4CY6A

Apo structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase hbpa
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
582
structure length
561
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
total genus 181
structure length 561
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy6A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy6A01
3EANA 1D7YA 4Z43A 4TM3A 3KLJA 3AE8A 2QA1A 1H86A 1GRGA 4U8MA 1Q9IA 4H4ZA 4A6NB 1CC2A 5U25A 5CKUA 4RG4A 1VG0A 4K2XA 3NT6A 3ALLA 2VQBA 1LVLA 1EL7A 1CBOA 1NAAA 3V3NA 4YSXA 3RP6A 2C75A 3DGZA 2YR5A 3AYIA 3UKKA 3O0HA 4OCGA 2GR1A 1ZOYA 2XVIA 1NHSA 3I6DA 4BJZA 1GT8A 1D4EA 1GREA 1YY5A 4YTPA 4CCQA 1IUSA 1RYIA 2V3AA 1H7WA 1O94A 1L9EA 5ER0A 1GEUA 2FBWA 3GD4A 4NTCA 2IVEA 2XLPA 3I3LA 3S5WA 1CC4A 3GDPA 1GTEA 1DXLA 1XDIA 1DJQA 2VVLA 1TYPA 1IUUA 2BCGG 4DGKA 5C3JA 5IQ1A 1PDHA 1GRHA 5IPYA 1DOBA 2X3NA 2XVJA 3M0OA 2GAHB 3CTYA 2B7RA 4K7ZA 3CPIG 1TDNA 5L46A 5GSNA 4GF7A 1GETA 4B65A 1GESA 1GRTA 2F5ZA 3DJEA 4J33A 4BK1A 1GSNA 3UKQA 2WETA 1ONFA 2RGJA 5KXJA 4OVIA 2Q6UA 2ZZCA 2QCUA 3C4NA 4N9XA 4X9MA 4TM1A 4H4TA 3NTAA 1Y0PA 2C65A 2XCGA 3ATQA 3IF9A 1NEKA 3UKPA 4U2SA 3BI2A 3COXA 1KSUA 3C96A 1VDCA 2EQ7A 1BZLA 1XANA 2WU2A 1ZP0A 3LADA 1M6IA 1PXAA 4H2RA 2R4JA 4IVOB 4Y4NA 1YQZA 4EM3A 2OLOA 4K22A 1RSGA 1HYUA 3DK9A 3ICTA 1PBEA 3DK4A 1F6MA 4EQWA 2VRMA 4FK1A 1QO8A 3URHA 5J7XA 3NG7X 3QSSA 1D4DA 4CBQA 2C7GA 3CNJA 1H83A 1E39A 4H4PA 4ZCCA 2B9YA 2R45A 2C76A 3VR8A 3AEEA 2BACA 4H4XA 1XPQA 1ZK7A 4U8KA 3NN6X 4GRTA 1NHPA 3NGCX 4NEWA 4H4RA 1TDOA 1ZDLA 2CVJA 3FIMB 3UOVA 1MO9A 3SFDA 2VQ7A 4NZHA 4D03A 3G5RA 3DGHA 2A8XA 1KNRA 2WHDA 3QFBA 4TM0A 4C74A 3ICRA 3RP8A 4DSGA 2C64A 2R4EA 2WESA 3AD8B 4J34A 4U8NA 3REDA 2XVEA 1YQ3A 3LZXA 2YLXA 3EAOA 3GYJA 1K0JA 3AE6A 3L1RA 4JY3A 4OPIA 2WP5A 3NNEA 1EL5A 1YQ4A 2WP9A 3UOYA 2BXSA 5FS7A 1N4UA 4P9SA 1F8RA 2GH5A 2Y6RA 2BC1A 