4K6XA

Crystal structure of disulfide oxidoreductase from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
199
structure length
199
Chain Sequence
PGDAVRVTSSKLVTQPGTSNPKAVVSFYEDFLCPACGIFERGFGPTVSKLVDIGAVAADYTMVAILDSASNQHYSSRAAAAAYCVADESIEAFRRFHAALFSKDIQPAELGKDFPDNARLIELAREAGVVGKVPDCINSGKYIEKVDGLAAAVNVHATPTVRVNGTEYEWSTPAALVAKIKEIVGDVPGIDSAAATATS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Rv2969c, essential for optimal growth in Mycobacterium tuberculosis, is a DsbA-like enzyme that interacts with VKOR-derived peptides and has atypical features of DsbA-like disulfide oxidases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Disulfide oxidoreductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 64
structure length 199
sequence length 199
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4k6xA00
2FNOA 3U5RE 2MMZA 3O76A 2YCDA 2B1LA 2H6XA 8GSSA 1TDIA 2JU5A 3LWAA 1ERVA 4I97A 5ECOB 4XIHA 3ZMLA 5ECPB 3KEBA 3WYWA 3KMOA 3EU4A 5ID2B 1JLVA 4RI7A 2H66A 4K7NA 3NZNA 4ZBBA 3IPZA 2YPMA 1FB6A 17GSA 3UVTA 2PERA 4POBA 2H73A 1EV4A 4WKWA 2DIZA 1SD9A 1JZWA 2KP1A 5D73A 1OKDA 1TRUA 1MEKA 3GV1A 2OE1A 4K6XA 1Z7PA 2GLRA 2PWJA 3ZVJA 2C8UA 4Q5NA 2IIYA 2B5XA 5DCHA 4DEJA 4DSQA 1BG5A 3IC4A 3UJ1A 2EIOA 3TB2A 2HSYA 5CRWA 4WBJA 5COHA 3KCMA 1WWJA 1JFUA 5G5EA 1GWCA 5ECNB 4ECBA 4MCUA 2N5FA 3APSA 2ON7A 1SK2A 2VM2A 2WJUA 4RQXA 4Q5QA 2GT6A 2OACA 2KHPA 1PGTA 2ZCTA 3RPNA 3ERGA 4WXTA 1K0DA 2FLSA 5IMAA 2LUSA 2P5RA 1XCCA 2VCXA 1Z9HA 1OC8A 2E2MA 3Q74A 1O85A 5HQPA 1ERWA 4F2IA 2P5QA 3QMXA 5IMCA 6GSTA 1A24A 2PUKC 2L5OA 3WD6A 4F0BA 2GQLA 2VCTA 1C72A 2FD3A 3K8NA 2DJ3A 2VCQA 2C3QA 1GNWA 1YEPA 3IRAA 1BJXA 2RM6A 1TRSA 1PSQA 4GTUA 4WF4A 4GF0A 1WOUA 2AV4A 