4CY6A

Apo structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase hbpa
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
582
structure length
561
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 181
structure length 561
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy6A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy6A01
2WPFA 4JN9A 1YQ4A 2JAEA 3IWAA 2WDQA 2PHHA 1FEAA 2JB1A 1TDEA 5HHFA 3KPFA 2QA1A 3H4KA 1B8SA 4Z24A 1NDAA 3AE2A 2IIDA 4B63A 1GESA 3FMWA 2ZBWA 4JNQA 2FJAA 1E1MA 2XFQA 4YTPA 4M52A 2X8HA 4H2QA 4Z2TA 2B9XA 2XVHA 1K0LA 3COXA 2CVJA 2WQYA 4WX1A 4TLZA 4H4YA 1PXBA 1CHUA 3NT6A 1L0VA 1BWCA 4XWRA 1K0JA 3FG2P 2H88A 3OC4A 4CY8A 4GDPA 2VOUA 5M10A 1CJCA 2YLSA 3DA1A 4OPLA 2RGJA 2XVJA 1H83A 1L9EA 4GR1A 3T37A 1EL9A 3NKSA 2AAQA 2WDRA 4AP3A 1KSSA 3F8DA 4IA6A 2UZZA 4A65A 3QSMA 1TDFA 3CNSA 3NNEA 3M12A 3Q9TA 5EB5A 4TM1A 3UP4A 3P1WA 2WOVA 3ATQA 1GETA 4B67A 4EQXA 5L46A 3SQPA 4O5UA 4FX9A 2BYBA 2DKHA 4J36A 1KDGA 3E1TA 1SEZA 1GRTA 3CGEA 4NEVA 1OJCA 4U2SA 2V60A 2BK3A 4YT0A 4A5LA 3IHMA 4JDRA 3JSKA 1GERA 2GR1A 1E7PA 4PABA 2R0CA 2XLUA 1PXAA 4IVMB 3SFEA 4B66A 2VZ2A 4GCMA 4D03A 4YTNA 2BACA 3AECA 3UOVA 2WPEA 1F3PA 4YSXA 4Z2UA 3RP6A 2VQBA 3AYIA 3NH3X 4LIIA 3GYJA 3SGLA 4AOSA 2YLXA 2C73A 2GQFA 2YLRA 3AB1A 1O95A 2BK4A 3D1CA 4ZN0A 4EQRA 3V3NA 3NK0X 1E39A 4H4VA 2F5ZA 1RYIA 1L9DA 5FS6A 2JB2A 2YR5A 3AD8B 3AEEA 3UTHA 2GR3A 1GXFA 4K22A 1E1KA 3BNUA 4NTCA 4FK1A 4EIQA 3AD9B 3CGBA 3GWFA 3LXDA 4YKFA 3RP7A 1COYA 1MOKA 4K5SA 3FPZA 2YVJA 1PJ5A 5KRQA 1CBOA 1OJTA 3AE4A 3GD3A 5U63A 2ZZBA 4BV6A 2WP5A 1BZLA 3P4RA 2YAUA 4D04A 1LPFA 4CNJA 1CL0A 3B3RA 4HA6A 1Y0PA 4A6NA 1EL5A 2C67A 2EQ8A 4J57A 2GV8A 3UKPA 3CNDA 1D4DA 1FOHA 1GRAA 1H84A 5LV9A 4DSHA 1YKJA 3C4NA 4GUVA 3CPJG 2WEUA 3AEFA 2JK6A 1F6MA 3KLJA 2EQ7A 1N4VA 4H2NA 2E5VA 3LOVA 1EBDA 4I58A 2WS3A 2GVCA 3NLCA 1YQZA 3QVRA 1PBCA 