QA 2GMJA 4USRA 2YWLA 2BS4A 2FBWA 1CJ4A 2CULA 1CJCA 4I58A 3M12A 1S2QA 2XFQA 1GRAA 1KNPA 1TDKA 1LPFA 2X8HA 3UTFA 1EL7A 2NVKX 1JRXA 3AEEA 3GD4A 2XLSA 2YLWA 2WDQA 4D04A 2C72A 4EIQA 1JRYA 1PBBA 3BI4A 3NHOX 2GMHA 1TDNA 4IV9A 3GWFA 2AAQA 4REKA 2WQYA 1Z6LA 2WBAA 5ER0A 3CGCA 1H7XA 3IWAA 2YLXA 5HYMA 4CBQA 1MOKA 3M13A 4H4YA 4JDRA 2PHHA 4EM4A 3I3LA 2B7SA 3V3OA 4JNAA 2X50A 4GCMA 4YSHA 4A7AA 1LTXR 4H2NA 1LV0A 2VRLA 3CNDA 2GR2A 3F8PA 3UOVA 4Z26A 2C65A 1JNRA 1PS9A 1KDGA 1S3EA 1E1NA 4JQ9A 4P9SA 1E1LA 3ZDNA 4BURA 5BULA 4BV6A 3ATQA 1IUXA 4PAAA 3V3NA 1VQWA 4LU6A 5FS6A 1NDAA 2V5ZA 2RGJA 4KX6A 1DOEA 1M6IA 2CFYA 2Z5YA 4A6NB 2VQ7A 1QLBA 4YWOA 1L9CA 2GVCA 3II4A 4Y4NA 3PS9A 3DJGX 2AQJA 3DK9A 3LADA 1GETA 4XWZA 1NHPA 2QCUA 3NTAA 1GTHA 3QVRA 4YXDA 3QSEA 4U2TA 1CF3A 2Y6QA 1KNRA 4H4TA 2YLSA 2R0PA 1ZOVA 2E4GA 3V76A 2YM1A 1N4VA 3P4PA 5JCMA 2V61A 2C7GA 2BK5A 3NGCX 1YY5A 5FS7A 3URHA 1L9EA 3KKJA 4OPLA 1PBCA 2R4EA 3NK0X 5JCKA 4KPRA 4CY6A 1GRGA 2WS3A 3PVCA 3ALLA 3NYFA 4FX9A 2WP6A 3CNSA 2YG6A 3AYJA 3F8DA 3NNEA 4GR1A 4D03A 3CNJA 1GV4A 1ZX9A 4OPGA 1NHSA 4H4RA 4U8MA 3AE9A 4U8IA 3UCLA 4IVOB 5BRTA 4H4ZA 5HHFA 4EQSA 2QA2A 1TYPA 5KOXA 2UZZA 2VVMA 1BWCA 3VRAA 5J60A 2WPFA 1H83A 2DKIA 2WEUA 4LIIA 3BI5A 3UKAA 4AP1A 1F8RA 3CN8A 1JNZA 3S5WA 3AXBA 2BXRA 3K30A 4FK1A 3GRTA 4AT2A 4JY3A 3RNMA 2B7RA 1K4QA 3CGDA 2X8CA 3CNPA 2QAEA 2WHDA 2WOWA 4NEVA 4BK1A 4H4UA 1Y0PA 2YG5A 4H4PA 5TR3A 1B4VA 1RP0A 3IC9A 2AR8A 2BCPA 4CNJA 1H6VA 2WPEA 1NHQA 2VQBA 2GR0A 2XVIA 2C75A 2YM2A 2EQ6A 3M0OA 3NTDA 4U2SA 4U8NA 4IA6A 1TYTA 2OALA 1DJNA 1BZLA 1GSNA 3P4QA 1MXTA 4GF7A 2VZ2A 1P2EA 2BACA 2V3BA 2RGHA 4K5SA 4B65A 3S61A 1GESA 1GEUA 2WDVA 4OPCA 3RP7A 2YLTA 2F5ZA 2EQ7A 2XLPA 3D1CA 1B5QA 3LZXA 3DJJA 2XVJA 5BUKA 3AEAA 2EQ8A 4N9XA 1GXFA 4A65A 4OVIA 1LJ1A 1ZMDA 1F8WA 3CPJG 3DH9A 2Q0LA 3AD9B 