1FO5A

Solution structure of reduced mj0307
Total Genus 16
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
16
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
b'MSKVKIELFTSPMCPHCPAAKRVVEEVANEMPDAVEVEYINVMENPQKAMEYGIMAVPTIVINGDVEFIGAPTKEALVEAIKKRL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Solution nuclear magnetic resonance structure of a protein disulfide oxidoreductase from Methanococcus jannaschii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
source organism Methanocaldococcus jannaschii
molecule tags Oxidoreductase
total genus 16
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1fo5A00
4OCFA 4ZB9A 20GSA 2L6DA 1NW2A 4PUAA 1QMVA 1G6YA 3IBHA 2C8UA 5IPGA 2GQMA 4GQCA 1GH2A 5KN1A 2ON5A 4YH2A 1HNAA 3LFLA 4ILFA 2LV3A 3C71A 4EO3A 4GRFA 4I2TA 5CP1A 4IP1A 3KH9A 3QOUA 3KD0A 1MEKA 4V2NA 2H6XA 1TI3A 4L0WA 5CRHA 3EINA 1THXA 1U6TA 2PGTA 3J7Yk 2L5OA 3F3QA 4XS1A 2V6OA 1YQ1A 3G7YA 4OCEA 1BYEA 3D0ZA 4PURA 3U6VA 3ZIJA 1NSWA 2B1KA 3HVXA 4TXVA 1SL1B 1E6BA 1BEDA 1SL0B 2P5QA 1WPIA 1T4ZA 2PU9C 4IP6A 3O76A 17GSA 1O7UA 5F8BA 2CX4A 2REMA 3TJKA 4HJMA 3R2QA 3SWLA 3A5WA 1G7OA 4L5OA 4FYUA 2KP2A 1T8EB 7GSSA 1R5AA 4I2UA 1YDKA 1ML6A 1O85A 4K0GA 2YV9A 6GSUA 2VCXA 4HUAA 2H0HA 3EU4A 2PERA 3DGQA 2J9HA 3TKQA 4V1Ap 4ACSA 3F6DA 4Q5FA 1M0UA 2AYTA 4CDOA 4HZ4A 3KTLA 1S3CA 4ML6A 3C73A 1HYUA 3DMLA 3VK9A 4IQAA 2DMMA 1SD8A 3ERFA 1AC1A 5HR0A 3GUSA 1M2AA 3WGEA 1NM3A 1F9MA 2IMIA 1FG4A 5CRWA 4MZWA 3DRNA 1FW1A 5B6MA 2IIYA 3M3MA 3LXZA 2VL2A 2FHEA 1ZGNA 3HXSA 2JADA 1M9AA 5D73A 5DBQA 3LYPA 2TIRA 2GVPA 2FLSA 2K6VA 1B4PA 8GSSA 1V57A 5HR3A 2CZ2A 1DE1A 4HU7A 2C0GA 1ERWA 1V58A 3GYKA 5KN3A 2QSIA 2JZSA 2XPDA 1UVZA 2D2ZA 4N0ZA 4PX1A 2H74A 3FRCA 1T7PB 1XFLA 4GSNA 5HFIA 1F3AA 16GSA 2WCIA 4ECJA 3KCMA 4EDYA 2X99A 3G7JA 1PGTA 4K8MA 1MDJA 5J4UA 1C72A 2JZTA 3HVVA 1MD3A 3QAWA 2OE0A 2BMXA 4GCIA 4MA9A 4XS4B 1RQMA 4YAVA 2FGXA 2RUFA 3IAM2 4IGJA 1XPVA 3KH7A 4EDZA 1FVKA 2P31A 4AGSA 4PNGA 2GQKA 2CAQA 4IJIA 2LTKA 4ULXA 2JSYA 2OBKA 3UAPA 1SJZA 4POBA 3GL5A 