2X8HA

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni in complex with gsh
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 192
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8hA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8hA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8hA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8hA03
2H1BA 4KW6A 4PQHA 3DH9A 4TR0A 4C3YA 4EKZA 3HVSA 3M1GA 4TLZA 2C3CA 4GDEA 4KNDA 4DNAA 3TRPA 3ERFA 5HHFA 4TR4A 3OR5A 2QA2A 1VF1A 2A2RA 3COXA 2QKEA 3IHMA 3DK8A 2YR5A 3ITJA 3KVEA 4ADWA 3NOFA 3NN6X 3NHOX 3P4QA 3HZLA 5IMCA 1JEHA 1TYTA 1M64A 5DBJA 4HQSA 1JOAA 1OYJA 1A0FA 2XC2A 3TUEA 4GQFA 4HJMA 4J57A 1M0UA 1TTZA 1KTEA 3Q19A 1RK4A 4WCTA 1OE8A 4L0UA 4L5OA 4CBQA 3E0UA 1KNPA 1J0FA 4J36A 5C00A 3FHKA 3NLCA 5F06A 1ZZYA 5HFGA 1MTCA 2YM2A 3LEFA 2AJQB 5IMDA 1FG4A 2VCQA 1F8SA 1XXUA 2OACA 6GSUA 4ACSA 2V3AA 3AEEA 5D96A 2GQWA 1U87A 1GSDA 3UOMA 5CNWA 2JB1A 3AYIA 2WP9A 5L46A 1KNRA 5CRHA 4H4SA 6GSVA 1Q4JA 4J33A 1AAZA 2O7KA 1ZOVA 5AIVA 1ZP0A 2JKCA 1GRXA 1FB6A 4TM1A 3FW2A 3RDWA 2HZEB 2C0FA 2X50A 3LZWA 5J60A 2HZEA 2B9WA 2WDQA 2X8GA 3GD4A 1NENA 2V60A 1TDKA 2VCTA 4ZXGA 2JK6A 1L9DA 2H01A 4N0ZA 1MDIA 1H4OA 2KOKA 3LXTA 2YZUA 5D9XA 6GSXA 1NAAA 5BUKA 7GSSA 3GSTA 3ALMA 4H4ZA 5F05A 1GPEA 2A2SA 3WGDA 3TCOA 2MMZA 2H71A 4I6XA 1GUMA 4Q5NA 3KH7A 1XBSA 1B9XC 4J2FA 1H81A 5KN0A 4NV5A 2V3BA 1F9MA 1WP0A 2MYGA 3FMWA 2BMXA 4ZBAA 1VGLA 1FCDA 4IJ3A 1PJ5A 2QC7A 2B1KA 3ED3A 3TOTA 4PNGA 2E0QA 2FWEA 1K3OA 1GV4A 4K22A 2GMJA 2BJXA 2GTUA 3I69A 4GXZA 3R9UA 5IM9A 4PGTA 2X99A 2P5RA 3KMNA 1ERUA 2BTOT 2B7SA 2J3NA 4IS0A 4OO4A 1H83A 2XLSA 1B48A 3PO7A 1TDFA 3WT2A 3GA4A 1EEMA 3D5JA 4YSHA 4MZWA 2VL9A 5F0GA 1FVKA 2VCZA 4Z24A 2DJJA 1HNAA 4U8OA 3GMBA 1ZOFA 3DJGX 1OC3A 2HZFA 1EL9A 1VG0A 5ECMB 4GSSA 1JRYA 1LPFA 2CVJA 3BJ5A 3QD9A 3UARA 1ZYEA 2JBVA 1WOUA 4PQIA 3EMPA 