1TRVA

The high-resolution three-dimensional solution structures of the oxidized and reduced states of human thioredoxin
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDAQDVASEAEVKATPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords THIOREDOXIN
publication title The high-resolution three-dimensional solution structures of the oxidized and reduced states of human thioredoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Electron transport
total genus 22
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1trvA00
1JZOA 1XCCA 3GNJA 4AJ7A 2HXKA 5F0GA 1A8LA 3G9BA 1O7UA 1EEJA 1WOUA 2YZUA 1XWAA 5E4WA 1YZXA 2LJKA 2VCWA 1BG5A 3UBLA 4IW9A 3TRPA 3GSSA 3GFKA 2LNTA 3FK8A 5IPGA 1B9YC 1WMJA 4POMA 4RUVA 3ZFLA 2X64A 5J41A 2B1LA 2B7KA 1TW9A 4IJ3A 2L4CA 4JZQA 4K6XA 2FWHA 1GSYA 2FD3A 1XOBA 1Z6MA 1XZOA 1Y6EA 1XW6A 3QR6A 2GSSA 2WJUA 4EKZA 3HVXA 3M9KA 4FYBA 3IK7A 2LTKA 2AAWA 2LSTA 3A2WA 2K18A 1AQVA 3HY2A 5A5KA 1WP0A 4PX1A 2M80A 2FHEA 2GQMA 2I4AA 3ZL5A 5JWRB 4EL1A 4IGJA 3MAKA 4X1UA 3KH7A 1AUCA 4AF2A 3W8JA 3EVIA 2DJ1A 1HQOA 5DJLA 5KEJA 3SWLA 3QAGA 3TKPA 1TRWA 2AV4A 2MMNA 3ZVJA 2P5QA 3LEFA 5DALA 2IFQA 2H72A 2JADA 3TOUA 2C3TA 4O92A 3HKRA 1AW9A 3ZVJD 4HQZA 2VOCA 1ACVA 1Z7RA 4TXVA 1N8JA 1UN2A 4MJAA 4DEJA 4EE0A 3FZ9A 5INYA 1I9DA 1Y25A 1XWGA 2FLSA 3EWLA 3D22A 4IQAA 3QDNA 1HNBA 5B6NA 3A2XA 2X8CA 1X9WB 1V2AA 2F8AA 3BCIA 3ISOA 2H1DA 1KEBA 2FWEA 2IMKA 2YANA 2MMOA 3P90A 1VF1A 2CVKA 2GT5A 1ERVA 2B6MA 1Q98A 4TR0A 1M9AA 2H66A 5DCGA 3UBKA 1TU7A 3GX0A 1K0OA 2VD1A 3QMXA 5GSSA 3GKXA 4XS1A 4MF7A 3DWVA 1GUMA 8GSSA 1FVKA 4JE1A 2V32A 1FOVA 3UL3A 3GMFA 4NXIA 1SJZA 3UVTA 4V2MA 3UAPA 4NV2A 3VWUA 1F37A 2B5YA 3DGQA 3GKNA 4MZWA 4L5LA 3GV1A 4IP1A 4KDYA 14GSA 3M3MA 3CXGA 3F0IA 4FH8A 3VPQA 3DKSA 5ID2A 1GSEA 1AC1A 1TJDA 3US3A 4KAEA 2DJKA 1GP1A 3F6DA 1TK5B 1PA3A 2H70A 3RHBA 1VF2A 1EGRA 2RUEA 4IELA 1QGVA 2ON5A 1EEMA 5FWGA 1JZRA 2CZ2A 3L9SA 16GSA 3E3EA 2KOKA 2YZHA 3BJ5A 2I1UA 5EY6A 5G5FA 2R6KA 3IR4A 3QAVA 5E59A 2DC5A 3TCOA 4IKHA 