3UJ1A

Crystal structure of the third thioredoxin domain of human erp46
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
106
structure length
99
Chain Sequence
b'TVLALTENNFDDTIAEGITFIKFYAPWCGHCKTLAPTWEELSKGVKIAEVDCTAERNICSKYSVRGYPTLLLFRGGKKVSEHSGGRDLDSLHRFVLSQA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Peptide Binding by Catalytic Domains of the Protein Disulfide Isomerase-Related Protein ERp46.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin domain-containing protein 5
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 29
structure length 99
sequence length 106
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uj1A00
3G7IA 4JR6A 2C0DA 2IN3A 4WEYA 1KEBA 4IBPA 1R5AA 2L4CA 4YQVA 3FZ5A 1YY7A 4HI7A 2DC5A 1XWKA 2O8VB 2JACA 1F37A 3QFAC 1EP7A 4ZB8A 1XFLA 4ZXGA 1J08A 2VO4A 2HSYA 2VOCA 2VD0A 2L6DA 3TGZA 5IMVA 2DMMA 1R26A 4IS0A 4E8EA 3D4TA 4GSTA 1TI1A 1TP9A 3DRNA 1Z7PA 1USBA 5AN1A 3GSSA 1DUGA 1H4OA 1M0UA 2LRNA 1OVNA 2OBIA 2PPTA 3ZFBA 1QXHA 4MJCA 5FHIA 2GVPA 2AJQB 2OACA 1IYHA 1XWGA 1T1VA 2DJJA 5A5KA 2O89A 5G5EA 2PN8A 1U3IA 2QGVA 1YEXA 3F4SA 1GUKA 2L6CA 5JCUA 2IJYA 4F0BA 4MZBA 5G1LA 1FB6A 2FWGA 4J2FA 4TXOA 4WBRD 4I2UA 5KN3A 1X9SB 1F3BA 3RDWA 2XPDA 1K0CA 4BPYA 2H74A 5D93A 2B5XA 1TRUA 2REMA 2LTKA 1R7HA 4HU9A 3UMAA 1DE1A 4TXVA 2H01A 3TKSA 3AY8A 2XHFA 5JWQB 1EOGA 4HEA2 2GZPA 4HDEA 2PU9C 5IO2A 1B9YC 4OCFA 2LQOA 3UL3A 2MMAA 5G5FA 6GSXA 5B6MA 4KE3A 2N5FA 2E2MA 1QMVA 5ECMB 5H5SA 2JU5A 1E6BA 5ID2B 1GNEA 1ZCPA 2A4VA 3LGCA 2VL2A 2P31A 5IOXA 1JZRA 4OCEA 2VLUA 2F3MA 7GSSA 3FW2A 4N10A 3ZREA 1NM3A 1MTCA 2I3YA 11GSA 4IQ1A 4G19A 4IN0A 1XPVA 1O7UA 2M46A 1ZMAA 3G7YA 1HNBA 3A5WA 5F06A 4AJ7A 3BJ5A 1PX7A 5D9TA 