4DVCA

Structural and functional studies of tcpg, the vibrio cholerae dsba disulfide-forming protein required for pilus and cholera toxin production
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
SNAAQFKEGEHYQVLKTPASSSPVVSEFFSFYCPHCNTFEPIIAQLKQQLPEGAKFQKNHVSFMGGNMGQAMSKAYATMIALEVEDKMVPVMFNRIHTLRKPPKDEQELRQIFLDEGIDAAKFDAAYNGFAVDSMVHRFDKQFQDSGLTGVPAVVVNNRYLVQGQSAKSLDEYFDLVNYLLTLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Vibrio cholerae
publication title The 1.2 A resolution crystal structure of TcpG, the Vibrio cholerae DsbA disulfide-forming protein required for pilus and cholera-toxin production
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
total genus 61
structure length 184
sequence length 184
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4dvcA00
5B8BA 3TKSA 4KGIA 3DMLA 4TXVA 1AQWA 3TJFA 1JZDA 4Q5NA 5ENUA 1LBKA 1DE2A 4NHWA 3N5OA 1HQOA 1RQMA 5ID2A 20GSA 2NTOA 1AQVA 1ST9A 5GAND 5ECSA 5IMDA 4OWYA 4JE1A 2LRNA 1YEXA 3KGKA 5CYYA 1QK8A 2P5QA 2PERA 5ELGA 3Q18A 1YKAA 1YDKA 4ID0A 1GNWA 4ML6A 3UARA 1J08A 4EDYA 3ERFA 4EUYA 4JEDA 4K1FA 3EVIA 5A4UA 3P90A 2JACA 1U3IA 3HA9A 2TIRA 2JSYA 2H8LA 2YANA 1PKZA 1GSFA 2B1KA 5DQSA 5ECQB 3TOTA 3D4MA 3DYRA 4IBPA 4O5RA 3LXZA 2VCQA 1THOA 2F8FA 2L4QA 6GSSA 3ED3A 1IYHA 1GUMA 2E2MA 4N0VA 1SJIA 3HVSA 2ON7A 4Z7XA 5CNWA 2JZTA 3D22A 4G9HA 3O76A 1ZOFA 2LS5A 1M2AA 2JZSA 3HHVA 4GSNA 1CQHA 2PVQA 1Y6EA 2C3TA 2YWMA 4HQSA 4QL9A 3LEFA 4WEYA 1ILOA 2F51A 1FW1A 2YWIA 4KDUA 1Z6NA 4JRRA 2PGTA 2QGVA 4HJMA 1PD21 4ECIA 3KTLA 2VL2C 2GZZA 2H1DA 1KTEA 3FW2A 2X64A 4NMUA 4EC0A 2VLTA 1EV9A 2OE1A 5IMZA 2LJKA 2H0HA 1I5GA 2X99A 4IELA 1VGLA 4ZB6A 3CYNA 1A23A 5B7CA 3CRUA 3KIJA 1BYEA 5G1LA 4KW6A 