3ZIVA

Crystal structure of ancestral thioredoxin relative to last archaea- eukaryotes common ancestor (aeca) from the precambrian period
Total Genus 25
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
25
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
SVIEINDENFDEVIKKSDKVVVVDFWAEWCGPCRMIAPIIEELAEEYAGKVVFGKVNVDENPEIAAKYGIMSIPTLLFFKNGKVVDQLVGARPKEALKERIKKYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Synthetic construct
publication title Conservation of Protein Structure Over Four Billion Years
pubmed doi rcsb
molecule keywords AECA THIOREDOXIN
total genus 25
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2013-01-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zivA00
2E2MA 3EE2A 5ELGA 3HKRA 4V2LA 1GTBA 5J5NA 2DIYA 3UVTA 3PGTA 4POKA 4ZBDA 4RQRA 2H1DA 2X8GA 3GTUA 2CX4A 4N0VA 3RAZA 3L0HA 1DE2A 4BPYA 2VUPA 1JLWA 1XPVA 4GRFA 2J9HA 1TU7A 2ON5A 2VIMA 5H5RA 5KEJA 3I43A 3LFLA 1TRVA 4ID0A 4I97A 5ECQB 1SK1A 1XW5A 1TK5B 3DYRA 4GF0A 4NHWA 3FR3A 1U6TA 4MP4A 5G31A 5DQSA 4MMMA 1RK4A 2AAWA 3CXGA 2NPBA 1SL0B 2H30A 4HJMA 2HRNA 5AGYA 2FD3A 3ZVJA 2I81A 4QQ7A 4MF5A 3U5RE 1B8XA 3F63A 3RHCA 1VF1A 2GQKA 2F8AA 1GUHA 1SK0A 2QC7A 3W6GA 3QAGA 2PBJA 3VPTA 2YV7A 4ZB8A 4E8HA 4TXOB 3VLNA 1AQVA 4V1Ap 3IAS2 4IP6A 4GQCA 2YPMA 3US3A 2RUEA 2KHPA 2YNXA 2AYTA 1E6BA 4KB3A 2EC4A 1B4QA 1WRYA 2KLXA 5KN3A 3EINA 1C72A 1GSFA 3P90A 4KX4A 2WRTA 5CRGA 4YQVA 2JSYA 1XFLA 4FIWA 2JL4A 3L9SA 3VPQA 1H75A 4I5QA 4EDZA 5B8AA 2CAQA 3GH9A 1PGTA 3L9UA 4L0WA 5KN0A 3ZVJD 3CMIA 2F9SA 3G7IA 3H93A 2CVKA 4MH2A 4PURA 1FB0A 1VRSD 2C3NA 2OE0A 4AGSA 4HUAA 1XWCA 2VL2A 1A24A 3I69A 3MDKA 2C80A 3NIVA 4AJ8A 1YKCA 1TDIA 1XZOA 4PQ1A 3ZIJA 2LRCA 2YZHA 4L8EA 4IELA 2B5XA 3TJKA 5DJMA 5B6MA 2LKUA 4NPBA 5JCGA 1WP0A 3GV1A 3GH6A 4K7OA 1UC7A 3HDCA 3RDWA 5DCGA 2MMOA 1V98A 5ECLB 4BVXA 2XC2A 3F9UA 1QQ2A 1ZYQB 3FZ4A 4RI7A 2RIIA 4FYUA 4MF7A 2DIZA 2BJXA 1JHBA 3ZITA 1W4VA 3AY8A 2N5AA 1OE8A 5ECRB 2VL3A 3HZ4A 4G19A 4GXZA 3EVIA 1XIYA 4TXVA 4ZB6A 22GSA 4Q5RA 2KP1A 1NHYA 5DALA 1Q4JA 1K0OA 