2K9FA

Structural features of the complex between the dsbd n-terminal and the pilb n-terminal domains from neisseria meningitidis
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
144
structure length
144
Chain Sequence
MVPHTLSTLKTADNRPASVYLKKDKPTLIKFWASWCPLCLSELGQTEKWAQDAKFSSANLITVASPGFLHEKKDGDFQKWYAGLNYPKLPVVTDNGGTIAQSLNISVYPSWALIGKDGDVQRIVKGSINEAQALALIRDPNADL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin
publication title Formation of the complex between DsbD and PilB N-terminal domains from Neisseria meningitidis necessitates an adaptability of nDsbD.
pubmed doi rcsb
source organism Neisseria meningitidis serogroup a
molecule tags Oxidoreductase
total genus 40
structure length 144
sequence length 144
ec nomenclature ec 1.8.4.11: Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase.
pdb deposition date 2008-10-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2k9fA00
4GRFA 2RIIA 1QFNA 5G2ZA 4N30A 5ECQB 1EV4A 2CVBA 1AUCA 5H5RA 2YPMA 2PBJA 5B6NA 4NHZA 3BBYA 3P7XA 2X8GA 1H75A 4WXTA 3UIWA 2M80A 4AGSA 1PRXA 4IN0A 1S3DA 4PQ1A 1MDIA 3C7MA 3A5WA 2HZEB 4Q5NA 5EY6A 4GXZA 4MP4A 1YQ1A 2HRNA 5DQSA 3RHCA 4HJ2A 2F8AA 4ZB6A 1J0FA 4JEDA 1SJ6A 3TGZA 1K0MA 3F4RA 2V2GA 1R4WA 5A4WA 1XFLA 2WCIA 4GSNA 1XCCA 1SENA 1EWXA 4L0UA 4LLRA 4HQSA 4HU9A 2PWJA 1ERWA 1OE8A 1M0UA 1E6BA 3EWLA 3H93A 4GCIA 4LL4B 3DVXA 2LJRA 3EMXA 2DLXA 2WS2A 1F9MA 4K7IA 1EP7A 5G5EA 2NBSA 3ZIJA 3MNGA 1EGRA 1PA3A 4J56E 3ERWA 5A4UA 1X9SB 2IJYA 2OE3A 3IA1A 4RQRA 4MH2A 3M1GA 2MMZA 3LXTA 2OBIA 3CMIA 3ZZXA 5IQYA 2H6YA 1X5DA 4MJAA 5B8AA 4POBA 3GTUB 2GQKA 3V1WA 3FR9A 5CRGA 1X9WB 1AW9A 1ZOFA 2FUG2 2JZTA 2WGRA 2A4VA 5ABRA 3IRAA 4ISDA 6GSVA 3F8UA 5IMCA 2ZCTA 5E59A 1PQNA 4KGIA 2HE3A 