4LLRA

Tryparedoxin peroxidase (txnpx) from trypanosoma cruzi in the reduced state
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
194
structure length
194
Chain Sequence
GDAKLNHPAPDFNETALMPNGTFKKVALTSYKGKWLVLFFYPMDFTFVCPTEICQFSDRVKEFSDIGCEVLACSMDSEYSHLAWTSIERKRGGLGQMNIPILADKTKCIMKSYGVLKEEDGVAYRGLFIIDPKQNLRQITVNDLPVGRDVDEALRLVKAFQFVEKHGEVCPANWKPGDKTMKPDPEKSKEYFGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the TRYPAREDOXIN PEROXIDASE from the human parasite TRYPANOSOMA CRUZI
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tryparedoxin peroxidase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 60
structure length 194
sequence length 194
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4llrA00
4WR5A 2VCZA 4OWYA 3Q18A 3GNJA 4YH2A 2JZTA 5ABRA 3FZ4A 4POLA 4GSTA 5ECNB 3ZL5A 3M0FA 4HI7A 4TR4A 5DAKB 1G0TA 4HJ2A 3VWXA 2PPTA 2YPMA 2OE0A 4GXZA 3EE2A 4NWYA 1AW9A 2KLXA 4OFMA 3KZQA 2IMEA 3HA9A 1OC3A 2CX3A 3M8NA 3RPNA 2H0GA 2GQMA 2H8LA 5ELGA 1XBSA 4OO5A 3IC4A 2CZ2A 4ZB6A 3H79A 4EL1A 5H5QA 3G7IA 1Q98A 1FB6A 1YF1A 3C1SA 3WT2A 4KE3A 4TR1B 5GSTA 1JFUA 2FGXA 2WCIA 3WGEA 3EURA 1S3CA 4HQSA 4AF2A 3VURA 2VL2C 3APQA 3WT1A 2YZHA 3D21A 3Q19A 1QGVA 3E0UA 1KBNA 1CQGA 3E3EA 3HJOA 1Y6EA 2O85A 2QKEA 3D22A 2VCWA 1F3AA 1B9YC 1GLQA 1DUGA 1ZOFA 3TUEA 3BJ5A 5DALB 1NM3A 1WPIA 5B6MA 4DSSB 5DQSA 2K8SA 4KCEA 3KMNA 4F82A 1BEDA 3UEMA 2DJ1A 2XC2A 2O87A 4JR4A 2X8HA 3KMOA 3G7YA 4KH7A 5F8BA 3HDCA 5J3RA 1T4ZA 3H1NA 4XTSA 5JCGA 4MLYA 4G2EA 1HD2A 4F0BA 2MMZA 3IV4A 1E2YA 4N0VA 1ML6A 2B1KA 2DMMA 2RLIA 5H5SA 3VK9A 5D96A 1DSBA 3UOMA 1PMTA 2VD0A 2TRCP 2CAQA 5EL8A 4PX1A 1UA5A 4IGJA 1WIKA 2YJHA 1YQ1A 2IWTA 5JWRB 3TKQA 3KD0A 2ZCTA 1B8XA 