3ZFBA 4IBPA 1PL1A 2D2ZA 2HRNA 3WGXA 2OE0A 3GRXA 1V57A 3U6VA 3HDCA 3TJKA 5ECIB 4DVCA 3KM6A 3W8JA 1MDKA 1GLPA 5DBQA 5DQYA 3RHBA 3HKRA 2H1AA 2RUFA 2CV4A 3JCML 4XTSA 3H8QA 1F37A 4KGIA 1F6MC 1O8XA 2VO4A 2TIRA 3FY7A 3PINA 1M99A 1K0NA 2JZSA 4V2NA 2V32A 4KDUA 1XW9A 2XC2A 3PGTA 4EUYA 1HYUA 3HCZA 2YN1A 3TJBA 2WFCA 4NV5A 1F9MA 3LJRA 1PKWA 4E8EA 2LJKA 5ECQB 3TKSC 5D9VA 2V6KA 1RW1A 3CRTA 2LQOA 4OMVA 1GTAA 2RUEA 5ENUA 1KBNA 2VL3A 4ZB9A 3GX0A 1I5GA 2O89A 1XFLA 3UEMA 3IAS2 1DBYA 2LKUA 2RIIA 4OO5A 5ELGA 1SENA 1RK4A 5B6NA 2FUG2 4TRXA 2NPBA 2CZ2A 2YWNA 2OA7A 2GZZA 3LSZA 5AIXA 3DWVA 3HA9A 4V2MA 4MABA 3DGQA 2BTOT 1YZXA 4V2LA 1EOGA 3QR6A 4IHUA 2HZFA 2B1KA 3HJMA 3HXSA 3ZMKA 4ML1A 4L5OA 2R37A 2G0FA 1TXXA 3FR9A 2VLVA 2GSTA 3M9JA 4IP1A 3HVVA 5EVOA 4YQUA 4NPBA 1QQ2A 2FHEA 1VGLA 1XWCA 2O7KA 1XWAA 1QUWA 1ERUA 4EXJA 6GSWA 4LA1A 2VLTA 4BWSA 6GSSA 2MMAA 5B6MA 1LBKA 2R4VA 3HZ8A 2GVPA 1XWKA 5HR1A 3IK9A 3VPQA 4YAVA 1B4PA 2EC4A 2B7JA 3DD3A 2GSSA 1EEMA 2MBSA 2YJHA 1FVJA 4IJIA 3L4NA 2C3NA 4G10A 2A2RA 4WETA 2PBJA 4K9ZA 2VAFA 1R5AA 2MMNA 4GXZA 1GSDA 3GX8A 5LNKe 2CAIA 4AJ6A 3F3RA 1AQWA 1K3OA 5KN2A 3PH9A 2FA4A 2JZTA 4MJAA 4IS0A 3KXOA 3GKMA 4JEDA 4I2UA 1VF4A 1E2YA 2L5LA 3HJOA 4L8EA 2OJLA 4X43A 1J9BA 2AJQB 3HVSA 3I6AA 5CO3A 3TKPA 3L9UA 3ZREA 2REMA 1NHYA 2GDRA 1UVZA 2JACA 4FIWA 5B8AA 1NHOA 4CDOA 3F6DA 1G6YA 2H76A 3A3TA 9GSSA 2L57A 1K3YA 4TXOA 4XS6A 6GSUA 5A4UA 1XIYA 5JCWA 3FR3A 4O32A 3C8EA 3US3A 2C0FA 4GSNA 3IR4A 2LJAA 4XS1A 3F4SA 5H5RA 4MMMA 3SBCA 4NXIA 2BJXA 2JL4A 1V40A 1JLWA 2B5YA 4WEYA 4F03A 4WR5A 4BVYA 3NOFA 2HYXA 2TRXA 2YJ7A 3CMIA 2IMEA 3FZAA 3RBTA 2YWMA 1R4WA 3APOA 2VOCA 2QGVA 4EDYA 1G6WA 2H0IA 2H71A 2HI7A 4PURA 1GSUA 2NBSA 3C73A 4MLYA 5IMFA 1OVNA 1Z7RA 5J4UA 