4CY6 | Genus

Total Genus 181

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	181
sequence length	582
structure length	561
Chain Sequence	SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution. pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus	181
structure length	561
sequence length	582
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date	2014-04-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4cy6A03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4cy6A01

4C3XA 3DK8A 2YLZA 1PHHA 4K8DA 4Y4LA 2AR8A 4I59A 1PXCA 2Q7VA 3UKLA 4CBQA 3HZLA 4H2PA 1F6MA 4BJYA 4J34A 3K7TA 3GRSA 4TM0A 4EMWA 4EQXA 2Z5YA 3EPTA 3ZDNA 3UTFA 3AE9A 2OAMA 2XVEA 2C75A 3AE2A 1Y56A 4FK1C 3AXBA 5GSNA 1H7WA 3AYLA 5KVHA 2YLTA 3CGCA 3NLCA 2VRMA 3SQPA 3UP5A 1OJCA 4YSHA 3CNJA 4YXDA 5HXIA 2JB2A 3E1TA 4RSLA 4AT0A 2BCGG 3II4A 4AP1A 1PXAA 1KNPA 4JQ9A 2H88A 3BI4A 1FEBA 1JOAA 2PHHA 4JY3A 1IUWA 2W0HA 3LADA 4BK2A 4ICYA 3ALMA 4J33A 1DNCA 1TYPA 2QCUA 3B3RA 4GF7A 4Z2RA 3AEFA 4U8OA 3GWFA 4GCMA 2GAGB 4ZCDA 2E1MA 2NPXA 1BWCA 2R0PA 3DGHA 4EIPA 1Q9IA 3GYJA 3PO7A 5M10A 2FBWA 3QSSA 1B37A 3URHA 2GVCA 3CGEA 4TLZA 3KD9A 4X4JA 1V59A 4B69A 2I0ZA 1REOA 1FEAA 1PJ6A 1ONFA 1QO8A 4NZHA 1L9EA 2CVJA 4U8IA 1CHUA 2ARDA 3AE3A 2DKHA 4U8NA 1O94A 4ZN0A 1ZP0A 4U2LA 2HQMA 2FJDA 4FK1A 2QA2A 2BS2A 1ELIA 1X31B 3FMWA 2C3CA 2NVKX 1JRXA 1B8SA 3VRBA 4FDCB 4B63A 1BGJA 4H4ZA 2V61A 4BV6A 2BXSA 2C70A 1E1MA 4A6NB 1P2EA 2YR4A 2B9XA 1XANA 2X50A 2XLUA 2BCPA 5U63A 3D8XA 1H86A 1CC2A 2XVHA 1DOEA 5JCIA 1Y0PA 1H83A 5IPYA 4H4RA 2A87A 4LU6A 1GOSA 3AYJA 2GR1A 3DK4A 3LB8A 3COXA 1YQ3A 2XFOA 2GMHA 1ZKQA 4H4XA 2CDUA 3C96A 3UKAA 4H4WA 2VZ2A 3UP4A 2C7GA 4XWZA 2TMDA 2WP6A 3UOVA 2C65A 4XWRA 2APGA 4H4UA 3NRNA 1P2HA 5EBKA 2OA1A 