4PQ1A

Crystal structure and functional implications of a dsbf homologue from corynebacterium diphtheriae
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
GTFQFHSPGGKTEIFYDEGERAPVSEIRGEGLTSDSVSLADYKDKIVVLNAWGQWCAPCRSESDDLQEVHEYLGDKGTVVGINVRDYSKNIAQDFVKDNGITYPSIYDPPFKTAAQLGGVPASVVPTTIVLDKQHRPAAVFLREVTAQDLIKVIDSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Corynebacterium diphtheriae
publication title Structure of a DsbF homologue from Corynebacterium diphtheriae
doi rcsb
molecule keywords Putative electron transport related protein
total genus 49
structure length 157
sequence length 157
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4pq1A01
1T1VA 5KEJA 1WOUA 3GSSA 2C4JA 4MK3A 1G7OA 4O7HA 1HD2A 2VAFA 1I5GA 3HZ8A 2H6ZA 2WZ9A 3TJJA 1A2LA 3F3RA 1ZYQB 2H1DA 4IP1A 3FW2A 4TXOA 1TRWA 1AQVA 5E59A 4D73B 5B6NA 5ID2A 1GTAA 5D93A 1F3BA 2X99A 2H74A 1XWGA 1XZOA 3BJ5A 3ZLPA 1XW9A 4OCFA 3HKRA 2VLTA 4KGIA 2JZRA 4GQFA 2C3TA 3FY7A 5L71A 3VWVA 3E3EA 3I69A 2B7KA 5AN1A 5A4VA 1TXXA 3TCOA 1M2BA 3P90A 4Q5RA 1G0TA 1CQHA 1UA5A 2O85A 4MF6A 5INYA 5CO3A 2LSTA 3DRNA 3QD9A 4XIHA 5LNKe 3N9JA 3ME7A 4PURA 3ZRDA 2OE0A 3EYTA 3C8EA 2VD1A 2H1BA 5G5EA 3I43A 5ECHB 1KEBA 1K0MA 3HHVA 3GKXA 4K0GA 3QAVA 1RW1A 2O7KA 1Z7RA 1B48A 1U3IA 2VCXA 6GSUA 3D4MA 1MDKA 3ERGA 3F0IA 5CRGA 2L4QA 3P8WA 1THOA 3ZIVA 2XHFA 3HXSA 1FOVA 2K9FA 2JU5A 3F9UA 3FHKA 1GNWA 4NMUA 3EINA 5FWGA 2B1LA 3NOFA 1O73A 4HUAA 4ISDA 3FZ9A 5D96A 4OFTA 1NHYA 4OWYA 3ERWA 1XOAA 5JWQB 3IC4A 4NWYA 2DJ2A 5EL8A 2YWNA 4PUFC 1PSQA 4ECBA 1U3AA 3F6FA 2VL9A 3CRTA 1XFLA 5GSTA 2CX4A 2JSZA 2XPEA 1FAAA 2VCZA 1EWXA 3WD6A 3TGZA 2C1YA 1BG5A 4OO4A 6GSYA 1BYEA 2GTUA 3TJKA 2HZEA 1B9XC 5HR3A 1B8XA 3MAKA 3HZ4A 4QQ7A 5ECPB 4TR1B 5HQPA 5D8IA 1U87A 2GQLA 4RI6A 5D73A 1NM3A 4ZBBA 2DMMA 4MA9A 2F9SA 2QKEA 4PNGA 1O6JA 5CREA 4KSMA 1VGLA 1EP8A 4YQMA 4G10A 3LJRA 3LGCA 4OFNA 2VD0A 4BA7A 3VLNA 5DALA 1EOHA 2G2QA 4PQHA 1LBKA 5IM9A 4PQIA 5DQYA 4L8EA 4FYCA 3U5RE 3W6GA 4QL9A 4RI7A 4DSSB 3HYPA 4Z7XA 1J08A 4PX1A 1ABAA 5F05A 