2FA8A

Crystal structure of the putative selenoprotein w-related family protein from agrobacterium tumefaciens
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
86
structure length
86
Chain Sequence
TKPRIAIRYCTQCNWLLRAGWMAQEILQTFASDIGEVSLIPSTGGLFEITVDGTIIWERKRDGGFPGPKELKQRIRDLIDPERDLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Putative Selenoprotein W-related family Protein from Agrobacterium tumefaciens
rcsb
molecule keywords hypothetical protein Atu0228
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Agrobacterium tumefaciens str.
total genus 22
structure length 86
sequence length 86
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10262 Rdx Rdx family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fa8A00
1AIUA 3LFLA 1G0TA 1USBA 5KN1A 4KAEA 4J57E 4Q5RA 1GSQA 4Q5QA 3IAM2 2CV4A 1FHEA 3QAWA 1EP8A 3AY8A 2REMA 3HD5A 4PQ1A 2LJRA 3G7YA 1O73A 2VLUA 2X8HA 1DUGA 2CAQA 1PSQA 2E2GA 1MTCA 1IYIA 3GN3A 2VCVA 1WRYA 2O85A 2PBJA 1V9WA 4JBBA 2LKUA 3I9V2 2HZFA 1GULA 2IMFA 4L5LA 1OC3A 5GZZB 4ECJA 3FY7A 2O87A 3FK8A 1WMJA 1U3IA 3BJ5A 2QSIA 4MZCA 3VURA 3CSJA 1XVWA 1J0FA 1TU8A 3TGZA 2PN8A 3VWUA 3EU3A 4N0VA 1MD4A 2DMLA 2YWNA 2WZ9A 2KOKA 3ZIJA 3QCPA 4HJ2A 1SKRB 5IM9A 3VWXA 4PQIA 4E8HA 1X9MB 1Z6NA 3KMNA 5GAND 2N5BA 3DGQA 4IJIA 2JSYA 3ZMKA 3WGEA 2YPMA 2V6KA 4ISDA 1MDIA 1ML6A 3VPQA 4I5QA 5ECOB 3IE3A 1E6BA 3D0ZA 2CX4A 2HXKA 3FR6A 1SL1B 5B7CA 4MDCA 3ZFLA 2CVKA 1K0AA 4JE1A 2HSYA 1WWJA 5AGYA 1K0MA 1FO5A 1WJKA 3D22A 3F63A 3H4KA 5CO3A 3VK9A 3L9UA 4MPGA 3Q6OA 4NWYA 5F06A 3S9FA 1WPIA 1GRXA 4ZL9A 1ON4A 3F9UA 2IIYA 3TRPA 1MDKA 3UL3A 3IC4A 3ZITA 2IWTA 2DBCA 5CRGA 4WETA 4XIHA 3DRNA 1QGVA 1ZMAA 2YN1A 3BCIA 2VAFA 2WJUA 1XWAA 1DE2A 4V2LA 3LYPA 4N10A 3PINA 1XW5A 3LQ7A 4IN0A 1U6TA 1PKWA 2PVOC 3HXSA 4MLYA 4DVCA 3FZAA 3IV4A 2O89A 1K0CA 3QPMA 5ECMB 2I3YA 4BWQA 1FW1A 2TRCP 2IPAA 3TKRA 1B4PA 2IN3A 2B7JA 3WGXA 3WT2A 2VL2A 2F51A 5IIZA 5H5SA 4WXTA 4Z7XA 3GH9A 3ISOA 4G9HA 2R2JA 5DBQA 5GAPD 5H5RA 1UVZA 3DMLA 3HVXA 2RM5A 4FYCA 5J5NA 1I9DA 5D8IA 2MMNA 4P3YB 