2DBCA 2IJYA 4JE1A 3GN3A 2XBIA 1YKAA 1SKSB 5GAND 2CVDA 4POMA 4I2TA 3GH6A 3GNJA 4F0CA 4NAXA 5AN1A 1ILOA 1SKRB 3MAKA 4AJ8A 3TGZA 5KN0A 2OADA 1VF3A 4AGSA 1PMTA 4KCAA 1GSFA 4JU5A 1YEXA 1IYHA 2K9FA 1XZOA 3ZLPA 2OKAA 5AGYA 11GSA 3LFLA 4TXOB 18GSA 5F0GA 4TR3A 1B8XA 1YF1A 4JBBA 1AQXA 3TJFA 2LRTA 5GZZB 3L0HA 4KE3A 16GSA 3MDKA 1T4YA 1Y6EA 4K7IA 2C0EA 4N30A 5ECMB 1GRXA 4MP4A 3CTFA 4BWQA 1AXDA 3RDWA 2VCWA 2DC5A 2R2JA 4NV2A 1X9MB 3FZ5A 1X5DA 4GQFA 4TR1A 2JSZA 4MF7A 1J0FA 5E4WA 4IN0A 1B9XC 5J9CA 1VRSD 4JRRA 5INYA 4IP6A 1GULA 4DSRA 20GSA 3L9VA 5KN3A 4Q5FA 1YQ1A 1MDJA 4ML6A 3QOUA 2VIMA 1TK0B 4J57E 2F3MA 2YZUA 2ZNMA 3TRXA 3FRCA 1T7PB 4ACSA 4RUVA 6GSVA 2ALBA 4MZWA 4WBRD 2FWFA 3G7JA 1HNAA 1THXA 2XPDA 5HFKA 3QFAC 2C3TA 5B7CA 1QFNA 1BYEA 1ERTA 2B5EA 3GIXA 1W89A 4HOJA 5IOWA 4QL7A 1X5EA 4AF2A 3FR6A 2H6ZA 2WDUA 2X8CA 1Q98A 3HD5A 3DXBA 5CNWA 2NTOA 1URMA 3GH9A 4MPGA 1GUHA 2ES7A 5DAKA 1QMVA 1OKTA 1VF2A 3KGKA 3ED3A 3ZZXA 2BMXA 5A4VA 1QXHA 3FYGA 4ZIJA 1ZCPA 2V41A 1X9SB 2AB6A 5IO2A 4JR6A 1FVKA 4KX4A 4TR1B 3VWUA 2WS2A 2P31A 4IGJA 3QAGA 1NSWA 4BPYA 4V1Ag 1XOAA 1PRXA 2ZUPA 1EP8A 4IQAA 4ZB8A 3IA1A 1K0AA 3F4RA 3ERWA 4HI7A 1HQOA 2HXKA 3G7YA 4KSOA 1TK5B 3F9UA 3GA4A 5F8BA 3DVWA 2V1MA 3PR8A 3IOSA 3KJYA 2KLXA 1GTIA 1M0UA 3BD2A 2PMTA 1O8WA 3TJGA 4ZBAA 1ZL9A 2XBQA 3SWLA 5G5FA 5D96A 5IMDA 1SD8A 3ZVJD 3QFBC 3TUEA 2F8FA 4NHWA 1TW9A 2GQMA 4EF0A 3J7Yb 2G2QA 2GSRA 3N5OA 1T4ZA 1S3CA 4PQHA 4ECCA 1SL2B 5DAKB 4LL4B 1BQ7A 3QAWA 4ECJA 4ILFA 5HFIA 2IWTA 1VF1A 3EWLA 3GKXA 1SK1A 3DYRA 1LJRA 3WT2A 1FAAA 4YH2A 1GNEA 4MJBA 4KB3A 4MF6A 2FWHA 4G2EA 4LMVA 2V2GA 3DRNA 3BCIA 4MZCA 2AUVA 3LGCA 3P8WA 1WP0A 2IMKA 2IN3A 4QQ7A 5CRGA 5C00A 4MA9A 2FA8A 1TKDB 2WB9A 3N9JA 4YAPA 1FOVA 1GH2A 2IMIA 