4KB3A 4K7NA 1J0FA 3HJMA 3J7Yk 4I2UA 3F3QA 1SJIA 2DJJA 4PUAA 3ZZXA 5J9BA 1WRYA 1OE8A 4XCSA 5DVBA 4TR0A 1JLWA 1M7TA 4N11A 4BWQA 2DJKA 3EVIA 3KM6A 1YF1A 1VF1A 22GSA 3KH9A 1SD9A 1T3BA 1K0CA 1V58A 2PN8A 4KDXA 1PX7A 2H75A 2MMNA 1EEJA 1SL0B 3DD3A 1ZGNA 1AQXA 1JZOA 2P31A 2O89A 3GKKA 5KN2A 3F6DA 4IGJA 2NBSA 4KE3A 2HZFA 4DVCA 3FEUA 4MH2A 1K0NA 1AIUA 4N0VA 2LRTA 2OKAA 5GAPD 5IO2A 3FRCA 5IOXA 1O7UA 1V57A 1M2AA 3UEMA 4G9HA 1A2MA 4EO3A 1BEDA 2L4CA 2PWJA 4L5OA 4IHUA 4JR6A 4N0ZA 4MJBA 5B6MA 2P5RA 3A2VA 1YKCA 3W8SA 2K6VA 3F4RA 4GSSA 1SK1A 2KLXA 4POMA 5KN0A 14GSA 3FR9A 1GTIA 2VLUA 3ZMKA 1H75A 5KN1A 1F6MC 3RDWA 2V41A 3U6VA 4ACSA 5IPGA 2WGRA 1XW6A 2C80A 1SL2B 2E2GA 3GNJA 3SWLA 5DBQA 3L9VA 1EGRA 2H70A 3QCPA 2I9HA 1GWCA 1S3DA 1XCCA 4MH3A 4F0BA 2I81A 4IN0A 3G7YA 4DSRA 4IP6A 2K8VA 3KJYA 3IK7A 2LS5A 3HA9A 3S9FA 1Z5YE 4WEYA 3TUEA 1YKAA 2AV4A 1VF2A 1R26A 3CSJA 5ENUA 2YANA 5CNWA 2H19A 3PINA 2FWFA 1SKRB 2K8SA 4YAPA 3N5OA 2YOIA 5C04A 4V2MA 3APSA 2REMA 3CTFA 3IAS2 1GSEA 4E8EA 2OA7A 4FIWA 3F8UA 3DVWA 2IFQA 2FWGA 2FA4A 1EEMA 4KH7A 2M80A 3KEBA 4EF0A 2NTOA 1U6TA 1GUMA 1EV9A 1N2AA 4HJMA 1OE7A 5AIVA 2L6CA 4JRRA 4NHZA 4WKWA 2A2SA 5LCZA 2YP6A 3RBTA 2LKUA 2I3YA 3G7JA 5B7CA 2O87A 2PMTA 2GT5A 18GSA 4AJ6A 3KH7A 4GSTA 1K0DA 3TB2A 4WF5A 2H8LA 2DLXA 2VIMA 4TKYA 3GX0A 4TXOB 4XRAA 1ST9A 4Q5QA 2CQ9A 1FB0A 4BVYA 3D5JA 3F4SA 3DWVA 5ID2B 1A24A 1SJ6A 2B1KA 2GDRA 4J57E 4JBBA 3D0ZA 6GSWA 4G2EA 4ML6A 3EWLA 2WJUA 4NV2A 1A0RP 3EC3A 1K3OA 1Q98A 3D21A 2PUKC 2HLSA 3LORA 3R2QA 4GCIA 4IW9A 3DMLA 5DCHA 2JADA 4ML1A 3ZL5A 4MP4A 1TDIA 4MF5A 2A2RA 1B4QA 4K7IA 4ZL7A 2VCQA 2LNTA 4POKA 4ZL9A 2N5FA 4RUVA 2LV3A 1ILOA 2R2JA 4HQZA 1U88A 5IO0A 1R4WA 3TRPA 3QOUA 1X5EA 3TRQA 13GSA 1XOBA 2F8AA 2IJYA 1S3CA 3TDGA 2LJAA 5CYYA 1Z3EA 4IBPA 2IMKA 1PMTA 2AHEA 1FHEA 5J5NA 4ILFA 5GAND 1V40A 3CRUA 2R37A 1OC9A 1X5CA 4GRFA 3HJPA 3C7MA 3EU3A 1QGVA 3CBUA 3A5WA 5CRHA 3M9JA 1WPIA 2GGTA 3CYNA 4IS0A 3IAM2 1PKZA 11GSA 3HCZA 3HDCA 4ECJA 5LD0A 3ERFA 5DAKA 3GL5A 3BBYA 1M0UA 4EDZA 3UOMA 3H93A 1FB6A 5G1LA 2E2MA 2YV7A 