2MBSA 1YJ6A 5CAXA 4DSSB 1GUKA 1Q4JA 3CSIA 3GSTA 2IFQB 5G1KA 2H70A 1V58A 3W8SA 4IP6A 4FYBA 3TOTA 4Q5FA 1ERUA 1FOVA 4ZL7A 5ECRB 3VPQA 4ECCA 3VWXA 3ZL5A 1VRSD 1O81A 2VL2A 2B3SA 3PH9A 5B7CA 3CSHA 4QL9A 3LQ7A 4MF7A 4XRDA 3WGEA 2H6XA 4X43A 4EF0A 1DUGA 2BMXA 4N10A 1WIKA 2R6KA 3O6TA 2IWTA 3L4NA 2F3MA 3L78A 1EEMA 3HXSA 3TUEA 5D96A 4EUYA 3QMXA 2GTUA 1TI3A 1SKSB 4MDCA 4MZCA 1ZCPA 2O7KA 1XOBA 2CV4A 2VIMA 1SKWB 5J4UA 4KDUA 2GVPA 4HDEA 1XVQA 1KBNA 1Z7RA 1EOHA 1TP9A 5H5SA 3ZYWA 1T3BA 3MDKA 3ZITA 4J57E 5HR2A 2NPBA 1THOA 2KUCA 1MD3A 4GSTA 5A4VA 1B4QA 3ZREA 4GQCA 3TKRA 3F4TA 3U5RE 1BG5A 4GF0A 1K0OA 2V6OA 3VFIA 4L0WA 1TK5B 3I69A 3JCML 4TXOB 1QMVA 4HUAA 2IMIA 2NTOA 1QXHA 4ZBDA 1VF3A 2V41A 3L9VA 1PN9A 4ECIA 4K0NA 3UBLA 1GSDA 2B1KA 2QSIA 1TRUA 4IVFA 2AB6A 1I5GA 13GSA 2DSAA 4HZ2A 2ZUPA 4L5LA 4PQIA 4GLTA 4KNDA 1PGTA 5G5FA 2YOIA 4YAVA 14GSA 3A2WA 1JLWA 4LL1B 5H5QA 2H1BA 2CAQA 3KCMA 1BAYA 5HR3A 3W8JA 2HFDA 5D8IA 4K7NA 1NM3A 2A2RA 2GDRA 3GHAA 1AC1A 1LBKA 4MF6A 2J9HA 1Z6NA 3BD2A 3MSZA 2DJKA 2M46A 1Z9HA 3DMLA 1JZRA 4RI7A 3DVWA 1R5AA 2K18A 5ECMB 1OC9B 3H1NA 5DALB 4P3YB 1BQ7A 4FYUA 5B6MA 3P2AA 1BJXA 2MMOA 3KH9A 4Q5RA 5DCHA 3LG6A 4IW9A 2X8CA 2XPDA 3A3TA 3D21A 2BJXA 1DBYA 2B7KA 3C71A 4F82A 3KM6A 1ZYEA 1SL1B 1ILOA 2H0GA 4ZB9A 1O85A 2LUSA 4PGTA 4OWYA 1K0NA 3TJKA 4N0VA 1DSBA 2JACA 1KNGA 3I43A 1JHBA 4O5RA 2M72A 4PQHA 1GL8A 2LSTA 2FWEA 1A8YA 4I2UA 4O92A 3TDGA 1CQGA 3ERGA 4FYCA 5A5KA 4MA9A 1A8LA 2C0EA 2E2GA 2LV3A 1MD4A 4X1UA 3DEXA 2I9HA 1YKAA 2GSQA 1XW5A 5ECKB 3TKSE 2IL3A 5IO2A 4ML6A 2DIZA 3HYPA 4JU5A 5C04A 3ME7A 2NVLA 5IPHA 1JZWA 2LRNA 2O8VB 2DJ1A 1Z3EA 1WPIA 3QCPA 2VLTA 3EU4A 4I5QA 18GSA 2IN3A 7GSSA 3KD0A 5LNKe 4G19A 3DGQA 3BCIA 1GLQA 2DJ3A 2YV7A 5GAND 2JU5A 1B9YC 1SJIA 