4V1Ap

Structure of the large subunit of the mammalian mitoribosome, part 2 of 2
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
97
structure length
97
Chain Sequence
b'AAALARLGLRAVKQVRVQFCPFEKNVESTRTFLQAVSSEKVRCTNLNCSVIADVRHDGSEPCVDVLFGDGHRLIMRGAHLTAQEMLTAFASHIQARG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The Complete Structure of the Large Subunit of the Mammalian Mitochondrial Ribosome
pubmed doi rcsb
molecule keywords MITORIBOSOMAL PROTEIN ML37, MRPL37
molecule tags Ribosome
total genus 22
structure length 97
sequence length 97
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-09-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4v1ap00
2L5LA 1PL1A 4ML1A 3JCML 3J7Yb 1HD2A 2KHPA 3FZ4A 1CQGA 1PX7A 2C4JA 3BJ5A 4FO5A 1JHBA 4L8EA 4F03A 2MBSA 2PU9C 5J9BA 1MTCA 4K8MA 2IPAA 3TRQA 5J3RA 4DSQA 2FWHA 4QL9A 5ECKB 4DSSA 1I9DA 2R6KA 5HFGA 1B9XC 2GSSA 2YOIA 3IHQA 6GSTA 1K0AA 2YWNA 3LYKA 5IPHA 4ZB8A 3F63A 5IIZA 2LJAA 5IOWA 5C00A 1PA3A 4XS6A 4KCEA 2GVPA 2R5GA 4IVFA 2H71A 2FWFA 3P7XA 1DE2A 2H1AA 5C04A 2YJHA 3CMIA 1HNAA 3GL3A 3AY8A 1XW9A 4Q5QA 4F82A 2EIRA 3DRNA 1I5GA 2C3TA 1YKAA 2DJ2A 3Q74A 2EC4A 2O87A 4BVYA 2C1YA 3F9UA 1AUCA 2H1BA 2FGXA 3LQ7A 4K6XA 3RBTA 3TUEA 4ML6A 1XWAA 1SKRB 2PGTA 5EPFA 2H0HA 2H74A 1EOHA 4MZWA 1THXA 4H86A 4NAXA 2VCQA 1SK0A 1FO5A 3BOAA 4GSNA 4K7OA 3I9V2 4JEDA 2LKUA 4O7HA 2PN8A 4EC0A 4GSTA 2M72A 3FZ9A 12GSA 3KP8A 4IELA 5CRDA 2LEGA 1AIUA 1X0RA 3LJRA 2WCIA 2VIMA 4DVCA 3M9JA 3R2QA 1A2MA 4N0VA 2CZ3A 4PGTA 2PVQA 4V1Ag 1M9AA 4MF7A 3HDCA 1NHOA 5DBQA 2IMEA 4P3YB 5ECOB 2GGTA 1EP8A 3GSSA 3IK9A 4EDZA 2H72A 3LORA 6GSUA 3PR8A 2X8CA 3CRUA 5GZZB 1ZMAA 2RLIA 3WGDA 1WE0A 2K18A 3CTGA 4ACSA 1OE7A 1ZOFA 