4HU9A 3BD2A 2NDOA 2OBKA 4HJ2A 4HZ2A 2VLVA 1MDIA 3FZ4A 1HNAA 4X1UA 2VM1A 2HZEB 1XWCA 1O8XA 2NVLA 1XWAA 1SKWB 2LRCA 3KGKA 1QQ2A 5GZZB 3IA1A 3FZAA 1Q4JA 2FWEA 4F0CA 1M99A 2YPMA 5G30A 1WWJA 4TR3A 5IPHA 4IJ3A 2GSRA 4IJIA 4NV5A 4OCEA 1YY7A 1TOFA 4G19A 5A5KA 5IIZA 1YQ1A 1W4VA 5IMFA 3KCMA 5DALB 3LEFA 4OFMA 5DJLA 3UBLA 1BAYA 2CVBA 3LYPA 3A3TA 1KNGA 3HJOA 2PBJA 5D9TA 4GWRA 4YH2A 1SU9A 2RM6A 3ME8A 5COHA 1SJZA 4N10A 2WCIA 3QAGA 4J56E 2F3MA 3WT1A 3A2XA 4EUYA 3US3A 3HVSA 2YJHA 1JLVA 1Y6EA 2BJXA 4MMMA 2GQKA 2FGXA 3VPQA 2KOKA 5B8BA 1FVJA 3M8NA 4OMVA 5HR2A 4F03A 3M0FA 1F3AA 5IMVA 3BCIA 1GTUA 3C1SA 5DDLA 3BCKA 3SBCA 3KMNA 1USBA 2LQOA 5F06A 2GQMA 3GURA 3H79A 1KBNA 4LMVA 2H0HA 1TW9A 4QL7A 5F8BA 4AF2A 3Q19A 1WJKA 3GV1A 3V1WA 2ZNMA 19GSA 3J7Yb 1SK0A 1HNBA 4ZB6A 2LTKA 4GLTA 2H6XA 2HI7A 4I97A 3F63A 3RHBA 3VI7A 4NHWA 3TRXA 2C0DA 5HR1A 1B9YC 1DE1A 3FZ5A 3LQ7A 4V1Ap 3TOTA 1AC1A 1K3YA 1QUWA 4AJ8A 4JZQA 4TXVA 3IPZA 3IR4A 4MPGA 2FHEA 4EC0A 4F82A 2FLSA 1WIKA 2MMAA 4HZ4A 1GRXA 1UVZA 4KDYA 2V1MA 2LNSA 1GSDA 2HRNA 1TKDB 2GVPA 3L0HA 2FY6A 1A2JA 4LA1A 5IMDA 3RHCA 3WT2A 5J41A 2L57A 3UIWA 2R3XA 1PX6A 2X8GA 2H73A 4NAXA 5EPFA 4XRDA 1V98A 5IMCA 1Y25A 4KX4A 3WGEA 2MZCA 5HFKA 2HYXA 2YWIA 5G1KA 1TI3A 2YWMA 1VF3A 1SYRA 5D9VA 2XBIA 1TRSA 1T00A 3GFKA 3APOA 4NPBA 5J4UA 3BOAA 2L5OA 1MEKA 1E6BA 3P7XA 3RPNA 1UC7A 3MSZA 5JCUA 2IFQB 2GS3A 3DVXA 4GSNA 1Z7PA 4K6XA 1JHBA 3TJFA 3VI5A 1TI1A 3D4TA 4MLYA 1AAZA 3GRXA 4HEA2 5ECIB 1JZWA 4O92A 2OE3A 5FHIA 3RPPA 2IIYA 2EIQA 4ZL8A 1G6WA 1EV4A 2TRCP 5JCGA 1K0BA 2AAWA 2H72A 4LMWA 1A8LA 2CZ3A 1QMVA 4MZBA 2IPAA 2B6MA 3UVTA 4IVFA 1PRXA 2ON7A 3CXGA 4FYBA 4BL7A 2JZTA 2YN1A 4CDOA 2C3NA 3VWUA 3CSHA 1PA3A 3KMOA 5IMAA 1ML6A 1R5AA 3E9JB 3M9KA 3VWXA 2GSTA 1T4YA 4JR4A 2YJ7A 1A0FA 3MDKA 3O6TA 1EZKA 1DUGA 2HSYA 2P0GA 3Q6OA 2OBIA 3RAZA 1S3AA 3UBKA 2H66A 2K18A 3FR3A 1Z6MA 2CV4A 3ZITA 5G2ZA 4ECIA 1ON4A 1NHOA 2C0FA 3HVVA 3KTLA 2MBSA 2RIIA 2H76A 1LJRA 3DKSA 2P5QA 3Q74A 5J9CA 2OJLA 5H5QA 5E4WA 1OAZA 2TRXA 1RK4A 2RUEA 2MMZA 3A2WA 3QFAC 3CSIA 2AB6A 