4OO4A 4FO5A 3Q74A 1VF4A 2DC5A 2O85A 2GSTA 3A2VA 2I3YA 3GX8A 5ECIB 4RI6A 3D0ZA 1FO5A 4DSRA 1Z6MA 1O8WA 2VO4A 4PNFA 4K2DA 3VURA 1PX6A 3KTLA 2TIRA 2QKEA 3IC4A 2RUFA 2JSZA 2KP1A 5ENUA 3C8EA 4LMWA 3ZMLA 1GSUA 3EURA 2PUKC 5CO3A 1TRVA 1XWBA 1EV9A 4WBJA 5ECHB 3U6VA 1U88A 4BL7A 5LCZA 4HQZA 3VPTA 2MMNA 16GSA 5DBQA 1GTBA 4OFTA 3GTUA 3O3TA 3J7Yk 5D93A 4X0XA 6GSSA 2AAWA 4IKHA 1RQMA 3G7JA 3HCZA 1K0DA 3TJBA 3APQA 1SKRB 4TXVA 2EIQA 5KN3A 2GGTA 1X0RA 1AIUA 2L4CA 3TKQA 1AQVA 3KH7A 3QFAC 2PU9C 4HU7A 4IJIA 3H8QA 4MPGA 2K8VA 1SL2B 1TJDA 1GSYA 5JCGA 4RUVA 3CRUA 4KSMA 3NZNA 2C8UA 2PERA 2P0GA 5ELAA 5CRHA 1TI1A 3ME8A 3HVXA 3QDNA 5G30A 1ML6A 3HD5A 4CHSA 3RAZA 3ZVJA 1JFUA 2IMKA 3C1RA 1XBSA 4JR4A 1F3BA 1YDKA 1GLPA 1J9BA 1GSEA 1XXUA 2RM5A 1O73A 3UOMA 2V32A 2VM1A 2X64A 1F2EA 3NOFA 4ULXA 3LEFA 1ZGNA 3VWUA 3J7Yb 2RM6A 2HSHA 2P5RA 2VCWA 4PURA 1ZZYA 2OE0A 3RPNA 1K0BA 4ZXGA 2B5YA 2ON5A 2NDOA 3D6IA 4TRXA 1FG4A 1AQXA 1XZOA 2ES7A 4XCSA 1G7OA 2YZUA 5J5NA 3OR5A 4KX4A 1TU8A 1ABAA 4F0CA 3GNJA 4HEA2 2DJJA 3UL3A 3GH6A 2C0GA 4TXOA 2EIOA 3UJ1A 3VK9A 2C80A 3SWLA 2DIYA 1UN2A 5HR0A 2RLIA 9GSSA 4FH8A 1PKZA 4ZL9A 3GIXA 4I2TA 1XWAA 1M7TA 5KN2A 3EU3A 1ERVA 3CRTA 3FY7A 1TU7A 2GQMA 2HZFA 3ZLPA 4MJBA 2C3TA 2MMAA 3FZ9A 3FEUA 5D9TA 2K8SA 1G7EA 1N8JA 1T4YA 1TRSA 3DKSA 4EDYA 3UVTA 3WGDA 3DXBA 5JWRB 4D73B 2CVKA 2Z9SA 2H0IA 5C00A 2P31A 2B5EA 1T00A 3CYNA 3APOA 1Z5YE 4ZL8A 3IR4A 1U3AA 3ZMKA 1OC9A 5DALA 4V2MA 1PKWA 4I6XA 3M8NA 3KMNA 3HVSA 3GYKA 2OBKA 3CTGA 1J08A 3ZFBA 3H4KA 2AUVA 2WZ9A 2DJ0A 1OKDA 5EPFA 5ECOB 3UARA 4HS1A 4MABA 2IMFA 4K1FA 1WMJA 3HJPA 4YH2A 4CW9A 4OMVA 3VI5A 3KZQA 1WP0A 2YWNA 1VGLA 3DWVA 2YP6A 2H75A 5DQYA 2IMEA 2FWGA 2N5AA 2O89A 3C73A 3LWAA 5F07A 3E0UA 5CYYA 5CRWA 4MLYA 5IOXA 