1JLWA 2LQQA 1XFLA 5AIXA 5KN2A 1M9BA 2YV9A 3MNGA 1OYJA 1XWAA 3TKRA 5C04A 4MPGA 5LD0A 3LWAA 4N11A 1M2BA 5ABRA 1SL2B 3KMNA 3O6TA 1MD3A 2PMTA 4KCAA 3EWLA 2CT6A 3QAGA 4V1Ap 2IMDA 3HCZA 3ZLPA 2ON5A 4BL7A 2OKAA 4BVXA 1GLQA 2H1BA 5G5EA 1N8JA 1TI3A 2EIQA 4YQUA 4MCUA 1X5DA 2XPDA 2ZUPA 3QMXA 2YV7A 3CSJA 1GWCA 1EP7A 4XCSA 7GSSA 1GULA 3TRXA 1EP8A 3GTUB 3DWVA 4K7NA 3TRQA 2L6DA 1M99A 2H66A 3F4RA 3EU3A 1AUCA 1U3AA 1O6JA 4PUAA 5CREA 5ECMB 5H5SA 2IL3A 1PL1A 1XCCA 1EGRA 3GKNA 5J9BA 4TOPA 3KH7A 3GTUA 4HJ2A 1VF4A 5IIZA 3QD9A 2KP1A 2M80A 5LNKe 2NVLA 1PSQA 4HUAA 3PINA 3GL5A 1G6WA 1MDIA 4XS6A 4GCIA 4O7HA 4FO5A 3MSZA 1EEJA 3I6AA 2IIYA 2X8GA 3HJPA 3L4NA 3KMOA 4LMVA 1SK1A 4ECCA 1TJDA 1NM3A 4HS1A 2VOCA 4KH7A 3KP8A 4FYBA 2FLSA 4EF0A 2I1UA 3TKSC 4TW5A 3RPPA 3P8WA 2B6MA 2RUFA 5G30A 4ZL9A 2GGTA 4ZB9A 2MMOA 1ABAA 1T3BA 3ZZXA 1PX6A 1VRSD 2DJ0A 1XOAA 2AUVA 3QCPA 1AIUA 4I6XA 3EYTA 2LQOA 3HDCA 3FZ5A 3VI7A 5F06A 5ECLB 3IK9A 4IW9A 4MP4A 2EIOA 4POMA 1FG4A 3GL3A 5G2ZA 3FKFA 5KN0A 2R5GA 3CRTA 3M1GA 3BOAA 4ZBDA 4ZBBA 3UAPA 1DUGA 2H75A 1DSBA 4WBRD 1USBA 4J2FA 4LL4B 2B5XA 5FT3A 3LGCA 5INYA 1PX7A 4MPFA 5C00A 1U87A 1G7EA 2VL9A 3F4SA 2M46A 1FB6A 5GZZB 4IJIA 3ERWA 1O73A 5GSSA 22GSA 5FHIA 3ZFBA 3M9KA 3HVXA 2JU5A 1K0BA 4YAPA 2NBSA 1DE1A 2GS3A 1OVNA 1T4YA 2EC4A 1VF2A 2VIMA 3RDWA 2GDRA 4IQ1A 3DVWA 1R7HA 1SJ6A 3ZIVA 5LCZA 4HZ2A 2NPBA 4YH2A 1SJZA 3GKKA 4JU5A 3VK9A 5JCUA 4AJ6A 2DBCA 2GZPA 3E9JB 4I2TA 3VURA 4NHZA 4N30A 2C0EA 3BCKA 3C7MA 1MDJA 2O89A 2HZEB 4KNDA 1GTIA 2HRNA 4DVCA 2VCTA 4HI7A 3HJMA 1NHOA 2YN1A 3PH9A 3IV4A 5CRDA 5H5RA 3UVTA 1F3BA 4AF2A 2E7PA 3LYPA 4ZL8A 1UC7A 2YWOA 1BEDA 2G2QA 2H1AA 4WETA 1B4PA 3WGXA 3DKSA 5F0GA 2QKEA 4D73B 4PUFC 2HZEA 2ZNMA 4EXJA 1A0RP 3R2QA 