2FA8A

Crystal structure of the putative selenoprotein w-related family protein from agrobacterium tumefaciens
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
86
structure length
86
Chain Sequence
b'TKPRIAIRYCTQCNWLLRAGWMAQEILQTFASDIGEVSLIPSTGGLFEITVDGTIIWERKRDGGFPGPKELKQRIRDLIDPERDLG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Putative Selenoprotein W-related family Protein from Agrobacterium tumefaciens
rcsb
molecule keywords hypothetical protein Atu0228
source organism Agrobacterium tumefaciens str.
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 22
structure length 86
sequence length 86
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10262 Rdx Rdx family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fa8A00
5H5SA 2R2JA 4YQUA 2D2ZA 4KUNA 2EIQA 4TXOB 4PQ1A 4EF0A 2WB9A 18GSA 4MJEA 4MJAA 3M8NA 3GHAA 2V41A 2LS5A 2K18A 5HFIA 3RHCA 4BVYA 2WULA 3GNJA 3HZ4A 3TJGA 3H8QA 4TVEA 1GWCA 3FEUA 2C0DA 2IN3A 5F07A 2C0FA 2YCDA 3UBKA 3UBLA 4WR4A 2IFQB 2PUKC 4AJ8A 1F2EA 1U87A 1NSWA 4PXOA 1TK5B 1FHEA 4MJCA 1MDKA 2YN1A 3GN3A 1YKAA 4L5OA 1BX9A 1YDKA 2RM6A 3C1SA 1EGOA 3GKMA 2AHEA 4GWRA 2PPTA 4TOPA 2F8FA 2LQOA 5DAKB 1Z6MA 4X43A 3UMAA 4PUAA 5JCWA 4TR1B 5G31A 1V2AA 2OA7A 4TKYA 5GSSA 4V2LA 3ZZXA 1ZYQB 1O7UA 1SKRB 3S9FA 4XS6A 3WT1A 4KSOA 3CMIA 5CRGA 1EP8A 4ZB9A 1X9MB 1VF3A 2DJ0A 4HZ2A 2PGTA 3BCIA 3HJMA 4X0XA 3D22A 1SL2B 4IQAA 4AJ6A 2GGTA 5EL8A 5H5RA 1TU7A 1TXXA 4YAPA 1WE0A 5KN3A 4OMVA 4ZXGA 1W89A 2GZPA 3KTBA 5CRHA 3GFKA 4OFNA 16GSA 2REMA 3TJFA 4BL7A 2GSTA 1VF2A 3LYKA 4WBJA 2E2GA 2JACA 2N5BA 4I8BA 5CP1A 2C1YA 3I6AA 5AGYA 3P2AA 2VLTA 4WBRD 1SL1B 1M7TA 1J9BA 2CV4A 4TR4A 4V2MA 1OYJA 5B6MA 4IW9A 4POBA 1H4OA 1EP7A 3QPMA 3TCOA 3EC3A 1GNWA 6GSVA 1XFLA 3DRNA 1SD8A 2KP2A 2RUFA 3ERFA 3L4NA 5CREA 5GSTA 2H71A 2K6VA 4IQ1A 1K3LA 2FWEA 4DSSA 2JSZA 1WMJA 2G2QA 2GSSA 4L0WA 2RUEA 3D21A 3KP9A 2K9FA 3TRPA 4FIWA 3VWXA 1PRXA 5IOWA 3GUSA 5FWGA 1Z7PA 3HJPA 4XTSA 1A2MA 1ZGNA 2M46A 2VCVA 1DBYA 1EEMA 3I9V2 1SJIA 3U6VA 5ECQB 3VI5A 4BPYA 4PNGA 3FR3A 1TTZA 