3UJ1A

Crystal structure of the third thioredoxin domain of human erp46
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
106
structure length
99
Chain Sequence
TVLALTENNFDDTIAEGITFIKFYAPWCGHCKTLAPTWEELSKGVKIAEVDCTAERNICSKYSVRGYPTLLLFRGGKKVSEHSGGRDLDSLHRFVLSQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Peptide Binding by Catalytic Domains of the Protein Disulfide Isomerase-Related Protein ERp46.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin domain-containing protein 5
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 29
structure length 99
sequence length 106
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uj1A00
1PRXA 1Z5YE 3P8WA 1WJKA 4XS4A 5IMFA 5DAKA 3KH9A 3KM6A 4K7NA 5JCUA 3QAGA 3TKSC 2H1AA 1QFNA 2FWEA 1DE1A 2L57A 4K0GA 1FOVA 1T00A 2H73A 3GTUA 11GSA 2PVQA 4MMMA 1O6JA 3ZMKA 3PH9A 4V1Ag 1BYEA 3LQ7A 2VCQA 3TKPA 3KCMA 4H86A 5CRHA 1MDKA 4MZBA 2VOCA 4PGTA 4ECJA 2YV9A 2OE1A 3ZMLA 1BG5A 4WKWA 1FVKA 2MZCA 2WGRA 2H74A 1XBSA 4I2TA 2C0FA 3DWVA 1YKCA 1AW9A 1XWCA 3KMNA 2YCDA 3O76A 1Z6MA 5D9VA 5AN1A 5HR0A 2VL3A 1EEMA 1NHYA 1PL2A 2H70A 5J9BA 1NHOA 4ZXGA 1Q4JA 2OJLA 2DBCA 4MJAA 2FCHA 4YQVA 5FWGA 4MP4A 14GSA 4Q5NA 4ILFA 1VF4A 1HD2A 1AC1A 3GNJA 4DVCA 1ERVA 3G7IA 5F05A 2P5QA 1XW5A 2H76A 3D4TA 3GX0A 1SYRA 1OE7A 2F51A 1RK4A 1X9SB 6GSYA 2GQMA 1QUWA 1HQOA 1CQHA 2MMAA 4EE0A 1GSSA 1NM3A 2RLIA 4XHMA 3DYRA 3D5JA 2IMIA 2VL2A 4IHUA 4YQMA 1GTBA 2H71A 2GS3A 3FR3A 1XFLA 4L0UA 1QQ2A 4MJBA 2C0GA 4IW9A 1QXHA 3RDWA 2N5AA 1ZCPA 3CTGA 4GCIA 1AUCA 1U3IA 2G2QA 4BPYA 3TJFA 3ZIVA 2WDUA 1AAZA 2PWJA 5IMDA 2HSHA 5ECPB 5JWRB 2CT6A 1BEDA 4N30A 4HZ4A 3DGQA 3TJJA 5INYA 2H66A 1M2AA 3IK9A 3A2WA 4Q5FA 4GSSA 3WGXA 1ACVA 2VAFA 