4YQVA 3D5JA 2WFCA 3HZ4A 2JZRA 3EMXA 4WR4A 2LSTA 1GRXA 4BVYA 1W89A 1X0RA 1SL1B 4WXTA 1HYUA 1MTCA 2B3SA 1OKTA 1XVWA 2VUPA 2OE0A 2CA8A 2FUG2 3FYGA 5DJLA 5ECIB 2L5LA 2K8VA 3FR3A 1OE7A 1B9XC 1GSSA 2H6ZA 1GSYA 1A8LA 4D73A 3I9V2 3QPMA 3GURA 6GSYA 3UVHA 3MWHA 3I43A 1EOHA 4ECJA 2VCWA 1IYIA 4AGSA 2LJRA 2V1MA 3KJYA 2O85A 1A2MA 2RM5A 1B9YC 3M3MA 4TR0A 4XTSA 5HFGA 11GSA 3D0ZA 4TKYA 4IP1A 3FK8A 4GTUA 3P2AA 3TKPA 6GSXA 3AY8A 3K8NA 1W4VA 4HOJA 3GH9A 2XBIA 4JZQA 5IOXA 1FVKA 2AB6A 2XPEA 3H8QA 2WS2A 3HZ8A 4FYCA 4MJAA 4POBA 2BJXA 4MLYA 2F3MA 3IK7A 1TU8A 5DALB 4LL1B 2PVOC 3GKXA 2XHFA 3H4KA 3CTFA 5HR0A 3FEUA 4KX4A 2HLSA 1OC9B 3HXSA 3TJBA 2WJUA 1ZYEA 2OBIA 3VFIA 2IMKA 4E8EA 4NV2A 5E4WA 4MMMA 2HXKA 3UJ1A 2IMEA 1Y25A 2WGRA 3ZVJA 2CVBA 4JR6A 1Q4JA 1TRWA 3GUSA 4LA1A 1TP9A 1KEBA 5DALA 1EGOA 4ZIJA 3ISOA 2A4VA 4N10A 3TOUA 3F0IA 4JBBA 3D6IA 3ZFLA 2DJJA 3CMIA 1OC9A 2FY6A 1Q98A 1UVZA 5DCGA 1VF1A 1BQ7A 4K0NA 2ALBA 2FWGA 2VL3A 2MBTA 1PMTA 1XWGA 1ZMAA 5GAPD 5J41A 4PQ1A 4XHMA 3O3TA 4HU7A 4K2DA 1GTBA 3ZRDA 2NDOA 4ACSA 2P31A 2IMFA 1FB0A 1UN2A 4QQ7A 2DJ2A 3ZMLA 2DIZA 1LJRA 1XVQA 1X9MB 1N2AA 2YZHA 2LJAA 2Z9SA 1R5AA 1OE8A 1GLPA 5H5QA 5D73A 3KM6A 1UA5A 3WT1A 3KD0A 5IO0A 3CTGA 3UOMA 1QXHA 3ZIJA 1DBYA 1JZWA 2GZYA 2O7KA 5AGYA 1EEMA 2KP2A 5DVBA 5HFIA 4G10A 4PURA 1T8EB 6GSTA 1TRUA 2L59A 2AHEA 2LRTA 5JCGA 2C0DA 3WD6A 2OADA 2OJLA 3HKRA 3WGEA 2YZUA 1JFUA 3E3EA 1LU4A 5DQYA 4IGJA 3HJOA 2RM6A 2GLRA 2I81A 2V41A 5J9CA 1A8YA 2V6OA 4K8MA 1M0UA 2VLUA 1MD4A 3C71A 2GQMA 1I9DA 3APSA 2VCZA 3UMAA 2HFDA 4TR3A 1ERTA 2LNTA 1WWJA 2LV3A 5A5KA 1AXDA 4PGTA 2I4AA 5ECRB 1XW9A 3HYPA 4MJBA 1GSEA 4KB3A 2RIIA 3KCMA 4GLTA 4MF7A 3TKSE 2H71A 1ACVA 2GQLA 4ISDA 5D9VA 12GSA 2GT6A 1QGVA 3VWXA 1GSUA 