4CY6A

Apo structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase hbpa
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
582
structure length
561
Chain Sequence
b'SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 181
structure length 561
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy6A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy6A01
1IUVA 1IJHA 2NPXA 3GRTA 2XDOA 3SQPA 1N4UA 4NEWA 4EQSA 3P4QA 4JY2A 1Q1RA 2YWLA 4YT0A 4YTNA 5FS8A 3AE4A 4A99A 1H7XA 3NYCA 4A9WA 2ZBWA 1DOEA 5FMHA 3UKLA 3FBSA 1JRXA 1IUTA 3C96A 3UTFA 4A79A 3AE1A 3AE9A 3CN8A 3BNUA 4ZN0A 2DKHA 2VOUA 1PBBA 1CJ4A 2C3DA 2IIDA 1FCDA 3I6DA 3CNDA 4AP3A 1Y56B 3P4RA 2E5VA 2NVKX 1P2EA 3EF6A 3VRDB 1KSUA 1GRGA 2X50A 1YQ3A 1NHSA 1BWCA 2Q0LA 4X4JA 3BHKA 4EMJA 3AE7A 1ZK7A 4PABA 1H86A 3AEAA 1KNRA 3GDNA 3BI4A 4Z2RA 3UKKA 1KF6A 2C76A 2B7RA 3AYLA 3M13A 1QO8A 5KVHA 4EMWA 3IWAA 4YSZA 3GYIA 3O0HA 4U2SA 2A8XA 3COXA 1JNRA 1Y0PA 2ZZBA 3UKAA 1Y56A 2Z5YA 4B65A 3ISHA 1PDHA 1D4EA 2RGHA 5HXIA 3V3NA 4FK1A 3DGZA 3VRBA 1TDOA 4JN9A 1PXCA 5JCLA 3KLJA 4BURA 4C5OA 3ALMA 3SFEA 1Q9IA 2YR5A 4Y4NA 5EB5A 4FK1C 3RP8A 3AEFA 1JEHA 2YAUA 3AD9B 1ZMDA 2YLTA 3DMEA 5HHFA 4EM4A 2FJAA 4BV6A 4IA5A 1GETA 3SGLA 2WU2A 5IPYA 3H4KA 4LA1A 1XHCA 2BCPA 2GR3A 2Y6QA 3ITJA 4JDRA 1K4QA 3LZWA 1JNZA 1E1LA 2FBWA 2VQBA 1OJCA 2QA1A 2XFNA 3UOYA 4E0VA 1TRBA 3V3OA 3E1TA 2XLUA 1GEUA 2BABA 1F6MA 4TM4A 1RYIA 2E4GA 1L9CA 2AQJA 4ZCCA 3KU9A 1H7WA 4EM3A 4YKGA 1GRBA 1UKVG 1K0LA 4B69A 1KNPA 2YM2A 4H2PA 3RP6A 4RG4A 4C77A 1GRHA 1ZOYA 1VG0A 4YWOA 2YR4A 4B68A 2WPFA 2VVLA 3LJPA 2YLXA 4J56A 1KSSA 1LJ1A 4NZHA 3AXBA 2FJBA 2WEUA 3M12A 3EANA 1BGJA 2XFUA 4DSHA 4I59A 2V3BA 2JB3A 2YLRA 2YVJA 3DK8A 4TM1A 3UOZA 2W0HA 5CQFA 2Q7VA 2X99A 2C66A 1TDKA 3UKHA 4AOXA 1DOCA 4EIQA 3ALJA 4A7AA 1JRYA 2HQMA 4REKA 4UDQA 4J2WA 3AE8A 4K7ZA 2GQFA 2V6OA 3KPFA 2OLOA 2TPRA 1GRFA 