1O7UA 1GUKA 2G2QA 4K0GA 1YF1A 4F9ZA 1DE1A 3WGDA 1XW6A 3EE2A 2L59A 3IPZA 2VUPA 4MF5A 4ACSA 2H6YA 4OD7A 1QMVA 2ZCTA 4HUAA 1SKWB 1ZGNA 1RW1A 2CX3A 1DSBA 2C1YA 2OE3A 5ECNB 1Z5YE 4HU7A 2A2RA 3CSIA 5AN1A 3ZFBA 4L5OA 2R37A 5ECPB 1JZRA 2GT5A 1M9BA 4POMA 3GTUA 5ELAA 3VI7A 2HT9A 2AJQB 1BYEA 3L78A 1TK8B 3KGKA 3ZZXA 4CW9A 4K0NA 3M3MA 3UVTA 1F9MA 5G31A 1B8XA 2C0DA 2CT6A 1THXA 1FB0A 4EE0A 18GSA 2MMZA 4GCIA 2OACA 5CYYA 1PN9A 4YQMA 4WF5A 4GQFA 4HOJA 1M0UA 4KH7A 4D73A 3M9KA 3KD0A 1XXUA 4POLA 1UN2A 4QL7A 2X64A 5DCGA 1A24A 1ERUA 2GSRA 3M8NA 4PUFC 3F4SA 2HZEB 2FUG2 1PL1A 2J9HA 1GSEA 2GQLA 1GNWA 3FYGA 6GSSA 4V1Ag 3HA9A 2AYTA 4IELA 5B6NA 2H75A 3EMPA 4RI7A 1TP9A 2I1UA 4RI6A 2V41A 5ID2B 4ZXGA 6GSVA 5J41A 2GZZA 4NPBA 4TVEA 5CP1A 1CQHA 2PPTA 4HJMA 3CTFA 1BG5A 1S3AA 4K7IA 2FD3A 1OC8A 4XRAA 3TOTA 1KNGA 1WE0A 5F07A 4MA9A 2KP1A 1E2YA 3CRTA 2FLSA 1AAZA 12GSA 4EKZA 1GL8A 2ES7A 1A0FA 1JLWA 4JU5A 2HI7A 4AJ7A 5DCHA 4EDZA 5A4VA 3NIVA 1EOGA 4X43A 3EC3A 4HDEA 14GSA 3R2QA 1YJ6A 3IHQA 3GSSA 3GTUB 3MSZA 2LNTA 4MF7A 2C8UA 4GXZA 2B6MA 1UA5A 4FYUA 2VIMA 4HZ2A 2HLSA 2K6VA 2BMXA 1SL0B 1TRSA 5C00A 2VL2C 1TKDB 4POBA 5ECHB 2K9FA 4FYBA 1G7OA 2IMIA 4D73B 4GSNA 5IMDA 4GSTA 1F2EA 1MDJA 2LTKA 3GKXA 3HZ8A 2RM6A 4IJ3A 5GSSA 5IO2A 1Z9HA 4JR6A 3H79A 2H0GA 5INYA 2GZYA 2WB9A 4ML6A 3F4TA 1ZZYA 3GKNA 4MPFA 4EDYA 5D73A 3LSZA 1I5GA 3F6FA 3MNGA 2F3MA 5IOXA 4FIWA 1X5DA 1YKCA 1JHBA 3Q74A 3LORA 1TOFA 3UOMA 5D9XA 5J4UA 4OWYA 4LA1A 2I81A 4GSSA 3TJKA 5F05A 4KDYA 4BL7A 2V1MA 5LNKe 4K8MA 3DVXA 4XTSA 1FAAA 1F3AA 1HYUA 1YF0A 2L6CA 2YZHA 2R4VA 17GSA 3ZLPA 1B48A 2M46A 3RHCA 3JCML 5CRWA 4OCEA 1V40A 3GH6A 1QXHA 4DSRA 2WGRA 3FW2A 1SD9A 5LCZA 2M80A 3GYKA 1SJZA 5ECLB 4TR3A 2YCDA 2L57A 5DJMA 3DIEA 4IP6A 3A5WA 3ZRDA 1A2MA 5CNWA 5D9VA 2H1GA 2P5RA 5ENUA 2VL3A 3VLNA 3GL3A 3L0HA 2VCXA 5DQSA 2H0IA 4DSSB 4KNDA 1M2DA 2GZPA 1OC9B 3EYTA 1QK8A 3IAS2 4JEDA 4ECBA 2L6DA 4AGSA 1GTIA 4K7OA 3VI5A 4AF2A 4N30A 4TR1A 2B5XA 2DLXA 3RPPA 1NSWA 1M7TA 2PVQA 1GP1A 3M9JA 1EP7A 1YDKA 5AIVA 2NBSA 1X5EA 1T8EB 1GTAA 5F0GA 3GMFA 1VGLA 1XWKA 