2DJ1A 5IMDA 1AC1A 4K2DA 2GQLA 2N5FA 4RQXA 4XHMA 1F6MC 4K6XA 2TRCP 5IIZA 2R37A 4PQHA 4F03A 3CBUA 1FAAA 1EGOA 1M9AA 1XCCA 4OCFA 5G2ZA 2M72A 3WGDA 1TU8A 1HYUA 1GLPA 5DAKA 3NZNA 2ZNMA 1SYRA 1SD8A 4OO4A 5CO3A 1GSDA 2IWTA 3L78A 5HR2A 1USBA 4PNFA 3ME7A 4HI7A 2B3SA 3E3EA 5ECNB 2Z9SA 3HXSA 3GYKA 5G1KA 5H5QA 1U87A 1CQHA 3LEFA 2C0DA 1BX9A 3C1SA 2AUVA 3IA1A 1ON4A 6GSTA 1VF4A 4DVCA 4JEDA 1GP1A 2R5GA 2AJQB 2H73A 5A4VA 2YWNA 1T7PB 3HVXA 1JZDA 2DLXA 3F6DA 3HJOA 1SKWB 2IN3A 1O73A 1G6WA 3DEXA 3KZQA 5IMZA 4KDYA 5E59A 1S3AA 3EYTA 1GSEA 5G30A 2B1LA 4ILFA 4O5RA 3EWLA 3ZLPA 1ACVA 4I6XA 3BCIA 2B1KA 3UEMA 5LNKe 1M2DA 2FHEA 4HEA2 2LV3A 2B7JA 2CA8A 3I9V2 1WIKA 1A8YA 4K0GA 4GCIA 5CP1A 2VOCA 3KD0A 3V1WA 1Z6NA 1RW1A 3EC3A 3KH9A 1V9WA 1K3YA 3UJ1A 3H79A 3HVVA 1J08A 1Z5YE 2H01A 1SL2B 3ERGA 4EF0A 1SYXA 5KN1A 1U3IA 2HZFA 10GSA 3LORA 5F0GA 4O7HA 3UARA 1TRUA 2E7PA 3KXOA 1TW9A 5FWGA 1ERTA 1F2EA 2F3MA 5D9XA 4XRDA 1G7OA 4F0BA 4KE3A 4TR3A 1PMTA 2R6KA 2XBIA 3D22A 2H1AA 2WGRA 3IK9A 2LSTA 3HYPA 5D8IA 4EL1A 3G7YA 3HA9A 2MYGA 2MMZA 2C3QA 3FZ5A 5DCHA 1TK8B 4E8EA 1TP9A 3D0ZA 2O87A 1M0UA 1X9WB 1AW9A 4ZB9A 5FT3A 2H6YA 1DUGA 4CHSA 4JU5A 1K0CA 2IJYA 2LEGA 3Q18A 2ZUPA 3H1NA 3D4TA 2VLTA 1OE7A 2FA4A 4ZBBA 20GSA 1K3OA 3VWVA 1FB6A 1SENA 5GSSA 2LRNA 4K0NA 3TKRA 1HQOA 1MTCA 2HYXA 1S3CA 1ZCPA 2MBTA 3GN3A 4XCSA 2R3XA 5IMVA 2I3YA 4LMVA 2B6MA 2G0FA 2C0FA 2V6OA 3MNGA 3APOA 2C0EA 3GKXA 4MF6A 2CQ9A 2P5RA 2ES7A 1T00A 3G7JA 4MABA 1B4PA 3LYKA 1O6JA 2CAIA 4BL7A 3HZ8A 3FHKA 2GDRA 3Q19A 5A4WA 1E2YA 14GSA 1M2AA 3W8SA 1TI1A 1ILOA 4KGIA 4ECIA 4MJEA 1YDKA 2YANA 5GZZB 2LQQA 3VWXA 4FYBA 3VI5A 2HI7A 2JZRA 4CW9A 1FW1A 5IMCA 2IIYA 4OWYA 3GUSA 1O8WA 5H5SA 3HHVA 4YQUA 3GSSA 1M2BA 3BOAA 3KEBA 1KBNA 2YJ7A 1EZKA 4N10A 4WEYA 2H6ZA 4LLRA 1FVKA 1O81A 4OFMA 5HR1A 3M9KA 3C8EA 1QK8A 2QGVA 1YF1A 1XWKA 1FG4A 2HLSA 4ECJA 5ABRA 2GVPA 1GSQA 2IFQA 2OE1A 3J7Yb 4RUVA 3PR8A 4KAEA 1X9MB 1A2JA 1THXA 2LJKA 1U3AA 1V58A 4ACSA 3DIEA 1X5CA 3H8QA 2P31A 3M1GA 3QDNA 1PL2A 1XW9A 2MZCA 6GSWA 3UOMA 2CZ2A 4EDYA 1JZWA 2CVDA 5J4UA 4Q5QA 