2KOKA 1MEKA 4GCIA 3KP8A 1EEMA 3IAM2 1I5GA 2F9SA 2I81A 1E6BA 2EIRA 4HZ4A 3QAWA 5G5EA 3IRAA 5EVOA 4XS4B 1O8XA 4ZB8A 2R5GA 1GSYA 1VF1A 4E8HA 5KN1A 4HOJA 3EU4A 2MYGA 1HNBA 4V1Ag 3WGDA 3N9JA 4F2IA 1XW5A 3IPZA 1ZYEA 3IXRA 1K3LA 1F2EA 4BPYA 1DBYA 4YAPA 1N8JA 2JZRA 4TR0A 2G2QA 4ZBDA 1GTBA 4Q5NA 4PNFA 1XOBA 1A24A 3GKMA 2LRNA 3PINA 3HD5A 1TK8B 2LQQA 3LWAA 1UN2A 5ECHB 4IQ1A 2X8GA 1YDKA 2HZFA 3C8EA 1T3BA 3ZIJA 2GT6A 3Q74A 1OE8A 5DAKA 1ZYQB 3ERFA 4WKWA 1Z9HA 4HS1A 3KH7A 1U3AA 5F05A 3DWVA 3F63A 2FWFA 3UIWA 1PX7A 3M3MA 3GH6A 1UC7A 1O73A 2O89A 1WWJA 4JBBA 2B5EA 5JWOB 2VL9A 2EC4A 1PL1A 2FA8A 3W8JA 2BMXA 5AGYA 4HZ2A 1AQVA 4TR1A 3GL3A 3W6GA 3DKSA 4WR4A 4TXVA 2PN8A 2LRCA 3I69A 1JLWA 6GSUA 1T4YA 4I97A 5ECOB 2P5QA 2KUCA 1NHOA 3J7Yb 5FWGA 1T00A 1YEXA 2C3NA 2WGRA 1ERTA 5IIZA 4G9HA 2XPEA 2B3SA 1XOAA 4PNGA 4JE1A 5DJLA 2PERA 3IAS2 3VWUA 5C04A 5H5RA 3FYGA 1YKCA 2DJKA 3C73A 2H70A 1SK0A 5DALA 3G7JA 2DJ3A 5HR2A 2GTUA 1G6WA 3A3TA 4ZILA 3JCML 5DCGA 1RW1A 3LQ7A 4FIWA 4MP4A 4MJAA 4DSSA 1ZGNA 5FT3A 4YQMA 1SKWB 3IBHA 2VL3A 2G0FA 4ZL8A 1FVKA 2VCQA 2KHPA 2YJ7A 2HLSA 2HT9A 2K9FA 1EEJA 4V2NA 1TTZA 4HDEA 5J41A 4Q5QA 3UVHA 5G30A 3ZITA 4K9ZA 3H8QA 4NHZA 4HQZA 3ZFBA 1CQHA 2N5AA 3P8WA 2V2GA 4HEA2 2K6VA 4LMVA 4EXJA 5G1LA 2IN3A 2YN1A 1WMJA 4ZXGA 1GNWA 3HZ4A 5IOXA 1YZXA 1SD8A 4K7IA 3TOTA 3ME7A 5IMZA 4ACSA 3D6IA 1SL2B 2F8FA 1V40A 1M2DA 2PU9C 1PN9A 1N2AA 2OA7A 1HNAA 3V1WA 4NMUA 1EV4A 6GSTA 1O6JA 2ZNMA 5A5KA 3TJFA 1EGOA 4MF6A 2OE3A 2P0GA 2F8AA 13GSA 3I6AA 3ERWA 1Z7RA 5JCWA 1AQWA 4RI6A 2N5BA 2JADA 1PKWA 1OC8A 1GP1A 1FO5A 5IPGA 4X0XA 3TDGA 1T7PB 1QFNA 3KIJA 3MNGA 4OCFA 2E7PA 2LEGA 2B1LA 3SWLA 3ZREA 2PUKC 3G9BA 2YWOA 4KAEA 1TXXA 4I8BA 4K7OA 1TW9A 2AHEA 5J4UA 