4N30A 4F0CA 1YQ1A 2BJXA 3KTLA 4IJIA 5IM9A 4EC0A 4ACSA 5ECRB 3S9FA 1NW2A 1ZCPA 1LBKA 5CNWA 4ID0A 4O7HA 2LUSA 4OD7A 4EUYA 3HA9A 4BWQA 4BL7A 4IP6A 3L78A 2VIMA 2VCXA 5ECPB 4P3YB 1AAZA 3H93A 2LS5A 2R4VA 1GTIA 9GSSA 4WBJA 4K7OA 2I3YA 1SYXA 2HSHA 5B8AA 2VD0A 5LD0A 4LMVA 4YH2A 1MDIA 1K3LA 2R37A 4CDOA 2YP6A 4ZILA 1M2DA 1EGOA 1EP7A 1A0RP 1JZWA 2DSAA 2GTUA 2E2MA 1B4PA 4POKA 4YQMA 2K8SA 5KN1A 2L6CA 3DEXA 1NSWA 1GNWA 4J57E 2IMFA 2DJ0A 1T8EB 2A4VA 1GSFA 4ZB9A 3GL5A 1HD2A 17GSA 3F8UA 4HUAA 3E0UA 4OFTA 1K0NA 2A2RA 2VL2C 1TK0B 4ZB6A 1TXXA 4TXOA 1OKTA 1ZMAA 5DCHA 2OE1A 3UOMA 3D4TA 1RK4A 4POLA 2GZZA 4BVXA 3J7Yk 3DVXA 2V6KA 3H1NA 1B48A 1CQHA 4I97A 4MJEA 3FW2A 2LEGA 3GRXA 1SKSB 2PMTA 1HNAA 1ERWA 1M7TA 2GZPA 1YJ6A 4GQFA 2X99A 4GCIA 12GSA 3CRUA 1G6WA 3BCKA 4IHUA 2H6XA 3I69A 4TN8A 4PURA 5HFIA 2YPMA 1JZDA 3I6AA 5HR2A 5COHA 5HR3A 1OYJA 3APOA 4RI7A 3GKMA 6GSUA 2YJ7A 5IO0A 1XBSA 4MPFA 4TR3A 2WZ9A 2YWIA 1ILOA 3IRAA 4QL9A 1OE7A 3HJPA 4TRXA 5ECSA 2H8LA 2HT9A 1A2LA 2WRTA 4AGSA 2H71A 3ZTLA 2N5AA 1TOFA 3EURA 2FCHA 3F4SA 3L9VA 3IXRA 1DE1A 1MD4A 1VF3A 1GSSA 5FHIA 2C0FA 1URMA 2IMDA 5ENUA 5D93A 1SYRA 2L6DA 4N10A 2O8VB 3KCMA 3H8QA 5JCGA 3EC3A 1F6MC 1XWCA 5ELAA 5AGYA 3V1WA 2H0GA 3UEMA 3Q19A 4OCFA 5IMZA 2B3SA 5CRHA 2CVBA 5ECQB 2IN3A 3KP9A 4TVEA 1PX7A 3ZIJA 3J7Yb 1M2BA 1X9MB 1YY7A 4PQ1A 4V1Ap 1FAAA 3TDGA 2FA8A 3PGTA 1EWXA 5B6MA 1ON4A 3TB2A 5HQPA 1ML6A 1WRYA 2JSZA 3TJJA 1DE2A 4PXOA 4ZL8A 1BJXA 4XCSA 5DAKA 3LJRA 3HYPA 5DQSA 1NHOA 3CSHA 1HNCA 4Z7XA 2H0HA 3C73A 5ECIB 2OJLA 3CMIA 3KJYA 2R3XA 2O7KA 4KB3A 2JZSA 5CYYA 3GSTA 3VWXA 3ERWA 2C0EA 4YQUA 3QFBC 1I5GA 2V1MA 2FWFA 1MTCA 1X0RA 1O8XA 2Z9SA 4KSOA 2REMA 3KXOA 1Z7PA 2JZTA 5EPFA 3ZZXA 5LNKe 3I43A 1GUKA 22GSA 4WXTA 1PD21 4F03A 2FGXA 3P2AA 3HXSA 1O73A 3BBYA 1JFUA 4BA7A 1M2AA 1M99A 1X5EA 1WIKA 3HZ4A 3JCML 1B8XA 5ABRA 5IOWA 3KMNA 1T3BA 1SENA 5H5SA 1LJRA 2NDOA 1K3OA 3GHAA 4HI7A 2R5GA 3BD2A 2C4JA 1TKDB 3BOAA 1YEXA 1UC7A 1V98A 1WPIA 2JSYA 2YNXA 4OWYA 3LYKA 4D73B 4K7IA 2H75A 2HSYA 1Z6NA 2VUPA 