3VWUA

Crystal structure of peroxiredoxin 4 from m. musculus
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
177
structure length
172
Chain Sequence
LSKAKISKPAPYWEGTAVINGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRIEEFKSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLNHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGVLRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTVCPAGWKPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Synergistic cooperation of PDI family members in peroxiredoxin 4-driven oxidative protein folding
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 49
structure length 172
sequence length 177
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3vwuA00
4O5RA 1WE0A 3LXTA 5ECRB 1EOGA 5ENUA 2YWOA 3C1RA 5G1KA 3GUSA 3PH9A 6GSXA 3N9JA 4POLA 2H76A 4KSMA 1OE7A 3GH6A 3LQ7A 2PUKC 1LJRA 1K0DA 1M0UA 4AGSA 1X5CA 1GTBA 4L8EA 4NHZA 3HZ8A 2H01A 5D8IA 1EGRA 3FYGA 1WMJA 2RLIA 1ERUA 1ERTA 1V40A 2RM6A 4MMMA 5DQYA 4CHSA 2I1UA 2FWHA 2JU5A 1TP9A 3HCZA 3M8NA 2P31A 2GQKA 5DAKB 3GKXA 1LBKA 4F0BA 2FWGA 2GDRA 3IXRA 3WYWA 1YKCA 3VURA 4MF5A 3UMAA 10GSA 5D9VA 2E2GA 4YAVA 5KEJA 2B1LA 2CX3A 2PWJA 2PBJA 5COHA 2VAFA 3E3EA 2YWIA 5ELAA 1FVJA 4FH8A 2GSQA 2K8SA 3CXGA 1GP1A 2IL3A 2F51A 3TRXA 4LLRA 1BX9A 4DSSB 2H70A 2WCIA 3BD2A 4IELA 3TKRA 1Y25A 2FNOA 1FOVA 1AQXA 1PGTA 3EURA 2CV4A 2VLVA 2M46A 3GL5A 3JCML 1JLVA 2V6KA 4ID0A 4OD7A 3G9BA 5CP1A 1THOA 3ZVJD 3VPTA 1U3IA 2O87A 4KUNA 1NSWA 3WT1A 2J23A 1QGVA 3QAVA 2KLXA 5KN3A 1TK0B 4QL9A 4G2EA 2JSYA 1JZWA 1ILOA 4IP1A 5E4WA 1PD21 1XVQA 1RW1A 4MABA 5DQSA 2C1YA 3BBYA 1PQNA 3EE2A 4RI6A 1Z6MA 3F63A 3MNGA 3CSIA 2AAWA 1Z9HA 4JR6A 3ZMKA 1OKDA 5AGYA 1BJXA 1HD2A 2YV7A 3VLNA 2H6YA 2B5YA 3GMFA 1FVKA 3FY7A 3L4NA 2DJ2A 3KMOA 1B4PA 2VD1A 4JU5A 4GF0A 19GSA 1I9DA 2K8VA 3BCKA 1BAYA 1YF1A 4LA1A 1R7HA 4HJ2A 1SYXA 3TKPA 1THXA 3TOUA 3TCOA 3NZNA 2TRCP 3OR5A 2HE3A 1VF2A 1AAZA 1NHYA 1YDKA 3TKSA 6GSSA 1X9WB 1J08A 4OFNA 3D6IA 4JR4A 4Q5RA 5G2ZA 1M2BA 1VGLA 2LRTA 1FAAA 4I97A 4FIWA 1M9AA 2VL2C 