3GMFA 2DMMA 1Y25A 4NWYA 1V2AA 4HI7A 4KSOA 5DDLA 2IPAA 3IE3A 3BJ5A 4POMA 5F05A 3TKPA 1USBA 3F3QA 1OE7A 4I97A 3QAWA 2L5LA 2YWMA 3TJFA 4MK3A 3UVHA 3FHKA 2P5QA 1A2MA 3PR8A 3KIJA 1SK1A 5DAKB 3VLNA 1OYJA 1ZYQB 2G0FA 2ON7A 1S3CA 4GWRA 3QFBC 4KA0A 1A2LA 2K6VA 3KTBA 1U3IA 2GLRA 4K0GA 4K7OA 4ZILA 1WRYA 1K3YA 3LYKA 4JRRA 4ZBBA 4O7HA 3FZAA 1E2YA 2REMA 1BEDA 1EOGA 4BVYA 3AY8A 1FVJA 4JZQA 3WYWA 2YWOA 5ID2B 6GSXA 1EP8A 4KB3A 1JZDA 2R4VA 1YF0A 4PUFC 2CX3A 4IGJA 4MJCA 2DMLA 3GKNA 5CREA 5D9VA 3D5JA 1H4OA 4OCEA 1OC8A 3IK9A 1T1VA 1GRXA 4K8MA 4MF5A 1THXA 2I4AA 3HDCA 10GSA 2N5BA 3K8NA 2E2MA 1SD8A 5CNWA 2GS3A 3GV1A 2GZZA 4QL7A 2H6ZA 3GL5A 5IIZA 2B6MA 5IMFA 6GSUA 2CX4A 2LS5A 4TW5A 1BYEA 4GTUA 2VD1A 2L5OA 2PMTA 3F6DA 5G1LA 1S3AA 2YWIA 1FB6A 4TVEA 5E4WA 3TOUA 4XRAA 4KUNA 3CSJA 4LMVA 6GSWA 2MYGA 4AJ6A 4IQAA 1DE1A 3F0IA 2GSRA 4IQ1A 5HFGA 3IHQA 1UA5A 2FY6A 2GZYA 4KW6A 1M9AA 5J3RA 2XBIA 4V1Ap 2D2ZA 2H72A 3Q19A 4MZBA 5D9XA 1EZKA 5AIXA 3DIEA 4IELA 4NV2A 3F6FA 1TOFA 2WFCA 3O76A 2H76A 1OC3A 3LSZA 1XIYA 4MH3A 5HFIA 5IOWA 4J2FA 2PVOC 2L4QA 4ECJA 4MJEA 5DCGA 4YAPA 2LRTA 3NIVA 1PX7A 2H1AA 4WETA 4WR5A 1Y6EA 2CZ3A 5FWGA 2JADA 1GTUA 2VLUA 3IBHA 3IOSA 4MPFA 4ZBAA 4HJMA 1N2AA 2H01A 1TK0B 4RQXA 2R2JA 4G2EA 1GSFA 1OKTA 1XW9A 3IK7A 4NAXA 2J23A 4EE0A 5IMZA 1AQWA 3EVIA 1WOUA 4NPBA 2I1UA 3UEMA 3GKMA 2PN8A 1OAZA 5AN1A 3VWWA 4IJ3A 3HZ4A 1AAZA 5COHA 5F0GA 3DRNA 1ERTA 1TKDB 2EC4A 4ZIJA 1F37A 2FNOA 3VI7A 3EMPA 20GSA 3R2QA 2B5XA 1M9BA 3FR6A 5AGYA 4KH7A 4KDYA 4EL1A 1YEXA 2GQLA 1WWJA 1XOAA 3TJGA 1T4ZA 2C3NA 1SK0A 2LNTA 3GH9A 3C1SA 3GL3A 2IIYA 1M2AA 4BA7A 1CQHA 3D4TA 1F6MC 1HD2A 2HNLA 3FRCA 3LFLA 3MAKA 4D73A 4AF2A 3WGXA 4WF4A 1EGOA 4EXJA 4L8EA 4XS1A 2BTOT 5KN1A 2YNXA 1W4VA 4CDOA 2YCDA 2TRCP 