The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
48
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sequence length |
167
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structure length |
167
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Chain Sequence |
GLKAGDSFPSDVVFSYIPWSEDKGEITASGIPINYNASKEWADKKVILFALPGAFTPVSSARHVPEYIEKLPEIRAKGVDVVAVLAYNDAYVMSAWGKANQVTGDDILFLSDPDARFSKSIGWADEEGRTKRYALVIDHGKITYAALEPAKNHLEFSSAETVLKHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The Crystal Structure of Peroxiredoxin Asp f3 Provides Mechanistic Insight into Oxidative Stress Resistance and Virulence of Aspergillus fumigatus.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| source organism |
Neosartorya fumigata (strain atcc mya-4609 / af293 / cbs 101355 / fgsc a1100)
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| molecule keywords |
peroxiredoxin Asp f3
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| total genus |
48
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| structure length |
167
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| sequence length |
167
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
1.11.1.15: Peroxiredoxin. |
| pdb deposition date | 2016-04-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF08534 | Redoxin | Redoxin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Glutaredoxin | Glutaredoxin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4GLT A; 4OCE A; 1OKD A; 3IA1 A; 4IGJ A; 2ALB A; 4MH3 A; 3U5R E; 1GRX A; 3TJG A; 3TRQ A; 2B7K A; 1K0N A; 3IBH A; 1J9B A; 2I3Y A; 1JLV A; 5KEJ A; 3G7I A; 1A23 A; 2DJJ A; 3EVI A; 1VGL A; 1PL2 A; 4MLY A; 3GKX A; 4OCF A; 4EKZ A; 2OA7 A; 4ZB8 A; 4I2U A; 2O8V B; 3FY7 A; 1XBS A; 3IK7 A; 3WD6 A; 2DSA A; 5E59 A; 5AGY A; 2RUF A; 2CT6 A; 3IR4 A; 4GST A; 4G2E A; 3UVH A; 1EGR A; 1X5C A; 5J9B A; 1GL8 A; 1T4Y A; 3QMX A; 2B7J A; 4HDE A; 1X9W B; 1XWC A; 1YF0 A; 4N0V A; 2F9S A; 3ZVJ D; 3NOF A; 3GL5 A; 3KGK A; 1GUL A; 3U6V A; 2K9F A; 3GIX A; 4RI7 A; 1MTC A; 1B4P A; 3UOM A; 3I9V 2; 1FG4 A; 3BOA A; 4BVY A; 2GT5 A; 3FRC A; 4WF4 A; 1DUG A; 2XHF A; 3GFK A; 4IJI A; 2L5O A; 7GSS A; 