4N0VA 1JLVA 2YWOA 4HZ4A 4JU5A 3C8EA 4WKWA 4O32A 3GL3A 3PINA 4MABA 2O89A 3D6IA 4IBPA 4XS6A 3P8WA 2VLUA 2DMLA 3G7YA 4AJ6A 1PX6A 1FB6A 1BYEA 1XFLA 2GDRA 2ZCTA 4MDCA 4RQRA 1SL0B 3HD5A 2DJ3A 4XIHA 4XRAA 6GSTA 1S3AA 2PWJA 5FT3A 1J08A 4MMMA 3LGCA 1S3DA 3GA4A 1R5AA 2AYTA 2LJAA 4K8MA 4I5QA 1GRXA 2KP1A 4KNDA 2HYXA 3TKSA 3HVVA 1TTZA 4HU9A 3G7JA 3RPNA 3WYWA 2PBJA 3GIXA 3VPTA 2AHEA 1VRSD 2GS3A 5JCUA 4KSMA 2YV9A 1G7EA 2LRCA 2K6VA 5IPHA 1SL1B 1FG4A 2H74A 2P5RA 3HZ8A 4XHMA 3D0ZA 2QGVA 1ZGNA 3EYTA 2TIRA 4G10A 2MMAA 3UMAA 3HCZA 3ERFA 5CRGA 5B7CA 3L0HA 2OE3A 2RM5A 6GSXA 1YEPA 5EL8A 2CVDA 3TJKA 4JR4A 4HJMA 2JL4A 3KM6A 2F3MA 5G30A 1BAYA 7GSSA 3KP8A 2VM1A 2RIIA 2IMEA 3GTUB 2AB6A 1A2JA 5ECHB 2H1AA 4OCEA 4IS0A 3DIEA 3CTFA 1ZYQB 4G9HA 3IBHA 2JZRA 1TRSA 1DUGA 3I9V2 1FW1A 1OC8A 4HDEA 3TKRA 5CREA 1T00A 3ZLPA 4KDXA 3QAWA 1VF4A 4OO4A 2WFCA 4DSSB 5JWQB 1TP9A 4F2IA 4EO3A 5KN2A 4MZBA 4V2LA 3D21A 3VK9A 2H30A 2O87A 2H1BA 2BTOT 2P0GA 4OMVA 4L8EA 1FHEA 5C00A 2G2QA 3O3TA 3TUEA 4LL1B 2WDUA 3IDVA 1T7PB 1Z5YE 2QC7A 3ZMLA 2HZEB 1MEKA 1SD8A 3D5JA 3ZYWA 2PU9C 2GLRA 1XPVA 1U87A 2MYGA 4K9ZA 5AISA 2WULA 1NHYA 5IOXA 2WS2A 2OADA 3CTGA 1BQ7A 4ZXGA 2PUKC 3LWAA 2K9FA 1K0CA 2B1KA 1CQGA 2OKAA 13GSA 4EDYA 4LL4B 2EIRA 3M9JA 5D9VA 3VURA 4G2EA 2LV3A 2TRXA 4YAPA 1O81A 5A4WA 3W8SA 2CA8A 4XTSA 4K7NA 3CSJA 1GNEA 4MK3A 3VFIA 2PPTA 2GZYA 4GF0A 1PSQA 4L5OA 3TKSE 1QMVA 1M9BA 5D96A 2VLVA 5JCWA 4GLTA 1Z3EA 3IA1A 2C3NA 3FKFA 1GSQA 4N11A 3ZFBA 2IWTA 2QKEA 4PNFA 1BX9A 2GQKA 1KTEA 2P31A 2B7JA 4MA9A 4POBA 2B5EA 2LNSA 3TRXA 1GLQA 5CO3A 4F82A 4K2DA 5G5EA 1MDKA 2L5OA 1PRXA 2N5FA 4I6XA 4NV5A 3WGXA 4YQVA 2ON7A 2CZ3A 3APQA 4MCUA 1EOHA 2CV4A 3EMPA 2C1YA 3LQ7A 1T4YA 4K0NA 2JU5A 3KTBA 2L59A 3UJ1A 2ALBA 4TXOB 2V41A 2VCQA 4PQHA 6GSVA 3FHKA 2O85A 2DJ2A 4AJ8A 4FIWA 2R2JA 3F9UA 5F8BA 2LJRA 1XXUA 4O5RA 4ZL9A 3MWHA 5D73A 2L4QA 3GURA 1U6TA 1WE0A 1PMTA 2RUFA 2I81A 1SKRB 4GXZA 5DVBA 2RLIA 3LYPA 3FZAA 3N9JA 1W4VA 2DLXA 1RQMA 2HFDA 3GYKA 2J23A 3HVSA 2IIYA 3Q6OA 2XPEA 4PUAA 1SJIA 