4YQVA 3QD9A 3FY7A 2YP6A 2OBIA 1K0OA 3DEXA 3R2QA 1M0UA 2DMMA 2H6XA 3KH9A 2H1BA 3IAS2 3E3EA 1GSYA 2GDRA 1B4PA 2VM2A 2NDOA 1CQGA 3O3TA 1XW6A 2V2GA 4WF5A 5G30A 14GSA 1RQMA 5CO3A 2ZNMA 2HE3A 3QAWA 4IS0A 1GTBA 2C3QA 5LNKe 1XWBA 1ZZYA 4EE0A 2CVKA 2GVPA 4MCUA 4EXJA 1XCCA 1QK8A 2B5EA 4P3YB 1GSQA 3US3A 1AQXA 5AIXA 3IXRA 2YWOA 1GTAA 3CRUA 1PMTA 2EIRA 2PBJA 4KH7A 2K8VA 3GRXA 3N5OA 1HD2A 1K3OA 1M9AA 3IBHA 4D73B 3F63A 1EV9A 1AQVA 5J41A 4EKZA 4GSNA 4TXOA 5IIZA 2LQQA 3F8UA 4RI6A 2LJRA 4KB3A 4F9ZA 2F3MA 3VWUA 1T00A 2F9SA 6GSXA 1GLQA 3LG6A 3SBCA 3SWLA 1OKDA 2H73A 1WIKA 1XOBA 1A0FA 1EWXA 4GTUA 5KN1A 3DXBA 2IFQA 1OC9A 4GSTA 1AW9A 3D4TA 2DJ2A 3UL3A 2GQLA 4K0GA 4KGIA 2B3SA 4ML1A 2NTOA 4LMWA 3FKFA 1ACVA 4IJIA 4TRXA 2DJKA 3VPQA 3HVVA 5J5NA 4N0VA 5DAKA 2AV4A 1U3AA 2YV7A 1UN2A 2PU9C 4MPFA 1KNGA 4HEA2 5DCHA 3IE3A 1V9WA 2L4QA 4HU7A 3GMFA 1J0FA 2YWNA 4TR1A 3A2WA 5JCGA 2XPDA 4JR4A 2IMDA 4I6XA 2X64A 3NOFA 3TOTA 5DJLA 2CAQA 1PD21 5FT3A 1YF1A 5HR0A 1SYXA 2DBCA 4NV2A 3VLNA 1Q98A 1QMVA 2H74A 4K9ZA 2J23A 1FB6A 4JE1A 1O81A 4IELA 1JLWA 1SK0A 1GSDA 2CVBA 3P7XA 4RUVA 2KOKA 2MMNA 4K6XA 1XWAA 2FLSA 2QGVA 5JWRB 1GLPA 3F4SA 1AIUA 5ECOB 3QR6A 3TB2A 2OE1A 2P5RA 3ME7A 3W6GA 2L4CA 1TKDB 1F37A 3IR4A 3CTFA 1G0TA 3UVHA 2X8CA 2HSYA 2O89A 2I9HA 5COHA 1S3AA 4XRAA 4IVFA 3PINA 1R5AA 5IM9A 2IMKA 3TGZA 3TKQA 2H19A 5EVOA 4PUFC 1R4WA 3LJRA 3MNGA 3TJJA 3TOUA 5CRDA 1XWKA 3QAVA 1DSBA 1BAYA 1N2AA 1X5CA 2L5LA 4QL9A 3HJOA 1F6MC 3DVXA 5IMCA 4MH2A 4IP1A 3VWWA 2VM1A 3Q19A 4MPGA 1UC7A 1JZDA 2C3TA 4WETA 1BEDA 1BG5A 1ERVA 1I5GA 2IWTA 2VOCA 4ILFA 4DVCA 1RW1A 2H01A 3C8EA 1Z3EA 2VL2C 2GS3A 4H86A 4KDUA 4KW6A 4IP6A 4PGTA 3GTUB 1OE8A 5ELGA 3C73A 2FCHA 3IPZA 3UAPA 2VD0A 2PN8A 4OO4A 4EDZA 2DIYA 4OCEA 2X99A 2BTOT 4JR6A 4WKWA 2B7JA 2VCWA 1HQOA 2K8SA 2WJUA 3FK8A 3DGQA 2IMFA 3ZMKA 3KJYA 4Q5FA 2DJ3A 3JCML 1KTEA 3HD5A 5DDLA 3EURA 3ZFBA 1U6TA 2E0QA 2IMIA 1ZL9A 3UOMA 3G7YA 3ERGA 1O8XA 2LNTA 2ON5A 5B8AA 3KCMA 1OC3A 1C72A 5B7CA 2WGRA 1QFNA 5J9BA 1SJ6A 3D6IA 4IN0A 3DYRA 1XBSA 3F4TA 2HLSA 4IHUA 1K0BA 3GH6A 3LFLA 4ID0A 