2LJAA

Solution structure of a putative thiol-disulfide oxidoreductase from bacteroides vulgatus
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
152
structure length
152
Chain Sequence
MSLRSGNPSAASFSYPDINGKTVSLADLKGKYIYIDVWATWCGPCRGELPALKELEEKYAGKDIHFVSLSCDKNKKAWENMVTKDQLKGIQLHMGTDRTFMDAYLINGIPRFILLDRDGKIISANMTRPSDPKTAEKFNELLGLEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution Structure of a putative thiol-disulfide oxidoreductase from Bacteroides vulgatus
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Bacteroides vulgatus
molecule keywords Putative thiol-disulfide oxidoreductase
total genus 47
structure length 152
sequence length 152
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ljaA00
1O81A 1X5CA 2ES7A 4BWSA 2VD0A 2FCHA 5CRDA 3TJJA 4BL7A 1SJIA 4G19A 4MCUA 1O73A 4HQZA 4JU5A 3LEFA 2GQLA 1FAAA 3IE3A 1T4YA 5E59A 3EC3A 4RI6A 2O8VB 3W8SA 3FRCA 1Q4JA 4YQVA 2VL9A 2V6KA 4TXOB 4PQIA 2FWGA 3LG6A 2WS2A 4EDYA 4F82A 1LBKA 3F3QA 1GH2A 1GNEA 5JWQB 3ZMKA 3WGXA 1A23A 4O92A 2CX4A 20GSA 4EVMA 4WF4A 1OVNA 5IO0A 4ZB6A 2GTUA 2O85A 2RUEA 2VLUA 1O8WA 4EDZA 2AHEA 3P90A 3TJGA 2J9HA 5IPGA 3KMNA 2IPAA 2KLXA 1AQVA 3Q18A 3QMXA 2JZTA 1TK0B 2GS3A 4NHWA 1GSEA 2O87A 5ECSA 4X1UA 2L4QA 1THOA 4J56E 3GKKA 4N30A 5ECMB 3DVWA 1AAZA 1YF0A 1K0CA 5JCWA 3M0FA 4MJEA 5J9BA 3HA9A 1GTBA 2MMOA 4ECIA 2ON7A 4HU7A 3QD9A 3MSZA 4JR6A 3ERWA 4F03A 4HZ4A 4JBBA 1QGVA 3F8UA 4V2NA 2NDOA 4PNFA 3EVIA 4HEA2 3FZ9A 3GX0A 2FWHA 2OE1A 1DSBA 3KTLA 4EO3A 1SYRA 1V2AA 4RQXA 1XW9A 3I69A 1BX9A 2I81A 4OWYA 1J9BA 1A2LA 2WCIA 2AUVA 4MJCA 2A2SA 2YWMA 4I6XA 4WETA 1TI3A 1PN9A 3LORA 3UEMA 4KB3A 2K18A 3ZVJA 3RDWA 1M99A 2VL2A 1OC8A 2EC4A 1GL8A 2B6MA 5DAKA 1A2JA 2ZNMA 2HLSA 2GLRA 3QR6A 3F6FA 4HQSA 3FR9A 1HYUA 2M46A 2CZ3A 1QK8A 4ULXA 1EEJA 5IMCA 1YY7A 1PL2A 4Z7XA 3TUEA 2CAQA 3DXBA 3IAS2 3O3TA 4IJIA 3PR8A 4J2FA 3BCIA 5F05A 2FUG2 2GQMA 2HZEB 2AYTA 3Q19A 4L5LA 2IJYA 4IVFA 1RW1A 1SKRB 3KIJA 2OADA 3FEUA 4ZB8A 3ZYWA 2E2MA 3RBTA 1GUMA 1U87A 3G7JA 4GXZA 4N0VA 4BVXA 3L9UA 4MABA 5ABRA 4ZBAA 