2EIOA 2AHEA 2EC4A 1AUCA 1VRSD 1A8YA 2CAIA 2FWEA 5B8AA 3D21A 1EV4A 3TDGA 2WS2A 2H72A 2VCWA 5G5FA 5EVOA 3N9JA 3W8JA 1M2BA 3DWVA 5A4UA 2IJYA 3GL5A 3I43A 5IPGA 2GDRA 4TOPA 1EWXA 5HR0A 3H93A 5KN0A 2KUCA 2H66A 1NHYA 4I2UA 3WT1A 2VCTA 3IXRA 2JSZA 2DJKA 3NOFA 2E2MA 2AB6A 3D5JA 6GSXA 4N0ZA 4PURA 3G7IA 1AQXA 2L4CA 1SK1A 2VD0A 4DEJA 2I4AA 3APSA 2XC2A 3M0FA 5E4WA 3KIJA 1WIKA 3K8NA 5IMVA 1FOVA 5B8BA 3KTBA 4TRXA 3HVVA 1GWCA 2CVDA 5DAKB 3L4NA 1N2AA 1VF4A 3KP8A 1K3OA 2YV9A 2WRTA 5IMAA 4TXVA 4HS1A 4MK3A 2QKEA 1TW9A 5LD0A 3P2AA 4TR1B 3IR4A 2JU5A 4TXOA 3ERGA 4OFNA 1H4OA 1B4QA 3E3EA 1ERTA 2DJ0A 2JZSA 4EVMA 2DJ3A 2AUVA 1F3BA 4ZL7A 2QGVA 2WDUA 3LWAA 4V2NA 2X99A 4K2DA 4OFMA 3WYWA 3GUSA 2C0GA 3GURA 2HFDA 1S3CA 3U5RE 1K3LA 3D6IA 4ZBAA 1KTEA 3DXBA 4NHWA 2HZEA 3FR9A 3LXZA 5FWGA 1A0RP 1X9WB 4QL9A 3EURA 2LJKA 1SYRA 5IMCA 2MMAA 1O8XA 2YNXA 5ID2A 4F0BA 2RUEA 2I9HA 1AQWA 3GNJA 1KBNA 1SK2A 2L5LA 2DIYA 4KSMA 1SD8A 1FVJA 2D2ZA 2GQMA 3SBCA 3GFKA 1R7HA 4L8EA 2C3NA 1TRUA 5KN3A 4TN8A 4K6XA 3O76A 1AQVA 1FB6A 4MABA 3NZNA 2K18A 4ECIA 1J08A 1VF3A 1GTUA 2YJHA 1HNCA 4ZB6A 4GTUA 2ON7A 1AXDA 3HCZA 4LL1B 1S3DA 4L0WA 1JLVA 3GHAA 2FA4A 4HI7A 2A4VA 5KN2A 1LU4A 4X1UA 4BWSA 1HQOA 2N5AA 2IMDA 3C7MA 1Q98A 3J7Yk 3ZIVA 2J23A 3QAVA 2OKAA 3HJPA 2IMKA 2H8LA 4GQCA 1V57A 4JZQA 1SENA 1PA3A 3VFIA 3LEFA 5G5EA 3VWVA 3EWLA 4TXOB 4AJ6A 1GSFA 1XWBA 4WKWA 5HR2A 3LGCA 4IHUA 4ZIJA 2VM1A 5HFGA 1PX6A 2OBKA 1BJXA 1JFUA 2EIRA 3GA4A 3GRXA 2OE0A 3E0UA 5HR3A 3KZQA 2KHPA 1BQ7A 1ZCPA 1XW9A 2K8VA 2DJ1A 1TK0B 1NM3A 2IL3A 2LRTA 4EC0A 2XBIA 3PR8A 2LEGA 1GSYA 2OE1A 3CTGA 5A4WA 3CYNA 1C72A 3A2XA 4POKA 1XPVA 2GSQA 1EV9A 2VCZA 3APQA 2H1BA 2FY6A 1T1VA 4OO5A 2JZTA 2GTUA 4Q5FA 5J3RA 1MD3A 7GSSA 19GSA 2CQ9A 2B3SA 4NV5A 1XWGA 3ZTLA 1T3BA 4EO3A 11GSA 2FA8A 4YAPA 3KMOA 1BAYA 1RQMA 1OE8A 1NW2A 2DMMA 4QQ7A 3A3TA 2H70A 3IDVA 1A2LA 2FCHA 3PGTA 4TKYA 1WOUA 5CAXA 1T4ZA 1UC7A 2ON5A 4G2EA 2X8CA 4I8BA 2B1KA 3UVHA 4OCFA 1EGOA 1EGRA 2EIQA 2XHFA 2CZ3A 3HHVA 4KB3A 5DVBA 5ECSA 1SJ6A 5JCGA 3QD9A 2HRNA 1EOHA 4DSSA 2JACA 2TIRA 2E0QA 3MAKA 