1A2JA 1PSQA 2CT6A 5B8BA 3M9JA 3UAPA 4KE3A 1GULA 2XHFA 4K6XA 3HJMA 4WEYA 3WD6A 1ON4A 4OCFA 1NW2A 1SK2A 1O8XA 2GT5A 3FZ4A 2H30A 3RBTA 4F03A 1WJKA 3IAM2 1KEBA 1SD9A 2TRXA 3TCOA 3KJYA 2LNSA 1UVZA 3IXRA 1AXDA 3HY2A 1I9DA 1XWKA 3LORA 2FCHA 3M3MA 5L71A 4AJ7A 3GKKA 1LJRA 3KXOA 2ALBA 2HYXA 1M2DA 3KEBA 3M0FA 3DYRA 2LTKA 5GAPD 4JBBA 2WB9A 4DVCA 2C0FA 1PL2A 1GSQA 5J9BA 1A24A 1K0CA 1V57A 3ED3A 1IYIA 1HNAA 5GSTA 2LJAA 1GUMA 3QAVA 4WF5A 6GSYA 4G10A 2OADA 3EYTA 1LU4A 1PD21 3EE2A 4ZB8A 3QD9A 4GSSA 2V6KA 2X99A 3M9KA 4I8BA 4EVMA 4F0BA 4TR0A 2VL3A 4PXOA 1JZOA 1OVNA 2F8FA 3F9UA 1ZMAA 1BX9A 1HNBA 2FGXA 5DVBA 2LJKA 3FK8A 1B4PA 2H71A 4AJ8A 4IHUA 1U6TA 3GA4A 1IYHA 2LQQA 2R3XA 1A0FA 1G0TA 3D4MA 4MMMA 3TKSC 1G6YA 4NMUA 5ECSA 1GTAA 3GUSA 5DAKA 2VUPA 4TR1B 3GX0A 3CXGA 3VWVA 4EO3A 4NXIA 1X5CA 2HT9A 3RPPA 4LA1A 1NSWA 1SU9A 3L9SA 3TB2A 1U87A 4IP1A 1FW1A 2OACA 1SJZA 2VCXA 5JWQB 2CA8A 6GSTA 1FAAA 2CZ2A 3DD3A 1QGVA 2LKUA 3CTFA 2FHEA 2FA8A 2C4JA 2YZHA 4XS6A 2JZRA 1SYRA 5ID2A 1EEJA 1FHEA 5AISA 2OJLA 2K9FA 3ISOA 4OD7A 2GSSA 2ZNMA 4YQUA 3IV4A 2OE1A 2C1YA 3PGTA 2B7JA 2OKAA 2QGVA 3FR3A 3L0HA 2XPEA 2O87A 2H74A 4PUAA 2VD0A 3P90A 2YJHA 3QAGA 3I6AA 1NHOA 5ECNB 4WKWA 2X8HA 1B9XC 4NV5A 5GSSA 3HA9A 3RDWA 2LEGA 1GNWA 4MZWA 4XS4B 2DBCA 5LD0A 2HRFA 3EC3A 4WR4A 5JWOB 4F2IA 1PL1A 3BCKA 1MDJA 2CAIA 2HI7A 5J9CA 8GSSA 3Q6OA 2G2QA 4BWQA 1ACVA 3GRXA 1TK8B 5F06A 2R37A 4BPYA 4KDXA 3G9BA 1GUHA 1HNCA 1X9MB 1ST9A 2KP2A 3QPMA 2JSYA 3A2XA 1Q98A 4PX1A 4OFMA 4HOJA 1YEPA 3F4SA 4ILFA 3FW2A 1R7HA 22GSA 5IM9A 2AV4A 5JCWA 3ZVJD 3LYPA 2YN1A 1R5PA 3KP9A 4OFNA 3GURA 5ECPB 5D9WA 1TXXA 3ERFA 3PINA 4TN8A 4V1Ag 4Z7XA 1MEKA 5IMVA 4HZ4A 5EL8A 1QUWA 2L59A 1YZXA 3G7IA 5HR1A 4POKA 3H79A 2WRTA 3LXZA 3LGCA 1TW9A 2KLXA 