1PHHA 1CC2A 4U8KA 3IF9A 4UP3A 3QVPA 2YG4A 2B9XA 1KFYA 2YG5A 4ADWA 3CGCA 3BI2A 3VR9A 2GMHA 3K7TA 4I58A 4YKFA 2R0GA 2BXSA 1CJ3A 1S3BA 2AR8A 3K7QX 2JBVA 4B64A 1DOBA 2XVIA 4YTMA 4HA6A 1D4CA 3G5QA 1GV4A 1NAAA 3R9UA 1N4WA 3AECA 5GRTA 1YQ4A 4J57A 1CC6A 2FJDA 3B6DA 3C4AA 4RSLA 3PVCA 4UDPA 1EL9A 5KRQA 4H2QA 4TM3A 2GMJA 4U8LA 1CHUA 2YG7A 2XFPA 3PS9A 1JRZA 3GWFA 4AOSA 4K2XA 4LU6A 3REDA 3LADA 1REOA 3CGDA 2B76A 2CULA 2BS3A 1VQWA 3DK4A 3QFBA 4J31A 3CNJA 4OPLA 1ELIA 3VRAA 2WP5A 3UKPA 2R45A 4CBQA 4A5LA 1E6EA 2C70A 1TYPA 1GSNA 3UTHA 1TDEA 4C3XA 3DJDA 3FIMB 1NG4A 2BS2A 4K5SA 1IUSA 4Z43A 1N4VA 2I0ZA 1H6VA 2VVMA 2ARDA 4H4PA 3CGBA 1B37A 1TYTA 4H4XA 3AD8B 2X8HA 2GV8A 2WOIA 4Y4LA 5DBJA 2QCUA 3G5RA 3GD3A 1YKJA 1P2HA 5BRTA 1E1NA 1EBDA 1PJ7A 2JB1A 2GQWA 1GALA 2QAEA 2RABA 1XANA 2YVFA 3IHMA 3FMWA 3M0OA 1H82A 1XPQA 3L1RA 4GDPA 1YY5A 4JY3A 3D8XA 1OJTA 2H89A 3VR8A 1ZKQA 1F8WA 4Y4MA 2XVFA 4OPCA 3DA1A 4WX1A 1TDNA 4U8OA 3ALLA 1PS9A 4C74A 1Z6LA 1M64A 2XFOA 2C64A 3SM8A 3CTYA 4BJYA 3AD7B 4J33A 2XVEA 1E1KA 1NDAA 2XLSA 1AOGA 1B8SA 1D7LA 2V60A 3UTEA 4DSGA 1EL8A 1YQZA 3GWDA 4GCMA 3AE3A 3DJEA 3UP4A 5C3JA 1S3EA 2YG3A 4B66A 3Q9TA 3QFAA 4U8MA 3ICTA 2AAQA 1E39A 1MXTA 3GMCA 4NEVA 4OCGA 3NK1X 4Z25A 4Z24A 4CNJA 2BCGG 3NN6X 4GUVA 4APNA 4C3YA 2YVGA 1GPEA 3AE5A 1DJNA 1FECA 1PBFA 3UCLA 4AT0A 2WPCA 1DJQA 2VZ2A 5IQ4A 2R4EA 3QJ4A 4EIPA 1ZOVA 2OALA 4GR1A 1LQUA 3HZLA 1FEBA 1NEKA 1RP0A 2WOVA 2XCGA 5HY5A 2JAEA 3H8LA 2V5ZA 2X8GA 1NG3A 4EQWA 4X9MA 3P4SA 2GB0A 3F8RA 3ADAB 4BJZA 5GSNA 5J60A 2XVHA 4OPDA 4D04A 4DNAA 3T37A 2WOWA 2R0PA 3NK0X 3UOVA 4DGKA 2V61A 3NH3X 4U8JA 2TMDA 3RHAA 2VQ7A 3FPZA 1CL0A 2C7GA 4HB9A 4N9XA 5TR3A 4B63A 5U1OA 1MOKA 4H2RA 5J7XA 4EQRA 1Q1WA 1VDCA 2GR2A 2R46A 4U2LA 2E1MA 2GAGB 3AEGA 1NPXA 2VVLG 4U8PA 3OC4A 3SFDA 1TDFA 4BK2A 4Z44A 2J3NA 3CNTA 3CNPA 3BHFA 3BI5A 4GF7A 1PBCA 2XVJA 4JQ9A 1QJDA 3UTGA 3K7MX 3KA7A 