3UOXA 1ERWA 4MMMA 4MA9A 3CNSA 3GYJA 2FWHA 2GR1A 1AOGA 1DXLA 4U8PA 2B5EA 4JY2A 2MMAA 2GH5A 4YWOA 4JBBA 1XW9A 3AD8B 3C1RA 3UKFA 2IMDA 3TJFA 5DJLA 4KSMA 4LMVA 1CJ4A 2YR4A 1NHPA 4BK2A 4OPTA 2BXRA 2IMIA 2XVHA 1T7PB 4TKYA 4OFMA 4F2IA 3KGKA 4LA1A 2LEGA 3M8NA 4O92A 1K0LA 1ZGNA 3M3MA 3B6DA 1M99A 1GOSA 2G0FA 1G7EA 2M46A 4EM3A 5JCLA 2BK3A 2B5XA 3N5OA 4KAEA 1O8WA 1BWCA 5E4WA 1TK8B 2PPTA 3QJ4A 4MLYA 2LRNA 4IKHA 1DODA 1OJCA 2K9FA 5CRWA 3AB1A 1M2BA 4OVIA 1O81A 2GQKA 1R7HA 3TKSC 4CNKA 4X4JA 2AV4A 2LS5A 3IWAA 3GH6A 1GSYA 3TJBA 1V58A 4K7OA 1GSUA 3RAZA 1GALA 1LJ1A 2F5ZA 4NWYA 4ISDA 1Z9HA 4QL9A 2GQMA 3GTUA 3L78A 3DK4A 2IVDA 4U2TA 1E2YA 1H84A 2CA8A 4ZL7A 1SJ6A 5CRGA 1GP1A 5J7XA 4LIIA 4Y4LA 2LTKA 2GQLA 4TXOB 3AECA 2HQMA 4IP6A 2XFQA 4TXOA 3BI4A 1DOEA 2WJUA 3ICTA 1NHRA 1TRWA 4D03A 4X43A 4K7IA 4CW9A 1Z6MA 4GRFA 3VWXA 2Q6UA 2BK4A 3B3RA 3J7Yk 5C2TA 2FUG2 2MZCA 1NM3A 4YH2A 4GTUA 5AGYA 3DGQA 5DALB 1SKRB 4Z2UA 4TR3A 1IUWA 2FJDA 2OE3A 5DALA 2YG5A 1B9YC 5B8AA 2GR2A 3HY2A 4F03A 1B4VA 1PN0A 3GYIA 1JZWA 4ECBA 1E6EA 3CRUA 1X5DA 4TM3A 1SD8A 1PBEA 4JDRA 4HDEA 3SBCA 4PXOA 3MSZA 4KPRA 1HD2A 2H6XA 4ML6A 2XVJA 1ZMDA 5ECHB 2YNXA 4AT0A 2YWIA 3KXOA 1V40A 1XVWA 5FWGA 4AJ6A 2R0CA 4HZ2A 3H79A 3DEXA 1U6TA 5M0ZA 2H75A 2IN3A 4K2DA 2M80A 2IWTA 4IVFA 1YQZA 1NEKA 1EV9A 5J3RA 4JU5A 4DSHA 4Y4MA 4C5OA 2CFYA 3K7TA 4K0NA 5DVBA 1CJ2A 3ZITA 2HNLA 2XYOA 5J5NA 4UDRA 2YWMA 3II4A 4PX1A 4D73B 3CBUA 3DJEA 3DKSA 3MWHA 4EXJA 3AYJA 4D73A 1O85A 3TKQA 2OLNA 5GAPD 3IRAA 1X5EA 1X0RA 1PHHA 5C04A 4AT2A 1LU4A 4A5LA 2YANA 1DBYA 4RQRA 5D9WA 4OWYA 4IVOB 3D4TA 4H2NA 3DK9A 3GRTA 2BC1A 3IAM2 4MJCA 3I43A 2E5VA 2GEWA 2WEUA 3A2XA 3RHAA 4V1Ap 1CF3A 4NMUA 3APSA 2VRLA 1ELIA 5F8BA 1QLBA 4GCMA 3KP9A 1MXTA 2VRMA 2YZHA 1TU7A 4IGJA 3QVPA 5F07A 2I81A 3TRXA 3HDCA 1MOKA 1JLWA 1OAZA 4J2WA 4XXGA 3UVHA 4BVXA 3VRAA 5A4WA 4RG3A 2F8AA 3VQRA 2OE0A 2VD1A 4XCSA 