2B7JA 2VD1A 1HQOA 2EIQA 3KH9A 1EGOA 3F63A 3GSTA 1Z5YE 4WF5A 3UARA 1EZKA 1M9BA 2X8GA 5JCUA 4MZWA 4RI7A 4OFTA 2HSYA 3GKNA 3LGCA 3KEBA 6GSSA 2O89A 3TOTA 1PMTA 2LTKA 4NWYA 2VOCA 2RM6A 3LWAA 3FR3A 2TRXA 1OC9A 2MYGA 3L4NA 1G6YA 4OFMA 3IK7A 2ON5A 1YEPA 3QAWA 4GSSA 3KD0A 2VCQA 2PN8A 4XS1A 1HNBA 4TR1A 5JCGA 1Z7RA 5D8IA 1XPVA 3D5JA 2MZCA 3FK8A 1SK0A 4AJ6A 2WULA 3LQ7A 2A4VA 4ZL7A 3ISOA 1ZYEA 2X8HA 2CAIA 4KH7A 2DMLA 1K0OA 1B4PA 4IS0A 4TRXA 5ECQB 4F9ZA 4MZBA 5ECKB 2PMTA 2LNTA 1OKTA 3GL5A 2HRNA 3IOSA 3UMAA 2I1UA 3QDNA 4POMA 4WR4A 3EE2A 1R5AA 3ZZXA 1YJ6A 1Z9HA 2K8SA 2J23A 2YN1A 3OR5A 4ZIJA 2H1AA 2JZRA 5H5QA 1Z7PA 1Z6MA 1B4QA 1TU7A 1IYIA 4HS1A 2IMDA 1TW9A 5AGYA 3MNGA 2GZYA 1YDKA 1T4ZA 2E7PA 3TJKA 1Z3EA 1K0DA 4GLTA 2PUKC 3VI7A 1GWCA 2FWEA 4Q5NA 1TKDB 1WJKA 4K9ZA 1WPIA 4YAVA 5IMAA 2V32A 3M9KA 2L5LA 1SU9A 1XW6A 16GSA 1MEKA 2AAWA 5E4WA 1V58A 2CA8A 3BOAA 5G30A 1S3DA 5HQPA 1WP0A 2DMMA 2LKUA 3N5OA 5DJLA 1DBYA 1ZOFA 1MDKA 2QKEA 5GZZB 4LA1A 1SD9A 4MMMA 5CRGA 3VWWA 3E9JB 1SL1B 3HJOA 1TTZA 3A2VA 4IQ1A 1K3LA 3EU4A 2VL3A 2H1GA 1PRXA 1JZDA 2N5FA 1WIKA 4IHUA 3UBKA 3ZLPA 2PU9C 2EIOA 1ERWA 6GSVA 14GSA 4LMWA 1EGRA 2NPBA 5DJMA 2WB9A 2F51A 2OJLA 2PGTA 2JSZA 3ZFLA 4YQUA 5GSSA 4OCFA 1BAYA 2H6YA 1ZZYA 5EY6A 4BWQA 2YZHA 2VIMA 2H6XA 1ZYQB 1NHYA 1QFNA 1U3AA 3I6AA 3TKQA 1V98A 1K0MA 3HJPA 1F2EA 3LYPA 3U6VA 1WE0A 2L6CA 3GIXA 1NW2A 3CMIA 4KDXA 4I2UA 5FWGA 2VAFA 1M0UA 2HE3A 3I9V2 4JR4A 3TRQA 1FO5A 2HFDA 2WZ9A 5DAKB 1T7PB 1YKCA 2XPEA 4KA0A 1JHBA 3D0ZA 4GWRA 2XC2A 4MH2A 3KGKA 1KBNA 5ID2A 1FB6A 4ILFA 3HD5A 4EUYA 2VLVA 4P3YB 4LL1B 12GSA 3MAKA 3P8WA 1BEDA 4PGTA 3C71A 1ZCPA 5AISA 3W8JA 3F3RA 2M80A 4NAXA 1XVQA 5GAND 2F8AA 22GSA 2LJAA 4I5QA 1Y25A 5COHA 1MD4A 2N5BA 2V2GA 4HI7A 3D22A 1JLWA 2G0FA 3TCOA 3EURA 1C72A 3F9UA 4BA7A 1PGTA 4ECBA 1AUCA 5ELGA 5DCGA 1MTCA 2FD3A 2B7KA 1TOFA 1IYHA 2L5OA 3MDKA 5ENUA 5CAXA 2DJ1A 4GTUA 3VLNA 4L8EA 4KW6A 4HDEA 1DE2A 3GSSA 4F0CA 4TR4A 1OC9B 4HJ2A 2BMXA 1YEXA 2IN3A 1R4WA 4G2EA 4IP6A 1M7TA 1ABAA 2H73A 3C8EA 2VCXA 2XBIA 4HZ2A 3HVSA 3D6IA 1T1VA 1W89A 