1K0NA 1KEBA 4ZIJA 3ZFBA 5AN1A 1YY7A 4NMUA 4K1FA 3DMLA 1X5DA 3UIWA 3VK9A 1O7UA 3HCZA 12GSA 4KH7A 1ML6A 3LXZA 2HT9A 2QSIA 4DSRA 1QFNA 2FA8A 3M0FA 3M8NA 1BQ7A 2X8HA 3VWWA 2FWFA 3VFIA 2L4CA 1A8LA 3GRXA 3OR5A 4D73B 3DVXA 2N5BA 3QAVA 4PX1A 4X43A 3GFKA 4HJ2A 1TRSA 4TR1B 1WPIA 2PWJA 4WF5A 1WMJA 4NAXA 1GNEA 2YWOA 2DJKA 4KUNA 1WE0A 3TDGA 4Z7XA 2OJLA 3WT1A 2A2RA 2XBQA 3U6VA 2VM2A 1U88A 2OA7A 3FEUA 1DE1A 3GTUB 2X64A 2H74A 4IJ3A 2X99A 5IQYA 1GWCA 4JR4A 4NWYA 3CTFA 1QGVA 2X8CA 5D9WA 1LJRA 4ZBAA 3GX8A 1GTAA 1BG5A 1NM3A 3IOSA 4WF4A 3SBCA 3L9VA 3TKSA 1B9XC 1Z7RA 3TKPA 1GH2A 4TR4A 3TJGA 3TJBA 3IR4A 1BYEA 1EOGA 4TW5A 2H76A 2IMDA 2LJRA 2F8FA 2VCXA 4FH8A 3NOFA 1Y25A 3RPPA 2A2SA 2RUFA 1GULA 4DSSA 2XHFA 4TN8A 2AB6A 3W8JA 5IOXA 2KOKA 4KNDA 2WZ9A 1K0AA 5D9TA 3WGXA 2GTUA 2VCQA 5LCZA 5KN2A 4HU7A 2PPTA 4OCEA 1GTIA 3KTBA 2GT6A 2A4VA 4K9ZA 5C04A 4MJCA 5IMFA 3WGEA 2LNTA 2GGTA 5D9VA 2D2ZA 2QKEA 2V41A 4JR6A 2HFDA 5JWQB 1LBKA 3QMXA 3APQA 2VD1A 4ZL8A 1XOBA 3UAPA 1MDJA 4JE1A 1F37A 1MD4A 4IQAA 2ALBA 3GSTA 3TGZA 1OVNA 2CX3A 1N8JA 5IO2A 1ZMAA 2H1BA 3GNJA 1SKSB 1K0BA 2HRFA 4F2IA 4HQSA 5EL8A 3KMOA 3DD3A 2HXKA 4NV2A 3ZRDA 1Z7PA 3RHBA 5L71A 2GLRA 5A5KA 2LJAA 5JCWA 3RBTA 2VLUA 3CSJA 1Y6EA 5AISA 4V1Ag 1A0FA 4HZ4A 3LWAA 1LU4A 2L57A 3QFBC 3HVSA 4N11A 2OACA 4G10A 2YWIA 4PUAA 3D4MA 1V57A 3LG6A 4J57E 4KDUA 4OFNA 4POBA 1ZGNA 1YZXA 2LS5A 2H66A 3M3MA 4GWRA 1M9BA 2V32A 3GHAA 1XVQA 2JU5A 3E9JB 3HD5A 2H6XA 3KCMA 3ISOA 3QD9A 2VL2C 1W89A 2GSSA 4KSMA 3A5WA 4MH3A 4GSNA 4F9ZA 5GAPD 2OKAA 4L5OA 7GSSA 3O76A 3HJPA 2G2QA 3TRQA 2GQMA 4TOPA 3TRPA 1EP8A 5B7CA 1THOA 1YJ6A 5E4WA 5J41A 2O89A 2DSAA 5ELAA 3ZIVA 3BBYA 4KSOA 3F3QA 1YEXA 1T4YA 3TKQA 1GLQA 4ZL7A 2VCVA 3UBKA 16GSA 1AIUA 3TJFA 1EV4A 1OC8A 2CZ3A 3DVWA 1TKDB 1A23A 4XRAA 4MZWA 3C1RA 1GTUA 3K8NA 1SD9A 1T4ZA 2AHEA 5J9BA 2H8LA 3QR6A 5JCUA 3ZREA 3DRNA 3ERFA 3C73A 1EWXA 1Z3EA 1KTEA 3GKMA 2FWGA 4LL1B 3M9JA 3FRCA 1SJ6A 3A3TA 4IKHA 1G0TA 1OC3A 3IRAA 3ZTLA 4ULXA 4XS4B 2NVLA 1FHEA 2CT6A 1RQMA 4YQMA 2L6DA 2JZSA 2YWMA 4YAPA 5DAKB 4OMVA 5DDLA 2VCZA 