4JRRA 3GMFA 3TKPA 3CSIA 4IBPA 4OMVA 1YJ6A 1OKDA 2VLUA 2M46A 4LL1B 2JSZA 4TXOA 3QDNA 2LJKA 4GSNA 3QCPA 1PX6A 11GSA 1TK0B 2CVDA 1K0OA 1WP0A 2H75A 3FY7A 2V41A 3FEUA 4BVXA 3GX0A 3R2QA 4ML6A 4GF0A 2JL4A 1USBA 3TKRA 2CX4A 1VRSD 4ZBAA 1ERVA 4BWQA 4IP1A 3UVTA 1AQXA 3L9VA 5CNWA 2M72A 2MBTA 2CT6A 5ECSA 2R37A 3UMAA 4K8MA 3F9UA 2I9HA 4LA1A 4V1Ap 4NV2A 5B6NA 2H01A 3KEBA 7GSSA 2BJXA 2IL3A 4MABA 1AXDA 4IP6A 3BCIA 2B5YA 4PURA 2IIYA 3C1RA 1H4OA 1B9XC 5ELAA 4ZB9A 4BA7A 5IQYA 2C3TA 2NTOA 3GA4A 1XWBA 3TB2A 4MMMA 2DMLA 2IFQB 3GSSA 2HE3A 4EF0A 3KH9A 5IMFA 4CW9A 4MPFA 1FB0A 2TRXA 1GTIA 4E8EA 1V98A 1C72A 3FW2A 3KM6A 2VLTA 3CRUA 3EU3A 1EWXA 4HU7A 3S9FA 1K0DA 2VLVA 5J5NA 5IO0A 2GQLA 3TKSE 4J56E 4GQCA 2DJ0A 2ON5A 2M80A 5F06A 5GAND 3KTLA 5J9CA 3QMXA 1YF0A 5AN1A 3PH9A 4N0ZA 5LD0A 1RK4A 2HFDA 3EMPA 1WRYA 3QAGA 3VI5A 4PUFC 4F9ZA 2GVPA 2HI7A 3DIEA 5LCZA 2WB9A 3ZFLA 4F0CA 4JR6A 1S3AA 1M2AA 3WD6A 3C71A 3HKRA 10GSA 2GQKA 2FWGA 1PA3A 3M9JA 1TDIA 3HHVA 5IPHA 4L8EA 1K3YA 2WDUA 3P7XA 2H1BA 1MDIA 2MMNA 4PQ1A 4YQVA 2IPAA 3TGZA 1ERUA 4XIHA 3EVIA 2E0QA 5IMDA 2VM1A 3DD3A 1FVJA 1LJRA 2VM2A 1SKSB 5LNKe 2YV7A 4GTUA 4MJBA 1TJDA 1A8YA 2OACA 1A0RP 3ZTLA 1G7EA 1URMA 3F4RA 1VF2A 1QQ2A 3US3A 3PGTA 3LGCA 1XWGA 2LUSA 2L4QA 5ECKB 3DYRA 1GNEA 4XS1A 3IK9A 3M9KA 4TR3A 3F6DA 1ERWA 1SL1B 3H93A 4N30A 3ERGA 2C0EA 3F3RA 4OFTA 4N10A 3DGQA 2LSTA 1ABAA 3VI7A 1MDJA 1R5PA 4BL7A 1SK2A 3GYKA 2ALBA 2XPDA 1GSQA 4KDYA 3KGKA 1XW9A 5HFKA 2FWEA 1JHBA 3K8NA 1OC9B 3IDVA 4LL4B 2AJQB 12GSA 1XVWA 3A2WA 2RM5A 2EIQA 4CHSA 4BVYA 2GZZA 1X9SB 3VWWA 3TJKA 1OYJA 2F3MA 2Z9SA 3LSZA 3QFBC 5CRWA 5HR1A 2QGVA 4EUYA 3FR3A 3MSZA 3GN3A 1M2BA 2OBKA 1GTAA 3UARA 4GSSA 1KNGA 4WXTA 6GSXA 1XWAA 4OFNA 4IW9A 