2YANA 2CVDA 2LRCA 1HQOA 1R26A 2E7PA 4XIHA 3MWHA 2VAFA 1JLVA 3P8WA 3HHVA 1W89A 2MZCA 4E8HA 11GSA 2FWFA 3UBKA 4EKZA 1O6JA 1FVKA 2HXKA 2WJUA 4ID0A 3TKSA 1DE2A 2JL4A 1V98A 1SL0B 1M99A 4XTSA 2V1MA 2QC7A 4GQFA 1GP1A 1B8XA 3ZIVA 1GNEA 5ELGA 5FT3A 4EC0A 2VOCA 3IDVA 4E8EA 2FA4A 1RK4A 3EINA 4BWSA 4TR3A 4YQMA 3US3A 2F51A 4YQVA 3HKRA 1MDKA 3HZ8A 3KMOA 4TKYA 1K0AA 3E3EA 5KEJA 3ZFLA 3GFKA 4N11A 3G7YA 3UMAA 1K3OA 2CQ9A 5EVOA 1XWCA 2VLVA 1TTZA 4IBPA 1KTEA 1WE0A 2FD3A 3GSSA 1UC7A 3D22A 4WBRD 3S9FA 3ZRDA 2PGTA 3BOAA 3E9JB 4KAEA 4XHMA 1URMA 4G9HA 3RHBA 2VCVA 5J41A 1NHYA 2WULA 2MBTA 3GKXA 3N5OA 1HYUA 2GT6A 3FKFA 1GH2A 5CP1A 4JR6A 1QK8A 1YF1A 5G31A 3L9UA 4MCUA 1M2BA 4K9ZA 5ECLB 3LJRA 2YJ7A 2HSYA 1YKCA 2JZSA 2N5FA 4FIWA 17GSA 3F3RA 3APSA 3TRXA 3QR6A 2I81A 5IMDA 2AJQB 3IPZA 4JE1A 5JCUA 1T7PB 3HJOA 4QQ7A 1TDIA 4Q5QA 1TRWA 1V40A 2XC2A 2KHPA 4PNGA 2L6CA 3HVVA 3N9JA 3FYGA 5DJMA 3TRPA 2HZEA 1K3LA 2H66A 2H1DA 2C0DA 2HLSA 4N0ZA 2VM2A 2C3QA 2E0QA 1GWCA 1PMTA 2H1GA 5INYA 4L5OA 5F8BA 2F9SA 2VCTA 2B1LA 5AIVA 1XW6A 4POLA 5IO0A 1ZL9A 1GSSA 1F3AA 3KP8A 2H19A 4TR1A 3I9V2 1G6WA 3CBUA 2L6DA 3IAS2 4BVXA 2DJ2A 1SYXA 3ZTLA 4EDZA 4DEJA 5IPGA 2IMDA 2LQOA 4ML1A 3W6GA 4IS0A 4O32A 4F9ZA 1A0RP 3SBCA 2OA7A 1YY7A 1VF2A 1XVWA 2VL9A 1O7UA 2RUEA 1XWGA 3WT2A 2H73A 2FLSA 5CRDA 3TRQA 2VCQA 5IMAA 2A2SA 2XBQA 4KCEA 5FHIA 1V9WA 4ACSA 1RW1A 3TJJA 4OO5A 4NHWA 1FB0A 4H86A 3WT1A 2FWHA 12GSA 4V2NA 5KN0A 2PPTA 2PVQA 2YV9A 4TOPA 3QOUA 1B48A 4DSQA 1T8EB 1A23A 4ECBA 1MTCA 19GSA 4XS4A 4TR4A 2H0HA 2AYTA 2WDUA 5DJLA 3FZ5A 4KCAA 1QQ2A 2EIRA 2H8LA 5HFKA 4DSSA 1Z7PA 5D73A 5GZZB 3Q18A 4V2LA 1GTIA 2IFQA 2VCZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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