3GTUA 3L9SA 1WMJA 3DIEA 2VL2C 1BJXA 1YZXA 2C0GA 1ZL9A 2X8HA 3OR5A 4KSOA 5DCGA 3D22A 3M1GA 3ZVJA 2PVQA 3TKPA 1PL2A 1XXUA 3C73A 3UARA 3HVXA 5ECQB 4LL4B 5IMZA 2YV9A 1WP0A 2VCTA 1OC9B 2IN3A 1F9MA 1AQWA 4ZBDA 2DC5A 3EURA 4XS4A 2RLIA 5HR0A 3DYRA 2IL3A 3IDVA 3G7IA 2A4VA 1ERVA 3CTGA 2FD3A 1JZDA 1A8YA 1GSUA 6GSXA 2NPBA 2L5LA 3UVHA 5DAKB 3L9UA 2ALBA 3ZTLA 2ZUPA 5CRWA 5G31A 2R5GA 2HSHA 5A4UA 2L6DA 4L0WA 3IK9A 5CRDA 5DJMA 2F8FA 2M72A 1VRSD 5F07A 4X43A 1FO5A 4MF7A 3DXBA 2EIRA 2JZSA 4X0XA 3LFLA 3ZVJD 2GLRA 4FH8A 2I1UA 4LLRA 1K0OA 2IWTA 2QSIA 1T7PB 1URMA 1ZCPA 4KDUA 2H30A 2H71A 2DSAA 3ISOA 4XS6A 2D2ZA 4L5LA 5ECLB 3KZQA 3PH9A 4PXOA 4MJAA 5ECNB 2EC4A 1VF4A 2TIRA 4Q5NA 4I5QA 1TP9A 5AIXA 12GSA 4OO5A 4EE0A 2AYTA 2KP2A 3WGDA 3IBHA 4TRXA 2LRNA 1TRUA 3IV4A 6GSTA 4O32A 3NZNA 1TRVA 4P3YB 2DMLA 3FK8A 1XVQA 2CZ2A 2PU9C 4KNDA 3EE2A 2IMDA 1M9AA 1ZZYA 2HRFA 2MBTA 5EVOA 1R5PA 3VFIA 4ECCA 4TW5A 3L4NA 2HNLA 1MD4A 4CHSA 4XTSA 1GL8A 4KCEA 2ON5A 3KIJA 4OD7A 1EGOA 4NXIA 1XIYA 4DSQA 3TJBA 4AJ7A 2IMFA 2FWHA 4POLA 3TKSC 3W8JA 3UMAA 4DEJA 3TJGA 9GSSA 4E8HA 5DQSA 1SKSB 1K3LA 3G9BA 4WBRD 1OKDA 3CMIA 3FKFA 4WXTA 1X9WB 2VCWA 2WS2A 4BWSA 2XC2A 1GSQA 1IYHA 4F2IA 3H1NA 5A4WA 10GSA 2DIZA 1XPVA 1PL1A 1Z9HA 3LXZA 2LJRA 2N5AA 2HXKA 1ERTA 1FVKA 1GH2A 2N5BA 4GTUA 3ED3A 5ECRB 3VPTA 2LUSA 5ELAA 5JWRB 1NSWA 1SYXA 3IHQA 4K2DA 1A23A 4KCAA 2VOCA 1C72A 1J9BA 4JEDA 2B5YA 1PQNA 3GSTA 2C0EA 5D9XA 1AUCA 2I4AA 4F9ZA 1TK5B 1O8WA 2GSQA 3VURA 4WF4A 3GN3A 1IYIA 4YQUA 1O85A 1EP7A 3EU4A 3APQA 3HD5A 4PGTA 2DIYA 4YAVA 1F2EA 3GKNA 1QK8A 1EOGA 4JE1A 1ERWA 2X64A 5H5SA 4I6XA 1HNCA 1SK2A 2FA8A 4HU7A 1FG4A 1XW5A 1ZYEA 5FT3A 2J9HA 3LWAA 5KN3A 5ELGA 2LEGA 1LU4A 1H4OA 1MDJA 1GSFA 4I8BA 1XWBA 1GULA 1DSBA 1GLQA 2M46A 3KP8A 1GSSA 3GA4A 2KP1A 4AGSA 3I6AA 3DGQA 4ZB8A 1M9BA 1TU7A 2V32A 3KTBA 5G5FA 3EMXA 2PERA 1ZOFA 5J3RA 2GSSA 4K8MA 2DBCA 1NW2A 4D73A 5ECKB 3TKRA 2QC7A 2JL4A 3GH6A 3FR6A 1DBYA 1GTBA 2WULA 4ZXGA 2DJ3A 4TN8A 4IQAA 3ZFLA 1K0AA 1BX9A 1I9DA 4IKHA 4MABA 2AJQB 2B5EA 4K0NA 4MZWA 5AISA 5JCWA 4K9ZA 