2MBSA 2BTOT 2O85A 1YF0A 2DJ3A 2HZEA 2VL9A 2JZTA 4MK3A 2DJ0A 2EIQA 1UVZA 2JSZA 1GSYA 2H0IA 3P7XA 4I8BA 5D96A 2XPEA 2H0GA 9GSSA 2NTOA 1HD2A 3P8WA 6GSSA 3TKSE 2P0GA 1PKZA 3C71A 2VD0A 3ZMKA 4RI6A 3O3TA 4F82A 1QXHA 5IOWA 4PNGA 2WJUA 4WBRD 3UMAA 1X9SB 2C8UA 2AV4A 2FY6A 1URMA 4EC0A 1G6YA 4KW6A 4AF2A 2HE3A 1F3BA 4O92A 1PN9A 5COHA 2P5QA 3KP8A 2FCHA 1H4OA 4ECCA 4X1UA 1OAZA 3D21A 1MEKA 1Z9HA 1JLVA 2NBSA 4XS6A 1NSWA 2OBIA 1FOVA 1GL8A 1K3LA 2DC5A 2DJ2A 3H4KA 5HFIA 3TOTA 3TUEA 5G5EA 1IYHA 1YKAA 5F05A 4PXOA 2CV4A 2WFCA 4XTSA 5DQYA 3LYPA 3IDVA 2MMNA 2PU9C 2VO4A 2B5EA 3Q6OA 1M99A 4TVEA 1KNGA 2K18A 1QUWA 5IPHA 2WDUA 3FZAA 1CQGA 2H19A 1F3AA 3C7MA 4GLTA 4MA9A 2JADA 4MZBA 5F8BA 1V2AA 5F06A 2CVBA 2REMA 1OC9B 4JZQA 5HQPA 4ECBA 2E2GA 1AQWA 2E0QA 5A4UA 2HSYA 3FKFA 1YEPA 4IP1A 3VI7A 1GUMA 1N2AA 3EU4A 2EIOA 4MJAA 2GZPA 1PL1A 3ZMLA 5ID2B 2F51A 2H1GA 4OO5A 3PINA 1OKDA 4J56E 1R26A 3TRXA 1FO5A 2IMIA 3QCPA 4HS1A 4TR1A 1AAZA 3I6AA 1QMVA 2C3TA 4N30A 2GT5A 1EGRA 1PRXA 2GSQA 4GSSA 4TXOA 4YAVA 3IPZA 5F07A 3A2XA 4PUFC 1M7TA 3EU3A 4MPFA 5G1LA 5CREA 2V1MA 3EURA 5B8BA 1AUCA 2J23A 3G9BA 1K0DA 5B6NA 2YV9A 3HJMA 3GL5A 4FYCA 4HOJA 2H75A 1F9MA 2KUCA 4XS1A 4HU9A 3KM6A 2L6CA 3F0IA 3KGKA 19GSA 5HFKA 2RM6A 4GQFA 3GX0A 5IM9A 4WXTA 3TOUA 4V2MA 2PMTA 2ON7A 1AQXA 1A2LA 2PN8A 3ZZXA 2GZZA 3VWUA 2VLVA 4WKWA 3LXTA 2MMAA 3KTLA 5INYA 4HDEA 1Z6MA 2LUSA 2R2JA 2L4QA 5JWOB 4XIHA 4POLA 1ABAA 3KJYA 1TK0B 2PVQA 2C1YA 2O7KA 1TI3A 2IFQB 4BVYA 2L59A 1PSQA 1IYIA 5CRDA 3MAKA 3F6FA 5ECPB 3F4SA 3J7Yk 1J9BA 3UVHA 3E0UA 2R4VA 5IPGA 1TRWA 1YQ1A 3KH7A 1ZL9A 1PQNA 13GSA 2VAFA 3WD6A 2WCIA 1WJKA 3EMPA 4OFTA 1HNCA 1V40A 5LD0A 4MLYA 3DXBA 2LQOA 3ED3A 3FZ9A 3TCOA 1XWGA 3F4TA 4X0XA 5HR3A 3SWLA 3VURA 4L5LA 1OYJA 3O6TA 4WETA 1PX7A 3CRTA 2O8VB 2YCDA 4NV5A 5ECOB 3GA4A 2DMLA 3BJ5A 2PVOC 2LTKA 1SJZA 2C4JA 1XXUA 5JWRB 1AXDA 3BD2A 4G2EA 3MSZA 4V2NA 2GSTA 2K9FA 3KP9A 2PGTA 3BCKA 4NHZA 5C00A 1EEJA 1TOFA 2DMMA 1R4WA 5DBQA 4EUYA 1EOHA 4ZL9A 5HR0A 3TB2A 1NW2A 4EO3A 1A0RP 3L4NA 3FY7A 4L0UA 4IS0A 1DSBA 1ZYEA 2YP6A 2I1UA 