4IVMB 5FS9A 4LA1A 2BABA 2A87A 3B6DA 5KWFA 2R4JA 3AECA 3K7MX 2C3CA 3UTHA 1LQTA 2B76A 2X3NA 3GMBA 5JCIA 3LXDA 4GRTA 1H86A 4JN9A 5GRTA 3VR9A 2GR1A 2GV8A 3FG2P 2Q0KA 3IHMA 1PDHA 4BK2A 3OZ2A 2YLRA 2JBVA 4CY8A 1IUVA 4OCGA 5U63A 2YVJA 4Z24A 4K2XA 1PXBA 1COYA 3GD3A 1D7LA 3CTYA 1GRFA 3CGEA 3BI2A 2XFOA 2IIDA 4EM3A 1YQZA 4Z25A 2BK3A 2APGA 2BCGG 1D5TA 3ADAB 4WCTA 5C3JA 5LV9A 2GR3A 2J3NA 2C66A 3AE8A 2Y6RA 3UTGA 1NHRA 2BS3A 2R45A 5U1OA 2WU2A 3OC4A 4TLZA 4AOSA 1O94A 1OJCA 3PO7A 2C73A 1TRBA 3KVEA 2X99A 2VVLG 3NYCA 2ARDA 4H4VA 3JSKA 4X4JA 3RHAA 2B9WA 4A79A 3KPFA 1HYUA 3ALMA 1YQ3A 1RSGA 2FJDA 3GYIA 3P4SA 3GMCA 3UKKA 3REDA 5M0ZA 4H2RA 1TDOA 1OJAA 5EOWA 1FEBA 2C3DA 3AE7A 5IQ4A 2Z5XA 2BYBA 2XFPA 3BHKA 3DGZA 4EMWA 3NKSA 4XXGA 2OLOA 2OLNA 4H2PA 2B9YA 2YG4A 2GH5A 1O5WA 3ICSA 1W4XA 3ICTA 4GUVA 1Q1RA 1DOCA 3AE5A 3GYJA 4ZN0A 2I0ZA 2VVLA 2E1MA 3AEGA 1YQ4A 4NTEA 2C67A 2XVEA 4OPIA 2YLZA 1D4CA 2A89A 4C77A 5KOWA 1CBOA 2W0HA 1L9DA 4H2QA 3CNTA 1NG3A 1EBDA 2RGOA 2ZZ0A 2ACZA 2XVFA 4YTMA 4J56A 1ZP0A 1OJ9A 1E7PA 5KVIA 1QO8A 2H89A 1JEHA 1H7WA 3AYIA 1M64A 3Q9TA 4EIPA 1GRTA 3VRDB 1N4WA 1X31B 2JK6A 2QA1A 4ADWA 3P1WA 4EMJA 1H84A 1GOSA 1F3PA 4OPTA 3CPHG 3QVPA 4A5LA 3UKPA 1CC2A 3AB1A 1GTEA 3NG7X 1D4EA 3EANA 1O95A 1PBDA 2XYOA 4EQWA 1EL8A 1YKJA 3GDPA 5IPYA 1DJQA 3H8IA 1ONFA 4NZHA 4B66A 1AOGA 5FMHA 3AE3A 3AYLA 3H4KA 4U2LA 4Z43A 4NTDA 2JB1A 3K7TA 3CIRA 3IF9A 3DJDA 5JCLA 5CQFA 3IHGA 3GWDA 1KF6A 5EB5A 4Z2TA 5JCNA 2C64A 4K5RA 2IVDA 5BVAA 1IJHA 1CC4A 4J57A 1PJ5A 2C76A 1D7YA 5GSNA 3AE1A 3DA1A 4CCRA 2Q6UA 3ATRA 1VG0A 3E1TA 2WETA 3UKQA 5KXJA 3GDNA 5J7XA 3LJPA 1BKWA 4C3XA 3LZWA 3NYEA 1V59A 3C96A 2NPXA 4OPDA 1VRQB 4HA6A 1B37A 5FS8A 2V60A 4I59A 4TM4A 4E0VA 1OJDA 1JOAA 1JRZA 1N4UA 3NK2X 4B64A 3GSIA 3QFAA 3NN0X 5L46A 1IUTA 1E1MA 2YVFA 4YSZA 2R9ZA 1PBEA 2X8GA 2ZZCA 