1GUKA 3MNGA 1MTCA 3FK8A 4EUYA 2YZHA 17GSA 2OE0A 2IMFA 4POBA 2DIZA 2H19A 1B9XC 1PX6A 3JCML 4GQFA 2OADA 3IXRA 1AQVA 3ZITA 4PUFC 2R5GA 2HYXA 2LQOA 3L9SA 2YANA 1WOUA 2HRFA 2WCIA 3G7YA 4G9HA 2IFQA 1M0UA 2REMA 2DLXA 5DJMA 2O8VB 4KCAA 1TP9A 2PUKC 3GHAA 3FZ5A 4OFMA 1LU4A 2I4AA 1TDIA 1GSEA 2LRNA 4MPFA 4CDOA 4RI7A 2V41A 5IMAA 4I5QA 1V2AA 3D22A 1OE8A 1GLPA 2HLSA 5ENUA 4WXTA 2JACA 4DSRA 4KUNA 5ECOB 2LRCA 5COHA 2ON7A 2KLXA 2X64A 2HZEB 4ML1A 1A24A 3TJBA 3DKSA 3VPTA 3LWAA 4MH2A 3BCIA 3SWLA 5B6MA 3TKRA 1EGOA 1B4PA 1B4QA 4E8EA 1PD21 3G7JA 5ID2B 2GZZA 2NBSA 2N5BA 2GT5A 4JU5A 4TOPA 4PX1A 2RIIA 4X1UA 1N2AA 2ES7A 3M8NA 2C3NA 1ILOA 2YV7A 3QAVA 3ZYWA 3I9V2 3GURA 1UC7A 4ACSA 4GWRA 3F6FA 3ED3A 3I6AA 5DJLA 4TR1A 3V1WA 2YWMA 2JZTA 1TRSA 1GTAA 2VO4A 1YKAA 2PBJA 3F4SA 5KN1A 3HCZA 3D21A 4N0VA 2CQ9A 2R4VA 4LA1A 4K0NA 1F9MA 2HFDA 1DBYA 2YOIA 1XIYA 5CRGA 3TRXA 4CW9A 2C80A 3APSA 1C72A 2VD0A 1M2BA 5DQYA 5GSTA 1UA5A 2PMTA 1K0CA 2WZ9A 4V2MA 2PPTA 4IELA 5A5KA 1ZOFA 2GSRA 2M46A 5IMCA 3P7XA 4PNFA 3KD0A 1ERTA 4BA7A 3IBHA 2XPDA 5IO0A 2H75A 3F9UA 3EU4A 2C3QA 3LYKA 2R37A 3IAM2 3ZL5A 2V32A 3J7Yk 3M3MA 4KH7A 3RHCA 4HDEA 4ZL8A 2DMMA 1GP1A 2I1UA 2B1LA 2XC2A 4I97A 4GXZA 2HSYA 4ZB8A 4WF5A 2VIMA 1TK8B 1BAYA 1MDIA 3UVHA 1WMJA 4D73B 1SD9A 3IA1A 1GSYA 3L0HA 4KDYA 4TR4A 4HUAA 1K0DA 1RQMA 1GL8A 4F0CA 3NOFA 2BMXA 2F9SA 2FD3A 2DJ2A 2L59A 1XXUA 2LNTA 5ECSA 1EOGA 1GRXA 1VF2A 4LMWA 1XVQA 1OYJA 4MH3A 4GSNA 2ZNMA 3CXGA 2YWIA 2IMDA 5FT3A 1QK8A 2BTOT 2D2ZA 2VCTA 3TKSE 1G7EA 4ECIA 1GSFA 4WBRD 4IP6A 2P5RA 2GSSA 5AGYA 4FO5A 4P3YB 1DUGA 3E0UA 4CHSA 3ZIJA 1SKRB 2EIRA 4O32A 5B7CA 4EC0A 3DRNA 5ABRA 5G2ZA 1OC3A 4L5OA 2L5LA 5JCGA 5CREA 4KDUA 2JADA 3EWLA 4EF0A 1XPVA 3TOUA 5B8AA 