3HVXA 4CHSA 2LJRA 2VL9A 3RHCA 1N8JA 2CQ9A 3GKKA 2RLIA 4PX1A 2VD1A 3QDNA 4JZQA 1K0CA 3A2XA 4LL1B 3D0ZA 2WRTA 3FEUA 3IV4A 5H5SA 3VK9A 1K3LA 3LYPA 2TRCP 1O81A 1A8LA 3MWHA 3F0IA 3DEXA 3IE3A 3TKQA 2ON5A 3EMPA 2EIQA 2IL3A 4MDCA 4N0ZA 2GZYA 1T3BA 2B7KA 1PX7A 1CQGA 5D9TA 3UIWA 1FB0A 2EIRA 2H8LA 1GP1A 3QAVA 12GSA 5IPGA 1J08A 1G7OA 1WPIA 1PD21 2LSTA 3HHVA 1SK0A 5IO0A 4KNDA 4TR4A 3V1WA 2C0GA 1ZZYA 1M2AA 1PKZA 3LG6A 4F82A 4WF5A 3D4TA 1TTZA 1TRVA 2IMDA 3C1SA 3F3QA 4KDYA 3AY8A 5HFGA 2H75A 2MBTA 14GSA 4PGTA 5DCGA 2DMMA 1SL0B 4WR4A 3DKSA 4FYUA 3C1RA 3KH9A 4PUFC 1G0TA 1H4OA 1M2BA 5ELAA 3L9SA 3ZFLA 4EO3A 3TOUA 5ABRA 3P2AA 1YJ6A 4ZL9A 5ECRB 1A0RP 4XS4A 4EKZA 4EC0A 4OFMA 2YV9A 4NMUA 1AC1A 1KTEA 3TKSE 2DJ2A 5LD0A 1PN9A 1WIKA 1EEJA 2WGRA 1AQVA 1V9WA 3GFKA 3L78A 5LCZA 2CA8A 2YNXA 1A2MA 5D9XA 3H1NA 4ECIA 5J41A 1H75A 4KCEA 4XHMA 1YDKA 2VL2A 3CSHA 4MPFA 3KMNA 2H19A 2V6OA 3Q6OA 2CVKA 5HR0A 4ULXA 5A4WA 4NHZA 3GHAA 1SU9A 2LNTA 2LRCA 2WCIA 1RQMA 2VD0A 4KDXA 2VCVA 22GSA 3VPTA 2HT9A 2K8SA 2P0GA 2O85A 5KN1A 5A5KA 5B8BA 2L4CA 1GSYA 2GZPA 2MMOA 4QL9A 2DJJA 1SJ6A 2A2SA 4EVMA 1A2JA 4RQRA 3A5WA 2H1GA 3KTBA 1R5PA 1EGOA 5JWOB 1EGRA 13GSA 1R7HA 2M80A 3UAPA 4TVEA 4YQVA 1MD3A 4XS4B 5GSSA 2DLXA 1T00A 1YY7A 1PL2A 4MJCA 3ZL5A 2QSIA 3M3MA 2YOIA 2I3YA 4IELA 3F8UA 1XW5A 4HUAA 4TOPA 2LQQA 3CYNA 2DJKA 3ERFA 2YZHA 1GLQA 3H93A 3LORA 3CXGA 1UA5A 3UBLA 3ZIJA 1JZRA 2PU9C 4YQMA 4HU7A 2OBIA 4OCFA 2HNLA 2R6KA 2VLUA 2QC7A 5DALA 2H0GA 1NM3A 4MH3A 3GYKA 5ECLB 1X9WB 4LMWA 5D8IA 4MH2A 1Z6MA 2VUPA 2B6MA 3TKRA 5D9WA 4MJEA 2AHEA 1DE1A 1ZYEA 2C0DA 3VFIA 1G7EA 2E0QA 5EY6A 1XVWA 4ID0A 2F51A 1UN2A 1ZMAA 3BOAA 2H6YA 3GSTA 1V98A 3S9FA 2X8GA 2H74A 3KH7A 3Q18A 4K8MA 5AIVA 1KEBA 1TI3A 5G30A 3ME7A 