2QC7A 2WULA 4OWYA 3G7YA 3FR6A 1VF2A 4K1FA 4MF5A 4GLTA 5CO3A 1GUMA 3ZL5A 3KEBA 3O76A 1S3AA 4PQIA 2DJJA 5G31A 1A0RP 3KGKA 4MH2A 2ON5A 5COHA 5HR1A 1LJRA 3UJ1A 4OO5A 2TRCP 1O7UA 2B5YA 2H19A 4ULXA 4WF4A 3GN3A 1Z6NA 1UVZA 1UC7A 4WEYA 3GX8A 4HI7A 3VLNA 2H0GA 3MAKA 1OAZA 4EKZA 4MK3A 2P5RA 4EUYA 1NSWA 1SYXA 3IE3A 4J56E 1XCCA 2GSRA 3N9JA 2KP1A 2X8HA 2L6CA 4MABA 5ECMB 1PMTA 2H1GA 2IMDA 4YH2A 1G0TA 3ED3A 1U87A 1SD8A 3HA9A 1R26A 4K0GA 1M2AA 2X64A 1FOVA 2HE3A 3QCPA 4ISDA 2FA4A 1FVKA 22GSA 4KSMA 3LSZA 2OE0A 3IC4A 3Q6OA 5D8IA 2IMFA 3ZMKA 4TRXA 3V1WA 3CBUA 5CNWA 2DLXA 3IXRA 3EURA 4E8EA 2PVOC 3DWVA 3DVWA 3H4KA 4FH8A 2O8VB 2M80A 4MZBA 2WDUA 4OMVA 3H79A 3C1RA 1BEDA 2HSYA 13GSA 2O89A 2NPBA 3SBCA 3EMXA 3DGQA 3L0HA 1X5CA 1OKDA 1M7TA 2VM1A 4Q5FA 4KB3A 1EV9A 3LXZA 2LSTA 4ZL9A 2YWOA 1SJZA 2CT6A 2IL3A 2QSIA 3BCIA 2YCDA 5ECIB 5ID2A 1TRSA 5ECNB 2GZYA 3GURA 3TJKA 5A4UA 4BWSA 1PGTA 5AGYA 1T4ZA 2JZSA 1U88A 1A2JA 2DMMA 3A3TA 2DIYA 5G5EA 2GTUA 2A4VA 16GSA 1ZCPA 2VM2A 2FWEA 2O85A 1GLPA 2LNTA 1TRVA 4GSSA 4PUAA 1X5DA 8GSSA 1TU8A 2YWMA 3BD2A 2H6XA 3EU3A 4KGIA 4LLRA 3UOMA 2FWGA 3CXGA 2AYTA 5CAXA 3GKKA 4EF0A 4IKHA 2NVLA 5JWQB 5F0GA 4KUNA 1WWJA 3D21A 2XPEA 3UVHA 1R4WA 1TTZA 2V6KA 4NWYA 5L71A 1YJ6A 1W4VA 2P31A 1J08A 4EL1A 3L9UA 3A5WA 4GXZA 3H1NA 2V2GA 4K7IA 2LUSA 2PUKC 2HRNA 4HS1A 4TKYA 2MBTA 1T7PB 2DJ1A 5CRHA 4DSSB 3NIVA 3TJFA 11GSA 3Q19A 2PPTA 4CHSA 4TXVA 4TR0A 1M99A 1M2BA 1N2AA 1XWGA 5J41A 2IMIA 5D93A 4ZBAA 3MSZA 5GAND 4WBJA 5H5RA 2P0GA 1FHEA 2XBIA 1JZRA 4KW6A 4IQ1A 3KM6A 5ABRA 2R37A 2K6VA 7GSSA 4IJ3A 2L59A 4KDUA 3G7IA 1DE1A 3RAZA 2IWTA 1S3DA 2IFQA 3HVVA 5IQYA 2CAQA 1YKCA 2DJ3A 4ZBDA 3C73A 1VF4A 2HXKA 4HQSA 1GULA 3O6TA 3UARA 1T00A 1SL0B 2RM6A 3MNGA 