5D73 A; 2KHP A; 3RDW A; 1PMT A; 2PER A; 4HEA 2; 5DVB A; 19GS A; 3UJ1 A; 4IN0 A; 2YPM A; 1GNW A; 2YV7 A; 2VUP A; 5A5K A; 1R4W A; 4KA0 A; 3DKS A; 1WMJ A; 4AF2 A; 2GST A; 5J4U A; 4K8M A; 3HVS A; 4MJE A; 3DVX A; 5G5E A; 5CYY A; 3QR6 A; 4EL1 A; 4MZW A; 3HJM A; 3MSZ A; 4O7H A; 2J9H A; 4LLR A; 4POL A; 2YWM A; 1HYU A; 3GX0 A; 1PL1 A; 2P0G A; 2O7K A; 1GNE A; 2H6X A; 2B6M A; 1SK0 A; 1TI1 A; 1K3Y A; 2CAQ A; 1YJ6 A; 4F2I A; 3PH9 A; 4POK A; 1EV4 A; 2YWO A; 3M1G A; 4MAB A; 1SJI A; 3UMA A; 3KTL A; 2CZ3 A; 4FH8 A; 5JWO B; 2QGV A; 3QOU A; 4O5R A; 2TIR A; 4MA9 A; 3LXZ A; 4KE3 A; 2G0F A; 4ACS A; 2VCW A; 1SL0 B; 1SK1 A; 3TB2 A; 1JHB A; 5CO3 A; 1IYH A; 4Q5Q A; 4LA1 A; 2DJ0 A; 3QD9 A; 1AW9 A; 4GCI A; 2TRC P; 1HD2 A; 4GQF A; 2OE3 A; 1C72 A; 3UBK A; 3W6G A; 4YAV A; 2FA8 A; 4TN8 A; 1LBK A; 2YJH A; 3ERF A; 1R5A A; 5JCG A; 5DJL A; 2LS5 A; 2C1Y A; 1AQX A; 4PNG A; 1PN9 A; 2V1M A; 4EDY A; 1ML6 A; 5IMF A; 1W4V A; 4NXI A; 2VCQ A; 1U88 A; 3ZRD A; 2OAC A; 5IO0 A; 1ZZY A; 5HFI A; 3CSI A; 5F05 A; 1M2D A; 3F3R A; 1EEJ A; 3APO A; 1FOV A; 1F2E A; 3EMP A; 2H75 A; 5HR1 A; 5DCG A; 3DRN A; 2OAD A; 2JU5 A; 2HSH A; 3KMN A; 5EPF A; 2I81 A; 3LEF A; 3GTU B; 2F8F A; 4DEJ A; 1MDJ A; 4GSS A; 4HU9 A; 4PUA A; 3FEU A; 2VM2 A; 1HNC A; 2WZ9 A; 1EZK A; 2GLR A; 2H72 A; 1V2A A; 4XIH A; 4POM A; 1GLQ A; 3DXB A; 4FYC A; 4JR4 A; 3RAZ A; 1GUM A; 5JWQ B; 4CHS A; 4TOP A; 4HZ4 A; 4NPB A; 1ZGN A; 1BAY A; 5IMV A; 2JZT A; 2C80 A; 1TTZ A; 1XZO A; 4IP1 A; 1WRY A; 2P31 A; 3HXS A; 4YQV A; 4RUV A; 6GSS A; 4D73 A; 2VL2 C; 3UEM A; 5CNW A; 4AJ6 A; 5D9X A; 1YQ1 A; 3D6I A; 1XVQ A; 2XC2 A; 2LNS A; 5ELA A; 4TR1 A; 3QAW A; 1USB A; 4BA7 A; 4F9Z A; 3HJO A; 4L0W A; 3LGC A; 3EWL A; 2QC7 A; 3J7Y k; 3KZQ A; 2FWG A; 2EIR A; 4J57 E; 4L5L A; 5GST A; 2MMO A; 1XIY A; 3I6A A; 1SL1 B; 13GS A; 1OC8 A; 1ABA A; 2V6K A; 4I97 A; 1GTI A; 5A4W A; 10GS A; 2VIM A; 4WBR D; 2CZ2 A; 4BVX A; 2M72 A; 1VRS D; 4HJ2 A; 1Q4J A; 3WGD A; 3ZVJ A; 3M8N A; 3TOU A; 3M0F A; 1Z9H A; 1MDK A; 2JAC A; 5IOX A; 2PN8 A; 3CRT A; 2GDR A; 3UL3 A; 1SD8 A; 2VD0 A; 3W8J A; 4F0B A; 1K0B A; 2B5X A; 2WJU A; 2VL9 A; 5H5R A; 1CQG A; 1FW1 A; 5IPG A; 2C0G A; 2QKE A; 1ZMA A; 2H76 A; 2H6Z A; 5B8A A; 4GQC A; 4GF0 A; 