5B8BA 4IBPA 4MP4A 5DBQA 4Q5NA 4TRXA 4IGJA 14GSA 3A3TA 3BJ5A 4K0NA 1OE8A 1S3DA 3C71A 1K3OA 1VF3A 3ZTLA 4K9ZA 1QFNA 3D4TA 4MH2A 2GQLA 5JCWA 3LSZA 4XS6A 4V2NA 5C00A 2LS5A 1YY7A 3HXSA 3WD6A 5JWOB 3ME8A 1KNGA 3LEFA 5IMCA 1WIKA 1MD4A 4K8MA 4P3YB 3H79A 3ED3A 2PGTA 5D73A 1EZKA 1WWJA 17GSA 2XC2A 3MDKA 4L0UA 5ECLB 2DC5A 5IO0A 4PXOA 4ML1A 4MF7A 1PSQA 4WBJA 1M9BA 3O76A 1XWGA 3H93A 1Q98A 5ECPB 2XPEA 1G0TA 5IMVA 1M2AA 5EPFA 1OC8A 1UA5A 3GSSA 2VL9A 3LGCA 1GRXA 4GWRA 4BWSA 3LJRA 5A5KA 1B4QA 4Q5FA 1O73A 2GS3A 2BJXA 1AUCA 4JZQA 1YJ6A 2IMIA 4ZXGA 4J2FA 3LYKA 1YKAA 2EC4A 1X5EA 4N11A 1S3CA 3UJ1A 2GZPA 6GSVA 5DALA 4OFMA 4GTUA 5AIVA 1CQHA 2HXKA 2YOIA 3HJPA 4X43A 5IMDA 2H19A 3SWLA 3IE3A 4HEA2 4FYBA 4WF5A 1N8JA 4EDZA 5KN1A 2VCZA 1YZXA 2FHEA 3C73A 3WGXA 2DJJA 4PQ1A 2GT6A 4MJAA 2LNTA 4AJ6A 1O8WA 4F2IA 3M0FA 1Z7PA 1K0AA 3ERGA 1Q4JA 2HSYA 3HA9A 3L9SA 1FB6A 3HD5A 2I9HA 1GSFA 5G30A 4IQAA 4FO5A 1KBNA 4IN0A 2YP6A 4PX1A 1O6JA 4K7OA 4NWYA 4MZCA 4CDOA 2WS2A 1MDKA 2M80A 2C4JA 4TR4A 3PGTA 2AB6A 4DEJA 1FW1A 4PNGA 1V98A 5E59A 1J0FA 1PA3A 3N5OA 2C0DA 3RBTA 2ZCTA 3ME7A 2B7JA 4PQHA 5A4WA 5DALB 4KDYA 1G6YA 2GT5A 3D4MA 3GA4A 5J3RA 2ON5A 1F6MC 2I3YA 2TIRA 2EIOA 2LTKA 3GKKA 3APSA 3RDWA 3HDCA 2E0QA 2CT6A 4O32A 4IP6A 3FW2A 2B5EA 2H1AA 1T8EB 2YZUA 4GRFA 3BOAA 4NPBA 3QFAC 1ST9A 1GH2A 1OAZA 2BMXA 4IJIA 2LNSA 1A2JA 4MA9A 1QMVA 1H75A 4I2UA 2V2GA 4IHUA 5G1LA 4ZBDA 3ZIVA 3H4KA 1PL1A 4NXIA 2FWFA 1TKDB 5F8BA 3GNJA 2C3QA 1T7PB 1Y6EA 2CVKA 1O81A 5IMFA 4MLYA 2K18A 1A8LA 2H1DA 3IRAA 2H6XA 5ECSA 3IK7A 3APOA 1YEPA 3FR9A 2M72A 1BG5A 1TDIA 1WP0A 3UEMA 3VFIA 3GKNA 4OWYA 1ZL9A 1SL0B 1XFLA 2C80A 2C0GA 1JHBA 1ML6A 1K0BA 5ECNB 3IR4A 3EWLA 3E9JB 2LQQA 3HZ4A 4JBBA 3M1GA 1DBYA 2P5QA 3GH9A 4GXZA 4EXJA 2QSIA 5JWRB 1BYEA 2AUVA 3ZFLA 5IOWA 5D93A 2LKUA 1MD3A 3KP8A 4HDEA 1UN2A 2XHFA 3QCPA 2YV9A 3IV4A 1HQOA 5LCZA 4L5LA 1QQ2A 1TRSA 4TN8A 1SKSB 3I43A 1G7OA 4HQZA 4DSSA 4HUAA 1XBSA 3L9UA 1A8YA 2ON7A 3QAGA 2GGTA 2HI7A 2HZEA 5CREA 3RPPA 2C0FA 2X64A 3CYNA 4WR5A 4GQCA 4O7HA 3KTBA 5ECHB 1F3BA 4MF6A 2DJ3A 1A0RP 