3F4RA 2VCQA 3RPPA 3IRAA 19GSA 3OR5A 3RPNA 3IOSA 2CA8A 2OADA 2E7PA 1XW5A 2VLUA 3F3QA 1Y6EA 1XWCA 3I43A 1A8LA 6GSWA 5IMVA 5ECHB 4AF2A 4XHMA 4D73A 3IK9A 1GRXA 3E9JB 2NBSA 1GP1A 4WR5A 2R37A 1FG4A 4ZBDA 2PMTA 5A4WA 3GL5A 3WGEA 3TRQA 4XCSA 1USBA 5E4WA 2MMZA 3HVSA 1F9MA 1A2LA 4O5RA 5CAXA 4NHZA 3ZYWA 6GSUA 2FY6A 3HY2A 2A4VA 1V40A 3F6DA 3QCPA 1S3DA 1YJ6A 3ERWA 2ES7A 1MD3A 3GURA 3L0HA 3A3TA 2V32A 4NAXA 2XPEA 4NXIA 4K8MA 3C7MA 1SU9A 1F3AA 1XOAA 1J08A 2B1LA 3GYKA 3E0UA 1SD9A 5HFKA 1R7HA 3PGTA 1EZKA 2H6ZA 2YNXA 4FYUA 2FWHA 1LU4A 1PA3A 2YJ7A 1SK1A 4ECIA 4ECBA 4ULXA 1TW9A 1XZOA 5B6NA 3A5WA 4YH2A 3P8WA 2LTKA 1SL0B 3D5JA 1K0DA 1DE2A 1O73A 1Z5YE 1NM3A 1SENA 1T8EB 2KUCA 4X1UA 3CSJA 2OJLA 3ZVJA 3F3RA 5IPGA 4Q5NA 1A2JA 2VUPA 4KAEA 3ZTLA 2WFCA 5D9XA 2C4JA 3FW2A 1O85A 4F0BA 1KEBA 2BMXA 4ECCA 1SK2A 3PR8A 17GSA 5G2ZA 3IAM2 3PH9A 4CW9A 2GSQA 5ECLB 2H0HA 2G0FA 1WP0A 4XS4B 3DWVA 3IDVA 2C0GA 2HNLA 4ZL9A 1THXA 4F0CA 4NMUA 5CYYA 3DKSA 2LNSA 4OCFA 1N8JA 2FA8A 3GH9A 3M9KA 1GSUA 4WXTA 1TI3A 3WGDA 4ZILA 4K7OA 2H72A 4MA9A 5DCGA 3VFIA 2N5FA 2H1GA 1G7EA 2TIRA 2CQ9A 5HR1A 5G5EA 2QSIA 3GTUA 1A8YA 4RI7A 4POKA 4PX1A 5ID2B 3C1RA 1TP9A 3LWAA 1ZYEA 2E2MA 1PGTA 4LMVA 5D96A 3NIVA 3QOUA 2F51A 3BOAA 2O85A 2HRFA 1ERUA 3HVXA 3NZNA 3L9SA 2JL4A 3RHBA 3ZL5A 2B1KA 3M0FA 1VRSD 3CSHA 3EVIA 5F05A 3ED3A 2VAFA 4J57E 3ISOA 3O76A 2KLXA 4MABA 4K2DA 3BJ5A 3F0IA 20GSA 2JSYA 1JZWA 4LA1A 3FRCA 2M72A 3QAGA 3WD6A 1FVJA 5JCUA 3ZMLA 3LQ7A 4GRFA 1BQ7A 5D8IA 2VCZA 1B9YC 2R3XA 4ZBBA 3HA9A 1AQWA 1YY7A 5D9TA 2MZCA 7GSSA 1B9XC 3J7Yb 2J9HA 4FO5A 1GUKA 3GSSA 4CHSA 4MF5A 5GAND 2VCXA 1WPIA 2OKAA 3TKSC 5B8BA 4QL7A 1V57A 1JFUA 5LCZA 1TRUA 5LD0A 1PL2A 3ME8A 2IPAA 4L5LA 2RLIA 3TJKA 2YWIA 2GQKA 5G1KA 4KSMA 2JZSA 4AGSA 4IKHA 3G7IA 3FZ9A 5F0GA 1TOFA 2LKUA 1TK0B 4HI7A 4TN8A 5GAPD 2MMOA 1T7PB 6GSYA 3VI7A 3ZITA 2OE0A 1AC1A 1MD4A 3FHKA 3ZFLA 3RBTA 3CBUA 1UVZA 2GSRA 1K0MA 3H79A 3KMOA 1PQNA 3MWHA 1WWJA 2I81A 1QQ2A 4OD7A 4EUYA 3GX8A 3LXZA 1M99A 2YWMA 1K0NA 1AUCA 1TU8A 1EGRA 3QMXA 1ZOFA 2NPBA 4XRDA 3GA4A 1QGVA 5IPHA 1YKCA 1YQ1A 