1DJQA 4Y4LA 3QSSA 4K2XA 2ACZA 4O5QA 3CGCA 1GRBA 4UDPA 2XFNA 3DJGX 3NG7X 3SM8A 4ICYA 2RGOA 4BURA 1ZOYA 2WP9A 2VRLA 4IVOB 2R0PA 3EPTA 3VRBA 2CDUA 4TM0A 1UKVG 3NYFA 3LJPA 3NHOX 5GSNA 1H81A 2WETA 3EF6A 3AYLA 1Q9IA 1Q1RA 1KF6A 1GEUA 3P4PA 2GH5A 1F8RA 2RABA 1REOA 4UDQA 1IUXA 2NPXA 1GRGA 1NENA 4U8MA 1N4UA 1H6VA 1OJAA 5DBJA 2R0GA 1NG4A 2OLOA 3CIRA 3ALLA 3URHA 4C3XA 4H4ZA 1PBEA 4YWOA 1B37A 2C3DA 3AEAA 3IF9A 4OVIA 4BJZA 4I59A 4JY2A 4WCTA 4RG3A 2YR6A 4EM3A 1B4VA 3GDPA 4IA5A 2YG3A 1JU2A 2A8XA 5IPYA 2X8GA 4ECHA 1DJNA 3CN8A 2VQ7A 3CNJA 4OPIA 2V6OA 1DXLA 3UTFA 2BXRA 3O0HA 3PS9A 4JY3A 2A87A 3AEBA 1TYTA 3HZLA 2CULA 1VG0A 2XFUA 2YWLA 1BF3A 3WE0A 2C64A 3AE3A 4H4SA 1NPXA 2X8CA 3AEGA 5EB4A 4EMIA 3NGCX 3DJJA 1N1PA 4Z44A 3UTGA 1S2QA 5FMHA 2BK5A 2WU5A 3CGDA 3LADA 4NZHA 5TR3A 4C5OA 1GSNA 2C3CA 3K7QX 5J7XA 2Q7VA 4K8DA 4A99A 5CQFA 3AE8A 4Z2RA 3AE5A 2YVFA 2V5ZA 1IUSA 1CC6A 1IUUA 1F8WA 5GRTA 1FL2A 3ADAB 3QSEA 2CFYA 3GSIA 2BS2A 2WU2A 4OPCA 2JKCA 1M6IA 3V76A 5HYMA 1NHSA 3FBSA 4CCQA 3AE6A 4PAAA 3PVCA 3S61A 1RSGA 4J31A 4A9WA 4CY6A 4OPGA 1Q1WA 2V3AA 2XVEA 3GRTA 3NRNA 4U8NA 4B64A 4YSHA 2XCGA 2TPRA 4AT0A 4YSZA 4APNA 2ZZCA 1GRFA 1NEKA 3M0OA 4OPDA 1PN0A 4BK1A 1BKWA 1K0IA 3ATRA 3RHAA 2V3BA 1S2YA 4A7AA 4B69A 5M0ZA 2YVGA 4U8OA 3KD9A 5JCKA 1GNDA 4FDCB 3UP5A 3NK1X 4TM4A 2YG6A 3B6DA 4H50A 5BVAA 3LZXA 4CCRA 4DNAA 4Y4NA 4AOXA 3C96A 5IQ4A 4OPUA 5EOWA 3CPHG 2QA2A 3GWDA 1DOEA 3CPIG 4U8JA 1QO8A 3EANA 1NHQA 2B9YA 2YM1A 1ZMCA 1IJHA 2OALA 1TRBA 2YLTA 2JB3A 2BCPA 3KVEA 3F8PA 5KVHA 2XLPA 4J56A 3REDA 3NTAA 4B65A 3R9UA 3ALJA 1TYPA 1NHRA 1O94A 2EQ6A 1ZMDA 3GDNA 4A79A 1IUWA 2WP6A 2TMDA 2GB0A 3AXBA 2B76A 1GV4A 1XDIA 1DOBA 1PBFA 4H2PA 4H4UA 2C72A 1N4WA 3BI2A 4P9SA 1M64A 2FBWA 3QJ4A 4LA1A 5U25A 1O5WA 2GQWA 1E1NA 1NG3A 3K7MX 3SFDA 3BHKA 4CRTA 2XLTA 1P2EA 3VQRA 2IVEA 2NVKX 4YXDA 5HXIA 1TDOA 2VRMA 4JQ9A 3V3OA 4YSYA 