1Z7RA 1Q1WA 1UVZA 2B76A 3KD0A 1K0JA 3KD9A 4E8EA 3QFAC 2VD0A 4AF2A 3AEBA 3CNTA 3A3TA 5L71A 4N0VA 1OJAA 3KZQA 3ZMLA 5IQ4A 3TDGA 5KXJA 4MF6A 3UBKA 4OCFA 3G5SA 2I3YA 2H19A 3L4NA 4I2TA 2XLTA 3VR9A 3HJOA 1REOA 1U88A 3G7JA 3CMIA 4HQZA 3IR4A 3RNMA 5JCGA 3HJPA 5GZZB 3E9JB 3VRDB 1Z3EA 3VWUA 1UC7A 1CJ3A 2R6KA 4MABA 3F3RA 2RUFA 1BYEA 2B7JA 4HEA2 2RUEA 2VOCA 2KP1A 1YZXA 1TP9A 2OLOA 3F4TA 1ACVA 2R37A 3F63A 2H66A 5G31A 5KN2A 4U2SA 5EB4A 3IDVA 1GSFA 3G7YA 3TKSE 2CX4A 4GR1A 5IMAA 1PD21 1F3BA 1XFLA 2IJYA 3V76A 1LV0A 1X9SB 4EL1A 1BEDA 2ZUPA 2CT6A 3GH9A 1TRUA 1F6MC 3IAS2 4GCIA 4K1FA 3UMAA 2C64A 3VR8A 1EEJA 4FO5A 1LTXR 2KLXA 1PKZA 4D04A 5KOWA 4LU6A 3P4RA 3ISHA 1PRXA 1EOGA 1OC9B 3D8XA 4A9WA 1GRTA 3QAWA 3NIVA 4X9NA 1OC9A 2O87A 1NSWA 1O73A 1BF3A 4GSNA 5HQPA 3P7XA 4J56E 1XDIA 2YWOA 2QSIA 4GWRA 3P4PA 3F6DA 3KH9A 3J7Yb 2GVPA 3FR9A 4XIHA 4HS1A 3GV1A 2ALBA 2B3SA 3L9UA 1EGRA 1GSEA 2RGHA 2YPMA 1YJ6A 5H5SA 2FHEA 1T4ZA 1HNBA 1IYHA 1SL0B 4OO5A 4AOXA 3HA9A 1E1LA 10GSA 4J31A 5JCMA 5H5RA 3AD7B 1ZMCA 4H4UA 4IJIA 5D8IA 5JWOB 3BHKA 2L4QA 2OA7A 1GLPA 5DAKB 5A5KA 2E1MA 2E4GA 5CP1A 1YY5A 2BABA 1WRYA 3PS9A 4UDPA 5CYYA 5DAKA 5TR3A 2EIRA 2GAHB 1KSUA 3F8RA 3LOVA 4IQ1A 1Z6NA 1HNCA 3HJMA 1YKJA 4KX6A 1E1KA 1ILOA 2EQ6A 3C71A 3Q6OA 2R45A 4G9HA 1B37A 5D93A 1YEPA 4RI6A 1DE2A 4N30A 3FEUA 2R9ZA 4BV6A 2AQJA 3AE8A 4K2XA 2I1UA 1QMVA 1S3DA 2H74A 1ERTA 1K0AA 4WR4A 1R4WA 3ATQA 1XANA 1SJIA 4ZILA 3NT6A 1FECA 2XDOA 3CIRA 4BVYA 2AYTA 4MH3A 4Q5RA 1SKWB 1HYUA 2BACA 4O5RA 2RM6A 3F8PA 4H50A 1IUTA 4EO3A 2H73A 2RGJA 3SFEA 2E2GA 1AXDA 3CPIG 3QSSA 3AD9B 3D22A 3IXRA 1SK0A 3PR8A 2RLIA 3GIXA 4GQCA 4OPGA 1E7PA 1D7YA 1COYA 3FY7A 5EBKA 2F51A 3CTFA 4YAVA 1KSSA 3SWLA 5DQSA 1GESA 4MF7A 4H2QA 1GTAA 2NVLA 2WULA 3EE2A 3GMFA 3VRBA 4ML1A 4IBPA 1SYRA 4POLA 1O94A 2LV3A 3FG2P 1XIYA 2RABA 1J08A 4MJAA 2PVQA 3DMEA 1FL2A 1PJ7A 4TM0A 2TRCP 5JWQB 