4DSRA 3KM6A 4K7NA 5AIVA 1GSEA 1K0CA 2N5AA 2A2RA 1GH2A 3FZ4A 4BVXA 1PX6A 2B6MA 2C0EA 4MF7A 2VL9A 4TW5A 1V98A 1JLVA 1NW2A 2HZFA 4Q5QA 4JEDA 2I1UA 1X9WB 4G2EA 12GSA 4EL1A 1XVWA 2R4VA 3QDNA 2M80A 5ECIB 3KP8A 3W8SA 1Y25A 1MDJA 2B5YA 2EIOA 2TRXA 1FW1A 1KBNA 5DBQA 3VK9A 3BBYA 5INYA 2HZEB 4N10A 1FVKA 3D4MA 4OWYA 3W8JA 2VIMA 5ECPB 1OVNA 2QC7A 1ST9A 1B4QA 2H70A 2JZRA 3DIEA 1WOUA 2EC4A 1B48A 3A2VA 4HJ2A 2AB6A 5FHIA 5ECSA 5KN0A 2P5QA 1QUWA 5HR3A 3GX0A 2LEGA 4G9HA 2JU5A 1XWGA 2AJQB 2O8VB 4XS4A 10GSA 1THOA 2P0GA 1FO5A 5EY6A 2O87A 4QQ7A 5HFGA 4FYCA 2H0GA 2LRNA 2B7KA 4XIHA 3MSZA 4POMA 5C00A 1PX7A 1X0RA 3FZ5A 1ERWA 3FZAA 5ECRB 1GUHA 2DSAA 1RK4A 2C8UA 2YPMA 3TKPA 3BCKA 2WS2A 4MF6A 5ID2A 3CXGA 4Q5RA 2YOIA 5D9WA 5IMFA 5ECMB 3Q74A 1SJZA 4Z7XA 4I2TA 1ILOA 1PSQA 1MTCA 2YZUA 5A4UA 4L8EA 5DQYA 3HZ8A 2CZ3A 2VL2A 5L71A 4MZBA 1V58A 5ELAA 2FWFA 2GQMA 3MAKA 3I69A 3RAZA 4I5QA 4NPBA 3IK7A 4KCAA 4RQXA 3QFBC 4HDEA 4HU9A 1OC9B 5CNWA 1IYHA 3TDGA 4HS1A 4HUAA 2GZZA 3TKSE 5CRWA 4DEJA 4HZ4A 5ENUA 1M2AA 1M9BA 4NHWA 2TRCP 2L5OA 4PQIA 5IMDA 2V1MA 1MEKA 4BWSA 1I9DA 1VGLA 2WDUA 5AN1A 2LJKA 1TDIA 2XBIA 2H66A 2MMAA 4JZQA 1TI1A 4G19A 4GSSA 3U5RE 3GSTA 1A23A 4L0UA 3HXSA 2VCTA 1W4VA 4JU5A 2F8AA 1FB0A 6GSTA 4FH8A 2H0IA 1R26A 2L6DA 4LL1B 1H75A 4KE3A 1DUGA 2HSHA 2GLRA 4LL4B 5DALB 3DMLA 4FYBA 3WT2A 1ON4A 2LSTA 1CQHA 11GSA 4F03A 1DE1A 3J7Yk 2XBQA 2CT6A 4O92A 2I3YA 2V6KA 5JWQB 4IBPA 5HQPA 3IV4A 4LLRA 2OBKA 4MLYA 3N9JA 3HYPA 4N11A 5IO2A 3FR9A 4JBBA 3LYPA 5DQSA 2GZYA 2YV9A 2H75A 2C3NA 1U88A 4E8EA 1OKTA 2H76A 1VF1A 4TR0A 1BJXA 3L78A 2CX3A 3CRTA 4IJ3A 2X8HA 3LGCA 4K1FA 1T4ZA 2HYXA 2L59A 4K0NA 3M3MA 3H1NA 2PWJA 1VF4A 3GKKA 1PKZA 4V2NA 3LSZA 1NHYA 4KCEA 5HR2A 1PL1A 1TRWA 1T3BA 1FOVA 3HDCA 4J2FA 1F3BA 2LRTA 2ZUPA 4HQSA 1YEPA 4GCIA 2HXKA 3UEMA 1M2BA 5F06A 1M2DA 1ABAA 1GSSA 5D73A 2HRNA 3DVWA 1GTUA 2FUG2 3Q6OA 1NHOA 3ZLPA 2IJYA 3CSIA 4ZL7A 1XPVA 2IMEA 4AJ7A 3LXTA 2HZEA 5IOXA 2LUSA 1IYIA 1Z9HA 3V1WA 5D93A 1ML6A 1AAZA 3GV1A 4E8HA 1SKSB 4ZB6A 1GTIA 3HKRA 4HQZA 4V1Ag 5IQYA 3IA1A 2DJJA 4GXZA 4EDYA 