4OFNA 5A4VA 2GSTA 2CX3A 4WF4A 2G0FA 3APSA 4KH7A 3G7IA 5D8IA 4TR4A 3ZREA 4OFMA 3M0FA 3DRNA 3KZQA 1KNGA 2LQQA 4GSTA 1YF0A 4X0XA 3O6TA 1V58A 3CYNA 5G1KA 4PUFC 3DVWA 3KEBA 1ZZYA 5GAPD 3TJBA 2F51A 1SK1A 2H73A 10GSA 5F07A 1U3IA 3F6FA 1PL2A 3IPZA 4WEYA 1PKZA 4PNGA 3EU4A 1R5PA 1V57A 4MPGA 5IIZA 4WR4A 1K0BA 2CT6A 3ZRDA 4K0GA 1TDIA 3A2VA 1AIUA 4ECIA 2MBTA 2MZCA 5ECLB 1A0FA 2F8FA 4LA1A 3TGZA 1GLPA 4G19A 1J0FA 1OC9B 3IOSA 2LKUA 4LMWA 4PGTA 4EDZA 4KE3A 3VWVA 4HEA2 3FZ4A 1F9MA 4JRRA 4MH2A 3EE2A 1V40A 2I9HA 1XW5A 3KMOA 4XRDA 2WCIA 2VL3A 1O8WA 1G6YA 2PERA 1F3AA 5ECNB 4KA0A 1YKAA 2XHFA 3FR9A 1B9XC 1Z9HA 4NAXA 5H5RA 1N2AA 4K1FA 1A24A 4N0ZA 2GGTA 1J9BA 3F3QA 1XWKA 3QCPA 4WETA 3NOFA 4ZL7A 3HHVA 4TR1B 5HR0A 3D4MA 5ELGA 1PQNA 3C7MA 4KCEA 4FYUA 2H0IA 3A5WA 4XS4B 5CP1A 2DJJA 4MF6A 4RQXA 5F06A 3LG6A 3WD6A 1ERTA 5IMDA 3CBUA 2C8UA 5J5NA 2OBKA 3M8NA 5G31A 3ERGA 5CAXA 4EVMA 1GH2A 3RAZA 4H86A 5IMAA 1EV4A 5CRWA 1KBNA 4MF5A 1TK8B 3PH9A 1TI1A 2IJYA 1U3AA 2H6ZA 5G2ZA 4ECJA 4GSNA 2JACA 1HYUA 2FA4A 3P7XA 1NM3A 4ZBAA 3CRTA 4I2UA 4TKYA 4JR6A 2KHPA 4D73A 3WGDA 1K0AA 3UIWA 1OE8A 3ZIVA 3IC4A 3WT2A 3TJFA 2HNLA 2X8HA 2VAFA 2NPBA 5B8BA 2FNOA 1BEDA 4NHZA 2TRCP 4WBRD 1A2MA 1GTBA 1PL1A 4EXJA 2C3QA 1WWJA 1X5CA 3RPPA 1GUHA 4TOPA 4E8EA 4I2TA 5GAND 3F4TA 3DXBA 5D9XA 6GSYA 5HFKA 2OACA 2YWMA 3HJOA 1XIYA 2BMXA 1OC3A 4ZBDA 3KIJA 1YDKA 1DBYA 1H4OA 4L0UA 1ZL9A 1GSUA 3R2QA 3L4NA 1GSDA 1QUWA 3QFAC 1PGTA 3F3RA 5AIVA 5IQYA 1QK8A 4HJ2A 5DALB 2IFQB 1V9WA 3RDWA 3ZITA 4KX4A 2CQ9A 5KN0A 1FVJA 3IAS2 4HZ2A 2LRNA 2DMMA 3O76A 5D9WA 1MDJA 4E8HA 1EZKA 1PN9A 3LXTA 1AQWA 5J3RA 2CAIA 4ZIJA 2ZUPA 1JLWA 2L5LA 2E2GA 2KLXA 2H6YA 4F0BA 1F3BA 3IE3A 1PKWA 3FRCA 1X5DA 4V1Ag 1K0MA 2VM2A 2F9SA 4MP4A 3TKQA 3GH9A 3H79A 2HRNA 4DVCA 1H75A 3ME8A 2A2SA 1B4QA 2HRFA 6GSWA 4IN0A 5ECOB 2HLSA 4KGIA 3E9JB 1RW1A 4MH3A 2LQOA 1UA5A 4GWRA 2CX4A 3DYRA 2GT6A 3C1RA 1EP8A 4ECCA 2ZNMA 11GSA 1OVNA 3K8NA 4Q5NA 2V2GA 2LRTA 4CHSA 4ZBBA 2FUG2 1JHBA 1QQ2A 3TKSC 3NZNA 3L9UA 1SD9A 1XOAA 2EC4A 2VCZA 