4TR1B 2K8VA 3ZIVA 3A3TA 6GSWA 1VF4A 2HYXA 5F0GA 1CQGA 4PXOA 3M8NA 5KN1A 1BJXA 3F4RA 4JE1A 2C0EA 5G1LA 4GCIA 1LJRA 4OMVA 1HNCA 4G9HA 1V57A 1XWAA 2R4VA 1MDIA 4V1Ap 2YP6A 2KOKA 3O6TA 4N0ZA 2BJXA 2CX3A 5INYA 4BVYA 3EYTA 2HXKA 5AIVA 4WEYA 5B6NA 1OC3A 1W4VA 5H5RA 10GSA 4ZBBA 2C3QA 2NBSA 4ZBDA 2E2GA 2CVBA 4TVEA 2DJ3A 5DBQA 3M9JA 4ACSA 4AF2A 1XXUA 1NHOA 1KEBA 3UJ1A 1PX7A 2OACA 2PVOC 1ON4A 3RAZA 2F8FA 2LNSA 1XOAA 1QUWA 3TRXA 4WR5A 4XIHA 1F3AA 1T3BA 2WRTA 3L9SA 3ZFBA 1VRSD 3GRXA 1A8YA 5CO3A 2KHPA 1YQ1A 4XS4A 3DVXA 2JSYA 1XIYA 3C73A 1TJDA 2GZZA 4PNGA 3GNJA 1ILOA 5G31A 2VO4A 4MJAA 5EPFA 3TKSC 2YJHA 4H86A 4K6XA 1URMA 5DQYA 5HFKA 1R7HA 1RQMA 3BJ5A 5IMFA 5IOWA 3GMFA 2H8LA 3APSA 1JFUA 1R26A 4MH3A 4TN8A 3LXTA 1A0RP 5IPHA 1N2AA 3IR4A 5GAPD 1A2MA 1GTIA 3H8QA 3QPMA 4N11A 2DC5A 2OBIA 1AC1A 1OE7A 3H1NA 5JWRB 1FVKA 1G7EA 2CT6A 2FA4A 1PL1A 5KN3A 2H72A 4DSRA 1CQHA 2LSTA 1V9WA 3Q74A 2R6KA 2AB6A 5ECPB 5D9VA 4IELA 2VCVA 2DJ0A 3V1WA 2I3YA 6GSUA 2LRCA 2IL3A 4NV2A 1SKWB 1XWBA 3SBCA 3E0UA 1TU8A 1WOUA 1XZOA 2C3TA 3KMOA 3IV4A 5DCHA 3PINA 1X0RA 1WRYA 2CQ9A 2R3XA 5F07A 4NHZA 3TGZA 1B9YC 3H4KA 4IW9A 4V1Ag 5ID2B 3GTUA 5CYYA 4PUAA 3C1RA 1X5DA 5LD0A 1VF1A 4AGSA 4WXTA 2TIRA 3UL3A 2GGTA 3SWLA 1GSSA 2YOIA 1QQ2A 1ERUA 2K6VA 3DWVA 1TRSA 4DEJA 2GT5A 2ALBA 1I5GA 1XOBA 3ED3A 1PD21 2YWOA 4FYUA 5HR2A 3FYGA 1S3CA 3ME8A 3QCPA 2HT9A 2H74A 5DDLA 1F9MA 8GSSA 1PKWA 2B1KA 2H6ZA 5G5EA 1AIUA 4WBJA 3GV1A 2FWFA 5IMVA 5JWOB 1XCCA 3HY2A 4Q5RA 1ACVA 5DALA 1F3BA 1U6TA 3JCML 5D73A 1VF2A 3IPZA 3G7YA 4OD7A 2V6OA 3R2QA 4XCSA 5J5NA 3LSZA 2OE3A 4JEDA 2P0GA 3TKSA 2VM1A 3IBHA 3RHBA 2C0DA 2GZPA 1Q98A 1E2YA 3EINA 2C4JA 2F9SA 1EWXA 5FT3A 2P31A 3UVTA 4PUFC 4K0NA 3FKFA 1HD2A 1YF1A 1YZXA 2HI7A 5DVBA 3FZ5A 5HFGA 2RUFA 1SL2B 2FLSA 2C0GA 2YWIA 1EOGA 1AW9A 4MF7A 4KAEA 1SD8A 5ECLB 1GSYA 3EMPA 2YPMA 3NIVA 5IQYA 4K0GA 3IXRA 3RPPA 2L59A 4TW5A 3RHCA 3A2XA 4OO5A 1QMVA 3APOA 5LCZA 1SJ6A 2C0FA 1G0TA 4GSNA 2LUSA 2BTOT 3GA4A 2V1MA 3VWVA 3VPQA 3M3MA 1AQXA 1OE8A 3KM6A 1PSQA 3N9JA 4DSQA 2VM2A 3GFKA 1VF3A 1T8EB 1J0FA 3FHKA 