3EU4A 3UJ1A 4OFTA 1E6BA 3Q18A 4MK3A 3UIWA 1XW9A 4GQCA 3APQA 1B8XA 3KD0A 4ACSA 2L57A 4IGJA 1A0RP 1JHBA 2AAWA 1GULA 2B5XA 1G6WA 3ZIJA 5J4UA 2H30A 2WRTA 1G6YA 3G9BA 3FYGA 2P31A 2CX4A 2WZ9A 4NWYA 1UA5A 2GTUA 3M9JA 1QXHA 1OC8A 1FAAA 3RDWA 1ZCPA 2O7KA 4MZWA 1XIYA 3HCZA 4EVMA 5C04A 3F9UA 2HFDA 3ZVJD 3F6FA 4MH3A 1GSFA 1TK8B 1OAZA 5ECNB 2HI7A 5AISA 3GKXA 22GSA 2R6KA 4KDYA 2WCIA 1GUMA 1YF0A 2PVOC 3WYWA 3EU3A 3C71A 1YEXA 3KTLA 3ZREA 3D0ZA 5H5QA 4F2IA 2X8GA 1MDIA 3EYTA 2IIYA 4MP4A 1LBKA 4EC0A 2H1DA 2VL3A 13GSA 2IL3A 8GSSA 4ZL8A 5JWOB 4V1Ap 1R5PA 1TJDA 4NV5A 2H8LA 3K8NA 2LV3A 1EOHA 4ECJA 5J9CA 1G7OA 1WJKA 6GSSA 3UARA 4ZB8A 5ABRA 3DD3A 4CDOA 2VLVA 4MJBA 1EV4A 1O8WA 2GT6A 2FWGA 4GF0A 3G7JA 1A24A 4GQFA 5IMAA 2R5GA 4KX4A 1AXDA 2OE3A 4MDCA 2RIIA 1X5DA 2FD3A 4K7IA 2PERA 4XS1A 3GIXA 5G5FA 1Z7RA 1ERTA 1SYRA 1X9SB 4OO5A 4WEYA 3KIJA 2HT9A 3IC4A 1HYUA 2L6CA 2AUVA 5DJMA 4MZCA 3EWLA 2VD1A 2MYGA 3TUEA 3WGXA 1XVQA 5J3RA 3GL3A 1T4YA 2V6OA 2H1AA 2C80A 5KEJA 1ZMAA 4O32A 2ZCTA 2GT5A 3KGKA 1X5EA 1K0AA 2LRCA 1PN9A 3L9UA 3TJBA 4KNDA 3H93A 9GSSA 3LEFA 3KMNA 5A5KA 5DALA 2JADA 4N30A 2CVDA 5D9VA 3ZIVA 2FA4A 4RQRA 3P90A 1S3CA 2CZ2A 4EO3A 2KP1A 5A4VA 2YANA 2I4AA 4BA7A 4G10A 4ML6A 4I2UA 1YZXA 2MBSA 3VURA 4POLA 1E2YA 2NVLA 2YJHA 3EMXA 1TRSA 2OACA 2DLXA 4OFMA 3FR6A 2DC5A 3TKSA 3ZRDA 2MBTA 3EE2A 1URMA 3TKRA 2FHEA 5G1LA 2FGXA 1OE7A 3APSA 4DSSB 3A2XA 4TR3A 3KH7A 4F82A 2JZTA 1O6JA 2RM5A 1WRYA 2XHFA 3KEBA 2A2SA 1HNAA 3H4KA 4KDXA 3CTGA 3MDKA 1XXUA 1JZOA 1HNCA 4JRRA 3L9VA 4I97A 2CAIA 2H6YA 3AY8A 3EMPA 2KHPA 4N0ZA 3KXOA 1JZRA 3VWVA 1K3YA 4HJMA 1BYEA 5EPFA 1HNBA 4HOJA 5ECKB 4J56E 2ON7A 1LJRA 4YQMA 4MMMA 1Q4JA 2DMLA 3M1GA 2DIZA 3KZQA 1PKWA 3APOA 4PQHA 1GNEA 2BJXA 3EINA 2FNOA 1T1VA 1U3IA 4DSQA 1EEJA 4YAVA 2VO4A 5IMZA 1GL8A 5E59A 5F8BA 1EOGA 1Z6NA 4PNFA 2ALBA 5IO0A 3IHQA 3LORA 3O6TA 2QKEA 2Z9SA 4BWQA 4PURA 4ISDA 1TRVA 3TRXA 3QFAC 4GLTA 4O7HA 2DJ1A 4WF4A 2YZHA 2LJAA 4TXVA 4ZIJA 2PVQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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