2ALBA 3EMXA 1OC9A 3EU4A 2RLIA 2HNLA 3RDWA 3QFBC 1TRVA 2GSSA 4YQUA 2P5QA 2IFQA 4MCUA 2C4JA 2AV4A 4JRRA 4ZBBA 3UIWA 3N5OA 3ZL5A 3RHBA 3FHKA 4NMUA 3ED3A 5ELGA 1QQ2A 2X8GA 4KGIA 2LSTA 2H1DA 2LRNA 5ECRB 3LYKA 3C8EA 1OKDA 4PX1A 1V58A 2L4QA 3BCKA 3HZ4A 2VLVA 3TRXA 3LXTA 2H1AA 4N11A 1FVKA 4MZWA 1R5PA 1O6JA 3KTLA 2QC7A 1EEJA 3UARA 1Z6MA 4LL4B 3Q18A 4PGTA 2PUKC 3KM6A 2V2GA 2OJLA 2LQQA 2NTOA 2DSAA 1JZOA 5JWQB 1YY7A 2A2SA 4O7HA 1O8WA 4XS6A 3BD2A 1M9AA 1TI3A 1W89A 1PL2A 1B9XC 5J9BA 4MF6A 5D9TA 1K0OA 3C1RA 1PKZA 1RK4A 3QMXA 4CHSA 1K0NA 1R26A 2K8SA 5HFIA 2VLTA 2OBIA 3TKSE 5DALB 2AAWA 3G7JA 5GSTA 13GSA 2FGXA 2YOIA 1OKTA 1T00A 2VCQA 2Z9SA 2H76A 2H30A 4XHMA 4G10A 4K9ZA 5HQPA 4BVYA 3CXGA 3FR3A 3QDNA 2LJAA 2F8AA 3ZYWA 3TB2A 2MZCA 4ZBDA 4YQVA 22GSA 3MDKA 5EPFA 2GS3A 2ZNMA 4GWRA 1GTBA 4DSQA 3DYRA 5ECIB 4RQRA 3IK7A 5D9WA 2YWOA 3TUEA 6GSWA 2M72A 5DAKA 1OYJA 3GKMA 2PGTA 3KEBA 3H1NA 2KLXA 2O7KA 2IFQB 1ERVA 4WF4A 5CRDA 3FKFA 2IMEA 5G2ZA 2L5OA 4PUAA 2GGTA 3F4RA 6GSTA 3HYPA 3IK9A 4ECCA 1LBKA 3FZ4A 2C3QA 4TW5A 3QFAC 5G30A 3EINA 4GF0A 2LQOA 1PMTA 1Z7PA 1ST9A 5DDLA 4ZILA 1GLPA 4BPYA 4XCSA 5H5QA 1SYXA 3TKPA 3ERWA 3APOA 4AJ8A 2H6ZA 1YEXA 2FNOA 3O3TA 3RPNA 1F6MC 4O5RA 4J2FA 3CMIA 4KX4A 2BTOT 3ERFA 2YANA 4XS4A 1GSDA 4ZL8A 3TCOA 4PNGA 1X5CA 1CQGA 5EY6A 3KH9A 2P0GA 4MJAA 4NHZA 1X9SB 8GSSA 1GNEA 3W6GA 4ZB8A 4OFTA 4O92A 4EF0A 3GKKA 2WULA 5EL8A 5ECKB 5COHA 1EEMA 3QOUA 1N8JA 3F3QA 4I97A 3ZVJD 1SJIA 2OA7A 1HNAA 4TR4A 4KA0A 1TI1A 3DEXA 3FZ9A 2YWMA 2GT6A 2JZRA 1URMA 4KDXA 3MWHA 4NXIA 4LLRA 3D4MA 1H75A 3V1WA 3QAGA 4K1FA 3GIXA 4IS0A 5JCWA 3U6VA 5J9CA 2NVLA 3CBUA 1V98A 1B9YC 3TKQA 3LJRA 5B6MA 2DIZA 2O8VB 2GVPA 3HDCA 1O85A 3L9SA 2GQKA 3ME7A 3H8QA 2LUSA 5ABRA 5IPHA 3HJMA 4ZB9A 2RUFA 2E7PA 3GX8A 2YP6A 1T7PB 2LV3A 2WCIA 4NAXA 1PGTA 10GSA 3IA1A 2CZ2A 2LS5A 4OO4A 4XS1A 4WR5A 3D4TA 4EUYA 3DVWA 5HR1A 2PMTA 3J7Yb 5ECQB 2R5GA 4WBJA 2N5FA 5E59A 4ML1A 1R5AA 4I6XA 3C1SA 1JZDA 1LJRA 2WFCA 1ZOFA 1SL2B 1OE7A 3LG6A 4FH8A 5AISA 3US3A 2VL9A 2FWGA 5L71A 3ZVJA 1EZKA 4V1Ap 1ACVA 2OADA 1TJDA 1DBYA 