5IQ1A 2XVHA 3UP5A 3ICRA 4U8KA 2E5VA 1OJTA 4BK3A 4K7ZA 3DMEA 4H4XA 2DKHA 1Q1WA 2JB3A 1JU2A 2FJEA 4DSGA 4Z2RA 4O5UA 2GRTA 1D4DA 1KSUA 2YG7A 1K0JA 4B67A 2BXSA 1F6MA 1DOBA 3UKLA 4RG4A 4CCQA 4UP3A 4C74A 1B8SA 4X9NA 1NPXA 2BK4A 1ELIA 4B63A 4U8JA 4Y4LA 1LVLA 4TM3A 4J31A 2WOIA 3FBSA 2GEWA 3LB8A 3RP8A 4YKFA 1EL9A 2FJAA 1EL5A 4C5OA 2A8XA 3EPTA 4AP3A 4GDEA 1H82A 4M52A 2GB0A 2PYXA 4H4QA 4JNQA 4K22A 4YT0A 1GALA 2CVJA 3AD8B 4AOXA 1K0LA 1BF3A 1XDIA 4DNAA 1PBFA 5U25A 2WU5A 2WESA 3KD9A 4H50A 1ZDLA 1GERA 4ECHA 2YVGA 4BJZA 2RABA 1XANA 3G5QA 3VR8A 1ZK7A 2GQFA 3KU9A 3AD7B 2XLUA 3DJEA 1S2YA 3LOVA 2XDOA 3DK8A 1ZMCA 4MJWA 3UOXA 4OPUA 4YTNA 2YQUA 3NLCA 4H7UA 3KLJA 4B1BA 3ZYXA 3C4AA 2XFNA 3FMWA 4DSHA 3QSSA 4C3YA 3QSMA 2IVEA 1KFYA 4BJYA 2WOVA 4APNA 5M10A 3I6DA 5HXIA 2YR4A 1UKVG 4X9MA 4J33A 1K0IA 1GT8A 4NEWA 3AE4A 1BGNA 1RYIA 3AEDA 2GF3A 3AEFA 1CC6A 1Q9IA 3G5SA 4K8DA 4YSXA 4H4SA 1PXCA 3EAOA 3UKHA 2HQMA 2JAEA 4CRTA 5HY5A 2ZZBA 3SQPA 3ISHA 3COXA 1SEZA 1NG4A 3R9UA 5KRQA 1REOA 3VQRA 1BGJA 1ZY8A 3O0HA 4WX1A 3K7QX 2FJBA 3NT6A 4EMIA 3NH3X 4J2WA 2XLTA 1FOHA 2OA1A 3BNMA 1PJ7A 1FEAA 2XLRA 4TM0A 2VOUA 4ZCCA 4HB9A 1F8SA 4RSLA 4Z2UA 4Z44A 2YR6A 1H81A 1VDCA 3CGBA 3AE2A 4TLXA 4YTPA 2ZBWA 3NIXA 1Y56A 4JY2A 2CDUA 3EF6A 1LQUA 2WP9A 1KSSA 3BNUA 4GDPA 2YG3A 2H88A 3KA7A 1S3BA 4UDRA 1L0VA 1GNDA 1E6EA 3ABVA 4YSYA 1TDFA 4J36A 3SM8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4A9WA 2HT9A 2EIRA 5EB4A 1ZKQA 1E2YA 4YH2A 3ZREA 3GSTA 5CREA 1UN2A 2C70A 2B9XA 2GDRA 4ICYA 2AUVA 3DK4A 1CJ3A 2HXKA 4XTSA 3HZLA 4EF0A 1QJDA 1DUGA 3SGLA 4EQRA 2BC1A 2E7PA 3QFBA 1E1KA 5DBJA 2MMAA 1IUUA 2R0GA 1ZYNA 1GUKA 2UZ8A 2VCVA 3NRNA 2L59A 4NTCA 5HFIA 3B3RA 3E3EA 4OCFA 4FDCB 3Q6JA 4MPFA 2YR5A 4IQ1A 1IUWA 2OAMA 4O7HA 3M0FA 3TOTA 3H8LA 2JSZA 5D9WA 1B9YC 2YAUA 3L9VA 3RPPA 1FECA 