3W6GA 3EWLA 4TN8A 3GMFA 3M9KA 2B7KA 1QGVA 4IP6A 1SL1B 1CQHA 5H5QA 2BMXA 3UAPA 3PH9A 3P90A 1U3IA 1T3BA 3U5RE 17GSA 4HDEA 1M2DA 1ACVA 1OE8A 1GNEA 3DYRA 4ECCA 1RW1A 2JL4A 3BCKA 4HU7A 1PX6A 4TR3A 3QOUA 3GHAA 2CVDA 5GSSA 2DBCA 2A2SA 2KP2A 3ZIJA 3UL3A 1K0NA 4KX4A 4I2TA 4HJMA 3GV1A 3IV4A 3ZVJA 5ELAA 2CAIA 1TK8B 1AC1A 1WRYA 1XW5A 3CSHA 1EEMA 1SJ6A 5HR3A 5JWOB 3VWXA 3TKQA 1O8XA 3F4RA 1PQNA 4F2IA 2H30A 3C1SA 1GH2A 5F06A 4G2EA 3HVXA 3TRPA 3QAWA 3TOUA 4TR1A 1HYUA 2AAWA 5KEJA 3G9BA 2OJLA 5LD0A 3F8UA 3FW2A 1K0DA 1QUWA 4DSRA 5CREA 1X5EA 3WGEA 4HZ2A 1XOAA 3KH9A 6GSWA 4MA9A 4HEA2 5G5FA 4K0NA 2M46A 3EVIA 4LMVA 1C72A 5FHIA 3FZAA 5LCZA 1H4OA 3M0FA 4FYBA 3DVXA 3QMXA 2CZ2A 3ZZXA 4G10A 3RPPA 4K2DA 3TKPA 3ZLPA 1K0CA 3TKSA 5KN2A 5DCHA 4TXOA 5JWRB 2NTOA 3D22A 4I97A 1EEJA 2LRCA 3TOTA 3HHVA 4J57E 4MH3A 3NOFA 4MPFA 3FKFA 1ERVA 2AB6A 4KDYA 5ECLB 1F2EA 5D9WA 2WRTA 6GSYA 6GSSA 1AW9A 4GQCA 4LMWA 2CVBA 4K7NA 5DALA 1K3YA 3WT2A 3FHKA 2H70A 1K3OA 1G6YA 2FHEA 2LRNA 1A2LA 3Q18A 2BJXA 2HLSA 1FVJA 3ZFBA 3VPTA 3GH9A 5HR0A 1Q4JA 1JZOA 1VRSD 1JLVA 2HZEA 1GL8A 4E8HA 3GTUA 1GSYA 4MPGA 4PQHA 3RHBA 4KH7A 1MDJA 2JU5A 2H6YA 1XFLA 1EWXA 4YAVA 2HYXA 3KTBA 3KP9A 1A8LA 1A0FA 2J9HA 2H8LA 4NMUA 2JACA 2E0QA 1JLWA 4KAEA 2RIIA 3TCOA 2OA7A 2LNSA 1PKWA 1UA5A 4PXOA 1Z5YE 2EIOA 2LJKA 2QGVA 5IOXA 2VCXA 2FY6A 4BA7A 4HU9A 3TDGA 1TKDB 2H75A 2HZFA 4PNGA 1FAAA 4PUFC 1EP7A 3UIWA 3MWHA 1ILOA 1MDIA 1UN2A 2FD3A 2REMA 4N10A 2AJQB 1SKSB 3APSA 3IPZA 5ID2B 4JBBA 4HOJA 5J4UA 3GIXA 1XPVA 2NDOA 5DVBA 5INYA 4HZ4A 1V2AA 2B1LA 2J23A 5D9XA 1PD21 1MD4A 3QDNA 5DAKA 2HRFA 1MD3A 4EO3A 1T1VA 4IQAA 1QMVA 4BVXA 1WMJA 2FCHA 3HZ4A 5KN3A 1XOBA 5GAPD 5KN0A 5DCGA 3D0ZA 4XRAA 2H01A 2X8GA 1PKZA 2C0EA 2OADA 