1O85A 1BX9A 4RQRA 1NHYA 5E59A 2XHFA 1V57A 1J0FA 3F4TA 1QK8A 6GSYA 4ZL9A 2CVKA 2HNLA 3HY2A 1J08A 2DBCA 1HQOA 2IFQA 2C0DA 1X5EA 3GHAA 2IJYA 2AYTA 1OAZA 1LBKA 2MBSA 1U6TA 2I4AA 3F6FA 4L0UA 2L57A 4HUAA 1SL0B 4TXOB 3KP9A 4Q5RA 3BOAA 3RHCA 1X9MB 2V32A 1YEPA 1DE1A 2CZ3A 2E2MA 2X99A 2H71A 1A2MA 4POKA 3VLNA 3QOUA 1MTCA 2VUPA 2L59A 3LJRA 2YWNA 1TI1A 1J9BA 4ID0A 1R26A 2R6KA 3D4MA 2H6YA 4ECIA 4ILFA 1V9WA 3TRXA 4GLTA 2OE1A 2FWHA 4ZIJA 2DSAA 3A2XA 1AC1A 5B8BA 2VD1A 3P90A 4H86A 1K0CA 2H1AA 4KNDA 3BCKA 5A4UA 2F51A 2RUEA 1LU4A 5D73A 4AJ7A 1W89A 4WF4A 1PL2A 2QC7A 1FW1A 2FD3A 2YP6A 2K18A 4NHWA 2PGTA 1BJXA 3L4NA 3CTGA 2OADA 4ML1A 2H66A 2DIZA 1XWCA 5J9BA 3LYPA 4JEDA 1OVNA 4K2DA 2L5LA 1JLVA 2AUVA 4EKZA 1F6MC 1TP9A 4MJEA 5DCHA 4AJ8A 4WBJA 2IMKA 5CP1A 2HSYA 2HXKA 2H76A 5IMVA 3ISOA 3BBYA 3APSA 4MJCA 2H0IA 4FYUA 22GSA 5D9XA 1ILOA 4NV5A 3Q6OA 1PD21 3KXOA 4JU5A 2JZSA 2YWMA 4BWSA 5CRDA 4NAXA 3DVWA 2GSRA 2WFCA 4I2UA 3ZRDA 1GRXA 1SYRA 5HQPA 3L9UA 2YNXA 2TIRA 1THXA 2DIYA 3PR8A 1UVZA 3UBKA 3DEXA 3AY8A 1PQNA 1OC9A 2C80A 2DLXA 5G2ZA 1T1VA 2L6CA 4FYBA 4IELA 1TU8A 1ZMAA 4XRAA 3UBLA 1FHEA 3DXBA 3CYNA 3L0HA 3CSHA 2P31A 3ZYWA 1XW6A 1R5AA 4OD7A 4F03A 3VWVA 3HVXA 1GSSA 3D5JA 2RUFA 1XXUA 2B6MA 2X64A 2IMFA 4V2LA 4KA0A 4N11A 1M9BA 5D93A 1A2LA 1O8WA 5A4WA 4WEYA 1TRVA 2IMDA 1TOFA 4KW6A 2H0HA 5IM9A 3O3TA 4YAVA 2H1DA 4MK3A 4EVMA 1X0RA 3ME8A 4MDCA 4ZBBA 8GSSA 3FHKA 1FOVA 3WYWA 4TOPA 1X5CA 3KTBA 1M7TA 3W8SA 3D0ZA 3QD9A 1X5DA 5E4WA 1ACVA 4RUVA 1XCCA 17GSA 3VFIA 2XBQA 9GSSA 3IA1A 2YZUA 2H30A 2DJ2A 5DVBA 3U5RE 2LQOA 3D4TA 5D9WA 1GWCA 4K7NA 5CO3A 2LRTA 4DSQA 1Z6NA 4D73B 1JZOA 3GKKA 5F0GA 2NDOA 1W4VA 3QFAC 2ON7A 4ULXA 2IMIA 5ECIB 2HRNA 2LJAA 2P5RA 2GSQA 1JZRA 