5EPFA 3MAKA 4QQ7A 1PRXA 5J9BA 3LXZA 1SKSB 3A2XA 5ECNB 1TDIA 2IFQB 2WULA 2DSAA 4LA1A 1PL2A 1JZOA 2BJXA 2MMOA 4FYCA 3FEUA 2RUEA 3F0IA 4N0ZA 4EVMA 2Z9SA 4HU7A 2IMFA 3KZQA 1NHOA 1BX9A 1GLQA 1OC9B 1EGOA 3GTUB 4YQMA 3TRQA 3GKMA 1AW9A 3FZAA 4G9HA 4GLTA 5IQYA 10GSA 3VWXA 1N8JA 1LU4A 2YJ7A 4XHMA 1B48A 3TKPA 1SJ6A 1Q4JA 2H0IA 2R5GA 3GYKA 2RLIA 3UIWA 2H30A 4DEJA 1SJZA 17GSA 1VF4A 1JHBA 5AIVA 3QCPA 4K7NA 3I43A 5H5QA 2GS3A 2OE1A 1Z6MA 4CW9A 3LYPA 3D4MA 1Z5YE 2DJ1A 3ZMLA 2HNLA 2FY6A 4PQIA 3VI5A 2GQKA 2H76A 4K6XA 2A2SA 1SENA 3D6IA 1THXA 4YH2A 5DBQA 4ZIJA 3IHQA 2H0GA 1VF3A 2JZSA 1XOBA 2GSTA 3TJJA 2VCZA 1S3AA 1DE2A 1GLPA 1ST9A 3HCZA 5KEJA 5IMDA 4IW9A 3VURA 1LBKA 4DSSB 2VL9A 3DWVA 4PUFC 1EWXA 4ULXA 3GL3A 1M2DA 3TOTA 5ECHB 2NDOA 4Z7XA 1RK4A 1SL2B 1GNWA 4OD7A 4TN8A 4EF0A 4ZILA 1TKDB 2LJKA 4IJ3A 2WRTA 5LD0A 1HD2A 1TK8B 3ZRDA 3EU3A 1M99A 5L71A 1U3AA 4NXIA 4MJAA 2BMXA 5J4UA 4HZ4A 1XBSA 3GL5A 5CREA 2DJ0A 2H75A 6GSTA 1EEMA 1PN9A 1TK0B 3F3QA 1GUMA 5IMZA 5CO3A 5COHA 3MDKA 3Q19A 1M9BA 1X5CA 4AJ8A 1YEPA 2K9FA 3BBYA 4KGIA 1K0NA 2CZ2A 3IOSA 5HR2A 1FW1A 1O8WA 5IPHA 2GT5A 1T8EB 1XCCA 3APSA 5ECPB 4NWYA 3S9FA 4ZL9A 4G10A 4CDOA 2VUPA 2QSIA 3APOA 4GRFA 2IWTA 3CXGA 4N0VA 3UARA 1XIYA 2C80A 3H1NA 4EDZA 2H6ZA 5D73A 2MMNA 4MH2A 1OYJA 1TRWA 3N9JA 1Y6EA 4IQAA 4XS1A 4KCEA 3Q18A 3LQ7A 4PUAA 3F4TA 1S3CA 3ME7A 4KUNA 3WT2A 4ECIA 2TRCP 2I4AA 2AAWA 2LJRA 5DJLA 5B8AA 3LORA 3F3RA 1I5GA 2FUG2 5G31A 1SK2A 3TKQA 1AQVA 1MD4A 1I9DA 3JCML 2EIRA 4YAPA 4F03A 2HSHA 1GSDA 3QR6A 2GLRA 2OKAA 2H72A 3J7Yk 2CX4A 2GZYA 1XZOA 4O7HA 2KUCA 3IE3A 2VD1A 3ZYWA 20GSA 2JZRA 1X5DA 2PMTA 2NPBA 4MZCA 1ILOA 2LNSA 3N5OA 1QFNA 4AJ6A 1SU9A 3GSTA 4EO3A 3HKRA 3FR9A 2AUVA 1EOHA 3TKRA 3LG6A 3KP8A 