3TKSC 2A2RA 4XS4A 1QXHA 3FYGA 4XCSA 1K0BA 3WD6A 1QK8A 2F9SA 3KXOA 1B9YC 2K9FA 1WOUA 4ZL7A 1Q98A 4NHZA 1E6BA 3M8NA 2C3NA 1TRUA 4MJEA 1AXDA 3LEFA 2YANA 2VL2A 3H93A 4KCAA 1OYJA 2XBQA 3KIJA 2V1MA 1XWBA 1U6TA 5HR2A 5B6NA 2RUEA 2F3MA 2GZZA 4ECJA 3D4MA 3P8WA 1YZXA 1SD9A 1TU7A 4KDXA 3MDKA 3E0UA 3KCMA 2V41A 2IJYA 3GL5A 4AF2A 5ELGA 3UMAA 1N8JA 1YDKA 2JADA 1AAZA 3C8EA 4MJCA 4TW5A 2H1DA 3SWLA 2OKAA 3F0IA 3L78A 4QL7A 3CTFA 1GSQA 4OFTA 1Z3EA 5HFIA 3VPQA 2FUG2 18GSA 4J2FA 3IA1A 1GWCA 2OBIA 3FY7A 1J9BA 4CDOA 2Z9SA 2DIZA 3ME7A 2DC5A 1SKWB 5IMZA 1O8WA 1AQWA 2L4CA 1JZWA 2KUCA 1ML6A 1TP9A 5AIVA 3HCZA 2CVKA 2HNLA 2EIQA 1GRXA 5DJMA 2DSAA 2MMAA 2IFQB 1OC8A 1LU4A 1K0MA 4JR6A 2I81A 5A5KA 5ENUA 3N5OA 5AN1A 3ZVJD 4IS0A 3ME8A 2VLVA 3UVTA 4ID0A 3ERWA 2VLUA 3WT1A 1J0FA 1YQ1A 4PURA 5IMFA 3LG6A 3W8SA 1BQ7A 2B5EA 5F07A 1KTEA 5E4WA 3TGZA 4PX1A 3UBLA 1ST9A 4NV5A 3S9FA 5G1LA 3KH7A 1MEKA 1GTUA 1XXUA 2YP6A 4GCIA 2B1KA 4HQZA 1F9MA 3HY2A 2B5XA 5IMDA 1BJXA 1WIKA 3I69A 2CX4A 4HJ2A 1Y25A 1X9SB 3FZ5A 4NHWA 1W89A 5E59A 4LA1A 5EL8A 3RHCA 2E7PA 3VI7A 1ON4A 3QAGA 2MMOA 3LXTA 5HQPA 3GSTA 2IN3A 4RQXA 3LGCA 4WR4A 1BX9A 1KBNA 3LFLA 2OE1A 4IGJA 4YQUA 5IMVA 1K3LA 3IOSA 1GTAA 3DIEA 5AIXA 4PNFA 3ZMLA 4ZIJA 1EGOA 3NZNA 5F8BA 2L57A 4RI6A 3QFBC 3KTLA 3H8QA 4TR1B 4XIHA 2PERA 5D9VA 4FYUA 1AQXA 5IO2A 3CSIA 2YN1A 2YZUA 3D5JA 5ECHB 3GH6A 4OD7A 3GNJA 3C71A 2LQOA 2LRTA 5JCGA 6GSVA 1V57A 3APOA 1GSEA 2YZHA 2K8VA 1FG4A 1PSQA 1SK2A 3F3QA 3DKSA 1TI1A 1SENA 4BPYA 2H6ZA 3GX0A 4YAPA 1B4PA 2AHEA 5A4VA 2E2MA 5ECQB 4L5OA 1GSDA 2I9HA 3F3RA 1DUGA 5EVOA 4L5LA 2CQ9A 3D6IA 19GSA 1R5AA 3US3A 4IW9A 1Z6MA 4TXOB 2PMTA 1BAYA 2JSYA 2I3YA 1B4QA 3GA4A 3TJBA 2G2QA 3GKXA 3DMLA 3TJJA 1Y6EA 3L9VA 