3CTFA 1GUMA 3F3QA 4MZBA 4K6XA 1TI3A 2WS2A 5G5FA 2OBIA 1VGLA 2K8VA 1BAYA 2DJJA 5B7CA 5JWQB 3ZVJD 4WBRD 1GSFA 3L78A 3FRCA 3FK8A 1TRSA 4L5LA 3UJ1A 4FH8A 3F8UA 3ED3A 5GZZB 3CRTA 1XWKA 1Q4JA 2FCHA 5JCUA 4TN8A 4MA9A 3A5WA 2KP1A 5FHIA 4RQXA 2ES7A 3GURA 3ZMLA 5DJMA 2R4VA 1MDKA 5ECLB 3OR5A 4L5OA 3VPTA 4MZCA 3LXZA 4EDYA 2H72A 1ZZYA 1EOHA 3LXTA 4O7HA 3QPMA 1ST9A 2A2RA 3GX8A 1K0BA 4DVCA 4YQUA 1SJIA 4EE0A 3FKFA 3TKSA 3FZAA 2L5OA 4WF5A 1SJ6A 3MWHA 5ECPB 5L71A 1ON4A 2QSIA 5EY6A 2GSTA 3TCOA 2A2SA 1RQMA 2HZEA 1Z6MA 3H4KA 4NXIA 2AV4A 5GSSA 5D9TA 2J23A 3IHQA 4K0GA 2KP2A 2C0FA 1F3BA 2WZ9A 5KN2A 2XBIA 3APOA 1R7HA 3ZLPA 1K0MA 4TRXA 4Q5FA 3TJJA 1JZWA 1PRXA 1QMVA 4MZWA 2V1MA 4PUAA 4XCSA 3EMXA 3GRXA 4XHMA 1WOUA 2LNSA 4O5RA 1AAZA 5HR3A 1SD9A 2R3XA 2C1YA 2GS3A 3DRNA 5KN3A 4OCEA 5ECRB 2RM6A 4AJ6A 2CVBA 1F37A 2HYXA 1G6YA 2C8UA 5DQYA 3HXSA 2H1GA 4K1FA 4KDXA 4HJMA 3A2VA 1XVQA 3FR9A 3GKXA 1ZL9A 5ID2A 4EO3A 2JSYA 4X1UA 4WETA 5KN0A 2VIMA 2LTKA 3DVXA 2J9HA 3NOFA 3U6VA 2MMAA 2NVLA 1K3OA 4KCAA 3LEFA 2MMOA 1EOGA 1YKAA 6GSWA 3HYPA 4OO4A 2H6ZA 4I2TA 4IS0A 2WRTA 3CMIA 2PVOC 2NPBA 2AAWA 4QL9A 1MD4A 1HYUA 5AIXA 4K0NA 3RAZA 2JU5A 3LFLA 3GTUB 1K0NA 4MF5A 4PQIA 3BD2A 1SJZA 2HSHA 2L6DA 4KUNA 4IVFA 2PVQA 2E2GA 3IOSA 2FUG2 3KCMA 4D73A 6GSVA 3DMLA 4X43A 4EC0A 4TVEA 5ECMB 5IMAA 1EV9A 4O92A 5IO2A 1TRUA 2VO4A 4QQ7A 2PMTA 1GSEA 1I9DA 1B48A 5CYYA 1XFLA 3FZ5A 2D2ZA 2H74A 3QAVA 3TKSC 4MPGA 2GGTA 2V6OA 4FYCA 4ZL7A 2RIIA 4GWRA 3TRPA 4XS6A 1XZOA 2WJUA 2YANA 1JZDA 1T8EB 2B7KA 3NIVA 1O7UA 2FY6A 5CRGA 3LYKA 3HZ8A 5HR0A 1NSWA 1M9AA 2I1UA 3HJMA 5DBQA 2B5XA 2YV9A 2GLRA 4TW5A 1B4QA 1GL8A 1K0AA 2YOIA 2BTOT 4MH2A 3FZ9A 5A4VA 1PKZA 1HNCA 5C00A 3LG6A 5IMCA 4DEJA 2H73A 5AISA 