2GSRA 1SU9A 2D2ZA 3HJMA 2MMZA 3GTUA 4ML1A 2WB9A 3IAM2 4BPYA 3QOUA 1A8YA 4YAVA 1SL2B 2VO4A 2OA7A 2HZFA 3RHCA 2CAQA 1FB0A 3EU3A 5A4UA 4BVYA 5DQYA 5ID2B 2XPDA 5H5QA 5J4UA 3RBTA 3CSIA 4FYCA 5JWOB 3U6VA 4WR5A 3VI7A 4DSSA 2VLTA 1T1VA 5HR1A 4V2NA 1OAZA 3MDKA 1S3CA 2J9HA 5J9BA 2B5XA 4I8BA 2YOIA 1SJ6A 1MD3A 3ED3A 5DDLA 5IMFA 1E6BA 5ECKB 2V6OA 1USBA 1C72A 2HZEA 3FEUA 4CW9A 2H1GA 1M0UA 1YF1A 2WGRA 4RI6A 1G7OA 5IMCA 4QQ7A 3MSZA 5AN1A 3OR5A 3FR6A 1K3YA 5F05A 3U5RE 3AY8A 1XVQA 2IL3A 1ZYEA 1QFNA 6GSSA 1TRVA 4JBBA 2VL2A 4HOJA 4GQCA 3Q74A 3C1SA 5LCZA 4NHWA 18GSA 4GSSA 5HFGA 3KH9A 3TJGA 2H76A 2DBCA 3IHQA 5IMVA 3W6GA 2FY6A 5D9TA 3IK9A 4F9ZA 3GH6A 5ECMB 2X8GA 2VL9A 1QXHA 5AIXA 4DSQA 1GWCA 1ST9A 4MJCA 2FWGA 4NPBA 1FO5A 3NIVA 2H01A 4DSRA 2N5BA 4GRFA 1SKWB 4Q5RA 3VI5A 2YN1A 3GX8A 4WF5A 2C0GA 2YCDA 2E7PA 4KDUA 3VLNA 1AQXA 3SBCA 4NMUA 2PN8A 4J56E 3GKKA 1K0DA 4MZCA 4KUNA 1IYIA 3LSZA 1T4ZA 1VGLA 3H4KA 1OKDA 4MLYA 4Q5FA 2EIOA 2NVLA 2VCTA 3N5OA 2DIYA 2GVPA 4X43A 1O6JA 1R4WA 1W89A 3QD9A 1Q4JA 3C71A 4HQSA 1GL8A 3LORA 2C80A 3IV4A 2YV7A 4ISDA 5J9CA 3FY7A 2PGTA 3EINA 1THXA 2XBQA 3EMXA 3ME7A 4PQIA 1XVWA 2YWNA 3UVHA 1XWBA 1YKCA 4OO5A 2DIZA 5CRDA 1X9SB 2QSIA 1TU8A 5DBQA 5C04A 2K8VA 2YJHA 1IYHA 2HE3A 3A3TA 4HU7A 4ECBA 19GSA 3LFLA 1SK2A 3KD0A 3GN3A 1TRUA 5IO2A 4LLRA 3FR3A 1ERUA 3LXZA 1XW9A 3F4RA 3DD3A 4IQ1A 1EV9A 2NBSA 2AUVA 2ES7A 1U88A 2EIQA 2GQLA 4QL7A 4GTUA 2NTOA 1E2YA 5G1LA 4J2FA 3WT1A 4HS1A 4NWYA 2HI7A 4ZB8A 4IVFA 2IPAA 1DSBA 1EOGA 4ILFA 4Q5QA 1G0TA 2L57A 1A23A 2XC2A 4FO5A 3TOTA 3DMLA 4EF0A 1R7HA 1GTAA 2GSQA 3FYGA 2M72A 1GULA 2M46A 5EVOA 3GUSA 1O85A 3Q18A 1THOA 1OC9A 3WGEA 3QPMA 3MNGA 3UARA 1GTUA 2PVOC 20GSA 3TRQA 4KW6A 2XBIA 3KGKA 1ZOFA 2IMIA 2C0DA 2PVQA 2E0QA 1AXDA 4ULXA 2KP2A 4ML6A 5GZZB 2KUCA 1LU4A 1TI3A 3HDCA 1SK0A 4TR1A 4MJBA 3ZMKA 5KN3A 2VCVA 4JEDA 3FZ5A 1ABAA 4L0WA 1UVZA 3PR8A 2RM6A 2AJQB 3F63A 4TW5A 3VWWA 5DAKB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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