1SJIA 1GULA 4GQFA 3C8EA 1K3OA 4KW6A 3J7Yb 5LD0A 3QAVA 1JZDA 2C3TA 1FOVA 2KUCA 3L0HA 1THOA 2L4QA 4EL1A 1YEPA 5CNWA 1HQOA 3TKRA 3MAKA 4WF5A 2WGRA 1VF2A 3A2XA 3LGCA 3IAS2 1PX6A 3ED3A 3H8QA 5D9WA 4O7HA 5JCUA 3IV4A 3I69A 5IOWA 3ZREA 2ES7A 3KM6A 3DIEA 4WETA 2HXKA 6GSWA 1YKCA 1B9XC 3ZMLA 1GUMA 1OYJA 3KMNA 4LMVA 3QAGA 2B1LA 5F0GA 2B5YA 3H4KA 2EIRA 3F8UA 3IE3A 3FHKA 4TOPA 2K9FA 3WGXA 1TJDA 3I6AA 2L57A 2G2QA 5IMCA 3FR3A 2VAFA 2DC5A 3FW2A 3FK8A 3M9JA 5AISA 3ME7A 4WF4A 3QPMA 2V2GA 1B48A 1GSDA 1F37A 1GSYA 1SENA 2BJXA 3PH9A 4GLTA 3ISOA 1XW5A 5D9VA 3W8SA 2JACA 4POMA 4WKWA 4NWYA 4D73B 1U88A 4KX4A 4WR5A 12GSA 2TRXA 4NV5A 4XS6A 5DALA 3H1NA 2WB9A 2HRNA 5DAKB 2O7KA 3GIXA 2WDUA 3TJBA 4KGIA 5ECNB 1OE7A 4PGTA 5AIVA 2FWEA 4WBRD 4I6XA 1S3AA 4ID0A 1XIYA 3Q6OA 2C4JA 1TRUA 3UVTA 3CRTA 1XW6A 2HZEA 1GRXA 3LXTA 2V6KA 2DJ2A 3FYGA 5F07A 4NV2A 2H6YA 2OJLA 4KDXA 4XHMA 3EYTA 2KP1A 1ST9A 4XIHA 5L71A 4ZIJA 3Q74A 4MH2A 2IFQB 4JR6A 2EIOA 3ERWA 3LYKA 4EF0A 1EV9A 3F0IA 4AF2A 3L4NA 1TTZA 1AIUA 4IN0A 3IA1A 3ZL5A 2B5XA 4O92A 1ZCPA 2K18A 4TR0A 3GA4A 4MK3A 1XWBA 4L5LA 1WOUA 4K2DA 4J2FA 1TU8A 2JSZA 2XBQA 5HR1A 1FAAA 1J08A 1UA5A 2IN3A 2ON7A 5EVOA 1SKSB 2AV4A 3ZITA 3RAZA 5CRDA 1UC7A 2X8GA 3F9UA 1GUHA 3JCML 2FWGA 3P2AA 3VWWA 4GSTA 2LEGA 2CZ3A 3HZ4A 2YV7A 2X8CA 1ZYQB 4IBPA 2FA8A 2IMFA 1M99A 4MLYA 5IO2A 4F82A 2YANA 2J23A 1XCCA 2DSAA 3UBLA 2H1AA 4G9HA 2IJYA 5EL8A 2YP6A 1WJKA 1AQXA 2ZNMA 4PQ1A 2RUEA 3GH6A 3U5RE 2GLRA 3UMAA 2IWTA 2WRTA 5J3RA 3ZYWA 2VCZA 4F0CA 4L8EA 2OE1A 2IMEA 4WR4A 4K0NA 2QKEA 4HU9A 5C00A 2VL2C 5H5RA 5DVBA 4Q5QA 4OFTA 3F63A 5DJMA 5ECLB 4ZL8A 5KN2A 2YCDA 3VLNA 4NHWA 1QUWA 4JRRA 1J0FA 2H01A 2OBIA 2H1GA 1QK8A 4MF6A 2O87A 5JCGA 2ZUPA 2HT9A 1G7EA 4MCUA 1OKTA 1W89A 4E8EA 5IMAA 1H4OA 1VF3A 2H19A 4OFMA 2H66A 4KDUA 3RHCA 4MJBA 3VPQA 3GKKA 3HKRA 1GTUA 1B4QA 5IMDA 4TR1A 2AJQB 14GSA 2JU5A 3O3TA 1FHEA 3TKSE 1AUCA 1K3YA 4KCEA 4MABA 3UEMA 2GT5A 5CAXA 2KLXA 5A5KA 3LORA 4LL4B 1GP1A 1XOBA 2GSSA 2WJUA 3CBUA 1DBYA 3TRXA 1T3BA 3I43A 4HI7A 4MJAA 4GWRA 2H71A 3I9V2 