4WR5A 5INYA 3CTFA 5D96A 3CTGA 1AAZA 2R4VA 4K7IA 4KB3A 5DQYA 3QAVA 5CYYA 5H5RA 4HQSA 3BD2A 2H73A 3NOFA 3D0ZA 1SYRA 2P5QA 3UVHA 2XBIA 1GRXA 1TOFA 1SD9A 2CVKA 3DGQA 4ID0A 2CT6A 3UEMA 4RQXA 3TCOA 2ZUPA 2C0EA 2MYGA 2CVBA 3O3TA 4IVFA 3ME8A 4JZQA 4MZWA 1FVJA 1PMTA 5CRHA 3TKSC 3GNJA 3WGXA 1YF0A 1PQNA 1GTUA 4XIHA 5EVOA 3DVXA 4GQFA 5AISA 4ISDA 4KSOA 5ECKB 3HA9A 2R6KA 4Q5FA 4TW5A 2JL4A 1CQGA 3EYTA 3L0HA 2NBSA 2VLTA 4NV5A 5GZZB 4V2NA 5DQSA 3TKSE 4HS1A 1ERUA 4ZL8A 1XOAA 1HNAA 2H1BA 3SWLA 3IXRA 2ZNMA 4X0XA 5ID2A 2OADA 3CSIA 3DIEA 3OR5A 2GZZA 4ZBDA 3QAGA 5AGYA 2FNOA 3CSHA 3C73A 2CAQA 1UVZA 3D21A 3CRUA 4L8EA 5KN0A 4E8HA 1URMA 1SL0B 2EIOA 2PERA 3LEFA 2FWFA 4F0CA 2R2JA 4RI7A 1EV9A 1WMJA 4IP6A 1TXXA 1EV4A 3CBUA 3IV4A 4NAXA 4V1Ag 2RM5A 4TRXA 2X8CA 2IFQA 1FHEA 19GSA 3M1GA 1WRYA 4OWYA 1UC7A 3GFKA 2AB6A 3KIJA 1AIUA 2FD3A 1HNCA 2DIZA 2KOKA 3EINA 1V58A 4HJMA 4YQUA 3CMIA 2LSTA 1V2AA 1GH2A 1YZXA 5HR0A 3IA1A 5KN1A 1QQ2A 4TR1B 2LRCA 1OC9A 2ZCTA 3IRAA 1BYEA 1FAAA 5DAKB 3GTUA 2EC4A 5F0GA 2I9HA 2HT9A 1K0AA 6GSWA 9GSSA 2VCQA 5ABRA 3F6DA 1F9MA 4JRRA 1ML6A 3VI7A 3A2WA 1GSEA 4L5OA 5JCGA 5GAND 4WF4A 3QAWA 4JBBA 4Q5QA 1A0RP 3RPNA 2K8SA 1A23A 2CVDA 4H86A 3LXTA 1K3OA 2PBJA 2R3XA 3ERGA 4JU5A 1T3BA 4OFMA 1Z6NA 3HVXA 3EVIA 4WBJA 2KP2A 4TR4A 4X43A 2WDUA 3IR4A 1K0DA 1TRSA 1OC8A 3G9BA 3HD5A 2NVLA 2C3NA 5CP1A 2OBKA 1X5EA 4ZBBA 4IJIA 4FO5A 2VCTA 3GX8A 3TJGA 4KNDA 4PXOA 3QOUA 4K0GA 5B7CA 5GAPD 2AV4A 3LYKA 1OE8A 3US3A 2DBCA 5A4VA 2VLVA 3KXOA 4EDYA 4DSSA 1ERTA 3I9V2 1ZYQB 4LMVA 2MMZA 4ZB6A 3TJKA 3UVTA 1VRSD 1A8LA 4ECJA 4KW6A 1NSWA 3DMLA 1T7PB 4YAVA 4KA0A 5HFKA 4LLRA 2LRTA 3ZIVA 3P2AA 4OO4A 4KAEA 2O85A 4OFTA 1K3LA 4Q5RA 5IMFA 2IPAA 3PGTA 4GCIA 5HR1A 5GSTA 