1VDCA 2BS4A 4ZCCA 2FJEA 4YKGA 3GMBA 4CBQA 2GAGB 1DNCA 2XVFA 3L8KA 2FJBA 3NYEA 4U2TA 3UKQA 4E0VA 1X31B 1ZDLA 4BK2A 1H82A 3CNTA 1PDHA 2WHDA 3VR9A 3M13A 3GYIA 2Q6UA 2E4GA 3DMEA 2BA9A 2C75A 2YLWA 2WOWA 3EAOA 1YQ3A 3UTEA 3GD4A 3UOXA 1CJ3A 1Y56A 2A89A 3AE1A 4UDRA 4AT2A 3AE9A 2GMHA 3VRDB 4TLXA 2GAHB 1VQWA 3KU9A 5BUKA 1LQUA 1NHPA 4U8LA 3DK8A 1TDKA 1ZKQA 3IC9A 2YG7A 1Z6LA 1GTEA 2O9ZA 5HY5A 4GF7A 4BJYA 1E1LA 5KXJA 4ZCDA 2XLRA 2GMJA 2H89A 2R4EA 2C76A 2BCGG 5KOXA 1CJ4A 2B7SA 2OAMA 4UP3A 3G5QA 1DODA 3AE7A 3QFAA 4YTMA 2BS3A 4EQSA 3DH9A 1PHHA 1RP0A 2DKIA 4U2LA 1PXCA 4DGKA 3BI5A 4Z26A 3ICTA 1AOGA 1HYUA 2QAEA 3AYJA 2XLSA 4H4XA 1ELIA 3LZWA 1FCDA 4BK3A 5EBKA 3I6DA 4IV9A 3RNMA 2RGHA 2BABA 3UOZA 4HB9A 4H4TA 1K4QA 2GRTA 1EL7A 1CC2A 2AQJA 5JCLA 3GRSA 4XWZA 5KVIA 5KWFA 4XXGA 2GF3A 1IUTA 1GOSA 3UKKA 2VVLG 3QVPA 2XVIA 5FS9A 2B9WA 2FJDA 2QCUA 3NK2X 2APGA 1MO9A 4U8KA 4H2RA 2C65A 5JCMA 2WOIA 5BRTA 2Q0LA 2ZZ0A 5FS8A 5JCNA 3DGHA 1MXTA 1BGJA 3UKLA 2E1MA 2X50A 2XFPA 3P4SA 1ZX9A 2Z5YA 5JCIA 1KNRA 4EQWA 1FECA 2WBAA 1H7XA 4Y4MA 5C3JA 3AD7B 1CC4A 4X9NA 2WESA 3ALMA 1ONFA 3NIXA 4OCGA 3PO7A 4JNAA 4B1BA 4B68A 3ISHA 3Q6JA 4H4PA 2C70A 3ZDNA 3BI4A 3QFBA 1GT8A 4AP1A 4KX6A 4A6NB 5KOWA 3ICRA 1JRYA 1D7LA 1PBDA 5BULA 2Q0KA 3F8RA 4EMJA 1JOAA 4H4QA 3NN6X 3ITJA 3NYCA 4RG4A 5ER0A 5FS7A 2R46A 2YM2A 1FEBA 1D4EA 2YLZA 2R45A 4H7UA 4J33A 2R9ZA 1D7YA 3KKJA 1H86A 1E6EA 3UCLA 1GTHA 2B7RA 4MJWA 4U8IA 3UKAA 4C3YA 1LV0A 2W0HA 3ICSA 3VRAA 2IVDA 3H8LA 2YG5A 4ADWA 1B5QA 3P9UA 4X4JA 1OJ9A 3L1RA 4J2WA 4Z25A 2BXSA 3D8XA 1TDNA 3P4QA 1LQTA 1LTXR 2ARDA 4U8PA 1ZY8A 5CKUA 3RP8A 4C77A 1GREA 3GMCA 5C2TA 1PJ7A 1W4XA 3IHGA 2XDOA 3I3LA 1Y56B 2XYOA 3AWIA 3C4AA 3BHFA 3OZ2A 1XPQA 5IQ1A 3BNMA 3H8IA 1LJ1A 3DJEA 2X3NA 2XFOA 1GPEA 2PYXA 3KA7A 2OLNA 3DGZA 4H4RA 1PJ6A 3S5WA 1YY5A 4GDEA 4EIPA 1D4CA 1S3BA 5U1OA 4REKA 1EL8A 4Z43A 1JRXA 2GR0A 