2Z9SA 1GSSA 5ELGA 1GSUA 5F07A 2FWEA 1MEKA 5IIZA 3K8NA 5CRWA 2F9SA 3P90A 1SENA 2MBSA 4GQFA 1SJZA 3WGDA 3M9JA 2ZNMA 4POBA 4J56E 3P8WA 4RUVA 2H30A 1TRWA 5JWQB 1SD8A 4MZBA 4N30A 2HRFA 2D2ZA 2GSRA 5CO3A 3L78A 4PQIA 1TW9A 2KOKA 3ZL5A 5GSSA 2FUG2 5AIXA 2YWMA 4EUYA 1DSBA 1AQWA 4ZBBA 3IOSA 2JZRA 1GLQA 2F8FA 3QDNA 4ZB6A 3VI5A 1MDJA 3PR8A 3KJYA 2H72A 4I5QA 4TW5A 4KNDA 1JZOA 1TXXA 1IYHA 2H0IA 4EVMA 3TB2A 1USBA 4G9HA 3ZFBA 4ECJA 2B7KA 5KN2A 2IMFA 3TDGA 1SK0A 3UVHA 4KX4A 2IMKA 5G5FA 2HZEB 1ZYEA 2WFCA 1BEDA 2O89A 4WKWA 3DWVA 2MZCA 4OFTA 5J9CA 3I69A 9GSSA 3DRNA 2VCTA 1H4OA 3LFLA 2FLSA 3EINA 3CSHA 3PINA 3R2QA 5H5SA 2KUCA 1ZGNA 2E7PA 4LMWA 3ZRDA 1XPVA 1ACVA 1GUMA 4MZWA 2H6ZA 4EC0A 3RHBA 1K3LA 3UIWA 2H73A 4EDYA 4TXOB 2PERA 5IMZA 2GSSA 2A2SA 4YAPA 3EU4A 4G19A 3IAM2 4YQVA 7GSSA 4KDXA 3KTLA 1BQ7A 2HT9A 2CAQA 4XRAA 4GLTA 5ECMB 2H66A 1N2AA 5DJMA 2FGXA 2MMNA 3G7YA 4XCSA 2L6DA 1SJIA 5J4UA 3ZITA 1K3YA 3W8JA 4GSSA 4WF4A 3W8SA 2LEGA 1ZOFA 3TJGA 3APQA 3WT2A 2JL4A 3CSJA 1JFUA 3IDVA 3FK8A 1T00A 4HU7A 1R5PA 3HVVA 1U88A 1O85A 4MH3A 3LYPA 2VIMA 5FT3A 3DYRA 2MBTA 4HU9A 3J7Yb 1URMA 1TU8A 1M99A 3HKRA 4XS4A 5D9TA 2R5GA 3UBLA 1EOHA 1GTIA 3EYTA 4KSOA 3EC3A 1T4ZA 2OE3A 3Q19A 4NAXA 4V1Ap 5B6MA 2BTOT 1WOUA 6GSUA 3CRTA 1EEMA 3GFKA 3D0ZA 5GSTA 4OO5A 3W6GA 4Q5QA 3QPMA 4JEDA 4TR3A 2L6CA 3ISOA 2L4CA 1XWAA 4HOJA 2VUPA 4ISDA 1MTCA 3Q6OA 2H0GA 2CVBA 1NW2A 2YWNA 1VF1A 2JADA 5A4UA 4BVXA 1V58A 3EMXA 2NDOA 4TR1B 1RK4A 1Z5YE 1KEBA 2VCXA 2XBIA 1AQVA 1SL2B 1K0NA 2TRXA 3TJJA 1UC7A 2C8UA 1FB0A 2C3TA 2L5LA 3VK9A 2E2MA 5CAXA 3VWXA 3GL3A 3F0IA 2AJQB 4HZ2A 1V2AA 4KDUA 3QR6A 2YN1A 1DE2A 1PKZA 2C0EA 2IWTA 2DMMA 4KA0A 3BCIA 3VWWA 5ECQB 3KGKA 4WXTA 4RQRA 4XS4B 2K6VA 1ZMAA 3UARA 5IQYA 2B1KA 2PU9C 2YZHA 5DJLA 4V1Ag 3DKSA 4O92A 1HYUA 4ZILA 4FYUA 4WEYA 1TU7A 1EV9A 3UOMA 3VPQA 4MPFA 1EP7A 2J9HA 1G7EA 5H5QA 2LJRA 1ABAA 2EIQA 1DUGA 2VL3A 3RHCA 1EGOA 3NOFA 4IJ3A 4POMA 5C04A 2FY6A 2GVPA 4LL1B 4V2MA 4RQXA 1XZOA 5ECKB 11GSA 3F3RA 1WRYA 4MK3A 2H75A 2VM1A 4ECCA 4ZL7A 4RI7A 3DXBA 2DIZA 1A24A 1F9MA 3US3A 2G2QA 