1YQ1A 4GWRA 2K18A 1TRVA 3UAPA 3GUSA 1O6JA 2G0FA 1EGRA 2NTOA 3GKKA 1B8XA 5E59A 3GV1A 3NIVA 5LCZA 3E3EA 4OFNA 3VFIA 1B4QA 1YKAA 1GSFA 3GURA 2IMKA 2I81A 1WOUA 2C0FA 3NZNA 3IK7A 2IMIA 1FG4A 1K0MA 2YWOA 1A2JA 1Q98A 3FK8A 3RBTA 2WJUA 1T4ZA 4PNGA 3APQA 3F8UA 4K1FA 1NHYA 1R5PA 4JEDA 3LFLA 22GSA 4K9ZA 1PSQA 2J23A 3GA4A 1TI3A 2HRFA 3GIXA 2WFCA 2H6YA 4BWSA 2V32A 4MP4A 3RHBA 1MDKA 2FHEA 4HZ2A 4ZL7A 4WXTA 2FWEA 1M9AA 4ECCA 5IOWA 2HZFA 6GSVA 3IAM2 2L57A 3WGDA 3GMFA 2IMEA 4MH3A 4P3YB 3ED3A 3TDGA 1ZYEA 4BWQA 1B4PA 2DLXA 1V57A 2XBQA 2G2QA 3ERWA 4MK3A 2L5LA 2VM2A 1BJXA 4EC0A 4D73B 4NHZA 2C1YA 4GQCA 1BAYA 3HZ4A 4NPBA 1JFUA 1DBYA 3H8QA 3EMXA 2YJHA 1U88A 5ECIB 1M2AA 2PGTA 2LEGA 3E0UA 2VCXA 4MABA 2FA4A 5CNWA 2O7KA 3ZZXA 2RUFA 5A4UA 3RHCA 1A2MA 4XRDA 2FGXA 1JLVA 3MWHA 4MJEA 2HLSA 1S3DA 1ZZYA 4XS4B 2XPEA 2ALBA 3HVSA 5EY6A 3GRXA 2F8AA 3EU4A 2B3SA 2HZEA 4MCUA 2GT6A 5DDLA 1Y25A 1R4WA 3DEXA 4IP1A 5DALA 2WB9A 4V2LA 4ML6A 2YWMA 2YZUA 1MDIA 1WP0A 4KSMA 2H0HA 3EWLA 2X99A 2GTUA 3HZ8A 2J9HA 14GSA 2GSQA 1BG5A 1YKCA 2GSSA 3IAS2 1ABAA 5D8IA 4WF5A 1WJKA 4I6XA 1FB0A 2TRXA 4NHWA 1A8YA 2F9SA 2VAFA 4LL4B 2VL3A 2DMLA 4TKYA 3DD3A 2V6OA 4WKWA 1OKDA 4KDYA 2V1MA 3ZLPA 3WD6A 3F4RA 1SK1A 4X1UA 1ACVA 6GSUA 3L9UA 4OO5A 4F82A 2A2RA 4MMMA 1W4VA 4EL1A 5D9WA 4K0NA 1EP8A 2H6XA 3EMPA 3M9KA 4BVYA 3KGKA 2M72A 3RPPA 1J0FA 3CYNA 1THOA 3GH6A 2CQ9A 4N30A 4BL7A 2C8UA 4K8MA 3PH9A 3C8EA 3O6TA 4FIWA 1O8XA 2E2GA 3ZITA 1SJIA 2E7PA 3UJ1A 3H79A 1KNGA 1IYIA 2VCVA 4TR1A 1A0FA 5DAKA 1T00A 2VCWA 5G2ZA 1UN2A 4DSRA 1LJRA 1E2YA 1JLWA 2FCHA 2KHPA 4PURA 2OA7A 5G1KA 5JWOB 2B5YA 2YANA 3P8WA 4K7OA 5IMCA 5LNKe 5B6NA 4TR3A 4LL1B 4J57E 3GKNA 3TJFA 1G6YA 1KBNA 5DCHA 4PGTA 2VM1A 2ES7A 2PWJA 1TU7A 