1Z6NA 4H86A 3H79A 4GSTA 5DJLA 2DJ0A 5J5NA 3GURA 2GS3A 5HR2A 1AAZA 3Q19A 3KD0A 3WT1A 2MZCA 1HD2A 4ZBDA 2CX3A 3W8SA 1AW9A 5DJMA 3ZITA 3FK8A 5GAPD 2KUCA 4HDEA 4L0WA 3TOTA 4POKA 4E8HA 2MYGA 1JHBA 1M9BA 2RM5A 1TJDA 3DMLA 3P90A 2GGTA 2CVBA 4KH7A 4K7OA 3ISOA 5DALB 3UARA 1FO5A 1NW2A 2YWOA 3CRUA 3NIVA 1DSBA 1S3AA 4IQ1A 2VL2C 4JR4A 2KP2A 3R2QA 2X99A 5D93A 1B9YC 4I5QA 2GSQA 4V1Ap 3F63A 3GSSA 1CQHA 1WRYA 2WZ9A 2X64A 3HZ4A 1ML6A 1XXUA 5IMVA 4OCEA 4OO4A 1B48A 1K0OA 2LTKA 1GL8A 2AYTA 3EYTA 2O8VB 1ZYQB 3IXRA 1TP9A 2DMLA 5H5QA 3IK7A 1GSSA 2JZRA 1DUGA 3ZIVA 2WULA 4OFTA 2PGTA 1PX6A 2FWEA 5IMZA 5GSTA 3QPMA 3DVXA 1XOBA 2L4QA 4PUAA 4L0UA 4O92A 1SYXA 2GQKA 10GSA 3GUSA 4EDZA 3WGDA 2QKEA 4HZ4A 3C7MA 3A2VA 1B4QA 1BX9A 2FY6A 2Z9SA 4GCIA 4PNGA 2KOKA 4O5RA 5G2ZA 2GT5A 3UMAA 3UVHA 3FZ4A 1WMJA 1XW6A 4NWYA 3EVIA 4L5LA 4HJ2A 4OWYA 2H0HA 4Z7XA 3I9V2 2PVQA 5IQYA 2NDOA 5DDLA 3UOMA 3RAZA 5L71A 3IBHA 3M0FA 5G1LA 2FGXA 4IKHA 2I9HA 3GMFA 3EURA 3LEFA 4IVFA 4PQ1A 4DSSA 4PNFA 5DVBA 3M1GA 2AAWA 2NVLA 2H1DA 2J23A 1U3IA 4P3YB 4X1UA 1ON4A 3KP8A 2C1YA 1M9AA 4ZL7A 2J9HA 4FYCA 4I6XA 1ZGNA 4MF5A 2CX4A 3KTLA 4J56E 4D73A 5FT3A 5IIZA 4X0XA 1OYJA 3G9BA 3EINA 2L6CA 1TU8A 3BBYA 4K0GA 5CRDA 2DIYA 1QGVA 3BJ5A 2CZ3A 4KUNA 1USBA 2C4JA 3LXZA 3M9KA 5ECSA 1SJZA 4ZB6A 3O3TA 4KAEA 5JWRB 1ST9A 2H72A 1BAYA 4I8BA 2C80A 3ZTLA 2H01A 3MSZA 3VLNA 2JADA 4N11A 2B3SA 4POLA 1EOHA 4MK3A 4XCSA 4Q5RA 1TI1A 2R5GA 1S3DA 5EPFA 5F05A 1OE7A 1K0MA 1MD4A 2LV3A 2PN8A 5AISA 3IAM2 1U3AA 1GTBA 1SJIA 3EMXA 3C71A 3RPPA 3LYKA 5IM9A 5C04A 4K0NA 5E59A 4DSSB 4GWRA 2L59A 3TCOA 5IOXA 3UBKA 1Y25A 1HNCA 3MNGA 2HE3A 1Z3EA 4HU9A 5DQSA 2YV7A 1A23A 1GSEA 1HNBA 1GTUA 5IPHA 1OAZA 1WE0A 2CT6A 4HEA2 4ZXGA 1EP7A 3FKFA 3WGEA 2M72A 