1VF4A 5COHA 1M2AA 4WXTA 1H86A 2YG7A 3P1WA 5JCWA 5G1LA 4BL7A 2HFDA 1GNDA 2GMHA 3NN0X 1Q9IA 1USBA 3H1NA 1WMJA 2RM5A 1VRQB 4FK1C 3F8DA 3VWVA 3US3A 2GB0A 4GLTA 2LJAA 2LQQA 3QAVA 3ZFBA 6GSYA 2BC0A 12GSA 1S3BA 2C65A 1LVLA 3EANA 2YV7A 4Z26A 2WGRA 1NG4A 4BK3A 3ZREA 1U3IA 2WOVA 3FK8A 3UIWA 3GYKA 4E0VA 2ZBWA 5ENUA 3VK9A 4WBRD 4BA7A 1KEBA 3PINA 5DCGA 4L5LA 1TK0B 2H0IA 4LLRA 2BS2A 3GFKA 2H76A 2OKAA 2GAGB 1YQ3A 4OFTA 3KU9A 5DDLA 3ME8A 5IMZA 1EBDA 1GWCA 2H70A 2VIMA 4EQWA 4RI7A 5HR3A 11GSA 3K30A 1X9MB 2K6VA 4EF0A 3KA7A 3K7MX 4ZB6A 1PBFA 2HI7A 2BK5A 2P5QA 5M10A 3DGZA 2NVKX 1UN2A 1OJDA 3DJJA 2WPCA 1CBOA 2C4JA 4NHWA 1ERVA 2V6OA 2H6ZA 1K0CA 3G5QA 3M0OA 3NTAA 3Q74A 1F2EA 2FLSA 5ELGA 2KHPA 3VI7A 2LRTA 5HR0A 3ZDNA 1GTUA 3IA1A 3FZAA 3OC4A 3GKMA 3UKQA 3FZ4A 1VRSD 1FAAA 2ZCTA 4BWSA 3BNUA 2X8HA 1NDAA 3NG7X 2ZNMA 1SYXA 5EVOA 1K0DA 2WDVA 3VPQA 5GAND 4B67A 3F8UA 4H7UA 1BGJA 1NG3A 3HVVA 4C3XA 3H8LA 2R3XA 1MD3A 4MK3A 4K7ZA 3HCZA 2H6YA 2G2QA 4H86A 1CQHA 3IBHA 3KIJA 3JCML 5IPHA 2RGOA 1EL7A 1ZY8A 3NNEA 3S61A 3HZ4A 1ONFA 1T1VA 1IUXA 1K0IA 1GERA 2GLRA 1XHCA 1PDHA 1XWGA 3TJJA 2CZ2A 2WDRA 3UJ1A 2CVKA 4L8EA 4JN9A 1ZDLA 1S3AA 2JSZA 1DJNA 3T37A 3RPPA 3LJRA 2JB3A 2BCPA 16GSA 3L0HA 1GXFA 2MMOA 2GSQA 1L9CA 4EM4A 4OPLA 2LNSA 3GSSA 4TLXA 4XRDA 1TJDA 2B7RA 4X9MA 3ZVJA 4BPYA 1X5CA 3KMOA 3GKNA 3FBSA 3LYKA 2CAIA 4X1UA 2C7GA 2WU2A 1V98A 2BS3A 2DIZA 2FGXA 4HJ2A 5IMFA 1EP8A 4K6XA 1EL8A 3C7MA 2CULA 1XWCA 4DSGA 1XW5A 1YF1A 2H89A 2XVIA 3EAOA 4POMA 5ECPB 2DKIA 4F82A 2JSYA 1PKWA 3K7QX 3CPJG 3D4MA 13GSA 3Q6JA 1MDJA 3G5RA 3SFDA 4YQMA 2W0HA 1QK8A 4FYCA 2ZZCA 2I4AA 1GREA 2C66A 4WX1A 3ZYXA 1FVJA 2XFOA 4HUAA 1GNEA 2H1GA 2N5BA 3TKPA 2WETA 4APNA 2VL2A 1AUCA 4KGIA 1RYIA 3GTUB 3QAGA 4U8LA 3BI5A 3ISOA 5G5FA 1D4DA 1P2HA 5U25A 3GL5A 3UP5A 4NHZA 4B64A 4YKGA 3CTYA 5DQYA 3IPZA 1TDEA 4KCEA 2C0EA 4ECHA 3CSJA 2Q7VA 4EQRA 3NTDA 2XLRA 