2LNT A; 4V2N A; 2V6O A; 1TDI A; 3EU3 A; 2VL3 A; 3M9J A; 4NMU A; 1QGV A; 3GH9 A; 3VWU A; 2H30 A; 3BBY A; 4LMV A; 2FWE A; 1O6J A; 1N8J A; 2YAN A; 2BTO T; 2RM6 A; 3TKQ A; 2IIY A; 4EVM A; 3CTF A; 4ZIL A; 3D22 A; 3EIN A; 2F8A A; 2IFQ B; 3C73 A; 3HZ8 A; 2P5R A; 3UAP A; 3TJF A; 2FLS A; 3TOT A; 4IVF A; 2OBI A; 3M9K A; 3D0Z A; 4OFT A; 6GST A; 1FO5 A; 5DCH A; 2AJQ B; 1Q98 A; 1YF1 A; 4DSR A; 1VF1 A; 2NDO A; 2HXK A; 2NBS A; 2H0I A; 4NHZ A; 3F4T A; 2JAD A; 2L4Q A; 4XS6 A; 3ZMK A; 6GSV A; 2HI7 A; 3WGE A; 1H75 A; 4DVC A; 3EU4 A; 2GQK A; 5FHI A; 1F3B A; 5E4W A; 3D5J A; 2GTU A; 4GSN A; 3IK9 A; 3KM6 A; 3LWA A; 4E8H A; 1QFN A; 4TR3 A; 5B7C A; 4NV5 A; 4F0C A; 4XS4 B; 3VI5 A; 3VWX A; 6GSU A; 3F3Q A; 4Q5N A; 3ME8 A; 3GNJ A; 1RW1 A; 4I8B A; 3HCZ A; 4X0X A; 2LST A; 4AJ8 A; 1GSE A; 2I4A A; 2DML A; 3E9J B; 5G5F A; 1YKA A; 2OKA A; 4FIW A; 3FZ4 A; 2FD3 A; 5A4U A; 2CX4 A; 2MYG A; 4G9H A; 3EUR A; 3IRA A; 4JED A; 2F3M A; 4K2D A; 1G6W A; 4WXT A; 4KW6 A; 2XBQ A; 4K0G A; 3HY2 A; 1ACV A; 2IN3 A; 3L4N A; 3A5W A; 4ILF A; 2L6D A; 5JWR B; 4EUY A; 4IKH A; 3HZ4 A; 1PX7 A; 1EOH A; 2FWF A; 2M46 A; 3L0H A; 2DIZ A; 2X8H A; 2LUS A; 5CAX A; 1BYE A; 5ID2 A; 2JSZ A; 3RHB A; 4HS1 A; 4TR4 A; 5B6M A; 2YNX A; 4IQ1 A; 2XPD A; 4E8E A; 1ZOF A; 2YZU A; 4ECI A; 5HR3 A; 3O76 A; 3BCK A; 2VM1 A; 3ME7 A; 3ZYW A; 2X8G A; 4GRF A; 3F9U A; 1GSY A; 2L4C A; 5CP1 A; 5ECR B; 1K0M A; 5F06 A; 4IQA A; 4JU5 A; 5D9V A; 3TCO A; 3GKK A; 5JCW A; 4KAE A; 2PUK C; 3HVX A; 2H0G A; 2B5Y A; 5EY6 A; 4K1F A; 2LRN A; 4TRX A; 4KCA A; 1XWK A; 1QMV A; 1S3A A; 3TRP A; 1QUW A; 3VWV A; 5G30 A; 1GTU A; 4HI7 A; 2RLI A; 1ST9 A; 4CDO A; 4MF6 A; 3F0I A; 3VWW A; 4PQ1 A; 5IMZ A; 1I5G A; 5LCZ A; 3FZ5 A; 3V1W A; 3KH9 A; 18GS A; 4FO5 A; 1PKW A; 2VD1 A; 1KBN A; 5D8I A; 4TW5 A; 8GSS A; 5CRH A; 6GSW A; 2VCZ A; 2H1G A; 2Z9S A; 2VL2 A; 3GH6 A; 4TKY A; 1NW2 A; 5ELG A; 3KTB A; 2ZUP A; 3ZL5 A; 3APS A; 4BPY A; 2HFD A; 2VCV A; 3HD5 A; 4QL7 A; 3WYW A; 1AQW A; 4WEY A; 3QCP A; 5HFK A; 3NIV A; 2LRT A; 3VPQ A; 1ZL9 A; 2JSY A; 1M2A A; 2PWJ A; 3FW2 A; 2R4V A; 1UC7 A; 4H86 A; 4N0Z A; 2C0D A; 1DBY A; 2REM A; 4EO3 A; 5A4V A; 1OC9 A; 2IMK A; 5HR2 A; 4NHW A; 2DLX A; 3TJB A; 4TR0 A; 3RPN A; 3HKR