2BK3A 3AB1A 3G5SA 2QAEA 1JNZA 2Z5XA 3NTDA 3UTFA 5JCKA 4A7AA 1IUTA 1LV0A 3VRDB 2XDOA 3VRAA 5M10A 2RGHA 3NK0X 3PO7A 1MOKA 3AE2A 3KPFA 1RP0A 3AEBA 4A79A 3UP5A 3KD9A 2V3BA 1LQUA 2E5VA 3C4AA 3NHOX 4FK1C 4IA6A 3GMCA 4YTMA 1GPEA 4JDRA 4GR1A 1GXFA 1FEAA 2GF3A 4PAAA 3AEFA 2R0GA 2DKIA 1PBDA 4OPCA 1Y56B 2WP6A 3NYEA 4WX1A 3IHMA 4H4SA 2NVKX 2TPRA 1AOGA 1NPXA 4H4YA 1ZMCA 4FX9A 4UDQA 2YLTA 1E1KA 2YG5A 2WS3A 3LOVA 3P9UA 2FJDA 2VRLA 4OPTA 1S3EA 2BS4A 1P2EA 3BHFA 3DMEA 4WCTA 3VRBA 4C3XA 4KPRA 4EQRA 1NENA 3G5QA 4U2TA 2ACZA 2WOIA 2ARDA 2CDUA 4RSLA 5EB5A 2WOVA 1L9DA 5HHFA 1GRFA 1GERA 2BA9A 2QA2A 2GQWA 3NRNA 1EL9A 1CJ4A 2FJAA 3LB8A 1COYA 2XFUA 3NN0X 1QLBA 2WDQA 4NEVA 3D8XA 1BF3A 2EQ9A 2XFQA 3GMBA 4J31A 1IUWA 1D7LA 1OJ9A 3CGCA 1B8SA 4OPDA 4U8OA 4UP3A 5DBJA 5KVIA 1L0VA 4CY8A 1CF3A 2XFNA 1F8SA 4LIIA 4EIPA 1JU2A 3IC9A 4LA1A 1KF6A 1DODA 3PS9A 2Q0KA 4BV6A 3FMWA 1ZX9A 3BI4A 3F8DA 1CJ2A 2YM2A 3BHKA 4H7UA 2BXRA 1NG3A 3SM8A 1VRQB 2JKCA 4H4WA 2V5ZA 3P4SA 1L9CA 4A6NA 4B63A 4J2WA 2B7SA 4EMIA 4YTNA 1GRAA 1O95A 2AAQA 3RHAA 2PYXA 2Y6QA 4U8LA 4U8IA 4ICYA 4UDPA 4Y4LA 3EF6A 3LJPA 5FMHA 1B5QA 4A5LA 4AP1A 1JRZA 3GRSA 4IV9A 3DH9A 3B3RA 4LU6A 2YQUA 3KVEA 4C3YA 1CJCA 3UKLA 3UTGA 1TDKA 1K0LA 2A87A 1PXCA 3L8KA 3GYIA 4RG3A 4JY2A 1JNRA 3B6DA 4K8DA 4H4UA 5EOWA 2XLUA 3AWIA 2JK6A 3QJ4A 3RNMA 1TYTA 3NK2X 4YKFA 2VOUA 3V3OA 1D4CA 3CPJG 2C3DA 3Q9TA 4TLZA 3AE7A 4Z2UA 2BC0A 4BURA 4GCMA 1Y56A 2V61A 4J36A 3R9UA 5BUKA 1MXTA 4I59A 1FOHA 3PVCA 1S2QA 4X9NA 1CL0A 3F8RA 3VR9A 4Z24A 1V59A 4Z25A 2WBAA 2E4GA 1OJAA 4NTDA 4USQA 2WDRA 5JCLA 2Z5YA 1S3BA 3AE4A 4NTEA 1JEHA 2YLRA 1GOSA 2C67A 2YM1A 2JB2A 3UCLA 4GDEA 2WEUA 2X99A 4C5OA 4EQXA 3GSIA 4YSHA 1JOAA 1PS9A 1ZY8A 3KKJA 3P4PA 1ELIA 3AE5A 1VQWA 3DJDA 4PABA 4H2PA 1E1NA 2GMHA 4YSZA 3AYJA 4JN9A 4XXGA 2YLWA 4JNAA 5TR3A 4DNAA 3P4QA 3H4KA 2J3NA 4FDCB 3LXDA 4Z44A 2GR3A 4JQ9A 3IHGA 1PBCA 