4V2LA 2GGTA 4LMWA 4FO5A 3E3EA 3GN3A 3KXOA 1F6MC 3LJRA 5ECQB 4DSSB 6GSTA 1WRYA 2V32A 3D6IA 4BWQA 4J56E 3P90A 2C3NA 1ZZYA 3SBCA 3KP9A 1JHBA 2LJKA 2G0FA 1F3BA 3ZZXA 2BTOT 3GV1A 3D4TA 4IELA 4HJ2A 3ZFBA 5DCGA 3QDNA 2YWMA 2VIMA 1GNWA 1PD21 3GRXA 3GTUA 3L9UA 3GNJA 4TXOA 1O6JA 4HQSA 3C1RA 5A4WA 1JLWA 5CYYA 2KOKA 4F9ZA 2H0IA 1GLPA 1JZWA 1MDIA 1QXHA 3UARA 4F0BA 5H5QA 4KCAA 4ISDA 1JFUA 1UN2A 2F8FA 1EV4A 1GUKA 3M0FA 2WFCA 1WIKA 4F03A 2MMOA 2LRTA 4BVXA 4EKZA 1LU4A 4MDCA 2GDRA 3TUEA 1TK8B 4K7OA 3CMIA 1KNGA 3GKXA 1I5GA 5FWGA 2YJ7A 2H0GA 3G9BA 4ZBBA 4DEJA 2H30A 4KSOA 4PXOA 1QFNA 3C7MA 1Z7PA 5AGYA 3IRAA 3NOFA 2CAIA 3UBKA 4ML1A 1OE8A 4IHUA 4MPFA 1GSEA 3DVXA 2M46A 5J9CA 2FWFA 5G1LA 5ABRA 1TDIA 3LG6A 1VRSD 1XZOA 3DWVA 9GSSA 2R4VA 3VWUA 1Z6MA 5IPHA 3TJFA 2DJ3A 1RW1A 1TI1A 4ZB6A 4YAPA 4JE1A 6GSYA 2LRNA 1GL8A 4HOJA 4WBJA 4DSSA 2C0EA 2MMNA 3F4TA 4LLRA 3CYNA 2MMAA 5ECOB 2VL3A 3ZFLA 3RPNA 2A4VA 5AIXA 4G2EA 3CSJA 2LJAA 3GKNA 1A8YA 3RBTA 1SK0A 3LEFA 4OO5A 2H76A 4NXIA 5JWQB 3GH9A 2GT6A 4EUYA 4HEA2 5IMZA 3WYWA 2B5EA 1G6WA 2CVBA 1BAYA 4G10A 2LNTA 2CVDA 1K0AA 2VCQA 2PWJA 4OFNA 1M9BA 4GSSA 3KMOA 3IDVA 3DD3A 1PMTA 5DALB 5A4UA 4RQXA 4ZBDA 1XBSA 4TVEA 1U87A 4OO4A 3TRPA 2LQOA 1Z7RA 1SKRB 3TRQA 3FZAA 2RIIA 4OWYA 5DDLA 5G1KA 1OC3A 4CW9A 4V2MA 4N0VA 4XCSA 4JEDA 3ZRDA 3PR8A 1TRVA 3DYRA 1VF1A 3HJMA 2HZEB 1Y6EA 4DSRA 1NHYA 2H70A 4K1FA 1E2YA 1HNCA 2I3YA 3QMXA 3GL3A 1V2AA 2R3XA 2IL3A 3TOUA 4MPGA 2FA4A 1PQNA 4BWSA 3VPTA 3PINA 1GSFA 1JZOA 2DBCA 4LA1A 2R37A 1TW9A 2RM5A 1V98A 1R4WA 4JR4A 2L59A 5CREA 4ECCA 1A23A 2E2MA 1GTIA 1CQHA 22GSA 4AJ8A 1GWCA 2GSRA 2HNLA 3HHVA 5IIZA 5B7CA 5IQYA 3GKMA 3TKSA 1TRSA 3CSHA 5B6NA 3QD9A 4TR3A 2JZRA 4E8HA 4P3YB 1OC9B 2PUKC 4TRXA 2P5RA 3D22A 1VGLA 5FT3A 4FYBA 1TU7A 5ELGA 4GTUA 1EOGA 2HYXA 2HSHA 3BBYA 3VWVA 1X9MB 18GSA 1T00A 2F9SA 2FUG2 1URMA 3ERGA 2HFDA 1X9WB 2FD3A 3MWHA 4BA7A 3WGDA 2OADA 3TJGA 1FB6A 3HZ8A 5HR2A 2I4AA 1K3LA 3QFBC 4TKYA 3HDCA 2FWHA 3P7XA 1YZXA 3A2WA 4NMUA 1ERVA 4PNFA 5D9XA 3LQ7A 1DE2A 2MYGA 2LNSA 3WT2A 4BPYA 