2V6OA 1OJTA 2VQ7A 3ICTA 1GRTA 3NK2X 3P4SA 2JKCA 3CPJG 4Z2UA 3LXDA 2GV8A 2XFNA 3AE6A 2V3AA 2E5VA 2B7SA 2WP5A 3CGDA 2PYXA 4K5SA 1VRQB 2C72A 4JDRA 4B68A 4DSGA 4YKFA 3M0OA 2WBAA 3UKFA 3CN8A 4K22A 3NIXA 4K5RA 2YQUA 3BNUA 1L9DA 2R4JA 3AEBA 4FX9A 4CRTA 4USQA 1GETA 2ZBWA 3NG7X 2R0CA 4NEVA 3ALLA 2GR3A 2AQJA 3GYIA 4Z26A 4I58A 3DGZA 3IC9A 2Y6QA 2OLOA 3NN6X 2YVGA 1RSGA 1D5TA 3ICRA 1GRBA 1K4QA 5JCKA 3I6DA 4U8JA 1NAAA 3SFEA 3AD8B 5LV9A 2TPRA 3JSKA 4TM3A 3V3NA 2GRTA 2XFPA 1GXFA 1OJAA 1NENA 1YY5A 3O0HA 3AE8A 4AP3A 4B66A 1TRBA 1SEZA 1BGNA 4TM1A 1NHQA 3AWIA 3D1CA 3CPIG 4TLXA 4AT2A 4J36A 2B9WA 4Y4NA 1JRZA 5HYMA 1PN0A 2R4EA 1VG9A 2V5ZA 4GRTA 4B1BA 1CJ3A 1D4EA 2JB1A 2XLRA 1D7LA 4H4PA 1XDIA 1QJDA 3P4RA 3KLJA 4NEWA 3CNPA 2GQWA 3BI2A 4YSZA 4NTEA 3H8LA 2ZZ0A 3KKJA 3SFDA 4YSXA 1LTXR 1IUSA 3AEEA 4USRA 3GD3A 4Z24A 2Y6RA 1GNDA 2WPFA 1H84A 4JY2A 2BABA 1TDNA 4J56A 2IVDA 4H4TA 3DJGX 4BURA 2C64A 3H8IA 4O5UA 3L1RA 1YQ4A 3LOVA 4RG3A 4XXGA 3GDNA 4A9WA 1ZX9A 2BK4A 3AEGA 3LJPA 4IVMB 3CGBA 2CFYA 5JCMA 1PXBA 1EL9A 1NEKA 3CNSA 2OLNA 1N4WA 2YLWA 1JEHA 4P9SA 4X9MA 4OVIA 5FMHA 5HHFA 1E6EA 2YVFA 3BHFA 1Z6LA 3AECA 5GRTA 4Z2TA 2WDVA 4EQWA 1F8WA 3S61A 2DKIA 2WPEA 2UZZA 3LZWA 4UDQA 1O95A 2Q0KA 2R46A 3AD7B 5FS9A 2XVFA 2YLRA 3AE5A 3UOYA 3UOXA 1ZOVA 3VR8A 3DA1A 1GRFA 3CPHG 1KFYA 3LZXA 4RG4A 2GR2A 3F8RA 3EAOA 5IQ1A 3T37A 1AOGA 4DNAA 4M52A 4UDPA 1PBCA 4ZCCA 4YWOA 3P9UA 1FECA 3P4PA 1FOHA 2RGJA 3C4AA 3S5WA 5KOWA 3SGLA 1KSSA 2YWLA 3NTAA 1NDAA 4ADWA 3RP6A 1BKWA 2GB0A 3CIRA 5ER0A 3VRAA 3P1WA 2GH5A 4YTPA 2CULA 2VVMA 2QA1A 1M6IA 1CL0A 3AYIA 4OCGA 3G5SA 1CBOA 1H81A 5EOWA 4C74A 5EB4A 3QSMA 2XLSA 2A89A 4A79A 3ADAB 1GT8A 3NYEA 5FS7A 4HA6A 2EQ6A 3ABVA 5BULA 4GR1A 4U8MA 4PABA 3B6DA 2YLSA 5HY5A 4B65A 1XHCA 5KWFA 1JNRA 