2B6MA 4JR4A 2HZEB 3HHVA 2B7KA 3DVWA 3M3MA 2YV7A 1GSQA 3P90A 2LJAA 3GHAA 2K8VA 5DALB 1VF2A 3ZFLA 4KH7A 1U87A 4POBA 3F63A 1A24A 1XWBA 3HVVA 4NV2A 1U6TA 4XS6A 2DIYA 2PVOC 4L0UA 1G7EA 3QFBC 1EEJA 5F07A 2H71A 2LNTA 2C3QA 1B9XC 4GSSA 2CAIA 3M0FA 5FWGA 4TVEA 5IPGA 4MF5A 1VGLA 3LJRA 3FKFA 4WR4A 4RUVA 4G2EA 2B7JA 1AQWA 3C1SA 3KD0A 3ISOA 1KTEA 3BCKA 3DXBA 4O32A 1TTZA 1F6MC 2OE0A 4FH8A 2DJKA 2YOIA 2YV9A 1TU8A 4MA9A 5DVBA 2JSYA 1PKZA 5D9XA 1QK8A 2X8GA 4XRAA 2MBTA 8GSSA 3HJMA 1UA5A 3KP9A 3L78A 3VLNA 2V41A 1MD3A 3IBHA 2YNXA 4O5RA 1TJDA 4TOPA 3MSZA 1AQXA 5HFIA 4POLA 3U6VA 4HQZA 1WIKA 1ERWA 3GX0A 1HYUA 1SD8A 4DVCA 1PGTA 3C71A 1O81A 4EUYA 1SKRB 2C0GA 5ECSA 3HJPA 1V9WA 3UOMA 2LV3A 5DCGA 2L4QA 3KCMA 1M7TA 3ZL5A 4F9ZA 4I8BA 2YWNA 5IM9A 3CRTA 2LS5A 3IC4A 2EIQA 4L0WA 4MDCA 5C00A 1PD21 1OKTA 3ERFA 4RI6A 5CRWA 2IIYA 1O73A 2IL3A 3A2VA 2GQMA 3PINA 4KDXA 18GSA 4CHSA 5D9VA 5ECLB 1M2BA 4O92A 3H4KA 4HOJA 2V2GA 1GWCA 5E4WA 2HI7A 4MF6A 1OC3A 3LSZA 3ZIJA 2LKUA 1XVQA 1XW5A 2CX3A 3GH9A 4MPGA 2P0GA 3IK9A 3TB2A 5F8BA 2QKEA 4EE0A 1XW9A 5CAXA 1GSUA 2ON7A 3SBCA 1TK5B 4ML1A 4D73A 1OAZA 1SK0A 1YJ6A 2YZHA 1C72A 3GKXA 3ZMKA 3QD9A 4PQHA 1FVKA 5ELGA 3ZVJD 1SL1B 1TW9A 5HR3A 1W89A 1JZDA 2X8HA 2AHEA 1WPIA 4I5QA 1BQ7A 1GTIA 1DSBA 1NW2A 1V40A 4IGJA 3PR8A 3W8SA 5HFGA 1AXDA 1EZKA 1K3YA 2MZCA 4MPFA 1V98A 3TOUA 3EC3A 1YDKA 2AYTA 3F6FA 3Q74A 5JWRB 4XS4A 2RM6A 1F3AA 3Q6OA 12GSA 2H1GA 3KTLA 3FY7A 3WT1A 2B1LA 3UBKA 2DJ2A 4ECBA 1K0OA 3E9JB 3D22A 4EXJA 2P5RA 3HYPA 1RQMA 2WZ9A 4KX4A 4FYBA 1QUWA 3RAZA 2PUKC 1XW6A 1GUHA 5AIXA 4PX1A 3KJYA 2FLSA 1FO5A 3FZ4A 1OE7A 3MNGA 3TRXA 1CQHA 3R2QA 2DJ3A 3QMXA 4I97A 1GP1A 3C1RA 3GN3A 5A4WA 5G30A 2O87A 3EURA 2FWHA 1X9MB 1GL8A 4PNFA 