1D5TA 1JNRA 3K30A 2Y6QA 3II4A 2OA1A 3UKFA 2Y6RA 2GR2A 2GEWA 3G5RA 3FIMB 1PS9A 1P2HA 1LVLA 1CF3A 2I0ZA 3CNPA 4NTEA 2R4JA 4X9MA 1BGNA 3ZYXA 1F8SA 2X99A 4DSGA 2JBVA 2J3NA 1QLBA 4USRA 2BC0A 1PBBA 3NN0X 1XANA 1ZOVA 2EQ9A 1KNPA 1XHCA 2WPCA 1JRZA 1KSUA 2WDVA 3K7TA 2Z5XA 2HQMA 5J60A 1DOCA 3UOYA 1NAAA 1OJDA 1L9CA 3DJDA 1VG9A 2VVLA 2YR4A 3DK9A 2BC1A 2C7GA 4LU6A 4K5RA 1S3EA 2C66A 2V61A 1JNZA 4TM3A 2AR8A 4K7ZA 1VRQB 4H4WA 4NEWA 4J34A 1H7WA 3ABVA 4USQA 1GRHA 4N9XA 3AEDA 1IUVA 4C74A 3DK4A 4CNKA 4FK1C 1GALA 1QJDA 2YQUA 4RSLA 2VVMA 3UKHA 3CTYA 4EMWA 1ZK7A 4KPRA 1CJ2A 1KFYA 4NTDA 1JEHA 4OPTA 3VR8A 4EM4A 3LB8A 1V59A 4GRTA 2YG4A 3NTDA 3G5SA 1ZP0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FYBA 1G0TA 2WDQA 2PHHA 5HHFA 3TDGA 4J2FA 2IFQA 5G30A 2ON5A 1F37A 1TW9A 3SBCA 4Z24A 3S9FA 2UZ8A 3AE2A 4ZXGA 3UOMA 3ZVJD 1SJ6A 4AJ7A 1GULA 4B63A 4JR4A 4TW5A 4WBJA 4ZL8A 1PFOA 2WDUA 1E1MA 1SENA 4EO3A 4HU7A 2B9XA 2XPEA 5J3RA 4O92A 1GLPA 1XIYA 5IMCA 4TLZA 3LEFA 3NT6A 1L0VA 1BWCA 1A24A 3OC4A 2H88A 4CY8A 1F2EA 2VOUA 2RGJA 12GSA 1L9EA 1EL9A 4NHWA 4LLRA 2H1BA 3HA9A 4XS6A 1LU4A 1FOVA 1TDFA 2GLRA 4GTUA 5EB5A 3TRPA 5IPGA 4NWZA 3LFLA 2LRCA 3SQPA 4O5UA 1FHEA 4NEVA 3ME7A 2BK3A 5LCZA 2L59A 4A5LA 5KN2A 4JDRA 3FR6A 3TJKA 2KP2A 2VAFA 4N11A 5G1KA 2DJJA 1ZYPA 2O8VB 1F3PA 4TXVA 3SGLA 4AOSA 2GQFA 3ED3A 2HE3A 1T4ZA 4EQRA 1GH2A 1M0UA 3NK0X 3H93A 2HRFA 4H4VA 16GSA 4I6XA 3LWAA 4K0NA 1GL8A 2LNSA 1BJXA 2JB2A 3CTGA 4PQHA 3TRXA 1LJRA 1GXFA 3KIJA 3IK9A 1XWGA 4QL9A 3RP7A 4K5SA 3FPZA 2YVJA 4IVFA 1CBOA 1OJTA 3GD3A 4BV6A 4NV2A 18GSA 3GRXA 1THXA 4J57A 1FW1A 4RI6A 1K3YA 3QPMA 1D4DA 3CNDA 3UKPA 1FAAA 3C4NA 3T2ZA 2WEUA 3AEFA 2YWOA 1F6MA 3KLJA 3SZFA 3BOAA 2EIRA 4HJ2A 1T3BA 2WS3A 4FQUA 2GVPA 4MJEA 1PBCA 1DJQA 4MNNA 3WGXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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