5AN1A 4ID0A 2F3MA 4K2DA 1ML6A 2L4CA 1DUGA 4JZQA 3WT1A 1JLVA 3FW2A 4KSMA 2ZUPA 4QL9A 2MMNA 1V40A 4XS4B 5HFIA 5J9CA 2HSHA 17GSA 4XS6A 3Q6OA 4I2TA 4MPFA 4Q5FA 3DMLA 3GX8A 3A2WA 4PQ1A 3AY8A 3QAVA 3LJRA 3GUSA 6GSTA 3VFIA 3IHQA 1KNGA 2CVDA 4XRDA 5HR0A 2GDRA 3L78A 18GSA 1U88A 1M2AA 4QQ7A 1FB0A 1FHEA 3KP9A 9GSSA 1XFLA 3UBLA 2PBJA 1WWJA 1TI1A 4FYBA 5CREA 2H0IA 1O6JA 3P2AA 5EVOA 1HNAA 2DJ2A 2IWTA 1B8XA 2DSAA 4WKWA 3A5WA 3HVXA 5G2ZA 4TR3A 4Q5QA 3GN3A 4YAPA 1BQ7A 2X8CA 2REMA 5IOXA 3EWLA 2VCTA 1B9XC 4K7IA 3L9VA 3GH6A 2GSSA 5B7CA 3G7IA 2DIYA 1PKZA 2YCDA 3UAPA 5D93A 2P5QA 3TDGA 1O8XA 5ECOB 2IFQA 1A24A 2H19A 1SYXA 4CW9A 3ZITA 4EL1A 3HXSA 2H1DA 1ZMAA 3GTUB 1SJZA 2KP2A 5ECNB 3US3A 1B48A 1YKAA 3KP8A 4D73A 1SK2A 2R5GA 3EU3A 1UN2A 3CYNA 4DVCA 1SENA 2G2QA 3DEXA 3MWHA 4MK3A 4HOJA 3LFLA 5FHIA 3TB2A 4KGIA 3ERFA 3H79A 1S3AA 3WGDA 1DE1A 3CSJA 5D9WA 5B8BA 1RK4A 5DQSA 2H1BA 3TOUA 3FY7A 4L5OA 2QC7A 5IMDA 1X9SB 3IC4A 2B1LA 3WT2A 3KCMA 2LEGA 2ZCTA 4BPYA 4IJ3A 1GLPA 4EE0A 4ECCA 3E3EA 3HDCA 4DSSA 1NM3A 3UVHA 3BBYA 3ZMLA 5J3RA 1UA5A 2B3SA 5DALB 2QSIA 4MLYA 3TJBA 2R37A 1F37A 1EV9A 3EMXA 5IO2A 5H5SA 2K9FA 3LXZA 2C3NA 4F2IA 2H01A 2NVLA 2AV4A 5J4UA 3UOMA 5KEJA 3HKRA 2O7KA 2H0HA 1GP1A 4GQFA 4NV5A 3GHAA 2H30A 3C7MA 2YJ7A 5LNKe 3F4TA 2MBSA 2H76A 1E6BA 2V41A 4O32A 3TKSE 2OKAA 1X9MB 1G7OA 1FG4A 1JZOA 4KSOA 2IMFA 4X43A 3ZREA 1X9WB 4FO5A 2PWJA 2IMKA 3FZAA 5CRWA 1MD3A 4NMUA 1XWKA 1KTEA 1OAZA 4L0WA 2YNXA 5G1KA 1A8LA 1GRXA 1MDJA 1BYEA 1GUKA 1K0BA 1K3OA 4J57E 4IGJA 4YH2A 2IMEA 3DIEA 1SK1A 2DJKA 3HYPA 4ECJA 4TKYA 1I9DA 4MF6A 1K0AA 3BCKA 2RLIA 3KZQA 3ZL5A 5D96A 5A4VA 1GULA 2E0QA 2IMIA 3QFAC 2GQKA 4KCEA 4ZL8A 4G10A 2DJJA 1ERTA 3ERGA 1QXHA 4IP1A 1XWCA 3NOFA 5ELAA 4K7OA 1G6WA 5F8BA 3CSHA 4GRFA 2IIYA 2LRNA 5HR3A 4LLRA 3RPNA 4MP4A 4NXIA 7GSSA 3KJYA 4XRAA 5IIZA 5EL8A 5CP1A 3CTFA 5KN2A 2TRCP 4ZILA 2FA8A 5AIXA 4KE3A 4IKHA 2MMAA 4L0UA 4ZB9A 3IA1A 4LMVA 2OBKA 4E8HA 3WGEA 2YZUA 1XWGA 5HR1A 4GF0A 2DIZA 4ZXGA 1SKSB 4FYCA 2HZFA 3DRNA 3CBUA 4E8EA 1U3IA 3GH9A 1O85A 1F6MC 4OO4A 2OA7A 2B5EA 