4MZCA 2H1AA 2OADA 2MMOA 2B5XA 1O81A 4Q5FA 2CAIA 2HFDA 2MYGA 3ZYWA 4KUNA 1W89A 2Z9SA 3UL3A 2GZZA 20GSA 3IXRA 3KP9A 3ZFBA 3DEXA 4POBA 5CP1A 4BVXA 2H0GA 3EMPA 2EIOA 5H5RA 3LYKA 4TR4A 2H1GA 1T4ZA 5ECOB 1V9WA 2F51A 1ZMAA 5EY6A 7GSSA 1YEPA 1F37A 2CA8A 4HOJA 1YF0A 4BPYA 3TKSE 4EL1A 1MTCA 4KW6A 1GP1A 1PGTA 3QMXA 2PVOC 1THXA 4K1FA 3D6IA 4ZBAA 4WR4A 1OKTA 4HQSA 1JZRA 16GSA 1X9MB 2YWOA 4FO5A 3GTUB 4MCUA 2C8UA 2KHPA 3Q18A 4WBJA 2RM5A 4MPFA 2DJ0A 1TK0B 1QFNA 5JWOB 1OC3A 3MWHA 1XVWA 3IE3A 1GUHA 5IQYA 2V6KA 1V2AA 2YZUA 2HT9A 5B8AA 5ABRA 2B3SA 2XBQA 3IOSA 1WE0A 1B4PA 4XS4B 2XPDA 1AXDA 4ULXA 2VL2A 2ZCTA 4TVEA 2WFCA 2HE3A 2R4VA 3PR8A 4H86A 2CT6A 2CVKA 2BTOT 4HDEA 3K8NA 2V6OA 3I9V2 2V2GA 3GMFA 1GUKA 4K7OA 4FYUA 1OC8A 2CVDA 1X9SB 4GF0A 4TR1A 4GQCA 1N8JA 4ZILA 3VWWA 3LXTA 2B7JA 2YZHA 1PKWA 1ACVA 2H6YA 3QPMA 3ZREA 2VM2A 1YDKA 1YJ6A 1HQOA 4L0UA 4EKZA 3M3MA 1DE2A 1SL1B 2E7PA 2G0FA 3KD0A 3TKQA 5AGYA 2VO4A 1GNEA 4LL1B 4CW9A 1QXHA 1XWKA 4DSSA 5HFGA 1E2YA 3FYGA 3H8QA 3TOUA 3P2AA 4V2NA 1TK8B 3QAWA 2IMEA 4ZIJA 5C00A 3C71A 6GSSA 2FCHA 4HS1A 4PQ1A 8GSSA 3JCML 4MJCA 1M2DA 4ID0A 2VCVA 2H01A 3KXOA 4YQVA 3HY2A 1SD8A 2GZPA 1PN9A 2ES7A 1X0RA 4GXZA 2PGTA 2FNOA 2LJKA 4RQXA 3ZMLA 5HFIA 4MJEA 5GSSA 1OYJA 1R7HA 1X5DA 4XS1A 3E0UA 2VUPA 1T8EB 3GYKA 2C3QA 2FUG2 1SENA 3PGTA 2VL3A 3QR6A 3WGXA 1AW9A 4HI7A 2O8VB 3NIVA 4KAEA 1PD21 4JU5A 1HYUA 4ZB9A 1G7EA 3ZIJA 1OVNA 4PNFA 2H0IA 2LQQA 3O76A 5D9WA 4WR5A 3QDNA 1KTEA 1TTZA 5CAXA 3UJ1A 2BMXA 1CQGA 3F4TA 3IRAA 2RUFA 2PPTA 3GX8A 3QFBC 3LG6A 4N30A 2JACA 6GSVA 2WRTA 2KUCA 3C1RA 2JSYA 1G6YA 3TKSA 1ERUA 1BQ7A 4I2TA 1YEXA 1Z6NA 2E0QA 4V2LA 4IQ1A 1RQMA 1TJDA 4RQRA 1TU8A 2L59A 3GL3A 4V1Ag 3GUSA 4IELA 3L78A 2J23A 1UN2A 2OE1A 3AY8A 2WDUA 2YNXA 4EDYA 1FW1A 3LSZA 2DJ1A 1GSYA 3WYWA 2YCDA 2R6KA 2GZYA 4J2FA 2OACA 2CX3A 3H4KA 1GLPA 2QGVA 3GIXA 3GHAA 2IMIA 5ECSA 17GSA 5IOWA 5F0GA 2WB9A 5ECMB 3O3TA 2GT6A 4XHMA 3MNGA 4O5RA 3GKMA 4MDCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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