2HSYA 4IKHA 1V9WA 4KAEA 4I5QA 1AQWA 5GAND 4BVYA 4N30A 3RDWA 1K0NA 3G7IA 4KNDA 4V1Ag 4MF7A 1YF1A 4MJEA 1ZOFA 2VOCA 3QFAC 4GF0A 2GZYA 3QCPA 3WD6A 3HCZA 4YQVA 5CRGA 1OAZA 3ZVJD 1GSSA 5LNKe 3P8WA 3BCIA 1OC8A 1B8XA 3GX8A 2AHEA 2XBIA 1J9BA 4K7IA 4K6XA 1TRWA 1EWXA 4RI7A 3CSIA 2H73A 1WWJA 2HRFA 3M1GA 2VLUA 1X5DA 1R5PA 3IPZA 1OC9A 4TR1B 4K9ZA 3EWLA 2OKAA 2XPEA 3HJOA 5HFGA 4Q5NA 3EU3A 1FVJA 3ZLPA 2I81A 3E9JB 4KA0A 2H6ZA 1T1VA 2M72A 1PA3A 2C3QA 2VM2A 2NVLA 4OMVA 2MZCA 1XW9A 5HFKA 3VWXA 2R2JA 2HZFA 5H5SA 2H72A 2K8VA 1X5CA 4YQMA 3IR4A 3UOMA 5ECPB 4TW5A 4O5RA 2O89A 2TRCP 3N9JA 1PSQA 3IK9A 3K8NA 2B3SA 2V1MA 1O73A 2NDOA 1BX9A 3V1WA 2AB6A 2B7KA 1MDKA 4GXZA 1EGRA 4MZBA 3M9KA 1ERTA 1AAZA 5IOXA 2H1DA 3UJ1A 1XWAA 5IMVA 1DUGA 3GTUB 4TXOB 3QR6A 3GSSA 2H1BA 5G30A 5GSSA 1M2DA 1MTCA 1DSBA 2VCVA 3EMXA 4EC0A 2OACA 1O81A 3BCKA 2NPBA 1EOHA 2M80A 2XHFA 2L6CA 4L0UA 5FHIA 3HVSA 1X0RA 2A2RA 1LBKA 5ECIB 1B9YC 2HI7A 5DQYA 3FZ9A 1SD9A 5G31A 1JZRA 1X5EA 5ID2A 1M2BA 1XXUA 3L78A 4FH8A 4FIWA 2DLXA 3RHBA 2PMTA 1G0TA 3OR5A 2GSQA 4EVMA 5E4WA 5D8IA 2A2SA 3RPPA 2ALBA 4HZ2A 2E0QA 3D4MA 5IO0A 4AJ7A 1YY7A 3ZMKA 2E2GA 2HE3A 1GSUA 3ZIVA 2LKUA 4AJ6A 1R26A 4DVCA 4IJ3A 3CTFA 3L9VA 2DJJA 3FY7A 1SK2A 3W6GA 4HS1A 5F06A 1A2JA 3TKPA 3VURA 1TXXA 4N11A 3IHQA 2L4CA 1O8XA 3DEXA 1KBNA 1TK0B 2N5FA 3AY8A 4MP4A 4N10A 4HDEA 5JCWA 4HQZA 5EPFA 5ECHB 1K0BA 4H86A 1SK1A 1K0CA 2X8HA 1Q98A 2OA7A 4POLA 10GSA 2KHPA 2RLIA 4JU5A 1EP8A 1XOAA 2H8LA 4MMMA 1PKWA 4RI6A 3O6TA 2OE3A 1PL1A 1Y25A 2DIZA 4RQRA 4PQIA 3UIWA 1Z6NA 3IXRA 4IW9A 5GZZB 5J41A 3MSZA 5ECMB 1T4YA 2LSTA 1CQGA 3EE2A 4QL9A 3CXGA 1TOFA 2YWNA 3Q19A 3UL3A 4ECBA 2C1YA 1OVNA 3MNGA 1WP0A 4O32A 3TKSC 1A2MA 1GLQA 4KE3A 2C0DA 5E59A 3KGKA 4WXTA 5G2ZA 1YJ6A 3IOSA 2PVOC 2YJHA 2CQ9A 4NPBA 2PVQA 2FY6A 2K8SA 5GAPD 2XC2A 1MD4A 5D93A 3KTBA 1QGVA 2IPAA 1SL2B 1W4VA 3FR6A 2E7PA 3F3RA 2MBTA 19GSA 2PN8A 2X64A 3H93A 4KH7A 3F4RA 3ZTLA 4J57E 1IYIA 3GHAA 2GZZA 2B7JA 5DCHA 5JWOB 5B8BA 4MF5A 2YWOA 4QL7A 1A0RP 1AXDA 1TKDB 5INYA 2YZHA 3GSTA 2YN1A 5COHA 