2PN8A 2C3NA 3TJBA 3EMPA 4KAEA 3H1NA 2P5RA 2VO4A 1PRXA 4IVFA 2DBCA 3FEUA 1O8XA 4MJBA 5B7CA 3GIXA 4TOPA 1FHEA 2OADA 3QAWA 2YJ7A 2MMOA 1EWXA 4BPYA 1M2DA 1UVZA 1OC9A 4XS1A 2P0GA 3EVIA 3RAZA 1QXHA 5IO2A 2YCDA 2VOCA 3GURA 2XPDA 1QK8A 4JE1A 5LNKe 3FZAA 3LORA 2LJKA 5IM9A 4YQUA 5AISA 2H1BA 2HRNA 2GLRA 1GWCA 2VLTA 5CRGA 2IIYA 2WRTA 4YH2A 2L59A 2YPMA 4GCIA 3MAKA 3GV1A 3DEXA 4KCEA 3IA1A 5HR3A 1SJ6A 3KIJA 1XW9A 2CZ2A 1ZYQB 2O8VB 1M7TA 2MMZA 4ZB8A 2R37A 1PN9A 3TGZA 4K0GA 4CW9A 3F8UA 2FA8A 1X9SB 2JACA 1YF0A 4GSNA 4F82A 1GULA 3IPZA 2CQ9A 1TJDA 1XWBA 1ERVA 4XTSA 5HFGA 2N5BA 4DSRA 5HR2A 4K2DA 3J7Yk 1JLWA 1Z6NA 5ECIB 2VD0A 2H74A 1CQGA 1OYJA 3MWHA 4PNFA 1G6WA 2WJUA 1J9BA 2YJHA 1R4WA 3ZYWA 4ULXA 3DVXA 3Q74A 3FZ5A 3O3TA 1OC9B 2I81A 3LWAA 4PGTA 4K1FA 3F4TA 3HHVA 1GNWA 5B8AA 1X0RA 4OMVA 3GTUA 1GSQA 2VL2A 2X8HA 4AF2A 1A0FA 4KB3A 2OE0A 1PX6A 3KD0A 4FYCA 2JSZA 2VCWA 4N0VA 5D9XA 2HYXA 1FO5A 4ZL8A 5ID2A 3F6DA 2WGRA 5F06A 4QQ7A 1R26A 3F9UA 3D5JA 1TOFA 4WETA 4N0ZA 1GLPA 3E0UA 3HJOA 2IMEA 1X5DA 2R4VA 1A2LA 1AIUA 3UBKA 1EV4A 1XCCA 4E8EA 3TKSE 1B9XC 1HNBA 1U6TA 3F4RA 4J57E 1SKRB 3ZZXA 4V2LA 12GSA 5AN1A 3IHQA 3ZREA 5ABRA 3CRUA 2MYGA 3GX0A 4KE3A 4TXOA 5F0GA 3ZIJA 3CTFA 1JZRA 2XBQA 3G7JA 1TI3A 1XVWA 2LSTA 2A4VA 1XXUA 3H8QA 5EY6A 5G5EA 4ZIJA 4MJCA 1VF4A 4NMUA 2ES7A 2REMA 1EP8A 5JCUA 1XW5A 20GSA 3DMLA 1U87A 1SKWB 1V57A 3C7MA 1GTAA 1W4VA 4OCEA 5GAND 3GTUB 4EO3A 4BA7A 2A2RA 3ERFA 4AJ7A 4QL7A 3IAS2 2V41A 5JCGA 1F2EA 4LL4B 2AHEA 2V1MA 4XHMA 1NHOA 1TTZA 3ZVJA 5ID2B 3S9FA 8GSSA 2FD3A 2OBIA 3A2WA 4IQ1A 3MSZA 3FHKA 3HY2A 2QC7A 2KP1A 2ZUPA 5EL8A 1Z3EA 3FZ4A 3GX8A 3IBHA 2GSTA 2DLXA 4KW6A 1V9WA 4K6XA 3Q18A 3DVWA 2B3SA 3FRCA 5HQPA 1EEJA 4OCFA 3A2VA 4TXVA 5IPHA 3LG6A 4EKZA 1GTUA 5FWGA 3RPNA 2MMAA 1GSEA 2DMLA 1LU4A 4N10A 5LD0A 5CNWA 4AJ8A 2QGVA 2AYTA 1E2YA 1SL1B 4NV5A 4MJEA 5F05A 2N5AA 5IPGA 2OE1A 2IPAA 5IOXA 4ZB9A 2CX4A 2I4AA 5GAPD 4ACSA 3M3MA 4TR1A 3SBCA 2R6KA 2ALBA 2G0FA 2O7KA 2H0HA 3TRPA 1IYIA 4F0CA 5CYYA 1QUWA 1YEXA 2DSAA 2B6MA 3WGEA 3TKQA 1WJKA 1WPIA 5G31A 1GL8A 3CTGA 