4OMVA 4KDUA 4MH2A 1XOAA 1THOA 4IBPA 4XS4B 3IRAA 3C73A 1F37A 4KUNA 2TRXA 4V2MA 4I2TA 1GUMA 2HYXA 4JR4A 6GSYA 2B1LA 4RQXA 3W8SA 1JZWA 3TJBA 2B5YA 1XOBA 4KCAA 3DKSA 4MJCA 1YZXA 4PXOA 1AC1A 1YEPA 1MEKA 4EL1A 3EVIA 3GSTA 1XZOA 1XBSA 3CSHA 2YZUA 1SKSB 4G19A 5CRHA 16GSA 3HY2A 2R3XA 3SWLA 1U3AA 3BBYA 2PWJA 4NV2A 5DJLA 5DQYA 3F3RA 2VD1A 2JADA 2XPEA 3A2WA 1SK0A 1TU7A 2V32A 1M99A 2NPBA 4L0UA 3FEUA 2RIIA 2LRCA 3HKRA 4ILFA 3CRUA 1ZYQB 1OAZA 1X0RA 3I6AA 3FRCA 1VF1A 2XBQA 5D96A 1KEBA 2VO4A 3F6DA 1XWCA 5D93A 2YV7A 3QR6A 1K0BA 3DD3A 2G0FA 4X0XA 1M2AA 3ZMLA 1YQ1A 1U87A 3RAZA 2HRFA 3I69A 3P8WA 4IW9A 3TKSA 9GSSA 4IP1A 1PD21 4MJBA 1Z7RA 20GSA 1PQNA 1VF2A 3KCMA 3Q19A 3G9BA 1XIYA 2FHEA 3ME8A 2PERA 1QUWA 5FHIA 5IQYA 2P31A 4MP4A 1FG4A 4BVXA 1ABAA 1AW9A 2GSTA 2GLRA 1HD2A 4MJEA 2F9SA 4IKHA 2BJXA 2FWFA 3E9JB 4MMMA 2C3TA 2NDOA 1OVNA 5C04A 3P90A 3UBKA 3KXOA 2B5EA 1YKAA 4KSOA 3M1GA 4EXJA 3PH9A 2H19A 1WP0A 1G7EA 3TOUA 2C0EA 4PNFA 1BEDA 1GH2A 3UBLA 1G6WA 1A2JA 1SU9A 2F8FA 5DALA 1K3YA 3KP9A 3IBHA 3TJFA 1TK5B 1ILOA 4IGJA 1TRWA 1ZYEA 3F8UA 3O6TA 4ID0A 5IMZA 4F2IA 2MMOA 3L9VA 4WEYA 4KW6A 2JL4A 4J56E 1J9BA 4RUVA 5AIXA 2LNSA 3C71A 2DC5A 1V2AA 3UAPA 3IOSA 1GUHA 1Q4JA 3HJOA 4IQAA 3TRQA 3UJ1A 4E8EA 2FWHA 3P7XA 1A8LA 5FT3A 3TJJA 1BX9A 2XPDA 1Z3EA 4HQSA 4WBRD 2CA8A 2R6KA 5KEJA 4CDOA 2H6XA 2VOCA 2MYGA 2H71A 5HFKA 2DJ2A 2V6OA 3VPTA 3BOAA 1T4YA 1R4WA 1TTZA 4IVFA 1HNBA 2H73A 4KCEA 4ULXA 2C80A 4PQHA 2MBSA 3TJGA 4HEA2 5IMFA 4O32A 1ZL9A 4IQ1A 3RBTA 1O81A 3OR5A 1Y25A 1G6YA 3FZ5A 5IO0A 2DJJA 3A2VA 1PRXA 1U88A 4YH2A 4K7NA 2H01A 4GRFA 4HU9A 3HVSA 4HZ4A 4F0CA 4FO5A 3KH7A 4F82A 2B7KA 3WD6A 2KP2A 4XRDA 1W4VA 5CREA 4MZBA 6GSUA 1ERWA 3GX0A 1PX7A 4BA7A 2H0HA 1GLQA 3ZREA 1XFLA 5IOWA 4Q5NA 3UMAA 4WR4A 1A23A 3VWWA 1GSUA 4YAVA 2C0FA 1IYHA 5G1KA 2H74A 1XVQA 4LMWA 3GV1A 4F03A 2PU9C 3F0IA 2VM2A 1K0DA 2YWIA 1GSSA 5JWOB 1XCCA 5A5KA 2YJ7A 2HSHA 1QFNA 1NHOA 3TKSC 5G1LA 4LMVA 5F8BA 2MBTA 4KE3A 1Y6EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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