2CAQA 2VCXA 1TTZA 4J57E 1Z6NA 2MMNA 2P0GA 1KTEA 4K8MA 3UVTA 4HJ2A 3APQA 3MAKA 4TRXA 1N8JA 5ECKB 2B1KA 3LEFA 2VCZA 1ZMAA 1VRSD 3CRTA 5FHIA 3BBYA 3KP9A 2IPAA 4GRFA 4PURA 2HZEA 5EY6A 1GUMA 1Q98A 1YY7A 3PGTA 2WULA 2X8HA 5ECMB 2L6CA 4F2IA 8GSSA 3KTBA 1URMA 2AAWA 4ISDA 4N0ZA 4BWQA 3QR6A 5ID2A 3FYGA 2M72A 1TU7A 2IIYA 4MCUA 5A4UA 1U6TA 1YZXA 2GTUA 1ML6A 4POLA 2JSZA 4ZIJA 1EEJA 3FZ9A 4MLYA 3VWVA 1JZWA 3RPPA 2FWGA 4OO4A 2VM1A 5G5FA 2IWTA 4YH2A 2CVDA 2L4CA 3BD2A 1K0AA 2G0FA 4O92A 1V9WA 3PR8A 5DALA 1SENA 2TIRA 2CA8A 1ERWA 3EVIA 1SL1B 1EP8A 5GZZB 5G1KA 4NMUA 4GLTA 1U88A 4MF6A 5ELGA 3VI7A 1EP7A 4TXOB 2CX3A 3GV1A 2JSYA 4L0WA 2LUSA 2F8AA 3QMXA 2MMOA 3A2XA 2H6YA 1SL0B 1TK0B 3GKMA 1GTUA 5DDLA 5CRDA 1KBNA 5HFIA 3WGEA 3HZ4A 5DCGA 3N9JA 1T4ZA 1YF1A 3VWWA 4POKA 3H1NA 3HD5A 2H1BA 4TVEA 2VL2C 2I3YA 1GLQA 2CZ2A 4IQ1A 1GWCA 5JCWA 4MZWA 3F4RA 1VGLA 2VCVA 4AGSA 1W4VA 3QAWA 3UARA 3UEMA 2LQQA 1U3AA 1OC9B 4K6XA 3LFLA 3M9KA 3KZQA 4WR5A 2H1DA 2YWNA 2FWHA 1X0RA 2R3XA 3FKFA 3LGCA 2B6MA 4D73A 4EO3A 3U6VA 2HI7A 1NW2A 3HVXA 3OR5A 4NHZA 4N10A 6GSSA 3VFIA 3ZTLA 1TI1A 3VURA 3R2QA 2B5XA 5CNWA 4XRDA 4BVYA 2TRXA 2C8UA 1GULA 3ZRDA 3C7MA 1YEPA 2B7JA 2JZRA 2H30A 4IVFA 2GSQA 1RW1A 3EU3A 3IRAA 3APOA 2L5OA 3M0FA 1G6WA 2GSTA 1M9AA 3FEUA 3CSHA 3GH6A 1QMVA 1XW9A 2E2MA 1XW6A 1TKDB 5G5EA 3IE3A 4I2UA 1AIUA 1R7HA 3QD9A 4YAPA 2XPEA 2O85A 1THOA 4Q5QA 2BJXA 3LXTA 4POMA 2IN3A 1F3BA 2TRCP 3HJMA 1T1VA 2DIYA 2B5EA 2E0QA 2XBQA 1U87A 4JR4A 4XS6A 1A2JA 1XCCA 1GSQA 4OFTA 1TI3A 4TR3A 3GL3A 1DSBA 2CVBA 3D6IA 5HR3A 2R2JA 2WB9A 4ZB6A 3H4KA 5KN2A 3VLNA 2F3MA 3HVSA 1J9BA 3GRXA 2C1YA 3GSTA 1FW1A 1MEKA 5LNKe 2HE3A 3UJ1A 1ON4A 1T7PB 2FUG2 4KB3A 3WT2A 3L78A 1M9BA 3D4MA 3S9FA 4MPGA 