4PXOA 3IHQA 4O32A 3ZTLA 1ML6A 3GYKA 3ZMKA 1K3YA 3ERGA 1YF1A 3JCML 4MZBA 4OFNA 6GSVA 4OMVA 3LYKA 3RBTA 5J4UA 1QQ2A 4PNGA 4MABA 1QUWA 1SD8A 3TJJA 3QR6A 2A2SA 3IE3A 2F9SA 1SKSB 2CZ2A 1R4WA 2YP6A 3ZL5A 5DJMA 1FVJA 3A5WA 2MYGA 2CAQA 2YNXA 1C72A 4AJ8A 4RUVA 4WKWA 1FO5A 2X8CA 3FY7A 1BJXA 2K9FA 3W6GA 3F3QA 2V6KA 1X5CA 2PWJA 4F2IA 13GSA 1EZKA 3NIVA 3G9BA 3EMPA 2ES7A 3C73A 3TB2A 5A4WA 2DIYA 5AN1A 2DMLA 5ECHB 3EU4A 5ECPB 4ZILA 1JZRA 2WZ9A 2J23A 3M0FA 1V9WA 2FWHA 3F63A 5IMVA 3A2WA 2HRFA 4MZCA 2C3QA 2C8UA 3GKMA 4IP6A 1E2YA 5DDLA 4NXIA 1M7TA 1O85A 1OC8A 2YWNA 1O8XA 4ZL7A 5HR3A 10GSA 2R37A 2FD3A 2R4VA 4L0UA 4HEA2 5HR1A 1SKWB 2REMA 4L5OA 4MJCA 5DAKB 2GSQA 1SU9A 2H30A 2L5OA 2LTKA 1K3LA 2LUSA 3P7XA 4POLA 1RW1A 2C3NA 2OBKA 4WBJA 3ME7A 5ELAA 3LXTA 1K0CA 5B6MA 3Q6OA 5JCWA 2L4CA 3GN3A 1GL8A 2A2RA 1PRXA 4GF0A 1URMA 2VD1A 1A2JA 3CSHA 5DAKA 5F05A 3NZNA 4V1Ag 3GX8A 4IVFA 2KHPA 2YCDA 5KN1A 2LEGA 2MBSA 1NHYA 1O8WA 1M2DA 1X5EA 2DJ3A 3TUEA 3TKQA 1ERWA 1OKDA 2P5RA 1TTZA 2VD0A 2K18A 3IAS2 3EURA 5JWQB 3EE2A 2AYTA 3UEMA 3ZREA 2H19A 5IPHA 4WF4A 4OFMA 2BTOT 3KEBA 4K9ZA 1KBNA 3FR6A 3F4TA 4DSRA 1K0AA 3GV1A 2PBJA 5CO3A 1K0DA 2IN3A 4GWRA 4KSOA 4TR4A 1AQXA 1WJKA 1SK0A 1WIKA 3N9JA 1Z9HA 4EVMA 1WE0A 1V40A 1A0FA 3F6DA 1S3CA 3FZ9A 2DJ1A 3DIEA 3GA4A 1HNAA 1G0TA 2DSAA 3VWUA 1BAYA 1X9WB 8GSSA 2H0GA 1GUHA 1J0FA 3L9UA 5D96A 5HFKA 2K6VA 2FCHA 4IS0A 2MMZA 2VM1A 5EL8A 1THXA 2WDUA 3A3TA 1K0NA 4F9ZA 3DEXA 2PU9C 3G7YA 2DLXA 3KH9A 1PL2A 5AIVA 3A2XA 3QFAC 2CZ3A 4K6XA 4BPYA 4NAXA 4POKA 1G7OA 2RLIA 3F9UA 4OCEA 1K0OA 2TRCP 3CSIA 4HQZA 5CRWA 2AAWA 4BWSA 1XIYA 3TJKA 4DEJA 4MH3A 2HE3A 4EO3A 3Q74A 1T4ZA 5A4VA 1V57A 3H79A 1S3DA 1WOUA 5KEJA 1F9MA 2OACA 4KDYA 4K7OA 3DVXA 2IWTA 3VWVA 