4L0UA 4AJ6A 4RQRA 1G6WA 3GRXA 4IP1A 4IJIA 1F3AA 1ERTA 1OKTA 1K0OA 2ALBA 4O32A 5DALB 1T8EB 4O92A 1FW1A 5IMCA 3F4SA 3GYKA 3IR4A 5D9TA 2LTKA 2F51A 1SU9A 2HZEB 4N30A 2R2JA 2YJ7A 4Q5NA 3EYTA 4YQVA 3TJGA 2N5AA 3IDVA 1R7HA 5CP1A 3GUSA 3ZREA 2VO4A 1F37A 4D73A 1V58A 1ZL9A 1GTBA 4ZL8A 4WF5A 1A23A 2B6MA 1OC9A 4ZB6A 5ECRB 1G7EA 4X0XA 3ZYWA 1SK1A 2G0FA 1GNWA 14GSA 4XS1A 2HT9A 4POLA 4WR5A 3E9JB 1A24A 3CRTA 4F9ZA 5LNKe 2JZRA 4EDYA 2R4VA 2LV3A 4OO4A 4WKWA 2ZUPA 3DXBA 1U3AA 1GTIA 3RPNA 2LQQA 2VUPA 4PQ1A 2WGRA 4POKA 4TR4A 5B7CA 3KMOA 1ZYEA 4OFNA 2DJ0A 1ERUA 3C7MA 5DAKB 1XIYA 5DJLA 4MMMA 2L4QA 3TB2A 2N5BA 2H73A 2XC2A 1FB0A 1XWCA 1ABAA 1YEXA 3TKSE 10GSA 3EU4A 4GWRA 5AISA 5ECSA 1O81A 2BTOT 2WB9A 2OE3A 1MDKA 3ISOA 3ERFA 4RUVA 4ILFA 3VK9A 5FT3A 2IIYA 1O6JA 3M1GA 3VWUA 5IMAA 4MDCA 4XS4B 1T4YA 2B7JA 2WFCA 5F05A 3HZ8A 5B8BA 1XVQA 1USBA 1EGRA 4IN0A 5JCWA 3LYPA 4NXIA 5GSTA 3EMPA 2GSTA 2XPDA 4G19A 3F4TA 1XBSA 3TRXA 4JR4A 1S3CA 4DEJA 1XW6A 2V32A 4KE3A 2L6DA 4YQMA 3VI5A 3IAM2 2YV9A 5DQYA 4BWQA 4MJBA 4XTSA 1TJDA 2JSZA 1NHYA 2MMZA 3HJPA 1AQVA 3ZIVA 1GSSA 4ECBA 2MMNA 1ERWA 3LWAA 4JZQA 2C8UA 3VURA 1IYIA 1TI3A 3KD0A 3GFKA 1YF1A 3E3EA 3PGTA 1B8XA 3CSJA 1RQMA 1Z9HA 2GDRA 1VGLA 4O5RA 2TRXA 3HKRA 4NPBA 1GUHA 4KA0A 4K9ZA 2GQLA 2I1UA 1VF3A 1SL2B 2DJKA 1NM3A 2YV7A 3ZRDA 4L0WA 2GSQA 1TOFA 4BL7A 3A2VA 1O85A 2PWJA 5EY6A 3ZITA 4X1UA 1THOA 4MJAA 2O7KA 4EE0A 2VD0A 1EZKA 4Q5RA 4G9HA 3EC3A 2GT5A 2MZCA 3HYPA 1EOGA 4Z7XA 2V6OA 3OR5A 1XZOA 4ECIA 4OCEA 1WP0A 1IYHA 3VWWA 3QD9A 3U6VA 1B48A 4KNDA 2LS5A 4F0BA 4V2MA 2HI7A 1F3BA 1V40A 4F0CA 2JZTA 1X9WB 1PN9A 3W8JA 3D4TA 5J5NA 3ERGA 2C0DA 2GS3A 3ZFLA 1URMA 1GLQA 4XRDA 2KLXA 5IM9A 4TOPA 3VFIA 2GQMA 4POBA 2F8FA 2ON7A 2D2ZA 