1THOA 2WULA 1OKTA 3L9SA 5EPFA 3HVSA 3GKNA 3GIXA 1Z5YE 1FAAA 4NPBA 2ZUPA 1Z3EA 2OJLA 5AIVA 3QR6A 5B8AA 3CBUA 3IK7A 4GRFA 5DDLA 2FNOA 1TKDB 1FG4A 3GH9A 4MCUA 3LORA 1SK1A 4QL7A 1A2JA 18GSA 4P3YB 3TJGA 2NBSA 4KX4A 1U88A 3ZVJA 2O7KA 3TJBA 1O81A 3GUSA 4IKHA 1KEBA 4KDUA 4GQFA 1A8LA 3ZZXA 3HJPA 4PQHA 1Z7PA 5ENUA 3CXGA 3TRQA 3I43A 2DC5A 1NW2A 1Y25A 1XPVA 3P2AA 2VCTA 3EINA 2H6XA 1S3DA 3I9V2 2YWIA 1SENA 2C3QA 5ECQB 2O8VB 5HFIA 3E9JB 3GV1A 3UL3A 4ECJA 19GSA 3M1GA 1YY7A 14GSA 1GSDA 1X9WB 2VOCA 1EGRA 3O76A 2PWJA 2H19A 4POMA 4G19A 4I5QA 4KSOA 3FR6A 3IE3A 2L4CA 2C4JA 4RI7A 1KTEA 4POBA 2LKUA 2LNTA 5HFGA 1VF4A 1GULA 1TRWA 1PSQA 1WE0A 1EP7A 1V58A 1QUWA 2PBJA 1G7OA 2REMA 2CQ9A 2HZEB 4ISDA 3F4SA 3RPPA 1M99A 5CREA 4DSRA 3MDKA 3GTUA 2A4VA 4PGTA 3ZIVA 1GSUA 3NZNA 3GFKA 5CRHA 3RHBA 4PXOA 1BYEA 5COHA 4XRDA 4FO5A 1XIYA 2OKAA 5F07A 4TKYA 1WJKA 3EC3A 3HCZA 4KB3A 2GZPA 2LS5A 2GSSA 4IQAA 4IN0A 2LV3A 4XS4A 4ECCA 2FHEA 5KEJA 1B4PA 2FLSA 4KGIA 4KSMA 3TOUA 1A0FA 1GH2A 1GUHA 3GSTA 4MF7A 4O32A 2EIOA 3MAKA 1DE2A 3J7Yk 1GTUA 3CSJA 2YCDA 1SU9A 3EYTA 1GLPA 5ID2B 1TK5B 3EWLA 2JACA 5G31A 3KJYA 2VL2A 20GSA 3WGXA 1F9MA 4ECBA 1BQ7A 4IJ3A 2B7JA 3IR4A 1U3IA 2V6KA 3RBTA 5D9VA 1IYIA 3ZMKA 4MH3A 16GSA 2C0GA 2VCXA 3VPQA 2CA8A 1BG5A 1QXHA 1AIUA 4V2MA 1A23A 4LMWA 1VF3A 1R4WA 4LLRA 1AUCA 2LJRA 4JZQA 4IHUA 4IJIA 2FA4A 2GT5A 4AGSA 3HVVA 3GL5A 5D8IA 2VCVA 2GDRA 4EDZA 1TU7A 2R2JA 4HU9A 5G1KA 1MD3A 2X8CA 2CAIA 1EZKA 2AB6A 2MZCA 5GAPD 1V2AA 1EP8A 3RDWA 1GUKA 3O6TA 5IOWA 2CV4A 4J57E 1IYHA 2I3YA 4J2FA 4CDOA 1H75A 1OE7A 3C7MA 1M0UA 5INYA 1PGTA 3UAPA 1U87A 4Z7XA 2VAFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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