1SKRB 4TR1B 3QAWA 1XZOA 4HDEA 5HR2A 2HYXA 3TGZA 1AW9A 1XPVA 5D8IA 4OD7A 4IQAA 1HNCA 1J9BA 4EKZA 1WP0A 2CAIA 2WRTA 2VLVA 17GSA 2CQ9A 2HT9A 3BD2A 2GVPA 4RQXA 3IXRA 5CRGA 4EL1A 5G1KA 2B1LA 4IHUA 1XWCA 4LLRA 2AJQB 4GSTA 4PQIA 4DSSB 3QOUA 2GTUA 2WULA 4TR1A 3GHAA 5IMFA 3RPNA 2R3XA 2PPTA 3GMFA 1SD9A 4MF6A 4GRFA 3D4TA 2L57A 3UL3A 3QAVA 3MDKA 2MZCA 3IA1A 1M9AA 3ZYWA 5ECOB 2CVKA 1BX9A 3EC3A 5E59A 1YY7A 2KOKA 2PN8A 2C0FA 4TXOB 2CV4A 2C0GA 2YOIA 4DSSA 3F8UA 2V2GA 4F03A 1TDIA 1ZGNA 2HSYA 3KTBA 1A2LA 4ULXA 1U6TA 2C4JA 2GSRA 2H70A 3US3A 5D93A 4XRDA 4E8HA 3VPTA 1B8XA 1H4OA 4F0CA 3QDNA 4Q5QA 2H6XA 3DGQA 5G5FA 3IDVA 2N5AA 5IO2A 5COHA 4L8EA 1Z6MA 4ML1A 2P0GA 4TXOA 1FOVA 3M9JA 1F37A 4IN0A 4GSSA 4X1UA 1ERUA 4PX1A 4X43A 1XXUA 3IOSA 1B4QA 1O81A 1OAZA 2FHEA 3CXGA 4ILFA 5CRHA 2CX4A 3PR8A 4HU9A 5AISA 3CBUA 4V2LA 1GTUA 5IPGA 1TW9A 1EV4A 1U88A 1YKCA 3HY2A 3S9FA 1QFNA 1ON4A 3FRCA 4GQCA 2IMIA 1OC3A 1NSWA 2VO4A 3W8SA 1GTAA 1XW5A 3TJGA 4K7IA 3LSZA 4PQHA 18GSA 1JLVA 1TK0B 3WGDA 4ECBA 2HSHA 3LJRA 1QMVA 1TK8B 1ZCPA 3GSTA 1V98A 5ECNB 1SL0B 2M72A 4XS4B 2I9HA 4MK3A 1HD2A 3L78A 1GUKA 4OFTA 3APOA 4I97A 1EWXA 4Q5FA 1ZL9A 4O92A 4NV5A 1VF3A 2D2ZA 4TRXA 3IR4A 4XRAA 4CHSA 1Z3EA 5EY6A 3ZITA 4AJ7A 4MF5A 1PN9A 5GSTA 4F0BA 3U5RE 5F07A 4XS4A 4TVEA 2FA8A 4V2MA 4RI7A 4BWQA 5D9WA 5J5NA 2V32A 1SYRA 2E2GA 4DSQA 5B6NA 3F3RA 1MDKA 3GNJA 2GT5A 2VAFA 1FHEA 4G19A 4FH8A 2LKUA 4KSMA 2DMMA 3DRNA 2H73A 4MZWA 5D9XA 5CP1A 3UBKA 2E0QA 2H76A 1R5PA 1YZXA 4I8BA 3BBYA 1O7UA 1YEPA 1KNGA 1WMJA 3C1SA 3LFLA 2RUEA 1K0MA 2KLXA 4WF5A 3LQ7A 4J57E 5HQPA 1BG5A 1SENA 2I3YA 2J9HA 2XBQA 4KDXA 1WRYA 3QFBC 1AC1A 3F6FA 4G2EA 5IOWA 3RHBA 4ZBAA 3KXOA 2WB9A 4YQMA 4KA0A 4GXZA 2GQKA 3G7IA 2DJKA 5IM9A 