A; 5FWG A; 1G7E A; 1PSQ A; 1R7H A; 2M80 A; 5J5N A; 1KEB A; 3TKR A; 2K18 A; 1U3A A; 5F07 A; 3E3E A; 1VF2 A; 1ERU A; 3ERW A; 4AJ7 A; 4MDC A; 4QL9 A; 5KN3 A; 3QAV A; 1U3I A; 1KNG A; 3CBU A; 4MJC A; 5IMA A; 5ECL B; 2I1U A; 3M3M A; 3DIE A; 2VAF A; 5AIS A; 1PGT A; 1JZW A; 2MBT A; 1XW6 A; 2CX3 A; 3MDK A; 2KLX A; 3IE3 A; 3A3T A; 4G10 A; 3CMI A; 2BJX A; 1X5D A; 2YWI A; 4RQR A; 3H8Q A; 4IBP A; 1PKZ A; 2EIQ A; 1J08 A; 2HZF A; 1V9W A; 4KH7 A; 5EL8 A; 4DSQ A; 1M99 A; 4I2T A; 1BG5 A; 1Z3E A; 4ZBA A; 2RUE A; 2E0Q A; 9GSS A; 1SK2 A; 1TKD B; 5IMC A; 3BD2 A; 5ECO B; 4MMM A; 2AYT A; 1TXX A; 3F63 A; 1AC1 A; 4PNF A; 2LQO A; 5CRW A; 1M2B A; 3GN3 A; 1TK0 B; 4HJM A; 4FYU A; 1AQV A; 2B1K A; 1Y6E A; 2N5F A; 3W8S A; 1K3L A; 4X43 A; 1XCC A; 4N10 A; 2PBJ A; 1U87 A; 5COH A; 1O8X A; 1EGO A; 2AAW A; 2KP2 A; 3ERG A; 4J56 E; 3C8E A; 2K8V A; 3C71 A; 2A4V A; 1FAA A; 1MD3 A; 4YAP A; 1YEP A; 3UIW A; 4LMW A; 4MJA A; 2I9H A; 4V2M A; 5D93 A; 1G7O A; 5D96 A; 1A8Y A; 3LYK A; 4NWY A; 4KX4 A; 4ZB9 A; 2AHE A; 5B8B A; 3D4M A; 4HQS A; 5ECN B; 3A2X A; 1XWA A; 3HA9 A; 1Z5Y E; 3VK9 A; 2JZS A; 3ZIV A; 1NSW A; 2GZZ A; 3RPP A; 4ZB6 A; 4V1A g; 1GLP A; 1V40 A; 1PA3 A; 2HYX A; 1V58 A; 2LQQ A; 5AIV A; 5G1K A; 1W89 A; 1J0F A; 3US3 A; 3NZN A; 2VLU A; 3E0U A; 3QAG A; 4K7I A; 4TXO A; 4MF5 A; 1A2L A; 1NHO A; 2CVK A; 4JZQ A; 2GSQ A; 3GL3 A; 2C3Q A; 2WGR A; 4D73 B; 2N5B A; 3RBT A; 3F4R A; 3G7J A; 1AIU A; 4K7N A; 4F03 A; 5H5S A; 1TI3 A; 1ERV A; 5J41 A; 4TR1 B; 2B3S A; 2GS3 A; 5L71 A; 1X9S B; 2RM5 A; 4HOJ A; 2YP6 A; 2FCH A; 1GWC A; 3N9J A; 1OC3 A; 3FR6 A; 5IM9 A; 4ZBB A; 2CAI A; 4K6X A; 2YOI A; 3TGZ A; 2ZNM A; 4ZXG A; 1AAZ A; 1YZX A; 5DQS A; 1U6T A; 2H1A A; 4KDX A; 2CVD A; 2FY6 A; 3C1S A; 1YKC A; 4OWY A; 1F3A A; 5F8B A; 4O92 A; 5KN2 A; 5IMD A; 3OR5 A; 2YJ7 A; 2K8S A; 3JCM L; 4PUF C; 1GUK A; 2IJY A; 4ML1 A; 3QDN A; 3G7Y A; 5DAK A; 3KH7 A; 4L0U A; 2X8C A; 4ZL9 A; 4RI6 A; 2AB6 A; 3IV4 A; 3HDC A; 4AGS A; 2H8L A; 4ID0 A; 2H74 A; 3TKP A; 4XRA A; 1ILO A; 4MJB A; 5INY A; 1DSB A; 1EV9 A; 3KD0 A; 1GSD A; 1DE1 A; 1XWB A; 1OYJ A; 3LYP A; 2C4J A; 3ED3 A; 1SD9 A; 1PRX A; 3DEX A; 2D2Z A; 3L9S A; 3SBC A; 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