4C5OA 1EBDA 3BI5A 3ALJA 3RP8A 2YG7A 2XYOA 4LA1A 1HYUA 2FJBA 1CJ2A 2ACZA 3F8PA 3NNEA 1CC6A 1GEUA 1RP0A 4TM4A 1EL5A 2EQ9A 2GAHB 5M0ZA 2YG4A 5U25A 2C76A 2R45A 3KU9A 3AD9B 1GALA 1YKJA 4U2TA 1QLBA 4EM4A 3QFBA 4A65A 1OJ9A 2YG5A 1GTEA 2WS3A 1CJ4A 4BJZA 1UKVG 5JCNA 3PVCA 4OPCA 1MXTA 2WHDA 3IF9A 4IA5A 2YR6A 3RNMA 1IJHA 1DJNA 1GPEA 3M13A 4WX1A 2YM2A 4YT0A 2X8CA 1LPFA 2J3NA 1E7PA 1Y56B 1E1KA 2C3DA 3GMCA 1LQTA 2EQ7A 2BK3A 3AE4A 3NHOX 4EM3A 4O5QA 1ZOYA 2XFUA 1GREA 5TR3A 1FL2A 4CNJA 3UTEA 1N4VA 1VDCA 1L0VA 4EQSA 3DJDA 2WQYA 2Q0LA 3RHAA 4EMIA 4EQRA 1ZMDA 3CNDA 2JBVA 5FS6A 4Z44A 5DBJA 4A5LA 3Q9TA 2YM1A 1PS9A 4YKGA 4B64A 1Q1RA 2BACA 1GRAA 5KVIA 3UKKA 4B67A 3IHGA 4CY6A 1B5QA 1PBEA 1GRHA 2WESA 4K7ZA 1NHSA 1D4CA 2BC0A 2B76A 4D03A 3M12A 3NTDA 2WEUA 3NT6A 4REKA 4A6NA 2QAEA 2RABA 3NK0X 5J60A 4C77A 4J2WA 4GDPA 4H4SA 4HB9A 2IVEA 2R0GA 4E0VA 3K30A 5EB5A 4KPRA 4IA6A 1PBBA 2XFQA 3KA7A 2WOVA 4D04A 1LJ1A 5L46A 1LV0A 4GDEA 4OPUA 5C2TA 4KX6A 3NYCA 1ZDLA 3P4QA 2XDOA 4H2NA 4JNQA 4OPGA 3DH9A 4DSHA 2XVJA 5FS8A 2JAEA 1H7XA 3DJJA 1DOCA 2WOWA 4YTMA 4WCTA 2C66A 1TYTA 1F8SA 1S3EA 5IQ4A 1PJ5A 2WU5A 2BYBA 2GR0A 1E1LA 2X8GA 1O5WA 3GRTA 3EANA 1FCDA 3CNTA 3Q6JA 1NHRA 4NTCA 1GERA 1LQUA 2IIDA 2WOIA 2V3BA 1K0JA 3UKHA 2B7RA 3AE1A 4A7AA 1K0IA 2GMJA 2YAUA 3QVPA 3GWDA 1N4UA 4LIIA 4CNKA 5BUKA 1BF3A 3QSEA 2O9ZA 2WETA 3I3LA 3WE0A 2WU2A 1D4DA 3DMEA 2Q6UA 3L8KA 2VRLA 1DOBA 1N1PA 1YQZA 1F3PA 1EL8A 1KNRA 3K7QX 3AE7A 3FBSA 5JCLA 5U1OA 3GD4A 3NN0X 4YTNA 2GEWA 3NKSA 1B4VA 4APNA 4X9NA 2V60A 1E1NA 2BS3A 3V3OA 2H89A 4H2RA 2XCGA 1JNZA 4UP3A 2GQFA 1L9CA 4N9XA 1IUVA 1D7YA 1M64A 2XVIA 2GF3A 2YLXA 2RGHA 5C3JA 1IUXA 3UCLA 1TDFA 2C67A 3ZYXA 2OALA 3G5QA 4H4YA 1ZY8A 1E39A 4Y4MA 3OC4A 2FJEA 4BK3A 1Q1WA 4Z25A 4ECHA 2XLTA 