3HD5A 3IPZA 2IFQB 5IMCA 1PKWA 2XC2A 2B7JA 3VWWA 2C1YA 3KP9A 2FWEA 2GSTA 6GSUA 1A24A 1WPIA 4KUNA 1TXXA 19GSA 4EE0A 3HVVA 4L0WA 2FA4A 4FIWA 1RK4A 5L71A 3VLNA 4CW9A 4KCEA 2K8SA 5KN3A 3BCIA 3L9VA 5J3RA 3H1NA 1HNBA 1TKDB 2B5EA 1GSQA 1V58A 9GSSA 2WCIA 14GSA 1GNEA 2JSZA 3FZAA 4KE3A 2FGXA 2H1GA 5IMAA 1GSDA 2IFQA 3TCOA 4ZXGA 2X8HA 2CVDA 1ZYQB 1T00A 3ZVJD 2R6KA 5CAXA 3IBHA 3GH6A 1V2AA 3VPQA 4BA7A 3L0HA 5IQYA 4IJ3A 2MMNA 2LNSA 3ME8A 4MH2A 4H86A 3GRXA 4I2UA 2B7KA 3W8JA 2DC5A 1FAAA 2F8AA 2GSSA 2JL4A 4XIHA 2VCXA 2FNOA 2H01A 3UIWA 1GP1A 1SYXA 2YJ7A 3M8NA 2ZCTA 3DXBA 1TOFA 3RHCA 1YJ6A 5B8AA 1X9SB 2VCVA 2HZFA 2TRXA 2C80A 4KAEA 4Q5RA 3FR9A 3V1WA 3C8EA 3H93A 1B48A 2PUKC 2VL2A 5DCHA 2BMXA 2YJHA 3A2VA 4OO5A 5D9TA 1R26A 2B5YA 4NWYA 4J56E 1XWKA 2O8VB 4LMWA 3IAM2 1TU7A 1PQNA 4NPBA 3SBCA 2OE3A 4YAVA 1SK2A 2H0IA 4L5LA 2KUCA 3FHKA 1XOBA 1F6MC 1G6YA 2HNLA 2G0FA 2FWFA 2MMAA 5ECKB 2IJYA 1F3AA 1XWBA 1PGTA 5JWOB 3E0UA 1YF0A 1T7PB 3I69A 2H6YA 1GH2A 1K3OA 4P3YB 2VM2A 3D21A 2O87A 3PGTA 2LRCA 1Z7RA 3G7JA 1T1VA 4XS1A 4RI6A 3FZ4A 3Q19A 2HI7A 4MA9A 4I5QA 4RQRA 4ZB8A 2H74A 3EINA 3UBLA 3DD3A 2AV4A 3TDGA 3GIXA 1S3AA 3C1RA 4IKHA 3MAKA 1TK5B 1MEKA 1TI1A 4WR5A 1E6BA 3J7Yk 5F8BA 3KZQA 2N5FA 1ZZYA 4OO4A 3OR5A 2JADA 1ERVA 1EOGA 1F2EA 1YQ1A 3GFKA 3J7Yb 4N0ZA 4F82A 1XW6A 2QSIA 2CX3A 4K0GA 4MJEA 5EPFA 1NW2A 4QL7A 3BJ5A 3VI5A 4JR4A 2OA7A 2QC7A 1PA3A 2YPMA 4OCFA 4EDZA 4GQFA 3LORA 3NOFA 1XBSA 4FYUA 3SWLA 5DBQA 3WYWA 3U6VA 3IC4A 1TRSA 3GX0A 4TN8A 2IPAA 2L6CA 2H72A 2N5BA 1TRVA 2EIRA 5ID2B 2R2JA 4HZ4A 3LG6A 4PNFA 5EVOA 5G31A 3TRPA 4CDOA 1AAZA 1H75A 5FWGA 1CQGA 16GSA 3APQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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