4WR4A 1W89A 4PQHA 2HRNA 4OD7A 4NPBA 1LJRA 13GSA 3VPQA 5DBQA 3FRCA 1X5DA 3IHQA 2XHFA 5C00A 3LXZA 3WGDA 1AQWA 2IMKA 4PQIA 4F03A 4XTSA 3UIWA 1FO5A 1TRVA 3CTFA 4IJ3A 3L9UA 3TUEA 3GKKA 1TRWA 2GDRA 4ML6A 1JZRA 2FWFA 3HKRA 4HQZA 3HXSA 2LSTA 3BCKA 2A2RA 1SKSB 5JWQB 5F0GA 2HZFA 3BOAA 2GVPA 4G2EA 4HZ2A 3J7Yb 3LJRA 4JBBA 2J9HA 1TOFA 3IV4A 1I9DA 3GMFA 4RI6A 3EURA 5D9TA 2N5FA 1HNCA 1FB0A 2FA4A 2NVLA 3U5RE 9GSSA 5ECLB 5D93A 2OKAA 1G0TA 3KGKA 3GSSA 1K3YA 4JR6A 5IOWA 1OC8A 4PUAA 3RHBA 2GZPA 5AIVA 4QL7A 5A4VA 1I5GA 1YDKA 4DSSB 1O81A 1OC9A 4XIHA 2H0IA 3MSZA 1ZL9A 1AXDA 20GSA 1BJXA 2H8LA 22GSA 2I9HA 4ZL7A 2VLUA 1EZKA 4Z7XA 3GN3A 2V6OA 4GSTA 1K3LA 1OAZA 1A2MA 3FZ4A 3FR6A 12GSA 3HHVA 5J41A 3WT1A 3NZNA 3ME8A 4EXJA 3IC4A 3HDCA 3D0ZA 4FYCA 2O7KA 1FVJA 3KMOA 1MDJA 3KP8A 4XS4B 5DAKB 1GNEA 1SJZA 1Z3EA 4GQCA 5KN3A 3A3TA 5LCZA 4HU7A 5A4WA 1ERUA 3GX8A 4EKZA 5H5SA 1IYIA 3GTUB 2DJ0A 2QSIA 1PQNA 4KSOA 3IPZA 2QC7A 4V2LA 4MABA 3QPMA 2H1GA 3KH7A 4F0BA 1ZYEA 2MBTA 2LJRA 2K18A 4IKHA 2ON5A 2OBKA 5EVOA 4EDYA 2EC4A 3GH9A 3UL3A 4G19A 4IQAA 1UVZA 3F63A 3ZLPA 4TW5A 2JZSA 4IN0A 1PX7A 5D96A 5J3RA 2ZUPA 5HQPA 1JLVA 3WYWA 3P2AA 4MF7A 4KGIA 1XWGA 4OWYA 2GLRA 3US3A 4J56E 2C3TA 3QCPA 4XRAA 1V58A 4ZBDA 1A23A 3L9VA 4MK3A 2OE3A 5IOXA 2OBIA 3IOSA 2MMZA 1K0MA 2MBSA 2H0HA 2DC5A 4TXVA 4MJCA 4MF5A 5ECIB 2CV4A 2VL9A 3FR9A 1M99A 1A0RP 5IQYA 2AV4A 3C1RA 4ZILA 3VWXA 1PMTA 3EMPA 1R5PA 2DJJA 4NAXA 5J9CA 2O89A 3F4TA 3LYPA 3IK7A 1XVWA 1S3AA 2YJHA 4PNGA 1V57A 2H0GA 2YZUA 3LORA 2FY6A 1FG4A 5CP1A 3TKQA 3N5OA 1WIKA 3KEBA 3TCOA 3Q18A 3KXOA 4ZBAA 4FYUA 3MDKA 2VLVA 3FZAA 3RBTA 1X9MB 2WS2A 2Z9SA 1PSQA 5ECNB 1GSUA 1V98A 3UOMA 1GNWA 1XWKA 4L8EA 2RUFA 4K1FA 1WPIA 1WE0A 1G7OA 4KE3A 3F3RA 