1YF0A 2L5OA 3HJMA 9GSSA 4AGSA 1ZYQB 1LBKA 2H0IA 2I4AA 2H66A 2HFDA 2WZ9A 1BG5A 5B8AA 5G2ZA 3TKRA 4V2NA 3HVSA 1M9BA 2VD1A 2ZNMA 1V98A 2N5FA 3G7JA 3HD5A 3KJYA 4MP4A 1GP1A 3FEUA 2GZPA 3KMNA 2VL3A 1JFUA 4CW9A 5CYYA 3IK7A 4I6XA 2HSHA 3RDWA 3BBYA 1OC3A 4MLYA 4V1Ap 2RM5A 1M0UA 2WS2A 5FWGA 1H75A 1R5PA 4N0ZA 3QAVA 2OBKA 3QPMA 3IBHA 5G30A 1HNCA 3O3TA 1HNBA 3J7Yk 2GQKA 1TK5B 1OVNA 4I2UA 4KSOA 2CV4A 4ZBBA 1SJIA 3UEMA 4AJ8A 2FA8A 2P5QA 4V2LA 1TW9A 2E2GA 2GT6A 3WGXA 4I5QA 3QR6A 2VL9A 2B3SA 1WPIA 1F6MC 1NW2A 2CX3A 2K8SA 3IAS2 2VLTA 4IBPA 5HFKA 3A2WA 1SYRA 4NV2A 4TVEA 2ZCTA 1TDIA 2GLRA 2KOKA 4WETA 1RK4A 3I6AA 4EVMA 2VAFA 2NBSA 4MZCA 4RI7A 4JRRA 2YWIA 2WJUA 4EXJA 4JE1A 3KZQA 3ZTLA 1A8YA 2FNOA 3HXSA 2OACA 4MF6A 2VL2C 1Z7RA 3DD3A 5D96A 4ZILA 1HQOA 4GQFA 4LL1B 2ES7A 1TRWA 2AUVA 1TK0B 3FRCA 3EE2A 2TIRA 2VCVA 1YEPA 4X43A 1DBYA 2YNXA 6GSXA 2CA8A 4OCFA 4AJ7A 1EV4A 4XHMA 5CRWA 3QFAC 3FR3A 3CYNA 2VCTA 2FLSA 4ZXGA 4GF0A 4GRFA 5DDLA 4QQ7A 1G7OA 1WJKA 3L9SA 1KEBA 1GSFA 2QKEA 5G1KA 3APQA 3P2AA 2PBJA 1TXXA 1ZGNA 5JCUA 4D73B 1O73A 1V9WA 2AV4A 1OC9B 2H76A 1QQ2A 3L4NA 1DSBA 5KN1A 3GKNA 4GTUA 1JZDA 2LJRA 4ZB9A 3HJOA 4JU5A 1PRXA 1GSUA 4N11A 5D73A 2VCWA 5ECPB 2C0GA 1QFNA 5CRGA 4POMA 5IO0A 2R3XA 3PINA 1E2YA 2F8AA 4LL4B 1X9MB 1XVWA 3I43A 1ZZYA 2RUFA 4WXTA 4WBRD 3GKMA 5IPGA 1XWKA 1GUKA 1PL2A 4FIWA 3F6DA 5DQSA 1YY7A 3DEXA 3WYWA 4FYCA 3VWVA 2C3QA 3EINA 3FR9A 2VOCA 1VF1A 3M3MA 2DMLA 2IMKA 5A4WA 2C80A 20GSA 3A2XA 5B6MA 3FK8A 2YPMA 2VCZA 3IRAA 4IHUA 2C0FA 4MCUA 3K8NA 1Z7PA 1FB6A 2X99A 3F6FA 1BYEA 2MYGA 4OFMA 3UBKA 2XHFA 5J9CA 1KNGA 5H5SA 3GTUB 4I8BA 4HUAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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