3AEGA 2YVFA 3NK1X 1IJHA 4XWRA 2YWLA 3M13A 1GNDA 1JRYA 4BK3A 1M64A 2ZZBA 4OPGA 4IVMB 1ZMDA 2FJEA 5U1OA 4B1BA 2XLSA 4CNKA 4ZN0A 3K7TA 4HB9A 1FECA 4H4QA 3GDNA 1JRXA 5KRQA 3DK8A 2IVDA 2YR6A 2Q0LA 2I0ZA 3CGDA 4U8JA 1NG4A 2OA1A 3GRTA 2OAMA 4B69A 1F8WA 1LQTA 3AE3A 5FS8A 4ZCDA 2R0PA 3OC4A 3II4A 4O5QA 5BRTA 4K5RA 3H8IA 4YXDA 2Q7VA 2WPFA 1OJTA 4AP3A 2X8HA 3NLCA 1XHCA 2GR0A 2HQMA 3AE9A 3QVPA 3ZYXA 3K30A 4Z2RA 3FPZA 1GRBA 2BK4A 3Q6JA 3ABVA 4GDPA 1DJNA 2WQYA 4EIQA 3LZWA 1OJCA 1K0IA 4ECHA 2E1MA 1Q1WA 1LTXR 3ISHA 3NYFA 4AOSA 4B64A 4Z2TA 2WPEA 4YSYA 2NPXA 3AYLA 3CIRA 1CC6A 4YT0A 5LV9A 2GQFA 1SEZA 3KA7A 2X8GA 2RGOA 2JBVA 3S61A 4AT0A 4K5SA 2X50A 4CRTA 1KDGA 1PXBA 5KVHA 4MJWA 3CNTA 3E1TA 3P4RA 2B9WA 4YKGA 5KOXA 1N4VA 1PJ7A 2GR2A 3GWFA 1GALA 3AD7B 4X4JA 4B67A 5HXIA 2C70A 3H8LA 1FL2A 3AXBA 4A65A 1OJDA 3DJJA 1H82A 2GVCA 1PJ5A 1Q1RA 3K7MX 3ZDNA 1NDAA 2XFOA 2YVJA 4OPUA 1LJ1A 3WE0A 1KSSA 1BWCA 5FS9A 3UP4A 3QFAA 5HYMA 1H7XA 2PHHA 1N1PA 3ATRA 1IUVA 4YWOA 3AD9B 3KU9A 1Z6LA 3RP7A 2YG7A 4O5UA 5HY5A 4BK2A 1PN0A 4DSHA 2JB1A 1PJ6A 3AEAA 1TRBA 2VZ2A 3P1WA 3UKFA 4AOXA 2AR8A 3SFEA 3AEDA 1S2YA 1DOEA 2XFPA 3IWAA 4IA5A 1TDEA 3FG2P 4A9WA 3ICSA 5JCNA 3ADAB 3UOXA 1F3PA 1BGNA 3GD3A 4USRA 1QJDA 3CNDA 2BYBA 5FS6A 3HZLA 3OZ2A 4U2LA 5EB4A 4Z26A 5J60A 1FEBA 3QVRA 1YKJA 3NYCA 2YR4A 1GTHA 3UKHA 2ZZ0A 1BKWA 2GB0A 2R9ZA 3NH3X 1H6VA 2B76A 2OLNA 4TLXA 2BK5A 2V6OA 1H81A 2XVHA 1E6EA 4ADWA 2JB3A 2WDVA 4H4VA 1EBDA 4H50A 1REOA 2O9ZA 2YAUA 3EPTA 4JNQA 3VQRA 1CJ3A 5CQFA 4C77A 3FBSA 5BVAA 5C2TA 3ITJA 3NIXA 2YG4A 2BS3A 2GRTA 2JAEA 1E7PA 2BCPA 3ALJA 1P2HA 1B37A 4J56A 2XYOA 4HA6A 2W0HA 1K4QA 1VG9A 3CGBA 1N4WA 2CULA 3UTEA 3ALMA 2VVMA 5KOWA 2GMJA 2DKHA 3T37A 1BGJA 4Y4MA 3AECA 1DOCA 3DJGX 2IIDA 4UDRA 4XWZA 4EMWA 3CGEA 3UKAA 4AT2A 5EBKA 1E1MA 1NHRA 5M0ZA 5JCIA 5KWFA 4B68A 2R0CA 2APGA 4APNA 1CHUA 2VVLG 4H2QA 2OALA 1KFYA 1TDFA 