3KZQA 2LEGA 2DSAA 3KP9A 3D4MA 3KIJA 4D73B 4N0VA 1GUMA 3CSJA 1U87A 2DJ1A 2FCHA 1OE8A 2LRNA 2I81A 4ISDA 5J3RA 4ZILA 1GUKA 4G9HA 3HJPA 1F3BA 3BCKA 3P7XA 2HLSA 3HYPA 4FO5A 1I9DA 6GSYA 3IHQA 4J2FA 3QCPA 2FWGA 1ZOFA 1V2AA 3ME8A 1EWXA 2A4VA 2JSYA 4LLRA 7GSSA 3F6FA 4GLTA 1THOA 1W4VA 1XPVA 5CAXA 2GTUA 2YWIA 1A2LA 3D6IA 4O7HA 2CAQA 1MDIA 1FG4A 1TOFA 1N2AA 4FH8A 3LXTA 3FW2A 1KNGA 1UC7A 1JZDA 2F9SA 4MZBA 2H1BA 3F4TA 4CW9A 3DIEA 3TDGA 3IDVA 2I1UA 4F9ZA 4PXOA 5CRHA 4PQIA 1FW1A 2N5AA 2IFQA 4HJMA 4HQZA 2PPTA 1ABAA 4BVXA 1OC9A 3I69A 5CREA 3D5JA 5CYYA 4OD7A 1O6JA 3APQA 1M7TA 1IYIA 1ACVA 1XWBA 5HR3A 5F06A 3LQ7A 2YP6A 4XRDA 2PVOC 4XRAA 1U6TA 2N5BA 1LU4A 2HZEA 2IPAA 2LNSA 4FYBA 3VWVA 4IJ3A 1TU7A 1X0RA 2H30A 1XWGA 3J7Yk 3GTUA 4K2DA 3VWXA 2M46A 2VM1A 2YANA 3E3EA 1TRWA 1O7UA 5ECKB 4TW5A 5G31A 1SYRA 3H4KA 2HRFA 1DE2A 1F2EA 3EE2A 2X8HA 3GL5A 3W6GA 4KA0A 3OR5A 5JCGA 1MTCA 6GSXA 4TN8A 1AIUA 4AJ7A 1SKWB 1BEDA 2I4AA 3A2WA 5J9BA 2K6VA 5CP1A 4OFNA 5ECHB 2LS5A 2R3XA 3O6TA 3ZYWA 1EZKA 1SL1B 2K18A 4HZ2A 4RI6A 1JZOA 4GRFA 5FWGA 1M2DA 2IMFA 5JCUA 4TKYA 3VI5A 1WJKA 1R26A 3D22A 2IFQB 1V58A 1T1VA 4TR0A 2F8AA 2L6DA 2H70A 1OC9B 1A8YA 5G1KA 3CSIA 2O87A 5KEJA 2OBKA 4EE0A 4EL1A 1Q4JA 2HSHA 3CBUA 4KSMA 3D21A 1U88A 1Z5YE 1PA3A 4K1FA 2HFDA 1X5CA 1T8EB 4GSSA 3E0UA 4HQSA 2HZEB 5JWQB 1GSQA 3GL3A 2OE3A 3VI7A 5ID2A 2E7PA 3TJJA 3G7IA 4N10A 3UL3A 3GTUB 2E2GA 1AUCA 4TXVA 4BA7A 1E6BA 3GKNA 3EU3A 3QD9A 2XHFA 1XBSA 3E9JB 1YKCA 2VCZA 3I43A 1K0BA 1XVQA 4GQCA 2K8VA 4G19A 3M8NA 1PQNA 3FZ9A 1F3AA 4KW6A 1EV9A 19GSA 5F07A 3TRQA 1A0FA 1TK8B 1OC3A 5FHIA 3EC3A 3TRPA 3TKSA 3VWWA 3VURA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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