5E59A 5F06A 1BX9A 2A2SA 4TKYA 1B9YC 2X8CA 3I69A 2CX4A 1X5CA 4K7OA 5HR1A 1USBA 2GQKA 3F8UA 1HNAA 5J4UA 3C1SA 4K2DA 5GAND 5D9WA 1FHEA 2AB6A 4TR0A 3ZFBA 1BQ7A 1K0BA 1PKZA 1B48A 2H6ZA 4KX4A 3A2VA 3HZ8A 1CQGA 5ECQB 4V2NA 3QOUA 4ZBBA 5JWOB 4NV2A 3GKXA 4JEDA 4ECBA 4NWYA 3E3EA 2YP6A 2GT6A 2IFQB 3HY2A 6GSWA 4I6XA 1SJIA 2LJKA 3HA9A 1OKTA 1H4OA 3IAS2 4IGJA 5G1LA 2LJAA 3LSZA 3NIVA 2I81A 1O85A 5GAPD 1Z7PA 2FLSA 4ZL9A 2NDOA 4RQRA 5KEJA 2R6KA 2LNSA 3VWUA 1M2DA 4O5RA 3I43A 5CO3A 1XZOA 1E6BA 3TRQA 4AJ8A 2JL4A 3HYPA 2V2GA 4RQXA 2A4VA 4HU9A 5AIXA 2LV3A 1GTIA 1GSDA 3A5WA 5IIZA 3P90A 4N11A 1ZGNA 1X5EA 1GUHA 4NXIA 3KIJA 3QFBC 4KA0A 3AY8A 3EINA 2DSAA 1GH2A 2CVKA 1O8WA 5CAXA 4JE1A 1ZZYA 3Q19A 3TJGA 3KTLA 2YNXA 1TXXA 5HR2A 2H6XA 1SYXA 4ULXA 5E4WA 2QGVA 3W6GA 2YPMA 4TR1B 1SL2B 3ERGA 1AQXA 2YWOA 1T8EB 5B8BA 1JFUA 3TOTA 4RUVA 3VI5A 2KHPA 1E2YA 1YEXA 3TKSA 1MD4A 2VM2A 2L6DA 2HXKA 2FNOA 4HOJA 1EOHA 5DCHA 3F0IA 4G10A 2FGXA 4NV5A 3FW2A 2ZCTA 3RAZA 2LRTA 4EVMA 1SU9A 2IL3A 2P31A 3GFKA 1XWAA 2YN1A 4X43A 3WD6A 4F9ZA 1JZDA 3ERWA 1O8XA 4PXOA 5IM9A 1T4YA 6GSXA 2O87A 3TJKA 4WBJA 1YF0A 3BJ5A 2YJ7A 1XOBA 4J2FA 2KUCA 4O7HA 2GQLA 5D73A 4HS1A 2PN8A 1LBKA 4KAEA 1M7TA 3ZFLA 4KNDA 2C0DA 1WP0A 2AUVA 2XBIA 3L4NA 1TU8A 1R26A 2LTKA 3ZVJA 3EC3A 6GSVA 1EV9A 4GTUA 4F82A 1ABAA 3EYTA 4TN8A 1K0NA 1JHBA 1F3AA 2EIQA 2VCWA 3ZREA 1TK5B 3K8NA 3VK9A 2H01A 4HEA2 1VF1A 2C0EA 3CYNA 2X99A 5EPFA 4EL1A 3GA4A 3DD3A 2E7PA 1XOAA 4L5LA 5G30A 5ECRB 2DJKA 4MA9A 1K3OA 5KN0A 3PINA 5LD0A 4AJ7A 1R5AA 1KNGA 2JU5A 5H5QA 2AJQB 1FB6A 1S3CA 1SJ6A 4EDZA 2IMEA 18GSA 4X0XA 4DSQA 3QFAC 2PVOC 5IPGA 1XWBA 3MWHA 2KP2A 3M9JA 4YQUA 4TXOA 3ZVJD 2KOKA 4GF0A 1THXA 1EV4A 2B3SA 1PA3A 3CRUA 2PGTA 3W8SA 