3HA9A 1ZL9A 2VM1A 4CHSA 5LCZA 3US3A 1I9DA 3FZ4A 1IYHA 1ERUA 2CV4A 3BD2A 1K0MA 4EXJA 1SYRA 2C0FA 3L9SA 4JBBA 2YOIA 3NIVA 2LJRA 4X43A 2WS2A 2P0GA 2LS5A 2R6KA 3FEUA 1K0OA 4FYCA 4XTSA 3KIJA 1SJ6A 4K7NA 5DQSA 1EZKA 2R5GA 1TK5B 2YZUA 1FO5A 3ME8A 1PKZA 2DJKA 1N8JA 5HQPA 3GURA 4ZXGA 1FB0A 1GTAA 2C80A 5JWRB 3H79A 1KEBA 5EY6A 2EC4A 5G5EA 2F51A 2GTUA 2WULA 4MZCA 1ACVA 1R7HA 3IK7A 1S3DA 3HJPA 1EEMA 5C04A 4ZL9A 3IC4A 2VCTA 4ZB8A 3PGTA 2DJ1A 4KB3A 2NTOA 5KN0A 4JZQA 2GS3A 3WT1A 2AUVA 3ZVJA 4TR4A 1Z5YE 2JL4A 1A0FA 3TCOA 3VI5A 4NHZA 6GSXA 2IMKA 2QC7A 1TP9A 3HD5A 1KTEA 1K0DA 1BG5A 1RK4A 3EC3A 1Q4JA 13GSA 3CTGA 2QGVA 5ELAA 1YKAA 1SYXA 3N5OA 2VLVA 3GFKA 2CX3A 1SU9A 1ILOA 2O85A 1BJXA 4POKA 3TB2A 1HD2A 2MBSA 2LRCA 2GZPA 2YPMA 2I9HA 5B8AA 1BQ7A 4OD7A 5D9TA 1XWKA 1EEJA 2CA8A 4XS4A 1GTBA 4Z7XA 2MMZA 4I97A 1Z3EA 2NBSA 2VD0A 2L5LA 4MJCA 4F2IA 1LJRA 2LQQA 1ON4A 1SKWB 3FR9A 2F8AA 5G5FA 4WEYA 1QQ2A 4BL7A 1AW9A 1U3AA 2VUPA 3LSZA 3FKFA 3TOTA 2VLTA 3UVHA 1N2AA 1XWGA 4YQUA 2RM6A 2AAWA 2VL9A 3DXBA 2I1UA 5D96A 3BJ5A 4Q5RA 1X9SB 3KZQA 2FCHA 3C1SA 4ZILA 1OKDA 2YNXA 4ZBAA 2VO4A 2ZCTA 1V40A 4IS0A 1PN9A 4I8BA 3Q18A 1U3IA 5ECRB 4LL1B 1F2EA 5J9BA 3CRUA 3LWAA 3D5JA 3GMFA 5F05A 2DIYA 3F6FA 3VI7A 1A2LA 1ABAA 2O8VB 3A2VA 4EE0A 3FZ5A 2CT6A 6GSVA 1XWCA 2VD1A 3EVIA 5ID2B 3KP8A 4TN8A 3APSA 4X1UA 5CO3A 3TGZA 3D21A 5ENUA 3DVWA 11GSA 5IM9A 4IQ1A 2N5BA 2IMDA 2WZ9A 1AQVA 2DJ0A 3DKSA 6GSSA 2PBJA 2GSTA 3TJJA 2FNOA 4ZL7A 1VF4A 1H75A 4MH3A 2HLSA 4XRAA 4PUFC 3S9FA 5GSTA 2CVKA 3NZNA 4DSQA 1XVQA 1PRXA 1Z9HA 4X0XA 4IVFA 3W8JA 1A8LA 4D73A 2VCWA 4KDYA 2V41A 3M8NA 1JLVA 1ZMAA 1WE0A 1NHOA 1PX7A 1HNBA 5DAKA 1YF0A 5ECSA 3HY2A 3KEBA 1EGOA 4KUNA 3APQA 3EURA 1EP7A 3E0UA 3HYPA 3MDKA 5ECKB 2F3MA 2N5AA 2YWIA 2EIQA 4KSMA 1A24A 3VFIA 4G19A 1YEXA 3APOA 1USBA 1O8WA 3F4SA 1GNEA 1ZYEA 4QQ7A 1XVWA 2LUSA 3BOAA 2GQLA 5DJLA 2DMLA 2H75A 2B6MA 2Z9SA 3TDGA 4PQHA 3GX0A 5J5NA 3EMPA 5IMFA 3KJYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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