2BK5A 1VQWA 3PS9A 4U2SA 2JB3A 3EF6A 3NH3X 1NPXA 4U8LA 1S2YA 4H4QA 1DODA 3DK9A 1DXLA 3FIMB 4CY8A 1NHPA 5KRQA 3ICSA 1IUTA 3AEDA 5KXJA 1KSUA 1PBFA 4K2XA 1MOKA 2A8XA 1GSNA 3NYFA 2VVLG 1KDGA 3VRDB 1PJ7A 2JK6A 4H50A 2ZZCA 1CC4A 1K0LA 1NG4A 3ITJA 3NGCX 4H7UA 3UOZA 3F8DA 2X3NA 1TDEA 4YSYA 1BZLA 2FJAA 1LVLA 2ZZBA 4EIQA 1COYA 1NG3A 3ISHA 3KPFA 3V76A 4JNAA 4CCQA 3H4KA 1IUUA 1JU2A 3ATQA 3C4NA 3RP7A 4J57A 1F8RA 3QFAA 2X99A 1KF6A 1S3BA 4A99A 1OJDA 4C3YA 2RGOA 3GMBA 1TDOA 2WPCA 5BVAA 2VQBA 4UDRA 3OZ2A 5BRTA 3R9UA 1DJQA 4EMJA 2VVLA 2B9YA 1RYIA 2BS4A 2YG3A 4Z43A 5J7XA 3AB1A 1GRGA 3BNMA 1H82A 1W4XA 3GSIA 4U8PA 1TDKA 3GDPA 4IV9A 2WDRA 4J31A 4U8KA 3SM8A 4CCRA 4H2QA 1PDHA 1XPQA 1ZK7A 2X8HA 1VG0A 3FPZA 3UKPA 1GTHA 4MJWA 1H6VA 1MO9A 5KOXA 2VOUA 3AEAA 3IHMA 4OPIA 2C73A 2BXRA 3G5RA 4IVOB 2Z5XA 4OPDA 1S2QA 2YG6A 3QJ4A 4H4VA 4AOXA 4PAAA 2EQ8A 3K7MX 4NTDA 1PBDA 3VR9A 4AOSA 2AAQA 3IWAA 3ATRA 1CJCA 3KVEA 3VQRA 2E4GA 2R9ZA 1CF3A 2WP9A 2F5ZA 3DJEA 3BHKA 2BA9A 3CTYA 2YR5A 4GUVA 1ZMCA 3UTHA 1EL7A 1GV4A 4JN9A 3UKQA 4DGKA 2WDQA 4BK1A 5CKUA 2XLPA 3REDA 2YVJA 3FG2P 4OPLA 5CQFA 3QVRA 3UTGA 1JRYA 4OPTA 2BC1A 3NK1X 1GESA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4PX1A 3DK8A 3KH7A 1F3BA 2YLZA 5EL8A 4Y4LA 2Q7VA 6GSSA 1SKWB 2GGTA 1XWKA 3PPUA 5ECHB 1GRXA 4N10A 4NWZA 1A2JA 4MF7A 1F6MA 2HZFA 2CAQA 3GRSA 4EQXA 3AE9A 5IO0A 4KGIA 5GSNA 5KVHA 3CGCA 2VRMA 3UP5A 3CNJA 1E2YA 2JB2A 3E1TA 4EKZA 1KNPA 3A5WA 4JY3A 1IUWA 4EF0A 3IOSA 5ENUA 1ZCPA 1DNCA 1TYPA 3T2YA 1XBSA 4GF7A 3UL3A 2GVPA 4Z2RA 2E1MA 2R0PA 3DGHA 1T8EB 1G0TA 3Q18A 3IV4A 3GYJA 3LYKA 2FBWA 2I1UA 2NVLA 4TLZA 3LSZA 4X4JA 1V59A 4B69A 1MD3A 4ZB6A 4BVXB 1OE8A 4NZHA 1XOAA 2PWJA 1L9EA 3GURA 1JHBA 4WETA 4E8HA 2B1KA 2ARDA 2H70A 4ZN0A 1S3CA 2I4AA 