1G6WA 2HXKA 3FR3A 1YF1A 5ENUA 2KP1A 4TXOB 3L9VA 4AF2A 4EKZA 1ZGNA 5ECQB 6GSSA 3D5JA 2IMDA 5ELAA 1GSSA 2WCIA 4V2MA 3QDNA 2N5AA 1Z9HA 5C04A 4HUAA 13GSA 3HY2A 4KDUA 2YPMA 1PX6A 2L5OA 2ON5A 2HYXA 3U5RE 2JSZA 4V1Ap 1GULA 1XWCA 5IMAA 5IIZA 5CRGA 3FHKA 2BTOT 2YN1A 1SYXA 3DYRA 3IDVA 2KLXA 4RQRA 3J7Yb 3EE2A 2CV4A 2M80A 4AGSA 3HXSA 2E0QA 2C4JA 4DSQA 3CSJA 2H1AA 1JZWA 2B1KA 3W8JA 3WGEA 3A3TA 1F2EA 1XVWA 2OE3A 3WYWA 5JCWA 2F51A 5F05A 2JADA 3BCIA 1WWJA 2GSRA 4PQ1A 1T4YA 3I69A 3VWVA 4IELA 5B8BA 1ZOFA 2QC7A 1BEDA 3V1WA 4MJBA 2C3TA 2GDRA 3BOAA 3IPZA 3KH9A 4KCAA 5DJMA 2X64A 2WS2A 2R37A 2RIIA 3O76A 1PA3A 1AUCA 3ZVJA 1N2AA 3H93A 4BA7A 4OMVA 5FT3A 3TRPA 1HQOA 2CZ3A 3HDCA 5IO0A 1J9BA 16GSA 2PVQA 3QPMA 5ECOB 1ZL9A 1GSYA 1ON4A 2GQLA 2FA8A 3VK9A 1AC1A 1SKWB 4L5LA 4MLYA 2HE3A 4XTSA 1PL1A 3DKSA 3FZ9A 5J9CA 3FRCA 2H1DA 2H70A 5ECRB 2YCDA 1MEKA 3C7MA 4FYUA 3KM6A 3TUEA 5HQPA 2VIMA 1Z3EA 3M9JA 4ACSA 5GSSA 1G7OA 1O85A 3LWAA 3TJBA 1ERVA 1PKWA 4IHUA 2LQQA 1VF1A 3G7JA 1K0BA 2H66A 2H8LA 3HJOA 5J3RA 1G0TA 2I1UA 1XXUA 4GXZA 3FR6A 4ZB9A 2H19A 3VPQA 4POMA 3P7XA 1GTAA 4GSNA 2V6KA 4IKHA 3KH7A 3KEBA 2GGTA 1XWAA 4WETA 1H75A 4GF0A 3L9SA 1QGVA 2F8FA 5CRDA 2L59A 3KTBA 4LMWA 3KMOA 4POKA 6GSYA 1Z7RA 3VWUA 5KN2A 1FOVA 3W6GA 4BVXA 4HJ2A 4QL9A 2TIRA 3L4NA 4GTUA 4ZBAA 5J41A 4MF7A 1RW1A 4ILFA 5EL8A 2HFDA 3K8NA 4F2IA 2D2ZA 1WE0A 2MBSA 1GTBA 1X9WB 4QL7A 5J5NA 1MDJA 2WGRA 2N5BA 4JE1A 4Q5NA 3F9UA 4TR0A 4K2DA 4N11A 4J56E 3VPTA 2OJLA 1X0RA 4XCSA 3M8NA 2XC2A 2K6VA 1A2LA 2YWIA 2YP6A 4NMUA 2CA8A 4I2TA 2HRNA 2LUSA 3FYGA 3VWWA 3UBLA 2B5EA 3I6AA 2JZTA 3ZTLA 2VL2C 3KMNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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