2X8GA 1AC1A 16GSA 5DVBA 2LRNA 1A23A 2OKAA 3L9VA 1TI1A 3F4SA 2H71A 2PMTA 2VCVA 4I8BA 4BWQA 3EU3A 4ILFA 2H1GA 5DDLA 1MDIA 2DJKA 2O85A 4ECIA 1KTEA 1RQMA 2X8CA 1AW9A 1DE1A 1AXDA 2PVQA 3D22A 3TOTA 3IC4A 2IJYA 3HJMA 2EIRA 1TK8B 5J41A 4HI7A 1A2MA 4WBRD 3L0HA 4KCAA 4TKYA 2LRCA 1XOBA 4E8HA 4TVEA 3U5RE 2GTUA 5GZZB 1K0MA 4G10A 2R2JA 3ZLPA 3C8EA 1TK5B 2CA8A 1E6BA 4YQMA 5DCHA 3AY8A 5HR1A 1X9MB 4ZBAA 2GZYA 3P2AA 1OKTA 3KXOA 1VRSD 2DJ1A 2HLSA 2R3XA 3KH7A 2VCQA 1GSYA 4HZ4A 3VI7A 4L0WA 4I6XA 18GSA 4NHWA 3KMNA 3GKMA 3GSTA 3QD9A 22GSA 4PUAA 4Z7XA 1U3AA 4WR4A 2CZ3A 3ERWA 3CBUA 4XIHA 1XWKA 1OVNA 5J9BA 3FR6A 3I9V2 1FG4A 4HJMA 4X0XA 1XWCA 4ZL9A 3QOUA 1F37A 2YNXA 5HR0A 3ZMLA 5EVOA 3A5WA 1SYRA 2F3MA 2LV3A 4K7NA 3U6VA 2GQMA 4MPGA 1OC3A 1PKWA 3TJKA 1F3AA 1SK2A 2B5XA 3GHAA 4D73A 3G7IA 5FHIA 4HS1A 3VWUA 5D96A 5ECOB 3M9KA 1K0OA 3V1WA 2L5OA 2JZTA 1B8XA 5CRDA 1GSDA 2VLUA 5DCGA 2IN3A 1HNAA 1R5AA 2OACA 4XRDA 4NV2A 1C72A 1GNEA 3D21A 3UVTA 3P7XA 4OO4A 1XOAA 4POKA 3C1SA 2LQOA 4KGIA 3KZQA 4EL1A 2V6OA 2RIIA 3O6TA 4DVCA 6GSTA 1PL2A 1XIYA 1NM3A 1PMTA 2QKEA 1W89A 2WULA 1ZCPA 5H5RA 1SK1A 3FZ9A 1ON4A 2V32A 5A4VA 2DIYA 4MDCA 3FKFA 4IKHA 1B48A 2HNLA 1GUKA 4IS0A 3TRQA 1B9YC 4I2TA 1TRUA 2KHPA 4HQSA 2NTOA 3GRXA 4GSTA 3QFBC 3CMIA 1ERWA 4EF0A 5INYA 2OBKA 3IK9A 1ZZYA 3KM6A 2L4QA 2L57A 2GZZA 2IFQA 1SU9A 2LJAA 4EE0A 3A2XA 3HYPA 4D73B 4MCUA 3GN3A 1O7UA 1Z7RA 2RUEA 1XW6A 3HVSA 1YQ1A 5L71A 3NIVA 2HZFA 4X1UA 4IW9A 3TKSC 2JZSA 4PUFC 3I6AA 3HVXA 2H8LA 2K9FA 2WDUA 2F8AA 3DGQA 6GSYA 1T1VA 2PPTA 4L5OA 3F6FA 2HSHA 2CVDA 1GUHA 3TJFA 1PX7A 2HFDA 2LUSA 4TR0A 2NBSA 1TRVA 3FR3A 3QMXA 2WB9A 3UAPA 2NVLA 2PVOC 3DD3A 5KN0A 3DIEA 2X99A 4KH7A 2AV4A 3F3QA 4BL7A 6GSWA 4F03A 2FA4A 2RM5A 5DAKA 2N5FA 4JRRA 4DSQA 3KH9A 4F9ZA 5HFKA 3KEBA 3KCMA 1T4YA 4ML6A 5IMAA 2FCHA 4K7IA 5D9WA 2VM2A 3GYKA 1JZDA 4LMVA 5J5NA 2NPBA 1T3BA 2CAIA 2IMDA 1HNCA 1S3AA 3UL3A 13GSA 4H86A 5HFIA 4ECBA 3KP9A 2WZ9A 2IFQB 4PURA 2OA7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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