5DJLA 3S9FA 4J2FA 4JBBA 4P3YB 2IL3A 1I9DA 2VCWA 6GSUA 5J3RA 1JZOA 4MCUA 1R5PA 4CDOA 5ENUA 4QL9A 3A2WA 4IJIA 2XPDA 2YOIA 3TKSC 1VF3A 3CTGA 3GKNA 1MD3A 4Q5NA 3WT2A 2BMXA 3ZL5A 4AJ7A 4IGJA 4GSTA 3MWHA 1PA3A 3QPMA 4MZCA 1OKTA 2JACA 4IBPA 3WYWA 3UL3A 1B48A 3PH9A 4I2UA 4YH2A 2LNSA 3KMNA 4DSSB 3IV4A 3GURA 2VM1A 1ERVA 1EP7A 4WBJA 4TKYA 1B9YC 1ERUA 4XS4A 1VF2A 2L5OA 4LMWA 3QOUA 2M46A 5D73A 3UBLA 3GL3A 1UN2A 4MJBA 2K8VA 4K7NA 2PUKC 3GMFA 3D6IA 3CRUA 3FW2A 1I5GA 3APSA 2B7KA 1K0MA 4GTUA 1O8XA 3F8UA 4H86A 4EVMA 3CSHA 4IN0A 2B5YA 4ZXGA 1XOAA 2FWEA 4KCEA 3GIXA 2TIRA 2RM5A 3F3RA 5FHIA 5DALB 4IQ1A 5AIXA 2FWHA 5IO0A 3Q74A 1SKRB 3IXRA 4KDXA 1G7EA 5CRWA 4TR0A 3FK8A 4K7IA 2KP2A 1O85A 5ECHB 4QL7A 5DVBA 1TJDA 1WWJA 2EIRA 2FNOA 1FVJA 1GNWA 3IBHA 2NDOA 4F0CA 4JRRA 4POMA 5HFGA 2K8SA 1SJIA 1R5AA 1ZZYA 2TRXA 2FLSA 2L5LA 3F4RA 5GSTA 6GSYA 4PGTA 3IC4A 3DWVA 5ECMB 4IVFA 3DKSA 1UA5A 2PERA 2V2GA 4ZILA 4NXIA 2HSHA 1PKWA 4O32A 3A2VA 5ECIB 1MDKA 2IPAA 6GSXA 2GS3A 5GAND 4ISDA 3FR9A 2VCTA 1WOUA 4ML1A 1SU9A 1GRXA 1GSUA 3KIJA 1ST9A 1J0FA 1TTZA 3EMXA 1BJXA 2YN1A 3IHQA 2ZCTA 2V6KA 5IMAA 2DBCA 1GSSA 3TJJA 11GSA 3HY2A 2LRTA 3IK7A 1XWBA 3LGCA 4WR5A 2DJJA 1OC9A 4WR4A 3P2AA 2I9HA 3RPNA 4BA7A 2HNLA 5AIVA 4DSQA 3CSIA 3FYGA 4EKZA 3JCML 4K8MA 4DEJA 1X0RA 4EXJA 3QFAC 1R7HA 4LA1A 3FR6A 2IMKA 2WULA 1EEMA 17GSA 2FGXA 5ECSA 1SK2A 3IAM2 3R2QA 2GSRA 2GZYA 5CRHA 1T3BA 1HNBA 4PQIA 5ID2A 1MDIA 3N5OA 2WB9A 1A2MA 1GUKA 1S3DA 5G5FA 3ZYWA 4HZ2A 2FUG2 4KCAA 1JFUA 1XW6A 4N0ZA 1T8EB 5J9CA 1XBSA 1XWAA 2K6VA 4MPGA 1EV9A 2I4AA 3QAWA 2OADA 2YZUA 3ZFLA 5CYYA 5D93A 1Q98A 4BWSA 8GSSA 3D5JA 3N9JA 3ERWA 2IMFA 4IHUA 4BWQA 4OD7A 4LL4B 4G9HA 3LSZA 5EVOA 1DBYA 1BEDA 2HZEB 4I2TA 4ML6A 4IW9A 2IMEA 3IE3A 1VGLA 2RLIA 1JZRA 3DGQA 6GSVA 1ERWA 1HNAA 4MDCA 3LJRA 1BAYA 2H72A 1T1VA 3CYNA 5ECKB 1SL1B 2YJHA 2H71A 2H0HA 3LQ7A 3GKKA 1PD21 4TRXA 1XVWA 4KA0A 5CNWA 2C0GA 4FO5A 5CAXA 18GSA 3ME8A 1ZOFA 1PX6A 4Q5FA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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