1H84A 2BS4A 2BC1A 4PAAA 3EPTA 1BF3A 4GRTA 1BZLA 2WS3A 4EQXA 1ZDLA 1CBOA 2C73A 2Z5XA 2RGOA 1E1MA 3ATQA 3QSMA 2C65A 3ZYXA 5FS9A 2APGA 5JCMA 4XWZA 3GSIA 5ER0A 3DH9A 1GT8A 2YLZA 1GRAA 3FG2P 3NLCA 2XLRA 4OVIA 4P9SA 4TM0A 5KVIA 1GXFA 1X31B 3AYIA 4IA6A 4GDEA 4K22A 4U2TA 4WCTA 2EQ9A 1GTEA 5FS7A 4IVMB 1OJAA 2BYBA 1CF3A 5KOWA 1SEZA 1VG9A 2O9ZA 1ZP0A 3NG7X 2F5ZA 4IV9A 4D03A 4USRA 2PHHA 3G5SA 3PO7A 1H81A 3P1WA 4YSHA 1K0IA 2XLPA 2WDRA 1GREA 1L0VA 4YXDA 3AE6A 3ATRA 2X3NA 1B5QA 2R9ZA 4A65A 5BVAA 4XXGA 2GF3A 3GYJA 3AWIA 4O5QA 2WETA 2B9WA 5EOWA 2V3AA 1GRTA 1IUXA 3NT6A 5JCIA 3DJJA 1PXAA 4XWRA 4NTEA 5L46A 1S2QA 3LXDA 1O5WA 4CCQA 2Q0KA 1LPFA 3UOXA 1LQTA 1ZX9A 3C4NA 1NHQA 3NKSA 1JOAA 4TLXA 3UKFA 1EL7A 2WESA 3KD9A 4H4VA 3ICRA 2RGJA 5JCNA 2BA9A 3AB1A 2QA2A 2H88A 3F8DA 5EB4A 3UKQA 3QSSA 1F3PA 2CVJA 3GD4A 4H4QA 2XFQA 3NRNA 3CPJG 1PN0A 3NN0X 3QSEA 5BUKA 4OPTA 2ACZA 4OPGA 1DODA 2B7SA 3Q6JA 1O94A 2VRLA 2YR6A 5KOXA 1KDGA 4IVOB 2OA1A 4FDCB 2Q6UA 1NENA 4KPRA 4M52A 3NYFA 1O95A 4YSXA 3KKJA 4BK3A 2WP6A 2GH5A 3LOVA 4CY8A 1RSGA 2A89A 3VQRA 1L9EA 2R0CA 1N1PA 2C75A 2GEWA 4JNQA 4CNKA 2C67A 4J34A 4ECHA 4EMIA 1PBDA 3F8PA 2EQ7A 2DKIA 2EQ8A 4JNAA 1PBEA 3IC9A 4YTPA 4B1BA 4LIIA 5C2TA 5LV9A 4X9NA 4B67A 1VRQB 2UZZA 3NNEA 4YSYA 1V59A 4USQA 3S61A 2WDQA 3BNMA 3RNMA 4A6NB 2WQYA 3NIXA 1LVLA 3NTDA 3B3RA 2IVDA 3L8KA 3AEEA 1ZY8A 2WU5A 4U8NA 1F8RA 2YG6A 3KVEA 2YQUA 3GDPA 1COYA 2WBAA 2ZZCA 4H4YA 4AP1A 2A87A 4CRTA 1DNCA 5IQ1A 2BK5A 2PYXA 4H2NA 2C72A 3NGCX 3NYEA 3LB8A 3CNSA 2WP9A 3AYJA 5FS6A 2CDUA 1M6IA 4OPIA 2BK3A 2XLTA 4O5UA 4H4RA 3AEDA 1FL2A 4J36A 5M0ZA 4A6NA 4H4UA 4H4TA 2R4JA 2X8CA 3DJGX 2YM1A 3WE0A 1IUWA 1EL5A 1NHRA 5JCKA 2GAHB 5CKUA 1D5TA 1GNDA 2BC0A 4BK1A 2GVCA 3II4A 3GMBA 3ICSA 3QVRA 4ZCDA 2GR1A 1MO9A 3CPHG 1OJ9A 2OLNA 1FOHA 1IUUA 1ONFA 2JB2A 3K30A 3NTAA 2CFYA 1GOSA 2C3CA 1FEAA 2JK6A 2BXRA 1ZMCA 5KXJA 2VRMA 