4E8HA 4OFNA 5L71A 4K9ZA 2HNLA 2NTOA 3F6DA 3ZZXA 5B6NA 5D8IA 2VUPA 1H75A 2AYTA 1SKWB 1SK0A 2IJYA 4IBPA 3UBLA 4HQSA 4AJ6A 4NHWA 1J08A 2LEGA 5ELAA 4V1Ap 2FHEA 5HFKA 2K9FA 3DEXA 1K0OA 4MDCA 1EGRA 2QKEA 3UMAA 5J5NA 3FHKA 3DMLA 3KJYA 2VD1A 4ID0A 5IO2A 4LMVA 2EIOA 5HFGA 4KCEA 1FAAA 4OO5A 4JRRA 1F37A 2HT9A 5F8BA 5IMZA 1WWJA 6GSTA 5H5RA 1TJDA 4KDXA 4FH8A 1SK1A 1WRYA 4LL4B 4WEYA 4IJIA 2DJ1A 1S3DA 2CAIA 3TB2A 1A8LA 4QQ7A 5DALB 1PKWA 2ALBA 1OKDA 2K8SA 3Q6OA 19GSA 4IS0A 2WRTA 1SK2A 2K8VA 3C8EA 4YAVA 2AHEA 3DVXA 1OVNA 4WF4A 2FA8A 1EWXA 4KSMA 1QGVA 2RM5A 2MYGA 3DVWA 2WJUA 3DXBA 5CRWA 2GGTA 4OCEA 2X8GA 3HJPA 5AISA 1V40A 4PQ1A 2OACA 3H8QA 1ZYQB 2DJ3A 2J23A 4KW6A 1YJ6A 3TDGA 2NPBA 1T3BA 5GSSA 1A8YA 1UN2A 4K7IA 1R4WA 1PGTA 2KP1A 3GKNA 4DEJA 3LG6A 3GL5A 4LLRA 3GYKA 3C73A 4FYBA 4AF2A 2PERA 1Z9HA 1JZOA 2K6VA 3DIEA 1TRUA 4XS1A 5ECHB 3FY7A 1O73A 1Y25A 2V1MA 4JZQA 3EMXA 3CSIA 1MD3A 2B7KA 3GUSA 2LS5A 4OCFA 1PL1A 1Y6EA 3E9JB 3CBUA 3ERFA 4IP1A 3F3QA 3IDVA 3HVVA 1YQ1A 2H72A 4HI7A 1JLWA 1B8XA 5DQSA 3SBCA 4ECCA 5F07A 1J0FA 1VF3A 2DMLA 3C71A 2GZYA 3O3TA 4XCSA 4LL1B 1PN9A 2V6KA 4QL9A 2B5YA 5D9XA 2WFCA 1O7UA 2RM6A 1NSWA 3M1GA 4MJEA 3ME7A 7GSSA 4OMVA 3G9BA 3IR4A 3W8JA 1TW9A 1A2LA 5IMVA 2L4QA 3TRPA 1HYUA 1KEBA 4I8BA 3O6TA 3RPNA 2LKUA 10GSA 2CZ3A 4Q5RA 3UBKA 4ZB9A 5IPHA 3CSJA 2RUEA 2C4JA 4HJMA 1X9WB 4BVXA 3TGZA 5CYYA 1G6YA 5C04A 4BL7A 1SD8A 6GSUA 3QDNA 4DSSA 5G31A 3EE2A 16GSA 4BWSA 2VLTA 1HNBA 3UAPA 5DVBA 3H93A 5EL8A 1DE2A 2F8FA 4FIWA 3H79A 3CMIA 1IYHA 1ST9A 2E2GA 2OA7A 1A0FA 3GIXA 2M80A 4MZCA 4WETA 2PU9C 3Q74A 1F2EA 3HJOA 1F6MC 1Z7RA 3ISOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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