2C3NA 4FK1A 1IYIA 3VRBA 3ERWA 4FDCB 3D6IA 1BGJA 4A6NB 1XPVA 2B9XA 4KW6A 2LUSA 5KN1A 2I9HA 1DOEA 1Y0PA 2H1BA 1FVKA 1GSYA 5JWQB 4H4RA 4G6HA 1OAZA 4N30A 1YQ3A 4XRAA 4J56E 1ZKQA 3UIWA 4HOJA 3UP4A 2TMDA 4YAPA 4JE1A 2V6OA 1OJTA 3T14A 4ZL7A 4IP1A 5IMVA 3P4SA 20GSA 4Z2UA 3WT2A 5D9XA 4QL9A 5IM9A 2E5VA 1TRWA 2PYXA 4JDRA 1VRQB 2VCWA 1A0FA 4YKFA 1M2DA 4GTUA 3UKFA 4K7IA 3KGKA 4G10A 2YQUA 2FWGA 2R4JA 2LRNA 3NZNA 1SL0B 3APSA 3GHAA 3QAWA 4TR1B 2AQJA 3GYIA 3IC9A 2YJHA 2H6YA 2YVGA 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3KU9A 3AD9B 1AXDA 4ZBAA 1ERWA 2YG5A 2WS3A 4PQIA 5ECOB 3ZL5A 2FWEA 3LFLA 2V6KA 1M7TA 2YZUA 1GPEA 4WX1A 4LL4B 3VWXA 2LV3A 2WJUA 2X8CA 1OYJA 4HS1A 1PRXA 1LPFA 1S3RA 1F2EA 1XWBA 1NHOA 2K18A 3QAVA 4HZ4A 3GMCA 1MDKA 1QUWA 3P90A 2EQ7A 4HQZA 3AE4A 4O5QA 3APQA 1ZOYA 1N4VA 1VDCA 1L0VA 3DJDA 3BCKA 4XIHA 1ZMDA 3CNDA 5FS6A 1XXUA 2PU9C 4A5LA 5J5NA 4K9ZA 3PINA 1GRAA 4B67A 3LG6A 4CY6A 1B5QA 3P2AA 2H0HA 2WESA 3CQFA 2WZ9A 1NHSA 1D4CA 4XS4B 4BWQA 1GNEA 1SENA 3GUSA 3IC8A 2DSAA 4EVMA 3LXTA 1AW9A 1B9YC 2R0GA 2XFQA 4D04A 5JCUA 4Q5NA 3WGXA 4OPUA 2B5XA 4KX6A 5C2TA 3RHBA 3NYCA 4JNQA 4KDXA 1JZRA 2C8UA 1DOCA 2WOWA 1T00A 1TW9A 2EIOA 2OKAA 2TIRA 5GSTA 1TYTA 1F8SA 2VCVA 4YQVA 4J57E 3HVVA 3NIVA 2GR0A 1O5WA 2FWFA 3CNTA 4NTCA 2PGTA 3I69A 1OVNA 2V3BA 1K0JA 1RQMA 3TKRA 3GWDA 5BUKA 1BF3A 5C00A 2WETA 4G9KA 3SZFA 6GSYA 2AUVA 3QFBC 4KH7A 3KEBA 1TDIA 4BWSA 4N0VA 1N1PA 4MABA 1F3PA 1X9MB 1KNRA 3GD4A 2DJ1A 4YTNA 3QFAC 3NKSA 2IWTA 2VL2A 4X9NA 2V60A 1ZYNA 4H2RA 3SY4A 2GQFA 4RI7A 4OCFA 1IUVA 4N9XA 1D7YA 3FZ5A 1A23A 2RGHA 5C3JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4CY6A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

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