4U8PA 3CNSA 4I58A 1X31B 2RABA 1NHQA 1PHHA 4E0VA 4GUVA 2A89A 2UZZA 1PBFA 2YLZA 2B9XA 3F8PA 1DNCA 3M12A 1LPFA 1O5WA 3SQPA 5JCMA 1FCDA 5GRTA 5U63A 4J57A 3NKSA 1GV4A 2X8CA 3BI5A 5BULA 2H88A 3AE1A 2CFYA 4M52A 2C72A 1UKVG 1ZKQA 4CCRA 4CNJA 2AQJA 3SGLA 4BJYA 2BS2A 4A99A 1B4VA 4D04A 3BNMA 4EMJA 4EQSA 3QSEA 3QSMA 3GWDA 3D1CA 1IUXA 2XVFA 2R46A 4TM4A 2WPCA 3UTHA 4OPLA 5IQ4A 2XLRA 4B66A 3K7QX 2EQ8A 3CNPA 2XLTA 2C3CA 1ZOVA 2GAGB 4EM4A 2YG6A 3CN8A 3BNUA 3CPHG 2C73A 2WU5A 3DA1A 4KX6A 1EL8A 2V60A 3UOZA 1D5TA 2C66A 2GEWA 1W4XA 2YVGA 2FJBA 2TMDA 2EQ6A 1E1LA 1KNPA 2GV8A 2WOWA 2YG3A 3JSKA 4H2NA 4REKA 2H89A 1H84A 2YLSA 2ZBWA 3V76A 2BABA 4CY6A 1PBBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F8BA 2C0EA 2F8FA 1JLVA 4Z43A 1YZXA 2GSSA 3AE8A 2QA1A 4GXZA 3TKSC 1URMA 2VL2C 2O7KA 4NHWA 4RG4A 5G1KA 3NT6A 3IAS2 4G9KA 10GSA 4G6GA 1LVLA 4O92A 1PD21 1V9WA 2P5RA 1K0MA 2VM2A 4OCGA 2C3QA 5IO0A 3RHBA 1ZOYA 4BJZA 3O6TA 2CX3A 1NHYA 4F0BA 4CCQA 1ST9A 1OKDA 2V3AA 1EZKA 1H7WA 5ER0A 4USSA 1GEUA 1XWGA 4NTCA 2YCDA 4WBJA 2L5OA 1DXLA 5LD0A 2VVLA 4KDYA 4DGKA 5C3JA 1SENA 5IQ1A 2HRFA 5IPYA 1DOBA 2X3NA 2XVJA 3M0OA 3CRUA 1ZL9A 4WR5A 5JCUA 4B65A 2GS3A 4XHMA 1GSNA 4G0KA 2DSAA 1UVZA 2LNTA 2PMTA 4HJ2A 1Y0PA 2C65A 2H71A 3UKPA 4FYUA 3FR9A 3BI2A 2OE3A 3BD2A 1OKTA 1BZLA 2EQ7A 2WU2A 1CQHA 4H2RA 2WS2A 3IBHA 5LCZA 4EM3A 2OLOA 3DK9A 5D9XA 3HZ8A 3ICTA 1PBEA 2YZUA 3D4TA 3URHA 1IYHA 3NG7X 5J7XA 1QMVA 4CBQA 1H83A 1ERUA 3M1GA 4H4PA 1YDKA 3C73A 3CBUA 3ZZXA 4ZCCA 2B9YA 3ED3A 1MDJA 4LL4B 1RQMA 2BACA 3GFKA 1DE1A 1XPQA 4IP6A 1ZK7A 3NN6X 4ZXGA 1JLWA 12GSA 1ZDLA 1XFLA 2CVJA 3FIMB 5KN3A 1K3LA 2HYXA 4HQZA 2R4EA 1X9WB 1CQGA 2IPAA 3REDA 2XVEA 3LZXA 3I9V2 1JZOA 3GYJA 2CV4A 3AE6A 3KEBA 4OPIA 2WDUA 2WP5A 1FVKA 5J41A 2R37A 3AB1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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