2ZZ0A 3D1CA 4H4WA 1DXLA 1XDIA 1S2YA 2WHDA 2WDVA 2BK4A 4H4SA 1HYUA 1LV0A 1E7PA 1QLBA 4MJWA 1OJDA 4NTDA 1F8SA 3I3LA 4ICYA 2BACA 1D7YA 3NK2X 4TLZA 5M10A 1H83A 2YLWA 2XYOA 2JKCA 2Y6RA 3EAOA 4Z2UA 4H50A 2B9YA 3V76A 2YLSA 3RP7A 1NHPA 3P4PA 1K0JA 1D4DA 4AT2A 4CY6A 4OPUA 1GTHA 1LTXR 3CPIG 4UDRA 1BKWA 1L9DA 2FJEA 3LZXA 1GESA 1GERA 4U8IA 3AEBA 3DGHA 4FX9A 4H4ZA 4Z26A 4K5RA 1CJCA 5BULA 2GRTA 3OZ2A 5U63A 5KWFA 1CJ2A 3ZDNA 3GRSA 5HYMA 3IHGA 4Z2TA 4RG3A 1W4XA 5EBKA 3DK9A 5U25A 4CCRA 1BGNA 2OAMA 3P9UA 3CIRA 4NTCA 3ABVA 1PJ6A 3CGEA 1B4VA 3AE2A 3H8IA 1CC4A 4K8DA 3UP5A 1JU2A 3NHOX 4H7UA 3URHA 4KX6A 2IVEA 2WPEA 2GR0A 3JSKA 3S5WA 2EQ6A 1PJ5A 1PXBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G0TA 1ZCPA 4ZBDA 2P31A 3L4NA 5KNLA 4EQSA 4JY2A 4YT0A 2YWLA 4YTNA 3LG6A 3AE4A 3T0KA 4OFNA 3FZ4A 2LKUA 4I2TA 1DOEA 3ZVJA 4HS1A 3WD6A 3FBSA 2B7JA 2WB9A 1IUTA 5DVBA 5D93A 3AE1A 2R37A 4OMVA 3WGXA 3BNUA 4ZN0A 2DKHA 2VOUA 4PQ1A 1CJ4A 1PBBA 2IIDA 1FCDA 1ZL9A 5E59A 2E5VA 3N9JA 4PABA 1ZK7A 2HRFA 2FWFA 1KNRA 3GDNA 1PGTA 2DJ2A 3UKKA 1KF6A 2XPEA 3AYLA 3W8SA 1O8WA 3M13A 3GYIA 1SJIA 1VGLA 3UKAA 2L5OA 3E3EA 4PQHA 1D4EA 5JCWA 4FK1A 4JN9A 4ID0A 1PXCA 3KLJA 4A5PA 1XVQA 3ALMA 1WRYA 4JEDA 1M9BA 2YPMA 5EB5A 4YH2A 4F2IA 3TDGA 4FK1C 4V2LA 1XIYA 4RI7A 3AEFA 2YCDA 1QGVA 2H0IA 1GWCA 3GTUB 1JEHA 1M2BA 2MMAA 4OCFA 3MIXA 2WU2A 4KX4A 2Y6QA 2R2JA 4X0XA 1E1LA 3KZQA 4BA7A 3KM6A 1OJCA 4E0VA 3V3OA 3E1TA 3IOSA 3VK9A 1GUMA 1F6MA 4K6XA 2A2PA 1L9CA 2E4GA 3DYRA 4HQSA 4ZCCA 1H7WA 4EM3A 1GRBA 3GTUA 1K0LA 2CX4A 4I2UA 3RP6A 1NM3A 2P5RA 4RG4A 2KP1A 5DBQA 3TKPA 1F6MC 4B68A 1VG0A 4YWOA 1J9BA 4WR4A 2VVLA 2YN1A 3LFLA 3LJPA 1LJRA 1KSSA 2O87A 4NZHA 4EDZA 3EANA 4GSNA 4G0IA 1XW9A 1EEMA 1FB6A 2IMIA 3IE3A 2V3BA 2YLRA 4TM1A 4HU9A 2MMNA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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