3TKPA 5DALA 3QJ4A 4WKWA 5C2TA 1E39A 3UP4A 3AWIA 1YKAA 3GTUB 4MF5A 4IA5A 2EQ9A 4EQXA 3IK7A 4RQXA 3AE6A 1J08A 3CMIA 2VOCA 2DIYA 3IDVA 1FL2A 2HSHA 2YWMA 3CRTA 2J9HA 2TMDA 1NENA 3DGHA 1YEXA 1G7EA 1TDEA 1RK4A 1F2EA 3C7MA 5G2ZA 2BRYA 5EBKA 3MIXA 4O5QA 2NBSA 5E4WA 1TKDB 3TRQA 2YWLA 1CJ4A 2CULA 4I58A 3TDGA 3QAVA 4OFTA 1XW9A 3VPTA 5HR1A 2RUEA 3APSA 2XLSA 2YLWA 2C72A 1K0MA 3RDWA 4BIKA 1W4VA 4GSNA 5IMVA 4G74A 1XOBA 1PMTA 5ECIB 1C72A 4JDRA 1BX9A 4YSHA 4JZQA 3CNDA 2VCTA 2XC2A 3PPUA 2N5BA 2ON7A 3GX0A 4CDOA 1KDGA 3C1RA 2KUCA 1AQWA 5G1KA 3WT2A 2FHEA 1ZCPA 2C3QA 4PUFC 3V3NA 2PERA 1F3AA 1GUMA 5FS6A 1ERVA 1M6IA 1R7HA 1PKZA 1QLBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4A9W A;  2HT9 A;  2EIR A;  5EB4 A;  1ZKQ A;  1E2Y A;  4YH2 A;  3ZRE A;  3GST A;  5CRE A;  1UN2 A;  2C70 A;  2B9X A;  2GDR A;  4ICY A;  2AUV A;  3DK4 A;  1CJ3 A;  2HXK A;  4XTS A;  3HZL A;  4EF0 A;  1QJD A;  1DUG A;  3SGL A;  4EQR A;  2BC1 A;  2E7P A;  3QFB A;  1E1K A;  5DBJ A;  2MMA A;  1IUU A;  2R0G A;  1ZYN A;  1GUK A;  2UZ8 A;  2VCV A;  3NRN A;  2L59 A;  4NTC A;  5HFI A;  3B3R A;  3E3E A;  4OCF A;  4FDC B;  3Q6J A;  4MPF A;  2YR5 A;  4IQ1 A;  1IUW A;  2OAM A;  4O7H A;  3M0F A;  3TOT A;  3H8L A;  2JSZ A;  5D9W A;  1B9Y C;  2YAU A;  3L9V A;  3RPP A;  1FEC A;  3TKP A;  5DAL A;  3QJ4 A;  4WKW A;  5C2T A;  1E39 A;  3UP4 A;  3AWI A;  1YKA A;  3GTU B;  4MF5 A;  4IA5 A;  2EQ9 A;  4EQX A;  3IK7 A;  4RQX A;  3AE6 A;  1J08 A;  3CMI A;  2VOC A;  2DIY A;  3IDV A;  1FL2 A;  2HSH A;  2YWM A;  3CRT A;  2J9H A;  2TMD A;  1NEN A;  3DGH A;  1YEX A;  1G7E A;  1TDE A;  1RK4 A;  1F2E A;  3C7M A;  5G2Z A;  2BRY A;  5EBK A;  3MIX A;  4O5Q A;  2NBS A;  5E4W A;  1TKD B;  3TRQ A;  2YWL A;  1CJ4 A;  2CUL A;  4I58 A; 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