1X9WB 2A89A 3CGCA 1B4PA 2EQ8A 5ECNB 1IUUA 4IHUA 4YTNA 3C8EA 2PN8A 2C72A 1QQ2A 3ICRA 3D1CA 3HVXA 2ZZBA 3KPFA 1XWAA 3IK9A 1K3YA 3KJYA 3L1RA 2IMFA 4HA6A 4K5SA 2B9XA 2WU5A 3QMXA 1M2DA 4FYBA 3D6IA 1EL5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2R4J A;  1LJR A;  3LXD A;  1LQU A;  4EWJ A;  3SN1 A;  4EC0 A;  2C4C A;  4H4Y A;  2FJE A;  4KDU A;  2R4V A;  1N4W A;  5LNK e;  3T6C A;  3BBY A;  2GVC A;  1JRP A;  2XFN A;  3F9U A;  1DSB A;  1KDG A;  1ZOY A;  3QCP A;  2C73 A;  2WP6 A;  2FCH A;  2E3T A;  4JQ9 A;  2OJL A;  2PP3 A;  3EPT A;  3VUR A;  4XWR A;  1GSQ A;  4YTM A;  4I8B A;  3NK2 X;  4CY6 A;  4FX9 A;  3AE5 A;  3F6F A;  1X31 B;  5E59 A;  3EWL A;  2DKH A;  1SK2 A;  4KX4 A;  1DOB A;  2VCV A;  4ECC A;  3AE3 A;  3FYY A;  1XOB A;  1DJQ A;  1FHE A;  2C8U A;  1A0R P;  1GUH A;  3FKF A;  3KTL A;  2WPE A;  3IE3 A;  1EP7 A;  3CSI A;  4B66 A;  3FZ9 A;  2F3M A;  4ZB8 A;  8GSS A;  14GS A;  5FS6 A;  3AE4 A;  1Z6L A;  1N8J A;  1S3C A;  2IID A;  3SQS A;  2OBI A;  4FH8 A;  3SZ0 A;  3UAP A;  4U8J A;  5JCK A;  3CGB A;  2DML A;  2A8X A;  4JE1 A;  1ON4 A;  2ES7 A;  2YN1 A;  2XBI A;  3T2Y A;  2H1A A;  1JCT A;  2IIY A;  3GUS A;  1GH2 A;  4NV2 A;  2DBC A;  1K0O A;  2I9H A;  1GRA A;  2YV9 A;  2H0H A;  3R1Z A;  1U3A A;  5HXI A;  2WB9 A;  5IQY A;  4C74 A;  3GX0 A; 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 1IUV A;  4H4X A;  5BRT A;  1QXH A;  4Z43 A;  2K18 A;  3GY1 A;  1GSN A;  3QPM A;  4JNA A;  2EQ7 A;  1XW6 A;  1KNG A;  1WJK A;  4QQ7 A;  5KEJ A;  4IA5 A;  1RP0 A;  4N11 A;  5CRD A;  2XH2 A;  4RQX A;  1ZYP A;  1CJC A;  1WWJ A;  1PDY A;  2KUC A;  2CV4 A;  5CRE A;  1TRB A;  3AN1 A;  4ZL8 A;  2GZP A;  4NEW A;  2VAF A;  3EIN A;  3LYP A;  4EMI A;  2I0Z A;  3ZLG A;  3EMX A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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