3IAM2 2VCZA 3IRAA 3QAGA 1XBSA 3TRPA 5J41A 2RIIA 1GSDA 1X5EA 3VWUA 2C1YA 2DLXA 4AJ7A 1J08A 5B8AA 2CVKA 2VLTA 5ECHB 4ZL9A 1M9AA 4NPBA 4N10A 4MJBA 2FGXA 1GTUA 3F6DA 4FH8A 2GSQA 3HHVA 4IQAA 2JU5A 1OKDA 1PX6A 3KH7A 2H75A 5IMZA 3GURA 2FNOA 3J7Yk 2X99A 3PH9A 4KCAA 2LQQA 11GSA 2LJKA 3D4MA 1TDIA 2IFQB 2B5XA 3L0HA 2I4AA 4XTSA 1T00A 4KDYA 1AQWA 1GUHA 1UC7A 3CTGA 1SL0B 1GLQA 1GTAA 1EEMA 1TRUA 2PERA 3VURA 2VUPA 4I8BA 2C8UA 3D21A 4D73B 2CZ2A 5ECRB 5D9XA 1PA3A 4LL4B 4RUVA 4TXOA 4FIWA 1FOVA 3HCZA 2H70A 3VWXA 4MZCA 1GSQA 2P5RA 3H93A 4CHSA 5L71A 3NZNA 19GSA 2WGRA 2YWNA 3WD6A 2CV4A 4MDCA 1EOHA 5ECIB 3VK9A 1H4OA 3IK9A 2VCWA 1GSUA 2HNLA 4CDOA 3J7Yb 2GT6A 4WBRD 3O76A 3VPTA 1GSFA 1TP9A 2JACA 3GKXA 3APQA 4DSSB 1Z6NA 5D9TA 3CRUA 2LS5A 4F0BA 2HRFA 2A2RA 3C1SA 4EC0A 4RQRA 2GVPA 3K8NA 4QL7A 4PX1A 1JZRA 2H71A 4O7HA 3ZRDA 4ML1A 4MA9A 4PURA 13GSA 1LU4A 1N8JA 3WYWA 4EXJA 2WDUA 3P7XA 2H0GA 3G9BA 5A4UA 5C04A 1WMJA 3CXGA 4IBPA 6GSXA 4YQMA 2LJRA 4HUAA 2X64A 1A0FA 1XVWA 3S9FA 3DD3A 1EP7A 1UVZA 3M1GA 3CRTA 1TK5B 1EV4A 2N5AA 2JADA 3BD2A 2YV9A 1K0NA 4K1FA 4MPGA 3HVVA 2YANA 5G5FA 1O7UA 4O5RA 2NTOA 1XW5A 2EIRA 3KXOA 1TXXA 1ZGNA 6GSYA 2WFCA 3PGTA 4JRRA 4K7NA 2LQOA 2RM5A 2PVQA 5F06A 3GL3A 4KNDA 3TJFA 4HU9A 2H66A 1M2DA 2MMZA 2OE0A 3I43A 4POBA 3TKPA 3TKRA 2B5YA 3IDVA 3GKMA 1NSWA 2I9HA 3QFBC 1ZL9A 3FR6A 3ZIJA 1ERVA 2R2JA 1Y6EA 5A4WA 1JZWA 2MBTA 4TOPA 5KN0A 3UIWA 4EKZA 4TR0A 3FZ4A 2KP1A 2XBQA 5A5KA 2KUCA 4I97A 4V2LA 4EF0A 4ML6A 5IM9A 3VI5A 1K3YA 1FW1A 1GNWA 2HZEA 3ZVJD 2L6DA 4AJ8A 1R5PA 2D2ZA 2YV7A 3U5RE 3CSIA 3HZ4A 2LV3A 3F4SA 2FY6A 3HZ8A 4XHMA 1EP8A 1BG5A 3DGQA 3QOUA 4KUNA 2Z9SA 1M2BA 2GSRA 2FHEA 4IN0A 1VGLA 4K8MA 4ISDA 2LRTA 1TRVA 3DKSA 3F0IA 1PQNA 1TK8B 3D4TA 5CRHA 4OFNA 5B6MA 5GSTA 2WJUA 2AJQB 2JZSA 1AXDA 2XPDA 4V2MA 4MF5A 4TXVA 1TRWA 3KTBA 4POKA 2JL4A 1THXA 4HJMA 3W6GA 4GSTA 2QGVA 4POLA 3DYRA 1FVJA 5CNWA 1H75A 1USBA 4KDUA 1ST9A 2PPTA 1OYJA 2DBCA 2GSTA 2XHFA 3ZTLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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